PROSITE entry PS51653

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51653
Entry name [info]	CV_ZBD
Accession [info]	PS51653
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-AUG-2012 CREATED; 27-MAR-2024 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51652
Associated ProRule [info]	PRU00986

Name and characterization of the entry

Description [info]

Coronaviridae zinc-binding (CV ZBD) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=113;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=108;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5072916; R2=0.0096032; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=885; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=416; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M= 14,-10,-12,-15,-10,  3, -7,-15,-12,-15,-15,-12, -3,-15,-12,-15, 17,  7, -5,-23, -8,-10;
/M: SY='A';  M= 14, -3, -4, -3,-10,-19,-14,-19, -7,-12,-10,-10,-10,-18,-15,-18,  0, -3,  7,-30,-18,-13;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-27, -7,-11,-27, 37,-15,-34, -4,-29,-18,  2,-17,-10, -2,  4,-11,-24,-23,-24,-11;
/M: SY='V';  M=  6,-17,-16,-20,-13,-10,-20,-16,  7,-13,  5,  7,-17,-20, -5,-13, -4,  0, 12,-25,-10, -9;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V';  M= -8,-28,-16,-31,-28, 24,-30,-19, 18,-21,  8,  6,-26,-30,-29,-18,-14, -4, 28,-11, 14,-28;
/M: SY='V';  M= -6,-28, 18,-32,-29,  9,-30,-28, 10,-25,  5,  2,-26,-32,-31,-22,-13, -5, 25,-27, -7,-29;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N';  M= -8,  9,-28, 11, -1,-28,  6, -1,-28, -8,-29,-20, 12,  9, -6,-12,  5, -7,-27,-33,-21, -5;
/M: SY='N';  M=  2, 16,-14,  8,  0,-20,  0, -2,-20, -6,-30,-20, 30,-14,  0, -6, 28, 12,-18,-40,-20,  0;
/M: SY='Q';  M=  0, -6,-29, -6, 10,-34,-17, -2,-18,  2,-21, -6, -6, 13, 32, -2, -1, -8,-25,-22,-16, 20;
/M: SY='T';  M= 12, -2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10, -2,-10,-10,-12, 18, 38,  0,-28,-12,-10;
/M: SY='V';  M=  2,-21,-12,-22,-21, -6,-22,-24, 17,-18, -1,  2,-17,-23,-20,-18,  4,  5, 31,-32,-12,-21;
/M: SY='L';  M= -2,-18,-16,-18,-12, -2,-18,-16,  4,-22, 18,  4,-14,-22,-12,-16, -2,  2,  2,-28, -8,-12;
/M: SY='R';  M=-12,-13,-22,-15, -9,-14,-22,-10,-13, 12,-11, -5, -7,-21, -3, 36, -5,  2,  0,-24,-10, -9;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-27, -1,  2,-28, 37,-14,-34,-11,-28,-20,  2,-14, -7,-14,  7,-11,-27,-26,-26, -3;
/M: SY='D';  M= -7, 24,-24, 31, 20,-30, -7, -4,-30, -1,-25,-23, 13, -9,  2, -8,  8, -1,-24,-35,-20, 11;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='I';  M=-11,-23,-25,-28,-22,  7,-32,-15, 22,-22, 16, 10,-19,-23,-16,-20,-15,  0, 12,-10, 17,-22;
/M: SY='R';  M=-12,-18,-22,-18,-12,-12,-24,-12, -6, 10, -8, -2,-12,-24, -6, 34,-10, -6,  8,-24,-10,-12;
/M: SY='R';  M=-14, -8,-32, -6,  6,-28,-20, -5,-26, 22,-25,-11, -5, 10, 14, 29, -8,-10,-24,-22,-15,  7;
/M: SY='P';  M=-12,-22,-34,-16, -8,-11,-24,-13, -7,-15, -6, -7,-22, 42,-12,-18,-16,-10,-17,-18, -5,-14;
/M: SY='P';  M=-13,-24,-28,-25,-15, 10,-24,-17, -1,-19,  3,  5,-22, 20,-18,-18,-18,-10, -9,-16, -4,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-20,-30,-20,  8,-28,-17, 20,-27, 45, 27,-28,-28,-17,-18,-28,-10, 10,-20,  0,-18;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C';  M= 16,-11, 38,-21,-17,-18,-16,-24,-17,-17,-14,-14,-11,-21,-17,-21,  5,  8, -4,-33,-21,-17;
/M: SY='K';  M=-14, -5,-30, -5,  1,-14,-22, 15,-23, 26,-21, -6, -3,-16,  5, 16,-12,-12,-19,-10, 16,  1;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C';  M= 14,-16, 28,-23,-19, -8,-17,-14,-14,-17,-11,-11,-16,-25,-17,-21, -4, -6, -6,-18,  0,-19;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='D';  M=-14, 25,-25, 38, 15,-29,-16, -7,-22, -3,-19,-19,  5,-13, -4,-11, -2, -8,-11,-36,-18,  6;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 17, 12,-30,-30,-28,-20,-13, -2, 43,-28, -8,-28;
/M: SY='M';  M= -8,-26,-19,-33,-26,  7,-28,-16, 27,-18, 16, 32,-23,-24,-16,-18,-17, -7, 25,-21, -1,-21;
/M: SY='A';  M=  4,-15,-22,-19,-16,-12, -2,-11,  0,-20, -1, -1, -9,-18,-13,-19, -2, -6, -1,-24,-11,-16;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-12,-10,-15,-12,  2,-10, -8,-10, 25, 43, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='D';  M= -9, 25,-23, 30,  8,-28, -9, -5,-28,  0,-28,-22, 18, -6, -1, -6, 11,  4,-22,-37,-19,  3;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='K';  M= -6, -2, -6, -5,  1,-24,-19,-14,-26, 24,-25,-12, -1,-14,  1, 12,  1,  3,-14,-28,-14,  1;
/M: SY='F';  M=-13,-14,-27,-17,-10,  9,-23, -9, -8, -2, -6, -1,-10, -4,-12, -5,-15, -9,-11,-11,  7,-11;
/M: SY='V';  M= -3,-25,-17,-30,-27, -2,-32,-28, 30,-22, 10, 10,-22,-23,-23,-22, -8,  5, 35,-27, -7,-27;
/M: SY='L';  M=-10,-15,-24,-13,  5, -8,-25, -9,  2,-13, 20, 10,-17,-19,  4,-10,-17,-10, -6,-22, -6,  5;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='S';  M= 12, -2, -6, -3, -2,-12,  0, -8,-10, -6,-15,-10,  3, -6, -2, -8, 19,  9, -4,-21,-12, -2; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -3,-18,-12,-21,-18,  0,-21,-18, 24,-15,  9,  9,-15,-15,-15,-15, -9, -3, 24,-15, -3,-18; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='B';  M= -4, 17,-14, 16,  2,-19, -8, -6,-19, -5,-20,-16, 15,-10, -3, -7, 14, 15,-13,-31,-14,  0; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-33,-11, -3,-25,-22,-19,-14,  2,-23,-13,-17, 47, -9, -8,-10, -8,-14,-28,-22, -9;
/M: SY='Y';  M=-18,-24,-26,-26,-22, 38,-30,  4,  3,-18, 11,  3,-22,-30,-19,-14,-22,-10, -4, 17, 55,-22;
/M: SY='V';  M= -5,-21,-21,-20,-16,-12,-27,-24,  9, -3, -5,  1,-21, -5,-17, -9,-11, -5, 19,-27,-13,-17;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N';  M=-10,  8,-12, -1, -6,-10,-11, 12,-20,-10,-23,-14, 19, -8, -6, -8,  4, -4,-22,-32,-10, -7;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='A';  M= 13, -8,-10,-13, -9, -7, -9,-13, -2, -9, -6, -4, -6,-13, -6,-11,  4,  2,  4,-18, -9, -7; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='P';  M= -3, -5,-17, -3, -1,-14, -8, -8,-10, -6,-15,-10, -2, 26, -4, -9,  3,  0,-13,-20,-15, -4; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-17, -1, -8,-18, 33, -9,-22,-10,-18,-12,  4,-11, -9,-10,  2, -9,-17,-15,-17, -9; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D';  M=-10, 22,-29, 28,  0,-33, 28, -8,-38, -9,-30,-24, 15,-16, -9,-14,  1,-14,-30,-31,-25, -5;
/M: SY='V';  M= -5,-15,-20,-14, -3,-18,-25,-12,  5, -6, -4,  4,-16,-20, 10, -6, -5, -5, 12,-26,-11,  4;
/M: SY='B';  M=  2, 19,-17, 16,  1,-22, -7, -7,-21, -5,-23,-19, 19,-12, -4, -9, 15, 12,-16,-35,-18, -1;
/M: SY='D';  M=-19, 49,-29, 64, 18,-38, -9,  1,-38,  0,-30,-29, 25,-11,  0, -9,  1, -9,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='V';  M= -4,-28,-20,-29,-25, -5,-31,-28, 26,-21,  6,  7,-26, -8,-24,-22,-12, -4, 32,-28,-11,-27;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-19,-10, -5,-15,-20,-12,-19,  9,-15,-10,  0,-14, -1, 24,  7, 23, -9,-26,-10, -5;
/M: SY='K';  M=-12,  2,-30,  5, 21,-29,-20, 13,-29, 27,-25,-10,  2, -9, 17, 16, -7,-12,-25,-24, -7, 18;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-26,-27,-24, 48,-30,  6,  0,-17,  4,  0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 23, 62,-24;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-32,-24,  6,-32,-24, 29,-28, 36, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 21,-22, -2,-24;
/M: SY='G';  M= -2,-16,-24,-18,-22,-18, 32,-19,-14,-18,-12,  0,-10,-22,-19,-18, -6,-14, -5,-22,-20,-21;
/M: SY='G';  M= -2,-15,-28,-15,-20,-21, 47,-20,-26,-22,-11,-11, -7,-22,-20,-20, -7,-18,-21,-20,-23,-20;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='M';  M= -8,-18, 17,-24,-18, -2,-21,-12,  4,-17, 14, 21,-18,-23,-12,-15,-16, -8,  3,-23, -7,-15; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='S';  M=  0, -3,-18, -7, -4,-17,-10,-10, -9, -2,-18, -4,  5,-13, -1, -5, 15,  6, -6,-32,-14, -3;
/M: SY='Y';  M=-17,-22,-27,-22,-22, 25,-30, 12,  5,-12,  2,  2,-22,-30,-13,-12,-18, -8,  0, 20, 65,-22;
/M: SY='Y';  M= -6,-16,-27,-19,-11, 10,-22,  2, -8, -9, -7, -3,-15,-22,  2, -9,-12,-10,-13, 17, 32, -6;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-12,  4,-26,  6,  5,-23,-12, -3,-21,  9,-18, -8,  1,-15,  1, 10, -5, -7,-14,-27,-12,  2;
/M: SY='N';  M= -8, 32,-22, 29,  8,-25, -4,  2,-25, -2,-27,-22, 35,-15,  0, -5, 10,  0,-25,-39,-20,  4;
/M: SY='H';  M=-18, -5,  5, -7, -7,-20,-22, 70,-30,-15,-20, -5,  3,-25,  1, -7,-10,-18,-25,-35,  8, -7;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -5, -6,-22, -6,  0,-21,-17,-12,-18, 22,-22, -9, -3,-15,  1, 17,  2, -1, -6,-26,-12,  0;
/M: SY='P';  M=-12,  1,-36, 14, 15,-32,-18,-12,-26, -4,-28,-22, -7, 52, -3,-14, -6,-10,-30,-32,-26,  3;
/M: SY='R';  M=-11, -9,-29, -8, -1,-26, -6,  1,-24,  9,-21, -9, -4, -7,  9, 19, -6,-12,-20,-23,-13,  2;
/M: SY='L';  M=-11,-26,-12,-30,-22,  7,-29,-14, 17,-24, 31, 21,-25,-28,-16,-19,-25,-10,  8,-16,  7,-20;
/M: SY='S';  M= 12, -4,-15, -7, -2,-20, -5,-10,-20, -1,-23,-16,  3,-12,  0,  7, 22,  9,-10,-31,-18, -2;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-23,-38,-28, 43,-33,-23, 19,-30, 20, 10,-22,-27,-30,-23,-22,-10, 11, -4, 16,-28;
/M: SY='P';  M= -5,-13,-32, -6,  1,-28,-15,-16,-21, -3,-30,-19,-11, 55, -5,-12,  2, -3,-24,-31,-25, -5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='C';  M= -6,-26, 40,-30,-28, -6,-30,-28,  3,-26,  7,  0,-26,-34,-28,-24,-15, -6, 16,-36,-16,-28;
/M: SY='S';  M= 12,  4,-14,  3, -1,-21, -4,-10,-16, -8,-19,-10,  3,-11, -2,-12, 19,  7, -9,-33,-18, -2;
/M: SY='N';  M= -6, 28,-22, 23,  3,-25, -6, 18,-25, -3,-26,-18, 32,-16,  0, -5,  5, -5,-25,-36,-13,  1;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G';  M= -2,-13,-28,-13,-20,-23, 53,-20,-30,-22,-17,-13, -5,-22,-20,-20, -5,-18,-23,-20,-25,-20;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='N';  M= -5,  4,-12, -2, -3, -9, -8,  0, -4, -3, -3,  3,  9,-11,  4, -3, -1,  1, -8,-17, -6,  0; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='V';  M=  0,-18, -7,-18,-18,  0,-18,-18, 19,-12,  6,  6,-18,-18,-18,-12, -6,  0, 29,-18, -6,-18; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F';  M=-12,-18,-12,-24,-18, 48,-18,-12,  0,-18,  6,  0,-12,-18,-24,-12,-12, -6,  0,  6, 18,-18; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='G';  M=  0, -6,-18, -6,-12,-18, 42,-12,-24,-12,-18,-12,  0,-12,-12,-12,  0,-12,-18,-12,-18,-12; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L';  M= -6,-18,-13,-19,-13,  5,-19,-13, 14,-18, 28, 12,-17,-17,-12,-13,-17, -6,  8,-12,  0,-13; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 11,  0,-15,  2,  0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-30, -1, 11,-31,-20, -6,-28, 42,-28, -8,  0,-11, 18, 30, -8,-10,-22,-20,-10, 14;
/M: SY='N';  M=  6, 10,-19,  2,  2,-24, -6, -4,-20,  5,-25,-14, 18,-13,  7,  0, 12,  2,-18,-30,-17,  4;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='S';  M=  0,  0,-13, -3,  0,-16, -8, -3, -9, -4,-14, -4,  6,-10,  9, -4, 13,  7, -9,-24,-11,  4; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='C';  M=  4,  0, 33,-11,-10,-23,-15,-12,-21,-12,-20,-14,  4,-24, -3,-14,  1, -5,-16,-36,-22, -7;
/M: SY='T';  M=  4, -6,-14,-10, -7,-14,-15,-17,-10, -2,-13, -9, -3,-13, -7, -6, 13, 20,  1,-29,-13, -7;
/M: SY='G';  M= 12, -8,-22,-12,-16,-24, 39,-20,-28,-16,-22,-16, -2,-16,-16,-18,  6, -4,-18,-22,-24,-16;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M= -8,-15,-28,-13, -4,-15,-26,-19,  5,-14, -5, -1,-16, 12,-10,-18,-10, -7,  1,-28,-15,-10;
/M: SY='B';  M=  7, 13,-18, 12,  0,-19, -6, -4,-20, -6,-21,-17, 11,-14, -4,-11, 11,  1,-15,-27, -8, -3;
/M: SY='V';  M=  4,-20,-19,-23,-17,-10,-25,-24, 13, -4, -1,  4,-18,-20,-15,-10, -9, -4, 21,-24,-10,-17;
/M: SY='B';  M= -9, 16,-24, 14,  9,-21,-16, -6,-11, -5,-15,-11, 13,-13, -1,-10,  0, -2,-13,-32,-15,  3;
/M: SY='D';  M=-11, 18,-28, 27,  8,-32,  5, -9,-32,  3,-26,-20,  6,-13, -4, -6, -3,-12,-22,-30,-20,  2;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-19,-34,-28, 53,-30,-16,  7,-24,  8,  2,-22,-30,-33,-18,-18, -8, 10,  4, 29,-28;
/M: SY='N';  M=  6, 22,-16,  6, -4,-18, -3, -2,-16, -4,-22,-16, 34,-16, -4, -6, 12,  8,-18,-34,-18, -4;
/M: SY='K';  M= -7, -3,-27, -3,  9,-30,-18, -3,-25, 26,-23, -7,  0,-12, 23, 26, -3, -6,-21,-21,-11, 15;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='A';  M= 23,-18,-14,-25,-15,  4,-12,-20, -2,-18,  7, -2,-16,-18,-17,-20, -3, -3,  2,-16, -7,-15;
/M: SY='T';  M= -2,  6,-13,  3, -5,-16,-17,-16,-14, -9,-14,-13,  3,-11, -8,-11, 17, 33, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='C';  M= -2, -7, 21, -7,  0,-22,-16,-16,-24,-13,-24,-19, -5, -5, -7,-15, 11,  5,-15,-39,-23, -4;
/M: SY='D';  M=-12, 23,-23, 26,  2,-25,-13, -6,-18,  1,-21,-16, 16,-17, -6, -5, -1, -5,-10,-35,-16, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	34 in 34 different sequences
Number of true positive hits	34 in 34 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CV ZBD
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

34 sequences

R1AB_AMV79  (F8RL29), R1AB_BC133  (P0C6W1), R1AB_BC279  (P0C6V9),

R1AB_BC512  (P0C6W0), R1AB_BCHK3  (P0C6W2), R1AB_BCHK4  (P0C6W3), 
R1AB_BCHK5  (P0C6W4), R1AB_BCHK9  (P0C6W5), R1AB_BCRP3  (P0C6W6), 
R1AB_BEV(P0C6V7), R1AB_BRV1   (P0C6V8), R1AB_CVBEN  (P0C6W7), 
R1AB_CVBLU  (P0C6W8), R1AB_CVBM   (P0C6W9), R1AB_CVBQ   (P0C6X0), 
R1AB_CVH22  (P0C6X1), R1AB_CVHN1  (P0C6X2), R1AB_CVHN2  (P0C6X3), 
R1AB_CVHN5  (P0C6X4), R1AB_CVHNL  (P0C6X5), R1AB_CVHOC  (P0C6X6), 
R1AB_CVM2   (P0C6X8), R1AB_CVMA5  (P0C6X9), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0), 
R1AB_CVPPU  (P0C6Y5), R1AB_FIPV   (Q98VG9), R1AB_IBVB   (P0C6Y1), 
R1AB_IBVBC  (P0C6Y2), R1AB_IBVM   (P0C6Y3), R1AB_MERS1  (K9N7C7), 
R1AB_PEDV7  (P0C6Y4), R1AB_SARS   (P0C6X7), R1AB_SARS2  (P0DTD1), 
R1AB_WBV24  (Q008X6)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

58 PDB

5RL6; 5RL7; 5RL8; 5RL9; 5RLB; 5RLC; 5RLD; 5RLE; 5RLF; 5RLG; 5RLH; 5RLI; 5RLJ; 5RLK; 5RLL; 5RLM; 5RLN; 5RLO; 5RLP; 5RLQ; 5RLR; 5RLS; 5RLT; 5RLU; 5RLV; 5RLW; 5RLY; 5RLZ; 5RM0; 5RM1; 5RM2; 5RM3; 5RM4; 5RM5; 5RM6; 5RM7; 5RM8; 5RM9; 5RMA; 5RMB; 5RMC; 5RMD; 5RME; 5RMF; 5RMG; 5RMH; 5RMI; 5RMJ; 5RMK; 5RML; 5RMM; 5ROB; 6JYT; 6ZSL; 7CYQ; 7NIO; 7NN0; 7NNG
» more