PROSITE entry PS51653
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | CV_ZBD |
Accession [info] | PS51653 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-AUG-2012 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 13-SEP-2023 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51652 |
Associated ProRule [info] | PRU00986 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Coronaviridae zinc-binding (CV ZBD) domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=84; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=79; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6085346; R2=0.0097928; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9030.4951172; R2=6.8697047; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=704; H_SCORE=13867; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=398; H_SCORE=11765; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 35, -6,-10,-12, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 22, 8, -4,-28,-20, -6; /M: SY='C'; M= 7, -6, 11,-14,-18,-18, 2,-18,-15,-16,-16,-12, 0,-24,-18,-18, 0, -6, -5,-32,-22,-18; /M: SY='G'; M= -8,-18,-26,-22,-24, 13, 31,-20,-24,-24,-14,-12, -8,-24,-28,-20, -8,-16,-18, -8, -7,-24; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='V'; M= 7,-26,-12,-28,-24, -1,-25,-26, 21,-20, 16, 9,-26,-26,-24,-20,-11, -2, 32,-26,-10,-24; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='F'; M= -8,-30,-14,-34,-30, 31,-30,-26, 18,-24, 10, 6,-26,-30,-34,-20,-14, -4, 31,-14, 6,-30; /M: SY='C'; M= -4,-26, 41,-30,-30, -8,-30,-30, 7,-24, -2, -2,-26,-34,-30,-24,-10, -4, 27,-38,-18,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M= -4, -2,-28, -2, -5,-26, 8,-12,-25,-10,-30,-20, 6, 25, -8,-14, 5, -5,-26,-32,-26, -8; /M: SY='N'; M= 2, 16,-14, 8, 0,-20, 0, -2,-20, -6,-30,-20, 29,-14, 0, -6, 28, 12,-18,-40,-20, 0; /M: SY='Q'; M=-10, -8,-34, -4, 12,-36,-20, -2,-20, 2,-24, -8, -8, 29, 33, -2, -4,-10,-30,-24,-18, 21; /M: SY='T'; M= 19, -4,-10,-14,-10,-14,-12,-20,-10,-10,-10,-10, -4,-10,-10,-14, 16, 31, 0,-26,-14,-10; /M: SY='V'; M= 0,-25,-14,-27,-25, -4,-27,-26, 25,-20, 5, 7,-21,-24,-23,-20, -3, 2, 35,-30,-10,-25; /M: SY='L'; M= -2,-18,-16,-18,-12, -2,-18,-16, 4,-22, 19, 4,-14,-22,-12,-16, -3, 2, 2,-28, -8,-12; /M: SY='R'; M=-12,-18,-22,-18,-12,-12,-24,-12, -7, 11, -8, -2,-12,-24, -6, 35,-10, -6, 7,-24,-10,-12; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -4, -2,-30, 2, 11,-30, 35,-12,-36, -8,-26,-20, 0,-12, -4,-12, 0,-16,-30,-24,-26, 3; /M: SY='D'; M= -9, 23,-24, 28, 28,-28,-10, 0,-28, 2,-26,-22, 19, -8, 8, -4, 9, -3,-26,-36,-20, 18; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M=-14,-26,-28,-30,-24, 14,-34, -8, 24,-22, 19, 12,-22,-26,-16,-20,-22,-10, 10, -1, 31,-24; /M: SY='R'; M=-12,-18,-22,-18,-12,-12,-24,-12, -7, 11, -8, -2,-12,-24, -6, 35,-10, -6, 7,-24,-10,-12; /M: SY='P'; M=-12,-10,-34, -6, 4,-28,-20,-12,-26, 22,-28,-14, -8, 27, 2, 20,-10,-10,-24,-24,-18, 0; /M: SY='P'; M=-10,-24,-32,-18, -8,-14,-24,-20, -4,-18, 1, -4,-24, 43,-14,-20,-18,-10,-14,-26,-18,-14; /M: SY='P'; M=-12,-24,-28,-24,-14, 7,-24,-15, 0,-18, 4, 9,-22, 19,-16,-18,-18,-10, -8,-18, -6,-16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M= 16,-12, 40,-22,-18,-18,-16,-24,-18,-18,-14,-14,-12,-22,-18,-22, 5, 8, -4,-34,-22,-18; /M: SY='K'; M=-14, -8,-30, -8, -2, -7,-24, 2,-18, 27,-18, -6, -8,-18, 2, 14,-14,-10,-16, -1, 25, -2; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M= 11,-16, 9,-22,-18, -1,-18, -7,-10,-14, -8, -8,-16,-24,-14,-18, -6, -6, -6, -7, 17,-18; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='D'; M=-12, 19,-22, 31, 1,-24,-18,-12,-13, -8,-14,-14, 1,-18,-12,-14, -4, -6, 1,-36,-16, -6; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='M'; M= -8,-26,-16,-32,-26, 18,-26,-16, 19,-18, 14, 27,-24,-26,-21,-16,-16, -6, 23,-17, 3,-22; /M: SY='H'; M= -6,-14,-26,-18,-16,-15, -4, 2, 1,-20, -9, 0, -4,-18,-10,-18, -3, -9, -3,-26, -6,-16; /M: SY='T'; M= 4, 0,-10, -6, -6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14, 4,-10, -6,-10, 28, 38, -4,-34,-14, -6; /M: SY='D'; M=-12, 39,-24, 47, 12,-32, -6, 0,-32, -2,-30,-26, 26,-12, 0, -8, 10, -2,-26,-40,-20, 6; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='K'; M= -6, -4, 2, -6, 0,-26,-18,-14,-28, 23,-28,-14, -2,-16, 0, 11, 0, -4,-16,-30,-16, 0; /M: SY='Y'; M=-14, -2,-26, -9, -7, 8,-20, -3,-16, 11,-16, -8, 4,-20, -7, 5,-10, -8,-16, -8, 13, -7; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='L'; M= -6,-18,-12,-18,-12, 6,-18,-12, 12,-18, 31, 12,-18,-18,-12,-12,-18, -6, 6,-12, 0,-12; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='S'; M= 15, -2, -6, -5, -2,-12, 0, -8,-10, -6,-14,-10, 2, -6, -2, -8, 18, 8, -4,-20,-12, -2; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='I'; M= -8,-14,-26,-15, 5,-12,-30,-18, 15,-13, 3, 3,-14,-14, -6,-17,-10, -8, 10,-26,-10, -3; /M: SY='D'; M= -8, 28,-20, 29, 5,-25, -8, -4,-25, -4,-25,-22, 22,-12, -2, -8, 14, 11,-20,-38,-18, 2; /M: SY='P'; M=-10,-12,-36, -6, 4,-30,-20,-16,-24, 13,-30,-16,-12, 51, -2, -1,-10,-10,-26,-26,-22, -2; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 49,-30, 4, 0,-18, 4, 0,-20,-30,-22,-14,-20,-10, -6, 22, 61,-24; /M: SY='V'; M= -6,-18,-22,-20,-14,-12,-28,-22, 11, 5, -3, 4,-16,-20,-12, -3,-12, -6, 19,-24, -8,-14; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='N'; M= -8, 7,-22, -2, -6, -2,-10, -6,-16,-10,-22,-16, 19, 1,-10,-10, 6, 0,-20,-28,-12, -8; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10, -2, 2,-14, -9, -4,-10, -2,-12, -6, 2, -6, 10, -2, 12, 13, -8,-18, -8, 6; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='P'; M= -2,-10,-14, -8, -4, -8,-10,-10, -4,-10, -2, -4, -7, 8, -6,-10, 1, 1, -6,-19,-10, -6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='G'; M= 0, -6,-18, -6,-12,-18, 43,-12,-24,-12,-18,-12, 0,-12,-12,-12, 0,-12,-18,-12,-18,-12; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -6, 12,-28, 11, -8,-30, 40,-10,-35,-12,-30,-22, 17,-18,-12,-14, 2,-14,-30,-28,-26,-10; /M: SY='Q'; M= -6,-10,-22, -8, 8,-22,-24, -8, -2, -2, -8, 0,-12,-16, 15, -4, -4, -6, 3,-26,-12, 12; /M: SY='B'; M= -2, 34,-22, 31, 6,-28, -4, 0,-26, -2,-26,-22, 30,-14, -2, -8, 6, -4,-24,-36,-20, 2; /M: SY='D'; M=-18, 48,-28, 60, 16,-36, -8, 2,-36, 0,-30,-28, 28,-12, 0, -8, 2, -8,-30,-40,-20, 8; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='T'; M= -8, -4,-18,-10, -6,-14,-20,-12,-18, 6,-14,-10, 0,-14, -2, 21, 8, 27, -8,-26,-10, -6; /M: SY='K'; M=-10, 4,-30, 8, 29,-30,-20, -6,-30, 34,-26,-14, 0, -6, 14, 18, -6,-10,-24,-24,-14, 22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 12, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='G'; M= 0,-18,-22,-18,-24,-18, 31,-24,-13,-20,-14, -8,-12,-24,-24,-20, -4,-12, 1,-24,-22,-24; /M: SY='G'; M= -4,-18,-26,-18,-20,-14, 31,-20,-17,-24, 1, -4,-12,-24,-20,-20,-12,-16,-14,-20,-18,-20; /M: SY='M'; M=-10, 1,-20,-11,-12, -5,-15, -1, 4,-11, 7, 20, 9,-22, -5, -8,-11, -6, -6,-28, -8, -8; /M: SY='N'; M= -2, 25,-16, 12, 0,-20, 0, 2,-20, -4,-30,-20, 41,-16, 0, -4, 22, 8,-22,-40,-20, 0; /M: SY='Y'; M= -8,-12,-22,-12,-12, 11,-18, 8, -8,-10,-12, -8, -8,-22, -6,-10, 3, 2,-10, 3, 41,-12; /M: SY='Y'; M=-16,-26,-28,-32,-26, 29,-34, -8, 19,-22, 10, 8,-20,-26,-20,-20,-20,-10, 8, 6, 39,-26; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='M'; M= -6,-17,-23,-19,-10,-12, -8,-17, 7,-15, 0, 10,-15,-19,-11,-16,-10,-10, 8,-24,-12,-11; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M=-14, 29,-28, 33, 16,-36,-12, 6,-28, 4,-26,-16, 20,-12, 23, 0, 2, -8,-30,-32,-16, 20; /M: SY='H'; M=-16, -8, 28,-12,-12,-20,-24, 49,-30,-18,-20, -8, -2,-28, -6,-12,-10,-16,-22,-38, 1,-12; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10, 0,-12, 10, 38,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='P'; M= -6, -4,-30, -2, 0,-26,-12,-12,-20, -8,-30,-20, 2, 49, -6,-14, 3, -2,-26,-34,-26, -6; /M: SY='C'; M=-12, -8, 28,-12, -6,-26,-24, 11,-28, -2,-22,-10, -5,-24, 3, -4, -8,-12,-20,-34,-11, -2; /M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-28,-24, 10,-30,-17, 20,-23, 26, 13,-28,-30,-22,-18,-20, -6, 22,-15, 10,-24; /M: SY='S'; M= 2, 4,-18, 8, 23,-24, -8, -6,-24, -2,-26,-20, 6, -6, 8, -6, 24, 8,-18,-36,-20, 16; /M: SY='F'; M= -6,-18,-18,-24,-18, 25,-20,-18, 2,-22, -3, -4, -8,-20,-20,-18, 3, 2, 2,-16, 4,-18; /M: SY='P'; M=-14, 11,-34, 23, 10,-34,-16,-10,-30, 5,-30,-22, -1, 33, -3, -7, -6,-10,-28,-32,-23, 1; /M: SY='L'; M=-14,-22,-24,-22,-12, -2,-26,-12, 1, -7, 23, 8,-18,-26, -8, 15,-22,-10, -2,-20, -4,-12; /M: SY='V'; M= -6,-28, 16,-30,-26, -1,-30,-26, 12,-26, 19, 7,-28,-32,-26,-22,-18, -6, 21,-31,-11,-26; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 33 in 33 different sequences |
Number of true positive hits | 33 in 33 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | CV ZBD |
Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
33 sequences
R1AB_BC133 (P0C6W1), R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BC512 (P0C6W0), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCHK4 (P0C6W3), R1AB_BCHK5 (P0C6W4), R1AB_BCHK9 (P0C6W5), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_BEV(P0C6V7), R1AB_BRV1 (P0C6V8), R1AB_CVBEN (P0C6W7), R1AB_CVBLU (P0C6W8), R1AB_CVBM (P0C6W9), R1AB_CVBQ (P0C6X0), R1AB_CVH22 (P0C6X1), R1AB_CVHN1 (P0C6X2), R1AB_CVHN2 (P0C6X3), R1AB_CVHN5 (P0C6X4), R1AB_CVHNL (P0C6X5), R1AB_CVHOC (P0C6X6), R1AB_CVM2 (P0C6X8), R1AB_CVMA5 (P0C6X9), R1AB_CVMJH (P0C6Y0), R1AB_CVPPU (P0C6Y5), R1AB_FIPV (Q98VG9), R1AB_IBVB (P0C6Y1), R1AB_IBVBC (P0C6Y2), R1AB_IBVM (P0C6Y3), R1AB_MERS1 (K9N7C7), R1AB_PEDV7 (P0C6Y4), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), R1AB_WBV24 (Q008X6)» more
|
PDB [Detailed view] |
58 PDB
5RL6; 5RL7; 5RL8; 5RL9; 5RLB; 5RLC; 5RLD; 5RLE; 5RLF; 5RLG; 5RLH; 5RLI; 5RLJ; 5RLK; 5RLL; 5RLM; 5RLN; 5RLO; 5RLP; 5RLQ; 5RLR; 5RLS; 5RLT; 5RLU; 5RLV; 5RLW; 5RLY; 5RLZ; 5RM0; 5RM1; 5RM2; 5RM3; 5RM4; 5RM5; 5RM6; 5RM7; 5RM8; 5RM9; 5RMA; 5RMB; 5RMC; 5RMD; 5RME; 5RMF; 5RMG; 5RMH; 5RMI; 5RMJ; 5RMK; 5RML; 5RMM; 5ROB; 6JYT; 6ZSL; 7CYQ; 7NIO; 7NN0; 7NNG » more |