PROSITE entry PS51688

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ICA
Accession [info]	PS51688
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-SEP-2013 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51688
Associated ProRule [info]	PRU01025

Name and characterization of the entry

Description [info]

Intramolecular chaperone auto-processing (ICA) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=102;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=97;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1746131; R2=0.0059309; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13667.4316406; R2=4.3975220; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1236; H_SCORE=19103; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=898; H_SCORE=17616; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-50; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='S';  M=  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,121,  *,  *,  *,  *;
/M: SY='D';  M=-24,-53,101, -3,-60,-34,-18,-57,-20,-50,-54, -9,-41,-20,-37, -3, -9,-53,-73,-44;
/M: SY='R';  M= 22,-49,-22, 17,-39,-17,-35, 17, 11, -8,-14,-25,-44,  2, 47,-12,-33, -8,-47,  3;
/M: SY='R';  M=-22,-53, -4,-17,-50,-43,-28,-48, 21,-46,-28,  3,-46,-17, 90, -9, -1,-47,-52,-38;
/M: SY='L';  M= -8,-31,-24,-21, 24,-52,-26, 19,-24, 46, 16,-37,-52,-28,-40,-24,-12,  7,-23, 31;
/M: SY='K';  M=  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,122,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *,  *;
/M: SY='T';  M=-19,-37,  9, 32,-37,-42, 30,-33, 24,-40,-15,  5,-38, 10,  9,  3, 51,-35,-55, -8;
/M: SY='N';  M=-19,-47, 56,  9,-46,-10,  0,-28,-18,-49,-44, 79,-25,-22,-25, -6,-19,-28,-45,-33;
/M: SY='I';  M=-37,-50,-55,-32,  8,-49,-31, 77,-36,  6,-14,-49,-11,-47,-32,-39,-28, 33,-48,-30;
/M: SY='Q';  M= -6,-49,-18, 35,-43,-17, -5,-20, 32,-37,-36, -4,-40, 38, 29,  0, 13, -4,-53,-40;
/M: SY='D';  M=-16,-51, 49, 24,-41,-24, -7,-34,  6,-41,-17, 15, 46,-15,-10,  1, 11,-23,-56,-10;
/M: SY='I';  M=-11,-19,-22,-44, -9,-53,-47, 53,-42, 30, 12,-28,-26,-36,-43, -3,-13, 29, -9, -4;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
/M: SY='D';  M=-15,-67, 15,-14,-70,-13,-33,-57,-25,-55,-60, -7, 14,-12,-55, -1, 11,-36,-78,-63; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-55;
/M: SY='D';  M=-17,-48, 33, 28,  6,-15,-13,-20,  6,-21,-29, -3, 10,  0, -8, 15, 19,-12,-52,-24;
/M: SY='D';  M= -4,-48, 44, 27,-48,  2,-16,-26,  3,-23,-29, 39,-14, -5,-11, 20,-20,-28,-56,-16;
/M: SY='A';  M= 48, -8,-14,-11,-18, 17,-10,-24,-36,-14,-13,-31,  5, 14,-24,  5,-17,  1,-25, -9;
/M: SY='L';  M=-21,-14,-21,-34, -8,-42,-42,  1,-35, 64,  4,-36,-45,-35,-34,-13,-20, -3, 26, -9;
/M: SY='D';  M=  6,-49, 57, 41,-42,-23,-21,-44, 12,-42,-27,  7,-27,  9, -1,  8, -1,-34,-58,-37;
/M: SY='K';  M=  8,-34,-19,-10,  2,-23,-24,  1, 45,-19,-12, 19,-25, -8, 26,-10, -7,  0,-49,-31;
/M: SY='I';  M=-23,-47,-46,-40,  4,-58,-42, 55,-44, 28, 17,-51,-52,-47,-43,-45,-22, 43, 50,-14;
/M: SY='M';  M= -9,-14,  5,  7,-23,-26,-11,-29, 21,  7, 40, 32,-44, -7, 25, 10,-14,-30,-51,-13;
/M: SY='Q';  M=  9,-49,  1, 11,-51,-15,-24,-47, 29,-21,-37, 15,-18, 53, 30, 11,-15,-38,-52,-34;
/M: SY='L';  M=-30,-45,-47,-42,-10,-46,-45, 35,-40, 51, 44,-43,-43,-38,-41,-36,-15, 27, 25,-17;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='R';  M=-29,-52, 14, 27,-47,-23, -2,-45, 24,-43,-28, 28, -1, 28, 51, -5, -4,-26,-55,-35;
/M: SY='P';  M=-13,-30,-48,-37,  9, 24,-18, 22,-44, 10, -3,-43, 58,-35,-49,-36, -6,  8, 28,-13;
/M: SY='V';  M=-15,  9,-32,-29,-13,-19, -5,  2, 30,-23, -6,-30,-41, -7, -1,-20, -3, 45,-42, 42;
/M: SY='T';  M=-23,-46,  5, 14,-16,-37, -4,-18, -3,-26,-15, -2,-40, 36,  5, 30, 45,-30, 14,  2;
/M: SY='Y';  M=-32,-35,-43,-50, 63,-42,-16,-31,-36,-26,-20,-42,-48,-42,-31,-40,-42,-36, 75, 99;
/M: SY='D';  M=-18,-50, 36,  5,-31,-32, 15,-23, 25,-29,-21, 35,-43, 20, 34, -6, -1,-21,-54, -5;
/M: SY='W';  M=-44,-55,-30,-38, 38,-51,-22,-20,  3,  8, 22,-40,-37,-33,  5,-33,-41,-27,103, 70;
/M: SY='K';  M=-25,-30, -9,-17,-37,-40,-21,  9, 64, -9,-23, 33,-43, -1, 21,-25, -5,-23,-51,-31;
/M: SY='D';  M= -8,-23, 44, 24,-43, -5, -4,-42,  2,-37,-41, 16, 26, -5, -5,  7, 16,-23,-55, -4;
/M: SY='D';  M=  1,-40, 44, 44,-39,-16,-15,-21, -1,-37,-32, 14,-13, 11, -4,  8, -6,-27,  6,-19;
/I:         I=-9; MD=-23;
/M: SY='W';  M=-16,-64,-49,-32,  1,-51,-59,  0,-28,-25, 12,-29,-26,-48,-54,-30,-18, 15, 23,  6; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-23;
/M: SY='A';  M=  7,-71, -6,  6,-22,-39,-31,-41,-18,-57,-49,-23,-19,-37,-29,-26,-33,-52,-70,-10; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E';  M=-21,-56,-42, 19,-74,-52,-35,-62,  3,-54,-14, 10,-24,-39,-23,-40,-41,-52, -9,-54; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-23;
/M: SY='G';  M=-34,-70, -2,-26,-40, 26,-45,-49, -2,-55,-28,-18,-28,-45,-26, -5,-24,-56,-34,-43; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-23;
/M: SY='R';  M=-32,-40, -9,-12,-40,  7,-30,-14, -6,-25,  9,-13,-12,-21, 16,-33,-17,-29,-46,-22; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-23;
/M: SY='E';  M=-21,-56, 34, 34,-39,  3,-14,-30, -2,-51,-49, 27, -4,-18,-10, -5,  0,-39,-63,-32; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='D';  M= -4,-53, 27, 12,-37,  6,-18,-30,  7,-34,-35, -5, 14,  7, -6,  8, -3,-19,-58,-23; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-23;
/M: SY='D';  M= 13,-40, 30, 19,-39, 11,  0,-13,  7,-19,-24, 18, -6,  4,-15, -1, -2,-29, -3,-10;
/M: SY='R';  M= -1,-51,  0, 12,-34,  4, 20,-17, 16,-37,-31, -7,  1,  2, 50,  0, -6,-13,-32,-38;
/M: SY='R';  M=-30,-50,-10, -3,-11,-32, 15,  4, 14, -8,-20, -2,  5, 10, 34,-16, 16,  9, 29, -5;
/M: SY='H';  M=-28,-43, 24, 33,-21,-19, 71,-33,  3,-31,-35, -1,-42, 39, 18,-17,-18,-17,-54,  0;
/M: SY='Y';  M=  5,-22,-31,-32, 25,-45,  3, 17,-26,  8, -1,-34,-23,-33,  6,-16, 20, 18, -1, 39;
/M: SY='G';  M=-20,-51,-40,-49,-47, 90,-31,-59,-39,-51,-35,-26,-17,-41,-45,-16,-41,-37, -9,-49;
/M: SY='F';  M=-30,-45,-57,-36, 70,-49,-45, 10,-43, 28, 15,-42,-16,-43,-48,-45,-32, 35, 10,  2;
/M: SY='I';  M=-35,-49,-56,-53,-18,-49,-54, 80,-45, 14,  9,-47,-27,-47,-53,-21,  6, 16,-49,-32;
/M: SY='A';  M= 80,-10,-42,-31,-48,-24,-44,-20,-37,-34,-34,-37,-41,-27,-42,-11, -1, -8,-51,-45;
/M: SY='Q';  M=-31,-57,  3, 20,-60,-27, 18,-42, -5,-42,-34, -6,-31,105,-18,-25,-36,-44,-50,-36;
/M: SY='E';  M=-29,-55, 61, 71,-57,-40,-19,-56,-16,-52,-47, -2,-36, 36, -5,-25,-27,-46,-58,-26;
/M: SY='V';  M=  7,-42,-54,-41,  5,-53,-50, 24,-47, 31,  9,-49,-51,-46,-41,-27, -2, 58,-52,-31;
/M: SY='Q';  M=  3,-52,  4, 47,-29,-34, -1,-12, 19,-31,-12,-11,-23, 56,  9,-25,-22,-17,-50,-14;
/M: SY='E';  M= 14,-49, 17, 52,-41,-33,-21,-48, 33,-30,-40,-16,-18, 30, -1, -2,  6,-40,-53,-33;
/M: SY='V';  M= 18,-44,-32,-30,-30,-50, -6, 40,-41, -1,-19,-36,-49,-21,-37,-26,-14, 60,-23,-14;
/M: SY='F';  M= -6,-10,  0,-29, 48,-38,-22, 19,-44, 33, 19,-13,-38,-28,-38,-19,-35, -1,-20, 27;
/M: SY='P';  M=-28,-58, -8,  3,-50, -9,-31,-29, -7,-36,-41,-13, 98,-10,-26,-16, -4,-41,-54,-50;
/M: SY='E';  M=-16,-51, 33, 58,-26,-31,  8,-38,  6,-28,-32, 19,-38, 21,-16,  6, -9,-29, -5,-11;
/M: SY='A';  M= 40, -7,-26,-15, -3,-24, 21,  5,-24, 10, -5,-20,-27,-23,-22,-11,-20,  9, -9, 26;
/M: SY='V';  M= -5,-43,-32,-21,-23, 24,-50,  0,-35,-13,-25, -9,-29,-27,-40,-24,-10, 68,-38,-39;
/M: SY='K';  M= -7,-27,  7,-11,-12,-15, 16,  1, 22,  7, -9,  0,-15,-16,  8,  6,  8, -8,-48, 10;
/I:         I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
/M: SY='D';  M=-29,-22, 64, 29,-36,  0,-16,-21,  0,-29,-22, -5,-16, -8,-14,  5,  8, -8,-60,-42;
/M: SY='P';  M= 11, -8,  3,  4, -6, -2, -4,-12, -6,-27, -6, -7, 42,-25,-14,  9, 15, -7, -1, -9;
/M: SY='E';  M=-23,-29, 25, 30, -4, 28,-15, -3, 12,-32,-29,  7,-11,  4,-11,  6,-13,-21,-51,-20;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='D';  M=-56,-43, 49,  0, -3,-35,-37,-25,-56,-32,-57,-40,-54,-40,-62,-42,-49, -8,-74,-19; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-6;
/M: SY='D';  M=-44,-66, 41, 28,-63,-49,-28,-24,-46,-45,-33, -8,-53,-10,-53,-18,-46, 13,-78,-47; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-6;
/M: SY='S';  M=-31,-59,-36,-14,-31,-49,-49,-37, 14,-31,  4,-24,-19,-26,-11, 29, 22,-35,-24,-32; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='G';  M=-48,-76,-40,-47,-51, 60,-49,-66,-51,-71,-70,-40,-37,-39,-71,-40,-56,-77,-72,-49; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-6;
/M: SY='N';  M=-43,-65,  1, 27,-58,-41,-48,-53, -5,-51,-27, 28,-19, -6,-27,-24, 15,-48,-75,-60; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='D';  M=-34,-72, 23, 18,-46,  0,-55,-32,-26,-52,-36,-19,  1,-34,-42,-22,-35,-45,-75,-42; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-6;
/M: SY='D';  M=-18,-50, 52, 19,-42, 40,-29,-32, -8,-45,-44, 23,-20,-26, -8,  1, -2,-21,-56,-18;
/M: SY='Y';  M=-13, -4,-33,-26, 31,-26, -1, 14,-12,  3, 14,-16,-20,-12, 22,-13,  4,  4, -8, 37;
/M: SY='Y';  M=-26,-50,-24,-13, -4,-40, 13,-21, 26, 37, 15,-20,-39, 19,-12,-27,-26,-22, 31, 47;
/M: SY='S';  M= 10, -8,-31,-16,-36, 34,-18,-20,-23,-23,-20, -5,-42,  9,-24, 42, 19,  0,-52,-10;
/M: SY='V';  M=-23,-45,-42,-29,  2,-57,-49, 34,-34, 28, 18,-50,-18,-35,-25,-40,-31, 59,-50,-15;
/M: SY='D';  M= -7,-49, 58,  2,-51,-21,-27,-42,  4,-33,-19, 48,-34,  5, 34,  8,-21,-47,-60,-30;
/M: SY='Y';  M=-16,-52, -4,-13, -8,-40, -2,-13,  4,-13,  0, -6, 15,-11,-25,-13, -3,-24,-23, 88;
/M: SY='D';  M= -7,-47, 39, 21,-33,  1,-12,-14,-21,-22, -7, 23,-25, 12,-15, 24, 13,-16,-56,-20;
/M: SY='E';  M= 15,-49, -2, 32,-44, 15,-19,-41,  2,-23, -8,  0,  3, 29, 26,  0,-19,-23,-51,-21;
/M: SY='L';  M=-26, -1,-55,-32, 17,-57,-46, 39,-41, 48, 29,-38,-53,-30,-48,-32,-22, 27,-46,-16;
/M: SY='I';  M=-11,-46,-31,-45, 19,-17,-20, 44,-28, 14, -3,  1,-49,-11,-45, -8,  4, 30,-18, -1;
/M: SY='P';  M= 31,-19,-37,-19,-33,-10,-41, -6,-15, -2, 29,-26, 57,-27,-34, -7,-13,  6,  3, -8;
/M: SY='Y';  M=-11,-49, 14, 11,  4,-46,-21,  9,-12, 27,  0,-35, 24,-20,-33,-36,-24, 18,  2, 27;
/M: SY='L';  M=  6,-44,-41,  3,-21,-18,-28, 10,-34, 50, 12, 17,-49,-16,-36,-18, -1,-13,-49,-18;
/M: SY='I';  M=  6,-45,-44,-37,-11,-45,-31, 45,-33, 11, 22,-43,-30, -4,-39,-16, 11, 41,-15, -9;
/M: SY='E';  M= 32,-47,-20, 33,-48, 17,  0,-44, 31,-25,-13,  2,-16,  7, -9,-11,-22,-24,-50,-14;
/M: SY='A';  M= 66, -4,-41,-17,-26,  3,-14,-25,-23,-24, -9,-35,-42,-22,-40,  8, -8, -8, -5, -7;
/M: SY='I';  M=-22,-26,-40,-27,  6,-56,-22, 49,-44, 27,  0,-38,-49,  9,-46,-34, 11, 38,-31,-17;
/M: SY='Q';  M=-25,-54,-17,  2,-46,-33,  0,-32, 53,-37,-35, -3,-41, 82, 22,-19,-31,-36,-49,-37;
/M: SY='E';  M= -5,-35,  6, 73,-51,-32,  5,-45,  5,-34,-41,-19,-30, 30,  5,-12,-10,-40,-13,-16;
/M: SY='L';  M=-10,-36,-33, -6,-22,-50, -2, -1,-13, 49, 11,-16,-49, 37,  5,-24,-17,  0,-49,-23;
/I:         I=-21; MD=-53;
/M: SY='Q';  M= -9, -1, 22,  1,-30,-33, 18,  2,  4,-13, -8,  9,-45, 35,-20,  8,  6,-19,-33, 11; D=-21;
/I:         I=-21; MD=-53;
/M: SY='K';  M= 26,-49,  3, 18,-44,-28,-11,-29, 38,-33,-10, -2,-42, 18, 17, -8,  2,-36,-55,-42; D=-21;
/I:         I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
/M: SY='R';  M=-27,-40,-22, 40,-36,-46,-12,-30, 36,-16, -6,-18,-44, 29, 46,-19,-19,-26,-53,-41; D=-21;
/I:         I=-21; DM=-53;
/M: SY='I';  M=-29,-33,-41,-46,-15,-49,-19, 55,-44, 25,  6, -3,-38,-34,-23,-29,  3, 40,-34,-15;
/M: SY='D';  M=  6,-50, 48, 47,-52,-33,-31,-27, 21,-24,-40, 16,-25, 17, -5, -7,-11,-31,-57,-43;
/M: SY='E';  M= 30,-46,  4, 43,-36,-29,-14,-41, 21,-39,-34, 24,-25,  9,  1,  4, 11,-33,-54,-42;
/M: SY='L';  M=-32,-35,-37,-25,-12,-56,-28,  6,-40, 66,  7,-35,-43, 12,-26,-28,-20, -1,-47,-25;
/M: SY='E';  M=-26,-34, -2, 67,-46,-34,-27,-33, 45,-38,-41, -8,-23, 28, -5,-11,-17,-29,-52,-33;
/M: SY='E';  M= 25,-46, 15, 36,-45,-19, -9,-39, 10,-30,-39,  4,-28, 21, -6, 25, 10,-32,-19,-26;
/M: SY='R';  M=-18,-52, -7, 44,-45,-27,  1,-25, 39,-29,-10,-11,-40, 26, 48,-18,-10,-35,-51,-31;
/M: SY='I';  M=-25,-45,-46,-46,-19,-32,-33, 40,-26, 39, 19,  5,-44,-19,-28,-28, -9, 33,-49, -4;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	26 in 26 different sequences
Number of true positive hits	26 in 26 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Bacteriophages, Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	peptidase S74
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

26 sequences

DEPOL_BPK05 (S6C8R9), DPO23_BPK64 (A0A0A8JA06), DPOL1_BPK32 (D1L2X0),

FIB11_BPE32 (B0FIH7), FIB37_BPAR1 (Q9G0B5), FIB37_BPK3  (Q38394), 
FIB37_BPM1  (P08231), FIB37_BPOX2 (P08232), FIB37_BPS16 (M1EAS5), 
FIB37_BPT2  (P07067), FIBER_BPK1E (P49714), FIBER_BPK1F (Q04830), 
FIBER_BPK5  (O09496), FIBL1_BPT5  (P13390), MRFA_DICDI  (Q54PT9), 
MRFL_BOVIN  (F1N4M2), MRFL_HUMAN  (Q96LU7), MRFL_MOUSE  (Q3UN70), 
MYRF1_CAEEL (G5EFI7), MYRF2_CAEEL (D9PTN5), MYRF_HUMAN  (Q9Y2G1), 
MYRF_MOUSE  (Q3UR85), MYRF_XENLA  (Q66IV1), VP1_MPRVN   (Q1I0V1), 
Y3934_DICDI (Q54B29), Y9218_DICDI (Q1ZXA9)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

3 PDB

3GW6; 6F45; 7DC3