Home  |  Contact
Entry: PS51700

General information about the entry

Entry name [info] SEPARIN
Accession [info] PS51700
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2014 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51700
Associated ProRule [info] PRU01037

Name and characterization of the entry

Description [info] SEPARIN core domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=96;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=91;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5120753; R2=0.0072149; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=15290.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1108; H_SCORE=15290; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=692; H_SCORE=15290; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='P';  M=  0,-40, -4,  2,-26, -5,-22, -3, 18, -8,-12,-17, 49,-10,  9,  3, -4,-17,-18,-30;
/M: SY='C';  M=-13, 21, 15,  2,-25, -6, -3,-33, 20, -5,-17, 10,-22, 10, 21, 20, -1,-29,-28,-21;
/M: SY='N';  M=-12,-37, 17, -7,-39,-15,-15,-27, 21,-26,-13, 44,-32, 15, 32, 25, -7,-33,-46,-30;
/M: SY='G';  M= 11,-13,-31,-29,-10, 39,-34,  4,-28, -6,-20,-12,-20,-29, -7, -4, 23, 14,-41,-29;
/M: SY='F';  M=-10,  4,-35,-33, 58,-29,  3, -5,-24,-11, -5,-19,-39,-27, -2, 11, 13,-18,-11, 49;
/M: SY='Y';  M=-26, 31,-27,-36, 41,-39,-11,-16,-30, -8,  8,-33,-45,-28,-18, -6,-18,-23,  3, 89;
/M: SY='V';  M=-22,-20,-47,-41,-12,-49,-42, 45,-38, 32, 16,-41,-42,-37,-28,-29,-15, 49,-42,-21;
/M: SY='L';  M=-28,-24,-46,-40, -8,-48,-27, 36,-28, 55,  3,-42,-44,-34,-38,-22,-19, 17,-36, -5;
/M: SY='N';  M=-27, -4, 36, -7,-41,-18,-10,-36, -9,-41,-34, 88,-29,-14, -3,-11,-13,-41,-59,-35;
/M: SY='P';  M=-25,-52,-14,-18,-34,-31,-23,-28,-22,-44,-22,-33,105,-13,-36,-11,-22,-38,-43,-42;
/M: SY='S';  M= -3,-35, 26, 16,-40, 19, 25,-38,-12,-29,-31, 10,-20,  3,-22, 40,  2,-27,-47,-27;
/M: SY='G';  M=  4,-37, -7,-24,-40, 63,-14,-40, -1,-37,-33, 23,-32,-17,-16, 10,-13,-38,-40,-18;
/M: SY='D';  M=-16,-21, 82, -3,-46,-20,-16,-42,-18,-45,-40, 48,-33,-18,-20, -9,-18,-25,-63,-34;
/I:         I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
/M: SY='L';  M=-24,-33,-48,-40,  3,-49,-32, 10,-41, 67, 17,-46,-35,-34,-38,-40,-27, -3,-33, -8;
/M: SY='P';  M=  0,-22,-14, -6,-30, -5,-12,-11, 23,-23, -3,-10, 32, 11,  4, 15, 11, -1,-42,-30;
/M: SY='R';  M=-15,-38,  9,  0,-35,  3, 26,-41, 20,-35,-20, 33,-25,  6, 38, 19, -2,-37,-46,-28;
/M: SY='T';  M=-12,-17,-22,-24,-27,-10,-28,-23,-18,-23, 13, -1,-26,-10,-22, 23, 74,-14,-49,-28;
/M: SY='Q';  M= -8,-43,-11, 48,-46,-15,-17,-40,  9,-31,-28, -7,-11, 67,  9,  1,-19,-34,-40,-30;
/M: SY='K';  M=  2,-33,  9, 23,-29, -9,  4,-26, 25,-18,-27, 16,-30,  9, 14, 13,  6,-24,-43,-23;
/M: SY='R';  M= -2,-18,-24,  2,-20,-30,-11,-29,  8,-15,  4, -4,-13,  6, 55, -7, 27,-16,-41,-16;
/M: SY='F';  M=-29,-18,-49,-43, 75,-46,-32, 19,-39, 25, 35,-40,-45,-41,-33,-31,-19,  0, -7,  3;
/M: SY='E';  M= -7,-39, -9, 31,-27,  0,-16,-24, 23, -2,-17,-11,-16, 22, 16,  7, -7,-18,-39,-15;
/M: SY='P';  M= -3,-41, 23, 15,-40, -1,  1,-38, 17,-31,-31, -6, 57, -2,-13,  8, -5,-32,-43,-21;
/M: SY='W';  M=-24,-41,-23,-19, 42,-37, -2,  4,-14, 17,-10,-17, -1,-14,-18,-19,-15,-10, 86, 24;
/M: SY='F';  M=-24,  8,-48,-43, 65,-46,-33, 22,-40, 37, 12,-30,-46,-35,-39,-36,-23,  1,-21,  5;
/I:         I=-17; MD=-42;
/M: SY='E';  M= -9, -2,  9, 26,-31,-34,-23,-32, 17,-28,-31, -9,-36, 10,  1,  1, -1,-37,-48,-14; D=-17;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='W';  M= -9,-38, -7, -9,-25,-14, -4,-17, 24,-17,-22, 15,-21,  8, 19, 27, -1,-28, 65,-10;
/M: SY='K';  M=-16,  3, -5, 10,  1, -9,  6, -9, 14,  3, -7, 11,-14, 12, 14, -4,-15,-10,-15,  4;
/M: SY='P';  M= -2,-19, -6,  2, -7,  6, -9,-25, 12,-16,-22,-16, 44, 11, -5,  8, -7,-15, 15, -1;
/M: SY='G';  M=-11,-21,  2,  0,-25, 36, 25,-19, -5,-32,-25, 32, -9,  4,-16, 21,  4,-33,-44,-25;
/M: SY='W';  M=-22,-48,-52,-31,  8,-35,-51,-27,-11,-26,-32,-46,-40,-20,-33,-12,-27,-36,151, 11;
/M: SY='E';  M=-16,-22, 26, 30,-39,-13, -8,-21, 26,-31,-29, 20,-17, 10, 16,  8, 11,-23,-20,-27;
/I:         I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
/M: SY='G';  M=-11,-38,-15,-32,-27, 71,  8,-29,-15,-14,-28, -5,-33,-10,-22, -2,-26,-21,-39,-32;
/M: SY='I';  M=-14,  6,-37,-24,-12,-42,-19, 45, -1, 14,  8,-11,-38,-29,-15,-14, -7, 33,-38,  3;
/M: SY='V';  M=  0, 12,-34,-18, 17,-38, -3, 30,-18, -7, -4,-21,-21,-25,-25, -5, 22, 34,-36,  6;
/M: SY='G';  M= -8,-33, -5, -2,-41, 68,-25,-47,-18,-40,-35, 34,-31,-15,-19,  5,-23,-42,-40,-17;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-16, 14,-26,-20,-20,-17, 22,-30,-25, -9,-22, 26, 47,  7, 13, -6,-41,-25;
/M: SY='P';  M= 27,-32,-14,  5,-34,-25,-22, -1, 15,-17, -6,-13, 33, -6, -1, -3,  2, 12,-42,-31;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
/M: SY='P';  M=-26,-52,-14,-17,-27,-32,-32,-27,-26,-32,-31,-31,106,-29,-31,-24,-22,-30,-42,-41;
/I:         I=-36; MD=-90;
/M: SY='T';  M=-14, -7, 12, -2,-36,-22,-20,-27, -8,-17, -3, 18,  0, -1,-24, 35, 45,-22,-49,-31; D=-36;
/I:         I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
/M: SY='E';  M=  4,-13, -3, 54,-38,-24,-14,-29,  0,-20, -6, -4, 24, -2,-10, 10, -2,-14,-22,-28;
/M: SY='E';  M= -1,-39, 32, 46,-39,-10,-12,-32, 14,-20,-14,  4, -8, 20,  0,  4,-10,-31,-44,-31;
/M: SY='E';  M=-21,-41,  8, 57,  1,-31,  8,-20, -1, -9,-15,-19,-17, 44, -2,-15, -4,-20,-39,-24;
/M: SY='F';  M=-29, 15,-37,-24, 54,-26,-14, 17,-36, 30, 30,-37,-43,-30,-36,-33,-14,  8, 16, 19;
/M: SY='Q';  M=  2, -7,-21, 16,-12,-32,-15,  8,  7, 12,  3,-19,-21, 17, 10, -9,  2, 12,-39,-15;
/M: SY='D';  M=  0,-36, 25, 21,-28,-13, -2,-32, 17, -5,-20, 14,-29, 20,  4, 15,  7,-26,-43,-25;
/M: SY='A';  M= 41,-10,-19, -8,-21, -4,  0,-16, -2,-13, 18, -1,-18,  5,-19, 11, -8, -6,-37,  2;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
/M: SY='L';  M= -4,-14,-38,-14,  0,-35,-31, 13,-33, 53,  2,-30,-41,-29,-18, -7, -7,  5,-36,-15;
/M: SY='E';  M=  3,  3,  4, 19,  1,-25,-11,-17,  6, -3, -3, -9,-31, 13, 10,  8, 19,-17,  1, -3;
/M: SY='N';  M=-14,-10, 19, 25,-40, -7,  4,-37, 17,-27,-29, 34,-29, 20, 12, 21,  9,-34,-46,-30;
/M: SY='H';  M=  4,  5,  7,-13,-20,-16, 51,-23, 20,-34,-26, 17,-25, -1,  8, 28,  0,-24,-42,  2;
/M: SY='D';  M=-21,-27, 77, 17,-46,-17,  2,-44,  0,-44,-39, 22,-25,  2, -4,  7,-18,-34,-17,-31;
/M: SY='L';  M= -7, 22,-44,-39,  3,-30,-35, 25,-38, 46, 15,-39,-42,-31,-38,-27, -8, 27,-37, -9;
/M: SY='F';  M=-32,-13,-44,-34, 73,-44,-23,  0,-37, 17, 13,-38,-46,-37,-35,-17,-26,  2, -9, 55;
/M: SY='L';  M=-18,-14,-46,-40,  9,-47,-38, 40,-37, 40, 22,-40,-31,-35,-22,-23,-19, 29,-37,-18;
/M: SY='Y';  M=-35,-21,-36,-38, 35,-42, -4,-20,-30,-17,-15,-36,-47,-27,-22,-30,-15,-25,  6,104;
/M: SY='C';  M=  9, 68,-42,-39, 59,-29,-21,  4,-37,  0, 10,-17,-27,-39,-39,-20,-18,  4,-28, -8;
/M: SY='G';  M=-13,-41,-28,-33,-47, 86,-35,-55,-33,-50,-39,-14,-32,-31,-41, -9,-32,-48,-38,-42;
/M: SY='H';  M=-33,-45,-17,-12,-32,-29,124,-42,-16,-32,-18, -7,-34,-11,-16,-23,-32,-48,-66, -2;
/M: SY='G';  M=-10,-41,-27,-35,-47, 82,-33,-53,-18,-49,-38,-10,-32,  2,-35, -9,-31,-47,-38,-40;
/M: SY='S';  M= 14, -8, -7,-25,-41, 41,-10,-41,-13,-42,-34, 12,-30,-19,-23, 50,  1,-33,-45,-34;
/M: SY='G';  M=  5, 15,-29,-35,-45, 79,-35,-49,-33,-41,-37,-16,-33,-31,-40, -5,-29,-36,-39,-41;
/M: SY='E';  M= 25,-24,  5, 49,-38,-13,-24,-20, -8,-12,-26,-11,-28,  5,-13, 11, -9,-13,-43,-33;
/M: SY='Q';  M= -8,-44, -8,  8,-46,-31, 22,-36, 23,-31,-24, -6,-31, 80, 20, -8,-20,-29,-40,-25;
/M: SY='Y';  M=-31, -1,-38,-39, 49,-35, 10, -9,-24, -3,-11,-36,-47,-30,-30,-32,-29, -8, -1, 90;
/M: SY='I';  M=-14,-12,-48,-43, 20,-39,-41, 51,-41, 31, 15,-41,-42,-38,-42,-35,-20, 29,-16,-13;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='R';  M=-21,-25, 18,-19,-33, -6,  3,-34,  3,-24,-34, -3, 24, -9, 31, 14,-15,-36,-50,-35; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='W';  M= -9,-38,-10,-18,-35, 31,-18,-41,  6,-22,-21,-11,-21, -5, 12, 10, -3,-36, 33,-12; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='Q';  M=-15,-13, 14,  7,-29,-23, 12,-24, 14,-30,-32, -3,-18, 22, 17,  8,  1,-31,-48,-26; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='T';  M= -2,-25,  3,  9,-21,-21,-21,  2, -2,-18,-18, -3,-10,-15,  4,  0, 14, -5,-23,-32; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='I';  M=-16,-43,-30,-33,-15,-43,-35, 48,-20, 13, -2,-22,-37,-16,  6,-26,-24, 18,-44,-27; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='R';  M= -2,  5, -7, 11,-37,-30,-18,-27, 22, -8,-20,-11,-12, 28, 28,-11,-21,-23,-43,-13; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='R';  M=-15,-42, -1, -3,-38,-17, -1,-30, 31, -5,-23, -1,-26, 24, 38,  3, -8,-29,-44,-29; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='L';  M=-10,  8,-17, -2,-23,-16,-11,-12, -8, 29, 21, -7, -6,  1, -8, -3, -9,-13,-23,-20; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-14,-32, 32,  5,-26, -3,  2,-23, 12,-33,-31, 18,  9,  1, 10,  1,  6,-26,-27, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='C';  M=-14, 72,-22,-15,-21,-19, -3, -2,  8,-13,-10, 10,-14, -8, 21,-12, -5, -6,-47,-27; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='C';  M=-20, 76,-22,-22,-16,-23,-21,-20,  9, -7,-25,  1, 13,-15, 42, -4,-17,-20,-45,-31;
/M: SY='A';  M= 48,-14,-28,-15,-40,  3,-30,-34, -2,-36,-29,-22, 34,-17,-19, 23, -2,-21,-41,-20;
/M: SY='V';  M= 30,-24,-24,-20,-20,-31,-37, 13,-23, -5,-16,-30, 25,-29,-30, -1, 13, 35,-44,-29;
/M: SY='T';  M= 27,  9,-19,-23,-30,-26,-32, -2,-21,-12,  8,-17,-14,-25,-31, 28, 31, 22,-46,-30;
/M: SY='L';  M=-28,-29,-49,-42, 48,-48,-20,  9,-41, 51, 29,-44,-36,-38,-39,-39,-27,  6,  9, -4;
/M: SY='L';  M=-31,-33,-47,-40, -1,-49,-22,  5,-35, 69,  9,-46,-48,-31,-38,-32,-27, -2,-35,-17;
/M: SY='M';  M=-26,-36,-48,-40, 55,-31,-27,  9,-27, 15, 81,-30,-41,-32,-28,-32,-27, -7, 47, -1;
/M: SY='G';  M=-10,-41,-28,-29,-47, 85,-35,-54,-33,-50,-39,-15,-32,-31,-41,-13,-32,-48,-38,-42;
/M: SY='C';  M=-25,136,-45,-45,-35,-26,-45,-42,-41,-30,-33,-31,-55,-48,-45,-28,-26,-30,-64,-46;
/M: SY='S';  M= -3,-20,  5,-11,-40,  1,-23,-39,-19,-42,-29,  1,-21,-11,-17, 73, -4,-32,-47,-31;
/M: SY='S';  M= -5,-28,-20,-21,-38,-14,-23,-38,-14,-42,-35, -8,-28,-12,-24, 82,  0,-30,-47,-30;
/M: SY='G';  M= 35,-17,-33,-34,-36, 52,-36,-19,-32,-21,-19,-19,-34,-30,-37, -8, -6, 19,-42,-35;
/M: SY='R';  M= 20,-31,-24,  0,-30,-23, 16,-31, 26,-27, -7,-17,-32, -5, 46, 12, -5,-18,-39, -8;
/M: SY='L';  M=-29,-11,-44,-28, -1,-46,-11, 11,-37, 55, 47,-41,-13,-27,-36,-33,-10,  4,-37,-14;
/M: SY='T';  M=  9,-16, -6,  2,-17,-24,  2,  5, 15, -8,-13, -7,-31,  9, 10,  9, 23,-17,-13,-21;
/M: SY='E';  M= -1, 18, 21, 24,-31, -5,  0,-18,-14,-10,-13, -5,  7, -4, -4,  3, -7,  2,-24,  1;
/M: SY='N';  M=  5,  7,-12,  4, -5,-15, 18,-10, -6,-17,  8, 19,-19, 18, 13,  3, -1,-16,-19, 12;
/M: SY='G';  M=  0,-40,-12,-12,-44, 74,-31,-48,-22,-39,-36, -5,-12,  1,-34,-10,-29,-43,-38,-23;
/M: SY='N';  M=-16, -6, 21, 25,-28, -6, 14, -3, -4, -2, -9, 26, -2,  3, -6, -6, -8,-20,-44,-11;
/M: SY='F';  M=-25,-31,-38,-35, 57,-17, 17,-14,-19, 18,  0,-20,-20,-14, -3,-28,-18,-15,-14, 53;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 7 in 7 different sequences
Number of true positive hits 7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Peptidase C50
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
7 sequences

BIMB_EMENI  (P33144    ), CUT1_SCHPO  (P18296    ), ESP1_ARATH  (Q5IBC5    ), 
ESP1_YEAST  (Q03018    ), ESPL1_HUMAN (Q14674    ), ESPL1_MOUSE (P60330    ), 
SEP1_CAEEL  (G5ED39    )
» more

PDB
[Detailed view]
3 PDB

5MZ6; 5U1S; 5U1T

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission