PROSITE entry PS51700
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SEPARIN |
| Accession [info] | PS51700 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2014 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51700 |
| Associated ProRule [info] | PRU01037 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SEPARIN core domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=96; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=91; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5120753; R2=0.0072149; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=15290.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1108; H_SCORE=15290; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=692; H_SCORE=15290; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-11; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; /M: SY='P'; M= 0,-40, -4, 2,-26, -5,-22, -3, 18, -8,-12,-17, 49,-10, 9, 3, -4,-17,-18,-30; /M: SY='C'; M=-13, 21, 15, 2,-25, -6, -3,-33, 20, -5,-17, 10,-22, 10, 21, 20, -1,-29,-28,-21; /M: SY='N'; M=-12,-37, 17, -7,-39,-15,-15,-27, 21,-26,-13, 44,-32, 15, 32, 25, -7,-33,-46,-30; /M: SY='G'; M= 11,-13,-31,-29,-10, 39,-34, 4,-28, -6,-20,-12,-20,-29, -7, -4, 23, 14,-41,-29; /M: SY='F'; M=-10, 4,-35,-33, 58,-29, 3, -5,-24,-11, -5,-19,-39,-27, -2, 11, 13,-18,-11, 49; /M: SY='Y'; M=-26, 31,-27,-36, 41,-39,-11,-16,-30, -8, 8,-33,-45,-28,-18, -6,-18,-23, 3, 89; /M: SY='V'; M=-22,-20,-47,-41,-12,-49,-42, 45,-38, 32, 16,-41,-42,-37,-28,-29,-15, 49,-42,-21; /M: SY='L'; M=-28,-24,-46,-40, -8,-48,-27, 36,-28, 55, 3,-42,-44,-34,-38,-22,-19, 17,-36, -5; /M: SY='N'; M=-27, -4, 36, -7,-41,-18,-10,-36, -9,-41,-34, 88,-29,-14, -3,-11,-13,-41,-59,-35; /M: SY='P'; M=-25,-52,-14,-18,-34,-31,-23,-28,-22,-44,-22,-33,105,-13,-36,-11,-22,-38,-43,-42; /M: SY='S'; M= -3,-35, 26, 16,-40, 19, 25,-38,-12,-29,-31, 10,-20, 3,-22, 40, 2,-27,-47,-27; /M: SY='G'; M= 4,-37, -7,-24,-40, 63,-14,-40, -1,-37,-33, 23,-32,-17,-16, 10,-13,-38,-40,-18; /M: SY='D'; M=-16,-21, 82, -3,-46,-20,-16,-42,-18,-45,-40, 48,-33,-18,-20, -9,-18,-25,-63,-34; /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97; /M: SY='L'; M=-24,-33,-48,-40, 3,-49,-32, 10,-41, 67, 17,-46,-35,-34,-38,-40,-27, -3,-33, -8; /M: SY='P'; M= 0,-22,-14, -6,-30, -5,-12,-11, 23,-23, -3,-10, 32, 11, 4, 15, 11, -1,-42,-30; /M: SY='R'; M=-15,-38, 9, 0,-35, 3, 26,-41, 20,-35,-20, 33,-25, 6, 38, 19, -2,-37,-46,-28; /M: SY='T'; M=-12,-17,-22,-24,-27,-10,-28,-23,-18,-23, 13, -1,-26,-10,-22, 23, 74,-14,-49,-28; /M: SY='Q'; M= -8,-43,-11, 48,-46,-15,-17,-40, 9,-31,-28, -7,-11, 67, 9, 1,-19,-34,-40,-30; /M: SY='K'; M= 2,-33, 9, 23,-29, -9, 4,-26, 25,-18,-27, 16,-30, 9, 14, 13, 6,-24,-43,-23; /M: SY='R'; M= -2,-18,-24, 2,-20,-30,-11,-29, 8,-15, 4, -4,-13, 6, 55, -7, 27,-16,-41,-16; /M: SY='F'; M=-29,-18,-49,-43, 75,-46,-32, 19,-39, 25, 35,-40,-45,-41,-33,-31,-19, 0, -7, 3; /M: SY='E'; M= -7,-39, -9, 31,-27, 0,-16,-24, 23, -2,-17,-11,-16, 22, 16, 7, -7,-18,-39,-15; /M: SY='P'; M= -3,-41, 23, 15,-40, -1, 1,-38, 17,-31,-31, -6, 57, -2,-13, 8, -5,-32,-43,-21; /M: SY='W'; M=-24,-41,-23,-19, 42,-37, -2, 4,-14, 17,-10,-17, -1,-14,-18,-19,-15,-10, 86, 24; /M: SY='F'; M=-24, 8,-48,-43, 65,-46,-33, 22,-40, 37, 12,-30,-46,-35,-39,-36,-23, 1,-21, 5; /I: I=-17; MD=-42; /M: SY='E'; M= -9, -2, 9, 26,-31,-34,-23,-32, 17,-28,-31, -9,-36, 10, 1, 1, -1,-37,-48,-14; D=-17; /I: I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42; /M: SY='W'; M= -9,-38, -7, -9,-25,-14, -4,-17, 24,-17,-22, 15,-21, 8, 19, 27, -1,-28, 65,-10; /M: SY='K'; M=-16, 3, -5, 10, 1, -9, 6, -9, 14, 3, -7, 11,-14, 12, 14, -4,-15,-10,-15, 4; /M: SY='P'; M= -2,-19, -6, 2, -7, 6, -9,-25, 12,-16,-22,-16, 44, 11, -5, 8, -7,-15, 15, -1; /M: SY='G'; M=-11,-21, 2, 0,-25, 36, 25,-19, -5,-32,-25, 32, -9, 4,-16, 21, 4,-33,-44,-25; /M: SY='W'; M=-22,-48,-52,-31, 8,-35,-51,-27,-11,-26,-32,-46,-40,-20,-33,-12,-27,-36,151, 11; /M: SY='E'; M=-16,-22, 26, 30,-39,-13, -8,-21, 26,-31,-29, 20,-17, 10, 16, 8, 11,-23,-20,-27; /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97; /M: SY='G'; M=-11,-38,-15,-32,-27, 71, 8,-29,-15,-14,-28, -5,-33,-10,-22, -2,-26,-21,-39,-32; /M: SY='I'; M=-14, 6,-37,-24,-12,-42,-19, 45, -1, 14, 8,-11,-38,-29,-15,-14, -7, 33,-38, 3; /M: SY='V'; M= 0, 12,-34,-18, 17,-38, -3, 30,-18, -7, -4,-21,-21,-25,-25, -5, 22, 34,-36, 6; /M: SY='G'; M= -8,-33, -5, -2,-41, 68,-25,-47,-18,-40,-35, 34,-31,-15,-19, 5,-23,-42,-40,-17; /M: SY='R'; M= -9, -4,-16, 14,-26,-20,-20,-17, 22,-30,-25, -9,-22, 26, 47, 7, 13, -6,-41,-25; /M: SY='P'; M= 27,-32,-14, 5,-34,-25,-22, -1, 15,-17, -6,-13, 33, -6, -1, -3, 2, 12,-42,-31; /I: I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='P'; M=-26,-52,-14,-17,-27,-32,-32,-27,-26,-32,-31,-31,106,-29,-31,-24,-22,-30,-42,-41; /I: I=-36; MD=-90; /M: SY='T'; M=-14, -7, 12, -2,-36,-22,-20,-27, -8,-17, -3, 18, 0, -1,-24, 35, 45,-22,-49,-31; D=-36; /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90; /M: SY='E'; M= 4,-13, -3, 54,-38,-24,-14,-29, 0,-20, -6, -4, 24, -2,-10, 10, -2,-14,-22,-28; /M: SY='E'; M= -1,-39, 32, 46,-39,-10,-12,-32, 14,-20,-14, 4, -8, 20, 0, 4,-10,-31,-44,-31; /M: SY='E'; M=-21,-41, 8, 57, 1,-31, 8,-20, -1, -9,-15,-19,-17, 44, -2,-15, -4,-20,-39,-24; /M: SY='F'; M=-29, 15,-37,-24, 54,-26,-14, 17,-36, 30, 30,-37,-43,-30,-36,-33,-14, 8, 16, 19; /M: SY='Q'; M= 2, -7,-21, 16,-12,-32,-15, 8, 7, 12, 3,-19,-21, 17, 10, -9, 2, 12,-39,-15; /M: SY='D'; M= 0,-36, 25, 21,-28,-13, -2,-32, 17, -5,-20, 14,-29, 20, 4, 15, 7,-26,-43,-25; /M: SY='A'; M= 41,-10,-19, -8,-21, -4, 0,-16, -2,-13, 18, -1,-18, 5,-19, 11, -8, -6,-37, 2; /I: I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49; /M: SY='L'; M= -4,-14,-38,-14, 0,-35,-31, 13,-33, 53, 2,-30,-41,-29,-18, -7, -7, 5,-36,-15; /M: SY='E'; M= 3, 3, 4, 19, 1,-25,-11,-17, 6, -3, -3, -9,-31, 13, 10, 8, 19,-17, 1, -3; /M: SY='N'; M=-14,-10, 19, 25,-40, -7, 4,-37, 17,-27,-29, 34,-29, 20, 12, 21, 9,-34,-46,-30; /M: SY='H'; M= 4, 5, 7,-13,-20,-16, 51,-23, 20,-34,-26, 17,-25, -1, 8, 28, 0,-24,-42, 2; /M: SY='D'; M=-21,-27, 77, 17,-46,-17, 2,-44, 0,-44,-39, 22,-25, 2, -4, 7,-18,-34,-17,-31; /M: SY='L'; M= -7, 22,-44,-39, 3,-30,-35, 25,-38, 46, 15,-39,-42,-31,-38,-27, -8, 27,-37, -9; /M: SY='F'; M=-32,-13,-44,-34, 73,-44,-23, 0,-37, 17, 13,-38,-46,-37,-35,-17,-26, 2, -9, 55; /M: SY='L'; M=-18,-14,-46,-40, 9,-47,-38, 40,-37, 40, 22,-40,-31,-35,-22,-23,-19, 29,-37,-18; /M: SY='Y'; M=-35,-21,-36,-38, 35,-42, -4,-20,-30,-17,-15,-36,-47,-27,-22,-30,-15,-25, 6,104; /M: SY='C'; M= 9, 68,-42,-39, 59,-29,-21, 4,-37, 0, 10,-17,-27,-39,-39,-20,-18, 4,-28, -8; /M: SY='G'; M=-13,-41,-28,-33,-47, 86,-35,-55,-33,-50,-39,-14,-32,-31,-41, -9,-32,-48,-38,-42; /M: SY='H'; M=-33,-45,-17,-12,-32,-29,124,-42,-16,-32,-18, -7,-34,-11,-16,-23,-32,-48,-66, -2; /M: SY='G'; M=-10,-41,-27,-35,-47, 82,-33,-53,-18,-49,-38,-10,-32, 2,-35, -9,-31,-47,-38,-40; /M: SY='S'; M= 14, -8, -7,-25,-41, 41,-10,-41,-13,-42,-34, 12,-30,-19,-23, 50, 1,-33,-45,-34; /M: SY='G'; M= 5, 15,-29,-35,-45, 79,-35,-49,-33,-41,-37,-16,-33,-31,-40, -5,-29,-36,-39,-41; /M: SY='E'; M= 25,-24, 5, 49,-38,-13,-24,-20, -8,-12,-26,-11,-28, 5,-13, 11, -9,-13,-43,-33; /M: SY='Q'; M= -8,-44, -8, 8,-46,-31, 22,-36, 23,-31,-24, -6,-31, 80, 20, -8,-20,-29,-40,-25; /M: SY='Y'; M=-31, -1,-38,-39, 49,-35, 10, -9,-24, -3,-11,-36,-47,-30,-30,-32,-29, -8, -1, 90; /M: SY='I'; M=-14,-12,-48,-43, 20,-39,-41, 51,-41, 31, 15,-41,-42,-38,-42,-35,-20, 29,-16,-13; /I: I=-6; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='R'; M=-21,-25, 18,-19,-33, -6, 3,-34, 3,-24,-34, -3, 24, -9, 31, 14,-15,-36,-50,-35; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='W'; M= -9,-38,-10,-18,-35, 31,-18,-41, 6,-22,-21,-11,-21, -5, 12, 10, -3,-36, 33,-12; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='Q'; M=-15,-13, 14, 7,-29,-23, 12,-24, 14,-30,-32, -3,-18, 22, 17, 8, 1,-31,-48,-26; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='T'; M= -2,-25, 3, 9,-21,-21,-21, 2, -2,-18,-18, -3,-10,-15, 4, 0, 14, -5,-23,-32; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='I'; M=-16,-43,-30,-33,-15,-43,-35, 48,-20, 13, -2,-22,-37,-16, 6,-26,-24, 18,-44,-27; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='R'; M= -2, 5, -7, 11,-37,-30,-18,-27, 22, -8,-20,-11,-12, 28, 28,-11,-21,-23,-43,-13; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='R'; M=-15,-42, -1, -3,-38,-17, -1,-30, 31, -5,-23, -1,-26, 24, 38, 3, -8,-29,-44,-29; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='L'; M=-10, 8,-17, -2,-23,-16,-11,-12, -8, 29, 21, -7, -6, 1, -8, -3, -9,-13,-23,-20; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='D'; M=-14,-32, 32, 5,-26, -3, 2,-23, 12,-33,-31, 18, 9, 1, 10, 1, 6,-26,-27, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='C'; M=-14, 72,-22,-15,-21,-19, -3, -2, 8,-13,-10, 10,-14, -8, 21,-12, -5, -6,-47,-27; D=-6; /I: I=-6; DM=-16; /M: SY='C'; M=-20, 76,-22,-22,-16,-23,-21,-20, 9, -7,-25, 1, 13,-15, 42, -4,-17,-20,-45,-31; /M: SY='A'; M= 48,-14,-28,-15,-40, 3,-30,-34, -2,-36,-29,-22, 34,-17,-19, 23, -2,-21,-41,-20; /M: SY='V'; M= 30,-24,-24,-20,-20,-31,-37, 13,-23, -5,-16,-30, 25,-29,-30, -1, 13, 35,-44,-29; /M: SY='T'; M= 27, 9,-19,-23,-30,-26,-32, -2,-21,-12, 8,-17,-14,-25,-31, 28, 31, 22,-46,-30; /M: SY='L'; M=-28,-29,-49,-42, 48,-48,-20, 9,-41, 51, 29,-44,-36,-38,-39,-39,-27, 6, 9, -4; /M: SY='L'; M=-31,-33,-47,-40, -1,-49,-22, 5,-35, 69, 9,-46,-48,-31,-38,-32,-27, -2,-35,-17; /M: SY='M'; M=-26,-36,-48,-40, 55,-31,-27, 9,-27, 15, 81,-30,-41,-32,-28,-32,-27, -7, 47, -1; /M: SY='G'; M=-10,-41,-28,-29,-47, 85,-35,-54,-33,-50,-39,-15,-32,-31,-41,-13,-32,-48,-38,-42; /M: SY='C'; M=-25,136,-45,-45,-35,-26,-45,-42,-41,-30,-33,-31,-55,-48,-45,-28,-26,-30,-64,-46; /M: SY='S'; M= -3,-20, 5,-11,-40, 1,-23,-39,-19,-42,-29, 1,-21,-11,-17, 73, -4,-32,-47,-31; /M: SY='S'; M= -5,-28,-20,-21,-38,-14,-23,-38,-14,-42,-35, -8,-28,-12,-24, 82, 0,-30,-47,-30; /M: SY='G'; M= 35,-17,-33,-34,-36, 52,-36,-19,-32,-21,-19,-19,-34,-30,-37, -8, -6, 19,-42,-35; /M: SY='R'; M= 20,-31,-24, 0,-30,-23, 16,-31, 26,-27, -7,-17,-32, -5, 46, 12, -5,-18,-39, -8; /M: SY='L'; M=-29,-11,-44,-28, -1,-46,-11, 11,-37, 55, 47,-41,-13,-27,-36,-33,-10, 4,-37,-14; /M: SY='T'; M= 9,-16, -6, 2,-17,-24, 2, 5, 15, -8,-13, -7,-31, 9, 10, 9, 23,-17,-13,-21; /M: SY='E'; M= -1, 18, 21, 24,-31, -5, 0,-18,-14,-10,-13, -5, 7, -4, -4, 3, -7, 2,-24, 1; /M: SY='N'; M= 5, 7,-12, 4, -5,-15, 18,-10, -6,-17, 8, 19,-19, 18, 13, 3, -1,-16,-19, 12; /M: SY='G'; M= 0,-40,-12,-12,-44, 74,-31,-48,-22,-39,-36, -5,-12, 1,-34,-10,-29,-43,-38,-23; /M: SY='N'; M=-16, -6, 21, 25,-28, -6, 14, -3, -4, -2, -9, 26, -2, 3, -6, -6, -8,-20,-44,-11; /M: SY='F'; M=-25,-31,-38,-35, 57,-17, 17,-14,-19, 18, 0,-20,-20,-14, -3,-28,-18,-15,-14, 53; /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of true positive hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C50 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
7 sequences
BIMB_EMENI (P33144), CUT1_SCHPO (P18296), ESP1_ARATH (Q5IBC5), ESP1_YEAST (Q03018), ESPL1_HUMAN (Q14674), ESPL1_MOUSE (P60330), SEP1_CAEEL (G5ED39)» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
5MZ6; 5U1S; 5U1T; 7NJ0; 7NJ1 |