Home  |  Contact
Entry: PS51735

General information about the entry

Entry name [info] VP35_IID
Accession [info] PS51735
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-OCT-2014 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
10-FEB-2021 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51735
Associated ProRule [info] PRU01071

Name and characterization of the entry

Description [info] Filoviruses VP35 interferon inhibitory domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=126;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=121;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1903224; R2=0.0113116; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11636.5292969; R2=13.6267748; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1133; H_SCORE=27076; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=381; H_SCORE=16828; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G';  M=  5, -4,-19, -4, -8,-25, 28,-14,-29,-11,-30,-19,  5,-14, -8,-12, 20,  2,-19,-31,-24, -8;
/M: SY='R';  M=-13, -6,-29, -6,  3,-24,-18, -8,-27, 36,-24, -9, -2,-15,  7, 41,-10,-10,-16,-21,-11,  3;
/M: SY='P';  M=-10,-24,-32,-18, -8,-14,-24,-20, -4,-18,  2, -4,-24, 42,-14,-20,-18,-10,-14,-26,-18,-14;
/M: SY='P';  M=-12,  3,-30,  5, -2,-17,-17, -5,-18, -7,-23,-17,  2, 25, -7,-12, -4, -2,-23,-23, -6, -7;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/M: SY='S';  M=  4, -2,-12,  0, -6,-17, -9,-14, -9,-12,-19,-13,  0,-15, -8,-13, 22, 11,  4,-37,-17, -7;
/M: SY='P';  M= 26,-14,-22,-16, -6,-24, -8,-20,-14,-10,-18,-14,-14, 30,-10,-20,  2, -4,-12,-24,-24,-10;
/M: SY='K';  M= -6,  0,-22, -4,  2,-22,-20,-14,-22, 26,-22,-10,  0,-10,  2, 14,  2, 14,-12,-24,-10,  2;
/M: SY='D';  M=-15, 26,-29, 40, 32,-31,-16, -2,-30,  1,-18,-21,  7, -8,  6, -7, -3,-10,-26,-34,-18, 19;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10,  7,-10, 10,-23;
/M: SY='A';  M= 12,-14,-17,-18,-11,-16,-17,-19, -4,  5, -9, -3,-13,-18,-10,  2, -4, -3, 10,-23,-13,-11;
/M: SY='R';  M=-13, -6,-26, -5,  8,-14,-21, -5,-13,  2,  2, -4, -4,-18,  3, 15,-12, -9,-14,-25,-10,  4;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-19,-33,-26,  4,-33,-26, 31,-27, 29, 17,-27,-27,-23,-23,-21, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-21,-31,-21,  7,-29,-17, 22,-26, 42, 27,-27,-27,-16,-19,-27,-10, 11,-20,  0,-19;
/M: SY='Y';  M=-13,-17,-20,-23,-20, 33,-27, -6, -3,-16,  0, -3,-13,-23,-20,-13, -7, 10, -3,  4, 34,-20;
/M: SY='D';  M= -4, 16,-19, 20,  2,-24, -4,-11,-25, -7,-24,-20,  9,-11, -5,-11, 16, 16,-15,-35,-18, -2;
/M: SY='H';  M=-19, -6,-31, -5, -5, -9,-22, 74,-22,-10,-16, -1,  1,-17,  4, -3,-12,-17,-25,-16, 32, -5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='P';  M= -8,-15,-32,-11, -4,-24,-21,-20,-15,-11,-23,-16,-15, 61,-10,-18, -3,  5,-20,-30,-24,-11;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P';  M=-13, -3,-28, -9, -9,  7,-17, -7,-13,-12,-17,-13,  6, 13,-14,-13, -7, -7,-21,-18, -2,-13;
/M: SY='N';  M=-10,  6,-27,  0, -7,-23, 17, -1,-30,  2,-27,-16, 20,-20, -4, 15,  0,-10,-27,-27,-19, -7;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='A';  M= 29,-13,-20,-16, -7,-23, -7,-20,-13,-10,-16,-13,-13, 22,-10,-20,  4, -2,-10,-24,-23,-10;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='Q';  M=-10, -6,-30, -6, 17,-24,-26, -6, -1, -3, -7,  0, -6,-10, 21, -6, -6,-10,-11,-23,-10, 17;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='V';  M= 21,-22,-10,-26,-22, -8,-18,-26, 14,-16,  2,  2,-22,-22,-22,-20, -2,  0, 29,-26,-14,-22;
/M: SY='Q';  M= -3,  0,-23,  0, 13,-33,-13,  3,-20,  3,-23, -7,  3,-10, 40,  3, 13,  0,-23,-27,-13, 27;
/M: SY='V';  M= 17,-23,-10,-27,-23, -7,-20,-27, 17,-17,  3,  3,-23,-23,-23,-20, -3,  0, 33,-27,-13,-23;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-24,-36,-27,  3,-36,-27, 38,-29, 29, 19,-24,-24,-21,-26,-22, -9, 26,-21, -1,-27;
/M: SY='C';  M= 16,-10, 35,-17,-14,-20,-10,-20,-20,-17,-20,-17, -7,-20,-14,-20, 13,  3, -7,-37,-23,-14;
/M: SY='K';  M= -9, -8,-26, -9, -1,-20,-22,-13,-13, 28,-13,  2, -8,-15,  1, 15,-13, -9, -5,-21, -8,  0;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-20,-34,-28,  1,-34,-29, 37,-25, 19, 15,-25,-25,-24,-24,-16, -5, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='G';  M= 20, -7,-17,-10,-10,-23, 24,-17,-24,-13,-24,-17,  0,-13,-10,-17, 17,  0,-14,-27,-23,-10;
/M: SY='R';  M=-17,-10,-30,-10, -3, -7,-23,  3,-20, 24,-17, -7, -6,-20,  4, 30,-13,-10,-17, -4, 19, -3;
/M: SY='D';  M=-17, 34,-30, 47, 17,-37,-13, -3,-37, 16,-30,-24, 14,-10,  3,  3, -3,-10,-27,-34,-17, 10;
/M: SY='S';  M=  4, 11,-13,  6,  0,-20,  0, -4,-20, -7,-30,-20, 24,-13,  0, -7, 32, 14,-16,-40,-20,  0;
/M: SY='H';  M=-10,  9,-27,  7, -5,-25, 15, 28,-32,-10,-27,-14, 18,-19, -3, -8,  1,-13,-29,-30,-10, -6;
/M: SY='D';  M=-10, 10,-26, 15,  4,-24,-17,-10,-18,  8,-13,-11,  1,-14, -2,  0, -6, -7,-14,-28,-12,  1;
/M: SY='L';  M= -4,-20,-17,-20,-14,  0,-20,-17,  7,-24, 24,  7,-17,-24,-14,-17, -7,  0,  4,-26, -6,-14;
/M: SY='D';  M=-10, 14,-30, 21,  7,-37, 13, -3,-33, -3,-27,-17,  7,-13, 13, -7,  0,-13,-30,-27,-20, 10;
/M: SY='V';  M= 14,-21,-15,-28,-22, -7,-22,-26, 19,-18,  4,  4,-19,-20,-20,-22, -4,  1, 25,-24,-11,-22;
/M: SY='F';  M=  7,-23,-20,-33,-23, 19,-23,-23, 14,-23,  7,  4,-17,-20,-23,-23,-10, -7, 10,-10,  3,-23;
/M: SY='H';  M=-13,-16,-23,-20,-13, -4,-23, 28,  3,-16, 16, 26,-13,-23, -3,-10,-20,-13, -4,-23,  7,-10;
/M: SY='D';  M=  4, 29,-23, 39, 10,-33, -7, -7,-30, -3,-23,-23, 10,-10, -3,-13,  3, -7,-20,-33,-20,  3;
/M: SY='H';  M=  7,  0,-24,  0, 18,-24,-14, 23,-23, -2,-17,-10,  0, -9,  9, -6,  0,-10,-20,-26, -8, 12;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='H';  M=-13, 13,-27,  7,  7,-27,-13, 39,-23,  0,-23, -7, 23,-17, 24,  3,  0,-10,-30,-30, -4, 14;
/M: SY='R';  M=  7, -7,-23,-10,  3,-26,-13, -4,-20, 10,-17, -7, -3,-13, 19, 20,  0, -7,-16,-20,-13, 10;
/M: SY='E';  M= -3, -6,-23, -6, 10,-17,-20,-13, -1,-10,-10, -7, -3,-10,  0,-13,  7,  0, -4,-30,-14,  4;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='A';  M= 19, -5,-12,-12, -7,-16, -7,-14,-12, -8,-15, -8, -2,-11, -5,-10, 19, 16, -3,-29,-16, -6;
/M: SY='E';  M=-14, 26,-30, 40, 44,-34,-16,  0,-34,  6,-24,-24,  8, -4, 12, -4,  0,-10,-30,-34,-20, 28;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D';  M=-14, 13,-26, 21, 19, -6,-17, -6,-25, -5,-17,-19,  3,-12, -3, -9, -1, -7,-21,-25, -8,  9;
/M: SY='S';  M=  4, 13,-13,  6,  0,-20,  0, -4,-20, -7,-30,-20, 26,-13,  0, -7, 30, 14,-16,-40,-20,  0;
/M: SY='A';  M= 28,-14,-20,-17, -7,-23, -8,-20,-12,-10,-16,-13,-14, 24,-11,-20,  3, -3, -9,-24,-23,-11;
/M: SY='Q';  M=-13,  0,-30,  0, 13,-33,-20, 40,-23,  3,-20,  0,  3,-13, 43,  7, -3,-13,-30,-23,  0, 27;
/M: SY='C';  M= 29,-13, 35,-23,-17,-20,-10,-23,-17,-17,-13,-13,-13,-20,-17,-23,  3, -3, -3,-30,-23,-17;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/M: SY='I';  M= -7,-20,-24,-30,-24, -3,-34,-27, 31,-24, 10, 10,-14,-17,-17,-24, -7,  9, 20,-23, -3,-24;
/M: SY='Q';  M= -6, -3,-23, -3,  7,-27,-13,  0,-23,  9,-23,-10,  3,-13, 25, 21, 10,  0,-20,-27,-13, 15;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 40,-30, 30, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20,  0,-27;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 26, 40, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  6,-26,-20, -2,-29, 35,-24, -9,  0,-15, 16, 48, -9,-10,-21,-20,-10,  9;
/M: SY='R';  M=-14, -7,-24,-10, -3,-17,-20, -6,-24, 17,-17,-10,  0,-17,  4, 44,  0,  9,-14,-23,-10, -3;
/M: SY='C';  M=-12,-27, 26,-35,-30, 19,-32,-27,  5,-29,  2, -1,-21,-31,-31,-25,-15, -9, 10,-22, -2,-30;
/M: SY='P';  M=-13, 13,-33, 26, 26,-33,-17, -7,-30,  0,-27,-23,  0, 28,  3,-10, -3,-10,-30,-33,-23, 13;
/M: SY='Y';  M=  9,-17,-22,-24,-18,  0,-21, -5,  8,-15,  1,  1,-14,-19,-12,-19, -7, -5,  4, -7, 16,-18;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='R';  M=-12,-14,-27,-14, -3,-16,-16, -6,-12,  1,  2,  1,-10,-21, 11, 18,-13,-11,-14,-20, -8,  2;
/M: SY='N';  M= -9, 24,-27, 23,  4,-29, 18, -3,-32, -6,-29,-23, 25,-16, -5, -9,  3,-10,-30,-33,-23,  0;
/M: SY='C';  M=  9,-19, 33,-26,-23,-13,-21,-26, -4,-20, -7, -6,-19,-26,-23,-22, -2,  1, 12,-34,-19,-23;
/M: SY='E';  M=  1,-10,-21, -7,  9,-19,-20,-16, -7, -6,-12, -9,-13,  3, -5,-12,  0, -2,  0,-30,-18,  1;
/M: SY='P';  M= 10,-17,-30,-13, -3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17, 57,-10,-20, -3, -7,-20,-27,-27,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V';  M= -1,-18,-12,-23,-22, -4,-27,-26, 16,-17,  3,  3,-17,-21,-21,-17,  1, 19, 28,-29, -9,-22;
/M: SY='I';  M= -7,-24,-24,-33,-26, -2,-33,-25, 35,-23, 14, 19,-18,-20,-17,-23,-13,  0, 25,-23, -3,-25;
/M: SY='H';  M=-16, -4,-30, -4,  5,-23,-21, 30,-24, 11,-19, -3,  1,-17, 25, 23, -8,-13,-25,-18,  5, 12;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-17,-33,-30,  0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30;
/M: SY='K';  M= -9, -2,-23, -5,  1,-21,-20,-11,-23, 26,-21,-10,  0,-12,  3, 24,  0, 10,-13,-23,-10,  1;
/M: SY='S';  M=  3, 13,-13,  6, -1,-19, -2, -4,-19, -7,-28,-19, 25,-13, -1, -7, 29, 16,-16,-39,-19, -1;
/M: SY='R';  M=-16,-12,-27,-15, -5,  7,-23,-11,-20, 19,-14, -6, -7,-19, -6, 24,-13,-10,-13,-11,  3, -5;
/M: SY='Q';  M= -1, -3,-23, -3,  3,-31, 10, -4,-25, -4,-26,-12,  3,-13, 19, -4, 13, -3,-23,-27,-18, 11;
/M: SY='Q';  M= -9, 14,-24, 16, 14,-29,-17, -3,-23,  1,-19,-13,  5, -9, 18, -2,  6,  9,-20,-29,-13, 16;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R';  M=-15, -3,-30, -3, 11,-26,-20, -2,-29, 31,-23,-10,  0,-14, 18, 43, -8,-10,-22,-21,-11, 12;
/M: SY='A';  M= 31,-13,-20,-17, -7,-23, -6,-20,-13,-10,-16,-13,-13, 22,-10,-20,  4, -3,-10,-23,-23,-10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,105,-29,-29,-16,-29,-26,-27,-28,-19,-18,-19,-39,-28,-28,-10, -9,-10,-43,-21,-29;
/M: SY='Q';  M=-13,  0,-30,  0, 13,-33,-20, 39,-24,  5,-20,  0,  3,-13, 42,  7, -4,-13,-30,-23,  0, 26;
/M: SY='K';  M= -7, -3,-30, -3,  0,-30, 10,-13,-33, 27,-30,-13,  0,-13,  0, 13, -7,-13,-23,-20,-17,  0;
/M: SY='S';  M=  0, -3,-17, -3,  0,-20, -7, -7,-23,  3,-27,-17,  7,-13,  3, 17, 23, 10,-13,-33,-17,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M=  6,  7,-27, 13,  3,-30,-10,-13,-23, -7,-24,-20, -3, 24, -7,-17,  0, -7,-20,-30,-23, -3;
/M: SY='V';  M=  3,-29,-11,-29,-28, -1,-28,-28, 26,-20, 12,  9,-29,-29,-28,-20,-10, -1, 43,-28,-10,-28;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-12,-37, -2, 16,-30,-20,-15,-23, -5,-27,-20,-15, 66, -2,-15, -7,-10,-30,-30,-27,  3;
/M: SY='N';  M= -2, 15,-20,  6, -5,-23, 19, -4,-25, -8,-30,-20, 30,-17, -5, -8, 16,  0,-24,-35,-23, -5;
/M: SY='P';  M= -8,-20,-39,-10,  0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20, 86,-10,-20, -9,-10,-29,-30,-30,-10;
/M: SY='K';  M= -6,  0,-23, -4,  3,-23,-20,-14,-23, 29,-23,-10,  0,-10,  3, 16,  1, 11,-13,-24,-10,  3;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 25,-20,  0,-27;
/M: SY='D';  M=-14, 30,-30, 44, 13,-36, 11, -5,-39, -4,-29,-26, 13,-12, -3,-12,  0,-13,-30,-34,-23,  5;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  6,-26,-20, -2,-29, 34,-23, -9,  0,-15, 17, 49, -9,-10,-21,-20,-10,  9;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='W';  M=-19,-39,-49,-39,-30,  9,-17,-30,-21,-20,-20,-20,-39,-30,-20,-20,-39,-30,-30,145, 28,-20;
/M: SY='V';  M= -1,-30,-12,-31,-30,  0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30;
/M: SY='C';  M=-13,-20, 73,-27,-27, -4,-30,-14,-21,-24,-14,-14,-20,-37,-24,-24,-13,-10,-10,-25,  5,-27;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-23,-31,-26, -1,-34,-15, 32,-25, 15, 15,-21,-24,-20,-23,-17, -8, 28,-24, -1,-26;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  6,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='Q';  M= -2, -5,-20, -5,  4,-25,-16, -6,-13,  5,-19, -6, -2,-13, 19,  2,  9,  1, -9,-28,-13, 11;
/M: SY='T';  M= -4,-14,-15,-19,-14,  6,-18,-14,  0,-17,  5,  6,-10,-19,-12,-14,  3, 10,  1,-24, -4,-12;
/M: SY='Q';  M=  0,  1,-27,  3, 27,-33,-17,  2,-21,  7,-18, -8, -2, -7, 36,  2,  2, -8,-25,-23,-15, 31;
/M: SY='D';  M=-17, 35,-30, 49, 20,-40,-13,  3,-34,  3,-27,-21, 14,-10, 18, -4,  0,-10,-30,-34,-17, 19;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-30, -7,-19,-30, 67,-19,-40,-19,-30,-20,  1,-20,-19,-20,  0,-20,-30,-21,-30,-19;
/M: SY='K';  M=-10,  3,-30,  6, 25,-30,-20, -7,-30, 38,-27,-13,  0, -7, 13, 21, -7,-10,-23,-23,-13, 19;
/M: SY='T';  M=  2,  1,-13, -6,  2,-14,-18,-17,-13, -7,-12,-12, -1, -8, -5, -9, 16, 35, -5,-29,-13, -1;
/M: SY='L';  M=-13,-22,-23,-24,-14, -1,-25,-10,  5, -8, 23, 18,-19,-25, -7,  9,-22,-10,  1,-20, -3,-12;
/M: SY='G';  M= 15,-10,-24,-13,-17,-27, 49,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20,  3,-14,-21,-20,-27,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2021_01 which contains 564'277 sequence entries.


Total number of hits 10 in 10 different sequences
Number of true positive hits 10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] VP35 IID
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
10 sequences

VP35_EBORE  (Q91DE0    ), VP35_EBORR  (Q8JPY0    ), VP35_EBOSU  (Q5XX07    ), 
VP35_EBOZ5  (Q6V1Q9    ), VP35_EBOZM  (Q05127    ), VP35_MABVA  (Q1PD52    ), 
VP35_MABVM  (P35259    ), VP35_MABVO  (Q6UY68    ), VP35_MABVP  (Q03039    ), 
VP35_MABVR  (Q1PDC9    )
» more

PDB
[Detailed view]
26 PDB

3FKE; 3KS4; 3KS8; 3L25; 3L26; 3L27; 3L28; 3L29; 3L2A; 4GH9; 4GHA; 4GHL; 4IBB; 4IBC; 4IBD; 4IBE; 4IBF; 4IBG; 4IBI; 4IBJ; 4IBK; 4IJE; 4IJF; 4LG2; 5BPV; 6OTC
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission