PROSITE entry PS51735
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | VP35_IID |
| Accession [info] | PS51735 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2014 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51735 |
| Associated ProRule [info] | PRU01071 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Filoviruses VP35 interferon inhibitory domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=126; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=121; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1903224; R2=0.0113116; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11636.5292969; R2=13.6267748; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1133; H_SCORE=27076; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=381; H_SCORE=16828; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 5, -4,-19, -4, -8,-25, 28,-14,-29,-11,-30,-19, 5,-14, -8,-12, 20, 2,-19,-31,-24, -8; /M: SY='R'; M=-13, -6,-29, -6, 3,-24,-18, -8,-27, 36,-24, -9, -2,-15, 7, 41,-10,-10,-16,-21,-11, 3; /M: SY='P'; M=-10,-24,-32,-18, -8,-14,-24,-20, -4,-18, 2, -4,-24, 42,-14,-20,-18,-10,-14,-26,-18,-14; /M: SY='P'; M=-12, 3,-30, 5, -2,-17,-17, -5,-18, -7,-23,-17, 2, 25, -7,-12, -4, -2,-23,-23, -6, -7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='S'; M= 4, -2,-12, 0, -6,-17, -9,-14, -9,-12,-19,-13, 0,-15, -8,-13, 22, 11, 4,-37,-17, -7; /M: SY='P'; M= 26,-14,-22,-16, -6,-24, -8,-20,-14,-10,-18,-14,-14, 30,-10,-20, 2, -4,-12,-24,-24,-10; /M: SY='K'; M= -6, 0,-22, -4, 2,-22,-20,-14,-22, 26,-22,-10, 0,-10, 2, 14, 2, 14,-12,-24,-10, 2; /M: SY='D'; M=-15, 26,-29, 40, 32,-31,-16, -2,-30, 1,-18,-21, 7, -8, 6, -7, -3,-10,-26,-34,-18, 19; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10, 7,-10, 10,-23; /M: SY='A'; M= 12,-14,-17,-18,-11,-16,-17,-19, -4, 5, -9, -3,-13,-18,-10, 2, -4, -3, 10,-23,-13,-11; /M: SY='R'; M=-13, -6,-26, -5, 8,-14,-21, -5,-13, 2, 2, -4, -4,-18, 3, 15,-12, -9,-14,-25,-10, 4; /M: SY='I'; M= -7,-30,-19,-33,-26, 4,-33,-26, 31,-27, 29, 17,-27,-27,-23,-23,-21, -7, 28,-23, -3,-26; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21, 7,-29,-17, 22,-26, 42, 27,-27,-27,-16,-19,-27,-10, 11,-20, 0,-19; /M: SY='Y'; M=-13,-17,-20,-23,-20, 33,-27, -6, -3,-16, 0, -3,-13,-23,-20,-13, -7, 10, -3, 4, 34,-20; /M: SY='D'; M= -4, 16,-19, 20, 2,-24, -4,-11,-25, -7,-24,-20, 9,-11, -5,-11, 16, 16,-15,-35,-18, -2; /M: SY='H'; M=-19, -6,-31, -5, -5, -9,-22, 74,-22,-10,-16, -1, 1,-17, 4, -3,-12,-17,-25,-16, 32, -5; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='P'; M= -8,-15,-32,-11, -4,-24,-21,-20,-15,-11,-23,-16,-15, 61,-10,-18, -3, 5,-20,-30,-24,-11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M=-13, -3,-28, -9, -9, 7,-17, -7,-13,-12,-17,-13, 6, 13,-14,-13, -7, -7,-21,-18, -2,-13; /M: SY='N'; M=-10, 6,-27, 0, -7,-23, 17, -1,-30, 2,-27,-16, 20,-20, -4, 15, 0,-10,-27,-27,-19, -7; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='A'; M= 29,-13,-20,-16, -7,-23, -7,-20,-13,-10,-16,-13,-13, 22,-10,-20, 4, -2,-10,-24,-23,-10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='Q'; M=-10, -6,-30, -6, 17,-24,-26, -6, -1, -3, -7, 0, -6,-10, 21, -6, -6,-10,-11,-23,-10, 17; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= 21,-22,-10,-26,-22, -8,-18,-26, 14,-16, 2, 2,-22,-22,-22,-20, -2, 0, 29,-26,-14,-22; /M: SY='Q'; M= -3, 0,-23, 0, 13,-33,-13, 3,-20, 3,-23, -7, 3,-10, 40, 3, 13, 0,-23,-27,-13, 27; /M: SY='V'; M= 17,-23,-10,-27,-23, -7,-20,-27, 17,-17, 3, 3,-23,-23,-23,-20, -3, 0, 33,-27,-13,-23; /M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-36,-27, 3,-36,-27, 38,-29, 29, 19,-24,-24,-21,-26,-22, -9, 26,-21, -1,-27; /M: SY='C'; M= 16,-10, 35,-17,-14,-20,-10,-20,-20,-17,-20,-17, -7,-20,-14,-20, 13, 3, -7,-37,-23,-14; /M: SY='K'; M= -9, -8,-26, -9, -1,-20,-22,-13,-13, 28,-13, 2, -8,-15, 1, 15,-13, -9, -5,-21, -8, 0; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-34,-28, 1,-34,-29, 37,-25, 19, 15,-25,-25,-24,-24,-16, -5, 35,-24, -4,-28; /M: SY='G'; M= 20, -7,-17,-10,-10,-23, 24,-17,-24,-13,-24,-17, 0,-13,-10,-17, 17, 0,-14,-27,-23,-10; /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10, -3, -7,-23, 3,-20, 24,-17, -7, -6,-20, 4, 30,-13,-10,-17, -4, 19, -3; /M: SY='D'; M=-17, 34,-30, 47, 17,-37,-13, -3,-37, 16,-30,-24, 14,-10, 3, 3, -3,-10,-27,-34,-17, 10; /M: SY='S'; M= 4, 11,-13, 6, 0,-20, 0, -4,-20, -7,-30,-20, 24,-13, 0, -7, 32, 14,-16,-40,-20, 0; /M: SY='H'; M=-10, 9,-27, 7, -5,-25, 15, 28,-32,-10,-27,-14, 18,-19, -3, -8, 1,-13,-29,-30,-10, -6; /M: SY='D'; M=-10, 10,-26, 15, 4,-24,-17,-10,-18, 8,-13,-11, 1,-14, -2, 0, -6, -7,-14,-28,-12, 1; /M: SY='L'; M= -4,-20,-17,-20,-14, 0,-20,-17, 7,-24, 24, 7,-17,-24,-14,-17, -7, 0, 4,-26, -6,-14; /M: SY='D'; M=-10, 14,-30, 21, 7,-37, 13, -3,-33, -3,-27,-17, 7,-13, 13, -7, 0,-13,-30,-27,-20, 10; /M: SY='V'; M= 14,-21,-15,-28,-22, -7,-22,-26, 19,-18, 4, 4,-19,-20,-20,-22, -4, 1, 25,-24,-11,-22; /M: SY='F'; M= 7,-23,-20,-33,-23, 19,-23,-23, 14,-23, 7, 4,-17,-20,-23,-23,-10, -7, 10,-10, 3,-23; /M: SY='H'; M=-13,-16,-23,-20,-13, -4,-23, 28, 3,-16, 16, 26,-13,-23, -3,-10,-20,-13, -4,-23, 7,-10; /M: SY='D'; M= 4, 29,-23, 39, 10,-33, -7, -7,-30, -3,-23,-23, 10,-10, -3,-13, 3, -7,-20,-33,-20, 3; /M: SY='H'; M= 7, 0,-24, 0, 18,-24,-14, 23,-23, -2,-17,-10, 0, -9, 9, -6, 0,-10,-20,-26, -8, 12; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='H'; M=-13, 13,-27, 7, 7,-27,-13, 39,-23, 0,-23, -7, 23,-17, 24, 3, 0,-10,-30,-30, -4, 14; /M: SY='R'; M= 7, -7,-23,-10, 3,-26,-13, -4,-20, 10,-17, -7, -3,-13, 19, 20, 0, -7,-16,-20,-13, 10; /M: SY='E'; M= -3, -6,-23, -6, 10,-17,-20,-13, -1,-10,-10, -7, -3,-10, 0,-13, 7, 0, -4,-30,-14, 4; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 19, -5,-12,-12, -7,-16, -7,-14,-12, -8,-15, -8, -2,-11, -5,-10, 19, 16, -3,-29,-16, -6; /M: SY='E'; M=-14, 26,-30, 40, 44,-34,-16, 0,-34, 6,-24,-24, 8, -4, 12, -4, 0,-10,-30,-34,-20, 28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-14, 13,-26, 21, 19, -6,-17, -6,-25, -5,-17,-19, 3,-12, -3, -9, -1, -7,-21,-25, -8, 9; /M: SY='S'; M= 4, 13,-13, 6, 0,-20, 0, -4,-20, -7,-30,-20, 26,-13, 0, -7, 30, 14,-16,-40,-20, 0; /M: SY='A'; M= 28,-14,-20,-17, -7,-23, -8,-20,-12,-10,-16,-13,-14, 24,-11,-20, 3, -3, -9,-24,-23,-11; /M: SY='Q'; M=-13, 0,-30, 0, 13,-33,-20, 40,-23, 3,-20, 0, 3,-13, 43, 7, -3,-13,-30,-23, 0, 27; /M: SY='C'; M= 29,-13, 35,-23,-17,-20,-10,-23,-17,-17,-13,-13,-13,-20,-17,-23, 3, -3, -3,-30,-23,-17; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20, 0,-23; /M: SY='I'; M= -7,-20,-24,-30,-24, -3,-34,-27, 31,-24, 10, 10,-14,-17,-17,-24, -7, 9, 20,-23, -3,-24; /M: SY='Q'; M= -6, -3,-23, -3, 7,-27,-13, 0,-23, 9,-23,-10, 3,-13, 25, 21, 10, 0,-20,-27,-13, 15; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 40,-30, 30, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20, 0,-27; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 26, 40, -3,-33,-13, -7; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 6,-26,-20, -2,-29, 35,-24, -9, 0,-15, 16, 48, -9,-10,-21,-20,-10, 9; /M: SY='R'; M=-14, -7,-24,-10, -3,-17,-20, -6,-24, 17,-17,-10, 0,-17, 4, 44, 0, 9,-14,-23,-10, -3; /M: SY='C'; M=-12,-27, 26,-35,-30, 19,-32,-27, 5,-29, 2, -1,-21,-31,-31,-25,-15, -9, 10,-22, -2,-30; /M: SY='P'; M=-13, 13,-33, 26, 26,-33,-17, -7,-30, 0,-27,-23, 0, 28, 3,-10, -3,-10,-30,-33,-23, 13; /M: SY='Y'; M= 9,-17,-22,-24,-18, 0,-21, -5, 8,-15, 1, 1,-14,-19,-12,-19, -7, -5, 4, -7, 16,-18; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='R'; M=-12,-14,-27,-14, -3,-16,-16, -6,-12, 1, 2, 1,-10,-21, 11, 18,-13,-11,-14,-20, -8, 2; /M: SY='N'; M= -9, 24,-27, 23, 4,-29, 18, -3,-32, -6,-29,-23, 25,-16, -5, -9, 3,-10,-30,-33,-23, 0; /M: SY='C'; M= 9,-19, 33,-26,-23,-13,-21,-26, -4,-20, -7, -6,-19,-26,-23,-22, -2, 1, 12,-34,-19,-23; /M: SY='E'; M= 1,-10,-21, -7, 9,-19,-20,-16, -7, -6,-12, -9,-13, 3, -5,-12, 0, -2, 0,-30,-18, 1; /M: SY='P'; M= 10,-17,-30,-13, -3,-27,-13,-20,-17,-10,-23,-17,-17, 57,-10,-20, -3, -7,-20,-27,-27,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= -1,-18,-12,-23,-22, -4,-27,-26, 16,-17, 3, 3,-17,-21,-21,-17, 1, 19, 28,-29, -9,-22; /M: SY='I'; M= -7,-24,-24,-33,-26, -2,-33,-25, 35,-23, 14, 19,-18,-20,-17,-23,-13, 0, 25,-23, -3,-25; /M: SY='H'; M=-16, -4,-30, -4, 5,-23,-21, 30,-24, 11,-19, -3, 1,-17, 25, 23, -8,-13,-25,-18, 5, 12; /M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30, 0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30; /M: SY='K'; M= -9, -2,-23, -5, 1,-21,-20,-11,-23, 26,-21,-10, 0,-12, 3, 24, 0, 10,-13,-23,-10, 1; /M: SY='S'; M= 3, 13,-13, 6, -1,-19, -2, -4,-19, -7,-28,-19, 25,-13, -1, -7, 29, 16,-16,-39,-19, -1; /M: SY='R'; M=-16,-12,-27,-15, -5, 7,-23,-11,-20, 19,-14, -6, -7,-19, -6, 24,-13,-10,-13,-11, 3, -5; /M: SY='Q'; M= -1, -3,-23, -3, 3,-31, 10, -4,-25, -4,-26,-12, 3,-13, 19, -4, 13, -3,-23,-27,-18, 11; /M: SY='Q'; M= -9, 14,-24, 16, 14,-29,-17, -3,-23, 1,-19,-13, 5, -9, 18, -2, 6, 9,-20,-29,-13, 16; /M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-30, 0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M=-15, -3,-30, -3, 11,-26,-20, -2,-29, 31,-23,-10, 0,-14, 18, 43, -8,-10,-22,-21,-11, 12; /M: SY='A'; M= 31,-13,-20,-17, -7,-23, -6,-20,-13,-10,-16,-13,-13, 22,-10,-20, 4, -3,-10,-23,-23,-10; /M: SY='C'; M=-10,-20,105,-29,-29,-16,-29,-26,-27,-28,-19,-18,-19,-39,-28,-28,-10, -9,-10,-43,-21,-29; /M: SY='Q'; M=-13, 0,-30, 0, 13,-33,-20, 39,-24, 5,-20, 0, 3,-13, 42, 7, -4,-13,-30,-23, 0, 26; /M: SY='K'; M= -7, -3,-30, -3, 0,-30, 10,-13,-33, 27,-30,-13, 0,-13, 0, 13, -7,-13,-23,-20,-17, 0; /M: SY='S'; M= 0, -3,-17, -3, 0,-20, -7, -7,-23, 3,-27,-17, 7,-13, 3, 17, 23, 10,-13,-33,-17, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='P'; M= 6, 7,-27, 13, 3,-30,-10,-13,-23, -7,-24,-20, -3, 24, -7,-17, 0, -7,-20,-30,-23, -3; /M: SY='V'; M= 3,-29,-11,-29,-28, -1,-28,-28, 26,-20, 12, 9,-29,-29,-28,-20,-10, -1, 43,-28,-10,-28; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M=-10,-12,-37, -2, 16,-30,-20,-15,-23, -5,-27,-20,-15, 66, -2,-15, -7,-10,-30,-30,-27, 3; /M: SY='N'; M= -2, 15,-20, 6, -5,-23, 19, -4,-25, -8,-30,-20, 30,-17, -5, -8, 16, 0,-24,-35,-23, -5; /M: SY='P'; M= -8,-20,-39,-10, 0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20, 86,-10,-20, -9,-10,-29,-30,-30,-10; /M: SY='K'; M= -6, 0,-23, -4, 3,-23,-20,-14,-23, 29,-23,-10, 0,-10, 3, 16, 1, 11,-13,-24,-10, 3; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 25,-20, 0,-27; /M: SY='D'; M=-14, 30,-30, 44, 13,-36, 11, -5,-39, -4,-29,-26, 13,-12, -3,-12, 0,-13,-30,-34,-23, 5; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 6,-26,-20, -2,-29, 34,-23, -9, 0,-15, 17, 49, -9,-10,-21,-20,-10, 9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-19,-39,-49,-39,-30, 9,-17,-30,-21,-20,-20,-20,-39,-30,-20,-20,-39,-30,-30,145, 28,-20; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='C'; M=-13,-20, 73,-27,-27, -4,-30,-14,-21,-24,-14,-14,-20,-37,-24,-24,-13,-10,-10,-25, 5,-27; /M: SY='I'; M= -8,-27,-23,-31,-26, -1,-34,-15, 32,-25, 15, 15,-21,-24,-20,-23,-17, -8, 28,-24, -1,-26; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30, 6, 0,-17, 3, 0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23; /M: SY='Q'; M= -2, -5,-20, -5, 4,-25,-16, -6,-13, 5,-19, -6, -2,-13, 19, 2, 9, 1, -9,-28,-13, 11; /M: SY='T'; M= -4,-14,-15,-19,-14, 6,-18,-14, 0,-17, 5, 6,-10,-19,-12,-14, 3, 10, 1,-24, -4,-12; /M: SY='Q'; M= 0, 1,-27, 3, 27,-33,-17, 2,-21, 7,-18, -8, -2, -7, 36, 2, 2, -8,-25,-23,-15, 31; /M: SY='D'; M=-17, 35,-30, 49, 20,-40,-13, 3,-34, 3,-27,-21, 14,-10, 18, -4, 0,-10,-30,-34,-17, 19; /M: SY='G'; M= -1, -8,-30, -7,-19,-30, 67,-19,-40,-19,-30,-20, 1,-20,-19,-20, 0,-20,-30,-21,-30,-19; /M: SY='K'; M=-10, 3,-30, 6, 25,-30,-20, -7,-30, 38,-27,-13, 0, -7, 13, 21, -7,-10,-23,-23,-13, 19; /M: SY='T'; M= 2, 1,-13, -6, 2,-14,-18,-17,-13, -7,-12,-12, -1, -8, -5, -9, 16, 35, -5,-29,-13, -1; /M: SY='L'; M=-13,-22,-23,-24,-14, -1,-25,-10, 5, -8, 23, 18,-19,-25, -7, 9,-22,-10, 1,-20, -3,-12; /M: SY='G'; M= 15,-10,-24,-13,-17,-27, 49,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-14,-21,-20,-27,-17; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of true positive hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | VP35 IID |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
10 sequences
VP35_EBORE (Q91DE0), VP35_EBORR (Q8JPY0), VP35_EBOSU (Q5XX07), VP35_EBOZ5 (Q6V1Q9), VP35_EBOZM (Q05127), VP35_MABVA (Q1PD52), VP35_MABVM (P35259), VP35_MABVO (Q6UY68), VP35_MABVP (Q03039), VP35_MABVR (Q1PDC9)» more
|
| PDB [Detailed view] |
26 PDB
3FKE; 3KS4; 3KS8; 3L25; 3L26; 3L27; 3L28; 3L29; 3L2A; 4GH9; 4GHA; 4GHL; 4IBB; 4IBC; 4IBD; 4IBE; 4IBF; 4IBG; 4IBI; 4IBJ; 4IBK; 4IJE; 4IJF; 4LG2; 5BPV; 6OTC » more |