Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51744
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HC_PRO_CPD |
| Accession [info] | PS51744 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2015 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51744 |
| Associated ProRule [info] | PRU01080 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Helper-component proteinase (HC-Pro) cysteine protease (CPD) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=122; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=117; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2420571; R2=0.0153408; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9759.5917969; R2=11.5726395; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=571; H_SCORE=16368; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=278; H_SCORE=12977; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= 2,-10,-17,-15,-13, -9,-19, -4, 1,-12, -1, 7,-10,-17, -7,-13, -2, 6, 5,-23, -3,-11; /M: SY='Y'; M=-14,-23,-26,-27,-21, 32,-27, 3, -1,-19, 7, 1,-20,-28,-19,-15,-20,-11, -6, 17, 39,-20; /M: SY='V'; M= -3,-12,-12,-16,-12, -9,-24,-20, 11,-14, -1, 0, -9,-21,-15,-16, -4, 1, 17,-30,-12,-14; /M: SY='P'; M= 6,-20,-23,-24,-14, 11,-17,-20,-10,-17,-10,-10,-17, 16,-20,-20, -7, -7,-10,-13, -6,-17; /M: SY='K'; M= -2, -1,-25, -3, 4,-23,-15, -9,-22, 22,-20,-10, 2, -8, 3, 14, -4, -6,-17,-24,-13, 3; /M: SY='E'; M= -2, 13,-22, 13, 18,-25,-11, 4,-22, -1,-22,-16, 12,-11, 6, -6, 7, -3,-19,-33,-16, 11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-26,-22, 39,-30, 6, 2,-17, 8, 2,-21,-30,-18,-13,-21,-10, -5, 20, 59,-22; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 34,-30, 17, 0,-12, 1, 0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 28, 76,-21; /M: SY='L'; M= -4,-25,-20,-30,-21, 1,-27,-19, 23,-23, 24, 21,-21,-23,-15,-20,-16, -6, 16,-22, -4,-19; /M: SY='N'; M=-10, 15,-21, 4, -5, -9,-11, 10,-13, -6,-16,-11, 26,-21, -1, -4, 3, 2,-20,-24, 2, -4; /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-31,-20, 2,-34,-21, 28,-24, 22, 16,-20,-22,-10,-21,-20,-10, 15,-19, 0,-17; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 70,-30,-20, 3,-30, 16, 3,-21,-30,-37,-20,-21,-10, 1, 6, 26,-29; /M: SY='L'; M= 6,-23,-17,-28,-20, 1,-23,-23, 15,-22, 20, 8,-21,-22,-19,-20,-12, -1, 15,-21, -6,-20; /M: SY='P'; M= 6,-18, -8,-19,-11,-18,-18,-12, -9,-16, -9, -8,-16, 15,-13,-20, -8, -8,-10,-28,-17,-14; /M: SY='M'; M= 1,-20,-18,-28,-18, -2,-18, -7, 15,-14, 20, 41,-20,-20, -5,-14,-16, -8, 8,-20, -4,-12; /M: SY='L'; M= -5,-18,-18,-20,-15, 2,-20, -8, 6,-17, 12, 12,-16,-23,-10,-14, -6, -1, 4,-18, 7,-13; /M: SY='F'; M= -7,-20,-21,-27,-22, 15,-13,-19, 6,-21, 5, 4,-14,-24,-21,-18,-12, -9, 6,-14, 0,-21; /M: SY='F'; M=-11, -3,-23, -7, -9, 9,-19, 3,-11,-11, -4, -5, 1,-22, -9, -5, -9, -8,-13,-15, 7, -9; /M: SY='V'; M= -3,-27, 5,-33,-29, -5,-32,-29, 25,-25, 7, 7,-23,-27,-25,-26,-13, -6, 29,-29,-10,-29; /M: SY='P'; M= -7, 6,-25, 5, -2,-23, -8,-12,-18, -7,-23,-16, 7, 11, -7,-11, 5, 5,-18,-32,-19, -6; /M: SY='D'; M=-11, 13,-28, 18, 16,-21, -8, -5,-23, -4,-20,-18, 6, -8, 0,-10, -1, -9,-22,-27,-13, 7; /M: SY='E'; M= 2, 11,-23, 15, 19,-25,-12, -4,-24, -1,-20,-17, 4, -9, 7, -7, 7, -2,-19,-28,-14, 13; /M: SY='N'; M=-11, 18,-24, 13, 9,-22,-11, 17,-22, 0,-21,-13, 24,-16, 7, -1, 3, -5,-25,-33,-11, 8; /M: SY='A'; M= 17,-13,-14,-19,-13,-13,-14,-17, -4, -5, -6, -2,-11,-16,-10, -2, 2, 5, 6,-23,-13,-12; /M: SY='E'; M= -3, 0,-26, 4, 13,-26,-11,-10,-24, 13,-24,-15, -1, -2, 3, 6, 1, -6,-18,-27,-17, 7; /M: SY='S'; M= 1, 3,-19, 2, -3,-14, -8,-11,-18, -5,-15,-13, 3,-15, -6, -4, 8, 5,-12,-28,-13, -5; /M: SY='F'; M=-16,-29,-19,-36,-29, 59,-30,-19, 6,-27, 11, 3,-22,-30,-35,-19,-19, -8, 9, 3, 25,-29; /M: SY='T'; M= -6, 2, -8, 2, -5,-19,-17, -6,-16, -5,-17,-12, 0,-17, -7, -5, 6, 7, -6,-33,-12, -7; /M: SY='R'; M= -8, -3,-26, -4, 6,-22,-18, -6,-24, 25,-20,-10, 1,-15, 6, 34, -6, -8,-15,-23,-13, 4; /M: SY='F'; M=-14,-16,-22,-20,-16, 23,-26,-13, 0,-16, 7, 4,-14,-23,-15,-11,-13, -3, -2, -9, 11,-15; /M: SY='I'; M= -4,-29,-19,-33,-27, 1,-32,-26, 34,-24, 20, 18,-25,-25,-22,-23,-17, -6, 32,-24, -5,-27; /M: SY='E'; M= -8, 5,-26, 4, 16,-24, -5, -3,-27, 8,-22,-16, 9,-12, 5, 15, 1, -5,-24,-27,-18, 9; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Q'; M=-10, -4,-27, -7, 6,-26,-22, -2,-12, 11,-15, 0, -1,-13, 25, 13, -4, -5,-15,-22, -9, 14; /M: SY='L'; M= 3,-23,-12,-27,-21, -2,-24,-23, 16,-22, 19, 10,-22,-24,-19,-20,-12, -2, 17,-24, -8,-20; /M: SY='V'; M= -6,-25, 2,-25,-21,-12,-27,-25, 6,-19, -5, 1,-24, 3,-21,-22,-12, -6, 12,-32,-17,-23; /M: SY='E'; M=-12, 9,-30, 15, 17,-27,-17, -6,-24, 4,-21,-17, 3, 10, 4, -1, -4, -7,-25,-31,-19, 9; /M: SY='S'; M= -1, -2,-20, -4, 0,-17,-16,-11, -7, -1,-10, -2, -2,-14, -1, -6, 1, 0, -3,-28,-13, -1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-19, 20,-29, 49, 22,-30,-30,-19,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 17, -7,-22, -9, 5,-25,-11,-14,-17, -1,-18,-12, -8, 11, 3,-10, 3, -2,-14,-24,-19, 3; /M: SY='W'; M=-20,-35,-44,-36,-28, 20,-23,-19,-14,-19,-14,-14,-34,-30,-20,-18,-34,-24,-24,115, 40,-21; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='T'; M= 0, -2,-14, -8, -6,-13,-17,-17,-13, -3,-12,-10, 0,-11, -6, -5, 16, 31, -4,-30,-11, -6; /M: SY='L'; M=-13,-28,-20,-33,-23, 30,-28,-16, 14,-26, 31, 22,-25,-28,-22,-18,-25,-10, 7,-10, 10,-21; /M: SY='R'; M= -2,-10,-24,-11, -5,-20, 2,-10,-15, -1,-15, -2, -5,-16, 0, 3, -1, -7,-10,-24,-15, -3; /M: SY='D'; M= -9, 19,-24, 23, 12,-26,-12, 6,-22, -2,-20,-13, 13,-13, 5, -6, 3, -4,-19,-34,-14, 8; /M: SY='V'; M= -7,-29,-18,-30,-26, 7,-31,-20, 25,-23, 21, 13,-27,-29,-23,-20,-18, -5, 28,-18, 7,-26; /M: SY='L'; M= 14,-21,-17,-25,-16, -1,-18,-17, 6,-20, 22, 6,-21,-22,-15,-19,-13, -6, 4,-16, -2,-16; /M: SY='R'; M= -7, -3,-22, -9, -6,-16,-14,-13,-15, 7,-14, -8, 1,-15, -4, 11, 1, 11, -9,-25,-11, -6; /M: SY='A'; M= 16,-10,-18,-15, -4,-16,-14,-18, -9, -6,-11, -8,-11,-14, -5,-12, 2, 4, -1,-11,-12, -4; /M: SY='C'; M= -4,-24, 22,-30,-24, -4,-27,-22, 6,-25, 14, 10,-23,-29,-20,-22,-17, -8, 8,-30,-11,-22; /M: SY='L'; M= -8, -7,-12,-11,-12, -8,-22, -8, -2,-11, 4, -1, -5,-23,-10, -8,-13, -8, -5,-24, -4,-12; /M: SY='Y'; M=-13,-10,-25,-17,-13, 4,-21, 3, -3,-10, -2, 7, -4,-22, -4, -5,-12, -7, -9, -4, 10, -9; /M: SY='L'; M= -1,-25,-21,-31,-21, 2,-26,-18, 22,-23, 29, 24,-23,-23,-14,-20,-20, -9, 13,-20, -3,-18; /M: SY='A'; M= 15,-12,-16,-18,-14,-15, -3,-18, -3,-13, -9, -4, -8,-15,-11,-15, 8, 3, 3,-26,-16,-13; /M: SY='T'; M= -4,-12,-20,-17,-10, -9,-23, -9, 0,-10, 2, 0, -9,-17, -8, -4, -3, 9, 2,-25, -6,-11; /M: SY='Y'; M=-16,-16,-26,-18,-14, 15,-26, -3, -2, -6, 4, 4,-14,-24,-11, 0,-18,-10, -5, -3, 23,-14; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-26,-27,-22, 46,-29, 11, -3,-19, 2, 0,-17,-29,-21,-13,-19,-11, -8, 15, 51,-22; /M: SY='P'; M= -8,-17,-37,-10, -4,-29, -4,-20,-23,-12,-29,-19,-15, 65,-12,-19, -7, -9,-28,-28,-29,-12; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= -7, 7,-21, 13, 22,-19,-16, -4,-18, 4,-14,-13, -1, -7, 4, -3, -1, -3,-14,-22, -9, 13; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= 3,-19, 3,-25,-22, -7,-25,-25, 9,-19, 3, 1,-17,-22,-20,-20, -3, 9, 18,-29,-12,-22; /M: SY='Y'; M= -9,-17,-23,-18,-11, -4,-24, -3, 1, -7, 2, 3,-14,-22, -1, 1,-10, -6, 1,-15, 8, -8; /M: SY='D'; M= -9, 17,-13, 18, 3,-27, -6, -5,-28, 1,-26,-19, 15,-15, 2, -1, 7, 0,-22,-34,-18, 2; /M: SY='A'; M= 38, -9, -1,-18,-10,-19, -4,-20,-12,-11,-13,-12, -8,-12,-10,-19, 12, 5, -2,-25,-20,-10; /M: SY='P'; M= -2,-14,-29, -9, 8,-20,-20,-16,-11, -9, -9,-10,-16, 29, -6,-15, -9, -8,-15,-27,-20, -1; /M: SY='L'; M= -4,-23,-18,-27,-21, 0,-27,-13, 18,-22, 20, 15,-21,-24,-17,-18,-15, -3, 18,-24, -3,-20; /M: SY='P'; M= -2,-19,-36,-11, -1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19, 76,-10,-20, -7, -9,-26,-29,-29,-10; /M: SY='V'; M= -9,-16,-24,-17, -7,-11,-26,-18, 4, -7, -1, 0,-13, -8, -9, -1, -8, 1, 5,-25,-10,-10; /M: SY='I'; M=-11,-25,-28,-33,-25, -2,-35,-10, 35,-26, 15, 19,-16,-21,-15,-24,-19,-11, 21,-22, 2,-24; /M: SY='L'; M= 7,-24,-18,-28,-18, 1,-22,-21, 14,-24, 31, 12,-24,-24,-17,-21,-18, -7, 9,-20, -6,-18; /M: SY='V'; M= -3,-24,-15,-24,-22, -1,-28,-25, 15, -6, 2, 5,-23,-26,-22, -9,-11, -3, 32,-25, -7,-22; /M: SY='D'; M=-18, 28,-29, 40, 12,-32,-13, 20,-35, 1,-27,-20, 15,-13, 3, 3, -1,-10,-27,-35,-10, 6; /M: SY='H'; M=-13, -5,-31, -3, -1,-22,-19, 67,-27,-10,-21, -5, 2, 4, 4, -6, -9,-17,-28,-29, 7, -3; /M: SY='A'; M= 4, -4,-23, -3, 4,-21, 1,-15,-13, -9,-14,-11, -5,-13, -7,-14, 1, -6, -7,-27,-19, -2; /M: SY='S'; M= -3, 3,-18, 2, 2,-19,-14, -1,-15, -5,-17,-11, 5,-14, 2, -5, 11, 10, -8,-32,-12, 1; /M: SY='K'; M= -8, -8,-28, -8, 4,-24,-20, -8,-20, 22,-15, -5, -6, -6, 10, 20,-10, -9,-17,-21,-11, 6; /M: SY='T'; M= -4, -5,-17,-10, -5,-15,-20, -5, -8, -9, -8, -4, -3,-14, 4, -7, 8, 21, -4,-28, -7, -1; /M: SY='M'; M=-12,-27,-17,-35,-26, 21,-30,-18, 21,-24, 19, 23,-22,-25,-21,-20,-20, -9, 14,-14, 6,-23; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='V'; M= -4,-21,-21,-21,-16, -9,-24,-21, 8,-16, 0, 3,-19, 6,-16,-18, -6, 3, 11,-28,-13,-18; /M: SY='D'; M=-13, 33,-25, 45, 10,-32, -6, -6,-33, -4,-26,-25, 14,-11, -3,-11, 6, 3,-23,-37,-19, 4; /M: SY='S'; M= 2, -5,-10, -7, -3,-22,-13,-13,-20, -2,-23,-15, -1, 4, -1, -3, 9, 6,-15,-31,-19, -3; /M: SY='F'; M=-15,-20,-24,-22,-15, 20,-25, -6, -6, -8, 5, 0,-14,-26,-13, 8,-14, -8, -6, -5, 19,-15; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= 1, -6, 0,-10, -9, -9,-11,-13, -3,-11,-10, -5, -2,-12, -7,-11, 12, 12, 2,-25,-11, -8; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -3,-25,-19,-26,-19, -2,-27,-21, 17,-16, 21, 11,-23,-25,-16,-13,-17, -6, 18,-23, -6,-18; /M: SY='P'; M= -5, 1,-24, -1, 1,-24,-13, -8,-18, -5,-24,-14, 7, 16, 6, -8, 10, 9,-20,-32,-19, 2; /M: SY='P'; M= -1, -8,-22, -8, -4,-22,-10, -6,-17, -6,-21,-12, -4, 8, -2, -9, 7, 6,-12,-29,-16, -5; /M: SY='G'; M= 1, -9,-25,-10,-16,-25, 48,-17,-31,-17,-26,-14, 0,-18,-15,-17, 6, -9,-23,-24,-25,-16; /M: SY='W'; M=-17,-25,-35,-26,-17, 12,-24, -3, -5,-12, -4, 4,-25,-26, -9,-13,-25,-17,-14, 56, 39,-13; /M: SY='H'; M=-19, -4,-27, -6, -6, -5,-21, 69,-21,-14,-11, 0, 6,-22, 0, -4,-12,-17,-23,-25, 17, -6; /M: SY='I'; M= -5,-20,-22,-24,-18, -2,-25,-15, 12,-14, 5, 8,-17,-13,-13,-12,-10, -2, 10,-18, 2,-18; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22, 7,-30,-19, 25,-27, 41, 25,-27,-27,-17,-20,-27,-10, 14,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-15, -3, 5,-25,-19, -7,-24, 25,-22, -8, 2,-14, 7, 19, -6, -5,-18,-25,-12, 6; /M: SY='A'; M= 15,-19, 3,-25,-19,-11,-18,-23, 5,-19, 0, 0,-17,-21,-17,-21, -2, -2, 12,-27,-15,-19; /M: SY='G'; M= 2, 4,-20, -2, -8,-23, 18, -9,-22,-10,-25,-15, 14,-17, -5,-11, 11, -3,-18,-30,-22, -6; /M: SY='T'; M= 0, 2,-12, -6, -6,-14,-14,-15,-14, -7,-17,-13, 6,-11, -6, -4, 22, 36, -5,-32,-13, -6; /M: SY='V'; M= -3,-28,-16,-29,-26, -2,-30,-28, 26,-21, 11, 9,-27,-19,-26,-21,-12, -1, 36,-28, -9,-27; /M: SY='A'; M= 3, -6,-22, -9, -8,-14, 3, -9,-18, -2,-16,-11, -1,-17, -7, -6, 2, -3,-14,-17, -4, -8; /M: SY='Q'; M=-10, 12,-27, 16, 24,-32,-14, 11,-26, 4,-23,-13, 10, -9, 25, 1, 5, -6,-27,-30,-14, 24; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 24,-30,-20, 17,-30, 40, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 9,-14, 6,-22; /M: SY='I'; M= -9,-26,-23,-30,-23, 1,-33,-15, 29,-23, 13, 13,-21,-24,-19,-22,-16, -8, 25,-20, 4,-24; /M: SY='S'; M= -2, 7,-21, 7, 2,-22,-14,-11,-16, -1,-18,-13, 5, -7, -1, -7, 8, 7,-12,-31,-15, 0; /M: SY='F'; M= -9,-29,-19,-33,-23, 32,-28,-20, 11,-29, 31, 11,-25,-29,-26,-20,-23, -9, 6, -9, 9,-23; /M: SY='A'; M= 14, -6, -9, -9,-10,-16,-13,-17, -4,-14, -1, -1,-10,-17,-12,-19, -4, -5, 0,-26,-14,-11; /M: SY='T'; M= 0, -6,-16,-11, -9,-10,-15, 1, -7,-13, -3, 0, -2,-16, -6,-11, 7, 13, -5,-29, -7, -8; /M: SY='B'; M=-11, 15,-24, 13, 9,-21,-13, 5,-19, 3,-17, -5, 14,-13, 4, 1, 0, -3,-19,-31,-12, 6; /M: SY='N'; M= -2, 4,-23, 0, -5,-20, 3,-11,-14, -7,-16,-11, 8,-17, -8,-10, 1, -4,-12,-28,-17, -7; /M: SY='L'; M= -1,-14,-20,-16,-13, -7,-15,-18, 7,-19, 11, 3,-12,-21,-15,-18,-10, -4, 6,-25,-10,-15; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= -8, 7,-23, 9, 12,-21, -4, -5,-19, 2,-16,-12, 5, -9, 3, 1, -1, -6,-17,-23,-14, 7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= 0, 6,-10, 1, -2,-23, 13, -9,-26,-10,-29,-20, 16,-16, -5,-11, 18, 2,-21,-35,-23, -4; /M: SY='E'; M= -5, 8,-28, 14, 34,-28,-10, -6,-27, 2,-21,-19, 1, 3, 8, -6, 2, -5,-26,-30,-21, 20; /M: SY='M'; M= -6,-23, -9,-30,-22, 7,-24,-11, 12,-19, 19, 27,-22,-25,-13,-17,-19, -9, 8,-17, 3,-18; /M: SY='K'; M= -6,-12,-25,-13, -2,-15,-22,-11, -8, 11, 2, 6,-12,-17, 3, 5,-15, -9, -8,-20, -7, 1; /M: SY='D'; M=-10, 18,-24, 21, 16,-24,-14, 6,-24, -3,-19,-16, 13,-11, 5, -6, 4, 1,-22,-34,-13, 10; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-29,-20,-21, 26,-17, 12, -5,-13, -3, -3,-17,-29,-14,-12,-17,-11,-12, 22, 62,-21; /M: SY='R'; M=-12, -3,-29, -6, 1,-21,-20, -8,-15, 13,-18, -9, 4, -1, 1, 16, -8, -8,-16,-25,-14, -2; /M: SY='V'; M= -3,-28,-15,-31,-28, -1,-32,-29, 32,-22, 11, 11,-25,-26,-26,-22,-10, 2, 41,-27, -7,-28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 62 in 62 different sequences |
| Number of true positive hits | 62 in 62 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C6 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
62 sequences
MVP_BCMNN (P0CJ94), MVP_BTMV(P0CJ96), MVP_BYMV(P0CJ95), MVP_LMV0(P0CJ97), MVP_LMVE(P0CW79), MVP_PEMVC (P0CK01), MVP_PEMVM (P0CK00), MVP_PPVD(P0CK03), MVP_PPVNA (P0CK02), MVP_PPVSK (P0CK04), MVP_PRSVH (P0CJ98), MVP_PSBMV (P0CJ99), MVP_PVMA(P0CK05), MVP_PVYHU (P0CK06), MVP_PVYN(P0CJ93), MVP_SBMVG (P0CK07), MVP_SBMVN (P0CK08), MVP_TEV (P0CK09), MVP_TUMVJ (P0CK11), MVP_TUMVQ (P0CK12), MVP_TVMV(P0CK10), MVP_ZYMVC (P0CK13), MVP_ZYMVR (P0CK14), MVP_ZYMVS (P0CK15), POL2_BAMMA (Q65329), POL2_BAMMN (P89684), POL2_BAMMU (Q65657), POL2_BAYMG (Q01365), POL2_BAYMJ (Q01207), POL2_BAYMY (Q9YJW2), POLG_BCMNN (Q65399), POLG_BSTV1 (Q65730), POLG_BTMV (Q6XW15), POLG_BVY3 (A0AUJ5), POLG_BYMV (P17765), POLG_LMV0 (P31999), POLG_LMVE (P89876), POLG_PEMVC (Q01500), POLG_PEMVM (O56075), POLG_PPVD (P13529), POLG_PPVNA (P17766), POLG_PPVRA (P17767), POLG_PPVSK (Q84934), POLG_PRSVH (Q01901), POLG_PSBMV (P29152), POLG_PVMA (Q85197), POLG_PVYC (P22601), POLG_PVYHU (Q02963), POLG_PVYN (P18247), POLG_PVYO (P22602), POLG_RGMVD (O11436), POLG_SBMVG (Q90069), POLG_SBMVN (P21231), POLG_SPMMV (P89201), POLG_TEV(P04517), POLG_TRMVU (A4KZ49), POLG_TUMVJ (P89509), POLG_TUMVQ (Q02597), POLG_TVMV (P09814), POLG_ZYMVC (P18479), POLG_ZYMVR (Q89330), POLG_ZYMVS (O36979)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
3RNV |