PROSITE logo

PROSITE entry PS51750


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] BRO_N
Accession [info] PS51750
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-MAR-2015 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51750
Associated ProRule [info] PRU01086

Name and characterization of the entry

Description [info] Bro-N domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=117;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=112;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1276999; R2=0.0133987; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10243.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=644; H_SCORE=10243; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=495; H_SCORE=10243; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M=  4, -9,-19,-12,  1,-17,-17,  5, -1,  6,  3, 18, -2,-18,  4,  0,-10, -3, -5,-25, -8,  1;
/M: SY='M';  M=  3, -3,-19, -9, -8,-10,-15, -8,  3,  1,  2, 10,  6,-20, -5, -8, -6,  6,  1,-31, -7, -7;
/M: SY='K';  M=  5, -2,-21, -3,  4,-10,-10,-12, -6,  6, -6,  2, -2,-10,  0, -5,  0, -3, -6,-25,-12,  1;
/M: SY='I';  M= -2, -9, -9,-17,-14,  2,-16,-14, 21,-12, 16, 10, -2,-22,-13,-17,-10,  4, 12,-30,  1,-14;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='Q';  M=  5, -3,-22, -2,  5,-23, -4,-11,-12,  4,-13, -7, -3,  2, 15,  1,  3,  2,-14,-21,-14,  7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='Q';  M=  3, -3,-19, -6, -1,-15,-12, -6, -4,  2, -9, -1,  3,  0,  4, -3,  1,  4, -6,-29,-13, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='F';  M=-14,-24,-19,-36,-29, 55,-24,-25, 11,-13, 18, -9,-12,-33,-24,-13,-11,-11, 15,  2, 20,-29; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='N';  M=  0,  4,-10,  0,  3,-11,-15,-13, -4,  2, -5,  1,  8,-12,  1, -6, -3,  1, -7,-30,-11,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='F';  M=-15,-22,-28,-34,-28, 61,-21,-19,  1, -9, 14,-12, -9,-31,-22, -9, -8,-13,  7,  6, 24,-29; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='N';  M=  0, 10,-19, 10,  1,-23,  5, -6,-14,  0,-14, -9, 11, -6, -2, -6,  0, -6,-18,-25,-19, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='N';  M=  2, 12,-17, 10,  7,-23,  5, -8,-14,  3,-15,-10, 15, -5,  2, -9,  3, -3,-20,-26,-21,  5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='K';  M= -2, -2,-22,  0, -1,-11,-10, -2, -9,  1, -6, -2, -3, -8, -1, -1, -1, -4, -7,-20, -4, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='P';  M=  4, -2,-20, -3,  4,-18, -6,-11, -9,  5,-12, -6, -2,  8,  2, -7,  4,  4,-11,-26,-15,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M= -5,-19,-19,-28,-24, 25,-19,-19, 26,-15, 18,  3,-12,-31,-20,-15,-11, -4, 23,-12, 12,-24; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -1,  2,-15,  5,  9,-21,-16, -4,-18,  7,-12, -2,  2, -4,  7,  8,  1, -5,-13,-26,-12,  8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M=  1,-13, -5,-19,-19,  7,-21,-21, 24,-17, 16,  5,-10,-26,-18,-19, -7,  9, 23,-27,  4,-18; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='Y';  M= -7,-13,-18,-10, -9,  1,-12,-10, -3, -5, -1, -5,-14,-10, -1,  8, -8, -9,  2,  7,  9, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='V';  M=  2, -9,-12,-10,-14,  3,-14,-14, 19,-11,  8,  1, -8,-19,-12, -9, -5,  5, 21,-17,  5,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='I';  M=  0,-10,-15,-13,-10,  3,-16,-10, 13, -7,  9,  6, -8,-18, -8, -9, -7,  2, 12,-20,  4, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='D';  M=  2,  7,-20, 11, -2,-23,  3,-13, -8,  0, -6, -7,  3, -9, -7,-11,  1, -1, -9,-23,-14, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M:         M= -2, -5,-18, -3, -2,-13,-13, -6, -4, -2, -3, -6, -6, -3, -4, -8, -3, -2, -3,-23, -5, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='N';  M=  0, 16,-17, 16, -1,-22, -4,-12, -8, -2, -8, -7, 18,-14, -6,-15, -3, -2,-12,-34,-18, -3;
/M: SY='G';  M=  1, 15,-26, 13,  0,-28, 21,-16,-16, -2,-16,-15, 14,-10,  2, -9, -2, -8,-25,-20,-22,  0;
/M: SY='E';  M=  0,  0, -8,  2, 20,-23,-16, -6,-16,  8,-11, -5, -1,  1, 14, -1, -2, -6,-18,-22,-14, 18;
/M: SY='P';  M= -2,-16,-24,-16,-10, -8,-15, -9,  3, -4, -6,-13,-16, 19,-13,-12, -6,  3,  1,-25, -5,-14;
/M: SY='W';  M=-32,-32,-30,-22,-10, 12, -8,-24,-15,-11,  1,-11,-44,-23, -9, -1,-21,-26,-10, 93, 46,-11;
/M: SY='F';  M=-16,-27,-24,-39,-30, 64,-28,-21,  3, -8, 20, -7,-13,-36,-24, -9,-13,-14, 11,  5, 27,-31;
/M: SY='V';  M=  3, -9, -8,-13, -8, -2,-20,-23,  9, -2, -2,  2, -3,-18,-14, -8, -4,  3, 11,-29, -8,-11;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= 18, -2,-27, -5, -8,-16, 21,-20,  0, -6, -5,  2, -3,-13, -5,-14,  3, -1, -4,-25,-24, -8; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=  1,  4,-23,  0,  7, -9,-10, -8,-11, 14,-12,  8, 11, -6, -1, -1,  1, -3,-13,-31,-13,  2;
/M: SY='D';  M=  1, 29,-25, 54, 12,-41, -8,-14,-31,  3,-13,-24,  5,  3, -3, -9, -1, -7,-21,-35,-15,  5;
/M: SY='I';  M= -2,-19, -8,-30,-25, 17,-21,-24, 34,-18, 18,  3,-10,-33,-23,-19,-11, -1, 30,-23,  2,-26;
/M: SY='A';  M= 24, -5, -1, -7, -2,-17, -8,-23,  2, -6, -3,  7, -3,-16,  1,-13,  2,  5,  7,-42,-34, -3;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=  0,  2,-18,  8, 14,-21,-13,-10,-18, 13,-12, -1, -2,  0,  5,  4,  1, -7,-15,-23,-11, 10;
/M: SY='I';  M=  7,-10,-21,-17,-14,  0, -4,-16, 12, -9,  3,  1, -4,-20,-11,-16,  1,  1, 10,-25,-12,-15;
/M: SY='L';  M= -8,-12, -4,-14,-13, 20,-20,-12, 22,-19, 36, 18,-18,-30,-20,-19,-18,  0, 13,-21, 25,-13;
/M: SY='G';  M=  0,  3,-22,  1,  4,-26, 24,-20,-17,  6,-17, -9,  2, -5, -2, -5,  0,-13,-24,-10,-22,  1;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='Y';  M=-30,-24,-40,-15,-18, 26,-27,  0, -4,-11, 24, -6,-27,-21,-12, -4,-17,-10,  8, 25, 59,-18; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='K';  M=  6, -2,-22, -3,  2,-13,-10,-14, -8,  9, -8,  3, -1, -4,  0, -4,  8,  7, -5,-26,-10,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='N';  M= -1, 17,-13, 14,  5,-21,-10, -8,-14,  6,-13, -3, 24, -9, -1, -7,  0,  0,-17,-40,-20,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='P';  M=  0,-10,-15, -9, -4,-18,-13, -9, -6, -3, -9,-13,-12, 19, -5,-12, -1,  6, -6,-27,-11, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='K';  M=  0,  3,-16,  3,  6,-14, -9, -8,-15,  8,-13, -1,  6, -7,  3,  4,  3, -4,-15,-25,-13,  3; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='K';  M=  0,  4,-24,  7,  3,-14,-11, -9,-15,  9,-10,  0,  3, -7,  7,  7, -2, -5,-12,-22, -7,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='A';  M= 22, -5,-22, -6, -5,-11, -5,-19,  1, -3, -5,  4, -4,-11,  0,-10,  6,  8,  8,-36,-23, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='I';  M= -5,-17,-18,-23,-20,  6,-17, -9, 32,-16, 20,  9,-12,-24,-18,-19,-13,  0, 24,-21, 11,-20; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='R';  M= -1, -5,-20, -2, -2, -9,-11,-12,-11,  6, -7,  2, -6, -6,  6, 15, -3, -6, -6,-17, -3, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='K';  M=  1,  5,-20,  7,  4,-14,-11,-11, -9,  8,-10,  0,  4, -7,  2,  2,  0, -4, -8,-24, -9,  1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='H';  M=-16,-15,-35,-12, -3, -7,-23, 48,-14, -6, -1,  9,-11, -5,  2,  4,-10,-14,-14,-18, 14, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='V';  M=  3,-16, -5,-18,-22,  7,-26,-25, 31,-20, 15,  3,-16,-35,-25,-15,-10,  6, 34,-28,  7,-23;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='D';  M=  0, 15,-24, 28,  6,-27, -6,-11,-23,  6,-14,-14,  4,  3, -4, -3,  3, -4,-18,-31,-14,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='D';  M=  2, 11,-23, 18,  7,-27, -4, -7,-18,  4,-13,-10,  4,  2, -2, -7,  2, -4,-17,-30,-16,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='E';  M=  0,  5,-18, 10, 12,-22,-11, -8,-18,  9,-12, -4,  0, -3,  4, -3,  2, -4,-15,-22,-11,  8; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='Y';  M=-16, -1,-26,  2, -6, -3,-14,  2,-15, -7, -3,-10,  0,-15, -6, -8, -9,-10,-13,  1, 12, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='K';  M= -1, -5,-21, -4, 12,-10,-13,-16,-14, 22,-13, 11, -4, -1,  6, 11, -4, -9,-14,-14, -6,  8; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='V';  M=  0, -7,-17,-10, -6, -2,-13,-17,  4,  3, -2,  4, -4,-12, -6, -2, -1, -1,  5,-21, -4, -8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='T';  M=  3, -1,-13, -7, -9,-10,-14,-16,  0, -4, -2,  0,  5, -8, -5,-15,  8, 19,  2,-33, -8, -8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='W';  M=-21,-24,-26,-23,-15, 24,-15,-15, -3,-11, 11, -7,-28,-22,-14, -8,-13,-13, -1, 39, 35,-16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E';  M= -1,  0,-16,  6, 18,-21,-11, -5,-19,  9,-10, -6, -5, -1,  6, -2,  3, -7,-17,-17, -9, 13; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E';  M= -1,  2,-13,  5, 12,-20,-12, -6,-13,  4, -6, -3,  0, -6,  7, -5, -2, -4,-14,-19, -9, 11; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='I';  M= -1,-12,-13,-19,-16,  8,-10,-14, 23,-13, 16,  7, -8,-21,-15,-16, -9,  0, 16,-20,  4,-16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='I';  M=  0, -3, -7, -9, -4, -6, -9,-10,  3, -3, -2,  2,  3,-13, -1, -4, -4, -2, -1,-22,-10, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-13, -2, -4, -6, -6,-11, -3,  0, -4, -3,  2, -9, -5, -5,  4,  2, -2,-19, -8, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='R';  M= -3, -2,-19,  0, -1, -9, -8, -4, -8,  1, -5, -1, -3, -6,  1,  2, -3, -4, -6, -9,  1, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='I';  M= -2, -5, -8, -7, -6,  0, -5, -7,  3, -3,  3,  2, -5, -8, -5, -1, -5, -2,  2,-10,  1, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='T';  M=  1, -1, -6,  1, -2, -6, -7, -6, -3, -3, -1, -4, -3, -3, -4, -5,  1,  2, -1,-15, -4, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='P';  M=  0, -3,-16, -1, -3,-11, -8,  1, -3, -1, -7, -5, -3,  5, -5, -5,  2,  3, -3,-20, -6, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='D';  M=  0, 14, -7, 16,  4,-16, -5, -7,-11,  1, -8, -8, 14, -7, -1, -8,  1,  0,-12,-24,-13,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='S';  M=  2,  1,-13, -3, -4, -3,  1, -7, -2, -1, -5, -3,  5, -8, -7, -8,  6,  3, -6,-19, -9, -7; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Y';  M= -4, -9,-12,-10, -9,  6, -9, -6,  3, -7,  5, -1,-10,-10, -7, -5, -4,  0,  4, -3,  9, -9; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='D';  M=  1,  5,-12,  8, -2,-16, -8,-11, -4, -3, -1, -4,  2, -9, -3, -9, -1,  2, -4,-23, -8, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='P';  M= -1, -8,-13, -6,  2,-16,-12, -5, -8,  0, -6,-10,-11, 25, -4,-13,  1,  9,-11,-26, -8, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M:         M=  0, -4,-17, -7, -8, -4, -7,-10, -1, -3, -3,  0,  0,-11, -5,  0,  0,  0, -3,-24, -6, -9; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='N';  M= -8,  6,-30,  2, -8,-10,  2,  0,-10, -2, -8, -4, 15,-14, -8, -7, -2, -4,-14,-21, -3, -9; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='W';  M= -9, -7,-17,-10, -8, -6, -1,-17, -3, -6, -4, -4, -6,-19, -8, -5, -7,-10, -8,  9,  0, -8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Q';  M=  1, -4,-22, -2, 11,-24,-15, 10,-15,  2,-12, -2, -4,  2, 17,  1, -2, -3,-17,-26,-11, 12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='P';  M=  0, -3,-25, -2,  4,-23, -5, -4,-19,  7,-20,-11, -3, 20, 13,  8, -3, -4,-23,-25,-16,  4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='K';  M= -1,  6,-23,  5, 10,-20, -9,  3,-19, 11,-17,  0, 10,  1,  6,  3,  0, -7,-21,-30,-16,  6;
/M: SY='T';  M= 10, -3,-21, -9,-15,-13,-13,-18,  4, -7,  1,  3,  3,-12, -3,-17,  8, 24,  9,-39,-10,-11;
/M: SY='I';  M=  0,-12,-16,-19,-17, -1,-16,-20, 22,-10,  6,  5, -6,-25,-13, -9, -7,  1, 19,-21, -2,-17;
/M: SY='F';  M=-17,-23,-19,-30,-24, 43,-25,-18, 10,-14, 24, -3,-17,-32,-22,-13,-15,-10, 13,  4, 30,-25;
/M: SY='I';  M=  0,-19,-18,-32,-28, 10,-17,-22, 48,-20, 20,  7, -8,-33,-23,-23,-11,  1, 37,-27,  1,-28;
/M: SY='N';  M=  3, 18,-17,  6, -8,-11, -6,-12, -5, -2,-12, -6, 35,-18, -8,-17, 12, 17,-10,-48,-20, -9;
/M: SY='E';  M= -1,  0, -5,  7, 36,-28,-17, -6,-25, 19,-11, -3, -6,  7, 13,  1, -2,-15,-24,-16,-14, 29;
/M: SY='P';  M=  5, -5,-24, -4,  1,-17, -7, -4,-11,  2,-13,-10, -6, 11, -1, -6,  6,  2,-11,-30,-17, -3;
/M: SY='G';  M=  2,  2,-38, -6,-17,-30, 69,-28,-11, -8,-19,-18,  1,-11,-16,-18,  0,-18,-28,  4,-29,-17;
/M: SY='I';  M=  0,-16, -5,-20,-19, 12,-23,-18, 26,-16, 22, 12,-15,-34,-22,-15,-14,  2, 24,-25, 10,-19;
/M: SY='Y';  M=-24,-23,-41,-20,-20, 23,-23,  0,  5,-11, 20, -2,-22,-22,-14, -8,-15, -9, 10, 15, 46,-20;
/M: SY='Q';  M=  5, -4,-18, -2, 13,-16,-14, -8,-13,  5, -7, -2, -5, -5, 19,  2,  0,  0,-12,-19, -7, 14;
/M: SY='L';  M= -6,-12, -6,-15,-14, 16,-19,-13, 25,-18, 33, 17,-16,-30,-19,-20,-16,  1, 16,-23, 20,-14;
/M: SY='I';  M=  2,-17,-14,-29,-22,  5,-15,-17, 37,-15, 19, 12, -6,-30,-18,-21,-11,  0, 27,-28, -4,-22;
/M: SY='M';  M=  0,-10,-20,-20,-15,  8,-13,-10, 11, -2, 11, 13,  2,-29,-14,-12, -8, -2,  5,-22, -2,-16;
/M: SY='R';  M=  1, -6,-26, -7,  0, -8, -8, -6,-13,  8,-12,  3, -3, -7,  3, 10,  2, -7,-10,-21, -9, -2;
/M: SY='S';  M=  6, -4, -4, -6, -1,-12, -6,-11, -8, -4,-13,-13, -2,-10, -8,-12, 22, 11, -8,-30,-22, -8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='K';  M=  1,  2,-20,  1,  6,-17,-11,-14,-17, 14,-15,  3,  5, -2, 10, 11,  2, -2,-14,-25,-13,  6; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='M';  M=  0, -4,-18, -6, -1, -4,-12,-10, -3,  7,  3, 12, -2,-10, -8, -7, -4,  1, -7,-26, -3, -4; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='P';  M= -1, -6,-24,  0,  8,-30, -8,  0,-16,  5,-17,-19,-13, 42, -1,-10, -3, -1,-20,-29,-18,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='A';  M=  5, -2,-22, -5, -6, -5,-10,-16,  3, -1, -3,  1,  3,-17, -7,-10,  0,  4,  4,-27, -7, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='A';  M= 29, -3,-25, -3, -2,-16, -3,-17,  2, -2, -8,  7, -2,-11,  3,-10,  8,  8,  8,-44,-31, -3;
/M: SY='E';  M=  2, -5,-21, -3, 14,-17,-13, -6,-13, 14,-11,  4, -6,  0,  7,  3, -2, -9,-12,-19,-11, 10;
/M: SY='E';  M= -1, -4,-14, -1, 19,-25,-11, -6,-19, 11,-14, -4, -6,  5, 13,  6, -4,-12,-19,-14,-14, 16;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='F';  M=-16,-24,-16,-38,-28, 65,-27,-25,  5,-10, 20, -8,-12,-35,-25,-11,-12,-14,  9,  0, 22,-29;
/M: SY='Q';  M=  2, -8,-22, -8,  5,-17,-16, -8,-15, 11,-13,  5, -6, -6, 27, 25, -5, -7,-14,-16, -7, 11;
/M: SY='D';  M=  1,  9,-22, 14,  7,-21, -9,-11,-19,  9,-13, -2,  7, -7,  5,  7, -1, -8,-15,-27,-14,  5;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='W';  M=-37,-38,-23,-32,-12, 15,  2,-37,-19,-16, -7,-20,-52,-27,-11, -3,-24,-35,-18,134, 43,-12; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='I';  M=  1,-14,-14,-20,-23, 14,-22,-21, 31,-17, 18,  6,-11,-34,-24,-15,-12,  4, 30,-26, 11,-23; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='F';  M= -6,-11,-18,-16,-15, 16,-18,-14,  5, -9, 12,  0, -6,-20,-13,-14, -4,  4,  7,-17, 12,-15; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E';  M=  2, 11,-12, 14, 15,-21, -4,-11,-17,  6,-11,-11,  8, -7, -1,-11,  6, -5,-17,-25,-18,  9; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='E';  M=  1,  6,-12, 14, 19,-26,-15, -7,-15,  6, -6, -7, -1, -4,  3,-10,  0, -6,-12,-25,-12, 14;
/M: SY='I';  M=  3,-13,-17,-16,-21,  7,-19,-22, 28,-15, 13,  5,-11,-32,-21,-11,-10,  3, 28,-27,  6,-21;
/M: SY='L';  M= -8, -9, -9,-11,-12, 15,-19,-11, 19,-16, 29, 12,-14,-28,-19,-18,-16, -2, 12,-21, 20,-13;
/M: SY='P';  M= -6,-10,-26, -1, 11,-34,-12,  5,-25,  9,-23,-26,-19, 69,  1, -7, -8, -3,-30,-30,-17,  3;
/M: SY='Q';  M=  7, -2,-15, -3,  6,-17,-14,-11, -9,  0, -7, -5,  0, -6, 12, -7,  9, 12, -8,-29,-13,  8;
/M: SY='I';  M=  0,-15, -8,-23,-18,  3,-17,-18, 31,-16, 19,  9, -9,-26,-17,-20,-11,  2, 23,-27,  1,-18;
/M: SY='R';  M= -6,-11, -6, -9, -4,-11,-19,-12,-14,  2, -9,  0, -8,-14, 12, 31, -8,-14, -6,-15, -6,  0;
/M: SY='K';  M=  2, -4,-12, -5,  6,-10,-13,-18,-10, 12,-11,  5, -1, -7,  1,  4,  1, -3, -9,-24,-13,  2;
/M: SY='T';  M=  0, -3,-23, -8, -6,-10,-19,  6, -9, -4, -5,  1,  5, -7,  5, -6,  2,  8, -6,-33, -7, -2;
/M: SY='G';  M=  2, -2,-29, -8, -8,-22, 32,-18,-10, -2,-14, -8,  0, -5, -7,-13,  0, -8,-20,-10,-21, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.


Total number of hits 9 in 9 different sequences
Number of true positive hits 9 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Bro-N
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
9 sequences

069L_IIV6   (O55709), 289L_IIV6   (Q91FN5), BROJ_NPVLD  (Q9YML3), 
VF201_IIV3  (Q197E1), VF201_IIV6  (Q91FW9), Y002_NPVAC  (P24655), 
Y1418_HAEIN (P44189), YL002_MIMIV (Q5UP77), YR125_MIMIV (Q5UPJ6)
» more