PROSITE entry PS51750
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BRO_N |
| Accession [info] | PS51750 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2015 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51750 |
| Associated ProRule [info] | PRU01086 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Bro-N domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=117; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=112; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1276999; R2=0.0133987; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10243.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=644; H_SCORE=10243; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=495; H_SCORE=10243; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= 4, -9,-19,-12, 1,-17,-17, 5, -1, 6, 3, 18, -2,-18, 4, 0,-10, -3, -5,-25, -8, 1; /M: SY='M'; M= 3, -3,-19, -9, -8,-10,-15, -8, 3, 1, 2, 10, 6,-20, -5, -8, -6, 6, 1,-31, -7, -7; /M: SY='K'; M= 5, -2,-21, -3, 4,-10,-10,-12, -6, 6, -6, 2, -2,-10, 0, -5, 0, -3, -6,-25,-12, 1; /M: SY='I'; M= -2, -9, -9,-17,-14, 2,-16,-14, 21,-12, 16, 10, -2,-22,-13,-17,-10, 4, 12,-30, 1,-14; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='Q'; M= 5, -3,-22, -2, 5,-23, -4,-11,-12, 4,-13, -7, -3, 2, 15, 1, 3, 2,-14,-21,-14, 7; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='Q'; M= 3, -3,-19, -6, -1,-15,-12, -6, -4, 2, -9, -1, 3, 0, 4, -3, 1, 4, -6,-29,-13, -1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='F'; M=-14,-24,-19,-36,-29, 55,-24,-25, 11,-13, 18, -9,-12,-33,-24,-13,-11,-11, 15, 2, 20,-29; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='N'; M= 0, 4,-10, 0, 3,-11,-15,-13, -4, 2, -5, 1, 8,-12, 1, -6, -3, 1, -7,-30,-11, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='F'; M=-15,-22,-28,-34,-28, 61,-21,-19, 1, -9, 14,-12, -9,-31,-22, -9, -8,-13, 7, 6, 24,-29; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='N'; M= 0, 10,-19, 10, 1,-23, 5, -6,-14, 0,-14, -9, 11, -6, -2, -6, 0, -6,-18,-25,-19, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='N'; M= 2, 12,-17, 10, 7,-23, 5, -8,-14, 3,-15,-10, 15, -5, 2, -9, 3, -3,-20,-26,-21, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='K'; M= -2, -2,-22, 0, -1,-11,-10, -2, -9, 1, -6, -2, -3, -8, -1, -1, -1, -4, -7,-20, -4, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='P'; M= 4, -2,-20, -3, 4,-18, -6,-11, -9, 5,-12, -6, -2, 8, 2, -7, 4, 4,-11,-26,-15, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= -5,-19,-19,-28,-24, 25,-19,-19, 26,-15, 18, 3,-12,-31,-20,-15,-11, -4, 23,-12, 12,-24; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='E'; M= -1, 2,-15, 5, 9,-21,-16, -4,-18, 7,-12, -2, 2, -4, 7, 8, 1, -5,-13,-26,-12, 8; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= 1,-13, -5,-19,-19, 7,-21,-21, 24,-17, 16, 5,-10,-26,-18,-19, -7, 9, 23,-27, 4,-18; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='Y'; M= -7,-13,-18,-10, -9, 1,-12,-10, -3, -5, -1, -5,-14,-10, -1, 8, -8, -9, 2, 7, 9, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='V'; M= 2, -9,-12,-10,-14, 3,-14,-14, 19,-11, 8, 1, -8,-19,-12, -9, -5, 5, 21,-17, 5,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= 0,-10,-15,-13,-10, 3,-16,-10, 13, -7, 9, 6, -8,-18, -8, -9, -7, 2, 12,-20, 4, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='D'; M= 2, 7,-20, 11, -2,-23, 3,-13, -8, 0, -6, -7, 3, -9, -7,-11, 1, -1, -9,-23,-14, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: M= -2, -5,-18, -3, -2,-13,-13, -6, -4, -2, -3, -6, -6, -3, -4, -8, -3, -2, -3,-23, -5, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='N'; M= 0, 16,-17, 16, -1,-22, -4,-12, -8, -2, -8, -7, 18,-14, -6,-15, -3, -2,-12,-34,-18, -3; /M: SY='G'; M= 1, 15,-26, 13, 0,-28, 21,-16,-16, -2,-16,-15, 14,-10, 2, -9, -2, -8,-25,-20,-22, 0; /M: SY='E'; M= 0, 0, -8, 2, 20,-23,-16, -6,-16, 8,-11, -5, -1, 1, 14, -1, -2, -6,-18,-22,-14, 18; /M: SY='P'; M= -2,-16,-24,-16,-10, -8,-15, -9, 3, -4, -6,-13,-16, 19,-13,-12, -6, 3, 1,-25, -5,-14; /M: SY='W'; M=-32,-32,-30,-22,-10, 12, -8,-24,-15,-11, 1,-11,-44,-23, -9, -1,-21,-26,-10, 93, 46,-11; /M: SY='F'; M=-16,-27,-24,-39,-30, 64,-28,-21, 3, -8, 20, -7,-13,-36,-24, -9,-13,-14, 11, 5, 27,-31; /M: SY='V'; M= 3, -9, -8,-13, -8, -2,-20,-23, 9, -2, -2, 2, -3,-18,-14, -8, -4, 3, 11,-29, -8,-11; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= 18, -2,-27, -5, -8,-16, 21,-20, 0, -6, -5, 2, -3,-13, -5,-14, 3, -1, -4,-25,-24, -8; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= 1, 4,-23, 0, 7, -9,-10, -8,-11, 14,-12, 8, 11, -6, -1, -1, 1, -3,-13,-31,-13, 2; /M: SY='D'; M= 1, 29,-25, 54, 12,-41, -8,-14,-31, 3,-13,-24, 5, 3, -3, -9, -1, -7,-21,-35,-15, 5; /M: SY='I'; M= -2,-19, -8,-30,-25, 17,-21,-24, 34,-18, 18, 3,-10,-33,-23,-19,-11, -1, 30,-23, 2,-26; /M: SY='A'; M= 24, -5, -1, -7, -2,-17, -8,-23, 2, -6, -3, 7, -3,-16, 1,-13, 2, 5, 7,-42,-34, -3; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= 0, 2,-18, 8, 14,-21,-13,-10,-18, 13,-12, -1, -2, 0, 5, 4, 1, -7,-15,-23,-11, 10; /M: SY='I'; M= 7,-10,-21,-17,-14, 0, -4,-16, 12, -9, 3, 1, -4,-20,-11,-16, 1, 1, 10,-25,-12,-15; /M: SY='L'; M= -8,-12, -4,-14,-13, 20,-20,-12, 22,-19, 36, 18,-18,-30,-20,-19,-18, 0, 13,-21, 25,-13; /M: SY='G'; M= 0, 3,-22, 1, 4,-26, 24,-20,-17, 6,-17, -9, 2, -5, -2, -5, 0,-13,-24,-10,-22, 1; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='Y'; M=-30,-24,-40,-15,-18, 26,-27, 0, -4,-11, 24, -6,-27,-21,-12, -4,-17,-10, 8, 25, 59,-18; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='K'; M= 6, -2,-22, -3, 2,-13,-10,-14, -8, 9, -8, 3, -1, -4, 0, -4, 8, 7, -5,-26,-10, 0; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='N'; M= -1, 17,-13, 14, 5,-21,-10, -8,-14, 6,-13, -3, 24, -9, -1, -7, 0, 0,-17,-40,-20, 1; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='P'; M= 0,-10,-15, -9, -4,-18,-13, -9, -6, -3, -9,-13,-12, 19, -5,-12, -1, 6, -6,-27,-11, -7; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='K'; M= 0, 3,-16, 3, 6,-14, -9, -8,-15, 8,-13, -1, 6, -7, 3, 4, 3, -4,-15,-25,-13, 3; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='K'; M= 0, 4,-24, 7, 3,-14,-11, -9,-15, 9,-10, 0, 3, -7, 7, 7, -2, -5,-12,-22, -7, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='A'; M= 22, -5,-22, -6, -5,-11, -5,-19, 1, -3, -5, 4, -4,-11, 0,-10, 6, 8, 8,-36,-23, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='I'; M= -5,-17,-18,-23,-20, 6,-17, -9, 32,-16, 20, 9,-12,-24,-18,-19,-13, 0, 24,-21, 11,-20; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='R'; M= -1, -5,-20, -2, -2, -9,-11,-12,-11, 6, -7, 2, -6, -6, 6, 15, -3, -6, -6,-17, -3, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='K'; M= 1, 5,-20, 7, 4,-14,-11,-11, -9, 8,-10, 0, 4, -7, 2, 2, 0, -4, -8,-24, -9, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='H'; M=-16,-15,-35,-12, -3, -7,-23, 48,-14, -6, -1, 9,-11, -5, 2, 4,-10,-14,-14,-18, 14, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='V'; M= 3,-16, -5,-18,-22, 7,-26,-25, 31,-20, 15, 3,-16,-35,-25,-15,-10, 6, 34,-28, 7,-23; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='D'; M= 0, 15,-24, 28, 6,-27, -6,-11,-23, 6,-14,-14, 4, 3, -4, -3, 3, -4,-18,-31,-14, 0; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='D'; M= 2, 11,-23, 18, 7,-27, -4, -7,-18, 4,-13,-10, 4, 2, -2, -7, 2, -4,-17,-30,-16, 2; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='E'; M= 0, 5,-18, 10, 12,-22,-11, -8,-18, 9,-12, -4, 0, -3, 4, -3, 2, -4,-15,-22,-11, 8; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='Y'; M=-16, -1,-26, 2, -6, -3,-14, 2,-15, -7, -3,-10, 0,-15, -6, -8, -9,-10,-13, 1, 12, -7; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='K'; M= -1, -5,-21, -4, 12,-10,-13,-16,-14, 22,-13, 11, -4, -1, 6, 11, -4, -9,-14,-14, -6, 8; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='V'; M= 0, -7,-17,-10, -6, -2,-13,-17, 4, 3, -2, 4, -4,-12, -6, -2, -1, -1, 5,-21, -4, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='T'; M= 3, -1,-13, -7, -9,-10,-14,-16, 0, -4, -2, 0, 5, -8, -5,-15, 8, 19, 2,-33, -8, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='W'; M=-21,-24,-26,-23,-15, 24,-15,-15, -3,-11, 11, -7,-28,-22,-14, -8,-13,-13, -1, 39, 35,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= -1, 0,-16, 6, 18,-21,-11, -5,-19, 9,-10, -6, -5, -1, 6, -2, 3, -7,-17,-17, -9, 13; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= -1, 2,-13, 5, 12,-20,-12, -6,-13, 4, -6, -3, 0, -6, 7, -5, -2, -4,-14,-19, -9, 11; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -1,-12,-13,-19,-16, 8,-10,-14, 23,-13, 16, 7, -8,-21,-15,-16, -9, 0, 16,-20, 4,-16; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= 0, -3, -7, -9, -4, -6, -9,-10, 3, -3, -2, 2, 3,-13, -1, -4, -4, -2, -1,-22,-10, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 1, -1,-13, -2, -4, -6, -6,-11, -3, 0, -4, -3, 2, -9, -5, -5, 4, 2, -2,-19, -8, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='R'; M= -3, -2,-19, 0, -1, -9, -8, -4, -8, 1, -5, -1, -3, -6, 1, 2, -3, -4, -6, -9, 1, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='I'; M= -2, -5, -8, -7, -6, 0, -5, -7, 3, -3, 3, 2, -5, -8, -5, -1, -5, -2, 2,-10, 1, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='T'; M= 1, -1, -6, 1, -2, -6, -7, -6, -3, -3, -1, -4, -3, -3, -4, -5, 1, 2, -1,-15, -4, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M= 0, -3,-16, -1, -3,-11, -8, 1, -3, -1, -7, -5, -3, 5, -5, -5, 2, 3, -3,-20, -6, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='D'; M= 0, 14, -7, 16, 4,-16, -5, -7,-11, 1, -8, -8, 14, -7, -1, -8, 1, 0,-12,-24,-13, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='S'; M= 2, 1,-13, -3, -4, -3, 1, -7, -2, -1, -5, -3, 5, -8, -7, -8, 6, 3, -6,-19, -9, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='Y'; M= -4, -9,-12,-10, -9, 6, -9, -6, 3, -7, 5, -1,-10,-10, -7, -5, -4, 0, 4, -3, 9, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='D'; M= 1, 5,-12, 8, -2,-16, -8,-11, -4, -3, -1, -4, 2, -9, -3, -9, -1, 2, -4,-23, -8, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M= -1, -8,-13, -6, 2,-16,-12, -5, -8, 0, -6,-10,-11, 25, -4,-13, 1, 9,-11,-26, -8, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: M= 0, -4,-17, -7, -8, -4, -7,-10, -1, -3, -3, 0, 0,-11, -5, 0, 0, 0, -3,-24, -6, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='N'; M= -8, 6,-30, 2, -8,-10, 2, 0,-10, -2, -8, -4, 15,-14, -8, -7, -2, -4,-14,-21, -3, -9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='W'; M= -9, -7,-17,-10, -8, -6, -1,-17, -3, -6, -4, -4, -6,-19, -8, -5, -7,-10, -8, 9, 0, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='Q'; M= 1, -4,-22, -2, 11,-24,-15, 10,-15, 2,-12, -2, -4, 2, 17, 1, -2, -3,-17,-26,-11, 12; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='P'; M= 0, -3,-25, -2, 4,-23, -5, -4,-19, 7,-20,-11, -3, 20, 13, 8, -3, -4,-23,-25,-16, 4; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='K'; M= -1, 6,-23, 5, 10,-20, -9, 3,-19, 11,-17, 0, 10, 1, 6, 3, 0, -7,-21,-30,-16, 6; /M: SY='T'; M= 10, -3,-21, -9,-15,-13,-13,-18, 4, -7, 1, 3, 3,-12, -3,-17, 8, 24, 9,-39,-10,-11; /M: SY='I'; M= 0,-12,-16,-19,-17, -1,-16,-20, 22,-10, 6, 5, -6,-25,-13, -9, -7, 1, 19,-21, -2,-17; /M: SY='F'; M=-17,-23,-19,-30,-24, 43,-25,-18, 10,-14, 24, -3,-17,-32,-22,-13,-15,-10, 13, 4, 30,-25; /M: SY='I'; M= 0,-19,-18,-32,-28, 10,-17,-22, 48,-20, 20, 7, -8,-33,-23,-23,-11, 1, 37,-27, 1,-28; /M: SY='N'; M= 3, 18,-17, 6, -8,-11, -6,-12, -5, -2,-12, -6, 35,-18, -8,-17, 12, 17,-10,-48,-20, -9; /M: SY='E'; M= -1, 0, -5, 7, 36,-28,-17, -6,-25, 19,-11, -3, -6, 7, 13, 1, -2,-15,-24,-16,-14, 29; /M: SY='P'; M= 5, -5,-24, -4, 1,-17, -7, -4,-11, 2,-13,-10, -6, 11, -1, -6, 6, 2,-11,-30,-17, -3; /M: SY='G'; M= 2, 2,-38, -6,-17,-30, 69,-28,-11, -8,-19,-18, 1,-11,-16,-18, 0,-18,-28, 4,-29,-17; /M: SY='I'; M= 0,-16, -5,-20,-19, 12,-23,-18, 26,-16, 22, 12,-15,-34,-22,-15,-14, 2, 24,-25, 10,-19; /M: SY='Y'; M=-24,-23,-41,-20,-20, 23,-23, 0, 5,-11, 20, -2,-22,-22,-14, -8,-15, -9, 10, 15, 46,-20; /M: SY='Q'; M= 5, -4,-18, -2, 13,-16,-14, -8,-13, 5, -7, -2, -5, -5, 19, 2, 0, 0,-12,-19, -7, 14; /M: SY='L'; M= -6,-12, -6,-15,-14, 16,-19,-13, 25,-18, 33, 17,-16,-30,-19,-20,-16, 1, 16,-23, 20,-14; /M: SY='I'; M= 2,-17,-14,-29,-22, 5,-15,-17, 37,-15, 19, 12, -6,-30,-18,-21,-11, 0, 27,-28, -4,-22; /M: SY='M'; M= 0,-10,-20,-20,-15, 8,-13,-10, 11, -2, 11, 13, 2,-29,-14,-12, -8, -2, 5,-22, -2,-16; /M: SY='R'; M= 1, -6,-26, -7, 0, -8, -8, -6,-13, 8,-12, 3, -3, -7, 3, 10, 2, -7,-10,-21, -9, -2; /M: SY='S'; M= 6, -4, -4, -6, -1,-12, -6,-11, -8, -4,-13,-13, -2,-10, -8,-12, 22, 11, -8,-30,-22, -8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='K'; M= 1, 2,-20, 1, 6,-17,-11,-14,-17, 14,-15, 3, 5, -2, 10, 11, 2, -2,-14,-25,-13, 6; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='M'; M= 0, -4,-18, -6, -1, -4,-12,-10, -3, 7, 3, 12, -2,-10, -8, -7, -4, 1, -7,-26, -3, -4; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='P'; M= -1, -6,-24, 0, 8,-30, -8, 0,-16, 5,-17,-19,-13, 42, -1,-10, -3, -1,-20,-29,-18, 1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='A'; M= 5, -2,-22, -5, -6, -5,-10,-16, 3, -1, -3, 1, 3,-17, -7,-10, 0, 4, 4,-27, -7, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='A'; M= 29, -3,-25, -3, -2,-16, -3,-17, 2, -2, -8, 7, -2,-11, 3,-10, 8, 8, 8,-44,-31, -3; /M: SY='E'; M= 2, -5,-21, -3, 14,-17,-13, -6,-13, 14,-11, 4, -6, 0, 7, 3, -2, -9,-12,-19,-11, 10; /M: SY='E'; M= -1, -4,-14, -1, 19,-25,-11, -6,-19, 11,-14, -4, -6, 5, 13, 6, -4,-12,-19,-14,-14, 16; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='F'; M=-16,-24,-16,-38,-28, 65,-27,-25, 5,-10, 20, -8,-12,-35,-25,-11,-12,-14, 9, 0, 22,-29; /M: SY='Q'; M= 2, -8,-22, -8, 5,-17,-16, -8,-15, 11,-13, 5, -6, -6, 27, 25, -5, -7,-14,-16, -7, 11; /M: SY='D'; M= 1, 9,-22, 14, 7,-21, -9,-11,-19, 9,-13, -2, 7, -7, 5, 7, -1, -8,-15,-27,-14, 5; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='W'; M=-37,-38,-23,-32,-12, 15, 2,-37,-19,-16, -7,-20,-52,-27,-11, -3,-24,-35,-18,134, 43,-12; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='I'; M= 1,-14,-14,-20,-23, 14,-22,-21, 31,-17, 18, 6,-11,-34,-24,-15,-12, 4, 30,-26, 11,-23; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='F'; M= -6,-11,-18,-16,-15, 16,-18,-14, 5, -9, 12, 0, -6,-20,-13,-14, -4, 4, 7,-17, 12,-15; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='E'; M= 2, 11,-12, 14, 15,-21, -4,-11,-17, 6,-11,-11, 8, -7, -1,-11, 6, -5,-17,-25,-18, 9; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='E'; M= 1, 6,-12, 14, 19,-26,-15, -7,-15, 6, -6, -7, -1, -4, 3,-10, 0, -6,-12,-25,-12, 14; /M: SY='I'; M= 3,-13,-17,-16,-21, 7,-19,-22, 28,-15, 13, 5,-11,-32,-21,-11,-10, 3, 28,-27, 6,-21; /M: SY='L'; M= -8, -9, -9,-11,-12, 15,-19,-11, 19,-16, 29, 12,-14,-28,-19,-18,-16, -2, 12,-21, 20,-13; /M: SY='P'; M= -6,-10,-26, -1, 11,-34,-12, 5,-25, 9,-23,-26,-19, 69, 1, -7, -8, -3,-30,-30,-17, 3; /M: SY='Q'; M= 7, -2,-15, -3, 6,-17,-14,-11, -9, 0, -7, -5, 0, -6, 12, -7, 9, 12, -8,-29,-13, 8; /M: SY='I'; M= 0,-15, -8,-23,-18, 3,-17,-18, 31,-16, 19, 9, -9,-26,-17,-20,-11, 2, 23,-27, 1,-18; /M: SY='R'; M= -6,-11, -6, -9, -4,-11,-19,-12,-14, 2, -9, 0, -8,-14, 12, 31, -8,-14, -6,-15, -6, 0; /M: SY='K'; M= 2, -4,-12, -5, 6,-10,-13,-18,-10, 12,-11, 5, -1, -7, 1, 4, 1, -3, -9,-24,-13, 2; /M: SY='T'; M= 0, -3,-23, -8, -6,-10,-19, 6, -9, -4, -5, 1, 5, -7, 5, -6, 2, 8, -6,-33, -7, -2; /M: SY='G'; M= 2, -2,-29, -8, -8,-22, 32,-18,-10, -2,-14, -8, 0, -5, -7,-13, 0, -8,-20,-10,-21, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Bro-N |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
069L_IIV6 (O55709), 289L_IIV6 (Q91FN5), BROJ_NPVLD (Q9YML3), VF201_IIV3 (Q197E1), VF201_IIV6 (Q91FW9), Y002_NPVAC (P24655), Y1418_HAEIN (P44189), YL002_MIMIV (Q5UP77), YR125_MIMIV (Q5UPJ6)» more
|