 |
|
| Entry: PS51807 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_C2HC_BV |
| Accession [info] | PS51807 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2016 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 10-FEB-2021 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51807 |
| Associated ProRule [info] | PRU01148 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc finger C2HC baculovirus (BV)-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.0585332; R2=0.0089217; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5033.5859375; R2=1.8714286; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=960; H_SCORE=6830; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=736; H_SCORE=6411; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='V'; M= 11,-14,-15,-13,-11, -2,-25,-24, 23,-11, 4, -1,-16,-28,-17,-10, -6, 4, 32,-28, 0,-12; /M: SY='P'; M= -9,-17,-30, -8, 2,-22,-12, 2,-24, 6,-20,-27,-24, 55, 1, 4, -1, -1,-24,-17, -5, -4; /M: SY='I'; M= 2,-18,-19,-21,-12, -8,-19,-10, 15, -6, 4, 4,-13,-11, 0, 1,-12, -1, 11,-23, -2,-10; /M: SY='P'; M= -3, -2,-25, 2, 5,-30, -6, 1,-22, 6,-25,-29, -5, 55, -4,-11, 3, 5,-29,-36,-22, -4; /M: SY='P'; M= -5,-18,-20,-16, -7,-12,-16, -6, 6, -6, -1,-13,-22, 33,-13,-15,-12, 2, -1,-28, -3,-12; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='D'; M= 0, 23,-26, 46, 16,-34,-13,-14,-29, 7, -9,-15, 0, -5, 4, -4, -2, -9,-18,-25, -6, 10; /M: SY='G'; M= 0, 13,-26, 4,-10,-23, 28,-18,-13, -3,-19,-12, 22,-15, -1, -4, -2, -9,-24,-21,-26, -8; /M: SY='P'; M= 0, -9,-22, -5, 15,-20,-15, -9,-18, 18,-18, -3,-12, 22, 12, 9, -5, -7,-19,-19,-10, 12; /M: SY='N'; M= 11, 5,-17, -1, 5,-20, -8, -9,-10, 1,-16, -7, 13, -4, 13, -7, 11, 12,-13,-38,-24, 6; /M: SY='P'; M= 8,-12,-22,-10, 2,-21,-12, -9, 0, 0,-10,-12,-15, 24, -4,-12, -2, 3, -1,-32,-18, -3; /M: SY='G'; M= 0, 9,-36, 3,-16,-30, 63,-27,-12, -8,-19,-19, 9,-12,-18,-19, 0,-16,-28, -3,-29,-17; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='I'; M= 3,-12,-14,-17, -9, -6,-12, -7, 13, -4, 7, 12, -6,-18, 4, 1, -9, -3, 8,-19, -4, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-22,-18,-26,-11,-13, 20,-24, 6, 6,-16, 32, 9,-26,-23,-15,-12,-19, -5, 7, 3, 49,-13; /M: SY='P'; M= -8,-17,-32,-10, 5,-38, 4, 4,-27, 7,-28,-37,-25, 92, -3,-12, -8, -3,-38,-24,-22, -3; /M: SY='I'; M= -1,-16,-11,-22,-17, 5,-19, -8, 28,-11, 27, 25,-11,-34,-19,-16,-17, 1, 19,-26, 10,-17; /M: SY='T'; M= 6, 17,-21, 16,-12,-26,-15,-19, -9, -6, -5, -7, 20, -7, -4,-24, 13, 30, -1,-50,-14, -8; /M: SY='E'; M= -1, -2, 7, 8, 53,-37,-20, -1,-30, 19,-11, -9,-11, 8, 21, -1, -1,-21,-28, -9,-18, 45; /M: SY='R'; M= 2, 2,-24, 10, -3,-19,-13,-16,-14, 6,-11, -3, -2, -8, 4, 14, 2, -4, -5,-26,-10, -3; /M: SY='L'; M= -3,-12, -9,-11, -9, 5,-18, -8, 7, -7, 20, 19,-16,-25, -6, 4,-15, -5, 5,-20, 12, -7; /M: SY='I'; M= -6,-14, -8,-21,-18, 12,-16,-14, 35,-20, 32, 16,-12,-30,-20,-24,-16, 0, 21,-24, 15,-18; /M: SY='D'; M= 0, 43,-22, 65, 11,-41, -9,-16,-31, 2,-12,-22, 22,-12, -7,-12, 0, -7,-21,-43,-17, 3; /M: SY='T'; M= 2, -8,-17,-11, -8, -6,-17,-14, 3, -5, 2, 3, -6,-12, 3, -3, 2, 11, 3,-26, -1, -4; /M: SY='L'; M= 3, -7, -8, -7, -7, 10,-15,-13, 15,-15, 27, 17,-15,-25,-12,-17,-12, 3, 10,-28, 12, -7; /M: SY='V'; M= 1,-19,-17,-23,-27, 24,-27,-25, 31,-19, 18, 2,-18,-37,-27,-13,-12, 3, 36,-22, 16,-27; /M: SY='F'; M=-21,-22,-28,-23,-21, 44,-26, -3, 4,-14, 28, 0,-21,-28,-19,-11,-16,-10, 7, 4, 43,-21; /M: SY='N'; M= -1, 18,-18, 1, -6,-16, 1, 0, -9, -1,-19, -2, 41,-19, 7, -1, -3, -1,-22,-44,-27, -2; /M: SY='H'; M= -3,-11,-31,-10, 11,-23,-20, 34,-21, 5,-17, 7, -9, 4, 32, 19, -7,-11,-25,-23, -6, 17; /M: SY='R'; M=-14,-18,-30,-11, -7, -7,-21, 22,-18, -3, -5, 0,-20, -1, 7, 25, -8,-15,-11,-10, 13, -5; /M: SY='T'; M= 9, 3,-17, -5,-14, -3,-13,-18, 12, -9, -3, -1, 13,-25,-14,-15, 5, 14, 11,-43,-13,-15; /M: SY='P'; M= 2, -5,-27, 4, -3,-14,-12,-11,-21, 4,-15,-15,-12, 15, 4, 13, -2, -8,-12,-24,-12, -5; /M: SY='R'; M= 0, -9,-22, -9, -2,-12,-14,-14,-11, 9,-14, 2, -6, -5, 13, 22, 3, -3, -7,-19, -8, 0; /M: SY='A'; M= 13, 3,-24, 6, -5,-22,-11,-16, -7, -3, -8, -4, 1, -9, 8, -3, 9, 11, 0,-36,-17, -3; /M: SY='R'; M= -5, -5,-27, -6,-10, -5,-18,-15, -8, 4, -5, 2, 1,-10, 0, 6, -1, 6, 0,-20, 5, -7; /M: SY='T'; M= 4, -5,-26, -3, -8,-20,-15, 0, -7, -5, -9, -7, -4, 4, -2, -7, 8, 11, -2,-36,-12, -8; /M: SY='D'; M= 5, 13,-19, 24, 1,-23,-11,-16, -9, -4, -2,-10, 2,-11, -7,-16, 7, 7, -3,-35,-10, -3; /M: SY='N'; M= 4, 14,-14, 9, 3,-26, -7,-13,-12, 0,-10, -7, 22, -7, 3,-18, 6, 13,-13,-40,-21, 4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='H'; M= -4, 1,-18, 0, 1,-18,-13, 31,-10, -5, -6, 3, 5, 1, 0,-11, 1, 2,-11,-30, -7, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='I'; M= -3, -3,-14, -1, 0,-13,-14,-14, 8, -2, 6, 2, -5,-15, -5, -7, -8, -9, 4,-23, -4, -3; /M: SY='Y'; M=-19,-22,-40,-21,-21, 23,-23, -1, 3,-11, 16, -6,-18,-19,-13,-11, -6, -1, 10, 6, 38,-21; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0; /M: SY='T'; M= 7, -3,-21,-14,-22, -7,-21,-21, 0,-10, 2, -2, 8, -4, -3,-28, 17, 43, 10,-44, -6,-13; /M: SY='M'; M= 1,-17,-16,-20,-10, 6,-14, -9, 6, -4, 16, 21,-15,-30,-11, -9,-14, -5, 3, -3, 6,-10; /M: SY='Y'; M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30, 0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10, 0,-20,-10, 10, 50, 90,-20; /M: SY='I'; M= -1,-16,-11,-21,-21, 12,-21,-19, 36,-20, 26, 11,-15,-33,-23,-19,-14, 3, 30,-26, 14,-21; /M: SY='R'; M= -3,-18,-26,-15, -8,-13,-25, 17, -8, -5,-10, 2,-16,-12, 18, 30,-10,-12, -3,-20, 1, 0; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS50940 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of true positive hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | C2HC BV-type |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
5 sequences
AC83_NPVAC (Q06670 ), VP91_NPVBM (O92446 ), VP91_NPVCF (Q7TLR9 ), VP91_NPVEP (Q91GH8 ), VP91_NPVOP (O10336 )» more
|
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission