PROSITE logo

PROSITE entry PS51807


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] ZF_C2HC_BV
Accession [info] PS51807
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JUL-2016 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51807
Associated ProRule [info] PRU01148

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger C2HC baculovirus (BV)-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.0585332; R2=0.0089217; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5033.5859375; R2=1.8714286; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=960; H_SCORE=6830; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=736; H_SCORE=6411; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='V';  M= 11,-14,-15,-13,-11, -2,-25,-24, 23,-11,  4, -1,-16,-28,-17,-10, -6,  4, 32,-28,  0,-12;
/M: SY='P';  M= -9,-17,-30, -8,  2,-22,-12,  2,-24,  6,-20,-27,-24, 55,  1,  4, -1, -1,-24,-17, -5, -4;
/M: SY='I';  M=  2,-18,-19,-21,-12, -8,-19,-10, 15, -6,  4,  4,-13,-11,  0,  1,-12, -1, 11,-23, -2,-10;
/M: SY='P';  M= -3, -2,-25,  2,  5,-30, -6,  1,-22,  6,-25,-29, -5, 55, -4,-11,  3,  5,-29,-36,-22, -4;
/M: SY='P';  M= -5,-18,-20,-16, -7,-12,-16, -6,  6, -6, -1,-13,-22, 33,-13,-15,-12,  2, -1,-28, -3,-12;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='D';  M=  0, 23,-26, 46, 16,-34,-13,-14,-29,  7, -9,-15,  0, -5,  4, -4, -2, -9,-18,-25, -6, 10;
/M: SY='G';  M=  0, 13,-26,  4,-10,-23, 28,-18,-13, -3,-19,-12, 22,-15, -1, -4, -2, -9,-24,-21,-26, -8;
/M: SY='P';  M=  0, -9,-22, -5, 15,-20,-15, -9,-18, 18,-18, -3,-12, 22, 12,  9, -5, -7,-19,-19,-10, 12;
/M: SY='N';  M= 11,  5,-17, -1,  5,-20, -8, -9,-10,  1,-16, -7, 13, -4, 13, -7, 11, 12,-13,-38,-24,  6;
/M: SY='P';  M=  8,-12,-22,-10,  2,-21,-12, -9,  0,  0,-10,-12,-15, 24, -4,-12, -2,  3, -1,-32,-18, -3;
/M: SY='G';  M=  0,  9,-36,  3,-16,-30, 63,-27,-12, -8,-19,-19,  9,-12,-18,-19,  0,-16,-28, -3,-29,-17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='I';  M=  3,-12,-14,-17, -9, -6,-12, -7, 13, -4,  7, 12, -6,-18,  4,  1, -9, -3,  8,-19, -4, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-22,-18,-26,-11,-13, 20,-24,  6,  6,-16, 32,  9,-26,-23,-15,-12,-19, -5,  7,  3, 49,-13;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-32,-10,  5,-38,  4,  4,-27,  7,-28,-37,-25, 92, -3,-12, -8, -3,-38,-24,-22, -3;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-11,-22,-17,  5,-19, -8, 28,-11, 27, 25,-11,-34,-19,-16,-17,  1, 19,-26, 10,-17;
/M: SY='T';  M=  6, 17,-21, 16,-12,-26,-15,-19, -9, -6, -5, -7, 20, -7, -4,-24, 13, 30, -1,-50,-14, -8;
/M: SY='E';  M= -1, -2,  7,  8, 53,-37,-20, -1,-30, 19,-11, -9,-11,  8, 21, -1, -1,-21,-28, -9,-18, 45;
/M: SY='R';  M=  2,  2,-24, 10, -3,-19,-13,-16,-14,  6,-11, -3, -2, -8,  4, 14,  2, -4, -5,-26,-10, -3;
/M: SY='L';  M= -3,-12, -9,-11, -9,  5,-18, -8,  7, -7, 20, 19,-16,-25, -6,  4,-15, -5,  5,-20, 12, -7;
/M: SY='I';  M= -6,-14, -8,-21,-18, 12,-16,-14, 35,-20, 32, 16,-12,-30,-20,-24,-16,  0, 21,-24, 15,-18;
/M: SY='D';  M=  0, 43,-22, 65, 11,-41, -9,-16,-31,  2,-12,-22, 22,-12, -7,-12,  0, -7,-21,-43,-17,  3;
/M: SY='T';  M=  2, -8,-17,-11, -8, -6,-17,-14,  3, -5,  2,  3, -6,-12,  3, -3,  2, 11,  3,-26, -1, -4;
/M: SY='L';  M=  3, -7, -8, -7, -7, 10,-15,-13, 15,-15, 27, 17,-15,-25,-12,-17,-12,  3, 10,-28, 12, -7;
/M: SY='V';  M=  1,-19,-17,-23,-27, 24,-27,-25, 31,-19, 18,  2,-18,-37,-27,-13,-12,  3, 36,-22, 16,-27;
/M: SY='F';  M=-21,-22,-28,-23,-21, 44,-26, -3,  4,-14, 28,  0,-21,-28,-19,-11,-16,-10,  7,  4, 43,-21;
/M: SY='N';  M= -1, 18,-18,  1, -6,-16,  1,  0, -9, -1,-19, -2, 41,-19,  7, -1, -3, -1,-22,-44,-27, -2;
/M: SY='H';  M= -3,-11,-31,-10, 11,-23,-20, 34,-21,  5,-17,  7, -9,  4, 32, 19, -7,-11,-25,-23, -6, 17;
/M: SY='R';  M=-14,-18,-30,-11, -7, -7,-21, 22,-18, -3, -5,  0,-20, -1,  7, 25, -8,-15,-11,-10, 13, -5;
/M: SY='T';  M=  9,  3,-17, -5,-14, -3,-13,-18, 12, -9, -3, -1, 13,-25,-14,-15,  5, 14, 11,-43,-13,-15;
/M: SY='P';  M=  2, -5,-27,  4, -3,-14,-12,-11,-21,  4,-15,-15,-12, 15,  4, 13, -2, -8,-12,-24,-12, -5;
/M: SY='R';  M=  0, -9,-22, -9, -2,-12,-14,-14,-11,  9,-14,  2, -6, -5, 13, 22,  3, -3, -7,-19, -8,  0;
/M: SY='A';  M= 13,  3,-24,  6, -5,-22,-11,-16, -7, -3, -8, -4,  1, -9,  8, -3,  9, 11,  0,-36,-17, -3;
/M: SY='R';  M= -5, -5,-27, -6,-10, -5,-18,-15, -8,  4, -5,  2,  1,-10,  0,  6, -1,  6,  0,-20,  5, -7;
/M: SY='T';  M=  4, -5,-26, -3, -8,-20,-15,  0, -7, -5, -9, -7, -4,  4, -2, -7,  8, 11, -2,-36,-12, -8;
/M: SY='D';  M=  5, 13,-19, 24,  1,-23,-11,-16, -9, -4, -2,-10,  2,-11, -7,-16,  7,  7, -3,-35,-10, -3;
/M: SY='N';  M=  4, 14,-14,  9,  3,-26, -7,-13,-12,  0,-10, -7, 22, -7,  3,-18,  6, 13,-13,-40,-21,  4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='H';  M= -4,  1,-18,  0,  1,-18,-13, 31,-10, -5, -6,  3,  5,  1,  0,-11,  1,  2,-11,-30, -7,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='I';  M= -3, -3,-14, -1,  0,-13,-14,-14,  8, -2,  6,  2, -5,-15, -5, -7, -8, -9,  4,-23, -4, -3;
/M: SY='Y';  M=-19,-22,-40,-21,-21, 23,-23, -1,  3,-11, 16, -6,-18,-19,-13,-11, -6, -1, 10,  6, 38,-21;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110,  0,-10,-10,  0,-40,-30,-20,  0;
/M: SY='T';  M=  7, -3,-21,-14,-22, -7,-21,-21,  0,-10,  2, -2,  8, -4, -3,-28, 17, 43, 10,-44, -6,-13;
/M: SY='M';  M=  1,-17,-16,-20,-10,  6,-14, -9,  6, -4, 16, 21,-15,-30,-11, -9,-14, -5,  3, -3,  6,-10;
/M: SY='Y';  M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30,  0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10,  0,-20,-10, 10, 50, 90,-20;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-11,-21,-21, 12,-21,-19, 36,-20, 26, 11,-15,-33,-23,-19,-14,  3, 30,-26, 14,-21;
/M: SY='R';  M= -3,-18,-26,-15, -8,-13,-25, 17, -8, -5,-10,  2,-16,-12, 18, 30,-10,-12, -3,-20,  1,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS50940

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 5 in 5 different sequences
Number of true positive hits 5 in 5 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] C2HC BV-type
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
5 sequences

AC83_NPVAC  (Q06670), VP91_NPVBM  (O92446), VP91_NPVCF  (Q7TLR9), 
VP91_NPVEP  (Q91GH8), VP91_NPVOP  (O10336)
» more