PROSITE entry PS51807

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51807

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ZF_C2HC_BV
Accession [info]	PS51807
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUL-2016 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51807
Associated ProRule [info]	PRU01148

Name and characterization of the entry

Description [info]

Zinc finger C2HC baculovirus (BV)-type profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=49;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=45;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.0585332; R2=0.0089217; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5033.5859375; R2=1.8714286; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=960; H_SCORE=6830; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=736; H_SCORE=6411; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='V';  M= 11,-14,-15,-13,-11, -2,-25,-24, 23,-11,  4, -1,-16,-28,-17,-10, -6,  4, 32,-28,  0,-12;
/M: SY='P';  M= -9,-17,-30, -8,  2,-22,-12,  2,-24,  6,-20,-27,-24, 55,  1,  4, -1, -1,-24,-17, -5, -4;
/M: SY='I';  M=  2,-18,-19,-21,-12, -8,-19,-10, 15, -6,  4,  4,-13,-11,  0,  1,-12, -1, 11,-23, -2,-10;
/M: SY='P';  M= -3, -2,-25,  2,  5,-30, -6,  1,-22,  6,-25,-29, -5, 55, -4,-11,  3,  5,-29,-36,-22, -4;
/M: SY='P';  M= -5,-18,-20,-16, -7,-12,-16, -6,  6, -6, -1,-13,-22, 33,-13,-15,-12,  2, -1,-28, -3,-12;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='D';  M=  0, 23,-26, 46, 16,-34,-13,-14,-29,  7, -9,-15,  0, -5,  4, -4, -2, -9,-18,-25, -6, 10;
/M: SY='G';  M=  0, 13,-26,  4,-10,-23, 28,-18,-13, -3,-19,-12, 22,-15, -1, -4, -2, -9,-24,-21,-26, -8;
/M: SY='P';  M=  0, -9,-22, -5, 15,-20,-15, -9,-18, 18,-18, -3,-12, 22, 12,  9, -5, -7,-19,-19,-10, 12;
/M: SY='N';  M= 11,  5,-17, -1,  5,-20, -8, -9,-10,  1,-16, -7, 13, -4, 13, -7, 11, 12,-13,-38,-24,  6;
/M: SY='P';  M=  8,-12,-22,-10,  2,-21,-12, -9,  0,  0,-10,-12,-15, 24, -4,-12, -2,  3, -1,-32,-18, -3;
/M: SY='G';  M=  0,  9,-36,  3,-16,-30, 63,-27,-12, -8,-19,-19,  9,-12,-18,-19,  0,-16,-28, -3,-29,-17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='I';  M=  3,-12,-14,-17, -9, -6,-12, -7, 13, -4,  7, 12, -6,-18,  4,  1, -9, -3,  8,-19, -4, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-22,-18,-26,-11,-13, 20,-24,  6,  6,-16, 32,  9,-26,-23,-15,-12,-19, -5,  7,  3, 49,-13;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-32,-10,  5,-38,  4,  4,-27,  7,-28,-37,-25, 92, -3,-12, -8, -3,-38,-24,-22, -3;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-11,-22,-17,  5,-19, -8, 28,-11, 27, 25,-11,-34,-19,-16,-17,  1, 19,-26, 10,-17;
/M: SY='T';  M=  6, 17,-21, 16,-12,-26,-15,-19, -9, -6, -5, -7, 20, -7, -4,-24, 13, 30, -1,-50,-14, -8;
/M: SY='E';  M= -1, -2,  7,  8, 53,-37,-20, -1,-30, 19,-11, -9,-11,  8, 21, -1, -1,-21,-28, -9,-18, 45;
/M: SY='R';  M=  2,  2,-24, 10, -3,-19,-13,-16,-14,  6,-11, -3, -2, -8,  4, 14,  2, -4, -5,-26,-10, -3;
/M: SY='L';  M= -3,-12, -9,-11, -9,  5,-18, -8,  7, -7, 20, 19,-16,-25, -6,  4,-15, -5,  5,-20, 12, -7;
/M: SY='I';  M= -6,-14, -8,-21,-18, 12,-16,-14, 35,-20, 32, 16,-12,-30,-20,-24,-16,  0, 21,-24, 15,-18;
/M: SY='D';  M=  0, 43,-22, 65, 11,-41, -9,-16,-31,  2,-12,-22, 22,-12, -7,-12,  0, -7,-21,-43,-17,  3;
/M: SY='T';  M=  2, -8,-17,-11, -8, -6,-17,-14,  3, -5,  2,  3, -6,-12,  3, -3,  2, 11,  3,-26, -1, -4;
/M: SY='L';  M=  3, -7, -8, -7, -7, 10,-15,-13, 15,-15, 27, 17,-15,-25,-12,-17,-12,  3, 10,-28, 12, -7;
/M: SY='V';  M=  1,-19,-17,-23,-27, 24,-27,-25, 31,-19, 18,  2,-18,-37,-27,-13,-12,  3, 36,-22, 16,-27;
/M: SY='F';  M=-21,-22,-28,-23,-21, 44,-26, -3,  4,-14, 28,  0,-21,-28,-19,-11,-16,-10,  7,  4, 43,-21;
/M: SY='N';  M= -1, 18,-18,  1, -6,-16,  1,  0, -9, -1,-19, -2, 41,-19,  7, -1, -3, -1,-22,-44,-27, -2;
/M: SY='H';  M= -3,-11,-31,-10, 11,-23,-20, 34,-21,  5,-17,  7, -9,  4, 32, 19, -7,-11,-25,-23, -6, 17;
/M: SY='R';  M=-14,-18,-30,-11, -7, -7,-21, 22,-18, -3, -5,  0,-20, -1,  7, 25, -8,-15,-11,-10, 13, -5;
/M: SY='T';  M=  9,  3,-17, -5,-14, -3,-13,-18, 12, -9, -3, -1, 13,-25,-14,-15,  5, 14, 11,-43,-13,-15;
/M: SY='P';  M=  2, -5,-27,  4, -3,-14,-12,-11,-21,  4,-15,-15,-12, 15,  4, 13, -2, -8,-12,-24,-12, -5;
/M: SY='R';  M=  0, -9,-22, -9, -2,-12,-14,-14,-11,  9,-14,  2, -6, -5, 13, 22,  3, -3, -7,-19, -8,  0;
/M: SY='A';  M= 13,  3,-24,  6, -5,-22,-11,-16, -7, -3, -8, -4,  1, -9,  8, -3,  9, 11,  0,-36,-17, -3;
/M: SY='R';  M= -5, -5,-27, -6,-10, -5,-18,-15, -8,  4, -5,  2,  1,-10,  0,  6, -1,  6,  0,-20,  5, -7;
/M: SY='T';  M=  4, -5,-26, -3, -8,-20,-15,  0, -7, -5, -9, -7, -4,  4, -2, -7,  8, 11, -2,-36,-12, -8;
/M: SY='D';  M=  5, 13,-19, 24,  1,-23,-11,-16, -9, -4, -2,-10,  2,-11, -7,-16,  7,  7, -3,-35,-10, -3;
/M: SY='N';  M=  4, 14,-14,  9,  3,-26, -7,-13,-12,  0,-10, -7, 22, -7,  3,-18,  6, 13,-13,-40,-21,  4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='H';  M= -4,  1,-18,  0,  1,-18,-13, 31,-10, -5, -6,  3,  5,  1,  0,-11,  1,  2,-11,-30, -7,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='I';  M= -3, -3,-14, -1,  0,-13,-14,-14,  8, -2,  6,  2, -5,-15, -5, -7, -8, -9,  4,-23, -4, -3;
/M: SY='Y';  M=-19,-22,-40,-21,-21, 23,-23, -1,  3,-11, 16, -6,-18,-19,-13,-11, -6, -1, 10,  6, 38,-21;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110,  0,-10,-10,  0,-40,-30,-20,  0;
/M: SY='T';  M=  7, -3,-21,-14,-22, -7,-21,-21,  0,-10,  2, -2,  8, -4, -3,-28, 17, 43, 10,-44, -6,-13;
/M: SY='M';  M=  1,-17,-16,-20,-10,  6,-14, -9,  6, -4, 16, 21,-15,-30,-11, -9,-14, -5,  3, -3,  6,-10;
/M: SY='Y';  M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30,  0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10,  0,-20,-10, 10, 50, 90,-20;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-11,-21,-21, 12,-21,-19, 36,-20, 26, 11,-15,-33,-23,-19,-14,  3, 30,-26, 14,-21;
/M: SY='R';  M= -3,-18,-26,-15, -8,-13,-25, 17, -8, -5,-10,  2,-16,-12, 18, 30,-10,-12, -3,-20,  1,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS50940

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	5 in 5 different sequences
Number of true positive hits	5 in 5 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	ZN_FING
Feature description [info]	C2HC BV-type
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

5 sequences

AC83_NPVAC  (Q06670), VP91_NPVBM  (O92446), VP91_NPVCF  (Q7TLR9),

VP91_NPVEP  (Q91GH8), VP91_NPVOP  (O10336)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment