 |
|
| Entry: PS51832 |
General information about the entry
| Entry name [info] | HD_GYP |
| Accession [info] | PS51832 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
10-MAY-2017 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 02-JUN-2021 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51831 |
| Associated ProRule [info] | PRU01176 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | HD-GYP domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=198; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=193; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9501035; R2=0.0128349; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=628; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=355; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20, 0,-22; /M: SY='Q'; M=-12, -1,-30, 1, 20,-32,-20, 2,-26, 23,-22, -8, 0,-11, 32, 26, -4,-10,-26,-22,-12, 25; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 12,-32,-20, 0,-26, 30,-24, -6, 0,-12, 30, 30, -6,-10,-24,-20,-10, 20; /M: SY='T'; M= 9, -9,-12,-17,-12, -8,-18,-20, -3,-15, 4, -3, -9,-15,-12,-15, 6, 24, 2,-25,-10,-12; /M: SY='Q'; M=-16, -4,-30, -4, 8,-28,-20, 27,-26, 13,-20, -4, 2,-16, 30, 30, -6,-12,-26,-22, -3, 16; /M: SY='D'; M=-14, 16,-28, 26, 19,-26,-18, -6,-23, 4,-11,-14, 2,-12, 2, -3, -8,-10,-20,-30,-14, 11; /M: SY='E'; M= 2, 6,-25, 8, 11,-27,-16, -8,-12, -4,-13, -9, -1,-10, 10,-10, -1, -8,-13,-26,-15, 10; /M: SY='V'; M= 7,-27,-13,-30,-27, -3,-27,-28, 27,-20, 8, 8,-25,-25,-25,-22, -8, -2, 39,-27,-10,-27; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='H'; M=-16, -7,-28, -6, 9, 1,-24, 20,-16, -4,-11, -5, -6,-17, 10, -3, -9,-12,-21, -8, 20, 9; /M: SY='R'; M= 5, -7,-19,-11, -4,-18,-12,-10,-20, 8,-18,-12, -1,-14, 0, 23, 8, 7,-10,-25,-14, -4; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-17, 20,-27, 45, 26,-28,-28,-17,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 30, -8,-14,-13,-10,-22, 15,-18,-19,-12,-19,-14, -3,-12,-10,-18, 15, 0, -9,-25,-22,-10; /M: SY='H'; M=-10, -1,-22, -3, 5,-18,-20, 15,-22, 2,-16, -9, 2,-13, 4, 11, 4, 12,-16,-28, -5, 2; /M: SY='A'; M= 26,-18,-14,-24,-14, -8,-12,-20, 2,-18, 14, 2,-18,-18,-14,-20, -6, -4, 4,-20,-12,-14; /M: SY='G'; M= 10, -6,-18,-10,-12,-22, 23,-18,-24,-14,-22,-16, 0,-14,-12,-16, 15, 8,-14,-27,-22,-12; /M: SY='E'; M=-12, 17,-30, 27, 39,-32,-18, -2,-32, 17,-25,-20, 5, -5, 13, 5, -2,-10,-28,-30,-18, 26; /M: SY='F'; M=-13,-21,-20,-27,-21, 25,-27, -8, 6,-19, 16, 13,-19,-25,-18,-15,-16, 0, 2, -4, 22,-19; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 4,-24,-20, -4,-30, 39,-24,-10, 0,-16, 10, 52,-10,-10,-20,-20,-10, 4; /M: SY='D'; M=-15, 42,-27, 59, 17,-37, -8, -2,-37, -2,-30,-28, 18,-10, 0,-10, 6, -5,-27,-40,-20, 8; /M: SY='N'; M=-10, 20,-26, 10, 2,-24, -8, 0,-22, 6,-30,-18, 32, 7, -1, 0, 2, -4,-28,-35,-21, -1; /M: SY='E'; M=-10, 3,-32, 13, 46,-30,-20, -5,-28, 5,-22,-20, -5, 21, 13, -5, -2,-10,-30,-30,-22, 28; /M: SY='T'; M= -5, -2,-15,-10, -8,-12,-20,-15,-15, -1,-12,-10, 0,-12, -5, 9, 13, 36, -5,-28,-10, -8; /M: SY='G'; M= 0, -5,-25, -5, -6,-30, 33,-11,-31,-11,-28,-15, 2,-15, 3,-11, 9, -8,-25,-25,-23, -1; /M: SY='N'; M= -3, 7,-21, -4, -6,-16, -9, 1,-12, 3,-14, 1, 17,-18, 1, 11, -1, -4,-14,-28,-13, -4; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-19, -6, 33,-24, -4,-28; /M: SY='I'; M= -8,-23,-27,-23,-15,-10,-28,-23, 12,-10, 3, 4,-21, 4,-15,-14,-16, -8, 9,-24,-11,-17; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='V'; M= -4,-23,-17,-29,-25, -2,-29,-22, 26,-19, 11, 20,-21,-22,-18,-19,-10, 4, 29,-26, -6,-23; /M: SY='E'; M= 6, -2,-23, -1, 11,-28, 8, -8,-25, -4,-23,-15, 1,-10, 8, -8, 10, -4,-21,-27,-21, 10; /M: SY='H'; M=-16,-11,-28, -9, 2, -7,-24, 20,-14, -2, -1, -1, -8,-21, 1, 10,-15,-12,-15,-16, 12, -2; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='C'; M= 1,-17, 20,-19,-19,-12,-19,-23, -2,-19,-12, -8,-13,-25,-19,-19, 8, 5, 14,-38,-18,-19; /M: SY='R'; M=-14, -2,-30, 0, 17,-26,-20, -3,-30, 32,-23,-12, 0,-12, 12, 41, -8,-10,-22,-22,-12, 12; /M: SY='L'; M= 0,-27,-21,-31,-21, 3,-27,-22, 22,-27, 33, 15,-24,-24,-18,-22,-21, -8, 13,-20, -3,-21; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='E'; M=-12, -9,-26, -5, 17,-13,-24, -7,-12, 0, 6, -3,-11,-16, 3, 9,-13,-10,-13,-24,-10, 9; /M: SY='H'; M= 12, -3,-23, -4, 7,-24, 2, 13,-24, -7,-18,-12, -1,-12, 0,-11, 1,-10,-19,-25,-12, 2; /M: SY='L'; M= 2,-22, 10,-26,-20, 0,-23,-16, -1,-22, 13, 1,-22,-28,-18,-21,-15, -8, 0,-18, 2,-20; /M: SY='G'; M= 10, -8,-25,-11,-11,-29, 39,-15,-30,-13,-24,-14, -2,-16, -5,-15, 2,-14,-23,-20,-24, -8; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 53,-30,-20, 8,-30, 26, 8,-24,-30,-32,-20,-24,-10, 4, -2, 18,-26; /M: SY='S'; M= 13, 9,-15, 11, 2,-25, -2,-10,-22, -8,-25,-20, 8,-10, -2,-12, 24, 8,-12,-35,-20, 0; /M: SY='E'; M=-12, 24,-28, 32, 41,-31,-14, 2,-31, 6,-24,-22, 15, -6, 12, -2, 2, -8,-30,-34,-20, 26; /M: SY='E'; M=-10, 10,-26, 12, 34,-21,-17, -1,-20, 1,-11,-13, 8, -9, 9, -3, -3, -8,-23,-30,-17, 22; /M: SY='L'; M= 0, -1,-22, 3, 4,-14,-17,-12, -8,-13, 8, -4,-10,-16, -7,-15,-10, -8, -8,-26,-12, -1; /M: SY='A'; M= 20,-11,-10,-17,-13,-13,-12,-21, -2,-12, -9, -7, -9,-15,-13,-16, 13, 15, 10,-28,-15,-13; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M=-16, 34,-30, 51, 36,-36,-14, 0,-36, 4,-26,-26, 12, -6, 8, -6, 0,-10,-30,-36,-20, 22; /M: SY='L'; M=-12,-12,-22, -9,-12, -2,-24,-13, 7,-21, 28, 16,-18,-24,-13,-16,-22,-10, 2,-24, -4,-12; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-34,-26, 4,-34,-26, 34,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 27,-22, -2,-26; /M: SY='Y'; M=-11,-11,-23,-13, -7, 7,-19, -6,-16, 6,-15, -9, -5,-19, -6, 10, -2, -3,-12,-10, 11, -7; /M: SY='K'; M=-10, -2,-24, -7, -4,-14,-18, -6, -8, 12, -4, 6, 3,-18, -1, 6,-12, -8,-10,-24, -8, -2; /M: SY='A'; M= 34, -6,-10,-12, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 22, 8, -4,-28,-20, -6; /M: SY='A'; M= 44, -8,-10,-17, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-13,-12, -7,-10, -8,-18, 15, 3, -2,-23,-20, -8; /M: SY='P'; M=-10,-22,-35,-15, -5,-21,-22,-20,-11,-15,-11,-11,-22, 62,-12,-20,-15,-10,-21,-28,-23,-12; /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20, 4,-24, -8, 20,-18, 32, 44,-24,-24, -8,-14,-24,-10, 10,-20, 0,-14; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30, 0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30; /M: SY='G'; M= 20,-10,-22,-14,-16,-26, 42,-20,-28,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20, 4,-12,-18,-20,-26,-16; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-38,-30, 0,-38,-30, 45,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 35,-22, -2,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='R'; M= -2, 2,-21, -4, -2,-20, -9, -3,-23, 11,-22,-14, 13,-17, 3, 28, 5, -2,-17,-27,-15, -2; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30, 0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 44, 28,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 9,-28, 5, 8,-28,-15, -5,-28, 38,-30,-12, 14,-12, 8, 23, -5, -8,-22,-25,-12, 8; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= 11,-10,-26,-12,-18,-28, 55,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-24,-20,-28,-18; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 12,-32,-20, 0,-26, 30,-24, -6, 0,-12, 30, 30, -6,-10,-24,-20,-10, 20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M=-13, 37,-23, 42, 9,-29,-10, -2,-29, -2,-26,-23, 25,-12, -2, -8, 7, 5,-24,-38,-18, 3; /M: SY='D'; M= 10, 18,-22, 24, 17,-30, -8, -8,-26, -2,-20,-20, 4, -8, 0,-12, 4, -6,-18,-30,-20, 8; /M: SY='E'; M= 3, 12,-25, 18, 37,-29,-14, -5,-27, 4,-19,-19, 1, -4, 10, -6, 2, -8,-23,-29,-20, 23; /M: SY='E'; M=-12, 18,-30, 29, 44,-34,-18, 2,-31, 8,-22,-19, 5, -4, 22, -1, 0,-10,-30,-31,-18, 33; /M: SY='W'; M=-15,-28,-34,-33,-25, 20,-22,-26,-13,-20,-11,-13,-26,-25,-22,-18,-22, -7,-17, 78, 21,-20; /M: SY='E'; M= 6, -3,-22, -1, 23,-25,-17, -8,-14, 1,-13,-10, -7, -9, 12, -6, 1, -6,-10,-26,-17, 17; /M: SY='I'; M=-10,-22,-28,-25, -9, -4,-33,-21, 26,-22, 19, 12,-18,-18,-12,-21,-18,-10, 13,-22, -4,-13; /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20, 2,-22, -5, 20,-15, 27, 51,-22,-22, -5,-12,-22,-10, 10,-20, 0,-12; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 11,-31,-20, -4,-28, 37,-26, -8, 0,-12, 22, 32, -8,-10,-22,-20,-10, 15; /M: SY='K'; M= -4, -2,-27, -2, 3,-30, 4, -9,-29, 17,-28,-12, 2,-12, 9, 9, 2, -8,-22,-23,-16, 6; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='T'; M= -4, -7,-21,-10, -6,-17,-20,-20,-14,-10,-17,-14, -7, 27,-10,-14, 9, 28,-11,-30,-17,-10; /M: SY='E'; M=-12, -6,-30, -5, 17,-23,-25, -5, -9, 6,-11, -4, -5,-11, 17, 12, -7,-10,-14,-23,-11, 14; /M: SY='I'; M= 2,-23,-25,-31,-23, 2,-28,-16, 24,-21, 8, 8,-18,-20,-15,-23,-13, -8, 14, -8, 14,-23; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M= 6,-11,-23,-14, -8, -8,-15, 13,-16, -1,-12, -6, -7,-19, -2, 7, -5, -8,-12,-10, 12, -8; /M: SY='D'; M=-16, 23,-30, 35, 34,-32,-16, 0,-34, 9,-24,-22, 8, -7, 10, 7, -2,-10,-28,-32,-18, 22; /M: SY='I'; M= 14,-20,-20,-30,-20, -8,-21,-21, 21,-19, 8, 14,-16,-16,-13,-23, -8, -6, 15,-20, -8,-19; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 19, -6,-19,-10, -6,-24, 10,-16,-23, 2,-22,-14, -2,-12, -6, -7, 8, -3,-13,-23,-20, -6; /M: SY='E'; M= -5, 1,-25, 5, 18,-26, 5, 9,-30, -5,-25,-17, 4,-10, 4, -7, 8, -7,-25,-30,-16, 10; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= 0, 2,-23, 6, 19,-26, 8, -8,-29, -4,-26,-20, 4, -8, 3, -8, 15, -1,-23,-31,-22, 11; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='D'; M=-16, 27,-32, 43, 22,-36,-14, -5,-34, -1,-28,-26, 7, 15, 1,-11, -2,-10,-30,-36,-22, 10; /M: SY='S'; M= 12, -3,-13, -5, -2,-20, -3,-10,-20, -4,-25,-17, 5,-12, 0, 1, 27, 12,-10,-34,-18, -2; /M: SY='G'; M= -2, 1,-28, 5, -2,-28, 7,-11,-30, -1,-24,-18, -1, 1, -6, 3, -2,-11,-23,-26,-22, -6; /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26, 36,-32,-22, 17,-30, 29, 12,-24,-28,-28,-22,-24,-10, 9, -8, 12,-26; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20, 0,-22; /M: SY='Q'; M=-12, 0,-30, 2, 22,-32,-20, 2,-26, 21,-22, -8, 0,-10, 32, 25, -4,-10,-26,-22,-12, 26; /M: SY='F'; M=-12,-24,-22,-30,-23, 24,-31,-16, 14,-24, 16, 7,-19,-25,-22,-19,-16, -1, 7, -6, 19,-23; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='K'; M= 11, -6,-22,-10, 0,-24,-12,-12,-22, 22,-20,-10, -4,-12, 2, 20, -2, -6,-12,-20,-14, 0; /M: SY='D'; M= -9, 2,-23, 8, 8,-24,-21, -9, -8, -3,-11, -6, -6,-16, 6, -7, -4, -6, 0,-30,-14, 7; /M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30, 0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30; /M: SY='A'; M= 42, -8,-10,-16, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-14,-12, -6,-10, -8,-18, 16, 4, -2,-24,-20, -8; /M: SY='Y'; M=-14,-26,-26,-28,-22, 16,-32, -6, 19,-22, 23, 12,-24,-28,-16,-18,-24,-10, 7, 0, 32,-22; /M: SY='E'; M= 0, 4,-18, 6, 21,-22,-12, -8,-22, -2,-22,-18, 4, -6, 6, -6, 20, 15,-16,-34,-18, 13; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10, 0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='D'; M=-18, 48,-28, 62, 17,-37, -8, 2,-37, 0,-30,-28, 26,-12, 0, -8, 2, -8,-30,-40,-20, 8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= -3, -2,-18, -5, -1,-19,-13,-10,-22, 9,-23,-14, 4,-12, 2, 15, 16, 15,-12,-30,-14, -1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 11, 0,-15, 2, 0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M=-14, -4,-28, -3, 19, -3,-22, -7,-23, 12,-15,-12, -5,-12, 2, 13, -8,-10,-19,-17, -5, 11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-23,-13, 1,-28,-18, 8,-12, 32, 13,-23,-25,-13, -8,-25,-10, 3,-20, -2,-13; /M: SY='A'; M= 27, -6,-18,-12, -2,-24, -8,-16,-18, 13,-18,-10, -6,-10, -2, -1, 2, -4, -8,-20,-16, -2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-12, 21,-28, 28, 44,-30,-15, 2,-30, 7,-23,-22, 13, -5, 14, -2, 2, -8,-30,-33,-20, 29; /M: SY='E'; M=-16, 18,-30, 29, 33,-31,-17, 0,-33, 12,-23,-21, 6, -8, 11, 13, -2,-10,-28,-31,-18, 21; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='P'; M= -7,-12,-32, -6, 0,-26,-15, 1,-22,-10,-28,-17, -8, 50, -5,-15, 2, -5,-25,-32,-20, -6; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 38,-30, 32, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 22,-20, 0,-26; /M: SY='Y'; M= 1,-12,-20,-16,-12, 7,-16, 16,-12,-13,-10, -6, -6,-20, -9,-12, -1, -5,-10, -9, 19,-12; /M: SY='G'; M= 20,-10,-22,-14,-16,-26, 42,-20,-28,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20, 4,-12,-18,-20,-26,-16; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M=-10,-28,-26,-36,-26, 2,-34,-21, 38,-25, 25, 29,-22,-22,-15,-24,-22,-10, 22,-20, 0,-24; /M: SY='V'; M= -2,-17,-12,-22,-21, -4,-24,-21, 13,-14, 4, 10,-17,-21,-17,-14, 0, 18, 24,-28, -8,-19; /M: SY='A'; M= 41, -8,-10,-15, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-15,-12, -5,-10, -8,-18, 17, 5, -2,-25,-20, -8; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='A'; M= 41, -8,-10,-15, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-15,-12, -5,-10, -8,-18, 17, 5, -2,-25,-20, -8; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='V'; M= -5,-25,-15,-25,-23, -5,-28,-23, 16, -8, 3, 5,-23,-28,-21, 1,-10, -2, 33,-28,-10,-23; /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26, 60,-30, -4, 0,-22, 6, 0,-20,-30,-28,-16,-20,-10, -4, 18, 50,-26; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='A'; M= 36, -5,-15,-11, 7,-22, -5,-15,-15, -5,-12,-12, -8, -8, -3,-15, 8, -2, -7,-22,-20, 2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='T'; M= -2, -6,-16,-15,-15,-12, -9,-22, -5,-15, -8, -7, -3,-13,-13,-15, 10, 29, 0,-27,-12,-15; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='K'; M=-16, 17,-30, 25, 12,-32,-16, -4,-34, 26,-28,-18, 8,-12, 6, 24, -6,-10,-24,-28,-14, 8; /M: SY='R'; M=-20, -8,-30, -8, 0,-20,-20, 24,-30, 21,-20, -8, 2,-20, 10, 53,-10,-12,-22,-22, -3, 0; /M: SY='P'; M= 7,-21,-23,-19,-12,-18,-18,-23, -2,-13,-12, -8,-21, 28,-16,-20, -5, -4, 3,-28,-21,-16; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 45,-28,-10, 0,-12, 10, 39,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='P'; M=-10, -6,-34, 0, 17,-30,-20,-12,-26, 18,-28,-16, -8, 32, 4, 4, -8,-10,-26,-26,-20, 8; /M: SY='A'; M= 36,-12,-17,-18, -8,-22, -5,-20,-12,-10,-15,-12,-12, 14,-10,-20, 5, -2, -7,-22,-22,-10; /M: SY='W'; M=-18,-36,-38,-38,-28, 21,-24,-26, -7,-24, 1, -7,-34,-30,-23,-20,-34,-22,-16, 87, 23,-22; /M: SY='D'; M= 8, 17,-18, 22, 5,-28, -4, -8,-25, -6,-25,-22, 9,-10, -2,-12, 17, 4,-15,-35,-20, 2; /M: SY='H'; M=-14,-16,-26,-20,-14, -6,-26, 31, 6,-17, 9, 21,-10,-22, -3,-12,-18,-14, -2,-24, 8,-12; /M: SY='D'; M= -3, 36,-25, 49, 13,-35, -8, -5,-33, -2,-25,-25, 13,-10, -2,-12, 2, -8,-23,-35,-20, 5; /M: SY='R'; M=-14, -2,-30, 1, 18,-26,-20, -4,-30, 33,-24,-12, 0,-12, 12, 38, -8,-10,-22,-22,-12, 13; /M: SY='T'; M= 18, -9,-13,-19,-13,-12,-15,-22, -1,-13, -5, -5, -7,-12,-12,-17, 10, 20, 5,-24,-12,-13; /M: SY='V'; M= -5,-23,-17,-25,-20, -3,-26,-19, 17, -8, 12, 19,-23,-25,-16,-10,-15, -5, 24,-25, -6,-18; /M: SY='Q'; M= -9, -7,-24, -5, 11,-18,-19, -5,-15, 2, -5, -5, -6,-15, 12, 11, -3, -5,-15,-25,-11, 10; /M: SY='F'; M=-14,-28,-24,-32,-24, 29,-32,-13, 16,-26, 25, 11,-24,-28,-22,-20,-24,-10, 7, -3, 24,-24; /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-38,-28, 33,-34,-24, 24,-30, 22, 12,-22,-26,-28,-24,-22,-10, 14, -8, 12,-28; /M: SY='Q'; M=-10, -5,-28, -5, 10,-28,-22, -3,-17, 19,-12, -1, -5,-13, 28, 13, -9,-10,-20,-20, -8, 19; /M: SY='E'; M= 4, 3,-25, 6, 35,-30,-15, -3,-23, 5,-18,-13, -2, -4, 21, -3, 2, -8,-23,-26,-18, 28; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-30, -1, 10,-34, 16, -4,-30, -2,-24,-11, 0,-12, 22, -4, 0,-14,-30,-22,-20, 16; /M: SY='K'; M= 4, -2,-25, -5, 5,-28,-15,-12,-25, 36,-25,-10, -2,-10, 5, 18, -5, -8,-15,-20,-12, 5; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='K'; M= -2, 2,-22, 3, 14,-26,-12, -8,-26, 20,-28,-16, 4, -8, 8, 9, 12, 2,-18,-30,-16, 11; /M: SY='H'; M=-18, 2,-30, 5, 14,-22,-20, 76,-30, -5,-20, -5, 8,-15, 12, 0, -8,-18,-30,-30, 11, 9; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M= -3,-12,-24,-16, -7, -3, -5, -9,-19, -2,-13, -7, -6,-19, 1, 8, -5,-10,-16,-13, -6, -3; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 43, 18,-30,-30,-22,-20,-27, -8, 17,-22, -2,-22; /M: SY='V'; M= -2,-23,-13,-27,-25, -2,-29,-28, 24,-19, 7, 7,-22,-24,-24,-19, -5, 10, 35,-28, -8,-25; /M: SY='D'; M=-16, 34,-30, 50, 36,-36,-14, 0,-36, 4,-26,-26, 12, -6, 8, -6, 0,-10,-30,-36,-20, 22; /M: SY='V'; M= 16,-22,-17,-28,-20, -6,-20,-24, 16,-20, 13, 6,-20,-20,-18,-22, -9, -4, 17,-22,-10,-20; /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 69,-30,-20, 3,-30, 16, 3,-22,-30,-37,-20,-22,-10, 2, 5, 25,-28; /M: SY='L'; M= -9,-22, 3,-25,-17, 3,-28,-18, 3,-19, 8, 4,-20,-27,-10,-15,-14, -8, 6,-23, -5,-13; /M: SY='K'; M= 3, -2,-25, -3, 14,-28,-15, -5,-23, 18,-20, -9, -2,-10, 17, 16, -2, -8,-19,-22,-14, 15; /M: SY='N'; M= -8, 9, 4, 0, -3,-17,-15, -8,-11, -8,-17,-13, 16,-22, -9,-10, 0, -3, -8,-38,-19, -6; /M: SY='L'; M= 4,-19,-22,-22, -7, -6,-24,-19, 12,-19, 17, 6,-18,-18,-11,-19,-13, -8, 6,-22, -8,-10; /M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 59, 20,-40,-12, 2,-37, 2,-28,-25, 17,-10, 10, -7, 0,-10,-30,-37,-18, 15; /M: SY='Q'; M= 4, -2,-25, -5, 9,-32,-15, -4,-21, 20,-21, -6, -2,-10, 25, 10, -1, -8,-19,-20,-12, 17; /M: SY='F'; M=-14,-26,-22,-36,-26, 32,-27,-13, 17,-21, 16, 30,-20,-24,-19,-17,-20,-10, 9, -8, 12,-21; /M: SY='L'; M= 4,-25,-16,-30,-22, 17,-23,-22, 10,-24, 20, 7,-23,-25,-24,-20,-15, -6, 12,-15, 1,-22; /M: SY='E'; M= -5, 8,-25, 15, 46,-28,-15, -2,-28, 5,-22,-20, 2, -2, 15, -2, 9, -3,-25,-32,-20, 31; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-38,-30, 0,-38,-30, 45,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 35,-22, -2,-30; /M: SY='K'; M= 12, -6,-22,-10, 0,-24,-12,-12,-22, 23,-20,-10, -4,-12, 2, 16, -2, -6,-12,-20,-14, 0; /M: SY='R'; M= -6, 4,-27, 7, 14,-25,-15, -3,-28, 14,-20,-15, 2,-13, 7, 28, -3, -8,-20,-25,-15, 8; /M: SY='R'; M=-14, -2,-30, 0, 19,-27,-20, 0,-28, 25,-22,-11, 0,-12, 20, 38, -6,-10,-24,-22,-12, 17; /M: SY='Y'; M=-18,-27,-32,-27,-22, 21,-28, 0, 0,-17, 7, 0,-27,-30,-14,-14,-27,-14,-10, 44, 51,-20; /M: SY='R'; M= 4, -6,-22, -9, 2,-24,-12, -4,-22, 10,-19,-10, -1,-14, 14, 23, 5, -3,-16,-23,-14, 6; /M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 59, 28,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 16, -8, 4, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 16; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51831; PS51833 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | HD-GYP |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
CDPD1_PSEAE (Q9HWS0 ), CDPD1_VIBCH (Q9KSG1 ), CDPD2_PSEAE (Q9HV27 ), CDPD2_VIBCH (Q9KSB1 ), CDPD_THEMA (Q9WY30 ), CGAP1_VIBCH (Q9KLR1 ), CGAP2_VIBCH (Q9KMV8 ), CGAP3_VIBCH (Q9KL18 ), PDEB_BORBU (O50161 ), RPFG_XANC8 (Q4UU85 ), Y2027_AQUAE (O67821 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
4R8Z; 5Z7C |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission