PROSITE logo

PROSITE entry PS51852


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] PG1
Accession [info] PS51852
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 28-FEB-2018 CREATED;
28-FEB-2018 DATA UPDATE;
27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51852
Associated ProRule [info] PRU01199

Name and characterization of the entry

Description [info] pG1 pseudoGTPase domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=175;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=170;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2622278; R2=0.0134794; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=649; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=315; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-11, -2,-27,  4, -4,-16,-21,-15, -4,-16,  0, -6, -8,  1,-10,-18, -9, -7, -8,-30,-13, -9;
/M: SY='T';  M=  7,-11,-20,-16,-12,-16, -8,-20, -5,-15,-12, -8, -7,  2,-11,-18,  7, 10, -3,-27,-16,-13;
/M: SY='N';  M= -9, 17,-19, 10, -4,-18,-13, -5,-13, -2,-18,-13, 21,-19, -6,  0,  5,  6, -9,-34,-15, -6;
/M: SY='I';  M=  8,-12,-18,-22,-20, -9,-20,-20, 17,-17,  1,  3, -6,-20,-16,-19, -4, -3, 17,-26,-11,-20;
/M: SY='D';  M=-15, 32,-26, 47, 15,-32,-15, -5,-26, -3,-22,-22,  9,-13, -3,-11, -2, -8,-16,-37,-18,  6;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-27, -4,  6,-26,-17, -2,-27, 26,-24,-10,  1,-14, 18, 36, -1, -6,-20,-23,-11, 10;
/M: SY='V';  M= -5,-26,-21,-29,-24, -4,-32,-27, 29,-13,  8, 11,-22,-23,-20,-16,-14, -5, 32,-25, -6,-24;
/M: SY='N';  M= -8, 19,-25, 11,  7,-25,  6, -1,-27,  7,-29,-18, 29,-15,  1,  2,  3, -7,-28,-31,-20,  4;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-20,-25,-14,  0,-28,-16, 14,-21, 31, 15,-25,-26, -7,-15,-22, -9,  9,-21, -3,-11;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-18,-30,-25, 16,-30,-18, 19,-23, 23, 11,-28,-30,-24,-19,-20, -6, 22,-13, 11,-25;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='I';  M=-10,-26,-24,-34,-26, 14,-32,-24, 34,-26, 15, 13,-17,-19,-21,-24,-17, -9, 20,-12,  5,-26; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='L';  M=  1,-22,-15,-26,-17, 16,-20,-17,  8,-22, 24,  8,-20,-22,-19,-17,-16, -7,  5,-12,  2,-17; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G';  M= -2,-10,-24,-12,-17,-20, 43,-13,-23,-15,-17, -3, -4,-17,-13,-15, -4,-15,-18,-17,-20,-15; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='R';  M=-11,  5,-24,  1,  4,-21,-13, -2,-24, 28,-23,-10, 11,-13,  7, 31, -5, -7,-19,-21,-10,  4; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='D';  M=-17, 36,-30, 48, 13,-35,-10, -2,-33, -2,-30,-27, 19,  6, -2,-10,  0, -9,-30,-38,-22,  5;
/M: SY='G';  M= -4,-10,-32, -8,-11,-30, 37,-18,-35, -6,-30,-18, -4,  2,-13,-11, -4,-16,-28,-22,-26,-13;
/M: SY='L';  M=-12,-25,-22,-25,-16,  5,-28,  2, 11,-26, 37, 16,-23,-28,-15,-16,-26,-12,  3,-22,  4,-16;
/M: SY='A';  M= 27,-17,-15,-27,-17,  2,-13,-22,  3,-17, -1, -3,-14,-15,-17,-22, -1, -4,  5,-15, -7,-17;
/M: SY='R';  M=-18,-11,-30,-11, -2, -7,-24, 10,-17, 11,-13, -4, -7,-21, 15, 26,-11,-10,-19, -2, 23,  3;
/M: SY='E';  M= -6,  6,-26, 13, 42,-30,-16,  0,-26,  6,-22,-16,  2, -4, 24,  0,  7, -5,-26,-30,-18, 33;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-22,-32,-22,  5,-29,-16, 25,-24, 36, 31,-25,-25,-14,-19,-25,-10, 14,-20,  0,-19;
/M: SY='A';  M= 28,-12,-17,-20, -8,-20,-11,-16, -1,-10, -6, -3,-10,-12,  1,-16,  3, -4,  0,-20,-15, -4;
/M: SY='N';  M= -8, 24,-20, 11,  0,-20, -4,  5,-22,  4,-28,-18, 40,-18,  2, 11, 12,  2,-25,-36,-18,  0;
/M: SY='E';  M=-12,  3,-28,  9, 44,-10,-22, -4,-25,  3,-15,-16, -4, -5,  9, -4, -4,-10,-25,-23,-11, 27;
/M: SY='I';  M= -8,-25,-25,-33,-25, 11,-31,-25, 28,-26,  9,  9,-15,-20,-20,-25, -9, -5, 17,-18,  2,-25;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  7,-27,-20,  4,-26, 23,-20, -6,  0,-16, 28, 48, -6,-10,-24,-20,-10, 14;
/M: SY='A';  M= 28,-11,-10,-19,-14,-14,-10,-22, -3,-12, -6, -6,-11,-14,-14,-18,  9, 12,  9,-24,-16,-14;
/M: SY='M';  M=-12,-18,-24,-21,-10, -2,-25,  0,  6,-11, 15, 23,-18,-22,  7, -8,-18,-10, -4,-11, 12, -2;
/M: SY='C';  M= -5,-17, 62,-23,-21,-15,-23,-23,-18,-25,-10,-13,-14,-31,-21,-23, -1, -3, -6,-42,-22,-21;
/M: SY='T';  M=  0, -4,-15, -8, -6,-15,-16,-18,-14,-10,-17,-14, -2,  8, -8,-12, 18, 34, -7,-32,-15, -8;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-13, 34,-26, 48, 24,-35,-10, -2,-35,  0,-28,-26, 15, -8,  4, -8,  7, -5,-26,-38,-20, 14;
/M: SY='D';  M=-15, 25,-28, 37,  6,-29,  1, -7,-29, -9,-16,-19,  7,-15, -7,-14, -5,-12,-23,-33,-18, -1;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='E';  M=-10, -2,-24,  2, 24,-18,-19, -5,-17,  9, -6, -7, -5, -9,  7,  8, -8, -9,-16,-22,-11, 15; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='Y';  M=-15,-15,-24,-17,-12, 22,-24,  8, -4, -9, -2,  0,-14,-22, -2, -7,-14, -9,-10, 13, 44, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='D';  M=  5,  8,-16, 13, -3,-19,-11,-12, -9, -7,-11,-11, -3,-14,-10,-14,  0, -4,  2,-27,-15, -6; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='L';  M= -9,-11,  7,-18,-17, -4,-22,-15,  5,-20, 11,  3, -6,-24,-15,-17,-14, -7,  1,-26, -9,-17; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='D';  M=-15, 21,-28, 33, 10,-29,-12, 15,-29, -4,-24,-19,  8,  8,  0, -9, -4,-10,-26,-31,-12,  3; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='G';  M= -4, -9,-26, -9,-14,-24, 44,-14,-33, -8,-24,-15,  0,-17,-12, -1, -2,-15,-24,-17,-22,-14; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='K';  M= -5, -5,-22, -7,  0,-19,-17,-12,-10, 18,-17, -5, -2,-10,  1,  8, -1, -3, -6,-21, -9,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='M';  M= -7,-12,-20,-19,-11, -9,-22, -9, 12,-10,  5, 18,-10,-14,  4,-10, -6,  2,  5,-19, -4, -5; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='Y';  M=-15,-19,-24,-19,-17, 22,-26, 10,  4,-12,  9,  4,-19,-26,-10,-10,-19, -9, -5, 17, 54,-17; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-22, 14, 41,-24,-14, -2,-24,  5,-19,-17,  2, -2, 14, -2,  7, -3,-22,-28,-17, 27; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='L';  M= -7,-26,-15,-26,-19,  7,-26,-19, 19,-24, 36, 15,-26,-26,-19,-17,-22, -7, 16,-19, -2,-19; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='E';  M= -2, 15,-21, 23, 26,-26,-10, -3,-25,  1,-20,-19,  6, -5,  6, -6,  7, -3,-20,-29,-17, 16; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-19,-29,-21, 20,-28,-19, 19,-26, 30, 14,-22,-24,-21,-19,-22, -9, 10,-12,  5,-21; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='R';  M= -3, -7,-22, -9,  2,-21,-14, -2,-20, 15,-15, -7, -2,-14, 14, 33, -3, -7,-15,-17,-10,  5; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='P';  M= -9,-17, -5,-12, -5,-24,-19,-19,-19,-12,-24,-17,-17, 54,-12,-19, -9, -9,-22,-29,-26,-12; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='V';  M= -1,-20,-14,-23,-20, -4,-23,-22, 22,-18,  4,  6,-16,-20,-18,-18, -2,  1, 27,-25, -8,-20; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='E';  M= 11, 11,-19, 15, 16,-25, -7, -7,-21, -1,-16,-16,  1, -6,  1,-10,  4, -5,-15,-25,-17,  9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='G';  M=  7,  6,-21,  9,  7,-25, 12,-10,-25, -6,-19,-17,  1, -9, -4,-12,  2, -9,-18,-23,-20,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='N';  M= -9, 14,  6,  3, -3,-20,-10, -4,-22,  7,-24,-15, 22,-18, -3,  2,  0, -4,-20,-31,-17, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='V';  M= -1, -4,-12,  0, -9,-12,-15,-15,  1,-11, -9, -6, -7,-17,-13,-13,  6,  3, 14,-30,-13,-11; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-6;
/M: SY='P';  M=-11,-15,-27,-14, -9, -3, -3,-12,-20, -4,-16,-11, -9,  8,-11,  5, -9,-10,-18,-14,-10,-12; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M: SY='Y';  M= -6,-13,-15,-13,-11,  7,-16, -1,  1,-12,  7,  1,-11,-18, -8,-10, -6, -2, -2, -4, 19,-11; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='P';  M=-10,-13,-25,-10, -3, -8,-15,-11,-14, -2,-16,-10,-11, 32, -7,  2, -8, -7,-17,-16,-12, -7; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='F';  M= -8,-21,-12,-25,-20, 30,-21,-17, 10,-19, 11,  5,-18,-21,-24,-14,-13, -5, 14, -6,  8,-20; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='N';  M= -9,  3,-15, -4, -5,  4, -9, -2,-12, -1,-12, -9, 12,-15, -5,  8,  1, -2,-12,-16, -3, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='S';  M=  2, -4,-15, -2,  2,-18, -6, -7,-14, -5,-20,-12,  1, 11,  4, -7, 15,  6,-13,-25,-15,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='F';  M=-11,-21,-16,-27,-20, 35,-23,-16, 11,-21, 13,  6,-15,-20,-23,-16,-15, -7,  6, -1, 13,-20; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Q';  M= -7, -9,-20, -9, -2,-14,-16,  5, -6, -3, -9,  0, -8,-14, 13, -2, -7, -8, -7,  0,  0,  6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='N';  M= -4, 14,-11,  4, -4,-11, -7, -3,-11, -4,-14,-11, 22,-11, -4, -4, 11, 18,-11,-25,-11, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E';  M=  1,  5,-18,  4, 10,-18, -7, -4,-15, -2,-18,-13,  7, 10,  1, -6,  4, -2,-17,-23,-16,  5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='T';  M=  7, -1, -7, -6, -5,-10, -9,-12, -9, -7,-11, -9,  1, -7, -5, -8, 17, 25, -2,-22,-10, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='F';  M= -9,-14,-11,-19,-14, 28,-14, -7,  4,-12,  7, 11,-11,-14,-14, -9,-11, -5,  2,  0, 11,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Q';  M= -6,  2,-19,  3, 18,-23,-14,  0,-16,  9,-14, -6,  0, -5, 23,  5,  1, -1,-17,-17, -9, 20; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='P';  M=  7, -9,-18, -7, -2,-18, -7,-12,-12, -7,-18,-12, -7, 28, -5,-12,  5,  0,-12,-21,-18, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='H';  M=-11,  9,-20,  7, 11,-16,-11, 37,-20, -2,-16, -7, 14,-11,  7,  0, -2, -9,-21,-23,  0,  7; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='G';  M=  9, -7,-18, -9,-12,-20, 37,-14,-23,-12,-18,-12, -2,-12,-12,-14,  2,-11,-16,-14,-20,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='C';  M= -7,-16, 35,-20,-20, -2,-21,-12, -5,-16, -5, -5,-16,-25,-18,-16, -9, -5,  4,-18,  2,-20; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-16,-24,-17, 12,-23,-16, 18,-21, 26, 12,-19,-20,-16,-16,-19, -7, 10,-11,  3,-17; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='C';  M= -5,-16, 62,-21,-21,-11,-21,-21,-10,-20, -9, -9,-16,-27,-21,-20, -7, -5,  4,-32,-18,-21; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='I';  M= -6,-20,-19,-20,-13, -3,-21,-17, 13,-17, 12,  6,-18,  2,-13,-16,-14, -6,  7,-17, -6,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Y';  M=-14,-15,-20,-16,-15, 26,-21, 10,  0, -9,  1,  0,-14,-21,-10, -8,-14, -7, -6, 19, 52,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='N';  M=  0, 14,-11,  7,  0,-14,  0,  0,-14, -4,-21,-14, 25,-11,  0, -4, 18,  7,-14,-28,-14,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='S';  M=  3, -4, 17, -5, -5,-14, -5,-11,-16,-11,-20,-14,  2,-13, -5,-11, 19,  9, -7,-30,-16, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='K';  M= -9, -5,-21, -6,  1,-17,-16, -7,-13, 24,-15, -4, -2,-10,  4, 23, -8, -7, -9,-14, -6,  1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E';  M=  4,  9,-16,  7, 19,-18, -7, -2,-16,  2,-14,-12,  9, -5,  5, -4,  4, -4,-16,-21,-14, 12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='S';  M=  7,  0, -7,  0,  0,-14,  0, -7,-14, -7,-21,-14,  7, -7,  0, -7, 28, 14, -7,-28,-14,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='L';  M= -9,-21,-14,-23,-16, 20,-21,-14, 11,-21, 28, 11,-20,-21,-18,-14,-20, -7,  5, -9,  5,-16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='S';  M= 13, -2, -5, -4, -2,-11,  0, -7, -9, -5,-12, -9,  2, -5, -2, -7, 16,  7, -4,-18,-11, -2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='Y';  M=-10,-16,-16,-17,-16, 20,-20,  1,  5,-11,  3,  2,-15,-20,-13,-10,-12, -5,  5,  8, 33,-16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='I';  M= -4,-19,-12,-21,-17,  1,-20,-14, 19,-14, 16, 18,-18,-18,-12,-13,-13, -4, 19,-16, -2,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='V';  M= -5,-15,-15,-16,-14, -7,-10,-14,  5, -6, -1,  2,-10,-16,-11,  1, -7, -5, 10,-16, -7,-14; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='E';  M=-10,  5,-26, 11, 33,-24,-17, 17,-26, 11,-19,-12,  2, -5, 14,  4, -3,-10,-24,-24, -8, 23; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-6;
/M: SY='F';  M=-10, -6,  2,-13,-13,  8,-17,  7,-18,-17,-15,-11,  4,-23,-14,-13,  2, -3,-14,-26,  0,-13;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20,  0,-27;
/M: SY='E';  M= -9, -9,-26, -7,  9, -3, -1,-12,-18,-12, -4, -9, -9,-16, -8,-12, -9,-12,-17,-18,-10,  2;
/M: SY='K';  M=-12,  0,-30,  0,  8,-28,-20, 10,-30, 39,-28, -8,  2,-12, 10, 25,-10,-12,-22,-22, -5,  8;
/M: SY='I';  M= -2,-16,-20,-22,-17, -7,-24,-21, 16,-21,  3,  3, -9,-16,-12,-20,  4, 10, 11,-28, -8,-17;
/M: SY='R';  M=-15,-14,-26,-16, -6,-12,-22, -5,-12, 14, -1,  8, -9,-21,  3, 35,-15,-10, -9,-20, -6, -4;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-12, 17,-30, 29, 53,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  4, -2, 16, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 35;
/M: SY='S';  M= 13, -8,-17,-12, -4,-20,-11,-13, -5,-10,-14, -7, -2,-12,  5,-13, 14,  4, -4,-28,-15, -1;
/M: SY='T';  M=  0,  9,-14,  8, -1,-19,-12,-13,-19, -8,-20,-17,  7,-10, -5,-10, 23, 29, -9,-35,-15, -3;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-23,-24,-11, -3,-28,-14, 13,-20, 30, 15,-22,-24,  0,-14,-22,-10,  2,-20, -2, -6;
/M: SY='L';  M= -5,-21,-24,-24,-21, -7, -1,-22,  6,-25, 11,  4,-15,-23,-18,-22,-12,-10,  1,-22,-11,-21;
/M: SY='R';  M= -4,-10,-26,-12, -5,-22,  0, -7,-28, 14,-20,-12, -2,-18,  1, 37, -5,-10,-18,-20,-15, -5;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R';  M=-13,  4,-26,  8,  5,-25,-15, -4,-30, 21,-25,-15,  5,-15,  6, 34,  1, -5,-20,-27,-14,  4;
/M: SY='D';  M=-16, 28,-28, 43, 20,-29,-15, -4,-27, -4,-14,-19,  7,-12,  0,-10, -5,-10,-23,-35,-16, 10;
/M: SY='N';  M= -8, 16,-22,  6,  4,-24,-12,  0,-21, 12,-25,-12, 23,-14, 11,  7,  5,  5,-22,-30,-14,  8;
/M: SY='Y';  M= -4,-10,-24,-12,-10,  1,-19, 33,-12,-10,-11, -4, -7,-21, -3, -9, -6, -8,-14, -3, 34,-10;
/M: SY='L';  M=  1,-24,-18,-28,-18,  2,-22,-15, 15,-21, 32, 25,-24,-24,-13,-18,-20, -8,  8,-20, -4,-16;
/M: SY='V';  M= 15,-21,-17,-24,-18,-12,-18,-25,  9,-15, -3, -2,-20,  0,-19,-21, -4, -3, 16,-26,-16,-19;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='N';  M=-12, 28,-23, 14,  2,-22, -6, 29,-22, -1,-27,-14, 44,-19,  8,  1,  5, -5,-30,-36,-11,  4;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='L';  M= -2,-26,-18,-31,-21, 22,-25,-20, 10,-26, 29, 10,-24,-26,-23,-20,-20, -8,  6,-13,  4,-21;
/M: SY='T';  M=  1,-11,-10,-16,-16, -7,-22,-23,  3,-14, -5, -4,-10,-17,-16,-14, 11, 29, 17,-31,-11,-16;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 43, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 17,-22, -2,-22;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-24,-35,-27,  3,-35,-27, 38,-28, 27, 18,-25,-25,-22,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-15,  5,-22;
/M: SY='A';  M= 31,-18,-10,-24,-18,-12,-12,-24,  6,-14, -2, -2,-18,-18,-18,-20,  2,  0, 19,-24,-16,-18;
/M: SY='N';  M= -7, 16,  4,  3,-10,-21,  5, -6,-24,-10,-26,-19, 29,-23,-10,-10,  6,  0,-23,-37,-23,-10;
/M: SY='K';  M=-13,  5,-32, 10, 12,-34,-18, -4,-28, 19,-27,-13,  0,  7, 17, 12, -6,-10,-26,-25,-15, 13;
/M: SY='R';  M=-16,-14,-34,-10,  0,-24,-20, -7,-26, 16,-24,-14, -7, 20,  3, 37,-10,-10,-24,-24,-17, -4;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='G';  M=  9, -6,-13, -8,-10,-15, 27,-11,-17,-10,-13,-10, -2,-10,-10,-11,  2, -8,-12,-11,-15,-10; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D';  M=-18, 43,-30, 61, 27,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 16, -8,  4, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 15;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='T';  M=  2, -3,-10, -9, -8,-10,-13,-15, -5,-10,-10, -8,  1, -9, -7,-10, 17, 27,  0,-26,-10, -8; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='S';  M=  4, -8,-12,-10, -9,-12, -2,-14, -4,-13,-14, -8, -2,-13, -8,-13, 15,  6,  3,-27,-14, -9; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='G';  M=  1, -7,-20, -5, -6,-21, 18,-13,-23,-11,-25,-16,  0,  7, -8,-13, 11, -1,-18,-25,-21, -8; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='E';  M= -8,  4,-25,  8, 28,-25,-16, -4,-25, 25,-21,-12,  0, -4, 12, 13, -4, -8,-20,-20,-12, 20; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='T';  M= -4, 12,-14,  5,  7,-14,-11, -5,-14, -2,-15,-12, 15, -9,  0, -4, 10, 18,-13,-27,-12,  3; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L';  M= -1,-21,-20,-25,-15, -3,-21,-13,  6,-12, 21, 17,-19,-23, -9, -2,-17, -8,  3,-20, -5,-13;
/M: SY='P';  M=-13, -1,-33, -1,  2,-26,-16, 23,-23, -6,-26,-12,  5, 29,  5, -8, -5,-11,-30,-31,-12,  0;
/M: SY='F';  M= -5,-18,-19,-24,-18,  9,-23,-20,  9,-22,  6,  2,-11,-20,-17,-19, -1,  5,  6,-21, -1,-18;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-14,-16,-30,-20, -8,-16,-28,-10,  3,  3, -4,  3, -8,-18,  7, 20,-12,-10, -2,-20, -6, -4;
/M: SY='Q';  M=-12,  2,-30,  4, 22,-33,-20, 31,-24,  5,-20, -4,  2,-11, 40,  6, -2,-12,-30,-24, -4, 30;
/M: SY='Q';  M=-11,  2,-30,  4, 26,-37,-20, 15,-23,  8,-20, -4,  1, -9, 49,  7, -1,-11,-30,-23, -9, 37;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Q';  M=  1, -7,-26,-11,  6,-29,-20, -3, -6, -1,-11,  2, -5,-12, 33, -3, -2, -8,-14,-20,-10, 18;
/M: SY='Q';  M=-12,  5,-28,  2, 13,-33,-16,  8,-22, 12,-22, -5, 11,-14, 40, 19,  0, -8,-28,-24,-12, 26;
/M: SY='L';  M=-12,-26,-22,-30,-22, 13,-30,-20, 15,-17, 17,  9,-21,-26,-20, -6,-19, -8, 14,-16,  2,-22;
/M: SY='A';  M= 39,-12, 14,-22,-14,-20, -5,-22,-14,-14,-12,-12,-12,-15,-14,-22,  6, -2, -2,-25,-22,-14;
/M: SY='N';  M= -3, 11,-22,  8, 13,-26,  0, -1,-24, -1,-26,-16, 18,-12, 12, -3, 14,  0,-24,-33,-19, 12;
/M: SY='K';  M=-10, -7, -5, -7,  1,-28,-22,-15,-28, 25,-28,-14, -7,  3, -1, 10,-10,-10,-20,-27,-17, -1;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-15,  5,-22;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='C';  M= -8,-22, 96,-30,-30,-16,-30,-30,-19,-28,-15,-15,-22,-38,-30,-28,-10, -8,  1,-46,-26,-30;
/M: SY='P';  M=  6,-15,-21,-15, -7,-20,-17,-16, -4, -9,-13, -6,-14,  9, -2,-14,  0, -2,  0,-27,-18, -6;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-21,-38,-29, 75,-30,-16,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 35,-29;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-19,-34,-26, 18,-32,-24, 24,-28, 27, 14,-26,-28,-26,-22,-21, -8, 22,-17,  3,-26;
/M: SY='D';  M=-16, 39,-30, 55, 13,-38,  5, -4,-40, -4,-30,-28, 16,-12, -4,-12,  0,-12,-30,-36,-22,  5;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='P';  M= -1,-18,-19,-16,-10, -9,-17,-17,  2,-13,  1, -2,-18, 16,-13,-15,-10, -5,  2,-20,-13,-13; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 18, -4,-11,-10, -2,-17, -7,-10, -9, -4, -9, -6, -4, -8,  5, -8,  7,  7, -5,-17,-11,  2; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='S';  M=  2, -7,-14, -7, -7,-15,-11,  5, -9,-12,-18, -9,  0,-17, -6,-11, 18,  8,  1,-36,-10, -7;
/M: SY='P';  M=  5, -9,-24, -8, -3,-23,-12,  4,-19,-10,-22,-13, -5, 23, -5,-14,  6,  0,-18,-30,-15, -6;
/M: SY='G';  M=  7, -5,-25, -5,  1,-26, 20,  5,-29,-10,-21,-14, -1,-14, -5,-13,  1,-13,-23,-24,-17, -3;
/M:         M= -8,-18,-29,-18,-16,-16, -3, -1, -4,-19, -7, -2,-11, -2,-14,-18,-11,-13, -6,-25,-10,-18;
/M: SY='G';  M= -7, -2,-28, -2,  4,-28, 15, 10,-30, -7,-23,-12,  2,-14,  7, -7,  0,-10,-27,-24,-14,  4;
/M: SY='Y';  M=  0, -9,-24,-11, -4, -8,-17,  2,-13,  3,-14, -6, -7,-17,  7, -2, -1, -4,-13, -5, 18,  0;
/M: SY='R';  M= -9, -8,-28, -8, -3,-26,  2, -8,-27,  4,-22,-12, -2, -6,  7, 16, -2, -4,-23,-22,-17,  0;
/M: SY='R';  M=-14,-10,-25,-12, -2, -6,-19, -3,-21, 10,-16, -8, -2,-19,  9, 32, -3, -6,-17,-17, -4,  2;
/M: SY='K';  M= -9,  9,-25,  4,  6,-26,-12,  0,-24, 19,-27,-12, 16,-14, 15, 19,  4, -3,-23,-28,-14, 10;
/M: SY='I';  M= -6,-19,-23,-25,-16, -3,-27,-18, 18,-18,  2,  6,-12,-18, -5,-17, -5, -4, 11,-22, -3,-12;
/M: SY='N';  M=-12, 23,-26, 20, 12,-32,-11,  5,-25, 10,-27,-14, 25,-14, 21,  6,  2, -6,-29,-31,-15, 16;
/M: SY='E';  M=-11,  8,-30, 14, 34,-29,-22, -3,-18,  3,-15,-12,  0, -6, 19, -4, -3,-10,-21,-28,-15, 25;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='R';  M=-14, -6,-25, -8, -1,-19,-20, -6,-25, 23,-19,-10,  0,-16,  5, 44, -3,  5,-15,-22,-10, -1;
/M: SY='Q';  M= -1, -1,-26, -2,  0,-25,-20, -9, -2, -7, -9, -1, -4,-13, 13,-11, -4, -8, -7,-24,-11,  5;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-22,-35,-27, 18,-34,-25, 28,-29, 27, 15,-25,-26,-25,-24,-22, -9, 21,-16,  4,-27;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='S';  M=  0,  1,-13, -4, -4,-13, -8, -7,-10, -1,-14, -2,  6,-11, -1, -3, 13, 13, -7,-26,-11, -2; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='Q';  M= -8,-10, -3,-11, -7,-14, -4, -4,-15, -9,-10, -5, -8,-19,  5, -8, -7,-10,-16,-13,  0, -2; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='L';  M= -2,-22,  5,-27,-22, -7,-12,-21,  2,-24, 11,  7,-20,-27,-20,-22,-15,-10,  4,-26,-13,-21;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-18,-32,-24, 19,-29,-19, 18,-25, 31, 20,-27,-29,-23,-19,-23, -8, 15,-16,  4,-22;
/M: SY='R';  M= -8,-16, -4,-18,-14,-15, -8,-18,-14, -2, -6, -5,-13,-24,-12,  3,-12,-10, -5,-26,-15,-14;
/M: SY='G';  M=  8, -5,-21, -7, -6,-28, 24,-12,-26,-10,-25,-15,  1,-14,  2,-12, 13, -4,-20,-26,-22, -2;
/M: SY='D';  M= -9,  1,-21,  2,  1,-12,-20,-11, -2,-11,  2, -4, -1,-20, -9,-11, -8, -6,  0,-31,-13, -4;
/M: SY='H';  M= -7,-13,-21,-13, -9, -9,-20,  4, -6,-17,  3, -1,-10, -5, -8,-13, -4,  3, -8,-28, -6,-10;
/M: SY='E';  M=-12,  6,-25, 14, 23,-12,-21, -8,-17, -3,-13,-14, -4,-12, -2, -9, -5, -8,-11,-27,-11, 11;
/M: SY='S';  M= -2, -6,  8,-13,-13,-13,-16,-15, -5,-18,-11, -9,  2,-21,-11,-17,  9,  3, -4,-36,-16,-13;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='R';  M=-15,-13,-26,-15, -6, -5,-23,-10,-17, 19,-14, -6, -7,-20, -3, 34,-11, -9, -7,-17, -4, -6;
/M: SY='R';  M=-19,  2,-30,  7, 12,-24,-19, 10,-31, 19,-21,-13,  4,-16, 10, 41, -7,-11,-24,-25,-10,  7;
/M: SY='N';  M=-10, 27,-21, 20,  3,-23, -5, 21,-25, -4,-28,-18, 36,-17,  2, -3, 10, -1,-26,-38,-13,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-17,-26,-16,  4, -6,-29,-16, 11,-17, 20,  7,-18,-18, -7,-16,-18,-10,  2,-23, -7, -3;
/M: SY='G';  M=  3, -3,-21, -5,-13,-17,  9,-15,-12,-15, -9, -9,  0,-21,-15,-16, -3, -8, -6,-27,-18,-14;
/M: SY='M';  M= -5,-22,-21,-25,-21, -5, -9,-18, 11,-22, 14, 15,-17,-23,-15,-19,-12, -8,  8,-23, -8,-19;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY PS51853

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.


Total number of hits 8 in 8 different sequences
Number of true positive hits 8 in 8 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] pG1 pseudoGTPase
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
8 sequences

RG190_DROME (Q9VX32), RHG05_HUMAN (Q13017), RHG05_MOUSE (P97393), 
RHG35_CANLF (P83509), RHG35_HUMAN (Q9NRY4), RHG35_MOUSE (Q91YM2), 
RHG35_RAT   (P81128), RHG35_XENLA (Q6NU25)
» more

PDB
[Detailed view]
2 PDB

5U4U; 5U4V