PROSITE entry PS51853
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PG2 |
| Accession [info] | PS51853 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
28-FEB-2018 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51852 |
| Associated ProRule [info] | PRU01200 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | pG2 pseudoGTPase domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=168; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=163; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4076810; R2=0.0152023; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9428.3173828; R2=32.3122253; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=500; H_SCORE=25584; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=270; H_SCORE=18153; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M= -4, -5,-24, -5, 8,-22,-14, -4,-26, 15,-20,-13, 0,-14, 7, 34, 2, -4,-17,-25,-15, 5; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 41,-30, 29, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20, 0,-27; /M: SY='I'; M= -7,-21,-22,-23,-14, -8,-28,-18, 14, -9, 12, 10,-20,-23, -7, -9,-16, -7, 14,-23, -6,-11; /M: SY='C'; M= -7,-20, 21,-28,-24, -7,-27,-20, 7,-20, 2, 13,-18,-25,-17,-20, -9, 1, 11,-32,-12,-21; /M: SY='C'; M= 6,-14, 43,-20,-18,-17,-17,-23,-15,-20,-17,-14,-11,-25,-18,-21, 8, 2, 0,-40,-23,-18; /M: SY='L'; M= 6,-25,-20,-30,-20, -1,-25,-23, 21,-25, 26, 12,-22,-22,-17,-23,-17, -7, 13,-20, -5,-20; /M: SY='M'; M= -8,-21,-17,-28,-21, 11,-24,-13, 14,-17, 18, 28,-20,-23,-14,-14,-14, 0, 13,-19, 1,-17; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M=-10, -6,-34, -3, 5,-31,-17, -7,-20, -3,-27,-15, -3, 47, 10, -9, -4, -9,-30,-29,-23, 5; /M: SY='Y'; M=-17,-15,-24,-15,-17, 28,-27, -5, 0,-20, 13, 1,-17,-27,-20,-16,-20,-10, -4, 0, 29,-18; /M: SY='S'; M= 0, -1,-20, 2, -2,-21,-10,-13,-12,-12,-23,-16, 2, 3, -4,-14, 18, 7,-10,-36,-19, -5; /M: SY='I'; M= -1,-23,-26,-27,-18,-10,-27,-23, 16,-14, 1, 4,-17, -4,-14,-11,-11, -7, 12,-23,-10,-20; /M: SY='D'; M=-16, 28, -8, 41, 25,-34,-16, -4,-36, -1,-26,-26, 8,-11, 2,-10, -1,-10,-27,-39,-21, 13; /M: SY='N'; M= -7, 5, 3, 3, -4,-19,-13, -9,-21, -7,-17,-15, 7,-20, -6, -1, 6, 0,-15,-36,-18, -6; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-26, 4,-35,-26, 36,-30, 33, 20,-25,-25,-20,-25,-24,-10, 22,-20, 0,-26; /M: SY='L'; M= 11,-20,-14,-23,-16, -4,-17,-20, 7,-20, 16, 4,-18,-21,-16,-19, -6, -1, 10,-24,-10,-16; /M: SY='G'; M= -5, -7,-25, -7, -3,-21, 10, -7,-26, -3,-23,-11, 1,-16, 10, 4, 5, -7,-22,-22,-15, 3; /M: SY='P'; M= 1,-18,-25,-16, -7,-15,-17,-18, -7,-16, -4, -7,-17, 25,-11,-18, -5, -4,-11,-27,-18,-11; /M: SY='L'; M= -8,-28,-17,-31,-24, 14,-28,-20, 21,-24, 28, 21,-27,-28,-22,-18,-21, -7, 21,-19, 1,-23; /M: SY='F'; M= 6,-24,-16,-30,-21, 21,-21,-21, 7,-23, 15, 4,-21,-24,-24,-20,-13, -6, 9,-12, 2,-21; /M: SY='E'; M= 8, 4,-21, 5, 11,-27,-10, 8,-22, -3,-20,-12, 2,-10, 10, -7, 8, -4,-18,-28,-13, 10; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= -5, 0,-20, 0, 12,-14,-15, -7,-11, -9, -3, -8, 2,-14, 0, -9, 3, 0,-13,-31,-14, 6; /M: SY='S'; M= -3, -8,-20, -8, -3,-20,-16, 0,-12, -9,-18, -8, -4, 0, 3, -9, 10, 7, -7,-31,-12, -2; /M: SY='T'; M= 6,-15,-13,-19,-15, -5,-19,-20, 4,-17, 8, 1,-14,-19,-15,-16, 2, 14, 9,-27,-10,-15; /M: SY='C'; M=-12,-18, 12,-22,-18,-15,-13,-18,-14,-10, -7, -6,-12,-27,-13, 4,-13,-11, -8,-28,-16,-18; /M: SY='R'; M= -1,-10,-22,-12, -4,-19,-16,-10,-18, 15,-17, -9, -4,-17, 0, 28, -1, -3, -6,-24,-13, -4; /M: SY='S'; M= 8, -9,-17, -9, -5,-19,-10,-16,-12, -4,-21,-13, -4, 0, -6, -9, 15, 6, -3,-32,-18, -6; /M: SY='A'; M= 23, -9,-13,-14, -9,-17, -6,-17, -5,-13,-14,-10, -3,-12, -7,-17, 18, 7, 0,-29,-17, -9; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='H'; M= -1, 10,-20, 3, 4,-23, -8, 18,-17, 0,-19, -7, 18,-13, 16, 0, 3, -6,-22,-25, -9, 9; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='C'; M= -3,-18, 21,-20,-16, -8,-21,-15,-11,-18, -5, -8,-18, -7,-16,-19,-11, -7, -8,-21, -5,-18; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='N'; M= 2, 8,-20, 0, -7,-20, 16, 9,-23, -8,-22,-13, 18,-16, -5, -8, 3, -8,-22,-25,-14, -7; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='Y'; M=-10,-13,-15,-15,-10, 14,-16, -3, -1, -6, 7, 2,-11,-16, -9, 3,-12, -6, -3, 0, 15,-10; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M= -5, 6,-24, 1, -4,-26, 16, -4,-28, -2,-27,-16, 18,-17, 3, 4, 7, -6,-25,-28,-20, -1; /M: SY='N'; M= -7, 14,-23, 15, 8,-26, 3, 11,-29, -6,-27,-18, 18,-14, 1, -7, 10, -4,-25,-34,-16, 4; /M: SY='N'; M=-11, 14,-27, 11, -3,-26, 14, 10,-32, -3,-27,-17, 21,-19, -3, 3, 0,-12,-29,-30,-16, -5; /M: SY='S'; M= 12, -6,-13, -9, -6,-17, -6,-15, -7,-13,-19,-12, 2,-12, -5,-15, 26, 12, -2,-34,-17, -6; /M: SY='L'; M= -7,-26,-20,-30,-23, 3,-32,-24, 26,-26, 27, 14,-23,-24,-20,-22,-17, 0, 21,-23, -3,-23; /M: SY='I'; M=-11,-27,-26,-31,-21, 9,-30,-20, 19,-24, 19, 16,-23, -7,-19,-22,-21,-10, 8,-18, -1,-21; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-33,-26, 16,-31,-24, 24,-27, 29, 14,-27,-29,-26,-21,-22, -7, 23,-18, 2,-26; /M: SY='D'; M=-13, 25,-27, 36, 33,-31,-16, -3,-31, 3,-23,-23, 8, -6, 7, -6, 3, -1,-26,-34,-19, 20; /M: SY='V'; M= -4,-21,-15,-23,-19, -2,-27,-23, 13,-13, 14, 7,-21,-24,-19,-12,-11, 4, 21,-26, -7,-19; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='C'; M= -1,-19, 3,-24,-17, 1,-21,-20, -1,-20, 1, -3,-17, -5,-18,-20,-11, -7, -1,-19, -8,-18; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='I'; M= -7, 1,-21, -4, -9,-12,-18,-12, 9,-14, -5, -2, 5,-14, -8,-15, 0, -2, 2,-26, -9,-11; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='G'; M= -1, -3,-19, -4, -3,-19, 20,-14,-23,-10,-18,-14, 0,-11, -8,-11, 6, 6,-16,-21,-18, -6; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='B'; M= 2, 7,-16, 7, 5,-17, -8, -7,-13, -6,-11,-11, 7,-12, -2, -9, 5, 0,-11,-27,-14, 1; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='S'; M= 4, -4, 4, -9, -6,-20,-13, 1,-22, -6,-22,-13, 0,-16, -4, -8, 12, 7,-12,-34,-13, -6; /M: SY='K'; M= -5, -4,-25, -3, 6,-27,-14, -7,-24, 15,-27,-13, 0, 3, 11, 12, 7, -1,-20,-28,-16, 7; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='R'; M=-14, 4,-27, -3, -3,-18,-18, 11,-14, 9,-18, -6, 15,-18, 2, 18, -6, -9,-16,-27, -7, -3; /M: SY='R'; M=-17, -5, -7, -9, -4,-20,-19, -3,-29, 17,-21,-13, 5,-23, 3, 46, -7, -9,-20,-27,-14, -4; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-27, 1,-33,-24, 35,-24, 22, 23,-24,-24,-20,-23,-19, -7, 30,-23, -3,-26; /M: SY='E'; M=-12, 3,-27, 11, 25,-21,-21, -5,-16, -3, -1, -7, -6,-12, 10, -6, -9,-10,-18,-27,-13, 17; /M: SY='L'; M=-11,-30,-24,-35,-25, 15,-34,-24, 30,-30, 32, 17,-25,-26,-23,-24,-25,-10, 17,-16, 4,-25; /M: SY='N'; M= -7, -4,-23,-11, -8,-15,-20,-13, -2, 1,-12, -5, 4,-16, -4, 4, 1, 3, -3,-27,-10, -8; /M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-32,-24, 4,-30,-21, 27,-25, 31, 23,-27,-27,-20,-20,-22, -7, 24,-23, -3,-23; /M: SY='A'; M= 12,-15, 2,-20,-16,-13, -1,-20,-11,-20, -1, -6,-13,-21,-16,-20, -1, -5, -5,-27,-18,-16; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 45,-30, 8, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='S'; M= 3, -3,-16, -4, -4,-20, 3,-11,-23, -6,-26,-17, 6,-13, -3, 0, 24, 15,-13,-33,-18, -4; /M: SY='W'; M= 11,-15,-22,-19,-13,-10, -9,-20,-16,-13,-18,-16,-12,-16,-10,-16, 5, 3,-12, 24, -4,-10; /M: SY='W'; M=-13,-29,-29,-33,-24, 25,-24,-23, 1,-24, 4, -3,-24,-26,-23,-20,-20,-12, -5, 36, 15,-21; /M: SY='Q'; M= -7, -3,-24, -4, 2,-25, -6, 9,-24, 0,-21, -9, 3,-14, 16, 7, 6, 2,-21,-26,-10, 7; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='L'; M= 0,-21,-21,-24,-17, 0,-25,-16, 11,-12, 13, 7,-20,-22,-14,-13,-15, -7, 9,-15, 5,-17; /M: SY='R'; M=-17, -5, -6, -9, -4,-20,-19, -3,-29, 17,-21,-13, 5,-23, 3, 45, -7, -9,-20,-27,-14, -4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='D'; M= -8, 14,-23, 20, 11,-29,-11, -3,-26, 13,-25,-15, 7, -9, 11, 5, 4, -4,-20,-26,-13, 11; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= -2, 10,-19, 15, 3,-25, -9,-11,-23, -7,-27,-21, 7, 5, -3,-11, 19, 13,-16,-37,-20, -1; /M: SY='E'; M=-10, 7,-25, 6, 18,-25,-14, 16,-26, 5,-23,-13, 11,-12, 17, 10, 5, -5,-25,-30,-11, 16; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='L'; M= -1,-21,-23,-21, -9, -8,-22,-16, 3,-18, 18, 6,-21, -5, -5,-16,-16, -9, -4,-22, -9, -8; /M: SY='V'; M= -7,-11,-18,-18,-15, 2,-24,-16, 8,-14, -2, 1, -6,-21,-10,-13, -4, 4, 9,-23, -4,-12; /M: SY='H'; M=-20, 7,-30, 10, 3,-23,-19, 86,-31, -9,-21, -4, 11,-19, 9, -1, -9,-19,-30,-31, 15, 1; /M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-14,-31, 57,-16,-37,-16,-29,-17, 0,-19, -8,-16, 0,-19,-30,-20,-27,-11; /M: SY='Y'; M= -5,-12,-24,-14,-12, 7,-20, 23, -9,-10, -9, -4, -9,-22, -5,-10, -5, -6,-12, 3, 41,-12; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='I'; M=-10,-29,-20,-31,-26, 18,-31,-19, 22,-24, 21, 12,-26,-29,-24,-20,-20, -7, 21,-12, 12,-26; /M: SY='V'; M= 2,-22,-13,-28,-24, 18,-24,-24, 9,-20, 4, 1,-19,-24,-27,-18, -5, 5, 20,-17, 0,-24; /M: SY='Y'; M=-18,-15,-30,-14, -7, 20,-28, 17, -5, -7, -3, -3,-17,-25, -5, -8,-17,-10,-13, 20, 64,-10; /M: SY='S'; M= 9, 8,-16, 1, -5,-22, 11, -7,-22, -9,-27,-19, 20,-14, -5,-10, 21, 5,-17,-34,-22, -5; /M: SY='S'; M= 15, 4,-12, -5, -6,-17, -6,-12,-14, -8,-19,-14, 10,-12, -6,-11, 21, 20, -8,-32,-17, -6; /M: SY='K'; M=-11, 5,-30, 8, 15,-28,-21, -7,-18, 19,-20, -9, 0,-10, 13, 8, -7,-10,-17,-25,-12, 13; /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13, -3,-15,-22, -3,-22, 20, -9, -5, -5,-22, 5, 55,-13,-10,-15,-20, -8, -3; /M: SY='R'; M= 14, -7,-21,-12, -2,-23,-11,-12,-21, 18,-18,-10, -4,-13, 1, 19, -1, -6,-11,-20,-14, -2; /M: SY='A'; M= 31, -6,-10,-13, -7,-18, -3,-17,-13,-10,-15,-13, -3,-10, -7,-16, 20, 14, -3,-27,-18, -7; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M=-11,-27,-22,-32,-24, 18,-30,-15, 21,-23, 23, 18,-24,-27,-20,-19,-21, -9, 15,-10, 14,-23; /M: SY='A'; M= 20, -6,-17,-13,-14,-20, 15,-17,-14,-13,-16,-11, 0,-17,-14,-17, 4, -6, -5,-24,-21,-14; /M: SY='C'; M= -2,-10, 21,-20,-19, -8,-18, -8, -8,-15, -6, 6, -8,-26,-12,-16, -8, -7, -6,-25, -4,-16; /M: SY='A'; M= 18,-17,-14,-22,-14, -6,-15,-20, 2,-18, 14, 2,-17,-18,-14,-18, -5, 4, 4,-22,-10,-14; /M: SY='R'; M=-13, -9,-26,-11, -2, -7,-19, -8,-24, 21,-19,-10, -2,-17, 1, 33, -5, -6,-15,-18, -5, -2; /M: SY='A'; M= 8,-14, -1,-23,-14,-16,-22,-20, 4,-16, -4, -1,-11,-17, -6,-18, -2, 2, 3,-26,-13,-11; /M: SY='F'; M= -4,-22,-17,-30,-21, 32,-24,-20, 3,-24, 15, 3,-18,-24,-25,-18,-12, 1, 3, -9, 8,-21; /M: SY='L'; M= 8,-24,-17,-29,-20, -1,-23,-23, 17,-23, 23, 10,-23,-23,-19,-21,-14, -6, 16,-21, -7,-20; /M: SY='S'; M= 7, -4, 4, -7, -2,-21, 0,-16,-23,-12,-22,-17, -2,-15, -8,-14, 14, 7,-13,-33,-22, -5; /M: SY='E'; M= -1, 4,-27, 4, 19,-28,-14, -5,-23, 8,-23,-15, 4, 7, 12, -1, 0, -7,-24,-27,-19, 15; /M: SY='V'; M= -7, -8,-19, -9,-17, -8,-24,-18, 14,-17, 5, 2, -8,-24,-18,-17,-10, -4, 18,-30,-10,-18; /M: SY='A'; M= 27, -6,-15,-11, 0,-25, -5,-10,-14, -5,-16, -9, -4,-10, 11,-10, 12, 1,-10,-23,-17, 5; /M: SY='D'; M= -2, 19,-23, 21, 12,-27, -8, 12,-27, -3,-24,-18, 15,-11, 3, -7, 7, -4,-22,-34,-14, 7; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='T'; M= -3,-10,-17,-17,-16, -9,-10,-20, 4,-16, -3, -1, -6,-13,-13,-16, 3, 15, 4,-21, -9,-16; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='P'; M= -9, 5,-22, 2, 0,-17, -9, -3,-16, 2,-20,-13, 12, 16, -1, 5, -1, -4,-20,-23,-16, -3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='I'; M= -9,-19,-24,-26,-16, -7,-30,-16, 21,-18, 13, 18,-15,-18, -3,-16,-12, -1, 10,-21, -3,-11; /M: SY='P'; M= -7,-15,-31,-10, 0,-24,-18,-14,-15,-10,-18,-12,-14, 44, 0,-14, -3, -5,-21,-29,-22, -3; /M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-31,-27, 6,-33,-21, 30,-23, 17, 13,-26,-27,-23,-21,-17, -6, 30,-17, 7,-27; /M: SY='Q'; M= -9,-11,-24,-12, 4,-14,-25,-10, 1,-10, 7, 4,-11,-15, 10, -8, -8, -1, -6,-23, -7, 6; /M: SY='L'; M= 5,-25,-17,-29,-19, 13,-22,-20, 9,-25, 27, 9,-23,-25,-21,-20,-18, -7, 6,-15, -1,-19; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 16, -3,-18, -4, -6,-21,-11,-18,-11,-10,-13,-12, -8, 2,-11,-17, 4, 4, -2,-27,-19,-10; /M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-12, 1,-14,-23,-10, -8, 12, -3, 6,-11,-17, 0, 13,-13, -9, -4,-23, -8, 0; /M: SY='T'; M= 0, -6,-17, -9, -6,-17, -4,-13,-14,-12,-10, -8, -2,-15, 0,-10, 12, 13,-10,-28,-14, -3; /M: SY='D'; M=-10, 8,-31, 15, 6,-36, 7, -5,-31, -4,-27,-17, 3, 2, 12, -8, -1,-13,-30,-27,-21, 8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29, -9,-15,-29, 48,-19,-35,-17,-30,-20, -2, -2,-16,-19, 3,-14,-28,-24,-29,-16; /M: SY='A'; M= 12, -4,-16,-12, -8,-17,-10, -9, -4, -7, -9, 2, 0,-16, 0,-10, 5, 0, -1,-27,-14, -4; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='V'; M= -1, -1,-19, -2, -8,-15,-15,-13, -1,-10, -9, -7, -2, 0,-11,-14, -3, -4, 1,-26,-14,-11; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='D'; M= -2, 16,-22, 25, 7,-27, -7, -7,-24, -4,-23,-20, 5, 8, -3,-11, 5, -3,-19,-30,-19, 1; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='F'; M=-11,-24,-16,-30,-23, 34,-24,-16, 11,-21, 16, 13,-20,-24,-24,-16,-17, -7, 11, -7, 10,-21; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='F'; M=-13,-17,-16,-21,-16, 32,-20, 3, -1,-19, 9, 3,-11,-20,-18,-11,-14, -9, -3, -3, 15,-16; D=-9; /I: I=-9; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18; /M: SY='D'; M= -9, 10,-19, 11, 9,-16,-12, -3,-14, 5, -9, -8, 7,-10, 1, 0, -5, -6,-14,-21,-10, 5; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='N'; M= -6, 15,-18, 14, 3,-19, -5, -2,-17, -3,-21,-16, 17, 6, -2, -6, 6, 0,-19,-27,-16, 0; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='D'; M=-13, 29,-24, 36, 17,-28, -9, 0,-28, 8,-24,-20, 18, -9, 4, 0, 0, -7,-24,-30,-16, 11; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='L'; M= 1,-17,-17,-19,-14, 2,-18,-11, 8,-17, 11, 4,-14,-19,-11,-15, -7, -2, 4,-13, 6,-14; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='A'; M= 3, -7, 3,-14,-12,-10,-14,-14, -2,-15, -2, -4, -2,-18,-11,-15, 0, -1, -2,-27,-13,-12; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='K'; M=-10, -8,-26, -7, 8,-20,-23, -8,-13, 14, -9, -3, -8,-16, 8, 14,-10, -9, -9,-23,-10, 7; /M: SY='E'; M=-14, 7,-29, 14, 32,-15,-20, -3,-27, 6,-17,-17, 0, -9, 7, 7, -4,-10,-24,-25,-12, 20; /M: SY='I'; M= -4, -7,-20,-11, -7,-12,-17,-10, 2,-14, 0, 0, 0,-18, 1,-11, 2, 0, -4,-29,-10, -4; /M: SY='M'; M= 2,-17,-20,-21,-12, -8,-20,-16, 6, -9, 9, 10,-14,-18, -8,-11, -8, -4, 3,-23, -8,-11; /M: SY='T'; M= -4,-10,-16,-17,-14, -9,-24,-19, 1, -8, -5, -3, -7,-16,-11, -1, 6, 23, 8,-27, -9,-14; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='E'; M= 0, 12,-24, 19, 34,-29,-12, -4,-27, 2,-22,-20, 3, -5, 9, -6, 7, -4,-23,-32,-20, 22; /M: SY='G'; M= -1,-12,-27,-14,-20,-23, 41,-21,-22,-20,-20,-13, -3,-19,-19,-20, 0, -8,-17,-21,-23,-20; /M: SY='E'; M= 5, 3,-23, 2, 19,-16,-13, -1,-18, 0,-15,-14, 2,-10, 4, -7, 1, -6,-18,-19, -4, 11; /M: SY='E'; M= 7, -1,-26, 1, 23,-26,-14, 3,-23, -1,-19,-15, -5, 8, 6, -9, 0, -8,-21,-27,-17, 13; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='I'; M= -7,-27,-21,-30,-24, 3,-27,-24, 22,-21, 12, 8,-24,-23,-20,-20,-18, -8, 20, 5, 1,-23; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 13,-12, 0,-16, -2,-17,-15,-15,-14, -7, -5, -8,-12,-17, -7, -5, -4, -6, -7,-26,-17, -5; /M: SY='Q'; M=-10, 7,-28, 8, 13,-33,-19, -1,-24, 18,-23, -8, 3,-10, 29, 11, -1, -3,-23,-24,-11, 21; /M: SY='E'; M= -3, -4,-23, -1, 20,-19,-18, -8,-16, 0, -8,-10, -6,-11, 4, 2, 0, -4,-12,-28,-15, 12; /M: SY='F'; M=-14,-30,-26,-40,-30, 36,-36,-26, 28,-30, 16, 11,-20,-24,-29,-26,-20,-10, 17, -7, 13,-30; /M: SY='S'; M= -3, 6,-22, 8, 2,-26, 0,-11,-28, 8,-28,-17, 6,-11, -1, 0, 11, 5,-18,-30,-17, 1; /M: SY='A'; M= 29, -8,-16,-14,-11,-23, 20,-18,-20,-13,-19,-14, -4,-13,-11,-18, 12, -2,-10,-23,-23,-11; /M: SY='R'; M= -6, -6,-24, -7, -6,-23, 11,-12,-29, 6,-24,-14, 1,-16, -4, 15, 4, 0,-19,-24,-18, -6; /M: SY='F'; M= -6,-22,-20,-30,-19, 34,-25,-17, 1,-20, 3, 1,-16,-23,-17,-16,-12, -8, 1, -4, 11,-16; /M: SY='R'; M= -6, -4,-20, -8, -1,-19,-17, -7,-15, 8,-15, 0, -1,-13, 10, 11, 5, 10,-11,-25,-10, 4; /M: SY='T'; M= 13, -3,-13, -9, -5,-17,-12,-17,-15, 0,-16,-12, -1,-10, -5, -6, 16, 23, -5,-27,-14, -5; /M: SY='V'; M= -7,-30,-18,-34,-29, 12,-33,-27, 31,-25, 18, 13,-26,-27,-27,-23,-17, -5, 33,-21, -1,-29; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='D'; M=-10, 13,-19, 19, 4,-14,-10, 16,-19, -4,-16,-12, 7,-11, 0, -6, 2, -4,-16,-19, 4, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= -5,-16,-25,-15,-10, -6, -3,-17,-15,-17,-13,-11,-11, 12,-15,-17, 0, -4,-15,-24,-15,-13; /M: SY='A'; M= 4, 3, 1, -1, -7,-19,-12,-11,-18, -7,-12,-12, 3,-20, -8, -4, -2, -6,-12,-31,-18, -8; /M: SY='S'; M= 0, 2,-17, 4, 1,-19, -9,-10,-18, -4,-17,-13, 3,-13, -2, -6, 16, 7,-11,-34,-15, -1; /M: SY='Q'; M= -4,-10,-26,-12, 0,-16,-20, 1,-11, 1, -5, 0, -9,-18, 20, 6, -7, -9,-15,-12, 5, 9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='L'; M=-10,-19,-25,-19,-12, -2,-25,-13, 7,-10, 9, 5,-18, -3,-10,-11,-17, -9, -1,-13, 4,-13; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='T'; M= -1, -7,-20,-13, -7,-10,-18, 7, -8, -7, -7, 4, -6,-15, 4, -7, 1, 8, -8,-18, 6, -3; /M: SY='H'; M=-10, -5,-21, -8, -6,-16,-21, 20,-16, 2,-14, -4, -1,-17, -1, 7, -1, 6, -8,-27, -1, -6; /M: SY='K'; M= -4, 6,-23, 3, 7,-27,-11, -5,-24, 21,-29,-13, 12,-11, 12, 12, 8, 0,-20,-29,-14, 9; /M: SY='N'; M= -7, 1,-19, -8,-13, -1, -4,-11,-11,-14, -7, -8, 10,-20,-14,-11, 1, 8,-11,-25, -9,-13; /M: SY='S'; M= 8, 0,-18, 1, 12,-24, 4,-10,-24, -6,-25,-19, 3, -9, 1,-10, 20, 4,-17,-32,-21, 7; /M: SY='F'; M= -9,-26, -1,-31,-25, 7,-26,-25, 5,-24, 0, -2,-21,-27,-23,-22,-12, -7, 6, 0, -1,-23; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M= -3,-20,-18,-27,-20, 32,-19,-10, -2,-18, 1, 4,-14,-22,-20,-16, -6, -4, -1, -4, 17,-18; /M: SY='A'; M= 9, -2,-19,-10,-10,-18, 3, 5,-15,-10,-13, -2, 4,-16, -6,-12, 2, -2,-12,-25,-12, -9; /M: SY='P'; M= -5, -6,-25, -2, 13,-20,-18,-13,-16, -7,-14,-14, -8, 19, -1,-11, 3, 4,-17,-30,-19, 5; /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-35,-27, 61,-30,-14, 3,-27, 15, 3,-22,-30,-32,-19,-22,-10, 0, 8, 32,-27; /M: SY='F'; M= -5,-26,-20,-30,-21, 28,-26,-14, 7,-24, 23, 7,-23,-27,-23,-19,-20, -9, 3, -5, 17,-21; /M: SY='N'; M= -6, 6,-23, 3, 6,-26,-11, 11,-24, 11,-27,-11, 13,-13, 13, 7, 9, -1,-21,-30,-10, 9; /M: SY='D'; M=-13, 21,-29, 32, 26,-31,-16, -6,-30, 0,-24,-23, 5, 8, 3, -8, 1, -2,-26,-34,-20, 14; /M: SY='C'; M= 4,-20, 26,-25,-22,-12,-23,-25, 2,-21, -7, -5,-17,-26,-21,-23, -1, -1, 13,-35,-17,-22; /M: M= -7,-24, -5,-24,-18, -6,-22,-23, -3,-21, 0, -5,-22,-11,-18,-20,-11, -6, -1, -8, -9,-18; /M: SY='D'; M= -6, 30,-25, 37, 22,-31, -9, -1,-30, 1,-25,-23, 17, -9, 3, -8, 3, -7,-26,-35,-20, 12; /M: SY='N'; M= 2, 10,-22, 9, 1,-27, 3, -9,-27, 8,-27,-17, 11,-13, -2, -1, 7, -4,-20,-29,-19, 0; /M: SY='K'; M= -3, -3,-27, -5, 7,-28,-17, -7,-26, 33,-24, -9, -1,-12, 14, 26, -6, -9,-18,-20,-11, 10; /M: SY='B'; M=-11, 15,-25, 15, 15,-17,-16, 1,-16, -1,-17,-15, 13,-15, 1, -6, -1, -6,-16,-26, -5, 7; /M: SY='Q'; M= -8, -3,-24, -1, 4,-17,-20, -8, -3, -9, -2, 3, -5,-14, 5,-10, -3, -5, -7,-27,-10, 4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS51852 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of true positive hits | 8 in 8 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | pG2 pseudoGTPase |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
8 sequences
RG190_DROME (Q9VX32), RHG05_HUMAN (Q13017), RHG05_MOUSE (P97393), RHG35_CANLF (P83509), RHG35_HUMAN (Q9NRY4), RHG35_MOUSE (Q91YM2), RHG35_RAT (P81128), RHG35_XENLA (Q6NU25)» more
|