PROSITE entry PS51861

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	OXYTX_ICK
Accession [info]	PS51861
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	20-JUN-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 13-SEP-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51861
Associated ProRule [info]	PRU01208

Name and characterization of the entry

Description [info]

Oxytoxin-type inhibitor cystine knot (ICK) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=54;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=49;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1349561; R2=0.0033110; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7789.5083008; R2=4.2398958; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1923; H_SCORE=15943; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1319; H_SCORE=13382; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N';  M=  9, 34,-21, 33, -2,-25, -3,-15,-12,  0,-15, -7, 41,-19, -6,-15,  2,  4,-13,-56,-31, -5;
/M: SY='W';  M=-26, -7,-15,-16,-10,  1,  5,-31,-16,-11,-20,-16,  1,-30,-10, -9,-16,-22,-25, 72,  7,-10;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-18,  3, 32,-19,-13,-14,-23, 34,-17, 11, -3, 10,  6,  4,  0,-13,-23,-17,-13, 22;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='W';  M=-29,-29, -9,-24,-10, 15, -6,-29, -4,-20, 12, -4,-44,-30,-15,-11,-25,-24, -9, 84, 39,-10;
/M: SY='P';  M= 14,-11,-30, -5,  5,-31, -5, -4,-16,  5,-21,-16,-16, 53,  5,-10, -1,  5,-16,-39,-29,  0;
/M: SY='I';  M= -3,-13,-16,-22,-13,  4,-13,-17, 30, -7, 17, 15, -6,-21,-16,-18,-11, -2, 18,-25,  2,-15;
/M: SY='G';  M= -6,  5,-41,  9, -7,-34, 26, 25,-20,-11,-15,-10, -1, -4,-12,-15, -3,-18,-28,-19,-16, -9;
/M: SY='T';  M= 10,  0,-20, -5, -9,-15, -9,-15, -5, -5,-11,-11,  5, -5, -5,-19, 31, 34, -1,-39,-15,-10;
/M: SY='S';  M=  4, -6,-20, -7,-11,-14,-14,-14,-12, -1,-12, -6, -2, -6,  5,  7, 18, 18, -2,-30,-10, -7;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='D';  M=  5, 15,-27, 23, -7,-30,  9,-20,-16, -5,-11,-17,  6, -7, -9,-18, 13, 11,-12,-30,-16, -9;
/M: SY='D';  M=  0, 47,-24, 65,  4,-38, -7,-17,-28,  0,-13,-21, 32,-16,-10,-13,  0, -4,-20,-49,-19, -3;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='D';  M=  3, 28,-27, 56, -2,-31,-16,-23,-15, -6, -4,-21,  1,-19,-16,-10, -3, -4,  2,-37, -4, -9;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='P';  M= -5, -9,-21, -3, 24,-31,-12, -1,-27, 21,-23,-15,-16, 57,  4, -4, -5, -7,-32,-23,-17, 14;
/M: SY='E';  M=  0, 12, -7,  6, 21,-29,  8,-10,-16,  7,-15, -9, 20, -7,  2,-15,  0,-11,-27,-24,-28, 16;
/M: SY='H';  M=-18,-18,-39,-18, -2,-19,-28,107,-11,-20,  1, 20,-12,  1, -4,-12,-12,-16,-21,-43,  7, -2;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110,  0,-10,-10,  0,-40,-30,-20,  0;
/M: SY='Y';  M=  4,-11,-33, -5, -8,  4,-14,-12,  1, -7, 13,  6,-17,-17, -3, -9, -6,  2, 10,-13, 15, -8;
/M: SY='R';  M=  1, -4,-27, -4,  0,-14,  8,-17,-17, 12,-20, -4, -4, -4,  0, 13, 10, -7,-17,-13,-15, -4;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='K';  M=  3,  9,-23,  2,  8,-10, -5,-15,-13, 20,-20,  4, 17, -4, -5, -2, 11,  3,-17,-34,-19,  0;
/M: SY='W';  M=-21,-34,-20,-38,-16,  0, -3,-25,  7,-11,  1,  2,-33,-32,-13, -9,-22,-24, -2, 79, 18,-16;
/M: SY='P';  M= -4,-10,-15,-10, -7,-10,-17, -7, -1, -8,  7, -4,-15, 22, -8,-20, -6, 14, -5,-32,  3, -7;
/M: SY='P';  M=-10, -1,-30, 10, -4, -3,-16,-11,-25,  1,-10,-31,-12, 30,-12,-10, -7, -9,-20,-22, -3,-11;
/M: SY='G';  M= 21,  0,-35, -5, -9,-25, 38,-25, -5, -5,-15, -4,  0,-10, -4,-15,  5, -4, -9,-22,-35, -9;
/M: SY='L';  M= -8,-12, -4,-17,-14, 16,-18,-12, 29,-20, 36, 18,-16,-30,-20,-22,-18,  0, 17,-22, 21,-14;
/M: SY='F';  M= -6,-14,-21,-23,-12, 20,-16,-20, 15,  0, 12, 10, -6,-20,-16,-12, -9, -7,  9,-17,  6,-15;
/M: SY='R';  M=-10,-20,-23,-10, -4,-19,-17, -4,-30, 10,-23,-11,-23, 24, 21, 54,-10,-21,-19, -9, -6,  0;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-20, -2, -4,-12, -4,-12, -8, -2,-16,-16,  2, -8, -8,-14, 36, 26, -6,-34,-18,-10;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='Q';  M= 10,-10,-20,-10, 20,-30,-20,  0,-20,  0,-20,-10,-10,  0, 80, 30,-10,  0,-30,-10,-10, 40;
/M: SY='R';  M=  4,-16,-20,-13,-17, -1,-20,-19,  7, -6, -6, -4,-16,-24, -7, 18,  1,  0, 18,-21,  0,-16;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='N';  M=  5, 12,-13, -2,-13,-13, -9,-13,  0, -5, -6,  0, 29, -9, -3,-20,  9, 27, -1,-45,-17, -8; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M=  0,  0,-11,  5, 39,-24,-15,-11,-25, 31,-15,  6, -5, 10,  9,  1,  0,-15,-25,-15,-15, 29;
/M: SY='D';  M=  5, 26,-25, 47,  5,-31, -5,-15,-26,  0,-15,-25,  5,-10,-10,-10, 19,  4,-15,-35,-15, -5;
/M: SY='D';  M=  0, 35,-33, 59,  1,-44, 18,-23,-31, -3,-13,-27,  7,-10,-13,-13,  0,-13,-23,-25,-16, -6;
/M: SY='K';  M= -4, -4,-34, -4, 16,-14,-14, 15,-20, 27,-18, 20, -2, 10,  0,  6, -2,-12,-22,-27, -8,  8;
/M: SY='I';  M=  5,-20,-20,-31,-30,  5,-19,-25, 51,-20, 15,  5, -9,-35,-25,-21,-10,  5, 45,-30, -1,-30;
/M: SY='N';  M=  0, 40,-10, 10,-10,-10,  0,-10,  0,  0,-20,  0, 80,-30,-10,-20,  0, 10,-20,-70,-40,-10;
/M: SY='T';  M=  5,  0,-25, -5, -1,-15,-15,-20, -9, 14, -9,  9,  5,  5,  0,-11, 11, 22, -4,-36,-10, -1;
/M: SY='C';  M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30,  0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60,  0;
/M: SY='P';  M= -7,  2,-30, 21, 10,-43,-10,  1,-33,  7,-24,-37,-18, 73, -3,-10, -7, -3,-34,-33,-17,  0;
/M: SY='P';  M= -5, -9,-30, -5, 15,-24,-10, -6,-25, 26,-25, -8,-14, 57,  0,  1, -5, -5,-29,-25,-15,  5;
/M: SY='Y';  M= -2,-16,-46, -5,-11,  6,-16, -9, -5, -5, 11, -1,-21,-15, -1, -5, -6, -1, 10,  3, 29,-11;
/M: SY='E';  M=  0,  0,-11,  5, 39,-24,-15,-11,-25, 31,-15,  6, -5, 10,  9,  1,  0,-15,-25,-15,-15, 29;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_04 which contains 570'157 sequence entries.

Total number of hits	7 in 7 different sequences
Number of true positive hits	7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Oxytoxin-type inhibitor cystine knot (ICK)
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

7 sequences

SPN1A_OXYTA (P86716), SPN1B_OXYTA (P86717), SPN2A_OXYTA (P86718),

SPN2B_OXYTA (P86719), TOX1_OXYLI  (P0C8M0), TOX1_OXYTA  (P83288), 
TOX2_OXYLI  (P84756)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

2N86