Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51869
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | APP_E1 |
| Accession [info] | PS51869 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
10-OCT-2018 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00204 |
| Associated ProRule [info] | PRU01217 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Amyloid precursor protein (APP) E1 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=160; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=155; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7426894; R2=0.0085000; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5131.9243164; R2=19.5646687; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=795; H_SCORE=20686; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=560; H_SCORE=16088; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 6, -8,-25, -7, 6,-21, -4,-14,-18, -1,-11,-10, -9, -2, -3, -8, -5, -9,-15,-23,-18, 1; /M: SY='M'; M=-11,-16,-27,-16, -9,-13,-26, -2, -2, 0, -3, 2,-12, -8, -6, 2,-15,-10, -2,-24, -5,-10; /M: SY='A'; M= 9,-14,-19,-19,-15, 4, -1,-18,-15,-17,-15,-13, -8,-18,-16,-17, 6, 0, -9, -2, -5,-14; /M: SY='E'; M= -6, -5,-24, -1, 22,-17,-22,-10, -7, -5, -4, -7, -9,-11, 2, -9, -3, -5, -7,-29,-14, 12; /M: SY='P'; M= -4,-19,-35,-13, -4,-21,-19,-14,-16,-10,-24,-16,-19, 62,-10,-19, -9, -9,-24,-21,-14,-11; /M: SY='Q'; M= -7, -9,-24,-11, 3,-21,-18, 1, -5, -3, -3, 14, -7,-15, 27, -1, -3, -6,-13,-23, -8, 15; /M: SY='V'; M= -4,-30,-19,-34,-30, 0,-34,-30, 39,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 41,-26, -6,-30; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='F'; M=-10,-21,-19,-28,-23, 24,-14,-15, 3,-19, 5, 14,-16,-23,-21,-16,-11, -1, 5,-12, 5,-20; /M: SY='F'; M= -9,-14,-20,-16, -3, 12,-23,-13, -6,-15, 4, -2,-11,-19, -7,-11, -6, 1, -7,-16, 1, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='G'; M= -1, -6,-27, -7,-10,-27, 48,-18,-35,-15,-26,-19, 0,-16,-14,-16, 3, -9,-26,-22,-26,-12; /M: SY='Y'; M= -9,-10,-28,-11, -5, -6,-22, 1,-17, 19,-15, -6, -8,-19, 1, 16,-12, -9,-14, -2, 22, -5; /M: SY='L'; M=-11,-22,-26,-21,-13, -7,-16,-16, -2,-13, 14, 4,-19,-10,-12, -1,-19,-11, -6,-21, -9,-15; /M: SY='N'; M= -1, 14,-19, 2, -3,-17, -9, -2,-12, -6,-12,-10, 24,-18, 1, -6, 4, 3,-17,-31,-15, -1; /M: SY='M'; M=-10,-16,-26,-22, -9,-12,-26, -8, 12, -5, 8, 23,-14,-18, 8, -6,-15,-10, 2,-20, -4, -2; /M: SY='Y'; M=-20,-12,-30,-12,-12, 10,-26, 52,-12,-10, -8, 0, -8,-26, -2, -6,-16,-14,-18, 6, 56,-12; /M: SY='M'; M= -8,-17,-20,-22,-14, -7,-24,-10, 9, -8, 10, 21,-15,-20, -2, -2,-11, 0, 7,-23, -5, -9; /M: SY='N'; M=-10, 22,-25, 16, 1,-24, -8, -1,-21, -3,-28,-20, 30, 10, -3, -7, 5, 1,-27,-37,-22, -2; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='E'; M=-12, 14,-26, 22, 23,-30,-15, 3,-26, 8,-20,-13, 5, -8, 22, 8, -1, -9,-25,-25,-13, 22; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='N'; M= -5, 19,-19, 15, 12,-22,-10, -4,-22, -2,-23,-19, 20,-11, 2, -5, 14, 12,-19,-36,-18, 7; /M: SY='G'; M= -1, -6,-27, -6, -8,-27, 45,-17,-34,-14,-26,-19, 0,-16,-13,-16, 3, -9,-26,-23,-26,-10; /M: SY='R'; M=-10, -9,-23,-13, -5, -5,-20, -9,-16, 13,-13, -1, -4,-16, -2, 17, -4, 1,-10,-19, -4, -4; /M: SY='W'; M=-20,-39,-46,-40,-30, 20,-21,-29,-17,-21,-16,-17,-37,-30,-23,-20,-37,-27,-26,130, 30,-21; /M: SY='E'; M= -8,-10,-24, -7, 9,-14,-26,-15, 1, -5, 1, -1,-13,-15, -5, -9,-10, -8, 4,-27,-11, 2; /M: SY='P'; M= -3, -9,-23, -9, -5,-20,-18,-19,-15,-10,-21,-15, -8, 34, -9,-14, 9, 21,-14,-31,-20, -9; /M: SY='D'; M=-17, 43,-27, 58, 16,-36,-11, -3,-36, -1,-27,-27, 17,-10, -1,-10, 3, -1,-26,-39,-19, 7; /M: SY='P'; M=-12, -7,-33, 3, 0,-22,-20,-16,-15,-13,-11,-12,-14, 39,-10,-18,-13,-10,-20,-30,-21, -8; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='S'; M= -4, 13,-17, 13, 10,-22, -8, -3,-20, -2,-21,-15, 13, -9, 8, -4, 14, 8,-17,-30,-15, 9; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='R'; M= -6, -6,-23, -6, -5,-21, 11, -8,-27, 8,-23,-13, 1,-15, -1, 20, 1, -7,-19,-20,-16, -5; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='T'; M= -4, -4,-16,-10, -9, -5,-20, -9,-11, -4,-12, -9, -3,-14, -7, -6, 10, 27, -5,-17, 8, -9; /M: SY='K'; M= 3, -6,-25, -8, 2,-26,-16,-11,-21, 14,-21,-10, -5, 3, 8, 10, -1, -2,-16,-22,-15, 4; /M: SY='T'; M= 0, -4,-18, -8,-10,-19, 9,-16,-23, -8,-21,-15, 2,-14, -9, -3, 15, 18,-13,-28,-18,-10; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24, 17,-33,-23, 25,-30, 36, 17,-26,-27,-23,-23,-26,-10, 14,-16, 4,-24; /M: SY='S'; M= -5, 0,-22, 1, 6,-21, -1, -9,-24, -2,-19,-15, 3,-13, 0, 3, 9, 4,-17,-29,-17, 2; /M: SY='D'; M=-10, 23,-24, 31, 3,-30, 5,-10,-32, -7,-25,-22, 10,-12, -7,-12, 6, 4,-22,-33,-20, -2; /M: SY='K'; M=-10, -1,-31, 2, 16,-30,-20,-10,-29, 37,-29,-13, -2, 3, 9, 20, -9,-10,-23,-23,-14, 12; /M: SY='L'; M=-10,-14,-24,-13, 7, -8,-25, -9, 1,-12, 19, 11,-17,-18, 3,-10,-17,-10, -6,-23, -7, 5; /M: SY='D'; M=-10, 16,-27, 25, 20,-31, 0, -4,-33, 2,-26,-22, 8,-10, 3, 0, 4, -7,-26,-32,-20, 11; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-37,-29, 1,-37,-29, 42,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 33,-22, -2,-29; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='Q'; M=-11, 12,-29, 12, 18,-32,-16, 1,-27, 22,-26,-12, 10,-10, 23, 13, -2, -9,-26,-26,-14, 20; /M: SY='Y'; M=-19,-17,-30,-17,-14, 20,-29, 19, -3, -7, -3, 0,-17,-27, 0, -7,-17,-10,-13, 23, 67,-11; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Q'; M=-12, -2,-30, -2, 12,-32,-20, 1,-26, 29,-24, -6, 0,-12, 31, 30, -6,-10,-24,-20,-10, 21; /M: SY='K'; M=-10, 3,-30, 6, 25,-31,-20, -5,-29, 34,-26,-12, 0, -7, 19, 19, -6,-10,-24,-23,-13, 22; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='V'; M= 6,-21,-13,-25,-19, -3,-19,-18, 17,-16, 13, 15,-20,-20,-15,-17,-10, -4, 20,-20, -7,-18; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='Y'; M=-18,-18,-26,-18,-18, 26,-26, 18, 0, -9, 0, 0,-18,-26, -9, -9,-18, -9, -9, 26, 70,-18; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='P'; M= -6,-15,-31, -7, 0,-25,-15,-16,-18, -9,-26,-18,-13, 65, -7,-16, -2, -5,-23,-28,-25, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='E'; M= -5, 10,-20, 11, 31,-21,-14, -3,-21, 3,-18,-16, 7, -4, 9, -2, 8, 4,-20,-28,-16, 20; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='L'; M=-11,-16,-21,-17, -8, -5,-21, -9, -2, 2, 12, 10,-14,-20, -4, 12,-18, -9, -3,-18, -4, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='B'; M=-12, 22,-24, 22, 12,-29,-10, 11,-23, 3,-22,-12, 19,-12, 21, 1, 2, -7,-26,-28,-12, 16; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='I'; M= -9,-26,-26,-35,-26, 0,-35,-26, 44,-26, 18, 18,-18,-18,-18,-26,-18, -9, 26,-18, 0,-26; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='T'; M= 6, -1, -9,-10, -9,-10,-15,-18, -9, -9, -9, -9, -1, -9, -9,-10, 16, 38, 0,-25,-10, -9; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='N'; M= -2, 22,-17, 8, -1,-18, -2, 3,-17, 2,-22,-15, 36,-16, 0, 5, 6, -1,-21,-30,-16, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='V'; M= -3,-26,-16,-30,-26, 0,-30,-26, 33,-21, 12, 12,-23,-23,-23,-21,-12, -3, 37,-23, -5,-26; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='V'; M= -2,-20,-12,-20,-15, -4,-24,-19, 18,-13, 6, 11,-22,-22,-17,-14, -9, -2, 29,-25, -9,-16; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='E'; M= -6, 6,-23, 12, 40,-26,-15, 0,-24, 6,-19,-15, 1, -3, 19, 0, 6, -5,-23,-26,-16, 29; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='A'; M= 24, -1,-12,-10, -7,-13, -3, -8,-10, -7,-13,-10, 3,-12, -6,-13, 9, 1, -6,-18, -8, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='N'; M= -1, 14,-17, 5, -1,-18, -4, -3,-16, -5,-24,-16, 24, 1, -3, -6, 13, 6,-19,-32,-18, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-23, -1, 8,-24,-15, 21,-17, 1,-16, -3, -1, 4, 24, 1, -3, -9,-22,-18, -4, 14; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3; /M: SY='P'; M= 4, -2,-23, 1, 4,-18,-12, -8,-17, -4,-16,-14, -7, 13, -4, -9, -2, -6,-16,-18, -9, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='V'; M= -4,-19,-16,-20,-15, -9,-25,-19, 15, -5, 1, 6,-18,-20,-10, -8, -9, -4, 23,-23, -8,-13; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='K'; M= -2, -3,-18, -5, -3,-18,-13,-12,-12, 6,-19,-10, 0, -1, -4, -1, 6, 5, -6,-27,-14, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='I'; M= -9,-25,-22,-31,-22, 3,-30,-20, 32,-24, 26, 22,-20,-20,-15,-21,-20, -9, 18,-18, 0,-21; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= -3, 5,-22, 9, 8,-27, 11, -6,-26, -5,-24,-16, 5,-10, 7, -7, 9, -4,-22,-26,-18, 7; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='N'; M= -7, 17,-20, 18, 3,-23, 3, -2,-25, -1,-25,-19, 19,-13, -1, 2, 10, -1,-21,-31,-17, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='W'; M=-15,-34,-38,-34,-26, 7,-19,-26,-10,-18,-13,-13,-34,-26,-19,-18,-31,-22,-15,105, 20,-19; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -9,-18,105,-26,-26,-18,-26,-26,-26,-26,-18,-18,-18,-35,-26,-26, -9, -9, -9,-44,-26,-26; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M=-11, -3,-26, -2, 9,-23, -7, -5,-27, 24,-22,-11, 0,-12, 7, 29, -6,-10,-20,-19,-12, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M=-10, -7,-21, -7, 2, -6, -5, -5,-18, 5,-12, -7, -3,-12, 3, 13, -6, -8,-15,-11, -5, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= 4, 5,-16, 6, 2,-20, 10, -9,-20, -6,-17,-14, 2, -8, -4,-10, 7, -2,-14,-21,-16, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M= -4, -5,-20, -6, -2,-17, -4, 9,-21, 10,-16, -7, 0,-12, 2, 19, -4, -9,-15,-16, -6, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='K'; M= -4, -4,-17, -4, 2,-15,-11, -8,-15, 15,-13, -6, -1,-10, 2, 10, 1, -1, -9,-19, -8, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -7, -2,-22, -1, 8,-24,-13, -2,-18, 15,-19, -6, -1, 1, 19, 12, -1, -5,-18,-17,-10, 13; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='K'; M= -1, -2,-20, -3, 5,-21,-12, -5,-18, 22,-17, -6, -1, -8, 12, 17, -4, -6,-14,-15, -8, 8; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='S'; M= 3, -1, -7, -2, -3,-11, 6, -7,-12, -6,-14,-10, 3, -6, -3, -6, 15, 9, -6,-18,-11, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M= -8, -4,-18, -4, -1,-11,-10, 22,-16, 1,-15, -5, 0,-11, 2, 1, -4, -7,-15, -1, 5, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='P'; M= -7, -6,-17, -6, -2,-12,-12, 4,-12, -1,-11, -5, -3, 9, -1, 4, -2, 2,-11,-16, -6, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M=-15, -2,-22, -2, 0,-15,-15, 58,-22, -1,-15, -2, 6,-15, 7, 11, -7,-13,-20,-20, 10, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Y'; M= -9,-11,-21,-13, -3, 0,-17, 0, -2,-11, -5, -3, -8,-13, -6,-10, -7, -8, -6, 2, 4, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='V'; M= -2,-22,-12,-24,-22, 0,-24,-22, 27,-17, 10, 10,-19,-19,-19,-17,-10, -2, 32,-19, -5,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='V'; M= -6,-11,-17,-14, -8,-10,-20,-14, 3, 6, -4, 1, -9,-14, -6, 5, -8, -3, 7,-17, -6, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='P'; M= -7,-15,-29, -7, 0,-22,-15,-15,-15, -7,-22,-15,-15, 66, -7,-15, -7, -7,-22,-22,-22, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='F'; M=-15,-19,-17,-24,-19, 46,-22, -5, 0,-17, 5, 0,-15,-22,-22,-12,-15, -7, -2, 12, 34,-19; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M=-12, -7,-22, -9, -3,-13,-17, 10,-11, 10,-10, -2, -1,-13, 3, 22, -9, -9, -9,-16, -1, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M= -7,-22,-16,-23,-16, 6,-23,-16, 17,-22, 34, 15,-21,-21,-15,-16,-21, -7, 9,-15, 0,-16; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= -3, 1,-22, 4, -9,-23, 40,-12,-29,-12,-22,-16, 3,-13,-12,-13, 0,-13,-22,-17,-21,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='E'; M= -9, 10,-25, 14, 37,-24,-14, -1,-23, 5,-20,-17, 6, 7, 11, -2, 0, -7,-26,-27,-18, 23; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='F'; M=-16,-26,-18,-34,-26, 57,-27,-18, 7,-26, 10, 3,-17,-24,-31,-18,-17, -9, 4, 4, 22,-26; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='V'; M= -6,-10,-18,-11,-10,-13,-19, -3, 2, -9, -8, -1, -6, -5, -6,-10, -5, -4, 6,-26,-10, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='S'; M= 5, -4,-12, -5, -5,-16, 6, -8,-14,-10,-19, -6, 3,-11, -2,-10, 21, 8, -8,-29,-16, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='D'; M=-11, 21,-23, 30, 20,-27,-13, -4,-27, 7,-21,-18, 8, -6, 4, -1, 2, 0,-20,-28,-14, 12; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='A'; M= 30,-10, -9,-17,-11,-13, -6,-18, -4,-10, -6, -6,-10,-11,-11,-16, 7, 7, 6,-20,-14,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M= -7,-22,-15,-22,-15, 7,-22,-15, 15,-22, 37, 15,-22,-22,-15,-15,-22, -7, 7,-15, 0,-15; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M= -9,-19,-16,-20,-12, 12,-21,-12, 8,-18, 24, 10,-18,-20,-10,-12,-18, -7, 2,-10, 3,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='V'; M= 0,-18, -7,-19,-19, -1,-21,-21, 16,-13, 5, 5,-18,-19,-19,-13, -3, 7, 30,-22, -7,-19; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='P'; M= -7,-15,-29, -7, 0,-22,-15,-15,-15, -7,-22,-15,-15, 66, -7,-15, -7, -7,-22,-22,-22, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='E'; M= -9, 9,-19, 16, 18,-19,-14, 5,-16, -1,-12,-11, 1, -8, 3, -5, -2, -7,-11,-24, -9, 10; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= -5, 4,-21, 4, -3,-22, 20, -8,-26, 3,-22,-14, 6,-12, -5, -2, -1,-10,-20,-18,-16, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -8, -4,-21, -4, 7,-20,-16, 0,-13, 12, -9, -1, -3,-11, 22, 14, -6, -7,-15,-15, -6, 14; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='F'; M=-13,-22,-15,-28,-21, 49,-22,-15, 3,-22, 13, 3,-16,-22,-26,-15,-16, -7, 1, 3, 18,-21; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M= -8,-11,-15,-10,-10, 8,-17,-12, 2,-17, 16, 3,-12,-18,-13,-13,-11, -5, 0,-15, 0,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M=-15, 7,-22, 10, 3,-17,-13, 59,-23, -6,-16, -4, 9,-13, 6, -1, -6,-13,-22,-23, 9, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -6, 0,-19, -4, 1,-18,-15, -2, -3, 1, -9, 0, 3,-12, 16, 0, -2, -5, -8,-18, -8, 8; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='E'; M= -8, 9,-21, 13, 32,-20,-13, 11,-21, 4,-16,-13, 7, -4, 12, 0, 0, -7,-22,-23,-10, 21; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M=-11, -1,-19, -3, 0,-15,-11, 0,-20, 15,-17, -9, 7,-14, 5, 36, -1, -3,-15,-19, -9, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='M'; M= 1,-10,-13,-15, -9, -7,-10, -3, 1, -4, 1, 19, -8,-12, 0, -1, -2, -2, 1,-17, -6, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='D'; M=-10, 16,-19, 22, 11,-15,-10, 2,-19, -1,-17,-15, 8, -9, 1, -5, 2, -4,-17,-18, -1, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -5,-12,-15,-12, -5,-13,-18, -8, 2, -1, -4, 2,-11,-15, 7, 3, -5, -4, 7,-18, -7, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='E'; M= -8, 5,-23, 8, 29,-17,-13, -2,-20, 3,-16,-15, 1, -5, 9, -2, -3, -8,-22, -4, -9, 19; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='N'; M= -4, 10,-16, 8, 2,-17, -6, -5,-16, 0,-20,-14, 13, 1, -1, -3, 9, 5,-15,-26,-14, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M=-11, -8,-19, -9, -8, 7,-16, 29,-11, -9, -8, -2, -3,-17, -4, -6, -5, -7,-12, -5, 25, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -5, -8,-16, -9, -2,-12,-17, -8, -3, 1, -1, 2, -8,-12, 7, 0, -5, 1, -3,-17, -6, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M=-15, -7,-21, -8, -4, -1,-16, 27,-18, 2,-10, -3, 0,-16, 0, 18, -9,-10,-15,-13, 7, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='W'; M=-15,-26,-34,-26,-18, 4,-15,-18,-16, -9,-15,-13,-25,-21,-11, -4,-26,-20,-21, 90, 17,-12; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M=-11, 6,-21, 5, 9,-17,-13, 40,-21, 2,-17, -6, 10,-11, 8, 3, -4,-10,-21,-22, 2, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='T'; M= -3, 5,-14, 4, 4,-18,-11, -5,-14, -2,-14, -8, 3, -7, 10, -3, 11, 14,-11,-22,-10, 7; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='T'; M= -1, -6,-12, -5, 4,-10,-15,-11, -2, -6, -5, -5, -7,-11, -5, -8, 4, 5, 5,-23,-10, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='A'; M= 18, -8, -9,-13,-11,-12, 1,-16, -5,-10, -7, -6, -7,-11,-11,-13, 5, 5, 3,-17,-13,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='K'; M= -1, -3,-20, -4, 2,-21, -4, -6,-20, 16,-17, -7, -1,-10, 8, 15, -3, -7,-15,-15,-10, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='E'; M= -1, 4,-20, 9, 32,-21,-13, -3,-20, 9,-14,-13, -1, -2, 11, 1, 0, -6,-18,-20,-14, 21; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='A'; M= 24, -5, -9,-11, -4,-16, -4,-11, -9, -5,-10, -7, -4, -7, 0,-10, 9, 5, -3,-17,-13, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -7,-15, 88,-22,-22,-15,-22,-22,-22,-22,-15,-15,-15,-29,-22,-22, -7, -7, -7,-37,-22,-22; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Q'; M= -3, -8,-15, -8, -3,-10, -7, -8, -6, -5, 0, -1, -6,-13, 1, -5, -1, -2, -6,-19, -8, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='T'; M= -3, 1,-15, 1, 7,-13,-14,-10, -6, -6, -9, -8, 0, -7, -1, -8, 6, 9, -5,-22,-10, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M=-10, -2,-22, -2, 10,-21,-15, 0,-20, 21,-16, -6, 0,-10, 16, 29, -5, -7,-17,-15, -8, 11; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= 0, 6,-17, 5, -5,-20, 23, -7,-23, -8,-21,-15, 11,-12, -7,-10, 7, -5,-19,-22,-18, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='M'; M= -8,-17,-16,-24,-16, 1,-19, -5, 14,-12, 19, 39,-17,-18, -4,-10,-15, -3, 8,-18, -1,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='T'; M= -7, -2,-19, -9, -7,-13,-18, -9, -1, -4, -8, -3, 5,-14, 1, 2, 1, 8, -4,-23, -8, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M= -8,-25,-15,-27,-21, 15,-25,-17, 17,-21, 25, 16,-23,-25,-20,-16,-19, -6, 16,-15, 2,-20; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='H'; M=-16, -6,-26, -6, 0,-14,-18, 31,-21, 7,-15, -3, 0,-17, 13, 23, -8,-11,-20,-14, 11, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='S'; M= 3, 7,-14, 10, 1,-21, 7, -8,-23, -8,-26,-19, 9,-10, -2,-10, 23, 8,-14,-32,-18, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='Y'; M=-14,-18,-20,-21,-18, 36,-22, 1, -2,-15, 0, -2,-14,-23,-17,-12,-10, -5, -5, 11, 41,-18; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= 15,-11,-18,-15,-14,-17, 24,-17,-16,-15, -8, -8, -7,-15,-14,-17, -1, -9,-10,-17,-18,-14; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='M'; M= -6,-19,-18,-23,-17, -4,-19, -9, 14,-11, 8, 29,-19, -4, -8,-12,-14, -6, 12,-21, -6,-13; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M=-10,-24,-18,-24,-17, 11,-26,-12, 14,-23, 36, 14,-24,-26,-16,-16,-24, -9, 6,-10, 11,-17; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='L'; M= -9,-13,-21,-11, 4, -6,-22,-11, -1, -6, 16, 4,-15,-16, -4, -6,-16, -9, -4,-19, -6, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='P'; M= -9,-17,-34, -9, 0,-26,-17,-17,-17, -9,-26,-17,-17, 77, -9,-17, -9, -9,-26,-26,-26, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='C'; M= -9,-17,103,-26,-26,-17,-26,-26,-26,-26,-17,-17,-17,-34,-26,-26, -9, -9, -9,-43,-26,-26; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='G'; M= 5,-10,-21,-12,-15,-19, 29,-17,-17,-16,-17,-11, -2,-15,-14,-17, 3, -9,-12,-20,-19,-15; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='I'; M= -2,-18,-16,-21,-16, -3,-21,-18, 16,-19, 10, 6,-13,-18,-13,-17, -3, 0, 14,-23, -6,-16; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='D'; M=-13, 32,-24, 46, 21,-31, -9, -1,-31, 0,-24,-23, 13, -7, 3, -7, 4, -5,-24,-33,-17, 12; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='R'; M= -9,-11,-21,-11, -3,-14,-19, -7, -7, 11, -4, 5, -9,-16, 6, 15,-11, -8, -4,-18, -6, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-3; /M: SY='F'; M=-19,-26,-21,-34,-24, 64,-29,-19, -4,-18, 4, -1,-17,-27,-33,-13,-19,-10, -3, 6, 24,-24; /M: SY='R'; M= 0, -8,-18,-12, -8,-15,-17, 0,-13, -1,-13, -7, -3,-17, -4, 10, 5, 8, -3,-27, -9, -8; /M: SY='G'; M= 7,-10,-27,-11,-19,-29, 60,-20,-36,-19,-27,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-17,-26,-20,-29,-19; /M: SY='V'; M= 7,-24,-10,-26,-25, -4,-25,-27, 20,-17, 5, 5,-24,-25,-25,-19, -4, 6, 37,-29,-11,-25; /M: SY='E'; M=-10, 8,-30, 17, 52,-30,-20, -2,-30, 17,-22,-18, 0, -2, 18, 5, -2,-10,-28,-28,-18, 35; /M: SY='F'; M=-17,-28,-21,-34,-28, 57,-30,-12, 4,-24, 8, 1,-21,-30,-31,-18,-19, -9, 4, 9, 37,-28; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M=-10,-17,-39, -9, 1,-30,-20,-19,-21, -2,-30,-19,-17, 76, -7,-13,-10,-10,-29,-29,-27, -7; /M: SY='P'; M= 1, -1,-26, -4, 0,-23,-13, -8,-16, -1,-18,-11, 4, 12, 2, -6, -2, -6,-20,-27,-19, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of true positive hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 7 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | E1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
18 sequences
A4_CAEEL(Q10651), A4_CAVPO(Q60495), A4_DORPE(Q06BR2), A4_DROME(P14599), A4_HUMAN(P05067), A4_MACFA(P53601), A4_MOUSE(P12023), A4_PANTR(Q5IS80), A4_PIG (P79307), A4_RAT (P08592), A4_SAISC(Q95241), A4_TAKRU(O93279), A4_TETFL(O73683), APLP1_HUMAN (P51693), APLP1_MOUSE (Q03157), APLP2_HUMAN (Q06481), APLP2_MOUSE (Q06335), APLP2_RAT (P15943)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences |
7 sequences
A4_BOVIN(Q28053), A4_CANLF(Q28280), A4_FELCA(P86906), A4_MACMU(P29216), A4_RABIT(Q28748), A4_SHEEP(Q28757), A4_URSMA(Q29149)» more |
| PDB [Detailed view] |
15 PDB
1MWP; 1OWT; 2FJZ; 2FK1; 2FK2; 2FK3; 2FKL; 2FMA; 2M05; 3KTM; 4JFN; 4PQD; 4PWQ; 7MRN; 8OTF » more |