PROSITE entry PS51871
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PV_P1_PRO |
| Accession [info] | PS51871 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
10-OCT-2018 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51871 |
| Associated ProRule [info] | PRU01219 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Potyviridae P1 protease domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=146; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=141; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1616805; R2=0.0203956; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8510.0996094; R2=5.5040131; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=385; H_SCORE=10629; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=213; H_SCORE=9682; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= -2, 2,-27, 3, 8,-28, -9, -9,-28, 25,-25,-13, 0,-11, 5, 18, -4, -9,-19,-23,-15, 6; /M: SY='M'; M= -9,-23,-24,-24,-15, 1,-25,-15, 7,-16, 10, 14,-22, 0,-10,-15,-17, -8, 3,-21, -6,-13; /M: SY='T'; M= 0, 0,-13, -6, -9,-13,-14,-14, -6, -6,-15, -9, 6,-16, -9, -8, 14, 19, 2,-33,-14, -9; /M: SY='E'; M= -4, 4,-23, 2, 13,-23,-17, -8,-18, 7,-19,-12, 5, -4, 5, 0, 2, 3,-15,-29,-16, 9; /M: SY='V'; M= 5,-14,-16,-20,-16, -8,-17,-19, 5,-14, -3, -1,-13,-18,-12,-15, 1, 11, 12,-22, -5,-15; /M: SY='S'; M= -4, 8,-23, 12, 5,-29, 3, 4,-28, -5,-27,-16, 8,-12, 10, -7, 14, -1,-23,-32,-16, 7; /M: SY='V'; M= -7,-29,-17,-33,-28, 15,-31,-25, 26,-24, 18, 14,-26,-28,-27,-21,-17, -5, 31,-20, 0,-27; /M: SY='B'; M= -6, 10,-21, 9, 6,-24, -5, -4,-20, -4,-20,-10, 9,-12, 7, -6, 10, 5,-18,-31,-16, 7; /M: SY='K'; M= -9, -5,-27, -5, 3,-24,-12, 7,-21, 15,-17, -2, -2,-14, 12, 9, -6,-10,-19,-23, -7, 7; /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24, 39,-30,-20, 12,-30, 33, 12,-26,-30,-28,-20,-26,-10, 6, -7, 13,-24; /M: SY='M'; M= 3,-23, -9,-30,-22, -4,-24,-19, 18,-20, 15, 19,-21,-23,-16,-20,-14, -7, 16,-24, -7,-20; /M: SY='R'; M=-13, -6,-28, -7, 1,-23,-12, -7,-29, 29,-23,-11, 0,-16, 6, 42, -7, -6,-19,-21,-12, 1; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-23, -1, -1,-21,-19,-10, -8, -2, -8, -4, -4,-15, 6, -2, -2, -2, -6,-26,-11, 1; /M: SY='L'; M= -7,-28,-19,-31,-24, 4,-32,-25, 27,-26, 30, 16,-26,-27,-22,-22,-20, -4, 24,-23, -3,-24; /M: SY='L'; M= -4,-18,-12,-22,-16,-11,-12,-21, -1,-10, 5, 2,-15,-22,-14,-12,-15,-11, -2,-23,-11,-16; /M: SY='D'; M= -8, 23,-26, 25, 16,-30,-11, -1,-28, 13,-27,-19, 18,-11, 7, 3, 1, -7,-25,-31,-17, 11; /M: SY='I'; M= -8,-19,-25,-25,-17, -8,-30,-18, 23,-19, 12, 12,-13,-21, -5,-17,-14, -8, 14,-23, -5,-13; /M: SY='C'; M= 2,-10, 21,-19,-16, -9,-15,-13,-12,-14,-10, 0, -6,-23,-12,-13, 0, -3, -6,-31,-15,-14; /M: SY='K'; M= -3, -5,-26, -6, 6,-24,-19,-11,-17, 22,-16, -5, -5,-12, 8, 11, -6, -7,-13,-22,-11, 6; /M: SY='A'; M= 11, -6,-20, -8, 4,-19, -7,-13,-14, -1,-10, -9, -5,-13, -3, -4, -1, -6, -8,-24,-17, 0; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='K'; M= -9, 3,-24, 1, -2,-14,-10, 4,-23, 6,-21,-12, 6,-15, -3, 1, 0, 1,-18,-22, -1, -3; /M: SY='N'; M= -8, 13,-27, 8, -2,-27, 14, -6,-30, 5,-29,-18, 20,-11, -4, 1, 0,-10,-28,-29,-21, -4; /M: SY='I'; M= -3,-21,-24,-26,-21,-10, -9,-21, 14,-20, 6, 10,-16,-21,-13,-20,-12,-10, 10,-21,-10,-19; /M: SY='N'; M= -4, 5,-21, 1, 5,-22,-13, -7,-16, 4,-23,-13, 10, -5, 4, -1, 8, 3,-14,-32,-17, 4; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-35,-28, 2,-35,-28, 38,-26, 21, 16,-25,-25,-24,-25,-18, -6, 34,-24, -4,-28; /M: SY='E'; M=-11, 9,-30, 17, 52,-29,-20, 14,-30, 7,-20,-17, 1, -3, 19, 0, -1,-11,-30,-30,-14, 34; /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-33,-26, 18,-32,-21, 24,-27, 27, 14,-25,-28,-24,-22,-22, -8, 18,-14, 8,-26; /M: SY='I'; M= -3,-27,-22,-34,-27, -2,-33,-29, 37,-25, 14, 14,-20,-21,-21,-26,-13, -3, 31,-23, -4,-27; /M: SY='G'; M= -1, 6,-28, 10, -8,-31, 41,-14,-37,-14,-29,-22, 5,-16,-13,-17, 3,-14,-27,-26,-26,-11; /M: SY='K'; M=-12, -3,-30, -3, 5,-27,-13, -8,-31, 39,-27,-11, 0,-13, 8, 36, -9,-11,-21,-20,-12, 5; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='K'; M= -9, -1,-23, -3, 3,-21,-18, 1,-23, 24,-21, -8, 1,-11, 5, 18, -2, 3,-15,-22, -6, 3; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='R'; M= -7, -7,-19, -8, -4,-16,-17, -2,-14, 9,-16, -6, -3,-15, -1, 15, 1, 3, -4,-25, -8, -4; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='K'; M= -6, 4,-16, 2, 6,-17,-10, -2,-15, 20,-16, -6, 5, -7, 9, 13, -3, -5,-13,-13, -7, 7; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='T'; M= 1, -5, -9, -7, -5, -7,-10, -9, -4, 2, -5, -3, -4, -8, -4, 4, 1, 5, 2,-13, -6, -5; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='T'; M= -2, -1,-14, -9, -9,-11,-14,-14, -8, -7,-11, -8, 3,-13, -8, -4, 12, 25, -2,-27,-11, -9; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='R'; M=-11, 0,-26, -3, 3,-23,-19, -1,-23, 25,-22, -9, 5,-15, 9, 27, -4, -3,-17,-24, -9, 4; /M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-30,-23, 10,-27,-22, 20,-26, 25, 12,-23,-26,-22,-21,-19, -4, 15,-18, 2,-23; /M: SY='D'; M=-10, 8,-23, 12, 5,-26,-14, 8,-23, 1,-22,-13, 6,-15, 8, 7, 6, -2,-16,-31,-11, 5; /M: SY='F'; M=-14,-23,-27,-25,-17, 23,-28,-13, 0,-16, 3, -1,-19, -4,-20,-15,-17, -8, -5, -4, 16,-19; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='R'; M= -5,-14,-21,-18,-12, -1,-23,-14, -3, 3, -7, -2,-11,-19,-10, 4, -7, 0, 3,-15, 2,-12; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='K'; M=-11, -7,-27, -7, 0,-18,-13, -4,-20, 18,-15, -6, -5,-16, 9, 18, -9, -8,-17,-15, -1, 3; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='K'; M= -9, -5,-23, -8, 1,-10,-23, -6,-15, 12,-15, -6, -4,-14, -3, 5, -4, 3, -9,-21, -4, -1; /M: SY='H'; M=-11, 4,-25, 4, 1,-16, -6, 36,-25,-10,-19,-10, 9,-17, 0, -7, 0,-10,-23,-29, -1, -1; /M: SY='G'; M= -8, -8,-25,-12,-10,-13, 6,-12,-21, 1,-13, -5, -2,-19, -8, 5, -6, -6,-15,-20,-12,-10; /M: SY='K'; M= -3, -5,-25, -7, -3,-23, 0,-15,-24, 16,-20,-10, -3,-14, -3, 6, -4, -3,-16,-22,-14, -3; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='V'; M= -5, -8,-15, -9,-12, -7,-21, -7, 3, -8, -3, -1, -9,-16,-11, -9, -2, 7, 10,-21, -1,-12; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M=-14,-20,-23,-23,-17, 25,-24, -4, -4,-11, 2, 2,-14,-25,-14, -1,-11, -6, -5, -2, 25,-16; /M: SY='L'; M= 11,-21, 5,-27,-19, 0,-19,-22, 0,-23, 14, 1,-20,-24,-19,-22,-12, -6, 3,-22, -9,-19; /M: SY='R'; M=-13, -8,-28, -9, -2,-16,-20, 18,-22, 16,-18, -6, -2,-19, 5, 30,-10,-11,-15,-19, 3, -2; /M: SY='C'; M= -2,-20, 23,-25,-23,-10,-26,-14, 0,-22, -1, -2,-18,-28,-21,-21, -8, -2, 11,-33,-12,-23; /M: SY='Q'; M=-12, 4,-29, 3, 14,-28,-13, 17,-27, 13,-23, -9, 8,-13, 20, 15, -4,-11,-27,-25, -9, 16; /M: SY='L'; M= -5,-21,-15,-23,-18, 1,-27,-21, 12,-21, 23, 9,-21,-24,-17,-16,-11, 9, 14,-25, -5,-17; /M: SY='R'; M= -8, -4,-28, -6, 3,-25,-17, -6,-25, 26,-22,-10, 0, -8, 9, 32, -7, -9,-19,-22,-12, 4; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='M'; M= -4,-11,-21,-13, 1,-10,-22, -4, 0, -9, 5, 11,-12,-15, -3,-10, -8, -1, -1,-25, -7, -1; /M: SY='N'; M=-10, 0,-23, -4, -5, -5,-18, -6, -8, -5, -5, 0, 3,-18, -2, -3, -6, -2,-10,-22, -4, -4; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -1, -7,-28, -8,-13,-28, 47,-16,-35,-11,-27,-18, 1,-18,-14, -9, 0,-16,-26,-22,-26,-13; /M: SY='R'; M= -9, -6,-18, -7, -4,-13,-20, -9,-12, 1, -9, -6, -4,-16, -2, 4, -6, -4, -9,-23, -6, -4; /M: SY='R'; M=-14,-10,-27,-12, -7, -6,-23, -8, -6, 1, -5, 1, -5,-13, -4, 10,-12, -8, -8,-18, -1, -8; /M: SY='K'; M= -3, -7,-23, -8, 1,-16,-17, -6,-15, 5,-15, -8, -4, -7, 0, 4, -1, -4,-10,-24,-10, -1; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M=-13, -5,-19, -5, 2,-21,-19, -6,-23, 17,-17,-10, -2,-17, 6, 33, -5, -7,-16,-24,-12, 2; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='R'; M=-12, 1,-24, 4, -4,-19,-16, -7,-14, 5,-15, -9, -2,-19, -4, 9, -6, -5, -5,-26, -9, -5; /M: SY='D'; M=-19, 47,-30, 67, 23,-39,-11, 0,-39, 1,-29,-29, 19, -9, 1, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 12; /M: SY='L'; M= -9,-24,-12,-29,-21, 6,-27,-17, 16,-21, 23, 20,-22,-25,-16,-16,-18, -5, 12,-22, -2,-19; /M: M=-11, -4,-26, -2, -3,-11,-20, -2,-13, -3,-14, -9, -3, -4, -5, -3, -5, -5,-11,-22, -1, -6; /M: M= -6,-13,-14,-14, -6,-13,-23,-13, -3,-13, -6, -4,-12, 0, -9,-16, -6, -5, -4,-28,-13, -9; /M: SY='D'; M=-10, 18,-25, 23, 13,-29, -9, 0,-28, 0,-25,-19, 12, -6, 4, -3, 5, -1,-24,-33,-17, 8; /M: SY='E'; M= -5, -5,-19, -4, 3,-17,-17,-13,-11, -3,-12, -7, -6, -6, -5, -5, -4, -4, -7,-27,-15, -2; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='W'; M= -3, -8,-18, -9, -5, 2,-10,-11,-11, -7, -9, -9, -8,-10, -9, -8, -5, -4, -9, 6, 1, -6; D=-14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='T'; M= -3, -5,-15, -6, -4, -8,-10, -8, -7, -8, -5, -4, -6,-12, -4, -8, -2, 3, -5, -5, -4, -4; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='R'; M=-11, 2,-26, 4, 8,-21,-17, -5,-20, 8,-17,-12, 2,-10, 4, 13, -3, -4,-17,-25,-11, 5; /M: SY='E'; M= -6, 0,-26, 2, 10,-22,-11, -1,-21, 0,-20,-12, 0, -4, 4, -4, 2, -3,-19,-23,-12, 6; /M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-34,-26, 24,-30,-23, 15,-26, 16, 8,-24,-26,-25,-21,-20, -7, 9, 4, 11,-25; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-32,-23, 13,-31,-22, 24,-26, 29, 17,-25,-27,-20,-21,-22, -8, 18,-18, 2,-22; /M: SY='E'; M=-11, 0,-14, 1, 5,-18,-19, 0,-19, -2,-12, -8, -2,-13, 2, 0, -3, -2,-16,-29,-10, 3; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='H'; M= -5, -9,-19,-11, -4,-16,-19, 8,-10, -6, -8, -2, -5,-17, 3, -3, -5, -6,-11,-17, -3, -2; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='L'; M= -3,-27,-21,-31,-22, 13,-27,-19, 16,-25, 25, 11,-24,-26,-21,-21,-20, -8, 10,-10, 7,-22; /M: SY='A'; M= 14,-11, -3,-17,-10,-17,-10,-12,-12, -6,-12, -5, -8,-17, -6, -8, 3, -2, -4,-26,-15, -8; /M: SY='K'; M= -8, 3,-27, 3, 3,-25, -4, -2,-28, 16,-24,-13, 6,-14, 3, 13, -4, -8,-22,-23,-12, 2; /M: SY='T'; M= -2,-13, -1,-18,-16,-11,-11,-15,-10,-11,-11, -7,-10,-21,-13,-10, -1, 3, -1,-25,-10,-15; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='Y'; M= -9,-13,-22,-16,-14, 7,-16, -8, -2,-16, 0, -2, -8,-19,-14,-13, -7, -3, -4,-14, 8,-15; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='E'; M= 1, -3,-22, -3, 4,-23, -2, -6,-21, 1,-20,-12, -1,-13, 1, 1, 4, -4,-14,-26,-15, 1; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: M=-10,-11,-26,-13,-10, -6,-13, -9,-12, -7,-14,-10, -5, -7, -8, -3, -5, -3,-12, 0, 0,-10; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='T'; M= -3,-10,-14,-11, -5,-14,-14, -9,-12, -4,-11, -7, -8,-15, -8, -4, -1, 2, -4,-26,-10, -7; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M= -7, 1,-25, 1, 3,-23,-13, -4,-22, 11,-22,-11, 3, -4, 3, 13, 0, -2,-17,-27,-14, 2; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -2, -8,-23, -8, -1,-19,-19, -5, -9, 2,-12, -5, -6,-10, 1, -1, -3, -4, -5,-26,-10, -1; /M: SY='V'; M= -5,-16,-20,-20,-16, -5,-26,-15, 13,-15, 1, 3,-12,-18,-15,-14, -6, 1, 16,-26, -7,-17; /M: SY='R'; M=-11, 4,-22, 5, 4,-21,-17, 4,-22, 8,-17, -9, 5,-15, 4, 11, -1, -2,-17,-28, -8, 3; /M: SY='T'; M= -6, -2,-18, -1, -2,-13,-18,-11, -8, -9, -8, -7, -4,-10, -6,-12, 0, 1, -6,-27, -9, -5; /M: SY='S'; M= -4, -4,-22, -6, -4,-13, -4, 0,-18, -8,-17,-11, 1,-16, -2, -6, 5, -1,-15,-21, -7, -3; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= -7, 10,-23, 12, 19,-22,-13, -3,-19, 3,-17,-10, 6,-10, 5, -2, 2, -4,-17,-26,-15, 12; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-35,-28, 7,-35,-27, 35,-27, 23, 16,-25,-25,-24,-25,-19, -7, 29,-21, -1,-28; /M: SY='R'; M= -5, -5, -7, -9, -4,-18,-19, -9,-19, 6,-17,-10, -1,-16, -2, 12, 3, 10,-10,-28,-12, -4; /M: SY='P'; M= -8,-12,-30,-11, -3,-14,-20, 0,-20, 6,-19,-10, -9, 15, -4, 6,-10,-10,-20,-19, -6, -6; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-13,-10,-33, -8,-12, -8,-15, -9,-22,-13,-21,-16,-12,-20, -9,-14,-10, -9,-22, 47, 7, -8; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 0,-26,-17,-30,-24, 6,-27,-24, 21,-22, 18, 11,-24,-25,-22,-19,-14, -5, 23,-21, -4,-23; /M: SY='I'; M= -6,-27,-20,-33,-27, 0,-34,-28, 34,-24, 16, 13,-22,-23,-22,-24,-13, 0, 32,-24, -4,-27; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-32,-23, 19,-31,-20, 19,-27, 30, 15,-25,-27,-22,-20,-23, -7, 13,-14, 8,-23; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='H'; M= -8, 0,-22, -2, -2,-16,-14, 9,-15, 0,-13, -6, 5,-10, 3, 3, -3, -4,-15,-21, -6, -1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='K'; M= -6, 0,-26, 1, 7,-23,-11, -5,-20, 8,-21,-12, 1, 3, 6, 3, -3, -6,-20,-18,-13, 6; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='D'; M= -9, 8,-23, 10, 6,-20, -7, -2,-21, 7,-19,-10, 6,-10, 2, 5, -2, -7,-18,-22,-10, 3; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M= -6, 5,-19, 3, 0,-14,-12, -5,-10, 0,-13, -8, 6,-13, 3, -2, 1, -3,-10,-18, -9, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='L'; M= -4,-18, -7,-19,-14, -3,-19,-17, 9,-17, 11, 6,-18,-17,-15,-16,-13, -6, 10,-20, -6,-15; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: M= 0, -2,-17, -2, -1,-15,-10, -6,-10, -2, -9, -7, -2, -4, 0, -3, 0, -1, -9,-19,-10, -1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -5, 0,-21, 2, 3,-19, 2, -5,-18, -2,-15,-10, 1, -3, 0, -3, -1, -6,-16,-19,-13, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -5, -1, -3, 0, 2,-16,-12, 0,-15, -1,-14, -9, -2, -5, -1, -1, -1, -5,-11,-22,-10, 0; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -9, 0,-17, 2, 4, -8,-12, -3, -9, 0, -7, -4, -3, -5, 3, 2, -5, -6, -9,-13, -4, 3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: M= -5, -7,-18, -8, -3, -4, -1, -2,-14, -6,-10, -5, -3,-13, -3, -6, -2, -7,-11,-14, -4, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='R'; M= -8, -7,-22, -6, -2,-15,-13, -5,-11, 2,-12, -5, -5,-12, -3, 9, -6, -6, -6,-18, -9, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Y'; M= -8,-10, 0,-12, -9, -1,-17, -2,-15,-11,-12, -9, -8,-17, -8, -8, -4, -5,-12,-10, 2, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='V'; M= -6,-13,-22,-16,-14, -4,-19,-14, 0, -8, -6, -2, -9,-13,-12, -4, -7, -4, 2,-17, -4,-14; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='D'; M= -8, 16,-26, 20, 0,-26, 9, 2,-30, -6,-26,-19, 14,-15, -3, -8, 4, -6,-25,-29,-14, -2; /M: SY='D'; M= -8, 16,-27, 20, 6,-30, 11, -6,-31, -1,-26,-18, 12,-14, -1, -7, 1,-10,-25,-30,-21, 2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='L'; M= -8,-24,-21,-29,-19, 13,-28,-17, 17,-23, 22, 13,-20,-23,-18,-19,-17, -5, 10,-14, 6,-19; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M=-15,-26, 7,-35,-28, 43,-27,-22, -4,-27, 5, -3,-19,-30,-33,-20,-16, -7, 0, -9, 10,-28; /M: SY='V'; M= -4,-29,-18,-33,-29, -1,-33,-29, 37,-24, 13, 13,-25,-25,-25,-24,-13, -4, 40,-26, -6,-29; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='R'; M=-17, -9,-29,-10, 2,-22,-20, 1,-23, 21,-15, -3, -2,-18, 19, 49, -9,-10,-19,-20, -9, 7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-12, -9,-29, -9, 2,-20,-19, -7,-23, 22,-19,-10, -3,-16, 6, 39, -8, -9,-16,-15, -9, 1; /M: SY='C'; M= -7, -6, 8,-12,-13,-12,-17, 7,-13,-16, -5, -4, 0,-25,-10,-12, -7, -7,-11,-32, -8,-13; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M= -9, 14,-24, 15, 9,-24, -7, 10,-26, -1,-23,-16, 14,-13, 4, 0, 5, -1,-23,-30,-11, 5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -1, -1,-26, -3,-15,-27, 52,-15,-35,-16,-28,-19, 8,-18,-15,-16, 3,-14,-27,-23,-26,-15; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M=-12, -5,-27, -6, 1,-20,-23, -4,-12, 15,-14, -1, -5,-15, 5, 15, -9, -8, -9,-22, -6, 1; /M: SY='L'; M= -9,-30,-23,-34,-25, 5,-33,-24, 32,-29, 35, 20,-26,-26,-21,-23,-24, -9, 21,-21, -1,-24; /M: SY='V'; M= -8,-16,-17,-16, -5, -1,-27,-12, 4,-10, -1, 0,-17,-21, -7,-12,-10, -5, 8,-18, 2, -7; /M: SY='B'; M=-14, 43,-24, 43, 10,-30, -5, 4,-30, 0,-30,-25, 39,-15, 0, -5, 6, -4,-29,-40,-20, 5; /M: SY='A'; M= 44, -9,-11,-17, -9,-20, 2,-19,-12,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 13, 2, -2,-22,-20, -9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M=-13,-16,-14,-17, -9, -7,-22, -9, -8, 2, 6, 2,-11,-22, -4, 23,-15, -9, -6,-19, -6, -9; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: M= -4, -5,-17, -5, -1,-16,-20,-12, -6, -6, -6, -5, -6,-16, -6, -7, -2, -2, -2,-29,-12, -4; /M: SY='K'; M=-12, -3,-26, -3, 2,-22,-20, -2,-19, 15,-18, -7, -1, -3, 3, 11, -9, -7,-17,-24, -9, 1; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='M'; M= -9,-14,-20,-14, -8, -7,-25,-14, 0, -3, 2, 3,-14,-17, -8, -4,-12, -6, 3,-23, -6, -8; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='T'; M= 0, -3,-12, -7, -6,-10, -4, -8,-11, -8,-10, -7, -1, -7, -5, -8, 9, 15, -6,-19, -7, -6; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='K'; M= -2, -1,-21, -3, 1,-15,-14, -4,-16, 6,-14, -9, 0,-13, 1, 6, -3, -5,-12,-14, -6, 0; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='S'; M= 0, 3,-13, 3, 2,-20, -2,-10,-20, -3,-20,-15, 4,-11, -3, -5, 11, 6,-12,-28,-16, -1; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: M= -9, -2, -9, -3, -1,-14,-19, -4,-12, -7,-11, -6, -2,-19, -3, -5, -5, -5, -9,-28,-11, -2; /M: SY='L'; M= -2,-21,-12,-24,-17, -2,-22,-17, 9,-18, 15, 10,-19,-23,-15,-16,-12, -3, 9,-22, -3,-16; /M: SY='H'; M= -9, 5,-25, 5, 6,-21,-11, 7,-20, 1,-14, -9, 6,-13, 3, 0, -2, -7,-19,-29,-10, 3; /M: SY='R'; M= -9, 2,-26, 4, 12,-24,-11, -4,-25, 10,-19,-12, 2,-13, 9, 13, -1, -5,-21,-25,-13, 9; /M: SY='I'; M= -9,-27,-26,-35,-26, 1,-35,-23, 38,-25, 20, 24,-20,-21,-16,-24,-19, -7, 23,-19, 1,-25; /M: SY='E'; M=-11, 0,-22, 4, 10,-22,-22, -5,-13, 1,-11, -6, -4,-15, 7, 3, -5, -6, -9,-28,-12, 7; /M: SY='H'; M=-16, -8,-28,-10, -2, -3,-22, 34,-16, -9, -9, 0, -2,-21, 10, -4,-12,-14,-21,-10, 14, 2; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 43,-30, 10, 0,-15, 3, 0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 67,-23; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 56 in 56 different sequences |
| Number of true positive hits | 56 in 56 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase S30 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
56 sequences
MVP_BCMNN (P0CJ94), MVP_BTMV(P0CJ96), MVP_BYMV(P0CJ95), MVP_LMV0(P0CJ97), MVP_LMVE(P0CW79), MVP_PEMVC (P0CK01), MVP_PEMVM (P0CK00), MVP_PPVD(P0CK03), MVP_PPVNA (P0CK02), MVP_PPVSK (P0CK04), MVP_PRSVH (P0CJ98), MVP_PSBMV (P0CJ99), MVP_PVMA(P0CK05), MVP_PVYHU (P0CK06), MVP_PVYN(P0CJ93), MVP_SBMVG (P0CK07), MVP_SBMVN (P0CK08), MVP_TEV (P0CK09), MVP_TUMVJ (P0CK11), MVP_TUMVQ (P0CK12), MVP_TVMV(P0CK10), MVP_ZYMVC (P0CK13), MVP_ZYMVR (P0CK14), MVP_ZYMVS (P0CK15), POLG_BCMNN (Q65399), POLG_BSTV1 (Q65730), POLG_BTMV (Q6XW15), POLG_BVY3 (A0AUJ5), POLG_BYMV (P17765), POLG_LMV0 (P31999), POLG_LMVE (P89876), POLG_PEMVC (Q01500), POLG_PEMVM (O56075), POLG_PPVD (P13529), POLG_PPVNA (P17766), POLG_PPVRA (P17767), POLG_PPVSK (Q84934), POLG_PRSVH (Q01901), POLG_PSBMV (P29152), POLG_PVMA (Q85197), POLG_PVYC (P22601), POLG_PVYHU (Q02963), POLG_PVYN (P18247), POLG_PVYO (P22602), POLG_RGMVD (O11436), POLG_SBMVG (Q90069), POLG_SBMVN (P21231), POLG_SPMMV (P89201), POLG_TEV(P04517), POLG_TRMVU (A4KZ49), POLG_TUMVJ (P89509), POLG_TUMVQ (Q02597), POLG_TVMV (P09814), POLG_ZYMVC (P18479), POLG_ZYMVR (Q89330), POLG_ZYMVS (O36979)» more
|