PROSITE entry PS51871

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PV_P1_PRO
Accession [info]	PS51871
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	10-OCT-2018 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51871
Associated ProRule [info]	PRU01219

Name and characterization of the entry

Description [info]

Potyviridae P1 protease domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=146;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=141;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1616805; R2=0.0203956; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8510.0996094; R2=5.5040131; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=385; H_SCORE=10629; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=213; H_SCORE=9682; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K';  M= -2,  2,-27,  3,  8,-28, -9, -9,-28, 25,-25,-13,  0,-11,  5, 18, -4, -9,-19,-23,-15,  6;
/M: SY='M';  M= -9,-23,-24,-24,-15,  1,-25,-15,  7,-16, 10, 14,-22,  0,-10,-15,-17, -8,  3,-21, -6,-13;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-13, -6, -9,-13,-14,-14, -6, -6,-15, -9,  6,-16, -9, -8, 14, 19,  2,-33,-14, -9;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-23,  2, 13,-23,-17, -8,-18,  7,-19,-12,  5, -4,  5,  0,  2,  3,-15,-29,-16,  9;
/M: SY='V';  M=  5,-14,-16,-20,-16, -8,-17,-19,  5,-14, -3, -1,-13,-18,-12,-15,  1, 11, 12,-22, -5,-15;
/M: SY='S';  M= -4,  8,-23, 12,  5,-29,  3,  4,-28, -5,-27,-16,  8,-12, 10, -7, 14, -1,-23,-32,-16,  7;
/M: SY='V';  M= -7,-29,-17,-33,-28, 15,-31,-25, 26,-24, 18, 14,-26,-28,-27,-21,-17, -5, 31,-20,  0,-27;
/M: SY='B';  M= -6, 10,-21,  9,  6,-24, -5, -4,-20, -4,-20,-10,  9,-12,  7, -6, 10,  5,-18,-31,-16,  7;
/M: SY='K';  M= -9, -5,-27, -5,  3,-24,-12,  7,-21, 15,-17, -2, -2,-14, 12,  9, -6,-10,-19,-23, -7,  7;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-20,-34,-24, 39,-30,-20, 12,-30, 33, 12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,  6, -7, 13,-24;
/M: SY='M';  M=  3,-23, -9,-30,-22, -4,-24,-19, 18,-20, 15, 19,-21,-23,-16,-20,-14, -7, 16,-24, -7,-20;
/M: SY='R';  M=-13, -6,-28, -7,  1,-23,-12, -7,-29, 29,-23,-11,  0,-16,  6, 42, -7, -6,-19,-21,-12,  1;
/M: SY='Q';  M= -5, -2,-23, -1, -1,-21,-19,-10, -8, -2, -8, -4, -4,-15,  6, -2, -2, -2, -6,-26,-11,  1;
/M: SY='L';  M= -7,-28,-19,-31,-24,  4,-32,-25, 27,-26, 30, 16,-26,-27,-22,-22,-20, -4, 24,-23, -3,-24;
/M: SY='L';  M= -4,-18,-12,-22,-16,-11,-12,-21, -1,-10,  5,  2,-15,-22,-14,-12,-15,-11, -2,-23,-11,-16;
/M: SY='D';  M= -8, 23,-26, 25, 16,-30,-11, -1,-28, 13,-27,-19, 18,-11,  7,  3,  1, -7,-25,-31,-17, 11;
/M: SY='I';  M= -8,-19,-25,-25,-17, -8,-30,-18, 23,-19, 12, 12,-13,-21, -5,-17,-14, -8, 14,-23, -5,-13;
/M: SY='C';  M=  2,-10, 21,-19,-16, -9,-15,-13,-12,-14,-10,  0, -6,-23,-12,-13,  0, -3, -6,-31,-15,-14;
/M: SY='K';  M= -3, -5,-26, -6,  6,-24,-19,-11,-17, 22,-16, -5, -5,-12,  8, 11, -6, -7,-13,-22,-11,  6;
/M: SY='A';  M= 11, -6,-20, -8,  4,-19, -7,-13,-14, -1,-10, -9, -5,-13, -3, -4, -1, -6, -8,-24,-17,  0;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='K';  M= -9,  3,-24,  1, -2,-14,-10,  4,-23,  6,-21,-12,  6,-15, -3,  1,  0,  1,-18,-22, -1, -3;
/M: SY='N';  M= -8, 13,-27,  8, -2,-27, 14, -6,-30,  5,-29,-18, 20,-11, -4,  1,  0,-10,-28,-29,-21, -4;
/M: SY='I';  M= -3,-21,-24,-26,-21,-10, -9,-21, 14,-20,  6, 10,-16,-21,-13,-20,-12,-10, 10,-21,-10,-19;
/M: SY='N';  M= -4,  5,-21,  1,  5,-22,-13, -7,-16,  4,-23,-13, 10, -5,  4, -1,  8,  3,-14,-32,-17,  4;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-21,-35,-28,  2,-35,-28, 38,-26, 21, 16,-25,-25,-24,-25,-18, -6, 34,-24, -4,-28;
/M: SY='E';  M=-11,  9,-30, 17, 52,-29,-20, 14,-30,  7,-20,-17,  1, -3, 19,  0, -1,-11,-30,-30,-14, 34;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-22,-33,-26, 18,-32,-21, 24,-27, 27, 14,-25,-28,-24,-22,-22, -8, 18,-14,  8,-26;
/M: SY='I';  M= -3,-27,-22,-34,-27, -2,-33,-29, 37,-25, 14, 14,-20,-21,-21,-26,-13, -3, 31,-23, -4,-27;
/M: SY='G';  M= -1,  6,-28, 10, -8,-31, 41,-14,-37,-14,-29,-22,  5,-16,-13,-17,  3,-14,-27,-26,-26,-11;
/M: SY='K';  M=-12, -3,-30, -3,  5,-27,-13, -8,-31, 39,-27,-11,  0,-13,  8, 36, -9,-11,-21,-20,-12,  5;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K';  M= -9, -1,-23, -3,  3,-21,-18,  1,-23, 24,-21, -8,  1,-11,  5, 18, -2,  3,-15,-22, -6,  3; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='R';  M= -7, -7,-19, -8, -4,-16,-17, -2,-14,  9,-16, -6, -3,-15, -1, 15,  1,  3, -4,-25, -8, -4; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K';  M= -6,  4,-16,  2,  6,-17,-10, -2,-15, 20,-16, -6,  5, -7,  9, 13, -3, -5,-13,-13, -7,  7; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='T';  M=  1, -5, -9, -7, -5, -7,-10, -9, -4,  2, -5, -3, -4, -8, -4,  4,  1,  5,  2,-13, -6, -5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='T';  M= -2, -1,-14, -9, -9,-11,-14,-14, -8, -7,-11, -8,  3,-13, -8, -4, 12, 25, -2,-27,-11, -9; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='R';  M=-11,  0,-26, -3,  3,-23,-19, -1,-23, 25,-22, -9,  5,-15,  9, 27, -4, -3,-17,-24, -9,  4;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-21,-30,-23, 10,-27,-22, 20,-26, 25, 12,-23,-26,-22,-21,-19, -4, 15,-18,  2,-23;
/M: SY='D';  M=-10,  8,-23, 12,  5,-26,-14,  8,-23,  1,-22,-13,  6,-15,  8,  7,  6, -2,-16,-31,-11,  5;
/M: SY='F';  M=-14,-23,-27,-25,-17, 23,-28,-13,  0,-16,  3, -1,-19, -4,-20,-15,-17, -8, -5, -4, 16,-19;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='R';  M= -5,-14,-21,-18,-12, -1,-23,-14, -3,  3, -7, -2,-11,-19,-10,  4, -7,  0,  3,-15,  2,-12; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='K';  M=-11, -7,-27, -7,  0,-18,-13, -4,-20, 18,-15, -6, -5,-16,  9, 18, -9, -8,-17,-15, -1,  3; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -9, -5,-23, -8,  1,-10,-23, -6,-15, 12,-15, -6, -4,-14, -3,  5, -4,  3, -9,-21, -4, -1;
/M: SY='H';  M=-11,  4,-25,  4,  1,-16, -6, 36,-25,-10,-19,-10,  9,-17,  0, -7,  0,-10,-23,-29, -1, -1;
/M: SY='G';  M= -8, -8,-25,-12,-10,-13,  6,-12,-21,  1,-13, -5, -2,-19, -8,  5, -6, -6,-15,-20,-12,-10;
/M: SY='K';  M= -3, -5,-25, -7, -3,-23,  0,-15,-24, 16,-20,-10, -3,-14, -3,  6, -4, -3,-16,-22,-14, -3;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='V';  M= -5, -8,-15, -9,-12, -7,-21, -7,  3, -8, -3, -1, -9,-16,-11, -9, -2,  7, 10,-21, -1,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-14,-20,-23,-23,-17, 25,-24, -4, -4,-11,  2,  2,-14,-25,-14, -1,-11, -6, -5, -2, 25,-16;
/M: SY='L';  M= 11,-21,  5,-27,-19,  0,-19,-22,  0,-23, 14,  1,-20,-24,-19,-22,-12, -6,  3,-22, -9,-19;
/M: SY='R';  M=-13, -8,-28, -9, -2,-16,-20, 18,-22, 16,-18, -6, -2,-19,  5, 30,-10,-11,-15,-19,  3, -2;
/M: SY='C';  M= -2,-20, 23,-25,-23,-10,-26,-14,  0,-22, -1, -2,-18,-28,-21,-21, -8, -2, 11,-33,-12,-23;
/M: SY='Q';  M=-12,  4,-29,  3, 14,-28,-13, 17,-27, 13,-23, -9,  8,-13, 20, 15, -4,-11,-27,-25, -9, 16;
/M: SY='L';  M= -5,-21,-15,-23,-18,  1,-27,-21, 12,-21, 23,  9,-21,-24,-17,-16,-11,  9, 14,-25, -5,-17;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-28, -6,  3,-25,-17, -6,-25, 26,-22,-10,  0, -8,  9, 32, -7, -9,-19,-22,-12,  4;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='M';  M= -4,-11,-21,-13,  1,-10,-22, -4,  0, -9,  5, 11,-12,-15, -3,-10, -8, -1, -1,-25, -7, -1;
/M: SY='N';  M=-10,  0,-23, -4, -5, -5,-18, -6, -8, -5, -5,  0,  3,-18, -2, -3, -6, -2,-10,-22, -4, -4;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-28, -8,-13,-28, 47,-16,-35,-11,-27,-18,  1,-18,-14, -9,  0,-16,-26,-22,-26,-13;
/M: SY='R';  M= -9, -6,-18, -7, -4,-13,-20, -9,-12,  1, -9, -6, -4,-16, -2,  4, -6, -4, -9,-23, -6, -4;
/M: SY='R';  M=-14,-10,-27,-12, -7, -6,-23, -8, -6,  1, -5,  1, -5,-13, -4, 10,-12, -8, -8,-18, -1, -8;
/M: SY='K';  M= -3, -7,-23, -8,  1,-16,-17, -6,-15,  5,-15, -8, -4, -7,  0,  4, -1, -4,-10,-24,-10, -1;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='R';  M=-13, -5,-19, -5,  2,-21,-19, -6,-23, 17,-17,-10, -2,-17,  6, 33, -5, -7,-16,-24,-12,  2; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='R';  M=-12,  1,-24,  4, -4,-19,-16, -7,-14,  5,-15, -9, -2,-19, -4,  9, -6, -5, -5,-26, -9, -5;
/M: SY='D';  M=-19, 47,-30, 67, 23,-39,-11,  0,-39,  1,-29,-29, 19, -9,  1, -9,  0,-10,-30,-39,-20, 12;
/M: SY='L';  M= -9,-24,-12,-29,-21,  6,-27,-17, 16,-21, 23, 20,-22,-25,-16,-16,-18, -5, 12,-22, -2,-19;
/M:         M=-11, -4,-26, -2, -3,-11,-20, -2,-13, -3,-14, -9, -3, -4, -5, -3, -5, -5,-11,-22, -1, -6;
/M:         M= -6,-13,-14,-14, -6,-13,-23,-13, -3,-13, -6, -4,-12,  0, -9,-16, -6, -5, -4,-28,-13, -9;
/M: SY='D';  M=-10, 18,-25, 23, 13,-29, -9,  0,-28,  0,-25,-19, 12, -6,  4, -3,  5, -1,-24,-33,-17,  8;
/M: SY='E';  M= -5, -5,-19, -4,  3,-17,-17,-13,-11, -3,-12, -7, -6, -6, -5, -5, -4, -4, -7,-27,-15, -2;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='W';  M= -3, -8,-18, -9, -5,  2,-10,-11,-11, -7, -9, -9, -8,-10, -9, -8, -5, -4, -9,  6,  1, -6; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-15, -6, -4, -8,-10, -8, -7, -8, -5, -4, -6,-12, -4, -8, -2,  3, -5, -5, -4, -4; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='R';  M=-11,  2,-26,  4,  8,-21,-17, -5,-20,  8,-17,-12,  2,-10,  4, 13, -3, -4,-17,-25,-11,  5;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-26,  2, 10,-22,-11, -1,-21,  0,-20,-12,  0, -4,  4, -4,  2, -3,-19,-23,-12,  6;
/M: SY='F';  M=-12,-28,-22,-34,-26, 24,-30,-23, 15,-26, 16,  8,-24,-26,-25,-21,-20, -7,  9,  4, 11,-25;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-21,-32,-23, 13,-31,-22, 24,-26, 29, 17,-25,-27,-20,-21,-22, -8, 18,-18,  2,-22;
/M: SY='E';  M=-11,  0,-14,  1,  5,-18,-19,  0,-19, -2,-12, -8, -2,-13,  2,  0, -3, -2,-16,-29,-10,  3;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='H';  M= -5, -9,-19,-11, -4,-16,-19,  8,-10, -6, -8, -2, -5,-17,  3, -3, -5, -6,-11,-17, -3, -2; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='L';  M= -3,-27,-21,-31,-22, 13,-27,-19, 16,-25, 25, 11,-24,-26,-21,-21,-20, -8, 10,-10,  7,-22;
/M: SY='A';  M= 14,-11, -3,-17,-10,-17,-10,-12,-12, -6,-12, -5, -8,-17, -6, -8,  3, -2, -4,-26,-15, -8;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-27,  3,  3,-25, -4, -2,-28, 16,-24,-13,  6,-14,  3, 13, -4, -8,-22,-23,-12,  2;
/M: SY='T';  M= -2,-13, -1,-18,-16,-11,-11,-15,-10,-11,-11, -7,-10,-21,-13,-10, -1,  3, -1,-25,-10,-15;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='Y';  M= -9,-13,-22,-16,-14,  7,-16, -8, -2,-16,  0, -2, -8,-19,-14,-13, -7, -3, -4,-14,  8,-15; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='E';  M=  1, -3,-22, -3,  4,-23, -2, -6,-21,  1,-20,-12, -1,-13,  1,  1,  4, -4,-14,-26,-15,  1; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M:         M=-10,-11,-26,-13,-10, -6,-13, -9,-12, -7,-14,-10, -5, -7, -8, -3, -5, -3,-12,  0,  0,-10; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='T';  M= -3,-10,-14,-11, -5,-14,-14, -9,-12, -4,-11, -7, -8,-15, -8, -4, -1,  2, -4,-26,-10, -7;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -7,  1,-25,  1,  3,-23,-13, -4,-22, 11,-22,-11,  3, -4,  3, 13,  0, -2,-17,-27,-14,  2; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M= -2, -8,-23, -8, -1,-19,-19, -5, -9,  2,-12, -5, -6,-10,  1, -1, -3, -4, -5,-26,-10, -1;
/M: SY='V';  M= -5,-16,-20,-20,-16, -5,-26,-15, 13,-15,  1,  3,-12,-18,-15,-14, -6,  1, 16,-26, -7,-17;
/M: SY='R';  M=-11,  4,-22,  5,  4,-21,-17,  4,-22,  8,-17, -9,  5,-15,  4, 11, -1, -2,-17,-28, -8,  3;
/M: SY='T';  M= -6, -2,-18, -1, -2,-13,-18,-11, -8, -9, -8, -7, -4,-10, -6,-12,  0,  1, -6,-27, -9, -5;
/M: SY='S';  M= -4, -4,-22, -6, -4,-13, -4,  0,-18, -8,-17,-11,  1,-16, -2, -6,  5, -1,-15,-21, -7, -3;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -7, 10,-23, 12, 19,-22,-13, -3,-19,  3,-17,-10,  6,-10,  5, -2,  2, -4,-17,-26,-15, 12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-22,-35,-28,  7,-35,-27, 35,-27, 23, 16,-25,-25,-24,-25,-19, -7, 29,-21, -1,-28;
/M: SY='R';  M= -5, -5, -7, -9, -4,-18,-19, -9,-19,  6,-17,-10, -1,-16, -2, 12,  3, 10,-10,-28,-12, -4;
/M: SY='P';  M= -8,-12,-30,-11, -3,-14,-20,  0,-20,  6,-19,-10, -9, 15, -4,  6,-10,-10,-20,-19, -6, -6;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='W';  M=-13,-10,-33, -8,-12, -8,-15, -9,-22,-13,-21,-16,-12,-20, -9,-14,-10, -9,-22, 47,  7, -8;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-26,-17,-30,-24,  6,-27,-24, 21,-22, 18, 11,-24,-25,-22,-19,-14, -5, 23,-21, -4,-23;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-20,-33,-27,  0,-34,-28, 34,-24, 16, 13,-22,-23,-22,-24,-13,  0, 32,-24, -4,-27;
/M: SY='L';  M=-11,-28,-21,-32,-23, 19,-31,-20, 19,-27, 30, 15,-25,-27,-22,-20,-23, -7, 13,-14,  8,-23;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='H';  M= -8,  0,-22, -2, -2,-16,-14,  9,-15,  0,-13, -6,  5,-10,  3,  3, -3, -4,-15,-21, -6, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='K';  M= -6,  0,-26,  1,  7,-23,-11, -5,-20,  8,-21,-12,  1,  3,  6,  3, -3, -6,-20,-18,-13,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D';  M= -9,  8,-23, 10,  6,-20, -7, -2,-21,  7,-19,-10,  6,-10,  2,  5, -2, -7,-18,-22,-10,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N';  M= -6,  5,-19,  3,  0,-14,-12, -5,-10,  0,-13, -8,  6,-13,  3, -2,  1, -3,-10,-18, -9,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L';  M= -4,-18, -7,-19,-14, -3,-19,-17,  9,-17, 11,  6,-18,-17,-15,-16,-13, -6, 10,-20, -6,-15; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M:         M=  0, -2,-17, -2, -1,-15,-10, -6,-10, -2, -9, -7, -2, -4,  0, -3,  0, -1, -9,-19,-10, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-21,  2,  3,-19,  2, -5,-18, -2,-15,-10,  1, -3,  0, -3, -1, -6,-16,-19,-13,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -5, -1, -3,  0,  2,-16,-12,  0,-15, -1,-14, -9, -2, -5, -1, -1, -1, -5,-11,-22,-10,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -9,  0,-17,  2,  4, -8,-12, -3, -9,  0, -7, -4, -3, -5,  3,  2, -5, -6, -9,-13, -4,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M:         M= -5, -7,-18, -8, -3, -4, -1, -2,-14, -6,-10, -5, -3,-13, -3, -6, -2, -7,-11,-14, -4, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -8, -7,-22, -6, -2,-15,-13, -5,-11,  2,-12, -5, -5,-12, -3,  9, -6, -6, -6,-18, -9, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Y';  M= -8,-10,  0,-12, -9, -1,-17, -2,-15,-11,-12, -9, -8,-17, -8, -8, -4, -5,-12,-10,  2, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='V';  M= -6,-13,-22,-16,-14, -4,-19,-14,  0, -8, -6, -2, -9,-13,-12, -4, -7, -4,  2,-17, -4,-14; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='D';  M= -8, 16,-26, 20,  0,-26,  9,  2,-30, -6,-26,-19, 14,-15, -3, -8,  4, -6,-25,-29,-14, -2;
/M: SY='D';  M= -8, 16,-27, 20,  6,-30, 11, -6,-31, -1,-26,-18, 12,-14, -1, -7,  1,-10,-25,-30,-21,  2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -8,-24,-21,-29,-19, 13,-28,-17, 17,-23, 22, 13,-20,-23,-18,-19,-17, -5, 10,-14,  6,-19; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-15,-26,  7,-35,-28, 43,-27,-22, -4,-27,  5, -3,-19,-30,-33,-20,-16, -7,  0, -9, 10,-28;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-18,-33,-29, -1,-33,-29, 37,-24, 13, 13,-25,-25,-25,-24,-13, -4, 40,-26, -6,-29;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='R';  M=-17, -9,-29,-10,  2,-22,-20,  1,-23, 21,-15, -3, -2,-18, 19, 49, -9,-10,-19,-20, -9,  7;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R';  M=-12, -9,-29, -9,  2,-20,-19, -7,-23, 22,-19,-10, -3,-16,  6, 39, -8, -9,-16,-15, -9,  1;
/M: SY='C';  M= -7, -6,  8,-12,-13,-12,-17,  7,-13,-16, -5, -4,  0,-25,-10,-12, -7, -7,-11,-32, -8,-13;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D';  M= -9, 14,-24, 15,  9,-24, -7, 10,-26, -1,-23,-16, 14,-13,  4,  0,  5, -1,-23,-30,-11,  5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-26, -3,-15,-27, 52,-15,-35,-16,-28,-19,  8,-18,-15,-16,  3,-14,-27,-23,-26,-15; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=-12, -5,-27, -6,  1,-20,-23, -4,-12, 15,-14, -1, -5,-15,  5, 15, -9, -8, -9,-22, -6,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-23,-34,-25,  5,-33,-24, 32,-29, 35, 20,-26,-26,-21,-23,-24, -9, 21,-21, -1,-24;
/M: SY='V';  M= -8,-16,-17,-16, -5, -1,-27,-12,  4,-10, -1,  0,-17,-21, -7,-12,-10, -5,  8,-18,  2, -7;
/M: SY='B';  M=-14, 43,-24, 43, 10,-30, -5,  4,-30,  0,-30,-25, 39,-15,  0, -5,  6, -4,-29,-40,-20,  5;
/M: SY='A';  M= 44, -9,-11,-17, -9,-20,  2,-19,-12,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 13,  2, -2,-22,-20, -9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M=-13,-16,-14,-17, -9, -7,-22, -9, -8,  2,  6,  2,-11,-22, -4, 23,-15, -9, -6,-19, -6, -9; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M:         M= -4, -5,-17, -5, -1,-16,-20,-12, -6, -6, -6, -5, -6,-16, -6, -7, -2, -2, -2,-29,-12, -4;
/M: SY='K';  M=-12, -3,-26, -3,  2,-22,-20, -2,-19, 15,-18, -7, -1, -3,  3, 11, -9, -7,-17,-24, -9,  1;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='M';  M= -9,-14,-20,-14, -8, -7,-25,-14,  0, -3,  2,  3,-14,-17, -8, -4,-12, -6,  3,-23, -6, -8; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='T';  M=  0, -3,-12, -7, -6,-10, -4, -8,-11, -8,-10, -7, -1, -7, -5, -8,  9, 15, -6,-19, -7, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-21, -3,  1,-15,-14, -4,-16,  6,-14, -9,  0,-13,  1,  6, -3, -5,-12,-14, -6,  0; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-13,  3,  2,-20, -2,-10,-20, -3,-20,-15,  4,-11, -3, -5, 11,  6,-12,-28,-16, -1; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M:         M= -9, -2, -9, -3, -1,-14,-19, -4,-12, -7,-11, -6, -2,-19, -3, -5, -5, -5, -9,-28,-11, -2;
/M: SY='L';  M= -2,-21,-12,-24,-17, -2,-22,-17,  9,-18, 15, 10,-19,-23,-15,-16,-12, -3,  9,-22, -3,-16;
/M: SY='H';  M= -9,  5,-25,  5,  6,-21,-11,  7,-20,  1,-14, -9,  6,-13,  3,  0, -2, -7,-19,-29,-10,  3;
/M: SY='R';  M= -9,  2,-26,  4, 12,-24,-11, -4,-25, 10,-19,-12,  2,-13,  9, 13, -1, -5,-21,-25,-13,  9;
/M: SY='I';  M= -9,-27,-26,-35,-26,  1,-35,-23, 38,-25, 20, 24,-20,-21,-16,-24,-19, -7, 23,-19,  1,-25;
/M: SY='E';  M=-11,  0,-22,  4, 10,-22,-22, -5,-13,  1,-11, -6, -4,-15,  7,  3, -5, -6, -9,-28,-12,  7;
/M: SY='H';  M=-16, -8,-28,-10, -2, -3,-22, 34,-16, -9, -9,  0, -2,-21, 10, -4,-12,-14,-21,-10, 14,  2;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-25,-23, 43,-30, 10,  0,-15,  3,  0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 67,-23;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	56 in 56 different sequences
Number of true positive hits	56 in 56 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase S30
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

56 sequences

MVP_BCMNN   (P0CJ94), MVP_BTMV(P0CJ96), MVP_BYMV(P0CJ95),

MVP_LMV0(P0CJ97), MVP_LMVE(P0CW79), MVP_PEMVC   (P0CK01), 
MVP_PEMVM   (P0CK00), MVP_PPVD(P0CK03), MVP_PPVNA   (P0CK02), 
MVP_PPVSK   (P0CK04), MVP_PRSVH   (P0CJ98), MVP_PSBMV   (P0CJ99), 
MVP_PVMA(P0CK05), MVP_PVYHU   (P0CK06), MVP_PVYN(P0CJ93), 
MVP_SBMVG   (P0CK07), MVP_SBMVN   (P0CK08), MVP_TEV (P0CK09), 
MVP_TUMVJ   (P0CK11), MVP_TUMVQ   (P0CK12), MVP_TVMV(P0CK10), 
MVP_ZYMVC   (P0CK13), MVP_ZYMVR   (P0CK14), MVP_ZYMVS   (P0CK15), 
POLG_BCMNN  (Q65399), POLG_BSTV1  (Q65730), POLG_BTMV   (Q6XW15), 
POLG_BVY3   (A0AUJ5), POLG_BYMV   (P17765), POLG_LMV0   (P31999), 
POLG_LMVE   (P89876), POLG_PEMVC  (Q01500), POLG_PEMVM  (O56075), 
POLG_PPVD   (P13529), POLG_PPVNA  (P17766), POLG_PPVRA  (P17767), 
POLG_PPVSK  (Q84934), POLG_PRSVH  (Q01901), POLG_PSBMV  (P29152), 
POLG_PVMA   (Q85197), POLG_PVYC   (P22601), POLG_PVYHU  (Q02963), 
POLG_PVYN   (P18247), POLG_PVYO   (P22602), POLG_RGMVD  (O11436), 
POLG_SBMVG  (Q90069), POLG_SBMVN  (P21231), POLG_SPMMV  (P89201), 
POLG_TEV(P04517), POLG_TRMVU  (A4KZ49), POLG_TUMVJ  (P89509), 
POLG_TUMVQ  (Q02597), POLG_TVMV   (P09814), POLG_ZYMVC  (P18479), 
POLG_ZYMVR  (Q89330), POLG_ZYMVS  (O36979)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment