 |
|
| Entry: PS51887 |
General information about the entry
| Entry name [info] | APHTHOVIRUS_LPRO |
| Accession [info] | PS51887 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
08-MAY-2019 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 07-APR-2021 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51887 |
| Associated ProRule [info] | PRU01235 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Aphthovirus leader protease (L(pro)) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=154; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=149; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0845935; R2=0.0117033; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=27719.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=805; H_SCORE=27719; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=378; H_SCORE=27719; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -6,-24,-16,-30,-24, 0,-24,-11, 24,-14, 16, 41,-24,-24,-11,-14,-16, -6, 25,-24, -4,-18; /M: SY='E'; M= -6, -5,-22, 1, 26,-19,-24,-11, -7, -1, -9, -9,-11,-11, 1, -8, -4, -6, 0,-30,-16, 13; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 72,-30,-20, 2,-30, 14, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='V'; M= 0,-18,-10,-22,-22, -4,-26,-26, 14,-16, 2, 2,-18,-22,-22,-16, 2, 20, 30,-30,-10,-22; /M: SY='L'; M=-10,-26,-28,-22,-12, -5,-26,-20, 5,-22, 20, 5,-26, 16,-16,-20,-22,-10, -5,-24,-11,-16; /M: SY='H'; M=-20, -7,-30, -7, -7, -3,-23, 73,-20,-10,-13, 0, 0,-23, 3, -3,-13,-17,-23,-10, 40, -7; /M: SY='N'; M=-12, 15,-22, 9, -4,-12,-13, -3, -8,-11, 0, -6, 20,-22, -8, -9, -7, -5,-15,-32,-12, -6; /M: SY='G'; M= -8, 13,-30, 20, -5,-34, 40,-12,-40,-12,-30,-24, 8,-16,-12,-16, 0,-16,-30,-28,-26, -9; /M: SY='E'; M=-10, 6,-30, 12, 41,-30,-20, -4,-30, 25,-24,-16, 0, -4, 16, 11, -4,-10,-26,-26,-16, 29; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 14,-34,-20, -2,-26, 35,-26, -6, 0,-10, 29, 22, -6,-10,-24,-20,-10, 21; /M: SY='K'; M= -6,-11,-22,-11, -5,-19,-24,-18, -7, 23,-15, -2,-11,-18, -5, 11,-10, -6, 7,-24,-10, -5; /M: SY='R'; M= -8, -8,-18,-13, -9,-12,-22,-14,-11, 4,-11, -7, -5,-17, -6, 19, 4, 19, 0,-26,-10, -9; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 53,-30,-20, 8,-30, 25, 8,-24,-30,-32,-20,-24,-10, 4, -1, 19,-26; /M: SY='Y'; M=-12,-12,-22,-16,-16, 15,-26, 5, -4,-10, -4, -4,-12,-22,-10,-10, -5, 13, -6, 7, 46,-16; /M: SY='G'; M= 6, -4,-18, -4, -8,-24, 27,-14,-28,-14,-30,-20, 6,-14, -8,-14, 25, 5,-18,-32,-24, -8; /M: SY='R'; M=-16,-18,-26,-18, -8, -9,-24, -8,-11, 7, 7, 1,-11,-24, -1, 36,-18,-10, -9,-20, -6, -8; /M: SY='P'; M=-14,-12,-36, -6, 0,-26,-20, 26,-24,-10,-26,-12, -9, 48, -2,-12,-10,-14,-30,-30,-11, -6; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='Y'; M=-14, 8,-26, 0, -5, -3,-16, 9,-15, 8,-19,-10, 16,-22, -2, 3, -6, -6,-20, -9, 20, -5; /M: SY='H'; M=-20, 19,-30, 27, 8,-28,-16, 62,-34, -6,-24,-11, 14,-16, 6, -4, -6,-16,-30,-34, 5, 4; /M: SY='D'; M=-12, 32,-26, 33, 3,-30, 12, -1,-32, -5,-30,-24, 31,-16, -5, -8, 4, -8,-30,-35,-22, -1; /M: SY='N'; M= -6, 25,-16, 9, -4,-16, -8, -1,-16, -4,-22,-16, 37,-16, -4, -4, 14, 19,-19,-36,-16, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='A'; M= 27, -5,-10,-13, -8,-17, -6,-18,-12,-10,-15,-12, -3,-10, -8,-15, 20, 19, -2,-27,-17, -8; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='L'; M= -6,-19,-16,-22,-16, 2,-26,-20, 9,-22, 27, 9,-19,-22,-16,-16,-11, 13, 6,-24, -4,-16; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='F'; M=-12,-19,-16,-29,-22, 46,-26,-20, -4,-22, 2, -4,-12,-22,-29,-16, -5, 13, 0, -5, 15,-22; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 8,-28,-20, 4,-26, 22,-20, -6, 0,-16, 29, 47, -6,-10,-24,-20,-10, 15; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-30,-28,-24, 19,-34, 1, 19,-18, 8, 8,-20,-26,-14,-18,-20,-10, 5, 11, 50,-24; /M: SY='V'; M= -4,-30,-14,-30,-26, 4,-30,-26, 26,-24, 25, 14,-30,-30,-26,-20,-18, -4, 35,-26, -6,-26; /M: SY='D'; M=-11, 23,-30, 34, 9,-35, 19, -8,-39, -6,-29,-25, 10,-13, -5,-13, 0,-14,-30,-31,-24, 2; /M: SY='E'; M=-10, -5,-30, -3, 26,-19,-28,-11, 0, -5, -5, -5, -8, -8, 5,-11, -8,-10, -7,-26,-12, 13; /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10, 0,-26,-20,-12,-24, 5,-26,-16,-12, 48, -2, 14,-10,-10,-26,-26,-22, -6; /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24, 37,-30,-20, 12,-30, 34, 12,-26,-30,-28,-20,-26,-10, 6, -8, 12,-24; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='D'; M=-18, 41,-30, 59, 29,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 15, -8, 5, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 17; /M: SY='W'; M= -9,-12,-33, -8, 11,-12,-15,-14,-24, -6,-22,-20,-13,-14, 0,-10, -7,-11,-25, 38, 0, 7; /M: SY='H'; M=-10, -9,-22, -7, 2,-14,-24, 26, -6, -9, -8, -1, -8,-19, -3, -8, -8,-10, 1,-30, -1, -3; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 49,-30, 5, 0,-18, 4, 0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 22, 61,-24; /M: SY='G'; M= -4, 1,-23, -5,-12,-17, 20,-10,-18,-16,-12,-11, 11,-21,-12,-13, 0, -8,-19,-28,-19,-12; /M: SY='N'; M= 2, 15,-14, 8, 0,-20, 0, -2,-20, -6,-30,-20, 29,-14, 0, -6, 29, 12,-18,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M=-14,-16,-36,-10, 0,-26,-20,-12,-24, 5,-26,-16,-12, 48, -2, 14,-10,-10,-26,-26,-22, -6; /M: SY='E'; M= -6, 2,-30, 9, 30,-30, 14, -8,-34, -1,-24,-20, 0, -8, 5, -8, 0,-14,-30,-26,-24, 17; /M: SY='N'; M=-10, 13,-20, 1, -8, -9,-11, -1, -5,-11, 0, -5, 26,-24, -8, -8, -5, -4,-15,-32,-12, -8; /M: SY='F'; M=-14,-23,-22,-27,-17, 27,-28,-18, 1,-12, 17, 6,-19,-25,-21, -9,-22,-10, -1, -9, 9,-17; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='L'; M=-14,-22,-24,-22,-12, -1,-26,-12, 1, -7, 23, 9,-19,-26, -9, 14,-22,-10, -1,-20, -4,-12; /M: SY='D'; M=-14, 20,-30, 30, 27,-34,-16, -4,-34, 22,-27,-20, 7, -7, 9, 8, -4,-10,-26,-30,-16, 18; /M: SY='A'; M= 17, -8,-12,-18,-12,-12,-12,-15, -3,-10, -3, 6, -8,-12, -8,-14, 7, 17, 2,-24,-12,-10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='K'; M=-14, 19,-30, 27, 14,-34,-16, -6,-34, 31,-30,-18, 8,-10, 6, 15, -6,-10,-24,-28,-14, 10; /M: SY='W'; M=-14,-15,-38,-15, 1,-21,-20, -5,-20, -1,-20, -8,-15,-18, 30, -1,-15,-18,-30, 45, 5, 17; /M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24, 6,-30,-24, 24,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 25,-24, -4,-24; /M: SY='E'; M= 2, 4,-18, 8, 24,-24, -8, -6,-24, -2,-26,-20, 6, -6, 8, -6, 24, 8,-18,-36,-20, 16; /M: SY='D'; M=-17, 43,-29, 56, 24,-36,-10, 1,-36, 2,-28,-27, 22,-10, 3, -7, 1, -9,-30,-38,-20, 13; /M: SY='Y'; M=-14,-16,-26,-18, -6, 4,-26, 1, -2,-10, 7, 5,-15,-22, 10, -6,-15,-10,-11, -5, 18, 2; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='G'; M= -2, -8,-30, -8,-13,-30, 49,-18,-38, -4,-30,-18, 0,-18,-13, -9, -2,-18,-28,-20,-25,-13; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 31,-30, 39, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M=-16, 34,-30, 50, 36,-36,-14, 0,-36, 4,-26,-26, 12, -6, 8, -6, 0,-10,-30,-36,-20, 22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M= -9, -2,-25, -2, 4,-24,-15, 18,-28, 19,-26,-10, 5,-14, 8, 20, 1, -5,-20,-27, -5, 4; /M: SY='E'; M= -5, 15,-22, 24, 28,-28,-10, -4,-28, 0,-26,-22, 8, -6, 8, -6, 15, 1,-22,-36,-20, 18; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 19,-10,-22,-14,-16,-26, 43,-20,-29,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20, 4,-12,-19,-20,-26,-16; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='A'; M= 27,-18,-14,-24,-14, -9,-11,-20, 1,-18, 13, 1,-18,-18,-14,-20, -5, -4, 4,-20,-12,-14; /M: SY='L'; M= -6,-30,-16,-30,-24, 6,-30,-24, 24,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 25,-24, -4,-24; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28; /M: SY='W'; M=-20,-32,-42,-32,-26, 18,-24,-11,-12,-16,-12,-12,-32,-30,-16,-16,-32,-22,-22,104, 49,-20; /M: SY='N'; M=-10, 9,-24, 1, -1,-17,-14, -4,-15, 12,-12, -7, 17,-18, -1, 7, -7, -6,-17,-28,-12, -1; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 39,-30, 31, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 22,-20, 0,-26; /M: SY='W'; M=-14,-15,-38,-15, -5,-15,-20,-18,-26, 23,-26,-14,-15,-18, -1, 11,-21,-18,-24, 45, 5, -1; /M: SY='H'; M=-16, 11,-30, 16, 12,-32,-18, 43,-28, 0,-22, -7, 8,-14, 27, 2, -4,-14,-30,-28, -1, 17; /M: SY='H'; M=-14,-16, 8,-19,-15, -8,-26, 23,-10,-22, 7, 3,-13,-28,-11,-15,-18,-14,-10,-31, 1,-15; /M: SY='L'; M= -6,-22,-24,-22,-20, -5, 8,-20, -3,-26, 20, 5,-19,-26,-20,-20,-19,-14, -5,-20,-11,-20; /M: SY='H'; M=-16, 0,-30, 0, 7,-27,-20, 68,-26, -3,-20, 0, 6,-16, 28, 4, -6,-16,-30,-26, 9, 14; /M: SY='T'; M= -4,-11,-14,-18,-14, -2,-24,-20, 1,-18, 13, 1,-11,-18,-14,-14, 1, 27, 4,-26, -6,-14; /M: SY='G'; M= -8, 13,-30, 20, -5,-34, 40,-12,-40,-12,-30,-24, 8,-16,-12,-16, 0,-16,-30,-28,-26, -9; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='A'; M= 18,-12,-14,-19,-12,-12, -8,-10, -1,-10, -3, 14, -9,-14, -4,-14, 5, 1, 2,-25,-12, -8; /M: SY='E'; M= 0, 4,-18, 5, 20,-22,-12, -8,-22, -2,-22,-18, 4, -6, 5, -6, 20, 15,-15,-34,-18, 13; /M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -6, 4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10, 0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10, 4; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= -1, -4,-18, -4, 0,-20, -8, -6,-24, 5,-26,-16, 6,-14, 4, 20, 21, 9,-14,-32,-16, 0; /M: SY='E'; M=-10, -1,-34, 9, 37,-30,-20, -8,-26, 2,-24,-20, -8, 34, 9, -8, -4,-10,-30,-30,-24, 21; /M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30, 0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30; /M: SY='C'; M= -6,-12, 71,-22,-22,-16,-26,-26,-22,-22,-16,-16,-12,-29,-22,-22, 1, 13, -6,-42,-22,-22; /M: SY='M'; M= -8,-26,-18,-30,-22, 4,-26,-14, 22,-20, 29, 33,-26,-26,-14,-16,-22, -8, 19,-22, -2,-18; /M: SY='W'; M=-10,-34,-30,-36,-30, 4,-28,-30, 16,-22, 1, 1,-32,-28,-24,-22,-24,-14, 15, 41, 7,-26; /M: SY='D'; M= -6, 29,-20, 32, 8,-28, -4, -2,-28, -4,-30,-24, 25,-12, 0, -8, 17, 4,-22,-40,-20, 4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= -4,-14,-21,-15,-11,-15,-22,-22, -5,-12,-13, -9,-14, 23,-15,-16, 2, 16, 0,-30,-18,-15; /M: SY='D'; M=-12, 20,-25, 25, 9,-29,-16, -8,-29, 17,-25,-18, 8,-10, 2, 5, 1, 4,-19,-30,-14, 5; /M: SY='M'; M= -6,-24,-16,-30,-24, 0,-24,-11, 24,-14, 16, 41,-24,-24,-11,-14,-16, -6, 25,-24, -4,-18; /M: SY='C'; M= -8,-15, 90,-25,-25,-18,-28,-28,-25,-25,-18,-18,-15,-33,-25,-25, -3, 4, -8,-45,-25,-25; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 35, -6,-10,-12, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 21, 8, -4,-28,-20, -6; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='F'; M=-16,-26,-20,-36,-26, 50,-26,-12, 8,-22, 14, 23,-20,-26,-25,-16,-20,-10, 4, -1, 19,-22; /M: SY='H'; M=-20,-15,-38,-15,-11, -9,-20, 51,-26,-14,-20, -8, -9,-24, -1, -8,-21,-24,-30, 38, 24, -8; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='G'; M= -4,-14, 27,-18,-24,-26, 32,-24,-36,-24,-26,-20, -8,-28,-24,-24, -4,-16,-22,-31,-30,-24; /M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30, 0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30; /M: SY='F'; M= -9,-19,-16,-25,-19, 42,-19,-16, -8,-22, -5, -8, -9,-22,-25,-16, 3, 1, -4, -9, 11,-19; /M: SY='M'; M= 13,-20,-16,-26,-16, -4,-16,-14, 9,-17, 19, 20,-20,-20,-11,-17,-12, -6, 6,-20, -8,-13; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= 0, -6,-19, -6,-12,-19, 43,-12,-25,-12,-19,-12, 0,-12,-12,-12, 0,-12,-19,-12,-19,-12; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= -9, -9,-29, -8, 2,-26,-20,-10,-19, 1,-22,-11, -8, 26, 10, 3, -1, 4,-22,-26,-18, 3; /M: SY='E'; M= -6, 2,-30, 9, 30,-30, 14, -8,-34, -1,-24,-20, 0, -8, 5, -8, 0,-14,-30,-26,-24, 17; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='A'; M= 23,-14,-18,-20,-14, -1,-11, -5, -6,-10, -6, -6,-14,-18,-10,-16, -1, -4, -4, -1, 18,-14; /M: SY='C'; M=-10,-26, 35,-30,-24, -2,-30,-24, 0,-30, 23, 4,-26,-34,-24,-24,-22,-10, 2,-32,-12,-24; /M: SY='V'; M= -6,-14,-16,-19,-19, -1,-23,-17, 15,-19, 16, 7, -9,-28,-19,-15,-13, -4, 17,-28, -8,-19; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='D'; M= -1, 19,-18, 27, 8,-28, -4, -6,-28, -6,-30,-24, 14,-10, 0,-10, 25, 9,-18,-40,-20, 4; /M: SY='E'; M=-11, 23,-27, 26, 39,-29,-13, 3,-29, 6,-24,-21, 19, -7, 12, -1, 3, -7,-30,-34,-20, 26; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-30,-28,-24, 19,-34, 1, 19,-18, 8, 8,-20,-26,-14,-18,-20,-10, 5, 11, 50,-24; /M: SY='C'; M= 27,-14, 39,-24,-18,-20,-11,-24,-18,-18,-14,-14,-14,-21,-18,-24, 2, -4, -4,-31,-24,-18; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='E'; M=-10, 6,-30, 12, 41,-30,-20, -4,-30, 25,-24,-16, 0, -4, 16, 11, -4,-10,-26,-26,-16, 29; /M: SY='D'; M=-12, 13,-25, 21, 5,-27,-18,-11,-20, 14,-21,-13, 1,-15, -3, 3, -6, -8, -8,-30,-14, 1; /M: SY='F'; M=-16,-30,-24,-40,-30, 50,-34,-24, 19,-30, 14, 8,-20,-26,-32,-24,-20,-10, 11, -1, 19,-30; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='P'; M=-14,-20,-36,-14, -8, -7,-24, -5,-12,-10,-19,-12,-20, 44,-10,-16,-14,-10,-22, -7, 12,-14; /M: SY='W'; M=-16,-21,-42,-17, 4, -5,-20,-19,-24, -9,-20,-20,-25,-19, -5,-12,-25,-22,-30, 82, 11, 3; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M=-16, 35,-30, 51, 35,-36,-14, 0,-36, 4,-26,-26, 12, -6, 8, -6, 0,-10,-30,-36,-20, 21; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M= -6, 21,-22, 31, 21,-30, -8, -4,-30, -2,-28,-24, 12, -8, 5, -8, 16, 2,-22,-38,-20, 13; /M: SY='D'; M=-18, 48,-28, 59, 15,-35, -8, 2,-35, 0,-30,-28, 29,-12, 0, -8, 2, -8,-30,-40,-20, 8; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= 11,-25,-10,-28,-25, -5,-23,-28, 21,-18, 5, 5,-25,-25,-25,-20, -5, 0, 39,-28,-12,-25; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28, 69,-30,-11, 0,-25, 8, 0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 41,-28; /M: SY='V'; M= 19,-22,-10,-26,-22, -8,-19,-26, 15,-16, 2, 2,-22,-22,-22,-20, -2, 0, 31,-26,-14,-22; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Peptidase C28 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
POLG_FMDV1 (P03306 ), POLG_FMDV5 (P03307 ), POLG_FMDVA (P03308 ), POLG_FMDVC (P03309 ), POLG_FMDVI (P03310 ), POLG_FMDVO (P03305 ), POLG_FMDVS (P03311 ), POLG_FMDVT (P15072 ), POLG_FMDVZ (P49303 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
1QMY; 1QOL; 2JQF; 2JQG; 4QBB; 6FFA |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission