PROSITE entry PS51887

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	APHTHOVIRUS_LPRO
Accession [info]	PS51887
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	08-MAY-2019 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51887
Associated ProRule [info]	PRU01235

Name and characterization of the entry

Description [info]

Aphthovirus leader protease (L(pro)) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=154;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=149;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0845935; R2=0.0117033; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=27719.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=805; H_SCORE=27719; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=378; H_SCORE=27719; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -6,-24,-16,-30,-24,  0,-24,-11, 24,-14, 16, 41,-24,-24,-11,-14,-16, -6, 25,-24, -4,-18;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-22,  1, 26,-19,-24,-11, -7, -1, -9, -9,-11,-11,  1, -8, -4, -6,  0,-30,-16, 13;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-20,-39,-29, 72,-30,-20,  2,-30, 14,  2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,  1,  7, 27,-29;
/M: SY='V';  M=  0,-18,-10,-22,-22, -4,-26,-26, 14,-16,  2,  2,-18,-22,-22,-16,  2, 20, 30,-30,-10,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-28,-22,-12, -5,-26,-20,  5,-22, 20,  5,-26, 16,-16,-20,-22,-10, -5,-24,-11,-16;
/M: SY='H';  M=-20, -7,-30, -7, -7, -3,-23, 73,-20,-10,-13,  0,  0,-23,  3, -3,-13,-17,-23,-10, 40, -7;
/M: SY='N';  M=-12, 15,-22,  9, -4,-12,-13, -3, -8,-11,  0, -6, 20,-22, -8, -9, -7, -5,-15,-32,-12, -6;
/M: SY='G';  M= -8, 13,-30, 20, -5,-34, 40,-12,-40,-12,-30,-24,  8,-16,-12,-16,  0,-16,-30,-28,-26, -9;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-30, 12, 41,-30,-20, -4,-30, 25,-24,-16,  0, -4, 16, 11, -4,-10,-26,-26,-16, 29;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 14,-34,-20, -2,-26, 35,-26, -6,  0,-10, 29, 22, -6,-10,-24,-20,-10, 21;
/M: SY='K';  M= -6,-11,-22,-11, -5,-19,-24,-18, -7, 23,-15, -2,-11,-18, -5, 11,-10, -6,  7,-24,-10, -5;
/M: SY='R';  M= -8, -8,-18,-13, -9,-12,-22,-14,-11,  4,-11, -7, -5,-17, -6, 19,  4, 19,  0,-26,-10, -9;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-20,-36,-26, 53,-30,-20,  8,-30, 25,  8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,  4, -1, 19,-26;
/M: SY='Y';  M=-12,-12,-22,-16,-16, 15,-26,  5, -4,-10, -4, -4,-12,-22,-10,-10, -5, 13, -6,  7, 46,-16;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-18, -4, -8,-24, 27,-14,-28,-14,-30,-20,  6,-14, -8,-14, 25,  5,-18,-32,-24, -8;
/M: SY='R';  M=-16,-18,-26,-18, -8, -9,-24, -8,-11,  7,  7,  1,-11,-24, -1, 36,-18,-10, -9,-20, -6, -8;
/M: SY='P';  M=-14,-12,-36, -6,  0,-26,-20, 26,-24,-10,-26,-12, -9, 48, -2,-12,-10,-14,-30,-30,-11, -6;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='Y';  M=-14,  8,-26,  0, -5, -3,-16,  9,-15,  8,-19,-10, 16,-22, -2,  3, -6, -6,-20, -9, 20, -5;
/M: SY='H';  M=-20, 19,-30, 27,  8,-28,-16, 62,-34, -6,-24,-11, 14,-16,  6, -4, -6,-16,-30,-34,  5,  4;
/M: SY='D';  M=-12, 32,-26, 33,  3,-30, 12, -1,-32, -5,-30,-24, 31,-16, -5, -8,  4, -8,-30,-35,-22, -1;
/M: SY='N';  M= -6, 25,-16,  9, -4,-16, -8, -1,-16, -4,-22,-16, 37,-16, -4, -4, 14, 19,-19,-36,-16, -4;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='A';  M= 27, -5,-10,-13, -8,-17, -6,-18,-12,-10,-15,-12, -3,-10, -8,-15, 20, 19, -2,-27,-17, -8;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 32,-30, 38, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/M: SY='L';  M= -6,-19,-16,-22,-16,  2,-26,-20,  9,-22, 27,  9,-19,-22,-16,-16,-11, 13,  6,-24, -4,-16;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F';  M=-12,-19,-16,-29,-22, 46,-26,-20, -4,-22,  2, -4,-12,-22,-29,-16, -5, 13,  0, -5, 15,-22;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  8,-28,-20,  4,-26, 22,-20, -6,  0,-16, 29, 47, -6,-10,-24,-20,-10, 15;
/M: SY='Y';  M=-16,-24,-30,-28,-24, 19,-34,  1, 19,-18,  8,  8,-20,-26,-14,-18,-20,-10,  5, 11, 50,-24;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-14,-30,-26,  4,-30,-26, 26,-24, 25, 14,-30,-30,-26,-20,-18, -4, 35,-26, -6,-26;
/M: SY='D';  M=-11, 23,-30, 34,  9,-35, 19, -8,-39, -6,-29,-25, 10,-13, -5,-13,  0,-14,-30,-31,-24,  2;
/M: SY='E';  M=-10, -5,-30, -3, 26,-19,-28,-11,  0, -5, -5, -5, -8, -8,  5,-11, -8,-10, -7,-26,-12, 13;
/M: SY='P';  M=-14,-16,-36,-10,  0,-26,-20,-12,-24,  5,-26,-16,-12, 48, -2, 14,-10,-10,-26,-26,-22, -6;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-20,-34,-24, 37,-30,-20, 12,-30, 34, 12,-26,-30,-28,-20,-26,-10,  6, -8, 12,-24;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D';  M=-18, 41,-30, 59, 29,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 15, -8,  5, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 17;
/M: SY='W';  M= -9,-12,-33, -8, 11,-12,-15,-14,-24, -6,-22,-20,-13,-14,  0,-10, -7,-11,-25, 38,  0,  7;
/M: SY='H';  M=-10, -9,-22, -7,  2,-14,-24, 26, -6, -9, -8, -1, -8,-19, -3, -8, -8,-10,  1,-30, -1, -3;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-26,-28,-24, 49,-30,  5,  0,-18,  4,  0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 22, 61,-24;
/M: SY='G';  M= -4,  1,-23, -5,-12,-17, 20,-10,-18,-16,-12,-11, 11,-21,-12,-13,  0, -8,-19,-28,-19,-12;
/M: SY='N';  M=  2, 15,-14,  8,  0,-20,  0, -2,-20, -6,-30,-20, 29,-14,  0, -6, 29, 12,-18,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M=-14,-16,-36,-10,  0,-26,-20,-12,-24,  5,-26,-16,-12, 48, -2, 14,-10,-10,-26,-26,-22, -6;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-30,  9, 30,-30, 14, -8,-34, -1,-24,-20,  0, -8,  5, -8,  0,-14,-30,-26,-24, 17;
/M: SY='N';  M=-10, 13,-20,  1, -8, -9,-11, -1, -5,-11,  0, -5, 26,-24, -8, -8, -5, -4,-15,-32,-12, -8;
/M: SY='F';  M=-14,-23,-22,-27,-17, 27,-28,-18,  1,-12, 17,  6,-19,-25,-21, -9,-22,-10, -1, -9,  9,-17;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='L';  M=-14,-22,-24,-22,-12, -1,-26,-12,  1, -7, 23,  9,-19,-26, -9, 14,-22,-10, -1,-20, -4,-12;
/M: SY='D';  M=-14, 20,-30, 30, 27,-34,-16, -4,-34, 22,-27,-20,  7, -7,  9,  8, -4,-10,-26,-30,-16, 18;
/M: SY='A';  M= 17, -8,-12,-18,-12,-12,-12,-15, -3,-10, -3,  6, -8,-12, -8,-14,  7, 17,  2,-24,-12,-10;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='K';  M=-14, 19,-30, 27, 14,-34,-16, -6,-34, 31,-30,-18,  8,-10,  6, 15, -6,-10,-24,-28,-14, 10;
/M: SY='W';  M=-14,-15,-38,-15,  1,-21,-20, -5,-20, -1,-20, -8,-15,-18, 30, -1,-15,-18,-30, 45,  5, 17;
/M: SY='L';  M= -6,-30,-16,-30,-24,  6,-30,-24, 24,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 25,-24, -4,-24;
/M: SY='E';  M=  2,  4,-18,  8, 24,-24, -8, -6,-24, -2,-26,-20,  6, -6,  8, -6, 24,  8,-18,-36,-20, 16;
/M: SY='D';  M=-17, 43,-29, 56, 24,-36,-10,  1,-36,  2,-28,-27, 22,-10,  3, -7,  1, -9,-30,-38,-20, 13;
/M: SY='Y';  M=-14,-16,-26,-18, -6,  4,-26,  1, -2,-10,  7,  5,-15,-22, 10, -6,-15,-10,-11, -5, 18,  2;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='G';  M= -2, -8,-30, -8,-13,-30, 49,-18,-38, -4,-30,-18,  0,-18,-13, -9, -2,-18,-28,-20,-25,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 31,-30, 39, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-16, 34,-30, 50, 36,-36,-14,  0,-36,  4,-26,-26, 12, -6,  8, -6,  0,-10,-30,-36,-20, 22;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M= -9, -2,-25, -2,  4,-24,-15, 18,-28, 19,-26,-10,  5,-14,  8, 20,  1, -5,-20,-27, -5,  4;
/M: SY='E';  M= -5, 15,-22, 24, 28,-28,-10, -4,-28,  0,-26,-22,  8, -6,  8, -6, 15,  1,-22,-36,-20, 18;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M= 19,-10,-22,-14,-16,-26, 43,-20,-29,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20,  4,-12,-19,-20,-26,-16;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='A';  M= 27,-18,-14,-24,-14, -9,-11,-20,  1,-18, 13,  1,-18,-18,-14,-20, -5, -4,  4,-20,-12,-14;
/M: SY='L';  M= -6,-30,-16,-30,-24,  6,-30,-24, 24,-26, 35, 16,-30,-30,-24,-20,-22, -6, 25,-24, -4,-24;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-20,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28;
/M: SY='W';  M=-20,-32,-42,-32,-26, 18,-24,-11,-12,-16,-12,-12,-32,-30,-16,-16,-32,-22,-22,104, 49,-20;
/M: SY='N';  M=-10,  9,-24,  1, -1,-17,-14, -4,-15, 12,-12, -7, 17,-18, -1,  7, -7, -6,-17,-28,-12, -1;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-26,-36,-26,  4,-36,-26, 39,-30, 31, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 22,-20,  0,-26;
/M: SY='W';  M=-14,-15,-38,-15, -5,-15,-20,-18,-26, 23,-26,-14,-15,-18, -1, 11,-21,-18,-24, 45,  5, -1;
/M: SY='H';  M=-16, 11,-30, 16, 12,-32,-18, 43,-28,  0,-22, -7,  8,-14, 27,  2, -4,-14,-30,-28, -1, 17;
/M: SY='H';  M=-14,-16,  8,-19,-15, -8,-26, 23,-10,-22,  7,  3,-13,-28,-11,-15,-18,-14,-10,-31,  1,-15;
/M: SY='L';  M= -6,-22,-24,-22,-20, -5,  8,-20, -3,-26, 20,  5,-19,-26,-20,-20,-19,-14, -5,-20,-11,-20;
/M: SY='H';  M=-16,  0,-30,  0,  7,-27,-20, 68,-26, -3,-20,  0,  6,-16, 28,  4, -6,-16,-30,-26,  9, 14;
/M: SY='T';  M= -4,-11,-14,-18,-14, -2,-24,-20,  1,-18, 13,  1,-11,-18,-14,-14,  1, 27,  4,-26, -6,-14;
/M: SY='G';  M= -8, 13,-30, 20, -5,-34, 40,-12,-40,-12,-30,-24,  8,-16,-12,-16,  0,-16,-30,-28,-26, -9;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='A';  M= 18,-12,-14,-19,-12,-12, -8,-10, -1,-10, -3, 14, -9,-14, -4,-14,  5,  1,  2,-25,-12, -8;
/M: SY='E';  M=  0,  4,-18,  5, 20,-22,-12, -8,-22, -2,-22,-18,  4, -6,  5, -6, 20, 15,-15,-34,-18, 13;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10,  0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='S';  M= -1, -4,-18, -4,  0,-20, -8, -6,-24,  5,-26,-16,  6,-14,  4, 20, 21,  9,-14,-32,-16,  0;
/M: SY='E';  M=-10, -1,-34,  9, 37,-30,-20, -8,-26,  2,-24,-20, -8, 34,  9, -8, -4,-10,-30,-30,-24, 21;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-22,-36,-30,  0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30;
/M: SY='C';  M= -6,-12, 71,-22,-22,-16,-26,-26,-22,-22,-16,-16,-12,-29,-22,-22,  1, 13, -6,-42,-22,-22;
/M: SY='M';  M= -8,-26,-18,-30,-22,  4,-26,-14, 22,-20, 29, 33,-26,-26,-14,-16,-22, -8, 19,-22, -2,-18;
/M: SY='W';  M=-10,-34,-30,-36,-30,  4,-28,-30, 16,-22,  1,  1,-32,-28,-24,-22,-24,-14, 15, 41,  7,-26;
/M: SY='D';  M= -6, 29,-20, 32,  8,-28, -4, -2,-28, -4,-30,-24, 25,-12,  0, -8, 17,  4,-22,-40,-20,  4;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P';  M= -4,-14,-21,-15,-11,-15,-22,-22, -5,-12,-13, -9,-14, 23,-15,-16,  2, 16,  0,-30,-18,-15;
/M: SY='D';  M=-12, 20,-25, 25,  9,-29,-16, -8,-29, 17,-25,-18,  8,-10,  2,  5,  1,  4,-19,-30,-14,  5;
/M: SY='M';  M= -6,-24,-16,-30,-24,  0,-24,-11, 24,-14, 16, 41,-24,-24,-11,-14,-16, -6, 25,-24, -4,-18;
/M: SY='C';  M= -8,-15, 90,-25,-25,-18,-28,-28,-25,-25,-18,-18,-15,-33,-25,-25, -3,  4, -8,-45,-25,-25;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='A';  M= 35, -6,-10,-12, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 21,  8, -4,-28,-20, -6;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='F';  M=-16,-26,-20,-36,-26, 50,-26,-12,  8,-22, 14, 23,-20,-26,-25,-16,-20,-10,  4, -1, 19,-22;
/M: SY='H';  M=-20,-15,-38,-15,-11, -9,-20, 51,-26,-14,-20, -8, -9,-24, -1, -8,-21,-24,-30, 38, 24, -8;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='G';  M= -4,-14, 27,-18,-24,-26, 32,-24,-36,-24,-26,-20, -8,-28,-24,-24, -4,-16,-22,-31,-30,-24;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-22,-36,-30,  0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30;
/M: SY='F';  M= -9,-19,-16,-25,-19, 42,-19,-16, -8,-22, -5, -8, -9,-22,-25,-16,  3,  1, -4, -9, 11,-19;
/M: SY='M';  M= 13,-20,-16,-26,-16, -4,-16,-14,  9,-17, 19, 20,-20,-20,-11,-17,-12, -6,  6,-20, -8,-13;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M=  0, -6,-19, -6,-12,-19, 43,-12,-25,-12,-19,-12,  0,-12,-12,-12,  0,-12,-19,-12,-19,-12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P';  M= -9, -9,-29, -8,  2,-26,-20,-10,-19,  1,-22,-11, -8, 26, 10,  3, -1,  4,-22,-26,-18,  3;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-30,  9, 30,-30, 14, -8,-34, -1,-24,-20,  0, -8,  5, -8,  0,-14,-30,-26,-24, 17;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='A';  M= 23,-14,-18,-20,-14, -1,-11, -5, -6,-10, -6, -6,-14,-18,-10,-16, -1, -4, -4, -1, 18,-14;
/M: SY='C';  M=-10,-26, 35,-30,-24, -2,-30,-24,  0,-30, 23,  4,-26,-34,-24,-24,-22,-10,  2,-32,-12,-24;
/M: SY='V';  M= -6,-14,-16,-19,-19, -1,-23,-17, 15,-19, 16,  7, -9,-28,-19,-15,-13, -4, 17,-28, -8,-19;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='D';  M= -1, 19,-18, 27,  8,-28, -4, -6,-28, -6,-30,-24, 14,-10,  0,-10, 25,  9,-18,-40,-20,  4;
/M: SY='E';  M=-11, 23,-27, 26, 39,-29,-13,  3,-29,  6,-24,-21, 19, -7, 12, -1,  3, -7,-30,-34,-20, 26;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Y';  M=-16,-24,-30,-28,-24, 19,-34,  1, 19,-18,  8,  8,-20,-26,-14,-18,-20,-10,  5, 11, 50,-24;
/M: SY='C';  M= 27,-14, 39,-24,-18,-20,-11,-24,-18,-18,-14,-14,-14,-21,-18,-24,  2, -4, -4,-31,-24,-18;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-30, 12, 41,-30,-20, -4,-30, 25,-24,-16,  0, -4, 16, 11, -4,-10,-26,-26,-16, 29;
/M: SY='D';  M=-12, 13,-25, 21,  5,-27,-18,-11,-20, 14,-21,-13,  1,-15, -3,  3, -6, -8, -8,-30,-14,  1;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-24,-40,-30, 50,-34,-24, 19,-30, 14,  8,-20,-26,-32,-24,-20,-10, 11, -1, 19,-30;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='P';  M=-14,-20,-36,-14, -8, -7,-24, -5,-12,-10,-19,-12,-20, 44,-10,-16,-14,-10,-22, -7, 12,-14;
/M: SY='W';  M=-16,-21,-42,-17,  4, -5,-20,-19,-24, -9,-20,-20,-25,-19, -5,-12,-25,-22,-30, 82, 11,  3;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=-16, 35,-30, 51, 35,-36,-14,  0,-36,  4,-26,-26, 12, -6,  8, -6,  0,-10,-30,-36,-20, 21;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M= -6, 21,-22, 31, 21,-30, -8, -4,-30, -2,-28,-24, 12, -8,  5, -8, 16,  2,-22,-38,-20, 13;
/M: SY='D';  M=-18, 48,-28, 59, 15,-35, -8,  2,-35,  0,-30,-28, 29,-12,  0, -8,  2, -8,-30,-40,-20,  8;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='V';  M= 11,-25,-10,-28,-25, -5,-23,-28, 21,-18,  5,  5,-25,-25,-25,-20, -5,  0, 39,-28,-12,-25;
/M: SY='F';  M=-20,-28,-22,-35,-28, 69,-30,-11,  0,-25,  8,  0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 41,-28;
/M: SY='V';  M= 19,-22,-10,-26,-22, -8,-19,-26, 15,-16,  2,  2,-22,-22,-22,-20, -2,  0, 31,-26,-14,-22;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_05 which contains 570'420 sequence entries.

Total number of hits	9 in 9 different sequences
Number of true positive hits	9 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase C28
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

9 sequences

POLG_FMDV1  (P03306), POLG_FMDV5  (P03307), POLG_FMDVA  (P03308),

POLG_FMDVC  (P03309), POLG_FMDVI  (P03310), POLG_FMDVO  (P03305), 
POLG_FMDVS  (P03311), POLG_FMDVT  (P15072), POLG_FMDVZ  (P49303)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

6 PDB

1QMY; 1QOL; 2JQF; 2JQG; 4QBB; 6FFA