Home  |  Contact
Entry: PS51895

General information about the entry

Entry name [info] AA1
Accession [info] PS51895
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 03-JUL-2019 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51895
Associated ProRule [info] PRU01243

Name and characterization of the entry

Description [info] Alt a 1 (AA1)-like domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=122;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=117;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5752673; R2=0.0301800; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5945.0000000; R2=0.0000000; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=230; H_SCORE=5945; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=97; H_SCORE=5945; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='T';  M=  0,-10,-19,-10, -5,-22, -9,-16,-14, -6,-17,-11, -8,-10, -5, -8,  1,  2, -8,-30,-20, -5;
/M:         M= -1,-10,-19,-11, -6,-21, -2,-10,-22, -8,-25,-18, -9, -6, -6,-12,  0, -7,-17,-27,-16, -7;
/M:         M= -8, -4,-24, -3, -2,-20,-15, -8,-17, -8,-20,-14, -2, -9, -4,-10, -2, -1,-13,-29,-14, -4;
/M: SY='E';  M= -7,  0,-30,  4, 20,-20,-18, -4,-21,  1,-23,-15, -2,-15,  5, -4, -1, -4,-20,-26,-12, 15;
/M: SY='T';  M= -6, -6,-19, -8, -5,-19,-20,-14, -7, -5,-14, -8, -1,-14, -3,-11,  0,  8, -2,-30,-17, -4;
/M: SY='I';  M=-10,-31,-13,-33,-27,  4,-31,-22, 14,-24,  3,  0,-30,-26,-22,-28,-20,-11, 12,  3,  4,-24;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S';  M=  1, -2,-18, -2,  1,-24,-14,-12,-16,  3,-21,-13, -1,-13,  0, -4,  5,  3,-10,-31,-20,  0; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -5,-29, -9,-29,-28, -4,-34,-29, 32,-26, 16,  9,-29,-26,-25,-27,-17, -7, 27,-23,-11,-26;
/M: SY='S';  M=  2, -4,-17, -7, -1,-21,-12, -9,-19,  2,-22,-13,  3,-10,  2, -3, 13, 12,-13,-29,-18, -1;
/M: SY='D';  M= -9, 18,-30, 21,  7,-31, -5, -7,-27, -3,-34,-23, 15,-17, -2, -9,  5, -6,-24,-40,-24,  3;
/M: SY='F';  M=-17,-31,-17,-36,-27, 34,-31,-11,  2,-27,  6,  2,-29,-31,-24,-25,-20,-15, -5, -1, 20,-27;
/M: SY='S';  M=  3,-11,-14,-11, -8,-13, -9,-13,-12, -7,-18,-12, -6,-15, -7,-13,  9,  5, -8,-24,-10, -7;
/M: SY='V';  M=  1,-24,-13,-25,-18, -5,-16,-20,  2,-19, -1, -2,-24,-19,-16,-20,-10, -7,  4,-22, -8,-17;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-30,-17, -5,-20,-16,  0,-21,  4,-18,-16, -5,-20,  2, 24, -7, -7,-20,-25,-13, -4;
/M: SY='K';  M= -6, -4,-25,-10,  2,-23,-18,-10,-21, 19,-22,-16, -3,-15,  2,  9,  0, -5,-17,-28,-17,  1;
/M: SY='S';  M= -5, -3,-22, -5, -1,-26,-15,-10,-21,  0,-23,-15,  2,  0,  2, -6,  4,  3,-15,-32,-20, -1;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S';  M= -3, -1,-19,  0,  1,-19,-12, -8,-14, -6,-18,-12, -1,-11, -2, -9,  2,  0,-11,-27,-14, -1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G';  M= -7,  6,-27,  6, -5,-27, 14,-10,-29,-11,-34,-23,  6,-16, -7,-14,  4,-10,-26,-27,-22, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-21, -3, -6,-23,  2,-14,-20, -8,-24,-17, -1,-14, -9,-12,  4,  3,-15,-31,-21, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='T';  M=  1, -4,-19, -1, -5,-22, -6,-14,-19,-10,-23,-17, -4, -9, -8,-14,  5,  7,-12,-31,-18, -6;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-12,-28,-26, -3,-28,-24, 21,-23,  9,  5,-26,-24,-22,-26,-17, -6, 20,-22, -6,-23;
/M: SY='N';  M=-10,  7,-25,  4,  4,-25,-14,  0,-22, -2,-25,-14, 13,-15,  7, -4,  5,  6,-18,-32,-18,  4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S';  M= -2, -6,-17, -9, -8,-14, -9, -4,-15, -6,-21,-12,  3,-17, -5, -8,  9, -1,-13,-24, -8, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-13,-27,-24, -5,-30,-25, 21,-20,  9,  9,-26,-23,-18,-24,-17, -2, 23,-24, -9,-19;
/M: SY='S';  M=  1,  1,-16,  0, -2,-21, -2, -9,-21, -5,-28,-19,  7,-15, -4,-10, 16,  3,-19,-30,-17, -3;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-18,-38,-29, 47,-30,-13,  3,-28,  4,  2,-30,-37,-27,-28,-19,-17, -6,  3, 22,-28;
/M: SY='N';  M= -9,  6,-25,  1,  2,-25,-16, -3,-22,  6,-26,-17, 14,-15,  2,  0,  6,  5,-18,-33,-18,  2;
/M: SY='L';  M=-13,-35,-10,-35,-29,  0,-38,-29, 27,-28, 28, 16,-34,-29,-23,-25,-24, -9, 19,-21, -9,-28;
/M: SY='T';  M= -4, -8,-19,-10, -3,-17,-18, -8,-14, -3,-15,-10, -2,-15,  2, -2,  5,  9,-10,-25,-13, -2;
/M: SY='G';  M=  7, -9,-18, -9,-11,-24, 14,-17,-23,-11,-27,-18, -6,-11,-11,-14,  8, -2,-16,-30,-22,-11;
/M: SY='T';  M= -7,  1,-22,  0, -3,-23,-15, -7,-19, -7,-23,-16,  6, -8, -3,-10,  3, 10,-14,-32,-16, -3;
/M: SY='N';  M= -9, 15,-27, 10,  3,-27, -7,  0,-26, -2,-33,-21, 22,-17,  0, -3,  7, -2,-24,-36,-20,  1;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='G';  M= -2, -3,-18, -4, -5,-16, 17, -8,-20, -8,-21,-15, -2, -5, -7, -9,  0, -9,-16,-18,-15, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='G';  M=  0, -3,-13, -3, -4,-14, 11, -8,-15, -5,-16,-11, -2, -9, -3, -7,  2, -4,-11,-16,-13, -4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='A';  M=  7,-10,-12, -9, -7,-19, -7,-16,-10, -8,-15,-10,-10, -5, -7,-11,  3,  6, -3,-27,-18, -7; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M:         M= -3,-15,-14,-17, -8,-11,-18,-12, -5, -7, -3, -3,-12,-16, -6, -5, -5,  0, -4,-20,-10, -9; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='N';  M= -9, 13,-26, 10,  1,-27, -6, -3,-25, -6,-31,-20, 17,-12, -2, -9,  5, -4,-22,-35,-19, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-13,-30,-23,  7,-29,-20, 10,-22,  9,  5,-26,-25,-17,-22,-15, -3,  9,-17, -2,-21;
/M: SY='Q';  M= -7,  0,-24,  1,  4,-23,-15, -4,-18, -1,-21,-14,  0,-14,  5, -5,  4,  2,-15,-30,-16,  4;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='S';  M=  6, -6,-15, -6, -3,-21, -8,-14,-14, -4,-21,-15, -1,-13, -4, -7, 16, 10,-10,-31,-20, -3;
/M: SY='A';  M= 21,-16, -8,-16, -9,-21, -4,-15,-12, -9,-20,-12,-13, -5, -7,-12, 10,  1, -5,-30,-19, -8;
/M: SY='S';  M= -4, -3,-23, -3,  2,-21, -8, -7,-22, -5,-25,-18, -1, -9,  0, -9,  7,  1,-19,-25,-14,  1;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='S';  M=  4,  2,-19,  2, -3,-26, -5,-11,-19, -7,-26,-16,  4,-12, -4,-10,  6,  0,-13,-35,-22, -3;
/M: SY='P';  M= -5, -9,-23, -9, -7,-22,-14,-14,-17,-11,-22,-18, -9, 11, -9,-16, -2, -4,-12,-31,-17, -8;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M:         M= -4, -7,-23, -8, -4,-24, -8,-13,-17, -4,-21,-15, -4, -8, -4, -8, -1, -3,-12,-28,-19, -4; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='I';  M= -9,-23,-15,-24,-19, -7,-20,-22,  1,-18,  1, -2,-22,-17,-16,-19,-12, -4,  1,-16,-10,-18; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='E';  M= -8,-11,-23,-10,  1,-18,-19,-11,-13, -6,-12, -9,-13,  0,  0,-11, -7, -8,-11,-26,-15,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D';  M= -6,  4,-22,  8,  3,-22, -7, -8,-19, -6,-22,-17,  0, -2, -2,-10,  1, -4,-16,-27,-16,  1; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='S';  M= -1,  1,-20,  1, -2,-23, -1, -8,-23, -4,-29,-20,  6, -9, -4,-11, 16,  3,-19,-31,-18, -3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-27,  0,  6,-25,-14, -8,-18,  5,-22,-16, -1,-14,  3,  1,  0, -5,-15,-31,-19,  4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V';  M= -6,-25,-15,-28,-22, -1,-27,-21,  9,-16,  2,  3,-23,-21,-16,-19,-14, -4, 10,-17, -5,-19;
/M: SY='Y';  M=-13,-23,-19,-26,-20, 11,-24,  0, -3,-19, -6, -5,-16,-27,-18,-19,-15,-11, -3, -4, 26,-19;
/M: SY='T';  M= -3, -6,-20, -6, -6,-22,-13,-14,-16, -8,-20,-14, -5, -2, -5,-12,  2,  5,-11,-31,-19, -6;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='G';  M=  1, -4,-26, -2,-10,-28, 30,-16,-31,-14,-33,-24, -5,-18,-12,-16,  3,-11,-23,-32,-26,-11;
/M: SY='D';  M= -8, 11,-29, 15,  9,-29, -7, -9,-24, -4,-30,-21,  5,-13,  0,-11,  2, -5,-21,-36,-22,  5;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='N';  M= -3,  0,-11, -3, -5, -8,  0, -5,-10, -5,-13, -9,  4, -7, -5, -7,  3,  0, -9,-15, -8, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='S';  M=  2,  2,-17,  3,  1,-23, -4,-10,-21, -4,-28,-20,  6, -5, -2,-11, 22,  3,-19,-31,-19,  0; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M:         M= -7, -8,-23,-12, -7,-17,-12, -9,-18, -2,-20,-14, -5,-10, -4, -7, -4, -6,-13,-27,-13, -7;
/M: SY='Y';  M=-17,-30,-19,-31,-22, 29,-30,  8, -3,-22, -5, -3,-23,-31,-21,-22,-19,-18, -5, 12, 50,-22;
/M: SY='S';  M=  0, -7,-20,-10, -2,-17,-10, -2,-22,  2,-24,-17,  1,-15,  1,  7, 13,  2,-20,-24,-12, -2;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 56,-30,-11,  0,-30, -1, -1,-30,-40,-29,-30,-20,-20,-10, 13, 29,-30;
/M: SY='S';  M=  7, -8,-16, -8, -2,-21, -7,-11,-15, -5,-20,-12, -3,-13,  1, -8, 10,  4, -9,-28,-18, -1;
/M: SY='F';  M=-14,-33,-13,-35,-28, 15,-34,-19, 15,-27, 15,  7,-32,-31,-24,-25,-22,-12,  9, -8,  9,-27;
/M:         M= -9, -7,-22,-10, -3,-16,-18, -6,-13, -6,-16, -9, -2,-19,  0, -9, -2, -5,-11,-18, -9, -3;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-27,  0,  5,-29, -6,-10,-27,  3,-30,-21,  0, -3,  2, -5,  4, -5,-22,-30,-22,  4;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='G';  M= -4, -3,-21, -4, -4,-22,  3,-11,-19, -5,-21,-16, -1,-10, -6, -5,  1, -1,-15,-26,-19, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='S';  M= -3,  3,-22,  5,  2,-24,  2,-11,-22, -2,-26,-19,  2,-11, -3, -9,  6,  0,-18,-29,-21,  0; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M:         M= -6, -6,-21, -5, -5,-16,  0, -9,-18, -8,-20,-14, -5,-14, -5,-10, -1, -5,-15,-20,-11, -6; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='D';  M= -6, 13,-28, 18, 13,-29, -7, -8,-26, -4,-32,-22,  8,-13,  1,-10,  8, -1,-23,-36,-23,  8;
/M:         M= -8, -6,-23, -5,  0,-17,-17, -8,-15, -6,-17,-11, -5,-12, -1,-10, -2, -4,-12,-26,-11, -1;
/M: SY='Y';  M=-12,-11,-22,-14,-10,  1,-17, -1,-16,-10,-18,-13, -4,-22,-10,-12, -4, -4,-14,-10, 12,-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-20,-11, -9,-18,  3,-11,-18, -7,-21,-14, -1,-16, -6, -4,  2, -3,-14,-26,-17, -8; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='L';  M=-14,-33,-11,-33,-27, -2,-34,-27, 19,-26, 26, 13,-32,-27,-19,-21,-23, -8, 13,-21,-10,-26; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='R';  M= -4,-16,-20,-19, -8,-14,-21,-13,-10, -4, -7, -4,-11,-19, -2,  5, -5,  4, -9,-22,-14, -8; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='I';  M=-10,-33,-11,-33,-29, -3,-36,-29, 27,-26, 23, 15,-32,-26,-22,-26,-23, -5, 24,-23,-10,-26;
/M: SY='Y';  M=-17,-25,-19,-28,-18, 15,-28,  3, -8,-17, -8, -8,-19,-28,-15,-17,-15,-11,-10, 10, 28,-18;
/M: SY='H';  M=-15,  1,-30, -5,  5,-19,-17, 33,-28,  5,-27,-17,  5,-17, 13,  5, -6,-14,-25,-25, -2,  5;
/M: SY='Q';  M= -9,  4,-27,  4, 12,-27,-15, -1,-24,  3,-25,-15,  4,-15, 14,  1,  0, -6,-21,-29,-18, 11;
/M: SY='V';  M= -6,-25,-12,-26,-23, -7,-24,-24,  8,-20,  7,  3,-23,-21,-16,-21,-12,  6, 11,-22,-10,-19;
/M: SY='G';  M=  5, -4,-22, -2, -7,-27, 16,-16,-26, -9,-30,-21, -6,-16, -9,-10,  6, -7,-20,-33,-25, -9;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='P';  M= -8, -5,-25,  0, -5,-27,-16,-16,-14,-12,-20,-15,-10,  8, -7,-19, -5, -5, -9,-35,-21, -6; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='G';  M=  7, -5,-19, -4, -6,-24,  8,-14,-22,-10,-27,-18, -4,-13, -7,-11,  7, -1,-16,-31,-22, -7; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V';  M=  1,-15,-14,-18,-15, -7,-16,-15, -1,-14,-10, -6,-11,-19,-13,-16, -3, -1,  3,-23, -7,-13; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-22, -8,-13,-25, 20,-17,-24,-14,-27,-20, -8,-13,-12,-16,  3, -2,-17,-30,-24,-13;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-14,-32,-23,  6,-32,-16, 10,-21, 14,  7,-28,-28,-17,-18,-20,-11,  5,-13,  5,-23;
/M: SY='W';  M=-12,-18,-19,-22,-13, -4,-18, -6,-16,-13,-17,-13,-11,-24, -8,-13, -6, -7,-16,  8,  6,-12;
/M: SY='G';  M=  2,-10,-28,-10,-18,-29, 52,-19,-37,-17,-38,-28,-10,-19,-17,-18,  1,-18,-27,-30,-29,-17;
/M: SY='E';  M= -5, -1,-24, -1,  6,-22,-10, -6,-21, -3,-23,-13,  3,-14,  4, -6,  4,  5,-17,-28,-17,  5;
/M: SY='T';  M=  6,-15,-15,-15,-14,-19, -2,-20, -8,-13,-14, -9,-12,-16,-11,-15,  1,  7, -1,-29,-20,-12;
/M: SY='D';  M= -9,  4,-25,  8,  3,-21,-16, -7,-17, -5,-22,-15, -2,-15,  0,-12,  0, -1,-14,-31,-15,  1;
/M: SY='I';  M= -7,-31,-11,-32,-29, -3,-33,-27, 27,-24, 16, 10,-31,-25,-22,-27,-21, -6, 27,-24, -8,-24;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='P';  M= -9, -9,-26, -9, -4,-27,-17,-12,-23, -8,-24,-21, -9, 34, -5,-13, -6, -8,-17,-32,-21, -5; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='T';  M= -2, -8,-15, -7, -8,-20,-14,-17, -9,-10,-12,-10, -5, -6, -8,-13,  1, 15, -3,-29,-18, -7; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='Y';  M=-13,-18,-21,-19,-14,  2,-19,  4,-11,-13,-14,-10,-13,-21, -9,-15,-12,-13, -8, -6, 23,-12;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='H';  M=-12, -2,-29,-10,  0,-18,-16, 29,-26,  0,-26,-19,  6,-19,  5, 12, -4,-10,-25,-25, -2, -1;
/M: SY='A';  M= 18,-14,-12,-14,-10,-22, -2,-18,-14, -8,-19,-13,-13,-12, -9, -7,  4,  0, -7,-31,-21,-10;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-28, -9,-12,-26, 35,-16,-34,-14,-35,-26, -8,-11,-14,-15,  1,-15,-27,-30,-25,-13;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-27, -6,-11,-28, 36,-16,-33,-14,-34,-25, -8, -9,-12,-16,  0,-14,-25,-29,-26,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N';  M= -9,  3,-21, -1, -4,-21,-12, -5,-18, -7,-20,-13, 10,-14, -4, -8,  1, -3,-17,-27,-16, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='G';  M=  0, -4,-20, -4, -9,-22, 29,-12,-25,-11,-27,-19, -3,-14, -9,-13,  5, -9,-20,-23,-21, -9; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='P';  M=  2, -9,-11,-10, -5,-15, -8, -9, -8, -5,-10, -6, -8,  5,  0, -7, -1, -3, -5,-18,-13, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='N';  M= -9,  9,-23,  8,  2,-23,-10, -4,-17, -4,-22,-12, 12,-14,  2, -5,  4, -2,-16,-30,-18,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='D';  M=-12, 15,-31, 27,  7,-33,-14,-13,-23,-10,-29,-23, -1, -4, -3,-17, -1, -4,-20,-42,-25,  1;
/M: SY='F';  M=-13,-22,-19,-23,-14,  5,-28,-12, -2,-16,  1,  2,-20,-23, -8,-16,-13, -7, -4,-13,  2,-13;
/M: SY='V';  M= -2,-23,-11,-23,-21,-10,-25,-24, 17,-19,  4,  2,-21,-20,-17,-23, -9,  2, 20,-26,-12,-17;
/M: SY='C';  M=  0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40;
/M: SY='S';  M= -4, -2,-22, -2,  4,-21,-13, -6,-21, -1,-22,-13,  2,-14,  8, -2,  9,  7,-16,-27,-16,  4;
/M: SY='Q';  M= -7, -5,-27, -6,  6,-28, -9, -2,-26,  4,-21, -8, -4, -8, 30,  2,  0, -8,-18,-24,-21, 12;
/M: SY='V';  M= -5,-16,-17,-16,-18,-15,-25,-21,  8,-15, -4, -2,-17,-12,-13,-21,-12,  0, 14,-30,-14,-13;
/M: SY='S';  M=  1, -6,-21, -7, -4,-24, -2,-10,-22, -5,-24,-16, -2,-11, -1, -5,  5, -3,-17,-29,-19, -4;
/M: SY='D';  M= -5,  1,-23,  4, -1,-26,-14,-11,-19, -9,-25,-18, -1,  0, -3,-14,  1,  2,-14,-35,-21, -2;
/M: SY='T';  M=  1,-17,-14,-19,-14,-15,-20,-13, -2,-12, -7, -5,-13,-13, -9,-12, -5,  3,  2,-28,-12,-12;
/M: SY='T';  M= -6,-13,-16,-13, -9,-13,-15, -8,-14,-11,-17,-13, -8,-10, -8,-15, -1,  3, -9,-18, -2, -9;
/M: SY='I';  M= -6,-21,-16,-22,-19, -6,-23,-21,  7,-19, -1,  0,-19,-17,-17,-20,-11, -2,  7,-23,-11,-18;
/M: SY='T';  M= -5,-15,-15,-15,-14,-10,-24,-18,  0,-15, -4, -4,-12,-19,-13,-14, -6, 11,  3,-25,-11,-13;
/M: SY='L';  M=-12,-27,-14,-28,-20, -6,-33,-21, 13,-20, 16, 12,-24,-25,-14,-16,-18, -6,  9,-22,-10,-20;
/M: SY='T';  M= -5,-12,-12, -9,-12,-15,-21,-16, -1,-16, -5, -6,-13,-20,-12,-18, -4,  2,  0,-28,-13,-13;
/M: SY='S';  M= -4, -1,-22, -3, -2,-22,-10,-10,-18, -2,-22,-14,  3,-14,  0, -7,  5, -3,-15,-31,-19, -1;
/M: SY='A';  M=  1,-13,-13,-14,-10,-16,-14,-15,-11,-11,-15,-10,-12,-11, -8,-13, -1, -5, -9,-27,-15,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 4 in 4 different sequences
Number of true positive hits 4 in 4 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] AA1-like
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
4 sequences

ALTA1_ALTAL (P79085    ), ALTA1_ALTBO (Q5EZ82    ), ALTA1_PLETA (Q5EZC5    ), 
PEVD1_VERDA (G0Y276    )
» more

PDB
[Detailed view]
3 PDB

3V0R; 4AUD; 5XMZ

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission