PROSITE entry PS51895
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | AA1 |
| Accession [info] | PS51895 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
03-JUL-2019 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51895 |
| Associated ProRule [info] | PRU01243 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Alt a 1 (AA1)-like domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=122; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=117; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5752673; R2=0.0301800; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5939.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=230; H_SCORE=5939; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=97; H_SCORE=5939; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= 0,-10,-19,-10, -5,-22, -9,-16,-14, -6,-17,-11, -8,-10, -5, -8, 1, 2, -8,-30,-20, -5; /M: M= -1,-10,-19,-11, -6,-21, -2,-10,-22, -8,-25,-18, -9, -6, -6,-12, 0, -7,-17,-27,-16, -7; /M: M= -8, -4,-24, -3, -2,-20,-15, -8,-17, -8,-20,-14, -2, -9, -4,-10, -2, -1,-13,-29,-14, -4; /M: SY='E'; M= -7, 0,-30, 4, 20,-20,-18, -4,-21, 1,-23,-15, -2,-15, 5, -4, -1, -4,-20,-26,-12, 15; /M: SY='T'; M= -6, -6,-19, -8, -5,-19,-20,-14, -7, -5,-14, -8, -1,-14, -3,-11, 0, 8, -2,-30,-17, -4; /M: SY='I'; M=-10,-31,-13,-33,-27, 4,-31,-22, 14,-24, 3, 0,-30,-26,-22,-28,-20,-11, 12, 3, 4,-24; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= 1, -2,-18, -2, 1,-24,-14,-12,-16, 3,-21,-13, -1,-13, 0, -4, 5, 3,-10,-31,-20, 0; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -5,-29, -9,-29,-28, -4,-34,-29, 32,-26, 16, 9,-29,-26,-25,-27,-17, -7, 27,-23,-11,-26; /M: SY='S'; M= 2, -4,-17, -7, -1,-21,-12, -9,-19, 2,-22,-13, 3,-10, 2, -3, 13, 12,-13,-29,-18, -1; /M: SY='D'; M= -9, 18,-30, 21, 7,-31, -5, -7,-27, -3,-34,-23, 15,-17, -2, -9, 5, -6,-24,-40,-24, 3; /M: SY='F'; M=-17,-31,-17,-36,-27, 34,-31,-11, 2,-27, 6, 2,-29,-31,-24,-25,-20,-15, -5, -1, 20,-27; /M: SY='S'; M= 3,-11,-14,-11, -8,-13, -9,-13,-12, -7,-18,-12, -6,-15, -7,-13, 9, 5, -8,-24,-10, -7; /M: SY='V'; M= 1,-24,-13,-25,-18, -5,-16,-20, 2,-19, -1, -2,-24,-19,-16,-20,-10, -7, 4,-22, -8,-17; /M: SY='R'; M= -7,-11,-30,-17, -5,-20,-16, 0,-21, 4,-18,-16, -5,-20, 2, 24, -7, -7,-20,-25,-13, -4; /M: SY='K'; M= -6, -4,-25,-10, 2,-23,-18,-10,-21, 19,-22,-16, -3,-15, 2, 9, 0, -5,-17,-28,-17, 1; /M: SY='S'; M= -5, -3,-22, -5, -1,-26,-15,-10,-21, 0,-23,-15, 2, 0, 2, -6, 4, 3,-15,-32,-20, -1; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= -3, -1,-19, 0, 1,-19,-12, -8,-14, -6,-18,-12, -1,-11, -2, -9, 2, 0,-11,-27,-14, -1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -7, 6,-27, 6, -5,-27, 14,-10,-29,-11,-34,-23, 6,-16, -7,-14, 4,-10,-26,-27,-22, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= -2, -3,-21, -3, -6,-23, 2,-14,-20, -8,-24,-17, -1,-14, -9,-12, 4, 3,-15,-31,-21, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='T'; M= 1, -4,-19, -1, -5,-22, -6,-14,-19,-10,-23,-17, -4, -9, -8,-14, 5, 7,-12,-31,-18, -6; /M: SY='I'; M= -6,-27,-12,-28,-26, -3,-28,-24, 21,-23, 9, 5,-26,-24,-22,-26,-17, -6, 20,-22, -6,-23; /M: SY='N'; M=-10, 7,-25, 4, 4,-25,-14, 0,-22, -2,-25,-14, 13,-15, 7, -4, 5, 6,-18,-32,-18, 4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= -2, -6,-17, -9, -8,-14, -9, -4,-15, -6,-21,-12, 3,-17, -5, -8, 9, -1,-13,-24, -8, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= -4,-27,-13,-27,-24, -5,-30,-25, 21,-20, 9, 9,-26,-23,-18,-24,-17, -2, 23,-24, -9,-19; /M: SY='S'; M= 1, 1,-16, 0, -2,-21, -2, -9,-21, -5,-28,-19, 7,-15, -4,-10, 16, 3,-19,-30,-17, -3; /M: SY='F'; M=-18,-30,-18,-38,-29, 47,-30,-13, 3,-28, 4, 2,-30,-37,-27,-28,-19,-17, -6, 3, 22,-28; /M: SY='N'; M= -9, 6,-25, 1, 2,-25,-16, -3,-22, 6,-26,-17, 14,-15, 2, 0, 6, 5,-18,-33,-18, 2; /M: SY='L'; M=-13,-35,-10,-35,-29, 0,-38,-29, 27,-28, 28, 16,-34,-29,-23,-25,-24, -9, 19,-21, -9,-28; /M: SY='T'; M= -4, -8,-19,-10, -3,-17,-18, -8,-14, -3,-15,-10, -2,-15, 2, -2, 5, 9,-10,-25,-13, -2; /M: SY='G'; M= 7, -9,-18, -9,-11,-24, 14,-17,-23,-11,-27,-18, -6,-11,-11,-14, 8, -2,-16,-30,-22,-11; /M: SY='T'; M= -7, 1,-22, 0, -3,-23,-15, -7,-19, -7,-23,-16, 6, -8, -3,-10, 3, 10,-14,-32,-16, -3; /M: SY='N'; M= -9, 15,-27, 10, 3,-27, -7, 0,-26, -2,-33,-21, 22,-17, 0, -3, 7, -2,-24,-36,-20, 1; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='G'; M= -2, -3,-18, -4, -5,-16, 17, -8,-20, -8,-21,-15, -2, -5, -7, -9, 0, -9,-16,-18,-15, -6; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='G'; M= 0, -3,-13, -3, -4,-14, 11, -8,-15, -5,-16,-11, -2, -9, -3, -7, 2, -4,-11,-16,-13, -4; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='A'; M= 7,-10,-12, -9, -7,-19, -7,-16,-10, -8,-15,-10,-10, -5, -7,-11, 3, 6, -3,-27,-18, -7; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: M= -3,-15,-14,-17, -8,-11,-18,-12, -5, -7, -3, -3,-12,-16, -6, -5, -5, 0, -4,-20,-10, -9; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='N'; M= -9, 13,-26, 10, 1,-27, -6, -3,-25, -6,-31,-20, 17,-12, -2, -9, 5, -4,-22,-35,-19, -1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='I'; M= -8,-28,-13,-30,-23, 7,-29,-20, 10,-22, 9, 5,-26,-25,-17,-22,-15, -3, 9,-17, -2,-21; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-24, 1, 4,-23,-15, -4,-18, -1,-21,-14, 0,-14, 5, -5, 4, 2,-15,-30,-16, 4; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='S'; M= 6, -6,-15, -6, -3,-21, -8,-14,-14, -4,-21,-15, -1,-13, -4, -7, 16, 10,-10,-31,-20, -3; /M: SY='A'; M= 21,-16, -8,-16, -9,-21, -4,-15,-12, -9,-20,-12,-13, -5, -7,-12, 10, 1, -5,-30,-19, -8; /M: SY='S'; M= -4, -3,-23, -3, 2,-21, -8, -7,-22, -5,-25,-18, -1, -9, 0, -9, 7, 1,-19,-25,-14, 1; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='S'; M= 4, 2,-19, 2, -3,-26, -5,-11,-19, -7,-26,-16, 4,-12, -4,-10, 6, 0,-13,-35,-22, -3; /M: SY='P'; M= -5, -9,-23, -9, -7,-22,-14,-14,-17,-11,-22,-18, -9, 11, -9,-16, -2, -4,-12,-31,-17, -8; /I: I=-7; MD=-15; /M: M= -4, -7,-23, -8, -4,-24, -8,-13,-17, -4,-21,-15, -4, -8, -4, -8, -1, -3,-12,-28,-19, -4; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='I'; M= -9,-23,-15,-24,-19, -7,-20,-22, 1,-18, 1, -2,-22,-17,-16,-19,-12, -4, 1,-16,-10,-18; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='E'; M= -8,-11,-23,-10, 1,-18,-19,-11,-13, -6,-12, -9,-13, 0, 0,-11, -7, -8,-11,-26,-15, 0; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='D'; M= -6, 4,-22, 8, 3,-22, -7, -8,-19, -6,-22,-17, 0, -2, -2,-10, 1, -4,-16,-27,-16, 1; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='S'; M= -1, 1,-20, 1, -2,-23, -1, -8,-23, -4,-29,-20, 6, -9, -4,-11, 16, 3,-19,-31,-18, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M= -6, 0,-27, 0, 6,-25,-14, -8,-18, 5,-22,-16, -1,-14, 3, 1, 0, -5,-15,-31,-19, 4; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='V'; M= -6,-25,-15,-28,-22, -1,-27,-21, 9,-16, 2, 3,-23,-21,-16,-19,-14, -4, 10,-17, -5,-19; /M: SY='Y'; M=-13,-23,-19,-26,-20, 11,-24, 0, -3,-19, -6, -5,-16,-27,-18,-19,-15,-11, -3, -4, 26,-19; /M: SY='T'; M= -3, -6,-20, -6, -6,-22,-13,-14,-16, -8,-20,-14, -5, -2, -5,-12, 2, 5,-11,-31,-19, -6; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='G'; M= 1, -4,-26, -2,-10,-28, 30,-16,-31,-14,-33,-24, -5,-18,-12,-16, 3,-11,-23,-32,-26,-11; /M: SY='D'; M= -8, 11,-29, 15, 9,-29, -7, -9,-24, -4,-30,-21, 5,-13, 0,-11, 2, -5,-21,-36,-22, 5; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='N'; M= -3, 0,-11, -3, -5, -8, 0, -5,-10, -5,-13, -9, 4, -7, -5, -7, 3, 0, -9,-15, -8, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='S'; M= 2, 2,-17, 3, 1,-23, -4,-10,-21, -4,-28,-20, 6, -5, -2,-11, 22, 3,-19,-31,-19, 0; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: M= -7, -8,-23,-12, -7,-17,-12, -9,-18, -2,-20,-14, -5,-10, -4, -7, -4, -6,-13,-27,-13, -7; /M: SY='Y'; M=-17,-30,-19,-31,-22, 29,-30, 8, -3,-22, -5, -3,-23,-31,-21,-22,-19,-18, -5, 12, 50,-22; /M: SY='S'; M= 0, -7,-20,-10, -2,-17,-10, -2,-22, 2,-24,-17, 1,-15, 1, 7, 13, 2,-20,-24,-12, -2; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 56,-30,-11, 0,-30, -1, -1,-30,-40,-29,-30,-20,-20,-10, 13, 29,-30; /M: SY='S'; M= 7, -8,-16, -8, -2,-21, -7,-11,-15, -5,-20,-12, -3,-13, 1, -8, 10, 4, -9,-28,-18, -1; /M: SY='F'; M=-14,-33,-13,-35,-28, 15,-34,-19, 15,-27, 15, 7,-32,-31,-24,-25,-22,-12, 9, -8, 9,-27; /M: M= -9, -7,-22,-10, -3,-16,-18, -6,-13, -6,-16, -9, -2,-19, 0, -9, -2, -5,-11,-18, -9, -3; /M: SY='E'; M= -5, 0,-27, 0, 5,-29, -6,-10,-27, 3,-30,-21, 0, -3, 2, -5, 4, -5,-22,-30,-22, 4; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='G'; M= -4, -3,-21, -4, -4,-22, 3,-11,-19, -5,-21,-16, -1,-10, -6, -5, 1, -1,-15,-26,-19, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='S'; M= -3, 3,-22, 5, 2,-24, 2,-11,-22, -2,-26,-19, 2,-11, -3, -9, 6, 0,-18,-29,-21, 0; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: M= -6, -6,-21, -5, -5,-16, 0, -9,-18, -8,-20,-14, -5,-14, -5,-10, -1, -5,-15,-20,-11, -6; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='D'; M= -6, 13,-28, 18, 13,-29, -7, -8,-26, -4,-32,-22, 8,-13, 1,-10, 8, -1,-23,-36,-23, 8; /M: M= -8, -6,-23, -5, 0,-17,-17, -8,-15, -6,-17,-11, -5,-12, -1,-10, -2, -4,-12,-26,-11, -1; /M: SY='Y'; M=-12,-11,-22,-14,-10, 1,-17, -1,-16,-10,-18,-13, -4,-22,-10,-12, -4, -4,-14,-10, 12,-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='G'; M= 0, -7,-20,-11, -9,-18, 3,-11,-18, -7,-21,-14, -1,-16, -6, -4, 2, -3,-14,-26,-17, -8; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='L'; M=-14,-33,-11,-33,-27, -2,-34,-27, 19,-26, 26, 13,-32,-27,-19,-21,-23, -8, 13,-21,-10,-26; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='R'; M= -4,-16,-20,-19, -8,-14,-21,-13,-10, -4, -7, -4,-11,-19, -2, 5, -5, 4, -9,-22,-14, -8; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='I'; M=-10,-33,-11,-33,-29, -3,-36,-29, 27,-26, 23, 15,-32,-26,-22,-26,-23, -5, 24,-23,-10,-26; /M: SY='Y'; M=-17,-25,-19,-28,-18, 15,-28, 3, -8,-17, -8, -8,-19,-28,-15,-17,-15,-11,-10, 10, 28,-18; /M: SY='H'; M=-15, 1,-30, -5, 5,-19,-17, 33,-28, 5,-27,-17, 5,-17, 13, 5, -6,-14,-25,-25, -2, 5; /M: SY='Q'; M= -9, 4,-27, 4, 12,-27,-15, -1,-24, 3,-25,-15, 4,-15, 14, 1, 0, -6,-21,-29,-18, 11; /M: SY='V'; M= -6,-25,-12,-26,-23, -7,-24,-24, 8,-20, 7, 3,-23,-21,-16,-21,-12, 6, 11,-22,-10,-19; /M: SY='G'; M= 5, -4,-22, -2, -7,-27, 16,-16,-26, -9,-30,-21, -6,-16, -9,-10, 6, -7,-20,-33,-25, -9; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='P'; M= -8, -5,-25, 0, -5,-27,-16,-16,-14,-12,-20,-15,-10, 8, -7,-19, -5, -5, -9,-35,-21, -6; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='G'; M= 7, -5,-19, -4, -6,-24, 8,-14,-22,-10,-27,-18, -4,-13, -7,-11, 7, -1,-16,-31,-22, -7; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='V'; M= 1,-15,-14,-18,-15, -7,-16,-15, -1,-14,-10, -6,-11,-19,-13,-16, -3, -1, 3,-23, -7,-13; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='G'; M= 0, -9,-22, -8,-13,-25, 20,-17,-24,-14,-27,-20, -8,-13,-12,-16, 3, -2,-17,-30,-24,-13; /M: SY='L'; M=-13,-30,-14,-32,-23, 6,-32,-16, 10,-21, 14, 7,-28,-28,-17,-18,-20,-11, 5,-13, 5,-23; /M: SY='W'; M=-12,-18,-19,-22,-13, -4,-18, -6,-16,-13,-17,-13,-11,-24, -8,-13, -6, -7,-16, 8, 6,-12; /M: SY='G'; M= 2,-10,-28,-10,-18,-29, 52,-19,-37,-17,-38,-28,-10,-19,-17,-18, 1,-18,-27,-30,-29,-17; /M: SY='E'; M= -5, -1,-24, -1, 6,-22,-10, -6,-21, -3,-23,-13, 3,-14, 4, -6, 4, 5,-17,-28,-17, 5; /M: SY='T'; M= 6,-15,-15,-15,-14,-19, -2,-20, -8,-13,-14, -9,-12,-16,-11,-15, 1, 7, -1,-29,-20,-12; /M: SY='D'; M= -9, 4,-25, 8, 3,-21,-16, -7,-17, -5,-22,-15, -2,-15, 0,-12, 0, -1,-14,-31,-15, 1; /M: SY='I'; M= -7,-31,-11,-32,-29, -3,-33,-27, 27,-24, 16, 10,-31,-25,-22,-27,-21, -6, 27,-24, -8,-24; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='P'; M= -9, -9,-26, -9, -4,-27,-17,-12,-23, -8,-24,-21, -9, 34, -5,-13, -6, -8,-17,-32,-21, -5; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='T'; M= -2, -8,-15, -7, -8,-20,-14,-17, -9,-10,-12,-10, -5, -6, -8,-13, 1, 15, -3,-29,-18, -7; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='Y'; M=-13,-18,-21,-19,-14, 2,-19, 4,-11,-13,-14,-10,-13,-21, -9,-15,-12,-13, -8, -6, 23,-12; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='H'; M=-12, -2,-29,-10, 0,-18,-16, 29,-26, 0,-26,-19, 6,-19, 5, 12, -4,-10,-25,-25, -2, -1; /M: SY='A'; M= 18,-14,-12,-14,-10,-22, -2,-18,-14, -8,-19,-13,-13,-12, -9, -7, 4, 0, -7,-31,-21,-10; /M: SY='G'; M= -1, -9,-28, -9,-12,-26, 35,-16,-34,-14,-35,-26, -8,-11,-14,-15, 1,-15,-27,-30,-25,-13; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -2, -7,-27, -6,-11,-28, 36,-16,-33,-14,-34,-25, -8, -9,-12,-16, 0,-14,-25,-29,-26,-11; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M= -9, 3,-21, -1, -4,-21,-12, -5,-18, -7,-20,-13, 10,-14, -4, -8, 1, -3,-17,-27,-16, -5; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= 0, -4,-20, -4, -9,-22, 29,-12,-25,-11,-27,-19, -3,-14, -9,-13, 5, -9,-20,-23,-21, -9; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='P'; M= 2, -9,-11,-10, -5,-15, -8, -9, -8, -5,-10, -6, -8, 5, 0, -7, -1, -3, -5,-18,-13, -4; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='N'; M= -9, 9,-23, 8, 2,-23,-10, -4,-17, -4,-22,-12, 12,-14, 2, -5, 4, -2,-16,-30,-18, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='D'; M=-12, 15,-31, 27, 7,-33,-14,-13,-23,-10,-29,-23, -1, -4, -3,-17, -1, -4,-20,-42,-25, 1; /M: SY='F'; M=-13,-22,-19,-23,-14, 5,-28,-12, -2,-16, 1, 2,-20,-23, -8,-16,-13, -7, -4,-13, 2,-13; /M: SY='V'; M= -2,-23,-11,-23,-21,-10,-25,-24, 17,-19, 4, 2,-21,-20,-17,-23, -9, 2, 20,-26,-12,-17; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-40,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-20,-30,-30,-30,-40,-10,-10,-10,-20,-20,-40; /M: SY='S'; M= -4, -2,-22, -2, 4,-21,-13, -6,-21, -1,-22,-13, 2,-14, 8, -2, 9, 7,-16,-27,-16, 4; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-27, -6, 6,-28, -9, -2,-26, 4,-21, -8, -4, -8, 30, 2, 0, -8,-18,-24,-21, 12; /M: SY='V'; M= -5,-16,-17,-16,-18,-15,-25,-21, 8,-15, -4, -2,-17,-12,-13,-21,-12, 0, 14,-30,-14,-13; /M: SY='S'; M= 1, -6,-21, -7, -4,-24, -2,-10,-22, -5,-24,-16, -2,-11, -1, -5, 5, -3,-17,-29,-19, -4; /M: SY='D'; M= -5, 1,-23, 4, -1,-26,-14,-11,-19, -9,-25,-18, -1, 0, -3,-14, 1, 2,-14,-35,-21, -2; /M: SY='T'; M= 1,-17,-14,-19,-14,-15,-20,-13, -2,-12, -7, -5,-13,-13, -9,-12, -5, 3, 2,-28,-12,-12; /M: SY='T'; M= -6,-13,-16,-13, -9,-13,-15, -8,-14,-11,-17,-13, -8,-10, -8,-15, -1, 3, -9,-18, -2, -9; /M: SY='I'; M= -6,-21,-16,-22,-19, -6,-23,-21, 7,-19, -1, 0,-19,-17,-17,-20,-11, -2, 7,-23,-11,-18; /M: SY='T'; M= -5,-15,-15,-15,-14,-10,-24,-18, 0,-15, -4, -4,-12,-19,-13,-14, -6, 11, 3,-25,-11,-13; /M: SY='L'; M=-12,-27,-14,-28,-20, -6,-33,-21, 13,-20, 16, 12,-24,-25,-14,-16,-18, -6, 9,-22,-10,-20; /M: SY='T'; M= -5,-12,-12, -9,-12,-15,-21,-16, -1,-16, -5, -6,-13,-20,-12,-18, -4, 2, 0,-28,-13,-13; /M: SY='S'; M= -4, -1,-22, -3, -2,-22,-10,-10,-18, -2,-22,-14, 3,-14, 0, -7, 5, -3,-15,-31,-19, -1; /M: SY='A'; M= 1,-13,-13,-14,-10,-16,-14,-15,-11,-11,-15,-10,-12,-11, -8,-13, -1, -5, -9,-27,-15,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of true positive hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | AA1-like |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
5 sequences
ALTA1_ALTAL (P79085), ALTA1_ALTBO (Q5EZ82), ALTA1_STEBT (Q5EZC5), PEVD1_VERDA (G0Y276), PEVD1_VERDV (G2WWV6)» more
|
| PDB [Detailed view] |
3 PDB
3V0R; 4AUD; 5XMZ |