Home  |  Contact
Entry: PS51904

General information about the entry

Entry name [info] GLYCOSYL_HYDROL_F25_2
Accession [info] PS51904
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 16-OCT-2019 CREATED;
16-OCT-2019 DATA UPDATE;
12-AUG-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00737
Associated ProRule [info] PRU01252

Name and characterization of the entry

Description [info] Glycosyl hydrolase family 25 (GH25) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=210;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=205;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3915133; R2=0.0228244; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=400; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M=  0, -7,-21,-10, -7,-14, -9, -9,-11, -6,-12, -5, -4,-10, -5, -6,  0, -1, -8,-23, -9, -7;
/M: SY='V';  M= -3,-14,-21,-17,-13, -8,-19,-14,  3, -9, -1,  3,-12,-15,-10,-10, -7, -3,  5,-22, -5,-13;
/M: SY='K';  M=-11, -4,-25, -4, -2,-11,-19,  1,-16,  5,-12, -6, -3,-15,  0,  5, -8, -7,-14,-17,  1, -2;
/M: SY='G';  M=  1,-13,-26,-14,-20,-21, 43,-20,-24,-20,-20,-13, -5,-20,-20,-20, -2,-15,-16,-20,-23,-20;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-23,-34,-27,  2,-33,-26, 35,-26, 17, 16,-22,-22,-21,-25,-16, -7, 28,-21, -2,-27;
/M: SY='D';  M=-19, 48,-29, 66, 19,-39,-10,  0,-39,  0,-30,-29, 19,-10,  0,-10,  1, -9,-29,-40,-20,  9;
/M: SY='V';  M= -4,-28,-17,-31,-27,  0,-31,-27, 31,-22, 14, 12,-25,-26,-25,-22,-13, -3, 36,-25, -6,-27;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-11, -1, -1,-18, -2, -9,-18,-10,-26,-18,  8,-11, -1,-10, 33, 16,-10,-36,-17, -1;
/M: SY='H';  M= -6,  0,-23, -1,  3,-19,-11, 18,-21,  0,-20, -9,  5,-15,  5,  2,  3, -5,-18,-25, -3,  2;
/M: SY='Y';  M=-15,-16,-31,-18,-15,  4,-18, 21,-16,-14,-13, -7,-12,-22, -8,-11,-17,-16,-20, 28, 29,-13;
/M: SY='Q';  M= -9,  7,-26,  3, 11,-31,-16,  6,-16,  4,-19, -4, 10,-13, 35,  4,  2, -5,-24,-25,-12, 23;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-26, -5, -9,-26, 32,-13,-30,-11,-26,-17,  2,-11,-11,-13,  4, -8,-23,-25,-23,-10;
/M: SY='B';  M= -5,  7,-22,  6,  2,-20,-12, -7,-17, -2,-18,-13,  7,-10, -3, -5,  3,  1,-13,-28,-13, -1;
/M: SY='I';  M= -5,-19,-23,-25,-21, -6,-27,-22, 24,-21,  7,  9,-14,-19,-16,-21, -9, -4, 19,-25, -6,-21;
/M: SY='D';  M=-12, 30,-24, 35,  8,-28, -7, -2,-27, -3,-25,-21, 21,-13, -1, -8,  4, -3,-23,-35,-17,  3;
/M: SY='W';  M=-15,-30,-36,-32,-24, 17,-21,-23,-11,-19, -9,-10,-28,-26,-20,-18,-27,-19,-16, 77, 21,-19;
/M: SY='E';  M= -2,  7,-23,  7,  8,-24, -9, -4,-22,  3,-22,-15,  8, -8,  6, -1,  6, -1,-19,-27,-15,  7;
/M: SY='K';  M=  0, -5, -8, -8, -2,-20,-15,-11,-17,  3,-15, -9, -4,-16,  0, -1, -1, -3,-11,-25,-12, -1;
/M: SY='V';  M=  0,-23,-15,-25,-22,  1,-25,-22, 16,-19, 11,  7,-22,-25,-21,-18,-12, -4, 23,-21, -4,-22;
/M: SY='K';  M= -1, -4,-24, -6,  1,-21,-15,-10,-20, 19,-20,-10, -3,-12,  2, 13, -4, -5,-13,-18,-10,  1;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='N';  M=  3,  5,-20,  2,  3,-22, -8, -6,-19,  3,-19,-12,  7,-12,  2, -1,  5, -2,-15,-27,-15,  2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='S';  M=  4,  4,-20,  2,  0,-21, -8, -6,-16, -4,-15,-10,  4,-13,  1, -8,  5, -1,-13,-27,-13,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='G';  M= -2, -3,-25, -3, -9,-25, 32,-12,-29, -8,-24,-15,  3,-15, -9, -9,  0,-12,-22,-21,-21, -9; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='I';  M= -3,-23,-19,-27,-22,  1,-27,-19, 20,-19,  8,  8,-19,-22,-18,-19,-12, -4, 20,-19,  1,-22;
/M: SY='D';  M= -6,  7,-24,  9,  7,-25,-12, -5,-22,  6,-21,-13,  5,-12,  5,  5,  3, -3,-16,-29,-14,  5;
/M: SY='F';  M=-13,-25,-19,-32,-25, 46,-20,-17, -1,-24,  5, -1,-17,-27,-30,-17,-15, -9,  0,  0, 18,-25;
/M: SY='V';  M= 16,-20,-12,-25,-20, -8,-13,-24,  8,-16,  1,  1,-18,-21,-20,-19, -3, -2, 19,-24,-13,-20;
/M: SY='Y';  M=-13,-25,-26,-31,-24, 18,-31,-14, 20,-20, 10, 10,-19,-24,-19,-17,-18, -9, 12, -3, 21,-24;
/M: SY='I';  M= -3,-24,-18,-29,-23, -4,-27,-22, 23,-21, 12, 12,-19,-22,-17,-18,-14, -7, 20,-23, -6,-22;
/M: SY='R';  M=-12, -4,-29, -5,  5,-24,-16, -6,-28, 34,-24,-10, -1,-14,  8, 35, -9, -9,-20,-18, -7,  5;
/M: SY='A';  M= 22,-13, -9,-19,-14,-13, -9,-19, -3,-14, -4, -5,-12,-17,-13,-18,  3,  0,  4,-23,-13,-14;
/M: SY='T';  M= -1, -4,-17, -8, -8,-16, -2,-15,-17,-10,-18,-13, -1,-10, -6,-11, 12, 19,-11,-22,-12, -7;
/M: SY='E';  M=-10,  4,-26,  9, 25,-19,-16,  2,-23,  2,-17,-13, -1,-10, 11, -1, -1, -7,-23,-21, -5, 17;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-28, -8,-16,-28, 54,-17,-36,-16,-28,-19,  1,-18,-16,-16,  3,-15,-27,-22,-27,-16;
/M: SY='T';  M=  0, -3,-19, -7, -6,-16, -6,-11,-13, -7,-14, -9,  0,-14, -5, -8,  7,  8, -8,-25,-12, -6;
/M: SY='N';  M= -5,  4,-21,  2, -5,-17,  1, -7,-20, -8,-18,-14,  6,-16, -6, -9,  5,  2,-16,-25,-11, -6;
/M: SY='Y';  M=-10,-14,-24,-17,-13,  8,-19,  1, -5,-11, -4, -2,-11,-22, -9, -9,-10, -6, -7, -2, 22,-13;
/M: SY='V';  M= -6,-11,-21,-12, -8, -9,-22,-14, -1, -5, -4, -2,-10,-15, -8, -6, -5,  0,  3,-22, -6, -9;
/M: SY='D';  M=-14, 38,-27, 47, 13,-33, -7,  0,-33,  0,-28,-25, 22,-12,  1, -7,  3, -7,-27,-37,-19,  7;
/M: SY='P';  M= -5, -5,-28, -2,  4,-24,-15,-10,-20,  0,-22,-14, -4, 20,  0, -4,  1, -2,-19,-28,-17,  0;
/M: SY='Y';  M= -9, -2,-21, -5, -4, -8,-18, -1,-14,  0,-12, -6, -1,-18, -2,  0, -5, -3,-12,-15,  5, -4;
/M: SY='F';  M= -6,-19,-19,-24,-19, 28,-20,-13, -4,-18,  2, -2,-15,-23,-22,-15,-12, -8, -3, -3, 15,-19;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='E';  M=  0, -2,-20, -2,  3,-18,-14, -8,-14,  1,-14, -9, -2,-10,  0, -2,  1, -2,-10,-24,-11,  1; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='E';  M= -2,  2,-22,  0,  6,-21,-12, -3,-20,  4,-19,-12,  3,-12,  6,  3,  4,  1,-16,-25,-10,  5;
/M: SY='N';  M=-10, 19,-23,  8,  0,-16, -9, 13,-19, -2,-23,-13, 30,-18,  6,  0,  4, -3,-25,-27, -6,  3;
/M: SY='W';  M= -9,-25,-27,-29,-22,  7,-27,-15, 10,-17,  4,  4,-22,-25,-16,-16,-19,-10,  5, 17, 17,-20;
/M: SY='K';  M=  0,  3,-22, -1,  5,-22,-12, -5,-19,  7,-19,-11,  6,-12,  6,  5,  3, -1,-16,-26,-13,  5;
/M: SY='N';  M= -1,  6,-23,  2,  1,-24, 11, -5,-25, -3,-23,-15, 12,-15, -1, -5,  3, -7,-23,-27,-18,  0;
/M: SY='A';  M= 32,-12, -3,-21,-13,-16, -7,-20, -6,-13, -7, -6,-11,-14,-12,-19,  6,  1,  2,-24,-17,-12;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-26, -4,  3,-21,-16, -4,-20, 15,-18, -8,  0,-14,  6, 16, -5, -6,-16,-20, -8,  3;
/M: SY='A';  M=  9,  1,-21, -2,  4,-23, -9, -9,-19,  7,-19,-12,  2,-11,  3,  2,  4, -2,-14,-25,-15,  3;
/M: SY='A';  M= 22, -7,-12,-14, -8,-16, -8,-11, -9, -8, -9, -8, -4,-15, -7,-12,  4, -1, -3,-22,-12, -8;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-28, -5,-14,-28, 52,-15,-36,-14,-28,-19,  4,-18,-15,-15,  1,-16,-28,-22,-27,-14;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-22,-29,-20,  5,-29,-20, 22,-22, 27, 18,-23,-24,-17,-18,-21, -8, 14,-20, -1,-20;
/M: SY='P';  M= -7, -9,-27, -8, -4,-17,-17,-10,-10, -1,-11, -6, -8,  3, -5, -5, -8, -7,-11,-23, -9, -6;
/M: SY='V';  M= -7,-22,-17,-25,-20,  1,-26,-17,  8,-11,  1,  3,-18,-23,-17, -3,-10, -2, 15,-17, -1,-20;
/M: SY='G';  M=  1, -3,-28, -2,-11,-29, 49,-14,-36,-16,-28,-19,  2,-17,-14,-17,  2,-16,-27,-23,-26,-13;
/M: SY='A';  M= 18,-18,-14,-23,-18, -5,-12,-22,  3,-16, -1, -2,-16,-17,-18,-19, -1, -1, 12,-21,-11,-18;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-29,-20,-20, 31,-30, 19,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10, 29, 78,-20;
/M: SY='H';  M=-14,-10,-27,-12, -9, -5,-22, 48,-13,-14, -8,  3, -3,-21, -2, -8,-12,-15,-15,-16, 14, -8;
/M: SY='F';  M=-19,-25,-24,-30,-25, 53,-29, -4,  0,-21,  5,  0,-19,-29,-26,-15,-19, -8, -3, 16, 46,-25;
/M: SY='A';  M=  5,-15,-17,-18,-13,  3,-12,-15, -7,-16, -7, -7,-11, -7,-15,-17,  2,  0, -5,-17, -3,-14;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-15, -8, -4,-13,-19,  2,-17,  1,-14, -8, -2,-19,  2,  9, -3, -1,-14,-18,  2, -3;
/M: SY='A';  M=  7,-14,-21,-17,-11, -5,-11,-15,-10,-13,-11, -9,-12,  5,-14,-17, -3, -4, -9,-17, -8,-13;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='N';  M= -4,  0,-16, -1, -2,-13, -8, -7,-10, -2,-11, -7,  2,-11, -2, -2,  2,  2, -7,-21, -9, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  0,  7,-10,  5, -1,-13, -2, -5,-13, -5,-15,-11, 10, -8, -3, -5, 12,  9,-10,-22,-11, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='T';  M=  0, -6, -3, -8, -5,-12,-13,-13, -6, -8, -8, -6, -6,-10, -7,-10,  1,  3, -1,-23,-12, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  2,  3,-20,  2,  5,-22, -6, -9,-21,  1,-21,-14,  4,-11,  1, -2,  9,  2,-15,-28,-16,  3;
/M: SY='D';  M= -5, 13,-23, 16, 12,-26,-10, -5,-24, -1,-23,-17,  8, -5,  4, -6,  8,  0,-20,-32,-17,  8;
/M: SY='A';  M= 22,-13,-20,-16,-11,-22,  8,-19,-15,-13,-16,-11,-10,  4,-12,-19,  3, -6,-10,-22,-22,-13;
/M: SY='K';  M=  0, -7,-23, -8,  2,-19,-18,-10,-10,  5,-11, -6, -6,-13,  2,  3, -3, -3, -6,-23,-10,  1;
/M: SY='E';  M=  4,  2,-22,  1,  9,-23,-11, -8,-18,  2,-17,-12,  1,-10,  6, -3,  4, -1,-14,-26,-15,  7;
/M: SY='Q';  M=-10,  5,-30, 10, 37,-35,-19,  5,-25,  9,-20,-10,  0, -5, 39,  5,  0,-10,-29,-25,-15, 38;
/M: SY='A';  M= 37,-13,-11,-22,-13,-13, -4,-21, -5,-13, -6, -7,-12,-14,-13,-20,  5, -1,  4,-20,-16,-13;
/M: SY='D';  M= -7, 12,-25, 13, 12,-27,-13, -1,-24,  8,-22,-14, 10,-12, 11,  6,  2, -4,-21,-29,-15, 11;
/M: SY='Y';  M=-11, -2,-25, -6, -6,  2,-18,  9,-13, -8,-10, -7,  2,-21, -6, -7, -7, -7,-15, -8, 11, -7;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-13,-33,-26, 41,-28,-19,  6,-25, 11,  4,-21,-28,-30,-19,-16, -6,  8, -5, 15,-26;
/M: SY='I';  M= -4,-24,-20,-27,-21,  4,-28,-17, 17,-20, 16,  9,-22,-25,-18,-18,-17, -7, 14,-13,  6,-21;
/M: SY='N';  M= -2, 10,-22,  8,  8,-25, -9, -2,-24,  8,-24,-15, 13,-12,  7,  6,  7, -1,-20,-29,-15,  7;
/M: SY='T';  M= -3, -6,-19,-11, -8,-10,-16, -6, -7, -6, -7, -3, -2,-18, -4, -4, -2,  1, -5,-21, -5, -7;
/M: SY='V';  M=  2,-24,-17,-28,-22, -1,-21,-23, 17,-22, 17, 10,-22,-24,-20,-21,-13, -5, 18,-22, -7,-22;
/M: SY='K';  M= -6,  1,-26,  1,  3,-26, -5, -8,-25, 11,-25,-13,  3, -4,  3,  7,  0, -6,-21,-26,-16,  2;
/M: SY='G';  M= -1,  0,-24, -1, -2,-22,  4,-10,-22, -1,-19,-13,  2,-10, -3, -5,  0, -7,-18,-25,-17, -3;
/M: SY='Y';  M= -7, -9,-23,-11, -7, -5,-18, -2,-10, -5, -7, -5, -7,-20, -5, -4, -9, -7,-10, -6,  9, -7;
/M: SY='N';  M= -3,  2,-24,  1,  0,-23,  2, -8,-23, -1,-22,-14,  5, -9, -2, -4,  2, -4,-18,-27,-17, -2;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M:         M= -3,-14,-21,-16,-14, -5, -8,-15, -1,-16,  0, -1,-10,-15,-13,-15, -8, -7, -1,-17, -6,-14; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D';  M= -6, 13,-20, 16,  6,-22, -6, -5,-21, -1,-19,-15,  9, -8,  0, -5,  5,  1,-17,-27,-14,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-11, -1, -2, -7, -8, -6, -6, -5, -7, -5, -1, -4, -4, -6,  1,  1, -4,-14, -5, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-16,-19,-15,  4,-19,-11,  2,-16, 14,  5,-15,-23,-14,-11,-15, -5, -1,-15,  5,-15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='P';  M= -8,-19,-30,-17, -9,-12,-20,-17, -7,-11,-12, -6,-17, 32,-12,-15,-10, -6,-12,-22,-13,-13;
/M: SY='I';  M= -8,-25,-26,-24,-17, -7,-24,-21, 10,-19,  4,  4,-23, 10,-18,-21,-16, -8,  6,-21, -9,-20;
/M: SY='V';  M=  1,-26,-19,-30,-25,  5,-22,-22,  8,-18,  1,  2,-25,-25,-21,-19,-14, -8, 14, 11,  6,-22;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-19,-29,-23, 12,-30,-18, 19,-25, 25, 13,-22,-27,-21,-20,-21, -8, 13,-16,  6,-22;
/M: SY='D';  M=-19, 47,-30, 65, 20,-39,-10,  0,-39,  0,-29,-28, 19,-10,  2, -9,  0,-10,-30,-39,-20, 11;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-19,-32,-25,  7,-30,-22, 24,-23, 18, 14,-25,-26,-21,-21,-18, -7, 22,-13,  2,-24;
/M: SY='E';  M= -9,  9,-29, 18, 56,-29,-20, -1,-29,  9,-20,-19,  0, -1, 18,  0,  1, -8,-28,-30,-19, 37;
/M: SY='D';  M= -5,  2,-23,  4,  2,-16,-13, -8,-17, -5,-16,-13, -1,-12, -3, -8,  0, -2,-13,-18, -8,  0;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='N';  M= -4,  0,-21, -2, -4,-15,-10, -7,-15, -6,-17,-12,  2, -5, -5, -9,  2,  0,-14,-23, -9, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='S';  M= -1, -1,-12, -1, -2,-11,  0, -7,-11, -5,-12, -8,  0, -2, -4, -6,  3,  0, -8,-15, -9, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M:         M= -4, -2, -7, -4, -3,-12, -9, -6,-10, -4,-11, -6,  0, -9, -1, -4,  0, -1, -9,-16, -8, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M:         M= -6, -5,-20, -6, -4, -9, -9, -8,-14, -4,-12, -9, -4,-12, -4, -6, -5, -5,-13,  0, -1, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='G';  M= -4, -2,-21, -3, -4,-18,  3, -6,-20, -4,-19,-11,  3, -8, -4, -4,  2, -3,-16,-21,-13, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M:         M= -5,-12,-19,-14, -9, -9,-15,-12, -4,-10,  0,  0,-10,-11, -8, -9, -8, -4, -5,-20, -7, -9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='S';  M= -1,  6,-19,  5, -1,-21, -3, -9,-20, -6,-23,-16,  9, -8, -3, -8, 14,  8,-15,-32,-17, -2;
/M: SY='K';  M= -2, -7,-22, -8, -4,-19,-12,-10,-15,  2,-16, -8, -4, -4, -3,  1, -2, -3,-12,-23,-13, -5;
/M: SY='S';  M=  3,  4,-21,  4,  7,-23, -6, -8,-21, -1,-20,-14,  3, -8,  3, -6,  8,  2,-16,-28,-16,  4;
/M: SY='E';  M= -1,  3,-22,  2,  6,-21,-12, -6,-17,  1,-16,-10,  2,-12,  6, -2,  2,  0,-14,-25,-13,  6;
/M: SY='I';  M= -7,-12,-20,-18,-16, -3,-20,-12,  7,-14,  7,  7, -6,-23,-12,-10,-11, -5,  4,-21, -4,-15;
/M: SY='T';  M= -2, -7,-16,-12, -7,-14,-18,-13, -6, -5, -8, -4, -3,-15, -4, -3,  3,  8, -1,-27,-11, -7;
/M: SY='B';  M=  4,  7,-21,  5,  6,-24, -8, -7,-21,  3,-20,-14,  7,-11,  4, -1,  5, -1,-17,-27,-16,  5;
/M: SY='F';  M= -7,-13,-23,-17,-12,  1,-17,-13, -4,-13, -5, -3, -9,-21,-11,-12,-11, -9, -6,  0,  1,-11;
/M: SY='V';  M=  4,-22,-10,-28,-22, -3,-24,-24, 16,-21, 11,  7,-19,-22,-19,-21, -9, -1, 18,-24, -8,-22;
/M: SY='K';  M= -7,  1,-24, -2,  3,-19,-17, -5,-14,  5,-12, -6,  3,-15,  5,  5, -3, -4,-13,-26,-11,  3;
/M: SY='A';  M= 12, -2,-18, -4,  0,-20,-11,-12,-13, -4,-13,-10, -3,-12, -2, -7,  6,  3, -7,-26,-15, -1;
/M: SY='F';  M=-16,-29,-23,-37,-28, 50,-27,-19,  2,-26,  8,  3,-23,-29,-30,-19,-22,-12, -1, 23, 24,-26;
/M: SY='L';  M= -5,-23, -1,-27,-21, -2,-26,-21, 11,-21, 13,  8,-20,-26,-18,-18,-15, -6, 11,-23, -6,-21;
/M: SY='D';  M= -4, 15,-21, 16, 10,-26, -9, -3,-24,  3,-23,-17, 13,-12,  5, -1,  7,  0,-20,-32,-17,  7;
/M: SY='R';  M= -4, -6,-23, -8,  4,-17,-18, -7,-12,  2,-10, -6, -5,-13,  3,  5, -2,  2, -9,-22, -8,  2;
/M: SY='I';  M= -2,-26,-17,-30,-24,  4,-27,-22, 22,-23, 19, 14,-23,-25,-20,-21,-16, -6, 21,-20, -2,-23;
/M: SY='E';  M= -9,  2,-26,  3, 18,-24,-17,  0,-22, 13,-19,-11,  2,-11, 12, 10, -2, -7,-21,-24,-11, 14;
/M: SY='E';  M=  3,  3,-22,  2,  7,-25, -9, -7,-21,  7,-21,-13,  4,-11,  6,  3,  6, -1,-16,-27,-16,  6;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='A';  M=  2, -9,-21,-12, -5,-11,-15,  0,-10, -3, -4, -2, -6,-17, -2, -1, -5, -6, -8,-19, -2, -5; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G';  M= -3, -9,-23,-12,-16,-14, 22,-14,-22,-15,-17,-13, -4,-18,-14,-15,  1, -1,-16,-15, -8,-16;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='Y';  M= -8,-12,-26,-14,-16, -4,  9, -5,-16,-12,-13, -8, -7,-22,-13,-11, -8,-12,-14, -6, 10,-16; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-14, -7, -3,-10,-14, -6, -7,  6, -8, -3, -4,-11,  0,  9, -4, -2, -3,-15, -5, -3; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='K';  M= -9,  1,-25, -2,  2,-18,-17, -4,-20, 12,-19,-10,  3,-11,  3, 10, -2,  0,-16,-21, -6,  1;
/M: SY='P';  M= -3,-21,-24,-19,-13,-14,-22,-20, -1,-15, -9, -6,-19, 24,-16,-19, -8, -4, -1,-25,-16,-17;
/M: SY='M';  M= -3,-19,-23,-23,-21,-11,  4,-18,  3,-20,  0,  8,-13,-21,-16,-19,-10,-11,  3,-21,-11,-20;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-23,-35,-27,  6,-34,-25, 34,-27, 22, 16,-23,-25,-22,-24,-20, -8, 27,-20,  1,-27;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 29,-29, 19,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 29, 78,-20;
/M: SY='T';  M= 10, -6, -6,-13,-11,-14,-10,-18,-10,-13,-13,-10, -3,-13,-10,-14, 16, 23, -1,-30,-15,-11;
/M: SY='N';  M= -2,  6,-19,  0, -7,-14,  3, -3,-19, -8,-22,-15, 15,-17, -5, -8, 11,  4,-18,-25, -7, -7;
/M:         M= -2, -7,-23, -9, -4,-14,-15, -6,-13, -1,-12, -7, -5, -8, -3, -2, -3, -1,-11,-19, -5, -4;
/M: SY='N';  M= -5,  5,-22,  4, -1,-14, -7,  4,-20, -5,-21,-15,  9,-15, -2, -6,  8,  0,-18,-21, -1, -3;
/M: SY='W';  M=-15,-20,-27,-24,-18, 25,-23,-13, -7,-18, -3, -5,-18,-25,-19,-15,-18,-11,-10, 30, 21,-16;
/M: SY='W';  M=-12,-26,-30,-29,-22, 15,-24,-13, -1,-18,  2, -2,-25,-26,-17,-16,-23,-13, -7, 41, 26,-19;
/M: SY='N';  M= -7,  8,-23,  5,  5,-21,-12, -2,-20,  4,-20,-12, 11,-12,  4,  4,  3, -1,-18,-27,-11,  4;
/M: SY='N';  M= -5,  9,-22,  8,  7,-23,-10, -2,-20,  1,-20,-12, 11,-12,  7,  0,  6,  1,-19,-30,-14,  6;
/M: SY='Y';  M=-12,-12,-16,-16,-14,  3,-23,  0, -2,-10, -4, -1, -7,-23,-10, -8,-11, -7, -5,-11, 15,-14;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L';  M= -6,-18,-17,-22,-17,  4,-22,-17, 12,-19, 17, 10,-17,-21,-16,-16,-13, -2, 10,-18, -2,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='G';  M= -3,  5,-14,  4, -4,-14,  8, -6,-14, -5,-13, -9,  6,-10, -6, -7,  0, -5,-12,-16,-11, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='N';  M= -3,  3,-14,  2, -1,-10, -4, -3,-11, -2,-12, -8,  5, -8, -1, -3,  3,  0,-10,-13, -6, -1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -4, -4,-21, -5, -5,-14,-11,-10,-14, -6,-13, -9, -3,-12, -6, -8,  0, -1,-10,-18, -9, -6;
/M: SY='S';  M=  0,  2,-21,  1, -1,-19, -4, -9,-19, -6,-18,-14,  3, -9, -4, -8,  6,  2,-14,-25,-14, -3;
/M:         M= -3, -6,-22, -7, -4,-12,-12, -9,-11, -5, -9, -6, -4,-15, -5, -5, -3, -3, -8,-22, -9, -5;
/M: SY='F';  M= -6,-19,-20,-23,-17, 13,-20,-16,  2,-18,  7,  2,-14,-21,-18,-15,-11, -5,  2,-14,  2,-17;
/M: SY='S';  M=  1,  2,-21,  1,  0,-21, -4, -9,-21, -1,-20,-14,  3, -9, -2, -5,  6, -1,-16,-26,-15, -1;
/M: SY='B';  M= -6,  8,-24,  8,  4,-21, -5, -4,-23,  2,-22,-15,  8,-11,  0, -1,  2, -5,-19,-26,-13,  1;
/M: SY='Y';  M=-13, -9,-20,-11,-12,  5,-22,  4, -7, -9, -6, -4, -9,-23, -9, -8,-11, -7, -9, -2, 26,-13;
/M: SY='P';  M= -8, -6,-29, -2,  0,-22,-14,-12,-20, -3,-22,-14, -7, 26, -5, -7, -5, -6,-21,-26,-18, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-20,-28,-20,  7,-28,-19, 17,-23, 27, 13,-23,-26,-19,-17,-21, -7, 12,-18,  1,-20;
/M: SY='W';  M=-20,-39,-49,-39,-30, 11,-20,-29,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,143, 29,-20;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-22,-31,-25,  6,-32,-19, 26,-23, 17, 13,-23,-25,-19,-21,-18, -8, 21,-12,  8,-24;
/M: SY='A';  M= 36,-12,-13,-19,-10,-19, -4,-19,-12, -8,-13,-11,-11, -6, -9,-14,  6, -2, -4,-15,-18,-10;
/M: SY='H';  M= -8,  8,-24,  6,  7,-24,-12, 15,-24,  3,-22,-11, 11,-15, 12,  7,  2, -6,-23,-27, -8,  8;
/M: SY='Y';  M=-18,-22,-30,-23,-21, 25,-29,  9,  1,-13,  0, -1,-21,-28,-13,-12,-20,-10, -7, 31, 62,-20;
/M: SY='N';  M= -3,  3,-24,  2, -5,-20,  3, -8,-22, -7,-21,-15,  6, -7, -6, -8,  3, -2,-19,-26,-14, -7;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-20, -2, -6,-16, -2, -8,-17, -6,-18,-12,  3,-15, -7, -7,  5,  2,-11,-25,-10, -7;
/M: SY='N';  M= -3,  2,-22,  0,  2,-18,-10, -5,-18, -1,-18,-11,  4,-11,  0, -3,  3,  1,-14,-24,-10,  0;
/M: SY='P';  M= -4, -7,-21, -5, -2,-21,-12,-13,-17, -6,-19,-13, -6, 14, -5,-11, -2, -3,-17,-27,-18, -5;
/M: SY='P';  M= -2, -4,-23, -3, -2,-21, -7,-11,-19, -6,-21,-14, -2,  8, -5, -9,  4,  1,-16,-27,-17, -5;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='Y';  M= -5, -8,-19, -9, -7, -1,-11, -7, -8, -9, -7, -5, -6, -9, -8, -9, -3, -2, -7,-12,  1, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='N';  M= -2,  0,-16, -1, -3,-13, -2, -7,-12, -5,-12, -9,  2, -4, -4, -6,  2, -1,-10,-17,-10, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M:         M= -6, -7,-24, -8, -5,-13,-10, -8,-15, -5,-15, -9, -5, -5, -5, -5, -1, -1,-13,-18, -5, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M:         M= -5, -1,-25,  0,  0,-19,-12, -8,-15, -5,-16,-11, -1, -1, -3, -8,  0, -3,-15,-24,-12, -2;
/M: SY='Y';  M=-11,-14,-24,-17,-13,  9,-18, -8, -9,-13, -8, -6,-11, -9,-14,-13,-11, -7,-11, -2, 10,-14;
/M: SY='G';  M= -2, -1,-24, -1, -6,-21,  9,-10,-23, -6,-20,-14,  2,-13, -7, -7,  1, -6,-17,-23,-15, -7;
/M: SY='G';  M= -1,-10,-24,-13,-12,-13,  4,-13,-12,-11,-11, -4, -6,-12,-10,-12, -3, -7,-10,-20,-12,-12;
/M: SY='W';  M=-16,-30,-40,-31,-24,  8,-18,-23,-17,-17,-16,-16,-29,-25,-17,-17,-29,-22,-23, 97, 22,-18;
/M: SY='Q';  M= -5, -2,-23, -4,  3,-22,-14, -3,-16,  0,-17, -7, -1,-10, 15, -1,  3,  1,-16,-23, -9,  8;
/M: SY='Y';  M= -9,-11,-24,-14,-11,  3,-16, -4,-10, -7,-10, -6, -8,-19, -9, -7, -7, -5,-11, -4, 13,-11;
/M: SY='W';  M= -6,-18,-26,-20,-15, -5,-16,-15,-14,-14,-16,-13,-16, -8,-12,-15, -8, -3,-15, 27,  5,-13;
/M: SY='Q';  M= -1,  2,-19,  2,  4,-22,-11, -6,-17, -3,-18,-11,  2,-12,  8, -5,  8,  4,-13,-27,-13,  6;
/M: SY='Y';  M= -7,-14,-23,-19,-14,  4,-18, -8,  0,-12, -1,  3,-11,-21,-11,-11, -8, -4, -1,-12,  7,-14;
/M: SY='W';  M= -7,-15,-30,-17,-14, -9, -1,-11,-22, -8,-20,-13,-12,-20,-10, -9, -9, -9,-20, 25,  1,-11;
/M: SY='Q';  M= -9,  4,-27,  4, 13,-30,-16,  5,-21,  8,-21, -7,  4,-11, 31,  8,  2, -5,-24,-23, -9, 21;
/M: SY='Y';  M=-13,-18,-24,-20,-18, 14,-24, -2,  1,-11, -1,  0,-14,-25,-14, -8,-13, -6,  0, -1, 27,-18;
/M: SY='S';  M=  3, -1,-21, -3, -4,-21,  4,-12,-21, -8,-22,-15,  3, -5, -6,-11, 10,  5,-16,-26,-18, -6;
/M: SY='G';  M= -3,  1,-24,  3, -1,-25, 14,-10,-27, -6,-23,-16,  3,-14, -3, -7,  6, -6,-20,-27,-19, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-10,-21,-13,-13,-11,-19,-16,  5,-11, -4,  0, -6,-18,-10,-12, -3,  0,  6,-26, -9,-13;
/M: SY='G';  M= -1,  0,-24,  0, -4,-23, 12,-11,-24, -7,-22,-15,  3,-10, -7,-10,  4, -5,-19,-25,-18, -6;
/M: SY='G';  M= -2, -2,-24, -5, -6,-22, 13,-10,-25, -4,-23,-14,  4,-14, -5, -3,  4, -3,-19,-24,-17, -7;
/M: SY='I';  M= -6,-16,-20,-20,-17, -4,-21,-17, 10,-16,  3,  3,-12,-19,-15,-15, -9, -4, 10,-22, -4,-17;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M:         M= -3, -5, -3, -6, -6,-16,-11,-12,-14, -9,-15,-11, -4, -3, -9,-11,  0, -3, -9,-27,-15, -8; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G';  M= -2,  0,-20,  2,-10,-23, 33,-13,-28,-13,-23,-17,  3,-14,-12,-14,  2,-10,-21,-21,-21,-11; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='I';  M= -5,-14,-18,-17,-14, -2,-17,-13,  8,-12,  3,  3,-10,-15,-11,-12, -9, -5,  6,-15, -1,-14; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='N';  M= -1,  5,-14,  4,  0,-14, -4, -5,-12, -4,-14,-10,  6, -7, -3, -6,  6,  2, -9,-22,-11, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-14, -4, -7,-11,  7, -8,-11, -7,-10, -7, -2,-11, -7, -7, -1, -4, -7,-14, -8, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='N';  M= -4,  2,-11,  0, -2, -7, -7, -3, -8, -3, -8, -6,  4, -8, -3, -3, -1, -2, -8,-14, -5, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='V';  M= -3,-21,-12,-23,-21,  0,-24,-21, 16,-16,  7,  6,-20,-23,-20,-15,-10, -2, 24,-22, -5,-21; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='D';  M=-18, 44,-29, 59, 18,-37, -9,  0,-37,  0,-29,-28, 20,-10,  0, -9,  1, -8,-29,-39,-19,  9;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-20,-24,-15,  3,-25,-13,  8,-14, 15, 12,-18,-23,-11, -9,-17, -7,  5,-17,  2,-14;
/M: SY='N';  M=-10, 30,-22, 24,  3,-23, -4,  4,-23, -1,-27,-20, 36,-16, -1, -4,  8, -1,-25,-36,-16,  1;
/M: SY='Y';  M= -6,-19,-21,-22,-16,  2,-22,-13,  4,-12,  1,  1,-17,-23,-14,-10,-11, -6,  6, -6,  7,-16;
/M: SY='F';  M=-11,-23,-19,-28,-21, 32,-24,-15, -1,-19,  5,  0,-18,-26,-23,-15,-15, -8, -1,  3, 18,-21;
/M: SY='Y';  M= -8, -1,-22, -6, -8, -5,-13, -1,-12, -5,-13, -8,  4,-13, -6, -5, -3, -3,-14,-16,  5, -8;
/M: SY='G';  M= -2, -3,-25, -4, -8,-23, 22,-13,-26, -8,-22,-14,  2,-15, -9, -9,  2, -7,-19,-24,-19, -9;
/M: SY='S';  M= -2,  8,-21,  8,  0,-22, -1, -9,-22, -6,-21,-17,  8,-11, -4, -8,  9,  4,-16,-30,-16, -2;
/M:         M= -4,-10,-22,-13, -6, -7,-18,-10, -5, -6, -4, -2, -8,-15, -7, -7, -6, -3, -5,-18, -2, -7;
/M: SY='E';  M= -1, -1,-21, -2,  1,-15,-13, -8,-16, -3,-14,-11, -1, -8, -3, -6,  1, -1,-13,-24,-11, -2;
/M: SY='E';  M= -4,  1,-23,  2,  5,-20,-11, -7,-17, -2,-13,-10, -1,-11,  3, -5,  1, -3,-15,-25,-12,  4;
/M: SY='L';  M= -7,-14,-22,-16,-11,  0,-21,-15, -1,-15,  6, -1,-13,-19,-13,-12,-11, -5, -3,-10, -2,-12;
/M: SY='K';  M= -6, -3,-24, -5,  0,-16,-15, -7,-14,  1,-13, -7, -2,-13,  1,  1, -2, -3,-12,-21, -8,  0;
/M: SY='K';  M=  1, -3,-22, -5, -1,-17,-12, -9,-16,  2,-16,-10, -1, -9, -1,  0,  2,  0,-12,-23,-11, -1;
/M: SY='F';  M= -7,-13,-23,-16,-12,  1,-18,-12, -4,-12,  0, -2,-10,-16,-11,-10, -9, -4, -5,-12,  0,-12;
/M: SY='A';  M=  3,-10,-18,-14, -9,-10,-11,-15, -8, -9, -6, -5, -9,-15, -9,-11, -3, -2, -5,-19, -9,-10;
/M:         M= -3, -5,-21, -6, -4,-17, -7,-11,-15, -3,-14, -9, -2,-12, -5, -4, -1, -3,-11,-24,-13, -5;
/M:         M= -4, -7,-24, -8, -6,-15, -8,-11,-12, -7,-12, -8, -5, -8, -7, -9, -3, -3,-10,-20,-10, -7;
/M: SY='S';  M= -3, -1,-22, -3, -3,-17, -9, -8,-15, -3,-16,-10,  1, -9, -4, -4,  2,  0,-12,-24,-11, -4;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-22, -4, -3,-18, -7,-10,-16, -4,-16,-10,  0, -7, -5, -5,  2,  0,-12,-25,-13, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_04 which contains 563'082 sequence entries.


Total number of hits 25 in 25 different sequences
Number of true positive hits 25 in 25 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Ch-type lysozyme
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
25 sequences

CF451_DICDI (Q86HE5    ), CF50_DICDI  (Q556R7    ), LYS1_CAEEL  (O62415    ), 
LYS2_CAEEL  (O62416    ), LYS3_CAEEL  (Q9XXS1    ), LYS4_ENTHI  (Q27650    ), 
LYS5_CAEEL  (Q20967    ), LYS7_CAEEL  (O16202    ), LYSG2_DICDI (Q86KC1    ), 
LYSG3_DICDI (Q8T2I5    ), LYSG4_DICDI (Q54BQ8    ), LYSG5_DICDI (Q54BL8    ), 
LYSM1_STRGL (P25310    ), LYS_ARTBC   (D4ANU4    ), LYS_BPB30   (Q8HA43    ), 
LYS_BPCP1   (P15057    ), LYS_BPCP7   (P19385    ), LYS_BPCP9   (P19386    ), 
LYS_BPMV1   (P33486    ), LYS_CHASP   (P00721    ), LYS_CLOAB   (P34020    ), 
LYS_CLOPE   (P26836    ), YEGX_ECO57  (Q8X7H0    ), YEGX_ECOL6  (Q8FFY2    ), 
YEGX_ECOLI  (P76421    )
» more

PDB
[Detailed view]
7 PDB

1H09; 1JFX; 1OBA; 2IXU; 2IXV; 2J8F; 2J8G

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission