PROSITE entry PS51904
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GLYCOSYL_HYDROL_F25_2 |
| Accession [info] | PS51904 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
16-OCT-2019 CREATED;
16-OCT-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00737 |
| Associated ProRule [info] | PRU01252 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Glycosyl hydrolase family 25 (GH25) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=210; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=205; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3915133; R2=0.0228244; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=400; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: M= 0, -7,-21,-10, -7,-14, -9, -9,-11, -6,-12, -5, -4,-10, -5, -6, 0, -1, -8,-23, -9, -7; /M: SY='V'; M= -3,-14,-21,-17,-13, -8,-19,-14, 3, -9, -1, 3,-12,-15,-10,-10, -7, -3, 5,-22, -5,-13; /M: SY='K'; M=-11, -4,-25, -4, -2,-11,-19, 1,-16, 5,-12, -6, -3,-15, 0, 5, -8, -7,-14,-17, 1, -2; /M: SY='G'; M= 1,-13,-26,-14,-20,-21, 43,-20,-24,-20,-20,-13, -5,-20,-20,-20, -2,-15,-16,-20,-23,-20; /M: SY='I'; M= -6,-28,-23,-34,-27, 2,-33,-26, 35,-26, 17, 16,-22,-22,-21,-25,-16, -7, 28,-21, -2,-27; /M: SY='D'; M=-19, 48,-29, 66, 19,-39,-10, 0,-39, 0,-30,-29, 19,-10, 0,-10, 1, -9,-29,-40,-20, 9; /M: SY='V'; M= -4,-28,-17,-31,-27, 0,-31,-27, 31,-22, 14, 12,-25,-26,-25,-22,-13, -3, 36,-25, -6,-27; /M: SY='S'; M= 10, 0,-11, -1, -1,-18, -2, -9,-18,-10,-26,-18, 8,-11, -1,-10, 33, 16,-10,-36,-17, -1; /M: SY='H'; M= -6, 0,-23, -1, 3,-19,-11, 18,-21, 0,-20, -9, 5,-15, 5, 2, 3, -5,-18,-25, -3, 2; /M: SY='Y'; M=-15,-16,-31,-18,-15, 4,-18, 21,-16,-14,-13, -7,-12,-22, -8,-11,-17,-16,-20, 28, 29,-13; /M: SY='Q'; M= -9, 7,-26, 3, 11,-31,-16, 6,-16, 4,-19, -4, 10,-13, 35, 4, 2, -5,-24,-25,-12, 23; /M: SY='G'; M= -1, -4,-26, -5, -9,-26, 32,-13,-30,-11,-26,-17, 2,-11,-11,-13, 4, -8,-23,-25,-23,-10; /M: SY='B'; M= -5, 7,-22, 6, 2,-20,-12, -7,-17, -2,-18,-13, 7,-10, -3, -5, 3, 1,-13,-28,-13, -1; /M: SY='I'; M= -5,-19,-23,-25,-21, -6,-27,-22, 24,-21, 7, 9,-14,-19,-16,-21, -9, -4, 19,-25, -6,-21; /M: SY='D'; M=-12, 30,-24, 35, 8,-28, -7, -2,-27, -3,-25,-21, 21,-13, -1, -8, 4, -3,-23,-35,-17, 3; /M: SY='W'; M=-15,-30,-36,-32,-24, 17,-21,-23,-11,-19, -9,-10,-28,-26,-20,-18,-27,-19,-16, 77, 21,-19; /M: SY='E'; M= -2, 7,-23, 7, 8,-24, -9, -4,-22, 3,-22,-15, 8, -8, 6, -1, 6, -1,-19,-27,-15, 7; /M: SY='K'; M= 0, -5, -8, -8, -2,-20,-15,-11,-17, 3,-15, -9, -4,-16, 0, -1, -1, -3,-11,-25,-12, -1; /M: SY='V'; M= 0,-23,-15,-25,-22, 1,-25,-22, 16,-19, 11, 7,-22,-25,-21,-18,-12, -4, 23,-21, -4,-22; /M: SY='K'; M= -1, -4,-24, -6, 1,-21,-15,-10,-20, 19,-20,-10, -3,-12, 2, 13, -4, -5,-13,-18,-10, 1; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='N'; M= 3, 5,-20, 2, 3,-22, -8, -6,-19, 3,-19,-12, 7,-12, 2, -1, 5, -2,-15,-27,-15, 2; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='S'; M= 4, 4,-20, 2, 0,-21, -8, -6,-16, -4,-15,-10, 4,-13, 1, -8, 5, -1,-13,-27,-13, 0; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='G'; M= -2, -3,-25, -3, -9,-25, 32,-12,-29, -8,-24,-15, 3,-15, -9, -9, 0,-12,-22,-21,-21, -9; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='I'; M= -3,-23,-19,-27,-22, 1,-27,-19, 20,-19, 8, 8,-19,-22,-18,-19,-12, -4, 20,-19, 1,-22; /M: SY='D'; M= -6, 7,-24, 9, 7,-25,-12, -5,-22, 6,-21,-13, 5,-12, 5, 5, 3, -3,-16,-29,-14, 5; /M: SY='F'; M=-13,-25,-19,-32,-25, 46,-20,-17, -1,-24, 5, -1,-17,-27,-30,-17,-15, -9, 0, 0, 18,-25; /M: SY='V'; M= 16,-20,-12,-25,-20, -8,-13,-24, 8,-16, 1, 1,-18,-21,-20,-19, -3, -2, 19,-24,-13,-20; /M: SY='Y'; M=-13,-25,-26,-31,-24, 18,-31,-14, 20,-20, 10, 10,-19,-24,-19,-17,-18, -9, 12, -3, 21,-24; /M: SY='I'; M= -3,-24,-18,-29,-23, -4,-27,-22, 23,-21, 12, 12,-19,-22,-17,-18,-14, -7, 20,-23, -6,-22; /M: SY='R'; M=-12, -4,-29, -5, 5,-24,-16, -6,-28, 34,-24,-10, -1,-14, 8, 35, -9, -9,-20,-18, -7, 5; /M: SY='A'; M= 22,-13, -9,-19,-14,-13, -9,-19, -3,-14, -4, -5,-12,-17,-13,-18, 3, 0, 4,-23,-13,-14; /M: SY='T'; M= -1, -4,-17, -8, -8,-16, -2,-15,-17,-10,-18,-13, -1,-10, -6,-11, 12, 19,-11,-22,-12, -7; /M: SY='E'; M=-10, 4,-26, 9, 25,-19,-16, 2,-23, 2,-17,-13, -1,-10, 11, -1, -1, -7,-23,-21, -5, 17; /M: SY='G'; M= 0, -8,-28, -8,-16,-28, 54,-17,-36,-16,-28,-19, 1,-18,-16,-16, 3,-15,-27,-22,-27,-16; /M: SY='T'; M= 0, -3,-19, -7, -6,-16, -6,-11,-13, -7,-14, -9, 0,-14, -5, -8, 7, 8, -8,-25,-12, -6; /M: SY='N'; M= -5, 4,-21, 2, -5,-17, 1, -7,-20, -8,-18,-14, 6,-16, -6, -9, 5, 2,-16,-25,-11, -6; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-24,-17,-13, 8,-19, 1, -5,-11, -4, -2,-11,-22, -9, -9,-10, -6, -7, -2, 22,-13; /M: SY='V'; M= -6,-11,-21,-12, -8, -9,-22,-14, -1, -5, -4, -2,-10,-15, -8, -6, -5, 0, 3,-22, -6, -9; /M: SY='D'; M=-14, 38,-27, 47, 13,-33, -7, 0,-33, 0,-28,-25, 22,-12, 1, -7, 3, -7,-27,-37,-19, 7; /M: SY='P'; M= -5, -5,-28, -2, 4,-24,-15,-10,-20, 0,-22,-14, -4, 20, 0, -4, 1, -2,-19,-28,-17, 0; /M: SY='Y'; M= -9, -2,-21, -5, -4, -8,-18, -1,-14, 0,-12, -6, -1,-18, -2, 0, -5, -3,-12,-15, 5, -4; /M: SY='F'; M= -6,-19,-19,-24,-19, 28,-20,-13, -4,-18, 2, -2,-15,-23,-22,-15,-12, -8, -3, -3, 15,-19; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='E'; M= 0, -2,-20, -2, 3,-18,-14, -8,-14, 1,-14, -9, -2,-10, 0, -2, 1, -2,-10,-24,-11, 1; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='E'; M= -2, 2,-22, 0, 6,-21,-12, -3,-20, 4,-19,-12, 3,-12, 6, 3, 4, 1,-16,-25,-10, 5; /M: SY='N'; M=-10, 19,-23, 8, 0,-16, -9, 13,-19, -2,-23,-13, 30,-18, 6, 0, 4, -3,-25,-27, -6, 3; /M: SY='W'; M= -9,-25,-27,-29,-22, 7,-27,-15, 10,-17, 4, 4,-22,-25,-16,-16,-19,-10, 5, 17, 17,-20; /M: SY='K'; M= 0, 3,-22, -1, 5,-22,-12, -5,-19, 7,-19,-11, 6,-12, 6, 5, 3, -1,-16,-26,-13, 5; /M: SY='N'; M= -1, 6,-23, 2, 1,-24, 11, -5,-25, -3,-23,-15, 12,-15, -1, -5, 3, -7,-23,-27,-18, 0; /M: SY='A'; M= 32,-12, -3,-21,-13,-16, -7,-20, -6,-13, -7, -6,-11,-14,-12,-19, 6, 1, 2,-24,-17,-12; /M: SY='R'; M= -7, -3,-26, -4, 3,-21,-16, -4,-20, 15,-18, -8, 0,-14, 6, 16, -5, -6,-16,-20, -8, 3; /M: SY='A'; M= 9, 1,-21, -2, 4,-23, -9, -9,-19, 7,-19,-12, 2,-11, 3, 2, 4, -2,-14,-25,-15, 3; /M: SY='A'; M= 22, -7,-12,-14, -8,-16, -8,-11, -9, -8, -9, -8, -4,-15, -7,-12, 4, -1, -3,-22,-12, -8; /M: SY='G'; M= -1, -4,-28, -5,-14,-28, 52,-15,-36,-14,-28,-19, 4,-18,-15,-15, 1,-16,-28,-22,-27,-14; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='L'; M= -9,-25,-22,-29,-20, 5,-29,-20, 22,-22, 27, 18,-23,-24,-17,-18,-21, -8, 14,-20, -1,-20; /M: SY='P'; M= -7, -9,-27, -8, -4,-17,-17,-10,-10, -1,-11, -6, -8, 3, -5, -5, -8, -7,-11,-23, -9, -6; /M: SY='V'; M= -7,-22,-17,-25,-20, 1,-26,-17, 8,-11, 1, 3,-18,-23,-17, -3,-10, -2, 15,-17, -1,-20; /M: SY='G'; M= 1, -3,-28, -2,-11,-29, 49,-14,-36,-16,-28,-19, 2,-17,-14,-17, 2,-16,-27,-23,-26,-13; /M: SY='A'; M= 18,-18,-14,-23,-18, -5,-12,-22, 3,-16, -1, -2,-16,-17,-18,-19, -1, -1, 12,-21,-11,-18; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-29,-20,-20, 31,-30, 19, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10, 29, 78,-20; /M: SY='H'; M=-14,-10,-27,-12, -9, -5,-22, 48,-13,-14, -8, 3, -3,-21, -2, -8,-12,-15,-15,-16, 14, -8; /M: SY='F'; M=-19,-25,-24,-30,-25, 53,-29, -4, 0,-21, 5, 0,-19,-29,-26,-15,-19, -8, -3, 16, 46,-25; /M: SY='A'; M= 5,-15,-17,-18,-13, 3,-12,-15, -7,-16, -7, -7,-11, -7,-15,-17, 2, 0, -5,-17, -3,-14; /M: SY='R'; M=-11, -6,-15, -8, -4,-13,-19, 2,-17, 1,-14, -8, -2,-19, 2, 9, -3, -1,-14,-18, 2, -3; /M: SY='A'; M= 7,-14,-21,-17,-11, -5,-11,-15,-10,-13,-11, -9,-12, 5,-14,-17, -3, -4, -9,-17, -8,-13; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='N'; M= -4, 0,-16, -1, -2,-13, -8, -7,-10, -2,-11, -7, 2,-11, -2, -2, 2, 2, -7,-21, -9, -3; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='S'; M= 0, 7,-10, 5, -1,-13, -2, -5,-13, -5,-15,-11, 10, -8, -3, -5, 12, 9,-10,-22,-11, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='T'; M= 0, -6, -3, -8, -5,-12,-13,-13, -6, -8, -8, -6, -6,-10, -7,-10, 1, 3, -1,-23,-12, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='S'; M= 2, 3,-20, 2, 5,-22, -6, -9,-21, 1,-21,-14, 4,-11, 1, -2, 9, 2,-15,-28,-16, 3; /M: SY='D'; M= -5, 13,-23, 16, 12,-26,-10, -5,-24, -1,-23,-17, 8, -5, 4, -6, 8, 0,-20,-32,-17, 8; /M: SY='A'; M= 22,-13,-20,-16,-11,-22, 8,-19,-15,-13,-16,-11,-10, 4,-12,-19, 3, -6,-10,-22,-22,-13; /M: SY='K'; M= 0, -7,-23, -8, 2,-19,-18,-10,-10, 5,-11, -6, -6,-13, 2, 3, -3, -3, -6,-23,-10, 1; /M: SY='E'; M= 4, 2,-22, 1, 9,-23,-11, -8,-18, 2,-17,-12, 1,-10, 6, -3, 4, -1,-14,-26,-15, 7; /M: SY='Q'; M=-10, 5,-30, 10, 37,-35,-19, 5,-25, 9,-20,-10, 0, -5, 39, 5, 0,-10,-29,-25,-15, 38; /M: SY='A'; M= 37,-13,-11,-22,-13,-13, -4,-21, -5,-13, -6, -7,-12,-14,-13,-20, 5, -1, 4,-20,-16,-13; /M: SY='D'; M= -7, 12,-25, 13, 12,-27,-13, -1,-24, 8,-22,-14, 10,-12, 11, 6, 2, -4,-21,-29,-15, 11; /M: SY='Y'; M=-11, -2,-25, -6, -6, 2,-18, 9,-13, -8,-10, -7, 2,-21, -6, -7, -7, -7,-15, -8, 11, -7; /M: SY='F'; M=-11,-26,-13,-33,-26, 41,-28,-19, 6,-25, 11, 4,-21,-28,-30,-19,-16, -6, 8, -5, 15,-26; /M: SY='I'; M= -4,-24,-20,-27,-21, 4,-28,-17, 17,-20, 16, 9,-22,-25,-18,-18,-17, -7, 14,-13, 6,-21; /M: SY='N'; M= -2, 10,-22, 8, 8,-25, -9, -2,-24, 8,-24,-15, 13,-12, 7, 6, 7, -1,-20,-29,-15, 7; /M: SY='T'; M= -3, -6,-19,-11, -8,-10,-16, -6, -7, -6, -7, -3, -2,-18, -4, -4, -2, 1, -5,-21, -5, -7; /M: SY='V'; M= 2,-24,-17,-28,-22, -1,-21,-23, 17,-22, 17, 10,-22,-24,-20,-21,-13, -5, 18,-22, -7,-22; /M: SY='K'; M= -6, 1,-26, 1, 3,-26, -5, -8,-25, 11,-25,-13, 3, -4, 3, 7, 0, -6,-21,-26,-16, 2; /M: SY='G'; M= -1, 0,-24, -1, -2,-22, 4,-10,-22, -1,-19,-13, 2,-10, -3, -5, 0, -7,-18,-25,-17, -3; /M: SY='Y'; M= -7, -9,-23,-11, -7, -5,-18, -2,-10, -5, -7, -5, -7,-20, -5, -4, -9, -7,-10, -6, 9, -7; /M: SY='N'; M= -3, 2,-24, 1, 0,-23, 2, -8,-23, -1,-22,-14, 5, -9, -2, -4, 2, -4,-18,-27,-17, -2; /I: I=-6; MD=-13; /M: M= -3,-14,-21,-16,-14, -5, -8,-15, -1,-16, 0, -1,-10,-15,-13,-15, -8, -7, -1,-17, -6,-14; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='D'; M= -6, 13,-20, 16, 6,-22, -6, -5,-21, -1,-19,-15, 9, -8, 0, -5, 5, 1,-17,-27,-14, 2; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='S'; M= -2, 0,-11, -1, -2, -7, -8, -6, -6, -5, -7, -5, -1, -4, -4, -6, 1, 1, -4,-14, -5, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='L'; M= -9,-17,-16,-19,-15, 4,-19,-11, 2,-16, 14, 5,-15,-23,-14,-11,-15, -5, -1,-15, 5,-15; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='P'; M= -8,-19,-30,-17, -9,-12,-20,-17, -7,-11,-12, -6,-17, 32,-12,-15,-10, -6,-12,-22,-13,-13; /M: SY='I'; M= -8,-25,-26,-24,-17, -7,-24,-21, 10,-19, 4, 4,-23, 10,-18,-21,-16, -8, 6,-21, -9,-20; /M: SY='V'; M= 1,-26,-19,-30,-25, 5,-22,-22, 8,-18, 1, 2,-25,-25,-21,-19,-14, -8, 14, 11, 6,-22; /M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-29,-23, 12,-30,-18, 19,-25, 25, 13,-22,-27,-21,-20,-21, -8, 13,-16, 6,-22; /M: SY='D'; M=-19, 47,-30, 65, 20,-39,-10, 0,-39, 0,-29,-28, 19,-10, 2, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 11; /M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-32,-25, 7,-30,-22, 24,-23, 18, 14,-25,-26,-21,-21,-18, -7, 22,-13, 2,-24; /M: SY='E'; M= -9, 9,-29, 18, 56,-29,-20, -1,-29, 9,-20,-19, 0, -1, 18, 0, 1, -8,-28,-30,-19, 37; /M: SY='D'; M= -5, 2,-23, 4, 2,-16,-13, -8,-17, -5,-16,-13, -1,-12, -3, -8, 0, -2,-13,-18, -8, 0; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='N'; M= -4, 0,-21, -2, -4,-15,-10, -7,-15, -6,-17,-12, 2, -5, -5, -9, 2, 0,-14,-23, -9, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='S'; M= -1, -1,-12, -1, -2,-11, 0, -7,-11, -5,-12, -8, 0, -2, -4, -6, 3, 0, -8,-15, -9, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: M= -4, -2, -7, -4, -3,-12, -9, -6,-10, -4,-11, -6, 0, -9, -1, -4, 0, -1, -9,-16, -8, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: M= -6, -5,-20, -6, -4, -9, -9, -8,-14, -4,-12, -9, -4,-12, -4, -6, -5, -5,-13, 0, -1, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='G'; M= -4, -2,-21, -3, -4,-18, 3, -6,-20, -4,-19,-11, 3, -8, -4, -4, 2, -3,-16,-21,-13, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: M= -5,-12,-19,-14, -9, -9,-15,-12, -4,-10, 0, 0,-10,-11, -8, -9, -8, -4, -5,-20, -7, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='S'; M= -1, 6,-19, 5, -1,-21, -3, -9,-20, -6,-23,-16, 9, -8, -3, -8, 14, 8,-15,-32,-17, -2; /M: SY='K'; M= -2, -7,-22, -8, -4,-19,-12,-10,-15, 2,-16, -8, -4, -4, -3, 1, -2, -3,-12,-23,-13, -5; /M: SY='S'; M= 3, 4,-21, 4, 7,-23, -6, -8,-21, -1,-20,-14, 3, -8, 3, -6, 8, 2,-16,-28,-16, 4; /M: SY='E'; M= -1, 3,-22, 2, 6,-21,-12, -6,-17, 1,-16,-10, 2,-12, 6, -2, 2, 0,-14,-25,-13, 6; /M: SY='I'; M= -7,-12,-20,-18,-16, -3,-20,-12, 7,-14, 7, 7, -6,-23,-12,-10,-11, -5, 4,-21, -4,-15; /M: SY='T'; M= -2, -7,-16,-12, -7,-14,-18,-13, -6, -5, -8, -4, -3,-15, -4, -3, 3, 8, -1,-27,-11, -7; /M: SY='B'; M= 4, 7,-21, 5, 6,-24, -8, -7,-21, 3,-20,-14, 7,-11, 4, -1, 5, -1,-17,-27,-16, 5; /M: SY='F'; M= -7,-13,-23,-17,-12, 1,-17,-13, -4,-13, -5, -3, -9,-21,-11,-12,-11, -9, -6, 0, 1,-11; /M: SY='V'; M= 4,-22,-10,-28,-22, -3,-24,-24, 16,-21, 11, 7,-19,-22,-19,-21, -9, -1, 18,-24, -8,-22; /M: SY='K'; M= -7, 1,-24, -2, 3,-19,-17, -5,-14, 5,-12, -6, 3,-15, 5, 5, -3, -4,-13,-26,-11, 3; /M: SY='A'; M= 12, -2,-18, -4, 0,-20,-11,-12,-13, -4,-13,-10, -3,-12, -2, -7, 6, 3, -7,-26,-15, -1; /M: SY='F'; M=-16,-29,-23,-37,-28, 50,-27,-19, 2,-26, 8, 3,-23,-29,-30,-19,-22,-12, -1, 23, 24,-26; /M: SY='L'; M= -5,-23, -1,-27,-21, -2,-26,-21, 11,-21, 13, 8,-20,-26,-18,-18,-15, -6, 11,-23, -6,-21; /M: SY='D'; M= -4, 15,-21, 16, 10,-26, -9, -3,-24, 3,-23,-17, 13,-12, 5, -1, 7, 0,-20,-32,-17, 7; /M: SY='R'; M= -4, -6,-23, -8, 4,-17,-18, -7,-12, 2,-10, -6, -5,-13, 3, 5, -2, 2, -9,-22, -8, 2; /M: SY='I'; M= -2,-26,-17,-30,-24, 4,-27,-22, 22,-23, 19, 14,-23,-25,-20,-21,-16, -6, 21,-20, -2,-23; /M: SY='E'; M= -9, 2,-26, 3, 18,-24,-17, 0,-22, 13,-19,-11, 2,-11, 12, 10, -2, -7,-21,-24,-11, 14; /M: SY='E'; M= 3, 3,-22, 2, 7,-25, -9, -7,-21, 7,-21,-13, 4,-11, 6, 3, 6, -1,-16,-27,-16, 6; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='A'; M= 2, -9,-21,-12, -5,-11,-15, 0,-10, -3, -4, -2, -6,-17, -2, -1, -5, -6, -8,-19, -2, -5; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= -3, -9,-23,-12,-16,-14, 22,-14,-22,-15,-17,-13, -4,-18,-14,-15, 1, -1,-16,-15, -8,-16; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='Y'; M= -8,-12,-26,-14,-16, -4, 9, -5,-16,-12,-13, -8, -7,-22,-13,-11, -8,-12,-14, -6, 10,-16; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M= -6, -6,-14, -7, -3,-10,-14, -6, -7, 6, -8, -3, -4,-11, 0, 9, -4, -2, -3,-15, -5, -3; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='K'; M= -9, 1,-25, -2, 2,-18,-17, -4,-20, 12,-19,-10, 3,-11, 3, 10, -2, 0,-16,-21, -6, 1; /M: SY='P'; M= -3,-21,-24,-19,-13,-14,-22,-20, -1,-15, -9, -6,-19, 24,-16,-19, -8, -4, -1,-25,-16,-17; /M: SY='M'; M= -3,-19,-23,-23,-21,-11, 4,-18, 3,-20, 0, 8,-13,-21,-16,-19,-10,-11, 3,-21,-11,-20; /M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-35,-27, 6,-34,-25, 34,-27, 22, 16,-23,-25,-22,-24,-20, -8, 27,-20, 1,-27; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 29,-29, 19, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 29, 78,-20; /M: SY='T'; M= 10, -6, -6,-13,-11,-14,-10,-18,-10,-13,-13,-10, -3,-13,-10,-14, 16, 23, -1,-30,-15,-11; /M: SY='N'; M= -2, 6,-19, 0, -7,-14, 3, -3,-19, -8,-22,-15, 15,-17, -5, -8, 11, 4,-18,-25, -7, -7; /M: M= -2, -7,-23, -9, -4,-14,-15, -6,-13, -1,-12, -7, -5, -8, -3, -2, -3, -1,-11,-19, -5, -4; /M: SY='N'; M= -5, 5,-22, 4, -1,-14, -7, 4,-20, -5,-21,-15, 9,-15, -2, -6, 8, 0,-18,-21, -1, -3; /M: SY='W'; M=-15,-20,-27,-24,-18, 25,-23,-13, -7,-18, -3, -5,-18,-25,-19,-15,-18,-11,-10, 30, 21,-16; /M: SY='W'; M=-12,-26,-30,-29,-22, 15,-24,-13, -1,-18, 2, -2,-25,-26,-17,-16,-23,-13, -7, 41, 26,-19; /M: SY='N'; M= -7, 8,-23, 5, 5,-21,-12, -2,-20, 4,-20,-12, 11,-12, 4, 4, 3, -1,-18,-27,-11, 4; /M: SY='N'; M= -5, 9,-22, 8, 7,-23,-10, -2,-20, 1,-20,-12, 11,-12, 7, 0, 6, 1,-19,-30,-14, 6; /M: SY='Y'; M=-12,-12,-16,-16,-14, 3,-23, 0, -2,-10, -4, -1, -7,-23,-10, -8,-11, -7, -5,-11, 15,-14; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='L'; M= -6,-18,-17,-22,-17, 4,-22,-17, 12,-19, 17, 10,-17,-21,-16,-16,-13, -2, 10,-18, -2,-17; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -3, 5,-14, 4, -4,-14, 8, -6,-14, -5,-13, -9, 6,-10, -6, -7, 0, -5,-12,-16,-11, -5; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='N'; M= -3, 3,-14, 2, -1,-10, -4, -3,-11, -2,-12, -8, 5, -8, -1, -3, 3, 0,-10,-13, -6, -1; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: M= -4, -4,-21, -5, -5,-14,-11,-10,-14, -6,-13, -9, -3,-12, -6, -8, 0, -1,-10,-18, -9, -6; /M: SY='S'; M= 0, 2,-21, 1, -1,-19, -4, -9,-19, -6,-18,-14, 3, -9, -4, -8, 6, 2,-14,-25,-14, -3; /M: M= -3, -6,-22, -7, -4,-12,-12, -9,-11, -5, -9, -6, -4,-15, -5, -5, -3, -3, -8,-22, -9, -5; /M: SY='F'; M= -6,-19,-20,-23,-17, 13,-20,-16, 2,-18, 7, 2,-14,-21,-18,-15,-11, -5, 2,-14, 2,-17; /M: SY='S'; M= 1, 2,-21, 1, 0,-21, -4, -9,-21, -1,-20,-14, 3, -9, -2, -5, 6, -1,-16,-26,-15, -1; /M: SY='B'; M= -6, 8,-24, 8, 4,-21, -5, -4,-23, 2,-22,-15, 8,-11, 0, -1, 2, -5,-19,-26,-13, 1; /M: SY='Y'; M=-13, -9,-20,-11,-12, 5,-22, 4, -7, -9, -6, -4, -9,-23, -9, -8,-11, -7, -9, -2, 26,-13; /M: SY='P'; M= -8, -6,-29, -2, 0,-22,-14,-12,-20, -3,-22,-14, -7, 26, -5, -7, -5, -6,-21,-26,-18, -5; /M: SY='L'; M= -9,-26,-20,-28,-20, 7,-28,-19, 17,-23, 27, 13,-23,-26,-19,-17,-21, -7, 12,-18, 1,-20; /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-30, 11,-20,-29,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,143, 29,-20; /M: SY='I'; M= -8,-27,-22,-31,-25, 6,-32,-19, 26,-23, 17, 13,-23,-25,-19,-21,-18, -8, 21,-12, 8,-24; /M: SY='A'; M= 36,-12,-13,-19,-10,-19, -4,-19,-12, -8,-13,-11,-11, -6, -9,-14, 6, -2, -4,-15,-18,-10; /M: SY='H'; M= -8, 8,-24, 6, 7,-24,-12, 15,-24, 3,-22,-11, 11,-15, 12, 7, 2, -6,-23,-27, -8, 8; /M: SY='Y'; M=-18,-22,-30,-23,-21, 25,-29, 9, 1,-13, 0, -1,-21,-28,-13,-12,-20,-10, -7, 31, 62,-20; /M: SY='N'; M= -3, 3,-24, 2, -5,-20, 3, -8,-22, -7,-21,-15, 6, -7, -6, -8, 3, -2,-19,-26,-14, -7; /M: SY='S'; M= -2, 0,-20, -2, -6,-16, -2, -8,-17, -6,-18,-12, 3,-15, -7, -7, 5, 2,-11,-25,-10, -7; /M: SY='N'; M= -3, 2,-22, 0, 2,-18,-10, -5,-18, -1,-18,-11, 4,-11, 0, -3, 3, 1,-14,-24,-10, 0; /M: SY='P'; M= -4, -7,-21, -5, -2,-21,-12,-13,-17, -6,-19,-13, -6, 14, -5,-11, -2, -3,-17,-27,-18, -5; /M: SY='P'; M= -2, -4,-23, -3, -2,-21, -7,-11,-19, -6,-21,-14, -2, 8, -5, -9, 4, 1,-16,-27,-17, -5; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='Y'; M= -5, -8,-19, -9, -7, -1,-11, -7, -8, -9, -7, -5, -6, -9, -8, -9, -3, -2, -7,-12, 1, -8; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='N'; M= -2, 0,-16, -1, -3,-13, -2, -7,-12, -5,-12, -9, 2, -4, -4, -6, 2, -1,-10,-17,-10, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: M= -6, -7,-24, -8, -5,-13,-10, -8,-15, -5,-15, -9, -5, -5, -5, -5, -1, -1,-13,-18, -5, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: M= -5, -1,-25, 0, 0,-19,-12, -8,-15, -5,-16,-11, -1, -1, -3, -8, 0, -3,-15,-24,-12, -2; /M: SY='Y'; M=-11,-14,-24,-17,-13, 9,-18, -8, -9,-13, -8, -6,-11, -9,-14,-13,-11, -7,-11, -2, 10,-14; /M: SY='G'; M= -2, -1,-24, -1, -6,-21, 9,-10,-23, -6,-20,-14, 2,-13, -7, -7, 1, -6,-17,-23,-15, -7; /M: SY='G'; M= -1,-10,-24,-13,-12,-13, 4,-13,-12,-11,-11, -4, -6,-12,-10,-12, -3, -7,-10,-20,-12,-12; /M: SY='W'; M=-16,-30,-40,-31,-24, 8,-18,-23,-17,-17,-16,-16,-29,-25,-17,-17,-29,-22,-23, 97, 22,-18; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-23, -4, 3,-22,-14, -3,-16, 0,-17, -7, -1,-10, 15, -1, 3, 1,-16,-23, -9, 8; /M: SY='Y'; M= -9,-11,-24,-14,-11, 3,-16, -4,-10, -7,-10, -6, -8,-19, -9, -7, -7, -5,-11, -4, 13,-11; /M: SY='W'; M= -6,-18,-26,-20,-15, -5,-16,-15,-14,-14,-16,-13,-16, -8,-12,-15, -8, -3,-15, 27, 5,-13; /M: SY='Q'; M= -1, 2,-19, 2, 4,-22,-11, -6,-17, -3,-18,-11, 2,-12, 8, -5, 8, 4,-13,-27,-13, 6; /M: SY='Y'; M= -7,-14,-23,-19,-14, 4,-18, -8, 0,-12, -1, 3,-11,-21,-11,-11, -8, -4, -1,-12, 7,-14; /M: SY='W'; M= -7,-15,-30,-17,-14, -9, -1,-11,-22, -8,-20,-13,-12,-20,-10, -9, -9, -9,-20, 25, 1,-11; /M: SY='Q'; M= -9, 4,-27, 4, 13,-30,-16, 5,-21, 8,-21, -7, 4,-11, 31, 8, 2, -5,-24,-23, -9, 21; /M: SY='Y'; M=-13,-18,-24,-20,-18, 14,-24, -2, 1,-11, -1, 0,-14,-25,-14, -8,-13, -6, 0, -1, 27,-18; /M: SY='S'; M= 3, -1,-21, -3, -4,-21, 4,-12,-21, -8,-22,-15, 3, -5, -6,-11, 10, 5,-16,-26,-18, -6; /M: SY='G'; M= -3, 1,-24, 3, -1,-25, 14,-10,-27, -6,-23,-16, 3,-14, -3, -7, 6, -6,-20,-27,-19, -3; /M: SY='V'; M= -4,-10,-21,-13,-13,-11,-19,-16, 5,-11, -4, 0, -6,-18,-10,-12, -3, 0, 6,-26, -9,-13; /M: SY='G'; M= -1, 0,-24, 0, -4,-23, 12,-11,-24, -7,-22,-15, 3,-10, -7,-10, 4, -5,-19,-25,-18, -6; /M: SY='G'; M= -2, -2,-24, -5, -6,-22, 13,-10,-25, -4,-23,-14, 4,-14, -5, -3, 4, -3,-19,-24,-17, -7; /M: SY='I'; M= -6,-16,-20,-20,-17, -4,-21,-17, 10,-16, 3, 3,-12,-19,-15,-15, -9, -4, 10,-22, -4,-17; /I: I=-5; MD=-11; /M: M= -3, -5, -3, -6, -6,-16,-11,-12,-14, -9,-15,-11, -4, -3, -9,-11, 0, -3, -9,-27,-15, -8; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= -2, 0,-20, 2,-10,-23, 33,-13,-28,-13,-23,-17, 3,-14,-12,-14, 2,-10,-21,-21,-21,-11; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='I'; M= -5,-14,-18,-17,-14, -2,-17,-13, 8,-12, 3, 3,-10,-15,-11,-12, -9, -5, 6,-15, -1,-14; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='N'; M= -1, 5,-14, 4, 0,-14, -4, -5,-12, -4,-14,-10, 6, -7, -3, -6, 6, 2, -9,-22,-11, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= -2, -4,-14, -4, -7,-11, 7, -8,-11, -7,-10, -7, -2,-11, -7, -7, -1, -4, -7,-14, -8, -7; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='N'; M= -4, 2,-11, 0, -2, -7, -7, -3, -8, -3, -8, -6, 4, -8, -3, -3, -1, -2, -8,-14, -5, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='V'; M= -3,-21,-12,-23,-21, 0,-24,-21, 16,-16, 7, 6,-20,-23,-20,-15,-10, -2, 24,-22, -5,-21; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='D'; M=-18, 44,-29, 59, 18,-37, -9, 0,-37, 0,-29,-28, 20,-10, 0, -9, 1, -8,-29,-39,-19, 9; /M: SY='L'; M= -8,-21,-20,-24,-15, 3,-25,-13, 8,-14, 15, 12,-18,-23,-11, -9,-17, -7, 5,-17, 2,-14; /M: SY='N'; M=-10, 30,-22, 24, 3,-23, -4, 4,-23, -1,-27,-20, 36,-16, -1, -4, 8, -1,-25,-36,-16, 1; /M: SY='Y'; M= -6,-19,-21,-22,-16, 2,-22,-13, 4,-12, 1, 1,-17,-23,-14,-10,-11, -6, 6, -6, 7,-16; /M: SY='F'; M=-11,-23,-19,-28,-21, 32,-24,-15, -1,-19, 5, 0,-18,-26,-23,-15,-15, -8, -1, 3, 18,-21; /M: SY='Y'; M= -8, -1,-22, -6, -8, -5,-13, -1,-12, -5,-13, -8, 4,-13, -6, -5, -3, -3,-14,-16, 5, -8; /M: SY='G'; M= -2, -3,-25, -4, -8,-23, 22,-13,-26, -8,-22,-14, 2,-15, -9, -9, 2, -7,-19,-24,-19, -9; /M: SY='S'; M= -2, 8,-21, 8, 0,-22, -1, -9,-22, -6,-21,-17, 8,-11, -4, -8, 9, 4,-16,-30,-16, -2; /M: M= -4,-10,-22,-13, -6, -7,-18,-10, -5, -6, -4, -2, -8,-15, -7, -7, -6, -3, -5,-18, -2, -7; /M: SY='E'; M= -1, -1,-21, -2, 1,-15,-13, -8,-16, -3,-14,-11, -1, -8, -3, -6, 1, -1,-13,-24,-11, -2; /M: SY='E'; M= -4, 1,-23, 2, 5,-20,-11, -7,-17, -2,-13,-10, -1,-11, 3, -5, 1, -3,-15,-25,-12, 4; /M: SY='L'; M= -7,-14,-22,-16,-11, 0,-21,-15, -1,-15, 6, -1,-13,-19,-13,-12,-11, -5, -3,-10, -2,-12; /M: SY='K'; M= -6, -3,-24, -5, 0,-16,-15, -7,-14, 1,-13, -7, -2,-13, 1, 1, -2, -3,-12,-21, -8, 0; /M: SY='K'; M= 1, -3,-22, -5, -1,-17,-12, -9,-16, 2,-16,-10, -1, -9, -1, 0, 2, 0,-12,-23,-11, -1; /M: SY='F'; M= -7,-13,-23,-16,-12, 1,-18,-12, -4,-12, 0, -2,-10,-16,-11,-10, -9, -4, -5,-12, 0,-12; /M: SY='A'; M= 3,-10,-18,-14, -9,-10,-11,-15, -8, -9, -6, -5, -9,-15, -9,-11, -3, -2, -5,-19, -9,-10; /M: M= -3, -5,-21, -6, -4,-17, -7,-11,-15, -3,-14, -9, -2,-12, -5, -4, -1, -3,-11,-24,-13, -5; /M: M= -4, -7,-24, -8, -6,-15, -8,-11,-12, -7,-12, -8, -5, -8, -7, -9, -3, -3,-10,-20,-10, -7; /M: SY='S'; M= -3, -1,-22, -3, -3,-17, -9, -8,-15, -3,-16,-10, 1, -9, -4, -4, 2, 0,-12,-24,-11, -4; /M: SY='S'; M= -2, -3,-22, -4, -3,-18, -7,-10,-16, -4,-16,-10, 0, -7, -5, -5, 2, 0,-12,-25,-13, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 25 in 25 different sequences |
| Number of true positive hits | 25 in 25 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Ch-type lysozyme |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
25 sequences
CF451_DICDI (Q86HE5), CF50_DICDI (Q556R7), LYS1_CAEEL (O62415), LYS1_ENTH1 (Q27650), LYS2_CAEEL (O62416), LYS3_CAEEL (Q9XXS1), LYS5_CAEEL (Q20967), LYS7_CAEEL (O16202), LYSG2_DICDI (Q86KC1), LYSG3_DICDI (Q8T2I5), LYSG4_DICDI (Q54BQ8), LYSG5_DICDI (Q54BL8), LYSM1_STRGL (P25310), LYS_ARTBC (D4ANU4), LYS_BPB30 (Q8HA43), LYS_BPCP1 (P15057), LYS_BPCP7 (P19385), LYS_BPCP9 (P19386), LYS_BPMV1 (P33486), LYS_CHASP (P00721), LYS_CLOAB (P34020), LYS_CLOPE (P26836), YEGX_ECO57 (Q8X7H0), YEGX_ECOL6 (Q8FFY2), YEGX_ECOLI (P76421)» more
|
| PDB [Detailed view] |
7 PDB
1H09; 1JFX; 1OBA; 2IXU; 2IXV; 2J8F; 2J8G |