PROSITE entry PS51915

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ZAD
Accession [info]	PS51915
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	22-APR-2020 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51915
Associated ProRule [info]	PRU01263

Name and characterization of the entry

Description [info]

ZAD domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=80;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6540072; R2=0.0114986; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3345.6870117; R2=13.6503067; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=509; H_SCORE=10294; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=335; H_SCORE=7919; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -4, -2,-22, -4, -5,-18, -8, -9,-10, -5,-12, -4,  0,-15, -2, -4,  0, -3, -7,-28,-14, -4;
/M: SY='I';  M= -9,-18,-24,-21,-16, -4,-25,-12,  5, -9, -1,  1,-13,-22,-10, -6,-11, -4,  5, -8,  1,-14;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-20, -6,-30, -5,  1,-21,-19,  0,-31, 28,-21,-11,  1,-19,  9, 65, -9,-10,-21,-21,-11,  1;
/M: SY='L';  M= -6,-22,-16,-25,-21,  1,-28,-17, 17,-22, 20, 10,-21,-25,-19,-18,-12,  4, 19,-25, -4,-21;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M= -2,-14,-22,-16,-14, -8, -1,  0, -9,-20,  6,  1,-11,-22,-13,-16,-11,-10, -8,-21, -5,-14;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='N';  M= -4,  2,-14, -1, -3,-18, -1, -9,-18,  2,-18,-11,  5,-14, -3,  2,  2, -1,-11,-24,-14, -4; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='K';  M= -1,  2,-19,  0,  1,-18, -8, -6,-17,  4,-17,-10,  4,-12,  1,  2,  4, -1,-12,-23,-11,  0; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M:         M= -8, -9,-12,-10, -9,  0,-18, -9, -6,-10, -7, -5, -7,-13, -8, -9, -3, -3, -4,-19, -3, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='S';  M=  0,  1,-16,  1,  1,-17, -7, -9,-13, -3,-16,-11,  3, -3,  0, -5, 10,  5,-10,-24,-13,  0; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='D';  M= -8,  8,-21, 12,  6,-17, -8,  0,-19, -1,-15,-12,  5,-12,  1,  1,  1, -5,-16,-22, -8,  2; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='N';  M=  2,  0, -2, -4, -6,-16, -7, -4,-16, -4,-15,-11,  4,-11, -5, -1,  3, -1,-10,-24,-13, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E';  M= -4,  1,-15,  2,  8,-14, -8,  0,-15,  3,-14, -8,  1, -4,  7,  4,  4, -1,-13,-17, -8,  7; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M:         M= -4, -4,-15, -6, -6, -9, -5, -7, -7, -1, -3, -1, -1,-11, -5,  0, -6, -5, -6,-16, -8, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  2, -7,-10,-10, -7,-12, -8, -9, -9, -8, -7, -3, -2, -9, -5, -5,  3,  0, -7,-25,-13, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='L';  M= -6,-17,-21,-18,-12, -2,-24, -8,  2, -9,  4,  3,-14,-20, -8, -9,-11, -6,  4,-18,  3,-11;
/M: SY='N';  M= -5, 11,-25,  8,  3,-24,-10, -6,-20,  1,-24,-16, 14, -2,  1, -3,  3, -4,-21,-26,-17,  1;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-22,-33,-25,  8,-32,-25, 30,-27, 25, 15,-23,-25,-22,-23,-19, -7, 23,-21, -1,-25;
/M: SY='F';  M=-14,-18,-22,-23,-16, 45,-21,-14, -8,-21,  0, -5,-13,-24,-24,-16,-13, -9, -7,  0, 18,-17;
/M: SY='D';  M=-10, 10,-24, 14, 12,-22,-13, -3,-23,  1,-17,-13,  6,-12,  4,  0,  3, -1,-19,-30,-13,  8;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E';  M= -2, -6,-20, -4,  3,-20,-11,-11,-13, -2,-13, -9, -6,  0, -2, -4, -4, -7,-10,-25,-16, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -5, -4,-22, -2,  3,-20, -8,-10,-14,  2,-15, -8, -4, -9,  2,  0, -1, -5, -9,-23,-14,  2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='N';  M= -3,  4,-21,  1,  3,-20, -9, -1,-17,  4,-19,-11,  9, -8,  5,  3,  2, -4,-16,-24,-12,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='S';  M= -5, -2,-19, -1, -1,-14, -5, -7,-19, -5,-18,-13, -1, -4, -3, -4,  1, -4,-16,-20, -9, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M=  0,-11,-19,-11, -7,-11,-12,-15, -7, -3, -4, -4,-11, -9, -8, -7, -6, -2, -4,-10, -8, -7; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='D';  M= -3,  3,-15,  7,  7,-15, -3, -2,-15, -3,-11, -9,  1, -2,  1, -4,  2, -3,-12,-18,-10,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R';  M= -4, -5,-13, -7, -4, -9,-11, -4, -5,  3, -4, -1, -2,-11,  0,  7, -2, -1, -3,-15, -5, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='T';  M= -2, -2,-12, -3, -2,-10,-11, -8, -6, -1, -8, -5,  0,-11, -3, -2,  4,  6, -1,-20, -9, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='L';  M=-11,-28,-22,-33,-24, 15,-30,-19, 21,-25, 26, 18,-25,-27,-21,-20,-23, -9, 14, -8,  7,-23;
/M: SY='A';  M= 13,-16,-12,-21,-16, -3,-17,-20,  2,-18,  4, -2,-15,-16,-16,-19, -3,  1,  6,-21, -8,-16;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-25,  3, 11,-21,-17,  6,-21,  7,-17, -7,  3,-13, 11,  9, -2, -6,-19,-25, -8, 10;
/M: SY='M';  M= -8, -7,-22, -8, -9,-13,-21, -2,  0, -7,  1,  8, -9,-19, -4, -7,-10, -7,  2,-26, -6, -7;
/M: SY='I';  M=-12,-30,-24,-36,-26, 17,-34,-24, 30,-30, 30, 17,-24,-26,-23,-24,-24,-10, 17,-15,  5,-26;
/M: SY='E';  M= -5, -1,-13, -3,  9,-24,-12,  1,-21,  1,-19,-10,  1,-15,  9,  2,  0, -7,-18,-29,-14,  8;
/M: SY='K';  M= -8,-10,-24,-10,  3,-12,-23, -7, -9,  5, -6, -2,-10,-16,  4,  5, -8, -5, -7,-18, -1,  3;
/M: SY='C';  M=-12,-23, 21,-28,-23, -2,-31, -9,  2,-25,  9,  3,-20,-31,-20,-22,-18,-10,  2,-25,  1,-23;
/M: SY='T';  M= -3,-12,-14,-19,-16, 10,-20,-20, -3,-18,  2, -4, -9,-18,-18,-14,  4, 22,  2,-21, -2,-16;
/M: SY='G';  M= -5,-10,-31, -9,-11,-23, 31,-10,-32,-14,-24,-17, -5,-19,-10,-13, -5,-17,-27,  0,-15,-10;
/M: SY='V';  M= -8,-27,-12,-31,-25, 10,-30,-24, 19,-23, 18, 10,-24,-27,-24,-17,-17, -5, 21,-21, -2,-25;
/M: SY='E';  M= -2, -2,-24, -1,  5,-18,-12,-10,-18, -3,-17,-13, -2, -9,  0, -4,  2, -3,-14,-17,-13,  2;
/M: SY='I';  M= -3,-28,-19,-31,-25,  3,-30,-25, 27,-24, 21, 15,-25,-22,-22,-22,-17, -6, 26,-23, -5,-24;
/M: SY='E';  M= -7, -4,-25, -2, 12,-22,-19, -4,-16,  4,-12, -8, -5, -6,  7,  1, -2, -4,-14,-27,-12,  9;
/M: SY='Q';  M= -7, -1,-23, -2,  5,-24,-15, -3,-17,  3,-17, -7,  1, -5, 12,  4, -1, -6,-19,-27,-14,  7;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='D';  M= -6, 11,-21, 12,  4,-21, -1, -4,-23, -3,-19,-15,  9,-13, -2, -7,  2, -4,-19,-27,-14,  1; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='D';  M=-12, 19,-28, 31, 12,-31, -8, -6,-28, -3,-25,-21,  5, 13, -1,-11, -1, -8,-24,-31,-20,  4; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='E';  M= -1,  0,-20,  0,  9,-20, -7, -9,-21,  0,-19,-14,  0, -6, -1, -5,  3, -1,-17,-27,-16,  4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-20,-31,-22, 18,-25,-19, 16,-26, 30, 15,-24,-27,-22,-20,-23, -9, 10,-14,  5,-22; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='P';  M= -4,-14,-31, -7,  0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11, 62, -7,-17,  4, -1,-24,-33,-27, -7;
/M: SY='Q';  M=-11,  6,-28,  7, 10,-28,-15,  3,-22,  9,-22,-11,  6, -8, 14,  5, -1, -5,-21,-27,-12, 11;
/M: SY='F';  M=-10,-13,-12,-18,-14,  2,-22, -5, -8, -9, -7, -2, -8,-23,-12, -6, -8, -5, -4,-14,  0,-13;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-24,-35,-26,  3,-34,-24, 36,-26, 27, 24,-24,-24,-19,-24,-22, -9, 24,-21, -1,-25;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M= -1, -5,-21, -7, -2,-11,-11,-11,-15, -5,-15,-11,  0, -5, -4, -8,  5,  3,-13,-24,-10, -3;
/M:         M= -4, -7, -7, -8,  0,-20,-12, -8,-17, -4,-16,-10, -6,-13, -1, -6,  0, -3,-11,-28,-14, -1;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y';  M= -9,-17,-25,-19,-12,  2,-22, -2, -8,-12, -4, -3,-14,-22, -5, -9,-10, -4, -8,  8, 11, -8;
/M: SY='T';  M=  3, -2,-19, -6,  4,-18,-14,-10,-16,  3,-14, -9, -1,-12,  2,  1,  7,  9,-11,-26,-12,  3;
/M: SY='Q';  M= -9,  4,-19,  6,  8,-26,-19, -6,-20,  6,-14, -8, -1,-14, 13,  3, -3, -4,-17,-27,-13, 10;
/M: SY='L';  M= -6,-28,-18,-31,-23, 18,-28,-21, 17,-26, 30, 15,-26,-28,-23,-20,-22, -8, 14,-16,  2,-22;
/M: SY='Q';  M= -7,  3,-25,  2,  6,-18,-15,  3,-18,  7,-17, -6,  4,-14,  8,  5, -1, -5,-18,-21, -2,  6;
/M: SY='E';  M= -5,  6,-18,  8, 10,-25,-10, -5,-22,  1,-21,-13,  6,-12,  9, -2,  9,  0,-19,-32,-16,  9;
/M: SY='A';  M= 15,-15,  5,-22,-16, -3,-14,-18, -7,-18, -3, -6,-13,-20,-16,-20,  1,  0, -1,-22, -9,-16;
/M: SY='Y';  M=-10,-17,-25,-21,-13,  7,-25, 11,  2,-15,  1,  5,-11,-22,-10,-11,-12,-10, -1,-13, 15,-14;
/M: SY='D';  M= -1,  9,-18, 11,  9,-26,-10, -7,-21, -1,-19,-14,  5,-12,  6, -6,  6, -1,-17,-31,-17,  7;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-21,-38,-28, 57,-31,-20, 10,-29, 17,  6,-22,-29,-33,-21,-21,-10,  6,  2, 23,-28;
/M: SY='R';  M=-10,-16,-18,-18,-10,-10,-24,-10, -5,  2, -4, -1,-11,-21, -3, 14,-10, -7, -2,-20, -3, -9;
/M: SY='E';  M= -8, -3,-25,  0, 16,-22,-20, -7,-19, 12,-13, -9, -5,-12, 10, 12, -4, -6,-14,-25,-13, 12;
/M: SY='R';  M= -5, -7,-22,-11, -2,-19,-18, -4,-12,  5,-11,  0, -3,-14,  9, 10,  1,  4,-10,-24, -9,  2;
/M: SY='C';  M= -2,-23, 32,-30,-27,  2,-27,-24,  0,-23, -3, -4,-21,-30,-27,-24,-10, -6, 11,-26, -7,-27;
/M: SY='M';  M= -9,-14,-25,-16, -2,-13,-26, -8,  3, -6,  2,  6,-11,-17,  3,  1,-10, -6, -1,-23, -7, -2;
/M: SY='R';  M= -9,  1,-27,  3, 14,-25,-17, -4,-25, 17,-20,-12,  0,-12, 13, 20, -3, -8,-21,-21,-12, 12;
/M: SY='T';  M=  7, -8,-14,-11, -7,-16,-13,-14,-10, -3,-14, -8, -4,-14, -5, -1, 13, 14,  1,-29,-14, -7;
/M: SY='H';  M=-11,  0,-25,  2,  3,-21,-21, 14,-11, -3,-13, -3, -1,-18, 14, -3, -5, -9,-10,-24, -1,  8;
/M: SY='R';  M=-11,  4,-25,  3,  5,-23,-14, -3,-18,  8,-17, -9,  6,-15,  7,  9, -3, -5,-15,-27,-13,  6;
/M: SY='L';  M= -7,-15,-24,-18, -8, -7,-23,-10,  0, -4,  4,  3,-12,-19, -7, -2,-12, -7, -1,-21, -5, -8;
/M: SY='F';  M=-12,-26,-23,-29,-22, 21,-26,-16,  6,-24, 16,  4,-23,-27,-21,-18,-19, -7,  2,  9, 16,-21;
/M: SY='Q';  M= -7,-10,-14,-12, -3,-17,-20, -6,-12, -4, -9, -3, -8, -6,  4,  1, -5, -4,-12,-26,-11, -1;
/M: SY='E';  M= -6,  1,-25,  2, 10,-22,-19, -3,-16,  2,-14, -9, -1, -7,  8,  0, -2, -2,-15,-26,-12,  8;
/M: SY='M';  M= -3,-13,-21,-16,-10,-12,-10, -8, -5,-10, -2,  1, -9,-19, -4, -7, -3, -2, -4,-24, -9, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	11 in 11 different sequences
Number of true positive hits	11 in 11 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	2
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	84.62 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	ZAD
Version [info]	2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

11 sequences

GRAU_DROME  (Q9U405), HANG_DROME  (Q9VXG1), INDRA_DROME (Q8IRH5),

KIPF_DROME  (Q8T053), OUIB_DROME  (Q9VHM6), PARIS_DROME (Q9VR05), 
PIRAG_DROME (Q9VLK8), PITA_DROME  (Q95RQ8), WEK_DROME   (Q9VJN5), 
ZN276_HUMAN (Q8N554), ZN276_MOUSE (Q8CE64)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

2 sequences

SRYD_DROME  (P07664), ZIPIC_DROME (Q9VAB8)

PDB
[Detailed view]

2 PDB

1PZW; 7POK