PROSITE entry PS51919
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | X4E |
| Accession [info] | PS51919 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
22-APR-2020 CREATED;
22-APR-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51919 |
| Associated ProRule [info] | PRU01267 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | X4e domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1328309; R2=0.0087352; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1016; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=615; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= 1, 7, -1, 21, 46,-40,-18, -3,-30, 14,-11,-13, -7, 5, 23, -5, -1,-16,-28,-15,-17, 40; /M: SY='I'; M= -3,-15,-10,-20,-20, 12,-20,-17, 35,-20, 28, 13,-15,-32,-22,-20,-15, 2, 27,-25, 15,-20; /M: SY='Y'; M=-27,-26,-49,-19,-18, 21,-30, 30, -6,-14, 16, -2,-26,-17,-12, -5,-15,-12, 3, 10, 50,-18; /M: SY='H'; M=-22,-21,-51,-19, -2,-24,-30,126,-19,-19, -6, 17,-13, 7, -1, -9,-11,-19,-26,-40, 9, -2; /M: SY='Y'; M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30, 0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10, 0,-20,-10, 10, 50, 90,-20; /M: SY='Q'; M= 6,-15,-20,-23, -5,-14,-17,-11, 18,-10, -1, -1, -7,-16, 28, 3,-10, 1, 6,-20, -8, 4; /M: SY='D'; M= 0, 25,-10, 50, 35,-45,-15,-10,-35, 10,-10,-20, 0, 0, 5,-10, 0,-15,-25,-25,-15, 25; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='V'; M= 11,-17,-21,-23,-26, 3,-21,-26, 40,-17, 10, 4,-12,-33,-22,-15, -7, 7, 42,-33, -2,-26; /M: SY='R'; M= 4,-12,-23, -6, -5,-12,-13,-13,-20, 8,-18, 1,-12, -9, 20, 46, 0,-15, -6,-16,-12, 0; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='T'; M= 10, 0,-20, -8,-15,-18,-15,-18, -2, -8, -5, -5, 8, -2, -2,-25, 25, 43, 5,-45,-12,-10; /M: SY='T'; M= 10, 0,-20, -6,-12,-16,-12,-16, -4, -6, -8, -8, 6, -4, -4,-22, 28, 38, 2,-42,-14,-10; /M: SY='V'; M= 8,-12,-20,-15,-24, -4,-25,-24, 17,-13, 3, 0, -8,-21,-12, -9, 2, 22, 28,-35, 1,-19; /M: SY='T'; M= 0, -5,-10,-10,-15, 0,-20,-15, 10,-15, 20, 10, -5,-15,-10,-25, 0, 25, 10,-35, 10,-10; /M: SY='F'; M=-10,-16,-10,-22,-20, 36,-23,-17, 20,-18, 31, 8,-16,-33,-23,-17,-16, -4, 16,-15, 25,-20; /M: SY='K'; M= 1, 2,-26, -3, 5,-15, 11,-18,-12, 13,-16, 2, 5, -4, 0, -2, 0, -7,-21,-17,-16, 2; /M: SY='Z'; M= 0, -5, 0, 0, 33,-24,-20, -2,-16, 5, -1, -3,-12, -2, 27, -1, -7,-10,-21,-12, -6, 34; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M= -1, -6,-12, -3, 4,-14, -4, 1,-11, 2,-12,-14, -9, 27, 3, -3, 3, 3,-14,-14, -9, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M= 2, 11,-17, 25, 18,-32, -9, -8,-25, 6,-16,-23, -4, 10, -2,-10, 13, 0,-21,-28,-17, 8; /M: SY='G'; M= 1, 5,-36, -7,-18,-27, 68,-27, -9, -9,-20,-17, 11,-13,-18,-20, 0,-16,-28, -1,-31,-18; /M: SY='T'; M= 7, -5,-17,-12,-20,-10,-22,-20, 9,-13, 7, 3, 1,-11, -8,-25, 10, 37, 17,-43, -1,-13; /M: SY='Y'; M=-19,-25,-40,-23,-25, 16,-22,-11, 23,-15, 24, -1,-22,-26,-16,-13,-15, -4, 26, 10, 42,-25; /M: SY='E'; M= 1, -1, 6, 7, 55,-39,-20, 0,-29, 17,-11,-10,-10, 9, 28, -5, -1,-17,-30,-10,-19, 49; /M: SY='G'; M= 5, 0,-30, -6,-13,-21, 37,-21, -9, -6,-17,-17, 1, -9,-14,-18, 17, 4,-17,-13,-24,-15; /M: SY='N'; M= 5, 19,-15, 0,-10,-16,-10,-12, -3, -4,-13, -1, 42,-15, 6,-17, 6, 23,-10,-55,-25, -3; /M: SY='S'; M= 10, 0,-20, -1, -2,-11, -2,-11, -9, -1,-18,-18, 1, -9, -9,-12, 38, 23, -8,-32,-19,-10; /M: SY='P'; M= -7,-17,-29, -9, 9,-36, -9, 7,-27, 9,-29,-37,-26, 94, -1,-10, -3, 3,-36,-30,-20, -1; /M: SY='F'; M= -9,-25,-29,-32,-32, 45,-28,-25, 21,-15, 17, -8,-17,-36,-26,-11,-11, -5, 29, -5, 26,-32; /M: SY='H'; M= 3,-12,-32,-12, 10,-29,-21, 47,-17, -7,-15, 4, -9, 2, 41, 10, -7, -6,-24,-30,-11, 20; /M: SY='F'; M=-14,-25,-29,-34,-21, 36,-20,-14, -2, -4, 2,-23,-16, 15,-18,-13,-10,-10, -4,-10, 6,-24; /M: SY='T'; M= 0,-11,-14,-12,-15, -1,-21,-15, 12,-13, 12, 2,-13, -5,-14,-19, -6, 16, 12,-32, 8,-13; /M: SY='P'; M= 5,-13, -1, -9, 4,-28,-12,-11,-18, 1,-18,-15,-15, 35, 4, -2, -4, -2,-16,-33,-31, 0; /M: SY='D'; M= -3, 37,-27, 57, 0,-22,-11,-20,-28, -1, -7,-24, 19,-18,-13,-12, -1, -8,-16,-38, -9, -7; /M: SY='N'; M= -8, 11,-26, -1, -8, -8,-13, 8, -7, -5, -8, -1, 31,-18, 4, -9, -5, 5,-14,-35, -5, -4; /M: SY='Q'; M= 11, 3,-24, -2, 12,-18,-10,-12,-13, 14,-18, 6, 8, -3, 25, 8, -1, 0,-17,-30,-20, 14; /M: SY='Y'; M=-22,-26,-45,-23,-24, 48,-26,-14, -5, -9, 21,-11,-24,-26,-14, -5,-12,-11, 10, 22, 50,-24; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='A'; M= 19, -6,-29, -3, -4, -7, -7,-15, 0, -4, 1, 5, -8,-14, 1,-10, 5, 7, 8,-30,-10, -5; /M: SY='C'; M=-12,-19, 23,-20,-15, 5,-29,-25, 16,-21, 18, -1,-19,-32,-22,-14,-16, -3, 18,-14, 8,-17; /M: SY='T'; M= 7, -8,-20,-16,-15,-12,-12,-15, 15,-10, 4, 1, -2, -3, -7,-23, 5, 19, 12,-38,-11,-13; /M: SY='C'; M=-18,-15,101,-21, 7,-20,-30,-34,-13,-22, 1,-13,-10,-24, -9,-14,-11,-10,-15,-20,-37, 1; /M: SY='N'; M= 4, 7,-18, -8,-18, 0,-13,-18, 6, -7, -5, -4, 25,-21,-12,-20, 8, 20, 4,-46,-15,-16; /M: SY='Y'; M= -8,-11,-29,-12,-16, 18,-17,-13, 0, -8, 6,-10, -8,-21,-15,-10, 6, 6, 5, -9, 19,-18; /M: SY='T'; M= 10,-10,-20,-15,-25, -5,-25,-25, 20,-15, 5, 0, -5,-20,-15,-20, 5, 30, 30,-40, 0,-20; /M: SY='H'; M= -5,-15,-30,-16, -3, -6,-23, 19,-12, -1, -9, 3,-10, -6, 16, 13, -7, -8,-10,-20, 1, 2; /M: SY='F'; M= -3, -8,-23,-21,-11, 23,-20,-17, -7, -1, -3, -8, 6,-18, 9, -1, -4, 0, -8,-18, 0, -5; /M: SY='I'; M= 7,-14,-25,-22,-13, 0,-10,-12, 12, -3, 1, 0, -6, -5, -9,-14, 0, 2, 7,-29,-14,-16; /M: SY='R'; M=-12,-21,-26,-24,-22, 27, -9,-20,-16, 0, -6,-10,-14,-21, 1, 34, -9,-25, -6, 5, 7,-17; /M: SY='I'; M= 12,-13,-22,-23,-19, -5, -9,-20, 34,-13, 6, 4, -3,-24,-13,-20, 2, 6, 27,-35,-16,-20; /M: SY='C'; M= -9,-13, 50,-15, -2,-12,-22,-26, -8,-13, -4,-11,-10,-22,-11, -2, 0, -4, -6,-21,-24, -7; /M: SY='C'; M=-10,-16, 73,-19, 7,-27,-26,-28,-19,-13, -9,-13,-12, -8, 6, 3,-12,-13,-17,-21,-39, 5; /M: SY='P'; M= -4, 8,-29, 26, 6,-41,-11, -5,-29, 4,-19,-31,-10, 51, -4,-13, -2, 3,-26,-36,-15, -1; /M: SY='H'; M= -9,-10,-27,-11, -4,-15, 1, 32, -9,-11, -2, 4,-10, -7, -6, -6, -6,-14,-17,-20, -2, -4; /M: SY='G'; M= -2, -6,-36,-11,-21,-15, 28,-23, -3,-11, -5,-11, -5,-11,-14,-19, 2, 3, -6, -4, -4,-18; /M: SY='N'; M= -2, 12,-15, 0, -4,-13,-10, -9,-13, 5,-20, 0, 32,-18, 16, 20, -5, -5,-18,-37,-22, 1; /M: SY='H'; M=-20,-19,-48,-15, -4,-16,-26, 92,-17,-15, -4, 9,-14, 1, -3, -8, -5,-12,-19,-28, 15, -5; /M: SY='T'; M= 7, -3,-17,-11,-20,-11,-21,-20, 7,-12, 7, 3, 3, -8, -6,-27, 11, 39, 14,-44, -2,-12; /M: SY='F'; M=-24,-20,-37,-28,-29, 61,-26,-17, -3, -9, 18,-14, -8,-32,-20, -8,-12,-12, 6, 12, 41,-29; /M: SY='H'; M= -1,-14,-24,-15, 9,-23,-22, 31, -5, -7, -8, 2,-10, -4, 26, 2, -9, -7,-13,-25, -7, 14; /M: SY='I'; M= -4,-16,-17,-21,-19, 6,-22, 3, 29,-20, 20, 12,-14,-27,-20,-18,-14, 0, 22,-29, 11,-19; /M: SY='R'; M= -9,-17,-16, -7, 0,-14,-20, -9,-30, 11,-19, -1,-19, -7, 29, 67, -9,-29,-13, -1, -3, 7; /M: SY='P'; M= 15, -5,-26, -4, 0,-23, -5,-10,-10, 1,-16,-12, -7, 23, 1,-13, 13, 15, -8,-40,-26, -4; /M: SY='R'; M= 3,-12,-20,-11,-16, -7,-20,-18, -2, -4, -7, -3,-10,-16, 1, 18, 4, 6, 11,-24, -3,-12; /M: SY='S'; M= 8, -3,-25, -5, -5,-16, -9, 8, -8, -5,-13, -8, 1, -5, -5,-15, 26, 21, -7,-39,-16, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of true positive hits | 5 in 5 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | X4e |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
5 sequences
NS7A_BC279 (Q0Q470), NS7A_BCHK3 (Q3LZX7), NS7A_BCRP3 (Q3I5J0), NS7A_SARS (P59635), NS7A_SARS2 (P0DTC7)» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1XAK; 1YO4; 6W37; 7CI3 |