Home  |  Contact
Entry: PS51935

General information about the entry

Entry name [info] NLPC_P60
Accession [info] PS51935
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 02-DEC-2020 CREATED;
02-DEC-2020 DATA UPDATE;
02-DEC-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51935
Associated ProRule [info] PRU01284

Name and characterization of the entry

Description [info] NlpC/P60 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=123;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=118;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6503333; R2=0.0077738; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1075; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=753; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M=  4, -5,-25, -7, -9,-13, -4, -5,  1, -5, -7, -2, -2,-14, -5, -5,  6,  3, -1,-28,-12,-10;
/M: SY='A';  M=  9,  5,-23,  7, -1,-23, -2,-12,-10,  0,-10, -6,  3, -4, -1,-10,  6,  7,-10,-33,-18, -3;
/M: SY='A';  M=  8, -3,-23, -7, -8, -3, -3,-21, -1, -3, -5, -2, -1,-16, -8,-12,  4,  3,  1,-19,-11,-10;
/M: SY='A';  M=  4, -9,-25, -9, -9,-14, -7,-13,  3, -2, -4, -3, -7, -2, -6, -7, -2,  1,  2,-25,-11,-10;
/M: SY='E';  M=  3,  1,-12,  5, 19,-24, -5,-13,-18,  6,-13,-10, -4, -5,  5, -9,  5, -6,-18, -9,-16, 14;
/M: SY='A';  M=  3, -7,-28, -4, -9,-11, -2,-18, -5, -4, -5, -4,-10,-10, -6, -5, -3, -2, -1, -8, -4,-10;
/M: SY='I';  M=  4, -7,-16, -7,-15, -1,-17,-17, 23,-13, 17,  9, -9,-28,-17,-17,-10,  2, 21,-30,  2,-16;
/M: SY='I';  M=  4,-16,-20,-26,-24,  2,-18,-18, 39,-15, 15, 10, -6,-33,-21,-18, -9,  4, 33,-29, -1,-25;
/M: SY='Q';  M=  4,  1, -7,  5,  8,-23,-13, -8,-18,  1,-15, -8,  0, -8, 12,  6,  6, -2,-15,-27,-20,  7;
/M: SY='Q';  M=  5, -4,-14,  0, 14,-23,-18,-11,-16,  8,-11, -2, -6, -2, 18,  9,  1, -2,-10,-22,-13, 15;
/M: SY='G';  M= 15, -4,-31, -7, -9,-15, 19,-20,  1, -7, -5,  0, -5,-13, -2,-13,  1, -2, -2,-21,-20, -9;
/M: SY='Q';  M=  4, -6,-21, -8,  3,-13,-14, -6, -6,  5, -4,  7, -4, -9,  9,  0, -2,  2, -7,-23, -5,  4;
/M: SY='K';  M=  7, -2,-21, -3,  4,-13,-10,-12, -7,  8,-10,  0,  0, -1,  1, -7,  7,  5, -8,-30,-15,  1;
/M: SY='W';  M=-21,-25,-32,-21, -6,  3,-17,  7,-13,-10, -1, -5,-27,-14, 10,  6,-16,-18,-13, 35, 27, -2;
/M: SY='I';  M=  1,-13,-18,-19,-13,  0,-13,-11, 23, -8, 14, 14,-10,-25,-16,-14,-11, -1, 16,-25,  2,-15;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-19, -9, -8,-29, 49,-26,-14, -6,-17,-16, -4, -9, -9, -9, -2,-19,-26,  3,-28, -9;
/M: SY='V';  M=  5,-10,-21,-11,-13,  0,-20,-20, 12, -6,  4,  3,-10,-19,-12,-11,  0, 13, 18,-28,  4,-13;
/M: SY='P';  M= -5,-17,-28, -9,  8,-35,-10,  5,-26,  8,-27,-32,-25, 83,  5, -3, -6,  0,-33,-29,-20,  1;
/M: SY='Y';  M=-37,-28,-56,-11,-18, 25,-29,  9, -9,-11, 28, -6,-37,-19,-10, -2,-19,-10,  7, 39, 81,-18;
/M: SY='R';  M=  2, -9,-20, -8, -7, -4,-11,-16, -2,  1, -5,  2,-10,-14, -3,  9,  3, -1,  2,-21, -4, -8;
/M: SY='W';  M=-31,-35,-20,-30, -8,  8, -4,-30,-18,-11, -5,-12,-44,-26, -6, -3,-21,-27,-17,108, 35, -7;
/M: SY='G';  M=  1,  2,-38, -3,-17,-30, 66,-28,-13, -8,-19,-19,  0,-10,-16,-13,  0,-19,-27,  4,-27,-17;
/M: SY='G';  M=  0, -4,-37,-12,-18,-20, 57,-26,-11, -7,-17,-18, -4, -5,-14,-11, -1,-18,-24,  4,-24,-18;
/M: SY='S';  M=  3, -4,-22,-10,-10, -9, -2,-17, -5,  0, -9, -2,  4,-13, -3, -1,  5,  3, -4,-24,-13, -9;
/M: SY='T';  M=  4,  3,-24,  0,-13,-11, -2,-19, -7, -5, -9,-10,  7,-13, -7,-10, 11, 12, -3,-30,-13,-12;
/M: SY='P';  M= -3,-11,-25, -7,  5,-27, -1, -4,-19,  6,-17,-19,-17, 47, -1, -6, -4, -3,-24,-22,-16,  0;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='S';  M=  2, -2,-22, -3, -7,-10, -1,-18, -9, -1, -8, -7, -2,-12, -4, -1,  4,  0, -6,-20,-10, -7;
/M: SY='G';  M=  2, -3,-35,-11,-18,-24, 45,-17, -5,-10,-14,-12, -2,-11,-15,-16,  3, -8,-16, -7,-22,-17;
/M: SY='F';  M=-15,-26,-30,-42,-36, 72,-27,-26,  8,-12, 19,-14,-10,-35,-26,-13, -9,-11, 16,  2, 26,-35;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='C';  M=-28,-19,156,-29,  9,-30,-38,-47,-20,-28, -1,-20,-10,-23,-19,-20,-18,-17,-20,-21,-57,  0;
/M: SY='S';  M=  4, -5,-23, -3, -2, -6, -1,-12,-11, -2,-16,-19, -7,-12, -9, -9, 31, 14, -9,-12, -9,-10;
/M: SY='G';  M=  3,  0,-36, -9,-17,-27, 62,-27, -9, -9,-18,-18,  1, -9,-17,-19,  6,-10,-24,  0,-28,-18;
/M: SY='F';  M=-14,-19,-16,-28,-23, 55,-23,-19,  8,-14, 27, -1,-14,-33,-24,-15,-12, -8,  9, -6, 28,-24;
/M: SY='V';  M=  5,-17,-14,-24,-24,  3,-25,-20, 25,-12, 11,  8, -8,-31,-20,-15, -6, 12, 28,-31,  0,-23;
/M: SY='R';  M= -7,-17,-27,-13, -4, -3,-19, -1,-12,  0, -2,  0,-17,-14, 16, 18, -8, -8, -8,  1, 14,  1;
/M: SY='Y';  M=-26,-21,-41, -7,-13, 10,-18,-12,-13, -7, 10,-10,-30,-19, -8, -1,-11, -9,  0, 43, 50,-14;
/M: SY='V';  M= 17, -9,-25,-11,-14, -6,-14,-20, 15, -9,  3,  5, -7,-20, -8,-13,  3, 13, 22,-35, -9,-14;
/M: SY='F';  M=-24,-27,-36,-31,-28, 60,-28,-15,  1,-10, 26, -8,-21,-32,-21, -8,-15,-13, 11, 18, 48,-28;
/M: SY='Q';  M=  6, -2,-23, -5, -2,-10,-11, -3,-10,  2,-12,  3,  4,-11, 11, 10,  1, -3, -9,-31,-15,  0;
/M: SY='Q';  M=  4,  2,-21,  5, 11,-19, -4,-12,-15,  8,-12, -3, -2, -4, 13,  1,  2, -3,-18,-20,-11, 10;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 11, -7,-25,-12,-13,  3,-14, -7,  5, -8,  0,  2, -1,-19, -8,-13,  3,  7, 10,-37,-11,-13;
/M: SY='G';  M=  1,  5,-35,  0,-12,-29, 59,-26,-13, -6,-19,-19,  3, -9,-16,-17,  3,-15,-27, -1,-27,-14;
/M: SY='I';  M=  3,-16,-20,-26,-22,  3,-15,-20, 38,-15, 15,  9, -8,-28,-16,-17, -9,  1, 31,-27, -1,-22;
/M: SY='E';  M=  2, -1,-17,  1, 10,-19,-10, -5,-13,  5,-10, -6, -3, -4,  3, -5, 10,  2,-12,-23,-12,  6;
/M: SY='L';  M= -5,-13, -9,-17,-14,  9,-17,-10, 22,-14, 26, 16,-13,-28,-15,-12,-13, -1, 13,-22, 13,-14;
/M: SY='P';  M= -6,-14,-30, -8,  2,-28, -4,  7,-21,  3,-20,-26,-20, 64, -4,-12, -6, -1,-28,-28,-16, -4;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='R';  M= -8, -8,-25,  1, -7,-16, -6,  0,-25,  2,-16, -6,-11, -5, 12, 38, -7,-22,-15, -9, -5, -3; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='T';  M=  0, -3,-24,  0,-10, -8,-15,-17, -7, -5, -4,-11, -5,-13, -7, -8, 10, 12,  2,-18,  1,-11;
/M: SY='T';  M= 15,  5,-20,  3, -3,-18, -8,-16, -5, -2,-10, -5,  7, -8, -1,-16, 18, 20,  0,-42,-22, -4;
/M: SY='G';  M=  5,  2,-28,  1, -7,-17,  6,-17, -8, -3, -9, -7,  3,-11,  1, -7,  1,  2, -8,-20,-11, -5;
/M: SY='D';  M=  6,  6,-19, 15, 15,-33, -4,-10,-19,  4,-13,-15, -4, 10,  6,-10,  4, -3,-18,-26,-20, 11;
/M: SY='Q';  M= -6,-18,-25,-15,  4,-11,-18, -7,-13, -5, -5, -6,-22,-12, 39, 14,-14, -6,-16, 21, 15, 16;
/M: SY='W';  M=-17,-24,-32,-15, -5,  2,-13,-12,-12, -6,  2, -5,-31,-19, -1,  0,-13,-15, -5, 47, 30, -6;
/M: SY='H';  M=  3,  2,-25, -3,  1,-19, -4, 14,-12,  0,-15,  2, 11, -8,  1, -2,  2, -5,-15,-36,-21,  0;
/M: SY='N';  M=  8,  0,-23, -8,-10, -4, -4,-15,  5, -4, -2,  3,  9,-20, -5,-12,  1,  5,  2,-32,-13,-10;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G';  M=  4, -3,-34,-12,-16,-27, 49,-21, -6, -6,-14,-11, -1, -6,-15,-18,  1, -8,-20, -6,-26,-16;
/M: SY='Q';  M=  2, -4,-25, -2,  0,-16,-18,-14,-14,  6, -9,  0, -4, -3, 15,  8,  2,  7, -7,-22, -3,  4;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='K';  M=  3,  0,-21, -2, 10,-18, -7, -2,-13, 12,-15,  2,  5,  8,  4, -2,  0, -4,-16,-29,-18,  6; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='I';  M=  1,-18,-16,-26,-26, 12,-19,-21, 39,-18, 17,  5,-11,-32,-23,-17,-11,  3, 35,-24,  6,-26; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='P';  M=  8, -1,-24,  2,  4,-16, -7,-11,-15,  5,-16,-13, -4, 12, -1, -7, 11,  5,-13,-31,-19, -2;
/M: SY='P';  M= -1, -6,-19, -2,  5,-13,-14,-10, -6,  5, -5, -4,-10,  8, -4, -4, -4, -4, -7,-23, -5,  0;
/M: SY='S';  M=  6,  3,-20,  7,  6,-18,  1,-14,-16,  1,-17,-16, -2, -9, -3, -9, 19,  4,-15,-14,-17,  0;
/M: SY='D';  M=  4, 12,-18, 22, 18,-34,-13, -3,-24,  4,-15,-13,  4,  2, 19,  1, -2, -6,-23,-29,-17, 18;
/M: SY='M';  M=  9,-11,-18,-12, -5, -8,-12, -6,  8, -3, 10, 15,-11, -6, -6,-13, -9,  3,  3,-33, -8, -7;
/M: SY='Q';  M=  4, -6,-24, -5, 13,-16,-14,-11,-18, 17,-17,  5, -6,  1, 29, 21, -2, -5,-19,-16, -9, 16;
/M: SY='P';  M=  1,-12,-24, -7,  2,-22,-14, -7,-17,  8,-18,-10,-14, 30,  7, 11, -4, -4,-13,-26,-14,  0;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20,  0,-10,-20,-20,  0,-20,-30, 10,-30,-20;
/M: SY='D';  M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='L';  M= -5,-15,-10,-20,-19, 20,-21,-15, 28,-18, 30, 13,-15,-33,-22,-19,-16,  0, 21,-21, 19,-19;
/M: SY='I';  M=  1,-18,-15,-22,-25, 17,-24,-23, 35,-19, 20,  6,-16,-36,-26,-16,-13,  4, 35,-25, 14,-25;
/M: SY='F';  M=-14,-25,-26,-41,-33, 70,-25,-25,  9,-12, 21,-10,-10,-35,-25,-14,-10,-12, 14, -1, 23,-33;
/M: SY='F';  M=-24,-31,-17,-43,-30, 70,-26,-28, -5,-11, 16,-16,-18,-37,-25, -8,-14,-21,  3, 28, 29,-31;
/M: SY='G';  M= -2, -1,-18,  2, -2,-22,  4,-13,-17, -1,-12,-10, -4, -4,  2,  0, -1, -7,-17,-15,-13, -2;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='T';  M=  2, -5,-15, -7, -5, -2, -4, -5, -2, -4, -2, -3, -3, -7,  0, -6,  2,  3,  0,-11, -3, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='Y';  M= -4, -7,-26, -5, -6, -6,  2, -9, -8, -4, -3, -9, -8, -8,  0, -4,  4,  1, -6,  0,  7, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G';  M=  3, -4,-28, -4, -2,-15, 15,-14,-11,  5,-14, -5, -6,  5, -3, -2,  2, -6,-14,-11,-14, -5; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='S';  M=  5,  5,-23,  3, -1,-19, 13,-15,-12,  1,-16,-13,  6, -4, -5,-11, 14,  5,-16,-23,-21, -5; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G';  M=  9,  1,-28, -4,-12,-18, 18,-23,  0, -4,-10, -5,  5,-12,-10,-15,  4,  3, -4,-24,-21,-12; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G';  M=  2, -7,-25,-13,-10,-17, 11,-16,  2, -6,-11,-12, -3,  6, -9,-16,  0, -1, -7,-15,-18,-13; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='N';  M=  1,  4,-26,  0, -7,-15,  2, -4, -9, -5, -9, -6,  8,-12,  0, -9,  5,  4,-12,-27,-11, -6;
/M: SY='H';  M=-19,-18,-49,-19,  0,-29,-29,135,-19,-19,-10, 19, -7,  9,  0,-10,-10,-19,-30,-51, -1,  0;
/M: SY='V';  M= 15,-12,-23,-12,-19, -4,-21,-21, 22,-10,  4,  5,-12,-26,-17,-10, -5, 11, 30,-35, -4,-19;
/M: SY='G';  M= 10,  0,-36, -7,-15,-26, 53,-26, -7, -7,-17,-12,  1, -9,-11,-18,  5, -8,-18, -9,-31,-14;
/M: SY='I';  M=  1,-19,-17,-33,-25,  1,-14,-14, 47,-15, 22, 17, -4,-32,-20,-23,-13,  1, 32,-29, -3,-25;
/M: SY='Y';  M=-35,-28,-53,-12,-20, 33,-28, -3, -8,-10, 28, -9,-36,-21,-12, -2,-17, -9,  9, 41, 79,-20;
/M: SY='I';  M= -2,-13, -1,-19,-17,  4,-18,-20, 30,-19, 21,  7,-11,-30,-20,-20,-12,  1, 23,-27,  3,-19;
/M: SY='G';  M=  0,  3,-36, -2,-12,-31, 63,-27,-13, -6,-18,-18,  0, -8,-16,-18,  1,-17,-28,  3,-27,-14;
/M: SY='N';  M=  1, 26,-22, 20, -3,-24,  9,-10,-13, -2,-17,-11, 35,-17, -7,-15,  2, -1,-21,-42,-28, -5;
/M: SY='G';  M=  0, 12,-33,  3,-15,-28, 54,-25,-11, -7,-18,-17, 16,-13,-17,-19,  1,-11,-26,-11,-29,-16;
/M: SY='Q';  M=  4, -2,-16, -3, 11,-21,-16, -5,-14,  5,-11,  0,  1, -7, 33, 10, -4,  1,-18,-23,-11, 18;
/M: SY='F';  M= -7,-23,-24,-33,-24, 33,-24, -8, 12, -3, 22, 16,-10,-37,-20, -8,-15, -7, 11, -9, 17,-24;
/M: SY='I';  M= -2,-17,-14,-27,-23, 10,-17,-18, 41,-19, 25, 12,-10,-32,-22,-22,-13,  1, 30,-26,  7,-23;
/M: SY='H';  M=-12, -6,-34, -8,  7,-28,-23, 88,-18,-10,-12, 10,  5,  2,  5, -9, -7,-14,-28,-46,-10,  6;
/M: SY='A';  M= 19, -2,-17, -1,  0,-20, -8,  0, -7, -5,-11,  0, -2,-10,  0,-11, 11,  6, -1,-43,-29, -3;
/M: SY='P';  M=  1, -1,-19, -6, -3,-16, -6, -7, -5, -2,-13,-13,  5, 10, -1,-12,  7, 10,-14,-34,-17, -5;
/M: SY='D';  M= -5,  0,-28,  8, -5,-14,-14,-11,-15, -2, -4,-10, -6, -2,  3,  1,  0,  4, -8,-17,  6, -4;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G';  M=  1, -3,-25, -4, -5,-13, 22,-15,-10,  0,-12,-11, -4, -7, -8, -7,  9, -4,-14, -4,-12, -8; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='N';  M=  0,  5,-21,  5,  4,-19, -7, -1,-15,  3,-14, -4,  8, -8,  4,  3,  3, -4,-16,-29,-15,  2;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-27, -6, -2,-25, 34,-14,-13, -1,-15,-12, -2,  1,-10,-15,  1,-11,-25, -8,-21, -5;
/M: SY='V';  M=  6,-19,-19,-21,-26,  6,-24,-25, 35,-17,  9,  1,-15,-34,-23, -8, -8,  6, 39,-28,  5,-26;
/M: SY='Q';  M=  2, -6,-22, -6,  0,-13,-15,-11, -6,  3, -7, -2, -3, -9,  8,  3,  4,  4, -5,-21, -5,  1;
/M: SY='V';  M= -2,-19,-24,-24,-23,  3,-20,-19, 30,-14, 12,  2,-12,-27,-15,-10, -9,  2, 31,-18,  9,-22;
/M: SY='D';  M=  5, 11,-22, 14, -5,-18, -6,-11, -7, -5,-10,-12,  8,-14,-11,-14, 14, 11, -4,-37,-15,-10;
/M: SY='P';  M=  0,  7,-23,  7,  1,-19, -6, -7,-16,  5,-19,-17, 10, 12, -6, -8, 11,  7,-19,-36,-19, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-19,-18,-21,-14,  6,-20,  1, 15,-11, 22, 19,-19,-30,-16,-12,-18, -4, 10, -4, 21,-14;
/M: SY='D';  M=  1, 14,-25, 18,  1,-25, -5,  0,-19,  1,-16, -8, 14, -9,  4,  0,  3, -2,-18,-35,-17,  0;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='E';  M= -3,  4, -7,  2, 13,-15, -9, -7,-13,  7,-10, -3,  8, -5,  5, -3,  0, -5,-15,-13,-10, 11; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='P';  M= -2, -7,-15, -8, -5, -9, -5,  1, -4, -5, -7, -7, -7,  4, -5, -8,  3,  3, -5, -7, -4, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P';  M= -3, -5,-27,  0, -3,-19,  2,-11,-12, -1,-11,-17,-10, 13, -7, -7,  3, -1,-13,-17, -8, -8;
/M: SY='Y';  M=-34,-28,-49,-16,-21, 32,-21, -9, -8,-11, 24,-11,-35,-23,-13, -3,-19,-14,  5, 49, 71,-21;
/M: SY='W';  M=-29,-33,-23,-25, -8,  0,  8,-38,-20,-14,-15,-21,-47,-24, -7, -1,-19,-34,-19,119, 27, -9;
/M: SY='Q';  M=  5, -6,-25, -6,  7,-17, -5,-14,-13, 11,-16,  1, -5, -3, 18, 12,  0, -4,-14,-17,-13,  9;
/M: SY='Q';  M= -4, -2,-26,  7, 10,-21,-13,  1,-23,  6,-12, -7, -9,  0, 14, 10, -3,-11,-19,-14, -3, 10;
/M: SY='R';  M= -3,-11,-20,-10, -4, -9,-17,  4,-11,  1, -4,  6, -9, -3,  6, 15, -7, -7, -8,-24, -3, -2;
/M: SY='Y';  M=-15,-22,-32,-19,-20, 26,-25,-13,  2,-10, 19, -4,-21,-24,-13, -8,-11, -3, 13,  8, 37,-20;
/M: SY='W';  M= -5,-13,-22,-15,-11, -3, -5,-19,  2, -8,  3,  1,-12,-21,-10,-12, -8, -3,  0, 10,  7,-10;
/M: SY='G';  M= -5, -9,-33,-12,-10, -8, 19,-19,-11, -3, -9,-12, -9,-11, -1, -1, -3,-12,-15,  4, -3, -8;
/M: SY='A';  M= 18, -9,-26,-14,-14, -4, -3,-22, 13, -8, -2,  1, -5,-20, -7,-11,  3,  4, 16,-32,-19,-14;
/M: SY='R';  M= -6,-16,-25,-11,-12, -5,-14,-14,-11,  2,-10, -2,-15,-14,  8, 35, -4,-13,  0, -7,  3, -8;
/M: SY='R';  M= -2,-17,-15,-10, -9,-10,-18,-14,-19,  5,-16,  0,-16,-13, 19, 55, -6,-20, -3,-11, -7, -3;
/M: SY='F';  M=-12,-23,-28,-29,-27, 29,-22,-18, 22,-14, 19, -1,-16,-30,-18, -9,-13, -7, 24, -4, 24,-26;
/M: SY='T';  M=  4, -6,-21, -9, -9, -2,-12,-16,  1, -1,  4,  6, -3,-15, -6,-11,  0,  8,  2,-26, -2, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_06 which contains 563'972 sequence entries.


Total number of hits 40 in 38 different sequences
Number of true positive hits 40 in 38 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Bacteriophages, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NlpC/P60
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
38 sequences

ALYS_BPDP1  (O03979    ), CWLO_BACLD  (Q65NQ9    ), CWLO_BACSU  (P40767    ), 
CWLS_BACSU  (O31852    ), DPP6_LYSSH  (P39043    ), LYTE_BACSU  (P54421    ), 
LYTF_BACSU  (O07532    ), MEPH_ECOLI  (P76190    ), MEPS_ECO57  (P0AFV6    ), 
MEPS_ECOL6  (P0AFV5    ), MEPS_ECOLI  (P0AFV4    ), MEPS_SHIFL  (P0AFV7    ), 
NLPC_ECOLI  (P23898    ), NLPC_HAEIN  (P45296    ), P54_ENTFC   (P13692    ), 
P60_LISGR   (Q01835    ), P60_LISIN   (Q01836    ), P60_LISIV   (Q01837    ), 
P60_LISMO   (P21171    ), P60_LISSE   (Q01838    ), P60_LISWE   (Q01839    ), 
PGDS_BACSU  (P96740    ), RIPA_MYCS2  (A0QX22    ), RIPA_MYCTU  (O53168    ), 
RIPB_MYCTO  (P9WHU4    ), RIPB_MYCTU  (P9WHU5    ), TIPK_BPN15  (O64333    ), 
TIPK_LAMBD  (P03729    ), Y1314_HAEIN (Q57223    ), Y2070_CORGB (A4QFQ3    ), 
Y2188_CORGL (Q8NNK6    ), Y2190_MYCTO (P9WHU2    ), Y2190_MYCTU (P9WHU3    ), 
Y2213_MYCBO (P67474    ), YAFL_ECOLI  (Q47151    ), YDDH_BACSU  (P96645    ), 
YKFC_BACC1  (Q736M3    ), YKFC_BACSU  (O35010    )
» more

PDB
[Detailed view]
10 PDB

2K1G; 2XIV; 3H41; 3NE0; 3PBC; 3PBI; 3S0Q; 4Q4G; 4Q4N; 4Q4T

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission