PROSITE entry PS51935
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NLPC_P60 |
| Accession [info] | PS51935 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
02-DEC-2020 CREATED;
02-DEC-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51935 |
| Associated ProRule [info] | PRU01284 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | NlpC/P60 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=123; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=118; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6503333; R2=0.0077738; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1075; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=753; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= 4, -5,-25, -7, -9,-13, -4, -5, 1, -5, -7, -2, -2,-14, -5, -5, 6, 3, -1,-28,-12,-10; /M: SY='A'; M= 9, 5,-23, 7, -1,-23, -2,-12,-10, 0,-10, -6, 3, -4, -1,-10, 6, 7,-10,-33,-18, -3; /M: SY='A'; M= 8, -3,-23, -7, -8, -3, -3,-21, -1, -3, -5, -2, -1,-16, -8,-12, 4, 3, 1,-19,-11,-10; /M: SY='A'; M= 4, -9,-25, -9, -9,-14, -7,-13, 3, -2, -4, -3, -7, -2, -6, -7, -2, 1, 2,-25,-11,-10; /M: SY='E'; M= 3, 1,-12, 5, 19,-24, -5,-13,-18, 6,-13,-10, -4, -5, 5, -9, 5, -6,-18, -9,-16, 14; /M: SY='A'; M= 3, -7,-28, -4, -9,-11, -2,-18, -5, -4, -5, -4,-10,-10, -6, -5, -3, -2, -1, -8, -4,-10; /M: SY='I'; M= 4, -7,-16, -7,-15, -1,-17,-17, 23,-13, 17, 9, -9,-28,-17,-17,-10, 2, 21,-30, 2,-16; /M: SY='I'; M= 4,-16,-20,-26,-24, 2,-18,-18, 39,-15, 15, 10, -6,-33,-21,-18, -9, 4, 33,-29, -1,-25; /M: SY='Q'; M= 4, 1, -7, 5, 8,-23,-13, -8,-18, 1,-15, -8, 0, -8, 12, 6, 6, -2,-15,-27,-20, 7; /M: SY='Q'; M= 5, -4,-14, 0, 14,-23,-18,-11,-16, 8,-11, -2, -6, -2, 18, 9, 1, -2,-10,-22,-13, 15; /M: SY='G'; M= 15, -4,-31, -7, -9,-15, 19,-20, 1, -7, -5, 0, -5,-13, -2,-13, 1, -2, -2,-21,-20, -9; /M: SY='Q'; M= 4, -6,-21, -8, 3,-13,-14, -6, -6, 5, -4, 7, -4, -9, 9, 0, -2, 2, -7,-23, -5, 4; /M: SY='K'; M= 7, -2,-21, -3, 4,-13,-10,-12, -7, 8,-10, 0, 0, -1, 1, -7, 7, 5, -8,-30,-15, 1; /M: SY='W'; M=-21,-25,-32,-21, -6, 3,-17, 7,-13,-10, -1, -5,-27,-14, 10, 6,-16,-18,-13, 35, 27, -2; /M: SY='I'; M= 1,-13,-18,-19,-13, 0,-13,-11, 23, -8, 14, 14,-10,-25,-16,-14,-11, -1, 16,-25, 2,-15; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -1, -3,-19, -9, -8,-29, 49,-26,-14, -6,-17,-16, -4, -9, -9, -9, -2,-19,-26, 3,-28, -9; /M: SY='V'; M= 5,-10,-21,-11,-13, 0,-20,-20, 12, -6, 4, 3,-10,-19,-12,-11, 0, 13, 18,-28, 4,-13; /M: SY='P'; M= -5,-17,-28, -9, 8,-35,-10, 5,-26, 8,-27,-32,-25, 83, 5, -3, -6, 0,-33,-29,-20, 1; /M: SY='Y'; M=-37,-28,-56,-11,-18, 25,-29, 9, -9,-11, 28, -6,-37,-19,-10, -2,-19,-10, 7, 39, 81,-18; /M: SY='R'; M= 2, -9,-20, -8, -7, -4,-11,-16, -2, 1, -5, 2,-10,-14, -3, 9, 3, -1, 2,-21, -4, -8; /M: SY='W'; M=-31,-35,-20,-30, -8, 8, -4,-30,-18,-11, -5,-12,-44,-26, -6, -3,-21,-27,-17,108, 35, -7; /M: SY='G'; M= 1, 2,-38, -3,-17,-30, 66,-28,-13, -8,-19,-19, 0,-10,-16,-13, 0,-19,-27, 4,-27,-17; /M: SY='G'; M= 0, -4,-37,-12,-18,-20, 57,-26,-11, -7,-17,-18, -4, -5,-14,-11, -1,-18,-24, 4,-24,-18; /M: SY='S'; M= 3, -4,-22,-10,-10, -9, -2,-17, -5, 0, -9, -2, 4,-13, -3, -1, 5, 3, -4,-24,-13, -9; /M: SY='T'; M= 4, 3,-24, 0,-13,-11, -2,-19, -7, -5, -9,-10, 7,-13, -7,-10, 11, 12, -3,-30,-13,-12; /M: SY='P'; M= -3,-11,-25, -7, 5,-27, -1, -4,-19, 6,-17,-19,-17, 47, -1, -6, -4, -3,-24,-22,-16, 0; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='S'; M= 2, -2,-22, -3, -7,-10, -1,-18, -9, -1, -8, -7, -2,-12, -4, -1, 4, 0, -6,-20,-10, -7; /M: SY='G'; M= 2, -3,-35,-11,-18,-24, 45,-17, -5,-10,-14,-12, -2,-11,-15,-16, 3, -8,-16, -7,-22,-17; /M: SY='F'; M=-15,-26,-30,-42,-36, 72,-27,-26, 8,-12, 19,-14,-10,-35,-26,-13, -9,-11, 16, 2, 26,-35; /M: SY='D'; M= 0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40, 0,-10,-30, 10,-10,-10,-10, 0,-10,-20,-40,-10, 0; /M: SY='C'; M=-28,-19,156,-29, 9,-30,-38,-47,-20,-28, -1,-20,-10,-23,-19,-20,-18,-17,-20,-21,-57, 0; /M: SY='S'; M= 4, -5,-23, -3, -2, -6, -1,-12,-11, -2,-16,-19, -7,-12, -9, -9, 31, 14, -9,-12, -9,-10; /M: SY='G'; M= 3, 0,-36, -9,-17,-27, 62,-27, -9, -9,-18,-18, 1, -9,-17,-19, 6,-10,-24, 0,-28,-18; /M: SY='F'; M=-14,-19,-16,-28,-23, 55,-23,-19, 8,-14, 27, -1,-14,-33,-24,-15,-12, -8, 9, -6, 28,-24; /M: SY='V'; M= 5,-17,-14,-24,-24, 3,-25,-20, 25,-12, 11, 8, -8,-31,-20,-15, -6, 12, 28,-31, 0,-23; /M: SY='R'; M= -7,-17,-27,-13, -4, -3,-19, -1,-12, 0, -2, 0,-17,-14, 16, 18, -8, -8, -8, 1, 14, 1; /M: SY='Y'; M=-26,-21,-41, -7,-13, 10,-18,-12,-13, -7, 10,-10,-30,-19, -8, -1,-11, -9, 0, 43, 50,-14; /M: SY='V'; M= 17, -9,-25,-11,-14, -6,-14,-20, 15, -9, 3, 5, -7,-20, -8,-13, 3, 13, 22,-35, -9,-14; /M: SY='F'; M=-24,-27,-36,-31,-28, 60,-28,-15, 1,-10, 26, -8,-21,-32,-21, -8,-15,-13, 11, 18, 48,-28; /M: SY='Q'; M= 6, -2,-23, -5, -2,-10,-11, -3,-10, 2,-12, 3, 4,-11, 11, 10, 1, -3, -9,-31,-15, 0; /M: SY='Q'; M= 4, 2,-21, 5, 11,-19, -4,-12,-15, 8,-12, -3, -2, -4, 13, 1, 2, -3,-18,-20,-11, 10; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='A'; M= 11, -7,-25,-12,-13, 3,-14, -7, 5, -8, 0, 2, -1,-19, -8,-13, 3, 7, 10,-37,-11,-13; /M: SY='G'; M= 1, 5,-35, 0,-12,-29, 59,-26,-13, -6,-19,-19, 3, -9,-16,-17, 3,-15,-27, -1,-27,-14; /M: SY='I'; M= 3,-16,-20,-26,-22, 3,-15,-20, 38,-15, 15, 9, -8,-28,-16,-17, -9, 1, 31,-27, -1,-22; /M: SY='E'; M= 2, -1,-17, 1, 10,-19,-10, -5,-13, 5,-10, -6, -3, -4, 3, -5, 10, 2,-12,-23,-12, 6; /M: SY='L'; M= -5,-13, -9,-17,-14, 9,-17,-10, 22,-14, 26, 16,-13,-28,-15,-12,-13, -1, 13,-22, 13,-14; /M: SY='P'; M= -6,-14,-30, -8, 2,-28, -4, 7,-21, 3,-20,-26,-20, 64, -4,-12, -6, -1,-28,-28,-16, -4; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='R'; M= -8, -8,-25, 1, -7,-16, -6, 0,-25, 2,-16, -6,-11, -5, 12, 38, -7,-22,-15, -9, -5, -3; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='T'; M= 0, -3,-24, 0,-10, -8,-15,-17, -7, -5, -4,-11, -5,-13, -7, -8, 10, 12, 2,-18, 1,-11; /M: SY='T'; M= 15, 5,-20, 3, -3,-18, -8,-16, -5, -2,-10, -5, 7, -8, -1,-16, 18, 20, 0,-42,-22, -4; /M: SY='G'; M= 5, 2,-28, 1, -7,-17, 6,-17, -8, -3, -9, -7, 3,-11, 1, -7, 1, 2, -8,-20,-11, -5; /M: SY='D'; M= 6, 6,-19, 15, 15,-33, -4,-10,-19, 4,-13,-15, -4, 10, 6,-10, 4, -3,-18,-26,-20, 11; /M: SY='Q'; M= -6,-18,-25,-15, 4,-11,-18, -7,-13, -5, -5, -6,-22,-12, 39, 14,-14, -6,-16, 21, 15, 16; /M: SY='W'; M=-17,-24,-32,-15, -5, 2,-13,-12,-12, -6, 2, -5,-31,-19, -1, 0,-13,-15, -5, 47, 30, -6; /M: SY='H'; M= 3, 2,-25, -3, 1,-19, -4, 14,-12, 0,-15, 2, 11, -8, 1, -2, 2, -5,-15,-36,-21, 0; /M: SY='N'; M= 8, 0,-23, -8,-10, -4, -4,-15, 5, -4, -2, 3, 9,-20, -5,-12, 1, 5, 2,-32,-13,-10; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= 4, -3,-34,-12,-16,-27, 49,-21, -6, -6,-14,-11, -1, -6,-15,-18, 1, -8,-20, -6,-26,-16; /M: SY='Q'; M= 2, -4,-25, -2, 0,-16,-18,-14,-14, 6, -9, 0, -4, -3, 15, 8, 2, 7, -7,-22, -3, 4; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='K'; M= 3, 0,-21, -2, 10,-18, -7, -2,-13, 12,-15, 2, 5, 8, 4, -2, 0, -4,-16,-29,-18, 6; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='I'; M= 1,-18,-16,-26,-26, 12,-19,-21, 39,-18, 17, 5,-11,-32,-23,-17,-11, 3, 35,-24, 6,-26; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='P'; M= 8, -1,-24, 2, 4,-16, -7,-11,-15, 5,-16,-13, -4, 12, -1, -7, 11, 5,-13,-31,-19, -2; /M: SY='P'; M= -1, -6,-19, -2, 5,-13,-14,-10, -6, 5, -5, -4,-10, 8, -4, -4, -4, -4, -7,-23, -5, 0; /M: SY='S'; M= 6, 3,-20, 7, 6,-18, 1,-14,-16, 1,-17,-16, -2, -9, -3, -9, 19, 4,-15,-14,-17, 0; /M: SY='D'; M= 4, 12,-18, 22, 18,-34,-13, -3,-24, 4,-15,-13, 4, 2, 19, 1, -2, -6,-23,-29,-17, 18; /M: SY='M'; M= 9,-11,-18,-12, -5, -8,-12, -6, 8, -3, 10, 15,-11, -6, -6,-13, -9, 3, 3,-33, -8, -7; /M: SY='Q'; M= 4, -6,-24, -5, 13,-16,-14,-11,-18, 17,-17, 5, -6, 1, 29, 21, -2, -5,-19,-16, -9, 16; /M: SY='P'; M= 1,-12,-24, -7, 2,-22,-14, -7,-17, 8,-18,-10,-14, 30, 7, 11, -4, -4,-13,-26,-14, 0; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='D'; M= 0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40, 0,-10,-30, 10,-10,-10,-10, 0,-10,-20,-40,-10, 0; /M: SY='L'; M= -5,-15,-10,-20,-19, 20,-21,-15, 28,-18, 30, 13,-15,-33,-22,-19,-16, 0, 21,-21, 19,-19; /M: SY='I'; M= 1,-18,-15,-22,-25, 17,-24,-23, 35,-19, 20, 6,-16,-36,-26,-16,-13, 4, 35,-25, 14,-25; /M: SY='F'; M=-14,-25,-26,-41,-33, 70,-25,-25, 9,-12, 21,-10,-10,-35,-25,-14,-10,-12, 14, -1, 23,-33; /M: SY='F'; M=-24,-31,-17,-43,-30, 70,-26,-28, -5,-11, 16,-16,-18,-37,-25, -8,-14,-21, 3, 28, 29,-31; /M: SY='G'; M= -2, -1,-18, 2, -2,-22, 4,-13,-17, -1,-12,-10, -4, -4, 2, 0, -1, -7,-17,-15,-13, -2; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='T'; M= 2, -5,-15, -7, -5, -2, -4, -5, -2, -4, -2, -3, -3, -7, 0, -6, 2, 3, 0,-11, -3, -4; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='Y'; M= -4, -7,-26, -5, -6, -6, 2, -9, -8, -4, -3, -9, -8, -8, 0, -4, 4, 1, -6, 0, 7, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= 3, -4,-28, -4, -2,-15, 15,-14,-11, 5,-14, -5, -6, 5, -3, -2, 2, -6,-14,-11,-14, -5; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='S'; M= 5, 5,-23, 3, -1,-19, 13,-15,-12, 1,-16,-13, 6, -4, -5,-11, 14, 5,-16,-23,-21, -5; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= 9, 1,-28, -4,-12,-18, 18,-23, 0, -4,-10, -5, 5,-12,-10,-15, 4, 3, -4,-24,-21,-12; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= 2, -7,-25,-13,-10,-17, 11,-16, 2, -6,-11,-12, -3, 6, -9,-16, 0, -1, -7,-15,-18,-13; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='N'; M= 1, 4,-26, 0, -7,-15, 2, -4, -9, -5, -9, -6, 8,-12, 0, -9, 5, 4,-12,-27,-11, -6; /M: SY='H'; M=-19,-18,-49,-19, 0,-29,-29,135,-19,-19,-10, 19, -7, 9, 0,-10,-10,-19,-30,-51, -1, 0; /M: SY='V'; M= 15,-12,-23,-12,-19, -4,-21,-21, 22,-10, 4, 5,-12,-26,-17,-10, -5, 11, 30,-35, -4,-19; /M: SY='G'; M= 10, 0,-36, -7,-15,-26, 53,-26, -7, -7,-17,-12, 1, -9,-11,-18, 5, -8,-18, -9,-31,-14; /M: SY='I'; M= 1,-19,-17,-33,-25, 1,-14,-14, 47,-15, 22, 17, -4,-32,-20,-23,-13, 1, 32,-29, -3,-25; /M: SY='Y'; M=-35,-28,-53,-12,-20, 33,-28, -3, -8,-10, 28, -9,-36,-21,-12, -2,-17, -9, 9, 41, 79,-20; /M: SY='I'; M= -2,-13, -1,-19,-17, 4,-18,-20, 30,-19, 21, 7,-11,-30,-20,-20,-12, 1, 23,-27, 3,-19; /M: SY='G'; M= 0, 3,-36, -2,-12,-31, 63,-27,-13, -6,-18,-18, 0, -8,-16,-18, 1,-17,-28, 3,-27,-14; /M: SY='N'; M= 1, 26,-22, 20, -3,-24, 9,-10,-13, -2,-17,-11, 35,-17, -7,-15, 2, -1,-21,-42,-28, -5; /M: SY='G'; M= 0, 12,-33, 3,-15,-28, 54,-25,-11, -7,-18,-17, 16,-13,-17,-19, 1,-11,-26,-11,-29,-16; /M: SY='Q'; M= 4, -2,-16, -3, 11,-21,-16, -5,-14, 5,-11, 0, 1, -7, 33, 10, -4, 1,-18,-23,-11, 18; /M: SY='F'; M= -7,-23,-24,-33,-24, 33,-24, -8, 12, -3, 22, 16,-10,-37,-20, -8,-15, -7, 11, -9, 17,-24; /M: SY='I'; M= -2,-17,-14,-27,-23, 10,-17,-18, 41,-19, 25, 12,-10,-32,-22,-22,-13, 1, 30,-26, 7,-23; /M: SY='H'; M=-12, -6,-34, -8, 7,-28,-23, 88,-18,-10,-12, 10, 5, 2, 5, -9, -7,-14,-28,-46,-10, 6; /M: SY='A'; M= 19, -2,-17, -1, 0,-20, -8, 0, -7, -5,-11, 0, -2,-10, 0,-11, 11, 6, -1,-43,-29, -3; /M: SY='P'; M= 1, -1,-19, -6, -3,-16, -6, -7, -5, -2,-13,-13, 5, 10, -1,-12, 7, 10,-14,-34,-17, -5; /M: SY='D'; M= -5, 0,-28, 8, -5,-14,-14,-11,-15, -2, -4,-10, -6, -2, 3, 1, 0, 4, -8,-17, 6, -4; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= 1, -3,-25, -4, -5,-13, 22,-15,-10, 0,-12,-11, -4, -7, -8, -7, 9, -4,-14, -4,-12, -8; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='N'; M= 0, 5,-21, 5, 4,-19, -7, -1,-15, 3,-14, -4, 8, -8, 4, 3, 3, -4,-16,-29,-15, 2; /M: SY='G'; M= -1, -1,-27, -6, -2,-25, 34,-14,-13, -1,-15,-12, -2, 1,-10,-15, 1,-11,-25, -8,-21, -5; /M: SY='V'; M= 6,-19,-19,-21,-26, 6,-24,-25, 35,-17, 9, 1,-15,-34,-23, -8, -8, 6, 39,-28, 5,-26; /M: SY='Q'; M= 2, -6,-22, -6, 0,-13,-15,-11, -6, 3, -7, -2, -3, -9, 8, 3, 4, 4, -5,-21, -5, 1; /M: SY='V'; M= -2,-19,-24,-24,-23, 3,-20,-19, 30,-14, 12, 2,-12,-27,-15,-10, -9, 2, 31,-18, 9,-22; /M: SY='D'; M= 5, 11,-22, 14, -5,-18, -6,-11, -7, -5,-10,-12, 8,-14,-11,-14, 14, 11, -4,-37,-15,-10; /M: SY='P'; M= 0, 7,-23, 7, 1,-19, -6, -7,-16, 5,-19,-17, 10, 12, -6, -8, 11, 7,-19,-36,-19, -6; /M: SY='L'; M= -9,-19,-18,-21,-14, 6,-20, 1, 15,-11, 22, 19,-19,-30,-16,-12,-18, -4, 10, -4, 21,-14; /M: SY='D'; M= 1, 14,-25, 18, 1,-25, -5, 0,-19, 1,-16, -8, 14, -9, 4, 0, 3, -2,-18,-35,-17, 0; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='E'; M= -3, 4, -7, 2, 13,-15, -9, -7,-13, 7,-10, -3, 8, -5, 5, -3, 0, -5,-15,-13,-10, 11; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='P'; M= -2, -7,-15, -8, -5, -9, -5, 1, -4, -5, -7, -7, -7, 4, -5, -8, 3, 3, -5, -7, -4, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -3, -5,-27, 0, -3,-19, 2,-11,-12, -1,-11,-17,-10, 13, -7, -7, 3, -1,-13,-17, -8, -8; /M: SY='Y'; M=-34,-28,-49,-16,-21, 32,-21, -9, -8,-11, 24,-11,-35,-23,-13, -3,-19,-14, 5, 49, 71,-21; /M: SY='W'; M=-29,-33,-23,-25, -8, 0, 8,-38,-20,-14,-15,-21,-47,-24, -7, -1,-19,-34,-19,119, 27, -9; /M: SY='Q'; M= 5, -6,-25, -6, 7,-17, -5,-14,-13, 11,-16, 1, -5, -3, 18, 12, 0, -4,-14,-17,-13, 9; /M: SY='Q'; M= -4, -2,-26, 7, 10,-21,-13, 1,-23, 6,-12, -7, -9, 0, 14, 10, -3,-11,-19,-14, -3, 10; /M: SY='R'; M= -3,-11,-20,-10, -4, -9,-17, 4,-11, 1, -4, 6, -9, -3, 6, 15, -7, -7, -8,-24, -3, -2; /M: SY='Y'; M=-15,-22,-32,-19,-20, 26,-25,-13, 2,-10, 19, -4,-21,-24,-13, -8,-11, -3, 13, 8, 37,-20; /M: SY='W'; M= -5,-13,-22,-15,-11, -3, -5,-19, 2, -8, 3, 1,-12,-21,-10,-12, -8, -3, 0, 10, 7,-10; /M: SY='G'; M= -5, -9,-33,-12,-10, -8, 19,-19,-11, -3, -9,-12, -9,-11, -1, -1, -3,-12,-15, 4, -3, -8; /M: SY='A'; M= 18, -9,-26,-14,-14, -4, -3,-22, 13, -8, -2, 1, -5,-20, -7,-11, 3, 4, 16,-32,-19,-14; /M: SY='R'; M= -6,-16,-25,-11,-12, -5,-14,-14,-11, 2,-10, -2,-15,-14, 8, 35, -4,-13, 0, -7, 3, -8; /M: SY='R'; M= -2,-17,-15,-10, -9,-10,-18,-14,-19, 5,-16, 0,-16,-13, 19, 55, -6,-20, -3,-11, -7, -3; /M: SY='F'; M=-12,-23,-28,-29,-27, 29,-22,-18, 22,-14, 19, -1,-16,-30,-18, -9,-13, -7, 24, -4, 24,-26; /M: SY='T'; M= 4, -6,-21, -9, -9, -2,-12,-16, 1, -1, 4, 6, -3,-15, -6,-11, 0, 8, 2,-26, -2, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 41 in 39 different sequences |
| Number of true positive hits | 41 in 39 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 3 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NlpC/P60 |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
39 sequences
ALYS_BPDP1 (O03979), CWLO_BACLD (Q65NQ9), CWLO_BACSU (P40767), CWLS_BACSU (O31852), CWLT_BACSU (P96645), CWL_CLODR (P0DX27), DPP6_LYSSH (P39043), LYTE_BACSU (P54421), LYTF_BACSU (O07532), MEPH_ECOLI (P76190), MEPS_ECO57 (P0AFV6), MEPS_ECOL6 (P0AFV5), MEPS_ECOLI (P0AFV4), MEPS_SHIFL (P0AFV7), NLPC_ECOLI (P23898), NLPC_HAEIN (P45296), P54_ENTFC (P13692), P60_LISGR (Q01835), P60_LISIN (Q01836), P60_LISIV (Q01837), P60_LISMO (P21171), P60_LISSE (Q01838), P60_LISWE (Q01839), PGDS_BACSU (P96740), RIPA_MYCS2 (A0QX22), RIPA_MYCTU (O53168), RIPB_MYCTO (P9WHU4), RIPB_MYCTU (P9WHU5), TIPK_BPN15 (O64333), TIPK_LAMBD (P03729), Y1314_HAEIN (Q57223), Y2070_CORGB (A4QFQ3), Y2188_CORGL (Q8NNK6), Y2190_MYCTO (P9WHU2), Y2190_MYCTU (P9WHU3), Y2213_MYCBO (P67474), YAFL_ECOLI (Q47151), YKFC_BACC1 (Q736M3), YKFC_BACSU (O35010)» more
|
| PDB [Detailed view] |
22 PDB
2K1G; 2XIV; 3H41; 3NE0; 3PBC; 3PBI; 3S0Q; 4Q4G; 4Q4N; 4Q4T; 7V6S; 7V6T; 7V6U; 8I2D; 8I2E; 8I2F; 8IDC; 8IDD; 8IGQ; 8JIA; 8XUD; 8XUP » more |