Home  |  Contact
Entry: PS51940

General information about the entry

Entry name [info] SARS_NSP3C_N
Accession [info] PS51940
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 02-DEC-2020 CREATED;
02-DEC-2020 DATA UPDATE;
07-APR-2021 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51940
Associated ProRule [info] PRU00490

Name and characterization of the entry

Description [info] Sarbecovirus Nsp3c-N domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=129;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0347111; R2=0.0144686; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=689; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=309; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='I';  M=-15, -3,-29, -3,-13, -1,-28,-18, 12,-20,  2,  0, -7,-18,-16,-22,-13,-10,  5,-22, -2,-17;
/M: SY='K';  M= -7,-10,-23,-10, -3,-20,-23,-17,-10, 27,-17, -3,-10,-17, -3, 13,-10, -7,  3,-23,-10, -3;
/M: SY='A';  M= 30, -7,-17,-13, -3,-23, -7,-17,-17, 10,-17,-10, -7,-10, -3, -3,  3, -3, -7,-20,-17, -3;
/M: SY='C';  M= -8,-12, 54,-20,-19,-17,-25,-22,-23,-14,-17,-15,-10,-27,-17, -8,  0, 10, -8,-39,-20,-19;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-29,-28,-20,-10,-31,-27, 22,-21,  1,  4,-22, 14,-19,-24,-14, -8, 15,-26,-12,-23;
/M: SY='E';  M= -6, 18,-23, 27, 29,-29,-11, -3,-29,  1,-26,-23,  9, -6,  8, -6, 13,  0,-23,-36,-20, 18;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-30, 13, 43,-30,-20, -3,-30, 23,-23,-17,  0, -3, 17, 10, -3,-10,-27,-27,-17, 30;
/M: SY='V';  M= -3,-27,-20,-23,-20,-10,-27,-27, 13,-17, -3,  0,-27, 10,-23,-20,-10, -3, 23,-30,-17,-23;
/M: SY='T';  M= -1, -4,-11,-12,-15, -8,-20,-19,  2,-12, -6, -5, -1,-18,-15,-12,  8, 26, 12,-31,-11,-15;
/M: SY='T';  M= -7, -7,-17,-13,-13,  3,-23, -7, -7,-10, -7, -7, -7,-17,-10,-10,  7, 30, -3,-10, 20,-13;
/M: SY='T';  M= -2, -7,-13,-15,-12, -8,-17,-12, -1,-10, -3, 12, -5,-13, -5,-10, 10, 25,  2,-28, -8, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-13, 20,-23, 40, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-30, 10, 33,-30, 10, -7,-33,  0,-23,-20,  0, -7,  7, -7,  0,-13,-30,-27,-23, 20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='T';  M=  0,-10,-10,-17,-17, -7,-23,-23,  3,-13, -3, -3,-10,-17,-17,-13, 10, 33, 17,-30,-10,-17;
/M: SY='K';  M=-10,  3,-30,  7, 27,-30,-20, -7,-30, 37,-27,-13,  0, -7, 13, 20, -7,-10,-23,-23,-13, 20;
/M: SY='F';  M=-13,-30,-17,-37,-30, 53,-30,-23, 10,-27, 10,  3,-23,-30,-37,-20,-17, -7, 17, -3, 17,-30;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10,  7,-10, 10,-23;
/M: SY='C';  M= -3, -7, 33,-17,-17,-13,-23,-23,-17,-17,-13,-13, -7,-20,-17,-17, 10, 30, -3,-37,-17,-17;
/M: SY='N';  M=  0, 14,-18, 10, 14,-22, -5, -2,-22, -2,-28,-20, 22,-10,  5, -5, 22,  7,-20,-38,-20, 10;
/M: SY='K';  M= -8,  8,-21,  0, -1,-19,-15, -7,-21, 15,-22,-12, 14,-14,  1, 15,  5, 12,-16,-28,-12, -1;
/M: SY='L';  M=-10,-20,-23,-20,-10, -3,-27,-17,  3, -3, 23, 10,-20,-23,-10, -3,-23,-10,  0,-20, -3,-10;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 37, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 23,-23, -3,-23;
/M: SY='L';  M= 10,-23,-17,-27,-17,  0,-20,-20, 10,-23, 30, 10,-23,-23,-17,-20,-17, -7,  7,-20, -7,-17;
/M: SY='Y';  M=-20,-24,-26,-29,-24, 51,-30,  3,  0,-19,  4,  0,-20,-30,-23,-14,-20,-10, -6, 21, 59,-24;
/M: SY='C';  M= 11,-17, 29,-27,-21,-14,-21,-26, -2,-21, -6, -6,-15,-22,-19,-25, -3, -1,  4,-31,-18,-21;
/M: SY='D';  M=-17, 47,-27, 53, 13,-33, -7,  3,-33,  0,-30,-27, 33,-13,  0, -7,  3, -7,-30,-40,-20,  7;
/M: SY='I';  M=-10,-20,-30,-27,-13,-13,-33,-17, 27,-17,  7, 13,-13,-17,  7,-17,-13,-10, 10,-20, -3, -7;
/M: SY='N';  M=-13, 43,-23, 37,  7,-27, -3,  7,-27,  0,-30,-23, 47,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='G';  M= -3, -7,-30, -7,-10,-30, 40,-17,-37,  3,-30,-17,  0,-17,-10, -3, -3,-17,-27,-20,-23,-10;
/M: SY='K';  M=-10, 13,-28, 11, 24,-28,-15, -2,-28, 25,-27,-16, 14, -9, 11, 13, -2, -8,-26,-28,-16, 18;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10,  7,-10, 10,-23;
/M: SY='Y';  M=-17,-15, 20,-19,-19,  1,-28, 22,-17,-17,-11, -7,-13,-31,-12,-14,-14,-12,-15,-11, 29,-19;
/M: SY='P';  M=-11,-11,-36, -6,  7,-33,-20,  0,-21, -3,-26,-11,-11, 46, 16, -8, -6,-11,-30,-26,-19,  8;
/M: SY='D';  M=-13, 30,-30, 43,  7,-37, 17, -7,-40, -7,-30,-27, 13,-13, -7,-13,  0,-13,-30,-33,-23,  0;
/M: SY='S';  M=  7,  0,-10, -3, -3,-17, -7,-13,-17,-10,-23,-17,  7,-10, -3,-10, 33, 30, -7,-37,-17, -3;
/M: SY='Q';  M= 11, -2,-19, -5,  5,-28, -9, -6,-19,  2,-22,-10,  1,-10, 19, -2, 15,  2,-15,-27,-16, 12;
/M: SY='T';  M= -4, 17,-14,  3, -6,-14,-11, -7,-14, -6,-19,-14, 26,-14, -6, -6, 16, 29,-13,-34,-14, -6;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-20,-30,-20,  6,-26,-11, 20,-21, 37, 37,-26,-26,-11,-16,-26,-10, 10,-20,  0,-16;
/M: SY='F';  M=-11,-30,-18,-33,-26, 31,-30,-22, 16,-28, 27, 11,-27,-30,-29,-20,-22, -8, 16,-12,  8,-26;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-25, -4,  3,-23,-15, -6,-28, 27,-26,-12,  2,-14,  8, 38,  2, -3,-18,-25,-12,  3;
/M: SY='G';  M= -8,  1,-33,  9, -4,-32, 21,-15,-33,-12,-30,-22, -2, 19,-12,-18, -3,-14,-30,-28,-28,-10;
/M: SY='E';  M=-10,  0,-30,  6, 39,-23,-25, -7,-11,  0,-10,-10, -5, -5, 10, -7, -5,-10,-16,-28,-15, 23;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='M';  M=-10,-12,-26,-16,  4,-10,-25, -7, 10, -8,  7, 24,-13,-13,  2,-11,-13,-10,  1,-23, -7,  2;
/M: SY='T';  M= -4,-15,-18,-22,-17,  4,-23,-21,  9,-20, -3, -1, -7,-16,-15,-18,  6, 13,  7,-23, -3,-17;
/M: SY='F';  M=-20,-23,-23,-30,-20, 47,-27,-13,-10,-10,  0, -3,-13,-27,-23, 10,-17,-10, -7,  0, 17,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-30,  9, 31,-30,-20, -6,-30, 33,-26,-14,  0, -6, 14, 17, -6,-10,-24,-24,-14, 23;
/M: SY='K';  M=-10,-10,-27,-10,  0,-17,-23,-13,-13, 23, -3,  0,-10,-17,  0, 13,-17,-10,-10,-20, -7,  0;
/M: SY='D';  M=-17, 27,-33, 43, 13,-37,-13, -7,-33, -3,-30,-27,  7, 23, -3,-13, -3,-10,-30,-37,-23,  3;
/M: SY='A';  M= 30, -3,-17, -7, 13,-23, -7,-13,-17, -3,-13,-13, -7, -7,  0,-13,  7, -3,-10,-23,-20,  7;
/M: SY='P';  M=-13,  3,-37, 17,  7,-33,-17,-13,-27, -7,-30,-23, -7, 57, -7,-17, -7,-10,-30,-33,-27, -3;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  7,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='I';  M=-10,-28,-25,-35,-25,  3,-33,-22, 35,-27, 30, 27,-23,-23,-17,-23,-23,-10, 20,-20,  0,-23;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-17,-33,-30,  0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='C';  M= -3,-27, 33,-30,-30, -7,-30,-30, 10,-23,  0,  0,-27,-33,-30,-23,-10, -3, 30,-37,-17,-30;
/M: SY='I';  M=-11,-20,-25,-24,-20, -7,-31, 13, 19,-21,  4, 11,-12,-22,-12,-18,-14,-11, 15,-26,  4,-20;
/M: SY='K';  M= -4,  0,-21, -3,  5,-25,-17, -8,-21, 15,-22, -9,  1,-10, 15,  8,  8, 11,-15,-26,-11, 10;
/M: SY='S';  M=  2, -8,-15, -5,  4,-16,-15,-14, -6, -9,-14,-10, -6,-14, -5,-11, 14,  6,  5,-34,-17, -1;
/M: SY='G';  M= -7, 10,-30, 17, -7,-33, 43,-13,-40,-13,-30,-23,  7,-17,-13,-17,  0,-17,-30,-27,-27,-10;
/M: SY='D';  M=-15, 31,-25, 46,  8,-30,-15, -7,-23, -5,-20,-20,  8,-15, -7,-12, -2, -8,-11,-38,-18,  0;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-21,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-27, 24, 17,-26,-26,-23,-24,-19, -7, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='T';  M= -7, -7,-17,-13,-13,  3,-23, -7, -7,-10, -7, -7, -7,-17,-10,-10,  7, 30, -3,-10, 20,-13;
/M: SY='C';  M=  8,-21, 46,-28,-25,-13,-23,-28, -5,-22, -8, -8,-21,-30,-25,-24, -5, -4, 12,-36,-21,-25;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 23, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 37,-27, -7,-27;
/M: SY='C';  M= -6,-27, 28,-33,-30, -7,-33,-30, 15,-26,  3,  3,-24,-31,-27,-26,-13, -6, 25,-34,-14,-30;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=  8, 14,-17, 16,  2,-24, -8,-12,-22, -7,-20,-18,  6,-10, -5,-13, 14, 12,-12,-32,-18, -2;
/M: SY='K';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10,  0,-13, 10, 43,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='K';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10,  0,-13, 10, 43,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='A';  M= 25, -6,-17,-11, -2,-23, -7,-16,-18, 10,-19,-11, -4,-10, -2, -2,  7, -1, -8,-22,-17, -2;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M= -3, -7,-30, -7, -7,-33, 40,-10,-33,-10,-27,-13,  0,-17,  7,-10,  0,-17,-30,-20,-23,  0;
/M: SY='T';  M= -7, 17,-17, 17,  0,-20,-17,-13,-20, -7,-17,-17,  7,-10, -7,-10, 13, 30,-10,-33,-13, -3;
/M: SY='T';  M= -3,-10,-13,-17,-13, -3,-23,-20,  0,-17, 10,  0,-10,-17,-13,-13,  3, 30,  3,-27, -7,-13;
/M: SY='E';  M= -7,  7,-23, 10, 37,-23,-20, -7,-23,  3,-17,-17,  0, -3, 10, -3,  7, 10,-20,-30,-17, 23;
/M: SY='M';  M= -7,-17,-23,-23,-20,-10, 10, -7,  0,-13,  3, 33,-13,-20, -7,-13,-13,-13, -3,-20,-10,-13;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10,  7,-10, 10,-23;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A';  M= 27, -5, -7,-10, -5,-13,  0,-12, -8, -7,-10, -8, -3, -7, -5,-12, 12,  3, -2,-17,-13, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10,  0,-13, 10, 41,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='A';  M= 33,-10,-17,-17,-13,-23, 23,-20,-20,-13,-17,-13, -7,-13,-13,-20,  7, -7,-10,-20,-23,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M=-12, -2,-30, -2,  8,-28,-20, -8,-30, 45,-28,-10,  0,-12, 10, 40,-10,-10,-20,-20,-10,  8;
/M: SY='K';  M=-10,  1,-30,  2, 19,-33,-20, -2,-27, 32,-26, -8,  0, -9, 28, 20, -6,-10,-24,-21,-11, 23;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 23, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 37,-27, -7,-27;
/M: SY='P';  M=-10,-13,-37, -7,  3,-30,-20,-17,-23, 10,-30,-17,-13, 57, -3, -3,-10,-10,-27,-27,-23, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-13,-18,-16,-12,-12,-25,-21,  2,  5, -7, -1,-12,-18,-11, -2, -4,  8, 13,-26, -9,-12;
/M: SY='D';  M=  0,  8,-17, 11, -5,-20,-13,-13, -8, -9,-14,-12,  2,-18,-11,-14,  5,  0,  3,-34,-17, -8;
/M: SY='E';  M= -7, 14,-21, 10, 22,-21,-15, -4,-21,  1,-19,-17, 14, -8,  5, -3,  9, 12,-20,-32,-17, 14;
/M: SY='Y';  M=  3,-17,-23,-20,-17, 13,-20,  7, -3,-10, -3, -3,-17,-23,-10,-13,-10, -7, -7, 13, 47,-17;
/M: SY='I';  M= 10,-23,-23,-33,-23, -7,-27,-27, 30,-23, 10, 10,-17,-17,-17,-27,-10, -7, 20,-20, -7,-23;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,  3,-10, -7,-10, 27, 40, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='C';  M= -3, -7, 33,-17,-17,-13,-23,-23,-17,-17,-13,-13, -7,-20,-17,-17, 10, 30, -3,-37,-17,-17;
/M: SY='Y';  M=-17,-23,-27,-23,-20, 23,-30,  7,  7,-17, 17,  7,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -3, 13, 53,-20;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-16, 37,-20,-14,-16,-27,-21,-18, -3, -7, -7,-16,-28,-14, -8,-15,-10, -9,-33,-16,-14;
/M: SY='F';  M= 12, -5,-16,-17,-14, 13,-10,-13, -9,-14, -8, -9,  3,-19,-18,-15,  0, -3, -7,-15, -3,-14;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  7,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-21,-33,-26,  4,-33,-26, 32,-28, 30, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-30, 13, 47,-33,-20,  3,-27, 10,-20,-13,  0, -3, 33,  3,  0,-10,-30,-27,-17, 40;
/M: SY='E';  M=-13, 23,-30, 37, 47,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  7, -3, 13, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 30;
/M: SY='A';  M= 33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,  3,-13, -3, -3,-17,-17,-17,-20,  3,  0, 17,-23,-17,-17;
/M: SY='K';  M= -7,  0,-23, -3,  3,-23,-20,-13,-23, 30,-23,-10,  0,-10,  3, 17,  0, 10,-13,-23,-10,  3;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-20,-10, -7,-17,-20,-20,-13,-10,-17,-13, -7, 23,-10,-13, 10, 30,-10,-30,-17,-10;
/M: SY='A';  M= 18,-21,-13,-26,-18, -5,-17,-22, 10,-19, 15,  5,-21,-21,-18,-20, -8, -3, 15,-22,-11,-18;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-13, 20,-23, 40, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='K';  M= -8, -1,-23, -5,  2,-22,-20,-12,-23, 27,-22,-10,  0,-11,  3, 23,  0, 10,-13,-23,-10,  2;
/M: SY='K';  M= 10, -3,-23, -7,  3,-27,-13,-13,-23, 30,-23,-10, -3,-10,  3, 13, -3, -7,-13,-20,-13,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K';  M=-10, -7,-33, -3,  7,-30,-20,-13,-27, 30,-30,-13, -7, 23,  3, 13,-10,-10,-23,-23,-17,  3;
/M: SY='S';  M=  0, 17,-17, 23,  7,-27, -3, -7,-27, -7,-30,-23, 13,-10,  0,-10, 27, 10,-17,-40,-20,  3;
/M: SY='A';  M= 22,-20,-17,-28,-20,-10,-18,-25, 16,-18,  3,  3,-16,-16,-16,-23, -3, -3, 18,-21,-12,-20;
/M: SY='F';  M=-20,-27,-23,-33,-27, 63,-30, -7,  0,-23,  7,  0,-20,-30,-30,-17,-20,-10, -3, 17, 47,-27;
/M: SY='Y';  M=-17,-23,-27,-23,-20, 23,-30,  7,  7,-17, 17,  7,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -3, 13, 53,-20;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-20,-23,-20,-10, -3,-27,-17,  3, -3, 23, 10,-20,-23,-10, -3,-23,-10,  0,-20, -3,-10;
/M: SY='P';  M= -7,-13,-30,-10, -3,-23,-20,-20,-17,-10,-23,-17,-13, 57,-10,-17,  0, 10,-20,-30,-23,-10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M= -7,-14,-23,-14,  1,-13,-28,-19,  9, -4, -2,  1,-15,-16, -8, -9,-10, -7, 12,-26,-10, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2021_02 which contains 564'638 sequence entries.


Total number of hits 10 in 10 different sequences
Number of true positive hits 10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Macro
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
10 sequences

R1AB_BC279  (P0C6V9    ), R1AB_BCHK3  (P0C6W2    ), R1AB_BCRP3  (P0C6W6    ), 
R1AB_SARS   (P0C6X7    ), R1AB_SARS2  (P0DTD1    ), R1A_BC279   (P0C6F5    ), 
R1A_BCHK3   (P0C6F8    ), R1A_BCRP3   (P0C6T7    ), R1A_SARS    (P0C6U8    ), 
R1A_SARS2   (P0DTC1    )
» more

PDB
[Detailed view]
2 PDB

2W2G; 2WCT

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission