Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51940
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SARS_NSP3C_N |
| Accession [info] | PS51940 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
02-DEC-2020 CREATED;
02-DEC-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51940 |
| Associated ProRule [info] | PRU00490 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Sarbecovirus Nsp3c-N domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=129; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0347111; R2=0.0144686; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=689; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=309; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='I'; M=-15, -3,-29, -3,-13, -1,-28,-18, 12,-20, 2, 0, -7,-18,-16,-22,-13,-10, 5,-22, -2,-17; /M: SY='K'; M= -7,-10,-23,-10, -3,-20,-23,-17,-10, 27,-17, -3,-10,-17, -3, 13,-10, -7, 3,-23,-10, -3; /M: SY='A'; M= 30, -7,-17,-13, -3,-23, -7,-17,-17, 10,-17,-10, -7,-10, -3, -3, 3, -3, -7,-20,-17, -3; /M: SY='C'; M= -8,-12, 54,-20,-19,-17,-25,-22,-23,-14,-17,-15,-10,-27,-17, -8, 0, 10, -8,-39,-20,-19; /M: SY='I'; M= -8,-27,-29,-28,-20,-10,-31,-27, 22,-21, 1, 4,-22, 14,-19,-24,-14, -8, 15,-26,-12,-23; /M: SY='E'; M= -6, 18,-23, 27, 29,-29,-11, -3,-29, 1,-26,-23, 9, -6, 8, -6, 13, 0,-23,-36,-20, 18; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 13, 43,-30,-20, -3,-30, 23,-23,-17, 0, -3, 17, 10, -3,-10,-27,-27,-17, 30; /M: SY='V'; M= -3,-27,-20,-23,-20,-10,-27,-27, 13,-17, -3, 0,-27, 10,-23,-20,-10, -3, 23,-30,-17,-23; /M: SY='T'; M= -1, -4,-11,-12,-15, -8,-20,-19, 2,-12, -6, -5, -1,-18,-15,-12, 8, 26, 12,-31,-11,-15; /M: SY='T'; M= -7, -7,-17,-13,-13, 3,-23, -7, -7,-10, -7, -7, -7,-17,-10,-10, 7, 30, -3,-10, 20,-13; /M: SY='T'; M= -2, -7,-13,-15,-12, -8,-17,-12, -1,-10, -3, 12, -5,-13, -5,-10, 10, 25, 2,-28, -8, -9; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-13, 20,-23, 40, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='E'; M= -7, 3,-30, 10, 33,-30, 10, -7,-33, 0,-23,-20, 0, -7, 7, -7, 0,-13,-30,-27,-23, 20; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='T'; M= 0,-10,-10,-17,-17, -7,-23,-23, 3,-13, -3, -3,-10,-17,-17,-13, 10, 33, 17,-30,-10,-17; /M: SY='K'; M=-10, 3,-30, 7, 27,-30,-20, -7,-30, 37,-27,-13, 0, -7, 13, 20, -7,-10,-23,-23,-13, 20; /M: SY='F'; M=-13,-30,-17,-37,-30, 53,-30,-23, 10,-27, 10, 3,-23,-30,-37,-20,-17, -7, 17, -3, 17,-30; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10, 7,-10, 10,-23; /M: SY='C'; M= -3, -7, 33,-17,-17,-13,-23,-23,-17,-17,-13,-13, -7,-20,-17,-17, 10, 30, -3,-37,-17,-17; /M: SY='N'; M= 0, 14,-18, 10, 14,-22, -5, -2,-22, -2,-28,-20, 22,-10, 5, -5, 22, 7,-20,-38,-20, 10; /M: SY='K'; M= -8, 8,-21, 0, -1,-19,-15, -7,-21, 15,-22,-12, 14,-14, 1, 15, 5, 12,-16,-28,-12, -1; /M: SY='L'; M=-10,-20,-23,-20,-10, -3,-27,-17, 3, -3, 23, 10,-20,-23,-10, -3,-23,-10, 0,-20, -3,-10; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 37, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 23,-23, -3,-23; /M: SY='L'; M= 10,-23,-17,-27,-17, 0,-20,-20, 10,-23, 30, 10,-23,-23,-17,-20,-17, -7, 7,-20, -7,-17; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24, 51,-30, 3, 0,-19, 4, 0,-20,-30,-23,-14,-20,-10, -6, 21, 59,-24; /M: SY='C'; M= 11,-17, 29,-27,-21,-14,-21,-26, -2,-21, -6, -6,-15,-22,-19,-25, -3, -1, 4,-31,-18,-21; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 53, 13,-33, -7, 3,-33, 0,-30,-27, 33,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='I'; M=-10,-20,-30,-27,-13,-13,-33,-17, 27,-17, 7, 13,-13,-17, 7,-17,-13,-10, 10,-20, -3, -7; /M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 37, 7,-27, -3, 7,-27, 0,-30,-23, 47,-17, 0, -3, 7, -3,-30,-40,-20, 3; /M: SY='G'; M= -3, -7,-30, -7,-10,-30, 40,-17,-37, 3,-30,-17, 0,-17,-10, -3, -3,-17,-27,-20,-23,-10; /M: SY='K'; M=-10, 13,-28, 11, 24,-28,-15, -2,-28, 25,-27,-16, 14, -9, 11, 13, -2, -8,-26,-28,-16, 18; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10, 7,-10, 10,-23; /M: SY='Y'; M=-17,-15, 20,-19,-19, 1,-28, 22,-17,-17,-11, -7,-13,-31,-12,-14,-14,-12,-15,-11, 29,-19; /M: SY='P'; M=-11,-11,-36, -6, 7,-33,-20, 0,-21, -3,-26,-11,-11, 46, 16, -8, -6,-11,-30,-26,-19, 8; /M: SY='D'; M=-13, 30,-30, 43, 7,-37, 17, -7,-40, -7,-30,-27, 13,-13, -7,-13, 0,-13,-30,-33,-23, 0; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -7,-13,-17,-10,-23,-17, 7,-10, -3,-10, 33, 30, -7,-37,-17, -3; /M: SY='Q'; M= 11, -2,-19, -5, 5,-28, -9, -6,-19, 2,-22,-10, 1,-10, 19, -2, 15, 2,-15,-27,-16, 12; /M: SY='T'; M= -4, 17,-14, 3, -6,-14,-11, -7,-14, -6,-19,-14, 26,-14, -6, -6, 16, 29,-13,-34,-14, -6; /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20, 6,-26,-11, 20,-21, 37, 37,-26,-26,-11,-16,-26,-10, 10,-20, 0,-16; /M: SY='F'; M=-11,-30,-18,-33,-26, 31,-30,-22, 16,-28, 27, 11,-27,-30,-29,-20,-22, -8, 16,-12, 8,-26; /M: SY='R'; M=-10, -4,-25, -4, 3,-23,-15, -6,-28, 27,-26,-12, 2,-14, 8, 38, 2, -3,-18,-25,-12, 3; /M: SY='G'; M= -8, 1,-33, 9, -4,-32, 21,-15,-33,-12,-30,-22, -2, 19,-12,-18, -3,-14,-30,-28,-28,-10; /M: SY='E'; M=-10, 0,-30, 6, 39,-23,-25, -7,-11, 0,-10,-10, -5, -5, 10, -7, -5,-10,-16,-28,-15, 23; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='M'; M=-10,-12,-26,-16, 4,-10,-25, -7, 10, -8, 7, 24,-13,-13, 2,-11,-13,-10, 1,-23, -7, 2; /M: SY='T'; M= -4,-15,-18,-22,-17, 4,-23,-21, 9,-20, -3, -1, -7,-16,-15,-18, 6, 13, 7,-23, -3,-17; /M: SY='F'; M=-20,-23,-23,-30,-20, 47,-27,-13,-10,-10, 0, -3,-13,-27,-23, 10,-17,-10, -7, 0, 17,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 4,-30, 9, 31,-30,-20, -6,-30, 33,-26,-14, 0, -6, 14, 17, -6,-10,-24,-24,-14, 23; /M: SY='K'; M=-10,-10,-27,-10, 0,-17,-23,-13,-13, 23, -3, 0,-10,-17, 0, 13,-17,-10,-10,-20, -7, 0; /M: SY='D'; M=-17, 27,-33, 43, 13,-37,-13, -7,-33, -3,-30,-27, 7, 23, -3,-13, -3,-10,-30,-37,-23, 3; /M: SY='A'; M= 30, -3,-17, -7, 13,-23, -7,-13,-17, -3,-13,-13, -7, -7, 0,-13, 7, -3,-10,-23,-20, 7; /M: SY='P'; M=-13, 3,-37, 17, 7,-33,-17,-13,-27, -7,-30,-23, -7, 57, -7,-17, -7,-10,-30,-33,-27, -3; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30, 7, 0,-17, 3, 0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23; /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-35,-25, 3,-33,-22, 35,-27, 30, 27,-23,-23,-17,-23,-23,-10, 20,-20, 0,-23; /M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30, 0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='C'; M= -3,-27, 33,-30,-30, -7,-30,-30, 10,-23, 0, 0,-27,-33,-30,-23,-10, -3, 30,-37,-17,-30; /M: SY='I'; M=-11,-20,-25,-24,-20, -7,-31, 13, 19,-21, 4, 11,-12,-22,-12,-18,-14,-11, 15,-26, 4,-20; /M: SY='K'; M= -4, 0,-21, -3, 5,-25,-17, -8,-21, 15,-22, -9, 1,-10, 15, 8, 8, 11,-15,-26,-11, 10; /M: SY='S'; M= 2, -8,-15, -5, 4,-16,-15,-14, -6, -9,-14,-10, -6,-14, -5,-11, 14, 6, 5,-34,-17, -1; /M: SY='G'; M= -7, 10,-30, 17, -7,-33, 43,-13,-40,-13,-30,-23, 7,-17,-13,-17, 0,-17,-30,-27,-27,-10; /M: SY='D'; M=-15, 31,-25, 46, 8,-30,-15, -7,-23, -5,-20,-20, 8,-15, -7,-12, -2, -8,-11,-38,-18, 0; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-27, 24, 17,-26,-26,-23,-24,-19, -7, 32,-23, -3,-28; /M: SY='T'; M= -7, -7,-17,-13,-13, 3,-23, -7, -7,-10, -7, -7, -7,-17,-10,-10, 7, 30, -3,-10, 20,-13; /M: SY='C'; M= 8,-21, 46,-28,-25,-13,-23,-28, -5,-22, -8, -8,-21,-30,-25,-24, -5, -4, 12,-36,-21,-25; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 23, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 37,-27, -7,-27; /M: SY='C'; M= -6,-27, 28,-33,-30, -7,-33,-30, 15,-26, 3, 3,-24,-31,-27,-26,-13, -6, 25,-34,-14,-30; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M= 8, 14,-17, 16, 2,-24, -8,-12,-22, -7,-20,-18, 6,-10, -5,-13, 14, 12,-12,-32,-18, -2; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3, 7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10, 0,-13, 10, 43,-10,-10,-20,-20,-10, 7; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3, 7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10, 0,-13, 10, 43,-10,-10,-20,-20,-10, 7; /M: SY='A'; M= 25, -6,-17,-11, -2,-23, -7,-16,-18, 10,-19,-11, -4,-10, -2, -2, 7, -1, -8,-22,-17, -2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= -3, -7,-30, -7, -7,-33, 40,-10,-33,-10,-27,-13, 0,-17, 7,-10, 0,-17,-30,-20,-23, 0; /M: SY='T'; M= -7, 17,-17, 17, 0,-20,-17,-13,-20, -7,-17,-17, 7,-10, -7,-10, 13, 30,-10,-33,-13, -3; /M: SY='T'; M= -3,-10,-13,-17,-13, -3,-23,-20, 0,-17, 10, 0,-10,-17,-13,-13, 3, 30, 3,-27, -7,-13; /M: SY='E'; M= -7, 7,-23, 10, 37,-23,-20, -7,-23, 3,-17,-17, 0, -3, 10, -3, 7, 10,-20,-30,-17, 23; /M: SY='M'; M= -7,-17,-23,-23,-20,-10, 10, -7, 0,-13, 3, 33,-13,-20, -7,-13,-13,-13, -3,-20,-10,-13; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 33,-30,-20, 13,-30, 37, 13,-27,-30,-27,-20,-27,-10, 7,-10, 10,-23; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 27, -5, -7,-10, -5,-13, 0,-12, -8, -7,-10, -8, -3, -7, -5,-12, 12, 3, -2,-17,-13, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3, 7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10, 0,-13, 10, 41,-10,-10,-20,-20,-10, 7; /M: SY='A'; M= 33,-10,-17,-17,-13,-23, 23,-20,-20,-13,-17,-13, -7,-13,-13,-20, 7, -7,-10,-20,-23,-13; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 45,-28,-10, 0,-12, 10, 40,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='K'; M=-10, 1,-30, 2, 19,-33,-20, -2,-27, 32,-26, -8, 0, -9, 28, 20, -6,-10,-24,-21,-11, 23; /M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27, 3,-30,-27, 27,-23, 23, 13,-30,-30,-27,-20,-17, -3, 37,-27, -7,-27; /M: SY='P'; M=-10,-13,-37, -7, 3,-30,-20,-17,-23, 10,-30,-17,-13, 57, -3, -3,-10,-10,-27,-27,-23, -3; /M: SY='V'; M= -4,-13,-18,-16,-12,-12,-25,-21, 2, 5, -7, -1,-12,-18,-11, -2, -4, 8, 13,-26, -9,-12; /M: SY='D'; M= 0, 8,-17, 11, -5,-20,-13,-13, -8, -9,-14,-12, 2,-18,-11,-14, 5, 0, 3,-34,-17, -8; /M: SY='E'; M= -7, 14,-21, 10, 22,-21,-15, -4,-21, 1,-19,-17, 14, -8, 5, -3, 9, 12,-20,-32,-17, 14; /M: SY='Y'; M= 3,-17,-23,-20,-17, 13,-20, 7, -3,-10, -3, -3,-17,-23,-10,-13,-10, -7, -7, 13, 47,-17; /M: SY='I'; M= 10,-23,-23,-33,-23, -7,-27,-27, 30,-23, 10, 10,-17,-17,-17,-27,-10, -7, 20,-20, -7,-23; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13, 3,-10, -7,-10, 27, 40, -3,-33,-13, -7; /M: SY='C'; M= -3, -7, 33,-17,-17,-13,-23,-23,-17,-17,-13,-13, -7,-20,-17,-17, 10, 30, -3,-37,-17,-17; /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20, 23,-30, 7, 7,-17, 17, 7,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -3, 13, 53,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='C'; M=-10,-16, 37,-20,-14,-16,-27,-21,-18, -3, -7, -7,-16,-28,-14, -8,-15,-10, -9,-33,-16,-14; /M: SY='F'; M= 12, -5,-16,-17,-14, 13,-10,-13, -9,-14, -8, -9, 3,-19,-18,-15, 0, -3, -7,-15, -3,-14; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30, 7, 0,-17, 3, 0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-33,-26, 4,-33,-26, 32,-28, 30, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 26,-22, -2,-26; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 13, 47,-33,-20, 3,-27, 10,-20,-13, 0, -3, 33, 3, 0,-10,-30,-27,-17, 40; /M: SY='E'; M=-13, 23,-30, 37, 47,-33,-17, 0,-33, 7,-23,-23, 7, -3, 13, -3, 0,-10,-30,-33,-20, 30; /M: SY='A'; M= 33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23, 3,-13, -3, -3,-17,-17,-17,-20, 3, 0, 17,-23,-17,-17; /M: SY='K'; M= -7, 0,-23, -3, 3,-23,-20,-13,-23, 30,-23,-10, 0,-10, 3, 17, 0, 10,-13,-23,-10, 3; /M: SY='T'; M= -3, -7,-20,-10, -7,-17,-20,-20,-13,-10,-17,-13, -7, 23,-10,-13, 10, 30,-10,-30,-17,-10; /M: SY='A'; M= 18,-21,-13,-26,-18, -5,-17,-22, 10,-19, 15, 5,-21,-21,-18,-20, -8, -3, 15,-22,-11,-18; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-13, 20,-23, 40, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='K'; M= -8, -1,-23, -5, 2,-22,-20,-12,-23, 27,-22,-10, 0,-11, 3, 23, 0, 10,-13,-23,-10, 2; /M: SY='K'; M= 10, -3,-23, -7, 3,-27,-13,-13,-23, 30,-23,-10, -3,-10, 3, 13, -3, -7,-13,-20,-13, 3; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='K'; M=-10, -7,-33, -3, 7,-30,-20,-13,-27, 30,-30,-13, -7, 23, 3, 13,-10,-10,-23,-23,-17, 3; /M: SY='S'; M= 0, 17,-17, 23, 7,-27, -3, -7,-27, -7,-30,-23, 13,-10, 0,-10, 27, 10,-17,-40,-20, 3; /M: SY='A'; M= 22,-20,-17,-28,-20,-10,-18,-25, 16,-18, 3, 3,-16,-16,-16,-23, -3, -3, 18,-21,-12,-20; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27, 63,-30, -7, 0,-23, 7, 0,-20,-30,-30,-17,-20,-10, -3, 17, 47,-27; /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20, 23,-30, 7, 7,-17, 17, 7,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -3, 13, 53,-20; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-30, 0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30; /M: SY='L'; M=-10,-20,-23,-20,-10, -3,-27,-17, 3, -3, 23, 10,-20,-23,-10, -3,-23,-10, 0,-20, -3,-10; /M: SY='P'; M= -7,-13,-30,-10, -3,-23,-20,-20,-17,-10,-23,-17,-13, 57,-10,-17, 0, 10,-20,-30,-23,-10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -7,-14,-23,-14, 1,-13,-28,-19, 9, -4, -2, 1,-15,-16, -8, -9,-10, -7, 12,-26,-10, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of true positive hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Macro |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
10 sequences
R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), R1A_BC279 (P0C6F5), R1A_BCHK3 (P0C6F8), R1A_BCRP3 (P0C6T7), R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2 (P0DTC1)» more
|
| PDB [Detailed view] |
8 PDB
2W2G; 2WCT; 6YXJ; 8CMF; 8GQC; 8HBL; 8UFL; 8UFM |