PROSITE entry PS51941
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BCOV_NSP3C_M |
| Accession [info] | PS51941 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
02-DEC-2020 CREATED;
02-DEC-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51940 |
| Associated ProRule [info] | PRU00490 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Betacoronavirus Nsp3c-M domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2286134; R2=0.0169392; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=577; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=253; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M=-10, -8,-24, -9, -9,-12,-26,-10, 7,-16, 7, 4,-10,-18, -3,-14,-10, -2, 2,-25, -5, -7; /M: SY='L'; M= -2,-19,-19,-20,-19, -9, 4,-20, -1,-21, 5, 2,-15,-24,-18,-18, -6, -6, 5,-25,-14,-19; /M: SY='G'; M= -9, -5,-26, -1,-11,-15, 9,-16,-14,-20, 5, -5, -9,-22,-16,-18,-13,-13,-13,-24,-15,-13; /M: SY='T'; M= 0,-11,-10,-18,-18, -6,-24,-24, 5,-14, -2, -2,-11,-18,-18,-14, 9, 31, 19,-30,-10,-18; /M: SY='V'; M= -9,-27,-17,-29,-27, 20,-30,-14, 17,-19, 7, 6,-26,-30,-26,-17,-14, -4, 25, -7, 22,-27; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='W'; M=-18,-26,-33,-30,-22, 17,-23, 3, -6,-17, -4, 7,-23,-26,-13,-14,-26,-18,-14, 49, 29,-17; /M: SY='N'; M= -7, 24,-22, 23, 20,-26, -7, 1,-26, 1,-27,-21, 26,-11, 6, -4, 12, 0,-26,-37,-20, 13; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='W'; M=-15,-33,-29,-35,-25, 26,-27,-23, 4,-27, 21, 4,-31,-30,-24,-20,-31,-16, -4, 35, 15,-22; /M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8, 0,-20,-16, -2,-28, 21,-22,-12, 2,-18, 8, 52, 1, -3,-18,-24,-12, 0; /M: SY='G'; M= 8, -3,-26, -2, 10,-28, 23,-13,-30, -7,-22,-18, -2,-11, -4,-13, 2,-12,-23,-23,-24, 3; /M: SY='M'; M= 0,-17,-18,-27,-18, -4,-20,-10, 15,-13, 11, 34,-15,-17, -6,-14, -9, 1, 10,-22, -4,-13; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-33,-27, 3,-33,-27, 32,-26, 27, 16,-27,-27,-24,-23,-20, -6, 31,-24, -4,-27; /M: SY='R'; M= 6, 1,-21, -7, -3,-20, -9, -5,-21, 10,-19,-12, 10,-17, 1, 23, 1, -4,-15,-24,-16, -3; /M: SY='H'; M=-14, -1,-23, -8, -7, 2,-20, 27,-19, -4,-15, -6, 7,-19, -6, -2, -5, -3,-17,-21, 8, -7; /M: SY='A'; M= 39,-10,-14,-18,-12,-22, 16,-20,-17,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20, 8, -4, -7,-20,-22,-12; /M: SY='K'; M=-10, 3,-30, 7, 27,-30,-20, -7,-30, 36,-27,-13, 0, -7, 13, 20, -7,-10,-23,-23,-13, 20; /M: SY='E'; M= -9, 19,-26, 25, 37,-29,-13, 0,-29, 4,-24,-21, 13, -6, 11, -3, 7, -4,-27,-34,-20, 24; /M: SY='Y'; M=-11,-10,-22,-15,-11, 10,-24, -6,-10, 1, -9, -6, -9,-19,-10, -2, -4, 11, -7, -4, 22,-11; /M: SY='G'; M= -7,-10,-30,-10,-13,-27, 39,-13,-37, -3,-27,-17, 0,-20,-10, 11, -3,-17,-27,-20,-23,-13; /M: SY='F'; M=-14,-20,-23,-24,-14, 27,-27,-17, -6, -3, 5, 1,-15,-23,-18, -3,-19,-10, -5, -7, 10,-14; /M: SY='L'; M= -6,-17,-16,-21,-16, 1,-26,-20, 7,-21, 24, 7,-17,-21,-16,-16, -8, 16, 6,-24, -4,-16; /M: SY='M'; M= -9,-24, 19,-32,-27, -6,-29,-20, 14,-22, 7, 21,-21,-27,-17,-22,-16, -9, 15,-30,-10,-23; /M: SY='P'; M=-14,-25,-30,-24,-14, 20,-25,-20, -9,-20, -7, -9,-21, 30,-24,-20,-16,-10,-14,-12, -2,-19; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='C'; M= -8,-22, 91,-30,-30,-16,-30,-30,-17,-28,-13,-13,-22,-38,-30,-28,-10, -8, 3,-46,-26,-30; /M: SY='T'; M= -5,-15,-17,-24,-19, -4,-26,-19, 15,-16, 7, 14,-13,-17,-12,-16, -2, 17, 14,-25, -5,-17; /M: SY='D'; M=-18, 40,-30, 58, 30,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 15, -8, 5, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 17; /M: SY='Y'; M=-10, -9,-22,-13,-13, 2,-23, 1, 1, -8, -6, -1, -6,-24, -4, -8, -7, 0, 0, -8, 22,-11; /M: SY='S'; M= -3, -6,-24, -4, 2,-24,-11,-10,-23, 7,-28,-17, 0, 11, 1, 9, 12, 3,-18,-31,-19, -1; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='N'; M=-12, 0,-23,-13,-16, 10,-20,-10, 7,-17, -2, -2, 14,-23,-16,-14, -8, -6, -4,-22, -2,-16; /M: SY='M'; M= 2,-20,-15,-26,-20, -2,-22,-18, 14,-17, 16, 19,-20,-22,-15,-16,-10, 3, 17,-24, -7,-17; /M: SY='K'; M= 4, -2,-23, -4, 5,-27,-13,-12,-25, 29,-26,-12, 0,-10, 5, 14, 2, -3,-15,-23,-13, 5; /M: SY='V'; M= -4,-20,-13,-25,-22, 10,-27,-24, 10,-19, 8, 3,-18,-23,-23,-17, -4, 14, 20,-23, -3,-22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20, 0,-23; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M=-11, -3,-23, -3, 7,-22,-16, 8,-21, 18,-17, -4, 1,-11, 22, 28, -5, -8,-19,-16, -6, 12; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='R'; M=-11, 1,-25, -3, -2,-22, -5, -7,-27, 17,-23,-13, 9,-16, 1, 27, -1, -1,-20,-24,-14, -2; /M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4, 6,-26,-20, -6,-30, 42,-26,-10, 0,-14, 10, 47,-10,-10,-20,-20,-10, 6; /M: SY='Y'; M=-11,-18,-28,-20,-22, 15, 13, -6,-17,-19,-11, -9,-11,-26,-21,-17,-11,-14,-16, 4, 21,-22; /M: SY='V'; M= -1,-13,-17,-13,-10,-15,-20,-19, -2, 6,-13, -4,-11,-19,-10, -1, 1, 1, 13,-29,-12,-10; /M: SY='D'; M=-11, 14,-32, 25, 2,-34, 15,-11,-36, -9,-30,-24, 4, 9, -9,-16, -2,-13,-30,-31,-26, -5; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='I'; M= -8,-17,-19,-22,-17, 4,-25,-13, 18,-17, 12, 8,-14,-17,-13,-16,-11, 1, 10,-10, 10,-17; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='T'; M= -3, 0,-15, -4, -1,-15,-16,-12,-15, 13,-15, -8, 0, -8, -1, 6, 5, 18, -7,-20, -8, -1; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='K'; M= -7,-10,-21,-13, -6,-13,-21,-15, 2, 12, -7, 1, -8,-12, -4, 4,-10, -7, 4,-17, -5, -6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 13,-33,-20, -3,-27, 36,-27, -7, 0,-10, 27, 23, -7,-10,-23,-20,-10, 20; /M: SY='E'; M=-10, -3,-26, -2, 24, -7,-25,-10,-11, -5, -8,-10, -6, -9, 1, -9, -3, -2,-12,-23, -8, 12; /M: SY='G'; M= -4,-10,-29,-10, -9,-27, 30,-11,-25,-13,-15, -8, -4,-19, 3,-11, -4,-16,-24,-20,-20, -3; /M: SY='T'; M= -5,-17,-17,-24,-19, -2,-28,-23, 15,-20, 13, 6,-15,-19,-17,-18, -4, 17, 14,-25, -5,-19; /M: SY='V'; M= -4,-30,-12,-32,-30, 18,-30,-28, 23,-22, 10, 8,-28,-30,-32,-20,-12, -2, 39,-21, -1,-30; /M: SY='D'; M=-13, 39,-26, 54, 16,-36, -8, -2,-36, -2,-30,-28, 18,-10, 0,-10, 9, -3,-26,-40,-20, 8; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='Y'; M= -5, -7,-13, -7, -7, 6,-10, 5, -4, -6, -7, -4, -5,-13, -3, -6, 2, 1, -6, 1, 23, -7; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 0,-26,-14,-27,-26, 5,-27,-18, 19,-17, 6, 6,-26,-28,-24,-18,-10, -2, 32,-16, 9,-26; /M: SY='R'; M=-10, -1,-27, 1, 18,-27,-17, -1,-27, 19,-23,-12, 2,-11, 18, 28, 1, -5,-22,-25,-14, 16; /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-26, 58,-30, -3, 0,-21, 6, 0,-20,-30,-27,-16,-20,-10, -4, 19, 52,-26; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 10, 0,-15, 2, 0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22; /M: SY='F'; M=-11,-24, -2,-29,-25, 21, -8,-21, -8,-28, 8, -2,-18,-29,-28,-21,-17,-12, -5,-14, -1,-25; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15, 5,-10, -5,-10, 30, 35, -5,-35,-15, -5; /M: SY='S'; M= 9, -4,-14, -5, -2,-20, -4, -9,-21, -1,-25,-16, 5,-12, 1, 6, 24, 10,-11,-32,-18, -2; /M: SY='K'; M=-14, 10,-30, 14, 11,-31,-18, -6,-32, 36,-28,-14, 4,-12, 8, 27, -8,-10,-22,-24,-12, 8; /M: SY='D'; M=-13, 24,-28, 34, 25,-32,-16, -4,-32, 13,-26,-21, 9, -8, 6, 1, 0, -4,-25,-32,-17, 15; /M: SY='P'; M= 2,-14,-28,-12, -4,-24,-17,-20,-16,-10,-22,-16,-14, 50,-10,-18, 0, 6,-18,-28,-24,-10; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-23, 23,-27, 36, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 24,-23, -3,-23; /M: SY='A'; M= 10, 4,-17, 1, -3,-20,-12, 10,-19, -9,-15,-11, 2,-12, -4,-11, 7, 8,-11,-28, -8, -5; /M: SY='D'; M= -7, 24,-23, 35, 22,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-24, 12, -8, 4, -8, 14, 0,-23,-38,-20, 13; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-35,-29, 1,-35,-29, 40,-26, 19, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 36,-24, -4,-29; /M: SY='I'; M= -6,-23,-24,-30,-22, -3,-30,-24, 30,-26, 13, 11,-15,-19,-16,-24, -8, -3, 18,-24, -4,-22; /M: SY='T'; M= 3, 2,-18, -5, 0,-21,-15,-10,-17, 7,-18, -9, 4,-11, 6, 1, 8, 15,-12,-26,-12, 3; /M: SY='K'; M= 6, 8,-22, 9, 6,-29,-12, -9,-23, 10,-21,-13, 2,-10, 7, 0, 2, -1,-16,-25,-15, 7; /M: SY='L'; M= 16,-21,-16,-26,-16, -3,-17,-20, 7,-21, 24, 7,-21,-21,-16,-20,-13, -6, 6,-20, -9,-16; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 7, 0,-19, 1, -2,-23, 5,-13,-23, -3,-22,-16, 3,-13, -4, -8, 14, 2,-14,-30,-19, -3; /M: SY='C'; M= -7,-23, 22,-26,-20, -3,-26,-21, 0,-27, 18, 3,-21,-30,-20,-21,-14, -6, 1,-32,-12,-20; /M: SY='N'; M= -5, 5,-23, -1, -8,-21, 7, -9,-18, -2,-24,-14, 15,-10, -8, -6, 3, -5,-15,-31,-20, -8; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= -8, 1,-17, 5, 21,-15,-11, 0,-17, 10,-11, -9, 0, -4, 9, 16, -2, -6,-15,-15, -9, 14; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= -5,-14,-33,-10,-10,-28, 19,-20,-28,-14,-28,-19, -9, 33,-14,-19, -3, -9,-27,-26,-28,-14; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20, 0,-24; /M: SY='V'; M= -7,-27, 20,-34,-30, -6,-34,-30, 20,-27, 5, 5,-23,-29,-26,-27,-14, -7, 25,-32,-12,-30; /M: SY='T'; M= 14, -7,-12,-16,-11,-12,-11,-14, -5,-10, -6, 4, -6,-12, -6,-13, 11, 18, 1,-26,-12, -9; /M: SY='M'; M=-10,-22,-22,-32,-22, 0,-24, -7, 27,-14, 20, 51,-20,-20, -4,-14,-20,-10, 14,-20, 0,-14; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-38,-28, 33,-34,-24, 24,-30, 24, 12,-22,-26,-28,-24,-22,-10, 14, -9, 11,-28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 11, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='T'; M= 1, -7,-10,-13,-13, -9,-19,-21, -3,-12, -8, -7, -5,-14,-13,-12, 16, 34, 10,-31,-11,-13; /M: SY='H'; M=-18, 9,-28, 4, 0,-20,-16, 80,-28, -8,-22, -4, 21,-20, 8, 0, -6,-16,-30,-32, 11, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-11,-23,-22,-25,-12, 9,-28,-13, 8,-21, 29, 13,-22,-26, -5,-13,-22,-10, 0,-16, 2, -8; /M: SY='B'; M=-12, 35,-22, 35, 6,-26, -9, -1,-26, -2,-26,-22, 29,-13, -2, -7, 8, 7,-23,-38,-18, 2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 21, -6,-20, -9, 11,-20,-13,-15, -8, -6, -9, -9, -8, -8, -1,-15, 2, -5, -6,-23,-17, 4; /M: SY='Q'; M= -8, -3,-26, 0, 23,-28,-22, -2,-12, 3,-13, -5, -7,-11, 26, 0, -2, -8,-12,-26,-13, 24; /M: SY='A'; M= 35, -6,-10,-12, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 21, 8, -4,-28,-20, -6; /M: SY='G'; M= 28,-10,-19,-16,-14,-24, 30,-20,-23,-14,-19,-14, -6,-14,-14,-20, 6, -9,-13,-20,-24,-14; /M: SY='R'; M= -8, -4,-21, -7, -4,-18,-16, -5,-12, 6,-16, -7, 4,-19, 5, 19, 2, -2, -6,-28,-13, -1; /M: SY='C'; M= -7,-14, 14,-17,-14, -7,-22, -8,-10,-14,-13, -8,-12,-25, -6,-14, 0, -2, -4,-21, 5,-11; /M: SY='M'; M= -6,-24,-16,-30,-24, 0,-24,-13, 24,-14, 16, 38,-24,-24,-13,-14,-16, -6, 27,-24, -4,-19; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 33,-21,-10, 0,-19, 10, 65,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='S'; M= -2, -4,-23, -4, 0,-27, 7, -8,-27, 5,-27,-14, 3,-14, 8, 8, 11, -2,-20,-27,-18, 3; /M: SY='L'; M= -7,-30,-18,-31,-24, 6,-31,-24, 27,-27, 34, 17,-29,-29,-23,-21,-23, -7, 25,-23, -3,-24; /M: SY='K'; M= -7, 6,-21, -1, 1,-21,-17,-10,-21, 21,-23,-11, 9,-12, 1, 13, 4, 13,-14,-27,-11, 1; /M: SY='V'; M= 12,-25,-10,-28,-25, -5,-23,-28, 20,-18, 5, 5,-25,-25,-25,-20, -5, 0, 38,-28,-12,-25; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Y'; M= 4,-12,-23,-16,-12, 2,-17, 24,-10,-10, -8, -3,-10,-21, -6,-11, -7, -9,-11, -1, 32,-12; /M: SY='V'; M= 0,-20,-11,-24,-24, -3,-27,-27, 18,-17, 4, 4,-20,-23,-23,-17, -1, 16, 33,-30,-10,-24; /M: SY='C'; M= -4,-26, 46,-30,-30, -9,-30,-30, 4,-24, -3, -3,-26,-34,-30,-24,-10, -4, 24,-39,-19,-30; /M: SY='L'; M= -1,-20,-14,-20,-15, -3,-20,-19, 9,-21, 14, 4,-16,-23,-15,-17, -2, 3, 12,-29, -9,-15; /M: SY='V'; M= -4,-30,-14,-30,-26, 4,-30,-26, 26,-24, 27, 14,-30,-30,-26,-20,-19, -4, 33,-26, -6,-26; /M: SY='A'; M= 23, -9,-17,-11, -4,-22, -4,-17,-16,-10,-21,-16, -5, 12, -7,-17, 16, 5,-10,-29,-22, -7; /M: SY='S'; M= 7, 6,-11, 3, 0,-20, 0, -7,-20, -9,-30,-20, 17,-11, 0, -9, 36, 17,-13,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M=-10, -5,-33, 1, 18,-30,-20,-11,-27, 20,-28,-16, -7, 27, 5, 6, -8,-10,-26,-26,-19, 10; /M: SY='D'; M=-10, 27,-26, 39, 28,-33,-11, -2,-33, 1,-27,-25, 12, -7, 6, -7, 9, -3,-26,-37,-20, 17; /M: SY='Q'; M= 15, -3,-19, -7, 5,-29, -9, -5,-17, -1,-19, -8, -1,-10, 23, -5, 12, 0,-15,-24,-16, 14; /M: SY='V'; M= -3,-24,-16,-24,-17, -4,-30,-26, 24,-17, 7, 7,-24,-24,-21,-19,-10, -3, 35,-28,-10,-20; /M: SY='P'; M= 2,-12,-25,-11, -5,-22,-17,-20,-15,-10,-20,-15,-12, 41,-10,-17, 3, 12,-15,-29,-22,-10; /M: SY='I'; M= 0,-21,-21,-29,-21, -3,-28,-24, 23,-23, 16, 10,-17,-19,-17,-22,-10, 4, 15,-22, -5,-21; /M: SY='Y'; M=-16,-23,-26,-24,-20, 20,-28, 6, 9,-16, 17, 15,-23,-28,-11,-13,-23,-10, -1, 8, 45,-18; /M: SY='N'; M=-12, 20,-22, 6, -3,-17, -7, 6,-16, 5,-20, -6, 35,-20, 2, 14, 1, -4,-22,-33,-15, -1; /M: SY='G'; M= 16, -6,-17, -8, -9,-23, 24,-16,-25,-13,-26,-18, 2,-13, -9,-16, 20, 2,-15,-29,-23, -9; /M: SY='Y'; M=-19, 4,-30, 12, 3, 1,-23, 11,-16, -4,-12,-12, -6,-20, -3, -9,-11,-10,-19, 1, 37, -3; /M: SY='L'; M=-11,-18,-19,-18,-19, 15,-27,-20, 10,-23, 18, 5,-20,-27,-24,-19,-18, -7, 13,-19, 1,-21; /M: SY='T'; M= 12, 2,-12, -9,-11,-14,-11,-15, -6, -9,-12, -9, 6,-15,-11,-12, 10, 17, 1,-29,-15,-11; /M: SY='S'; M= 0,-11,-20,-12,-12,-18, 3,-18, -9, -8,-17, -8, -4,-16,-10,-11, 8, -1, -2,-28,-16,-12; /M: SY='Q'; M= -1,-11,-17,-11, -4,-17,-17,-10, -3, -9, -6, -2, -8,-17, 8, -8, 7, 3, 1,-29,-12, 2; /M: SY='T'; M= -3, -1,-14, -9,-10, 6,-13,-12,-12,-13,-15,-12, 8,-16,-12,-11, 15, 19, -8,-25, -5,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 20 in 20 different sequences |
| Number of true positive hits | 20 in 20 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Macro |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
20 sequences
R1AB_BC133 (P0C6W1), R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCHK4 (P0C6W3), R1AB_BCHK5 (P0C6W4), R1AB_BCHK9 (P0C6W5), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_MERS1 (K9N7C7), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), R1A_BC133 (P0C6F7), R1A_BC279 (P0C6F5), R1A_BCHK3 (P0C6F8), R1A_BCHK4 (P0C6T4), R1A_BCHK5 (P0C6T5), R1A_BCHK9 (P0C6T6), R1A_BCRP3 (P0C6T7), R1A_MERS1 (K9N638), R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2 (P0DTC1)» more
|
| PDB [Detailed view] |
17 PDB
2JZD; 2JZE; 2JZF; 2KQV; 2KQW; 2RNK; 2W2G; 2WCT; 6ZON; 6ZP4; 7XC3; 7XC4; 8GQC; 8HBL; 8PPL; 8UFL; 8UFM » more |