PROSITE entry PS51941

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51941
Entry name [info]	BCOV_NSP3C_M
Accession [info]	PS51941
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	02-DEC-2020 CREATED; 02-DEC-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51940
Associated ProRule [info]	PRU00490

Name and characterization of the entry

Description [info]

Betacoronavirus Nsp3c-M domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2286134; R2=0.0169392; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=577; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=253; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M=-10, -8,-24, -9, -9,-12,-26,-10,  7,-16,  7,  4,-10,-18, -3,-14,-10, -2,  2,-25, -5, -7;
/M: SY='L';  M= -2,-19,-19,-20,-19, -9,  4,-20, -1,-21,  5,  2,-15,-24,-18,-18, -6, -6,  5,-25,-14,-19;
/M: SY='G';  M= -9, -5,-26, -1,-11,-15,  9,-16,-14,-20,  5, -5, -9,-22,-16,-18,-13,-13,-13,-24,-15,-13;
/M: SY='T';  M=  0,-11,-10,-18,-18, -6,-24,-24,  5,-14, -2, -2,-11,-18,-18,-14,  9, 31, 19,-30,-10,-18;
/M: SY='V';  M= -9,-27,-17,-29,-27, 20,-30,-14, 17,-19,  7,  6,-26,-30,-26,-17,-14, -4, 25, -7, 22,-27;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='W';  M=-18,-26,-33,-30,-22, 17,-23,  3, -6,-17, -4,  7,-23,-26,-13,-14,-26,-18,-14, 49, 29,-17;
/M: SY='N';  M= -7, 24,-22, 23, 20,-26, -7,  1,-26,  1,-27,-21, 26,-11,  6, -4, 12,  0,-26,-37,-20, 13;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='W';  M=-15,-33,-29,-35,-25, 26,-27,-23,  4,-27, 21,  4,-31,-30,-24,-20,-31,-16, -4, 35, 15,-22;
/M: SY='R';  M=-13, -8,-26, -8,  0,-20,-16, -2,-28, 21,-22,-12,  2,-18,  8, 52,  1, -3,-18,-24,-12,  0;
/M: SY='G';  M=  8, -3,-26, -2, 10,-28, 23,-13,-30, -7,-22,-18, -2,-11, -4,-13,  2,-12,-23,-23,-24,  3;
/M: SY='M';  M=  0,-17,-18,-27,-18, -4,-20,-10, 15,-13, 11, 34,-15,-17, -6,-14, -9,  1, 10,-22, -4,-13;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-19,-33,-27,  3,-33,-27, 32,-26, 27, 16,-27,-27,-24,-23,-20, -6, 31,-24, -4,-27;
/M: SY='R';  M=  6,  1,-21, -7, -3,-20, -9, -5,-21, 10,-19,-12, 10,-17,  1, 23,  1, -4,-15,-24,-16, -3;
/M: SY='H';  M=-14, -1,-23, -8, -7,  2,-20, 27,-19, -4,-15, -6,  7,-19, -6, -2, -5, -3,-17,-21,  8, -7;
/M: SY='A';  M= 39,-10,-14,-18,-12,-22, 16,-20,-17,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20,  8, -4, -7,-20,-22,-12;
/M: SY='K';  M=-10,  3,-30,  7, 27,-30,-20, -7,-30, 36,-27,-13,  0, -7, 13, 20, -7,-10,-23,-23,-13, 20;
/M: SY='E';  M= -9, 19,-26, 25, 37,-29,-13,  0,-29,  4,-24,-21, 13, -6, 11, -3,  7, -4,-27,-34,-20, 24;
/M: SY='Y';  M=-11,-10,-22,-15,-11, 10,-24, -6,-10,  1, -9, -6, -9,-19,-10, -2, -4, 11, -7, -4, 22,-11;
/M: SY='G';  M= -7,-10,-30,-10,-13,-27, 39,-13,-37, -3,-27,-17,  0,-20,-10, 11, -3,-17,-27,-20,-23,-13;
/M: SY='F';  M=-14,-20,-23,-24,-14, 27,-27,-17, -6, -3,  5,  1,-15,-23,-18, -3,-19,-10, -5, -7, 10,-14;
/M: SY='L';  M= -6,-17,-16,-21,-16,  1,-26,-20,  7,-21, 24,  7,-17,-21,-16,-16, -8, 16,  6,-24, -4,-16;
/M: SY='M';  M= -9,-24, 19,-32,-27, -6,-29,-20, 14,-22,  7, 21,-21,-27,-17,-22,-16, -9, 15,-30,-10,-23;
/M: SY='P';  M=-14,-25,-30,-24,-14, 20,-25,-20, -9,-20, -7, -9,-21, 30,-24,-20,-16,-10,-14,-12, -2,-19;
/M: SY='I';  M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='C';  M= -8,-22, 91,-30,-30,-16,-30,-30,-17,-28,-13,-13,-22,-38,-30,-28,-10, -8,  3,-46,-26,-30;
/M: SY='T';  M= -5,-15,-17,-24,-19, -4,-26,-19, 15,-16,  7, 14,-13,-17,-12,-16, -2, 17, 14,-25, -5,-17;
/M: SY='D';  M=-18, 40,-30, 58, 30,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 15, -8,  5, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 17;
/M: SY='Y';  M=-10, -9,-22,-13,-13,  2,-23,  1,  1, -8, -6, -1, -6,-24, -4, -8, -7,  0,  0, -8, 22,-11;
/M: SY='S';  M= -3, -6,-24, -4,  2,-24,-11,-10,-23,  7,-28,-17,  0, 11,  1,  9, 12,  3,-18,-31,-19, -1;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='N';  M=-12,  0,-23,-13,-16, 10,-20,-10,  7,-17, -2, -2, 14,-23,-16,-14, -8, -6, -4,-22, -2,-16;
/M: SY='M';  M=  2,-20,-15,-26,-20, -2,-22,-18, 14,-17, 16, 19,-20,-22,-15,-16,-10,  3, 17,-24, -7,-17;
/M: SY='K';  M=  4, -2,-23, -4,  5,-27,-13,-12,-25, 29,-26,-12,  0,-10,  5, 14,  2, -3,-15,-23,-13,  5;
/M: SY='V';  M= -4,-20,-13,-25,-22, 10,-27,-24, 10,-19,  8,  3,-18,-23,-23,-17, -4, 14, 20,-23, -3,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-23, -3,  7,-22,-16,  8,-21, 18,-17, -4,  1,-11, 22, 28, -5, -8,-19,-16, -6, 12; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-11,  1,-25, -3, -2,-22, -5, -7,-27, 17,-23,-13,  9,-16,  1, 27, -1, -1,-20,-24,-14, -2;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 42,-26,-10,  0,-14, 10, 47,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='Y';  M=-11,-18,-28,-20,-22, 15, 13, -6,-17,-19,-11, -9,-11,-26,-21,-17,-11,-14,-16,  4, 21,-22;
/M: SY='V';  M= -1,-13,-17,-13,-10,-15,-20,-19, -2,  6,-13, -4,-11,-19,-10, -1,  1,  1, 13,-29,-12,-10;
/M: SY='D';  M=-11, 14,-32, 25,  2,-34, 15,-11,-36, -9,-30,-24,  4,  9, -9,-16, -2,-13,-30,-31,-26, -5;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='I';  M= -8,-17,-19,-22,-17,  4,-25,-13, 18,-17, 12,  8,-14,-17,-13,-16,-11,  1, 10,-10, 10,-17; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='T';  M= -3,  0,-15, -4, -1,-15,-16,-12,-15, 13,-15, -8,  0, -8, -1,  6,  5, 18, -7,-20, -8, -1; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='K';  M= -7,-10,-21,-13, -6,-13,-21,-15,  2, 12, -7,  1, -8,-12, -4,  4,-10, -7,  4,-17, -5, -6; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 13,-33,-20, -3,-27, 36,-27, -7,  0,-10, 27, 23, -7,-10,-23,-20,-10, 20;
/M: SY='E';  M=-10, -3,-26, -2, 24, -7,-25,-10,-11, -5, -8,-10, -6, -9,  1, -9, -3, -2,-12,-23, -8, 12;
/M: SY='G';  M= -4,-10,-29,-10, -9,-27, 30,-11,-25,-13,-15, -8, -4,-19,  3,-11, -4,-16,-24,-20,-20, -3;
/M: SY='T';  M= -5,-17,-17,-24,-19, -2,-28,-23, 15,-20, 13,  6,-15,-19,-17,-18, -4, 17, 14,-25, -5,-19;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-12,-32,-30, 18,-30,-28, 23,-22, 10,  8,-28,-30,-32,-20,-12, -2, 39,-21, -1,-30;
/M: SY='D';  M=-13, 39,-26, 54, 16,-36, -8, -2,-36, -2,-30,-28, 18,-10,  0,-10,  9, -3,-26,-40,-20,  8;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='Y';  M= -5, -7,-13, -7, -7,  6,-10,  5, -4, -6, -7, -4, -5,-13, -3, -6,  2,  1, -6,  1, 23, -7; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-26,-14,-27,-26,  5,-27,-18, 19,-17,  6,  6,-26,-28,-24,-18,-10, -2, 32,-16,  9,-26;
/M: SY='R';  M=-10, -1,-27,  1, 18,-27,-17, -1,-27, 19,-23,-12,  2,-11, 18, 28,  1, -5,-22,-25,-14, 16;
/M: SY='F';  M=-20,-26,-24,-31,-26, 58,-30, -3,  0,-21,  6,  0,-20,-30,-27,-16,-20,-10, -4, 19, 52,-26;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 10,  0,-15,  2,  0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22;
/M: SY='F';  M=-11,-24, -2,-29,-25, 21, -8,-21, -8,-28,  8, -2,-18,-29,-28,-21,-17,-12, -5,-14, -1,-25;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T';  M=  5,  0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,  5,-10, -5,-10, 30, 35, -5,-35,-15, -5;
/M: SY='S';  M=  9, -4,-14, -5, -2,-20, -4, -9,-21, -1,-25,-16,  5,-12,  1,  6, 24, 10,-11,-32,-18, -2;
/M: SY='K';  M=-14, 10,-30, 14, 11,-31,-18, -6,-32, 36,-28,-14,  4,-12,  8, 27, -8,-10,-22,-24,-12,  8;
/M: SY='D';  M=-13, 24,-28, 34, 25,-32,-16, -4,-32, 13,-26,-21,  9, -8,  6,  1,  0, -4,-25,-32,-17, 15;
/M: SY='P';  M=  2,-14,-28,-12, -4,-24,-17,-20,-16,-10,-22,-16,-14, 50,-10,-18,  0,  6,-18,-28,-24,-10;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 36, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 24,-23, -3,-23;
/M: SY='A';  M= 10,  4,-17,  1, -3,-20,-12, 10,-19, -9,-15,-11,  2,-12, -4,-11,  7,  8,-11,-28, -8, -5;
/M: SY='D';  M= -7, 24,-23, 35, 22,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-24, 12, -8,  4, -8, 14,  0,-23,-38,-20, 13;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-21,-35,-29,  1,-35,-29, 40,-26, 19, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 36,-24, -4,-29;
/M: SY='I';  M= -6,-23,-24,-30,-22, -3,-30,-24, 30,-26, 13, 11,-15,-19,-16,-24, -8, -3, 18,-24, -4,-22;
/M: SY='T';  M=  3,  2,-18, -5,  0,-21,-15,-10,-17,  7,-18, -9,  4,-11,  6,  1,  8, 15,-12,-26,-12,  3;
/M: SY='K';  M=  6,  8,-22,  9,  6,-29,-12, -9,-23, 10,-21,-13,  2,-10,  7,  0,  2, -1,-16,-25,-15,  7;
/M: SY='L';  M= 16,-21,-16,-26,-16, -3,-17,-20,  7,-21, 24,  7,-21,-21,-16,-20,-13, -6,  6,-20, -9,-16;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='S';  M=  7,  0,-19,  1, -2,-23,  5,-13,-23, -3,-22,-16,  3,-13, -4, -8, 14,  2,-14,-30,-19, -3;
/M: SY='C';  M= -7,-23, 22,-26,-20, -3,-26,-21,  0,-27, 18,  3,-21,-30,-20,-21,-14, -6,  1,-32,-12,-20;
/M: SY='N';  M= -5,  5,-23, -1, -8,-21,  7, -9,-18, -2,-24,-14, 15,-10, -8, -6,  3, -5,-15,-31,-20, -8;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -8,  1,-17,  5, 21,-15,-11,  0,-17, 10,-11, -9,  0, -4,  9, 16, -2, -6,-15,-15, -9, 14; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P';  M= -5,-14,-33,-10,-10,-28, 19,-20,-28,-14,-28,-19, -9, 33,-14,-19, -3, -9,-27,-26,-28,-14;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='V';  M= -7,-27, 20,-34,-30, -6,-34,-30, 20,-27,  5,  5,-23,-29,-26,-27,-14, -7, 25,-32,-12,-30;
/M: SY='T';  M= 14, -7,-12,-16,-11,-12,-11,-14, -5,-10, -6,  4, -6,-12, -6,-13, 11, 18,  1,-26,-12, -9;
/M: SY='M';  M=-10,-22,-22,-32,-22,  0,-24, -7, 27,-14, 20, 51,-20,-20, -4,-14,-20,-10, 14,-20,  0,-14;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-24,-38,-28, 33,-34,-24, 24,-30, 24, 12,-22,-26,-28,-24,-22,-10, 14, -9, 11,-28;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 11,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='T';  M=  1, -7,-10,-13,-13, -9,-19,-21, -3,-12, -8, -7, -5,-14,-13,-12, 16, 34, 10,-31,-11,-13;
/M: SY='H';  M=-18,  9,-28,  4,  0,-20,-16, 80,-28, -8,-22, -4, 21,-20,  8,  0, -6,-16,-30,-32, 11,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='L';  M=-11,-23,-22,-25,-12,  9,-28,-13,  8,-21, 29, 13,-22,-26, -5,-13,-22,-10,  0,-16,  2, -8;
/M: SY='B';  M=-12, 35,-22, 35,  6,-26, -9, -1,-26, -2,-26,-22, 29,-13, -2, -7,  8,  7,-23,-38,-18,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='A';  M= 21, -6,-20, -9, 11,-20,-13,-15, -8, -6, -9, -9, -8, -8, -1,-15,  2, -5, -6,-23,-17,  4;
/M: SY='Q';  M= -8, -3,-26,  0, 23,-28,-22, -2,-12,  3,-13, -5, -7,-11, 26,  0, -2, -8,-12,-26,-13, 24;
/M: SY='A';  M= 35, -6,-10,-12, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 21,  8, -4,-28,-20, -6;
/M: SY='G';  M= 28,-10,-19,-16,-14,-24, 30,-20,-23,-14,-19,-14, -6,-14,-14,-20,  6, -9,-13,-20,-24,-14;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-21, -7, -4,-18,-16, -5,-12,  6,-16, -7,  4,-19,  5, 19,  2, -2, -6,-28,-13, -1;
/M: SY='C';  M= -7,-14, 14,-17,-14, -7,-22, -8,-10,-14,-13, -8,-12,-25, -6,-14,  0, -2, -4,-21,  5,-11;
/M: SY='M';  M= -6,-24,-16,-30,-24,  0,-24,-13, 24,-14, 16, 38,-24,-24,-13,-14,-16, -6, 27,-24, -4,-19;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 33,-21,-10,  0,-19, 10, 65,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='S';  M= -2, -4,-23, -4,  0,-27,  7, -8,-27,  5,-27,-14,  3,-14,  8,  8, 11, -2,-20,-27,-18,  3;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-18,-31,-24,  6,-31,-24, 27,-27, 34, 17,-29,-29,-23,-21,-23, -7, 25,-23, -3,-24;
/M: SY='K';  M= -7,  6,-21, -1,  1,-21,-17,-10,-21, 21,-23,-11,  9,-12,  1, 13,  4, 13,-14,-27,-11,  1;
/M: SY='V';  M= 12,-25,-10,-28,-25, -5,-23,-28, 20,-18,  5,  5,-25,-25,-25,-20, -5,  0, 38,-28,-12,-25;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='Y';  M=  4,-12,-23,-16,-12,  2,-17, 24,-10,-10, -8, -3,-10,-21, -6,-11, -7, -9,-11, -1, 32,-12;
/M: SY='V';  M=  0,-20,-11,-24,-24, -3,-27,-27, 18,-17,  4,  4,-20,-23,-23,-17, -1, 16, 33,-30,-10,-24;
/M: SY='C';  M= -4,-26, 46,-30,-30, -9,-30,-30,  4,-24, -3, -3,-26,-34,-30,-24,-10, -4, 24,-39,-19,-30;
/M: SY='L';  M= -1,-20,-14,-20,-15, -3,-20,-19,  9,-21, 14,  4,-16,-23,-15,-17, -2,  3, 12,-29, -9,-15;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-14,-30,-26,  4,-30,-26, 26,-24, 27, 14,-30,-30,-26,-20,-19, -4, 33,-26, -6,-26;
/M: SY='A';  M= 23, -9,-17,-11, -4,-22, -4,-17,-16,-10,-21,-16, -5, 12, -7,-17, 16,  5,-10,-29,-22, -7;
/M: SY='S';  M=  7,  6,-11,  3,  0,-20,  0, -7,-20, -9,-30,-20, 17,-11,  0, -9, 36, 17,-13,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M=-10, -5,-33,  1, 18,-30,-20,-11,-27, 20,-28,-16, -7, 27,  5,  6, -8,-10,-26,-26,-19, 10;
/M: SY='D';  M=-10, 27,-26, 39, 28,-33,-11, -2,-33,  1,-27,-25, 12, -7,  6, -7,  9, -3,-26,-37,-20, 17;
/M: SY='Q';  M= 15, -3,-19, -7,  5,-29, -9, -5,-17, -1,-19, -8, -1,-10, 23, -5, 12,  0,-15,-24,-16, 14;
/M: SY='V';  M= -3,-24,-16,-24,-17, -4,-30,-26, 24,-17,  7,  7,-24,-24,-21,-19,-10, -3, 35,-28,-10,-20;
/M: SY='P';  M=  2,-12,-25,-11, -5,-22,-17,-20,-15,-10,-20,-15,-12, 41,-10,-17,  3, 12,-15,-29,-22,-10;
/M: SY='I';  M=  0,-21,-21,-29,-21, -3,-28,-24, 23,-23, 16, 10,-17,-19,-17,-22,-10,  4, 15,-22, -5,-21;
/M: SY='Y';  M=-16,-23,-26,-24,-20, 20,-28,  6,  9,-16, 17, 15,-23,-28,-11,-13,-23,-10, -1,  8, 45,-18;
/M: SY='N';  M=-12, 20,-22,  6, -3,-17, -7,  6,-16,  5,-20, -6, 35,-20,  2, 14,  1, -4,-22,-33,-15, -1;
/M: SY='G';  M= 16, -6,-17, -8, -9,-23, 24,-16,-25,-13,-26,-18,  2,-13, -9,-16, 20,  2,-15,-29,-23, -9;
/M: SY='Y';  M=-19,  4,-30, 12,  3,  1,-23, 11,-16, -4,-12,-12, -6,-20, -3, -9,-11,-10,-19,  1, 37, -3;
/M: SY='L';  M=-11,-18,-19,-18,-19, 15,-27,-20, 10,-23, 18,  5,-20,-27,-24,-19,-18, -7, 13,-19,  1,-21;
/M: SY='T';  M= 12,  2,-12, -9,-11,-14,-11,-15, -6, -9,-12, -9,  6,-15,-11,-12, 10, 17,  1,-29,-15,-11;
/M: SY='S';  M=  0,-11,-20,-12,-12,-18,  3,-18, -9, -8,-17, -8, -4,-16,-10,-11,  8, -1, -2,-28,-16,-12;
/M: SY='Q';  M= -1,-11,-17,-11, -4,-17,-17,-10, -3, -9, -6, -2, -8,-17,  8, -8,  7,  3,  1,-29,-12,  2;
/M: SY='T';  M= -3, -1,-14, -9,-10,  6,-13,-12,-12,-13,-15,-12,  8,-16,-12,-11, 15, 19, -8,-25, -5,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	20 in 20 different sequences
Number of true positive hits	20 in 20 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Macro
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

20 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1), R1AB_BC279  (P0C6V9), R1AB_BCHK3  (P0C6W2),

R1AB_BCHK4  (P0C6W3), R1AB_BCHK5  (P0C6W4), R1AB_BCHK9  (P0C6W5), 
R1AB_BCRP3  (P0C6W6), R1AB_MERS1  (K9N7C7), R1AB_SARS   (P0C6X7), 
R1AB_SARS2  (P0DTD1), R1A_BC133   (P0C6F7), R1A_BC279   (P0C6F5), 
R1A_BCHK3   (P0C6F8), R1A_BCHK4   (P0C6T4), R1A_BCHK5   (P0C6T5), 
R1A_BCHK9   (P0C6T6), R1A_BCRP3   (P0C6T7), R1A_MERS1   (K9N638), 
R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2   (P0DTC1)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

17 PDB

2JZD; 2JZE; 2JZF; 2KQV; 2KQW; 2RNK; 2W2G; 2WCT; 6ZON; 6ZP4; 7XC3; 7XC4;
» more