PROSITE entry PS51951

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	COV_NSP9_SSRNA_BD
Accession [info]	PS51951
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	07-APR-2021 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51951
Associated ProRule [info]	PRU01296

Name and characterization of the entry

Description [info]

Coronavirus Nsp9 single-stranded RNA (ssRNA)-binding domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=111;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=106;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8070202; R2=0.0136548; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=747; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=344; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='M';  M= -7,-19,-20,-28,-19, -3,-20, -6, 19,-13, 14, 44,-16,-19, -3,-13,-12, -6, 10,-23, -3,-12;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-26,-10,-11,-24, 21,  9,-24,-14,-20, -9, -2,-19, -5,-12, -3,-15,-17,-24,-13, -9;
/M: SY='K';  M=  0, -4,-27, -5,  1,-29,  3,-14,-30, 27,-27,-12, -1,-12,  1, 12, -5,-11,-20,-20,-16,  1;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-18,-30,-22,  6,-29,-19, 22,-25, 37, 24,-29,-29,-19,-19,-24, -8, 19,-22, -2,-21;
/M: SY='K';  M=-12, -2,-30, -2,  8,-28,-20, -8,-30, 45,-28,-10,  0,-12, 10, 40,-10,-10,-20,-20,-10,  8;
/M: SY='T';  M= -4, -3,-19, -6,  6,-20,-21,-10,-10, -3,-11, -6, -4,-11, 11, -4,  7, 17, -5,-27,-12,  8;
/M: SY='R';  M=-13, -6,-29, -7,  5,-25,-20, -2,-22, 28,-19,  1, -3,-14, 19, 33, -9,-10,-18,-20, -9, 10;
/M: SY='A';  M= 29,-11,-10,-17,-11,-16, -6,-19, -5,-12,-11, -9, -9,-14,-11,-17, 14,  5,  7,-27,-18,-11;
/M: SY='C';  M= -5,-22, 33,-29,-27, -9,-30,-29,  6,-24, -2, -2,-21,-29,-26,-24, -7,  2, 19,-36,-16,-27;
/M: SY='K';  M= -2, -2,-21, -7, -5,-18,-16,-10,-12, 14,-17, -8,  4,-18, -4, 13, -3, -4, -4,-26,-13, -5;
/M: SY='A';  M= 35, -8,-13,-15, -9,-21, 10,-18,-16,-11,-17,-13, -5,-11, -9,-18, 15,  1, -6,-24,-21, -9;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-27,  0,  7,-28, 33,-13,-34,-10,-27,-20,  2,-13, -5,-13,  6,-11,-27,-26,-26,  1;
/M: SY='G';  M=  8,-13,-19,-15,-15,-18, 10,-21,-12,-15,-15,-10, -9, -9,-16,-18,  5,  2, -1,-27,-20,-16;
/M: SY='D';  M=-14, 36,-24, 48, 12,-32,-13, -6,-32, -3,-24,-24, 14,-10, -3,-10,  6,  7,-22,-37,-17,  4;
/M: SY='Q';  M= -7,-10,-27,-11, -2,-25,  5, -5,-15, -7, -8,  4, -7,-17, 17, -6, -7,-13,-19,-20,-13,  8;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='B';  M=  7,  8,-16,  5, -4,-19,  4,-11,-19, -7,-17,-14,  7,-11, -7,-11,  8,  6,-12,-24,-16, -6; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='H';  M= -1,-12,-21,-16,-13,-12, -6,  8,  1,-15, -4,  2, -5,-15, -8,-14, -7,-11, -2,-18, -3,-13; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='C';  M= -7,-14, 59,-19,-13,-17,-27,-24,-18,-19,-14,-14,-15,-28,-19,-21, -4,  0, -3,-41,-23,-16;
/M: SY='S';  M=  9,  5,-15, -2, -6,-20,  8,-10,-20, -9,-24,-17, 14,-13, -6,-11, 21, 11,-14,-33,-20, -6;
/M: SY='E';  M= -9, -2,-20,  0,  7, -4,-23,-14, -9, -8, -8, -9, -7,-15, -9,-11, -1,  4, -1,-25, -8,  0;
/M: SY='G';  M= -7,  0,-32,  7,  7,-31, 22,-13,-34, -9,-28,-21, -1,  8, -6,-14, -2,-14,-30,-27,-26, -1;
/M: SY='N';  M=  0, 11,-16,  3, -1,-19, -7, -7,-19,  2,-26,-17, 20,-13, -1, -1, 20, 16,-15,-35,-17, -1;
/M: SY='A';  M= 17, -6,-22,-10, -1,-28,  2,-12,-21,  6,-20,-10, -4,-12,  7, -3,  2, -7,-15,-20,-17,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-21, 38,-25,-20, -9,-28,-23, -9,-18,  8, -2,-21,-31,-20,-17,-18,-10, -3,-33,-14,-20;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-13,-16,-20,-16,-14, 18,-21,  8,  3,-10,  8,  3,-16,-21, -9, -9,-16, -7, -4, 13, 44,-14; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-18,-20,-28,-22,-20, 25,-28, 17,  3,-10,  3,  9,-20,-28, -8,-10,-20,-10, -7, 22, 68,-18;
/M: SY='N';  M=  1, 23,-16,  7, -4,-18, -4, -1,-16, -4,-22,-16, 36,-16, -4, -5, 12, 11,-19,-35,-18, -4;
/M: SY='N';  M= -6, 29,-17, 14, -1,-19, -2,  4,-19, -3,-28,-19, 46,-17, -1, -3, 16,  9,-24,-39,-19, -1;
/M: SY='E';  M= -5, -2,-23, -1, 19,-19,-20,-11, -8, -6,-12,-10, -2, -8,  3,-10,  6,  3, -9,-30,-14, 10;
/M: SY='G';  M=  2, -1,-22, -2, -7,-25, 26,-12,-29, -6,-30,-19,  9,-15, -7, -8, 15, -2,-21,-29,-23, -7;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-28,-10,-18,-26, 54,-15,-32,-17,-24,-11,  3,-20,-16,-17, -1,-17,-26,-22,-26,-17;
/M: SY='R';  M=-10,  3,-28, -2, -5,-25, 14, -6,-31, 10,-27,-16, 13,-18, -2, 19, -2,-11,-26,-24,-19, -5;
/M: SY='S';  M=  7, -3,-17, -6, -1,-21, -9,-12,-20,  7,-23,-14,  2,-11,  0,  7, 16, 12,-10,-29,-15, -1;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-20,-38,-30, 46,-32,-24, 17,-28, 12,  6,-22,-28,-34,-22,-18, -8, 17, -5, 15,-30;
/M: SY='M';  M= -4,-26,-14,-30,-26,  0,-26,-17, 26,-16, 14, 32,-26,-26,-17,-16,-14, -4, 32,-26, -6,-21;
/M: SY='Y';  M= -3,-19,-24,-21,-18, 16,-23,  6,  0,-13,  4,  0,-19,-26,-11,-14,-15, -8, -5, 12, 47,-18;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='F';  M=-14,-29,-26,-36,-27, 30,-34,-18, 24,-27, 18, 11,-21,-26,-25,-23,-21,-10, 13, -4, 21,-27;
/M: SY='I';  M= -6,-23,-19,-29,-22,  1,-31,-24, 24,-24, 22, 12,-20,-22,-19,-21,-13,  5, 20,-24, -4,-22;
/M: SY='S';  M= 15, -2,-10, -5, -3,-19, -3,-13,-17,-10,-24,-17,  5,-10, -3,-12, 32, 21, -7,-35,-19, -3;
/M: SY='D';  M= -6, 24,-19, 32,  8,-28, -8, -7,-28, -5,-27,-23, 13,-10, -1,-10, 18, 10,-18,-39,-19,  3;
/M: SY='N';  M=-12, 12, -9,  9,  0,-24,-16,  6,-24,  8,-24,-13, 13,-19, -2,  2, -4, -8,-18,-33,-12, -2;
/M: SY='P';  M=-12,  6,-34, 12,  7,-32,-15, -8,-24, -4,-29,-19,  3, 40,  2,-11, -4, -8,-30,-32,-24,  2;
/M: SY='N';  M= -9, 25,-26, 23, -1,-29, 22, -3,-32, -7,-30,-23, 28,-17, -7,-10,  4,-10,-30,-33,-23, -4;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-17, 20,-27, 46, 26,-29,-29,-17,-19,-29,-10, 10,-20,  0,-19;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10,  0,-11, 10, 36,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='Y';  M=-13,-26,-25,-26,-25, 16,-29, -5,  9,-15,  1,  1,-26,-30,-19,-15,-19, -9, 10, 23, 40,-24;
/M: SY='V';  M= 18,-17,-10,-22,-19, -9,-17,-24,  8,-14, -1, -1,-17,-19,-19,-18,  3, 10, 22,-26,-14,-19;
/M: SY='K';  M= -7, -1,-26, -1,  6,-26,-16, -9,-28, 34,-29,-12,  2,-11,  8, 26,  1, -3,-18,-24,-12,  6;
/M: SY='W';  M=-18,-34,-35,-40,-30, 33,-28,-26,  1,-26, -1, -5,-29,-28,-27,-22,-29,-19, -7, 67, 24,-26;
/M: SY='E';  M= -9,-11,-26, -5, 17,-14,-24,-12, -6, -8,  4, -4,-15, -1, -2,-11,-12, -9, -9,-27,-14,  7;
/M: SY='N';  M=-10,  5,-23, -1, -1, -8,-14,  9,-22,  9,-23,-11, 14,-17, -1,  5,  1, -5,-19,-25, -3, -1;
/M: SY='D';  M=-11, 29,-26, 37, 28,-31,-11,  0,-31,  2,-27,-24, 18, -8,  7, -5,  7, -5,-27,-37,-20, 17;
/M: SY='D';  M=  5, 19,-21, 20,  1,-28,  7, -7,-27, -7,-26,-21, 15,-13, -5,-12, 10, -3,-20,-33,-21, -2;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-25, -8,-17,-25, 59,-17,-34,-17,-25,-17,  0,-17,-17,-17,  0,-17,-25,-17,-25,-17; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='N';  M= -7, 25,-14, 18,  2,-16, -4,  2,-16, -1,-19,-14, 29,-11, -1, -3,  7,  5,-17,-27,-13,  0; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='C';  M= -8,-17, 15,-23,-16, -8,-28,-19, -1,-17, -6, -2,-14,-24, -7,-16, -6, -1,  3,-28,-10,-12;
/M: SY='I';  M= -7,-20,-22,-28,-26, -3,-31,-24, 33,-22,  9, 11,-12,-23,-21,-22,-12, -5, 28,-26, -6,-26;
/M: SY='Y';  M= -9,-16,-22,-18,-16,  3,-26, -8,  0,-12, -6, -4,-16, -6,-14,-14, -5, 10,  2, -9, 19,-18;
/M: SY='V';  M= -5,-26,-18,-30,-25,  1,-32,-27, 29,-24, 18, 12,-23,-24,-22,-22,-13,  1, 30,-25, -5,-25;
/M: SY='E';  M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  4, -2, 16, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 33;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='E';  M=-14, 27,-30, 41, 43,-34,-16,  0,-34,  6,-24,-24,  8, -4, 12, -4,  0,-10,-30,-34,-20, 27;
/M: SY='P';  M= -1,-18,-35,-12, -2,-28,-17,-20,-18,-10,-27,-18,-18, 75,-10,-20, -7, -8,-25,-28,-28,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='C';  M=-11,-20, 76,-27,-24,-15,-29,-24,-22,-21, -9,-12,-19,-36,-23,-14,-13,-10, -8,-41,-22,-24;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10,  0,-14, 10, 47,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='V';  M= -3,-18,-19,-19,-20, -4, -3,-16, -1,-18, -1, -2,-15,-24,-18,-16, -4, -1,  6,-18,  0,-20;
/M: SY='V';  M= -4,-24,-15,-29,-25, -1,-28,-22, 26,-18, 11, 20,-22,-24,-19,-18,-10,  3, 32,-26, -6,-23;
/M: SY='D';  M=-16, 29,-30, 40, 18,-38,-14,  0,-34, 13,-28,-20, 12,-10, 14,  3, -2,-10,-28,-32,-16, 16;
/M: SY='T';  M= -3,  2,-17,  3, -9,-18, -4,-17,-13,-12,-16,-13, -1,-16,-13,-14,  9, 12, -1,-32,-17,-11;
/M: SY='P';  M=  3,-18,-27,-16,-12,-22,  1,-22,-13,-14,-19,-12,-16, 26,-16,-20, -5, -9, -9,-26,-24,-16;
/M: SY='N';  M= -6,  5,-20, -2, -5,-17,-16,-10,-11, 10,-18, -9, 11,-18, -5,  4,  0,  4, -4,-30,-13, -5;
/M: SY='G';  M= -2, -8,-30, -8,-13,-30, 50,-18,-38, -4,-30,-18,  0,-18,-13, -9, -2,-18,-28,-20,-26,-13;
/M: SY='P';  M=  1,-23,-25,-20,-12,-14,-21,-22,  1,-16, -2, -4,-23, 24,-16,-20,-11, -6,  0,-27,-18,-16;
/M: SY='E';  M=-10,  4,-30,  8, 32,-33,-20,  0,-27, 23,-23,-11,  0, -6, 29, 13, -3,-10,-27,-24,-14, 30;
/M: SY='I';  M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='K';  M= -8, -7,-26, -7,  1,-23,-22,-14,-17, 34,-21, -6, -7,-14,  1, 19,-10, -8, -4,-22,-10,  1;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-17,-34,-30,  0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10,  0,-11, 10, 36,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='N';  M= -7, 24,-23, 10, -7,-23, 23,  0,-27, -7,-30,-20, 40,-20, -7, -7,  7, -7,-30,-33,-23, -7;
/M: SY='L';  M= -8,-21, 10,-26,-20,  0,-28,-22,  3,-26, 23,  5,-21,-28,-20,-20,-15,  3,  4,-28, -8,-20;
/M: SY='N';  M=-12, 29,-22, 13,  0,-20, -4,  8,-22,  7,-28,-18, 47,-20,  2, 16,  6, -2,-28,-36,-18,  0;
/M: SY='T';  M=  0, 11,-13,  0, -5,-15,-10,-10,-15, -7,-20,-15, 19,-13, -5, -7, 22, 30,-10,-35,-15, -5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='R';  M=  0, -8,-20,-13, -9,-16,-16, -9,-11,  7,-13, -7, -1,-20, -4, 23, -3, -4, -2,-25,-13, -9;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 15,-20,-22,-28,-18, -7,-11,-15, -1,-12, -1, 13,-20,-18, -8,-16,-11,-10, -2, 14, -3,-12;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 42, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 18,-22, -2,-22;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y';  M=  4,-11,-19,-15,-13,  4,-17, -1, -7,-10, -8, -7,-10,-19, -9,-12,  2,  8, -6, -2, 27,-13;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-28,-38,-28,  2,-38,-28, 43,-30, 27, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 25,-20,  0,-28;
/M: SY='G';  M= 11, -6,-19, -7,-10,-24, 31,-16,-28,-14,-27,-19,  3,-14,-10,-16, 18,  0,-18,-28,-24,-10;
/M: SY='A';  M= 29,  3,-12, -7, -6,-20,  0,-11,-14, -8,-18,-14, 10,-12, -6,-14, 16,  4, -9,-28,-20, -6;
/M: SY='T';  M=  0, -7,-10,-14,-14, -8,-22,-22, -1,-12, -6, -6, -7,-14,-14,-12, 13, 39, 11,-30,-10,-14;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='R';  M=-16,-14,-26,-14, -7,-16,-22, -7,-17, 19,-13, -6, -7,-22,  1, 50,-10, -8, -4,-22,-10, -7;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_05 which contains 570'420 sequence entries.

Total number of hits	59 in 59 different sequences
Number of true positive hits	59 in 59 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Nsp9 ssRNA-binding
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

59 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1), R1AB_BC279  (P0C6V9), R1AB_BC512  (P0C6W0),

R1AB_BCHK3  (P0C6W2), R1AB_BCHK4  (P0C6W3), R1AB_BCHK5  (P0C6W4), 
R1AB_BCHK9  (P0C6W5), R1AB_BCRP3  (P0C6W6), R1AB_CVBEN  (P0C6W7), 
R1AB_CVBLU  (P0C6W8), R1AB_CVBM   (P0C6W9), R1AB_CVBQ   (P0C6X0), 
R1AB_CVH22  (P0C6X1), R1AB_CVHN1  (P0C6X2), R1AB_CVHN2  (P0C6X3), 
R1AB_CVHN5  (P0C6X4), R1AB_CVHNL  (P0C6X5), R1AB_CVHOC  (P0C6X6), 
R1AB_CVM2   (P0C6X8), R1AB_CVMA5  (P0C6X9), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0), 
R1AB_CVPPU  (P0C6Y5), R1AB_FIPV   (Q98VG9), R1AB_IBVB   (P0C6Y1), 
R1AB_IBVBC  (P0C6Y2), R1AB_IBVM   (P0C6Y3), R1AB_MERS1  (K9N7C7), 
R1AB_PEDV7  (P0C6Y4), R1AB_SARS   (P0C6X7), R1AB_SARS2  (P0DTD1), 
R1A_BC133   (P0C6F7), R1A_BC279   (P0C6F5), R1A_BC512   (P0C6F6), 
R1A_BCHK3   (P0C6F8), R1A_BCHK4   (P0C6T4), R1A_BCHK5   (P0C6T5), 
R1A_BCHK9   (P0C6T6), R1A_BCRP3   (P0C6T7), R1A_CVBEN   (P0C6T8), 
R1A_CVBLU   (P0C6T9), R1A_CVBM(P0C6U0), R1A_CVBQ(P0C6U1), 
R1A_CVH22   (P0C6U2), R1A_CVHN1   (P0C6U3), R1A_CVHN2   (P0C6U4), 
R1A_CVHN5   (P0C6U5), R1A_CVHNL   (P0C6U6), R1A_CVHOC   (P0C6U7), 
R1A_CVM2(P0C6U9), R1A_CVMA5   (P0C6V0), R1A_CVMJH   (P0C6V1), 
R1A_CVPPU   (P0C6V2), R1A_IBVB(P0C6V3), R1A_IBVBC   (P0C6V4), 
R1A_IBVM(P0C6V5), R1A_MERS1   (K9N638), R1A_PEDV7   (P0C6V6), 
R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2   (P0DTC1)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

27 PDB

1QZ8; 1UW7; 2J97; 2J98; 3EE7; 5C94; 5HIY; 5HIZ; 6W4B; 6W9Q; 6WC1; 6WXD; 7BWQ; 7CYQ; 7DVY; 7EIZ; 7KRI; 7N3K; 8DQU; 8EIR; 8GWB; 8GWE; 8GWF; 8GWG; 8GWI; 8GWN; 8GWO
» more