Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51952
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | COV_EXON_MTASE_COACT |
Accession [info] | PS51952 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
07-APR-2021 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51952 |
Associated ProRule [info] | PRU01297 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Coronavirus (CoV) ExoN/MTase coactivator domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=138; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=133; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3322325; R2=0.0103626; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7327.7509766; R2=21.3843803; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=789; H_SCORE=24200; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=403; H_SCORE=15946; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 44, -9,-12,-18, -8,-21, -2,-19,-12, -4,-12,-10, -9,-10, -8,-15, 8, -1, -2,-20,-19, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='K'; M= -1, 2,-20, -3, -1,-21,-13, 0,-19, 10,-22,-11, 7,-13, 0, 4, 7, 5,-12,-29,-10, -1; /M: SY='A'; M= 13, 3,-22, -3, 7,-27, -9, -6,-17, -2,-19,-12, 5, 0, 11, -7, 5, -4,-19,-26,-19, 8; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='Y'; M=-14,-18,-23,-19,-10, 18,-27, 4, -2,-14, 2, 1,-15,-24,-10,-11,-14, -9, -2, -6, 21,-10; /M: SY='A'; M= 28,-16,-16,-20,-11,-19,-10,-22, -5,-12,-11, -9,-16, 8,-13,-20, 2, -2, 2,-24,-20,-13; /M: SY='S'; M= 10, -2,-14, -3, -5,-18, -8,-15, -9,-12,-18,-13, 1,-12, -6,-15, 20, 10, -2,-33,-17, -6; /M: SY='N'; M= -4, 35,-19, 16, -1,-20, 0, 7,-19, -1,-28,-19, 53,-19, -1, -2, 10, 0,-27,-38,-20, -1; /M: SY='S'; M= 9, -3,-10, -3, -3,-18, -3,-12,-15,-11,-26,-17, 6,-12, -3,-11, 35, 18, -4,-39,-19, -3; /M: SY='S'; M= 9, -3,-16, -6, -7,-21, 11, -7,-22,-12,-24,-16, 4,-13, -6,-13, 22, 11,-13,-31,-18, -7; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-34,-27, 3,-34,-27, 34,-27, 27, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 29,-23, -3,-27; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-29,-19, 9,-30,-19, 18,-27, 47, 19,-29,-30,-19,-16,-29,-10, 9,-20, 0,-19; /M: SY='S'; M= 6, 0,-10, -4, -4,-16, -8,-14,-16,-10,-22,-16, 6,-10, -4,-10, 32, 32, -6,-36,-16, -4; /M: SY='L'; M= -4,-25,-19,-28,-18, 12,-25,-12, 11,-26, 33, 13,-24,-27,-19,-19,-22, -9, 5,-17, 2,-18; /M: SY='C'; M= -8,-22, 96,-30,-30,-16,-30,-30,-19,-28,-14,-14,-22,-38,-30,-28,-10, -8, 1,-46,-26,-30; /M: SY='A'; M= 34, -4,-11,-13, -7,-19, -1,-16,-13, -9,-16,-13, -1,-11, -7,-16, 18, 8, -4,-26,-19, -7; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='A'; M= 29, -5,-10,-10, -5,-19, -1,-15,-15,-10,-19,-15, 0,-10, -5,-15, 24, 12, -5,-30,-19, -5; /M: SY='V'; M= -1,-29,-13,-28,-27, -3,-29,-29, 25,-19, 6, 7,-29,-17,-28,-20,-10, -1, 41,-30,-12,-28; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M= -8,-20,-39,-10, 0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20, 86,-10,-20, -9,-10,-29,-30,-30,-10; /M: SY='A'; M= 25, -7,-19,-11, 0,-25, -3,-15,-18, 4,-17,-11, -7, -6, -1, -7, 3, -5,-11,-21,-19, -1; /M: SY='K'; M= -2, 4,-26, 4, 7,-28,-16,-11,-27, 33,-26,-12, 1,-10, 5, 17, -4, -5,-17,-23,-12, 6; /M: SY='T'; M= 24, -5,-10,-15,-10,-15,-11,-20,-10,-10,-10,-10, -5,-10,-10,-15, 15, 26, 0,-25,-15,-10; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='L'; M= -9,-24, -6,-25,-17, -2,-29,-21, 8,-15, 23, 9,-23,-27,-17,-13,-22, -9, 8,-24, -6,-17; /M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 59, 22,-38,-12, -1,-38, 6,-29,-27, 17, -9, 2, -5, -1,-10,-29,-37,-19, 12; /M: SY='Y'; M= 3,-18,-22,-24,-18, 22,-20, 0, -3,-14, -2, -3,-17,-23,-15,-15,-10, -7, -5, 10, 38,-18; /M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-32,-28, 2,-32,-28, 32,-24, 19, 14,-28,-28,-26,-22,-16, -4, 39,-26, -6,-28; /M: SY='K'; M= 3, 5,-25, 2, 5,-29, -6, -6,-24, 16,-24,-11, 6,-12, 11, 6, 0, -7,-20,-24,-15, 8; /M: SY='Q'; M= 7, -1,-20, -4, 3,-25, -9, 3,-20, 0,-21,-10, 5,-12, 16, 3, 12, 0,-17,-27,-14, 9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 3, -5,-25, -9,-15,-23, 36, -4,-27,-15,-21, -8, 4,-19,-12,-15, -1,-14,-22,-23,-20,-14; /M: SY='Q'; M= 3, -5,-21, -8, 2,-25,-17, -8,-14, 8,-17, -5, -4,-12, 16, 5, 4, 3,-10,-24,-12, 9; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-33,-27, 3,-33,-27, 33,-26, 25, 16,-27,-27,-24,-23,-19, -6, 32,-24, -4,-27; /M: SY='G'; M= 3, -3,-18, -9,-13,-19, 13,-17,-18,-14,-19,-13, 3,-14,-12,-15, 13, 13,-11,-27,-19,-13; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='C'; M=-11,-20,109,-29,-29,-16,-30,-26,-28,-29,-19,-19,-20,-39,-29,-29,-11,-10,-10,-44,-22,-29; /M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-31,-30, 0,-31,-30, 31,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 49,-29, -9,-30; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='C'; M= 7, -8, 31,-16,-15,-16,-16,-21,-18,-16,-17,-15, -6,-19,-15,-18, 12, 18, -5,-36,-20,-15; /M: SY='N'; M=-10, 15,-25, 14, 0,-23,-12, -7,-18, -6,-24,-18, 16, 10, -7,-10, 2, 1,-18,-35,-20, -5; /M: SY='H'; M=-12, -3,-30, -3, -5,-25, 10, 40,-33, -2,-25, -8, 5,-18, 0, -1, -7,-18,-28,-25, -2, -5; /M: SY='T'; M= 19, 0,-11, -9, -7,-16, -7,-15,-13, -9,-15,-13, 4,-11, -7,-13, 18, 21, -5,-29,-16, -7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='T'; M= -1, 10,-13, 0, -6,-14,-11,-10,-14, -7,-19,-14, 17,-13, -6, -7, 21, 32,-10,-34,-14, -6; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='M'; M=-10,-17,-24,-22,-10, -4,-25, -6, 9,-10, 7, 23,-15,-19, 10, -8,-13, -9, 1,-18, -1, 0; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='I'; M= -8,-30,-27,-38,-30, 0,-38,-30, 47,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30; /M: SY='T'; M= 2, 0,-10, -8, -8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12, 2,-10, -8,-10, 24, 44, -2,-32,-12, -8; /M: SY='V'; M= 0, -9, -6,-16,-18, -9,-20,-19, 8,-16, -5, -2, -3,-23,-17,-16, 1, 3, 15,-32,-14,-18; /M: SY='K'; M= -5, -2,-25, -4, 0,-26, -1,-14,-28, 22,-26,-13, 1,-12, 0, 10, 1, 1,-18,-23,-15, 0; /M: SY='P'; M= -7,-23,-31,-17,-10,-20,-24,-23, -2,-14,-16, -9,-23, 51,-16,-21,-11, -7, -5,-29,-23,-17; /M: SY='E'; M=-10, 19,-28, 31, 43,-32,-15, -1,-32, 5,-24,-23, 6, -4, 13, -4, 4, -7,-28,-34,-20, 28; /M: SY='A'; M= 37, -9,-13,-16, -7,-21, -2,-18,-13,-10,-15,-13, -8, 1, -8,-18, 13, 2, -5,-24,-21, -8; /M: SY='N'; M= -4, 19,-15, 5, -4,-16, -9, -5,-16, -5,-21,-16, 30,-15, -4, -5, 17, 23,-15,-36,-16, -4; /M: SY='T'; M= 6,-10,-17,-18,-13,-12,-19,-19, 0,-13, -5, 0, -9, -2,-10,-15, 6, 20, 2,-26,-12,-13; /M: SY='D'; M=-13, 36,-25, 38, 11,-31, -8, 2,-29, 0,-28,-22, 29,-13, 6, -5, 6, -2,-27,-37,-18, 8; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='D'; M=-17, 38,-30, 55, 32,-37,-13, 0,-37, 3,-27,-27, 14, -7, 6, -7, 0,-10,-30,-37,-20, 19; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -5,-13,-17,-10,-25,-17, 7,-10, -3,-10, 35, 28, -7,-37,-17, -3; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22, 39,-30, 13, 0,-13, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 71,-22; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -2,-28, 11,-31,-30, -3,-31,-30, 21,-22, 5, 5,-28,-31,-29,-22,-11, -2, 38,-33,-13,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 31,-30, 39, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20, 0,-24; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='A'; M= 30,-12, 26,-21,-15,-20, -8,-22,-16,-16,-14,-14,-11,-18,-15,-22, 7, -1, -4,-30,-23,-15; /M: SY='H'; M=-20, -2,-30, -2, 0,-20,-20, 80,-30, -2,-20, -2, 8,-20, 10, 14,-10,-18,-28,-28, 14, 0; /M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-35,-30, 0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30; /M: SY='E'; M= -1, 9,-27, 17, 40,-29,-15, -5,-27, 4,-20,-19, -1, 3, 11, -6, 1, -8,-25,-29,-21, 25; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M= -4, 29,-22, 31, 6,-29, -1, -4,-28, -4,-27,-23, 22,-13, -3,-10, 9, 0,-23,-36,-20, 1; /M: SY='V'; M= -2,-25,-19,-28,-22, -4,-26,-21, 21,-18, 12, 19,-24,-12,-18,-19,-14, -5, 23,-25, -8,-21; /M: SY='D'; M=-12, 32,-25, 44, 13,-33,-10, -4,-33, 3,-29,-25, 15,-10, 0, -6, 8, -1,-23,-37,-18, 7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-12,-27,-20,-30,-23, 24,-29,-18, 12,-20, 17, 8,-23,-29,-24,-10,-19, -7, 14,-11, 10,-23; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='K'; M=-13, 4,-30, 6, 11,-31,-19, -4,-29, 35,-27,-10, 2,-12, 18, 28, -7,-10,-23,-22,-11, 14; /M: SY='F'; M=-16,-27,-23,-30,-23, 36,-30, -7, 8,-24, 23, 8,-24,-30,-23,-17,-24,-10, 1, 4, 34,-23; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 45,-28,-10, 0,-12, 10, 40,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='G'; M= 0, -9,-29,-10,-19,-29, 63,-20,-38,-19,-29,-19, 0,-19,-19,-19, 1,-15,-28,-21,-29,-19; /M: SY='K'; M= -9, -1,-28, -1, 8,-28,-18, -9,-29, 42,-29,-11, 1,-11, 9, 29, -5, -7,-19,-22,-11, 8; /M: SY='F'; M=-19,-28,-15,-35,-28, 59,-29,-13, -3,-25, 4, -3,-21,-31,-32,-19,-21,-11, -5, 19, 36,-27; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-35,-30, 0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M= 3,-18,-16,-24,-18, -2,-24,-22, 11,-20, 17, 6,-17,-20,-16,-18, -7, 10, 11,-24, -7,-18; /M: SY='G'; M= -3, -7,-24, -9,-14,-23, 27, -3,-27,-15,-21,-12, -1,-18,-10,-14, 2, -3,-18,-24,-17,-13; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='V'; M= 1,-18,-19,-23,-14, -6,-27,-23, 17,-18, 8, 5,-17,-18,-15,-19, -6, 4, 18,-25, -8,-16; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='R'; M=-10, 8,-23, 3, 5,-22,-12, 0,-22, 22,-22,-10, 14,-13, 11, 23, -3, -6,-20,-22,-11, 7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-35,-30, 0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30; /M: SY='G'; M= -6,-10,-27,-10,-11,-23, 24,-12,-30, -3,-22,-14, 0,-19, -7, 11, 0,-10,-21,-23,-20,-11; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 70,-30,-12, 0,-26, 8, 0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 40,-28; /M: SY='C'; M= -6,-21, 57,-28,-27,-11,-29,-28, -7,-25, -5, -7,-21,-33,-27,-24, -8, -1, 10,-40,-20,-27; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20, 0,-22; /M: SY='E'; M= -9, 1,-25, 2, 20,-24,-19, -5,-25, 15,-20,-13, 1, -9, 12, 17, 3, 4,-19,-26,-14, 15; /M: SY='N'; M=-12, 32,-22, 16, 0,-20, -4, 28,-22, -2,-28,-16, 50,-20, 2, 0, 6, -4,-30,-38,-12, 0; /M: SY='D'; M= -8, 12,-20, 13, 5,-21,-18,-11,-17, 0,-17,-14, 5,-12, -4, -5, 5, 12, -8,-32,-14, 0; /M: SY='V'; M= -2,-28,-16,-26,-24, -6,-28,-28, 21,-18, 3, 4,-28, -8,-26,-20,-10, -2, 35,-30,-14,-26; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='N'; M= -3, 6,-20, -2, -1,-21,-15, -6,-14, 5,-18, -9, 11,-15, 7, 2, 5, 7,-11,-28,-13, 3; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -4, -4,-29, -5, -7,-32, 39, -9,-33,-10,-27,-14, 4,-17, 5,-10, 1,-16,-30,-21,-23, -1; /M: SY='C'; M=-14,-22, 40,-31,-27, 16,-28,-17,-10,-24, -3, 0,-19,-32,-25,-21,-14, -8, -4,-19, 5,-25; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M=-11,-19,-26,-22,-11, -9,-28,-15, 7, -4, 10, 8,-15,-21, -3, 5,-17, -9, 4,-21, -5, -9; /M: SY='G'; M= -3, 9,-26, 10, -7,-29, 34,-12,-34,-12,-28,-21, 12,-17,-12,-14, 4, -9,-26,-28,-25,-10; /M: SY='H'; M=-14, -2,-28, -6,-12, -2, -2, 26,-18,-10,-16, -8, 6,-24, -6, -8, -8,-12,-22, -6, 26,-12; /M: SY='G'; M= 2, -8,-26, -8,-16,-28, 56,-18,-36,-18,-30,-20, 2,-18,-16,-18, 8,-12,-26,-24,-28,-16; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='S'; M= 2, 3,-17, -3, -2,-19, -9, -6,-13, -6,-19, -7, 10, -7, 3, -7, 15, 11,-13,-32,-16, 0; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='D'; M=-14, 30,-25, 45, 9,-31,-13, -7,-24, -5,-22,-21, 9,-14, -6,-12, 1, -6,-12,-38,-18, 1; /M: SY='R'; M= 2, -6,-22, -7, -2,-24, 1, -7,-25, 4,-23,-13, 1,-15, 6, 16, 9, -2,-17,-26,-17, 0; /M: SY='T'; M= -1,-14,-15,-19,-14, -2,-22,-19, 3,-19, 16, 3,-13,-19,-14,-15, -2, 17, 4,-26, -7,-14; /M: SY='R'; M= -6, -6,-24, -6, -5,-20, -7, -9,-21, 7,-19,-12, 0,-17, -1, 24, 2, -2,-12,-25,-14, -5; /M: SY='Q'; M= -7, -7,-24,-10, 1,-17,-16,-10, 1, -8, -6, 3, -3,-14, 5,-10, -2, -3, -4,-26,-11, 2; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='T'; M= 2, -7,-22,-10, -2,-22,-17,-14,-11, -7,-16, -9, -6, 11, 4,-11, 8, 13,-11,-27,-16, -1; /M: SY='V'; M= -6,-18,-18,-23,-19, 6,-24,-18, 11,-12, 3, 8,-13,-23,-17,-12, -8, -3, 15,-22, -3,-18; /M: SY='P'; M=-10, 0,-27, 5, 3,-24,-18, -8,-14, -7,-13, -6, -6, 9, 5,-10, -4, -5,-15,-29,-16, 3; /M: SY='Q'; M= -4, 8,-22, 9, 12,-32,-10, 2,-22, 1,-25,-12, 10,-11, 28, 0, 15, 1,-23,-31,-15, 20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 59 in 59 different sequences |
Number of true positive hits | 59 in 59 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | ExoN/MTase coactivator |
Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
59 sequences
R1AB_BC133 (P0C6W1), R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BC512 (P0C6W0), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCHK4 (P0C6W3), R1AB_BCHK5 (P0C6W4), R1AB_BCHK9 (P0C6W5), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_CVBEN (P0C6W7), R1AB_CVBLU (P0C6W8), R1AB_CVBM (P0C6W9), R1AB_CVBQ (P0C6X0), R1AB_CVH22 (P0C6X1), R1AB_CVHN1 (P0C6X2), R1AB_CVHN2 (P0C6X3), R1AB_CVHN5 (P0C6X4), R1AB_CVHNL (P0C6X5), R1AB_CVHOC (P0C6X6), R1AB_CVM2 (P0C6X8), R1AB_CVMA5 (P0C6X9), R1AB_CVMJH (P0C6Y0), R1AB_CVPPU (P0C6Y5), R1AB_FIPV (Q98VG9), R1AB_IBVB (P0C6Y1), R1AB_IBVBC (P0C6Y2), R1AB_IBVM (P0C6Y3), R1AB_MERS1 (K9N7C7), R1AB_PEDV7 (P0C6Y4), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), R1A_BC133 (P0C6F7), R1A_BC279 (P0C6F5), R1A_BC512 (P0C6F6), R1A_BCHK3 (P0C6F8), R1A_BCHK4 (P0C6T4), R1A_BCHK5 (P0C6T5), R1A_BCHK9 (P0C6T6), R1A_BCRP3 (P0C6T7), R1A_CVBEN (P0C6T8), R1A_CVBLU (P0C6T9), R1A_CVBM(P0C6U0), R1A_CVBQ(P0C6U1), R1A_CVH22 (P0C6U2), R1A_CVHN1 (P0C6U3), R1A_CVHN2 (P0C6U4), R1A_CVHN5 (P0C6U5), R1A_CVHNL (P0C6U6), R1A_CVHOC (P0C6U7), R1A_CVM2(P0C6U9), R1A_CVMA5 (P0C6V0), R1A_CVMJH (P0C6V1), R1A_CVPPU (P0C6V2), R1A_IBVB(P0C6V3), R1A_IBVBC (P0C6V4), R1A_IBVM(P0C6V5), R1A_MERS1 (K9N638), R1A_PEDV7 (P0C6V6), R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2 (P0DTC1)» more
|
PDB [Detailed view] |
91 PDB
2FYG; 2G9T; 2GA6; 2XYQ; 2XYR; 2XYV; 3R24; 5C8S; 5C8T; 5C8U; 5NFY; 6W4H; 6W61; 6W75; 6WJT; 6WKQ; 6WKS; 6WQ3; 6WRZ; 6WVN; 6XKM; 6YZ1; 6ZCT; 6ZPE; 7BQ7; 7C2I; 7C2J; 7DIY; 7EIZ; 7JHE; 7JIB; 7JPE; 7JYY; 7JZ0; 7KOA; 7L6R; 7L6T; 7LW3; 7LW4; 7MC5; 7MC6; 7N0B; 7N0C; 7N0D; 7NH7; 7O7Y; 7O7Z; 7O80; 7O81; 7ORR; 7ORU; 7ORV; 7ORW; 7R1T; 7R1U; 7ULT; 8A23; 8BSD; 8BZN; 8BZV; 8C0G; 8C5M; 8EIR; 8F4S; 8F4Y; 8OSX; 8OT0; 8OTO; 8OTR; 8OV1; 8OV2; 8OV3; 8OV4; 8RV4; 8RV5; 8RV6; 8RV7; 8RV8; 8RV9; 8RVA; 8RVB; 8RZC; 8RZD; 8RZE; 8S8W; 8S8X; 8TYJ; 9EMJ; 9EML; 9EMV; 9EUN » more |