PROSITE entry PS51952

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	COV_EXON_MTASE_COACT
Accession [info]	PS51952
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	07-APR-2021 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51952
Associated ProRule [info]	PRU01297

Name and characterization of the entry

Description [info]

Coronavirus (CoV) ExoN/MTase coactivator domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=138;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=133;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3322325; R2=0.0103626; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7327.7509766; R2=21.3843803; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=789; H_SCORE=24200; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=403; H_SCORE=15946; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M= 44, -9,-12,-18, -8,-21, -2,-19,-12, -4,-12,-10, -9,-10, -8,-15,  8, -1, -2,-20,-19, -8;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K';  M= -1,  2,-20, -3, -1,-21,-13,  0,-19, 10,-22,-11,  7,-13,  0,  4,  7,  5,-12,-29,-10, -1;
/M: SY='A';  M= 13,  3,-22, -3,  7,-27, -9, -6,-17, -2,-19,-12,  5,  0, 11, -7,  5, -4,-19,-26,-19,  8;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='Y';  M=-14,-18,-23,-19,-10, 18,-27,  4, -2,-14,  2,  1,-15,-24,-10,-11,-14, -9, -2, -6, 21,-10;
/M: SY='A';  M= 28,-16,-16,-20,-11,-19,-10,-22, -5,-12,-11, -9,-16,  8,-13,-20,  2, -2,  2,-24,-20,-13;
/M: SY='S';  M= 10, -2,-14, -3, -5,-18, -8,-15, -9,-12,-18,-13,  1,-12, -6,-15, 20, 10, -2,-33,-17, -6;
/M: SY='N';  M= -4, 35,-19, 16, -1,-20,  0,  7,-19, -1,-28,-19, 53,-19, -1, -2, 10,  0,-27,-38,-20, -1;
/M: SY='S';  M=  9, -3,-10, -3, -3,-18, -3,-12,-15,-11,-26,-17,  6,-12, -3,-11, 35, 18, -4,-39,-19, -3;
/M: SY='S';  M=  9, -3,-16, -6, -7,-21, 11, -7,-22,-12,-24,-16,  4,-13, -6,-13, 22, 11,-13,-31,-18, -7;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-21,-34,-27,  3,-34,-27, 34,-27, 27, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 29,-23, -3,-27;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-29,-19,  9,-30,-19, 18,-27, 47, 19,-29,-30,-19,-16,-29,-10,  9,-20,  0,-19;
/M: SY='S';  M=  6,  0,-10, -4, -4,-16, -8,-14,-16,-10,-22,-16,  6,-10, -4,-10, 32, 32, -6,-36,-16, -4;
/M: SY='L';  M= -4,-25,-19,-28,-18, 12,-25,-12, 11,-26, 33, 13,-24,-27,-19,-19,-22, -9,  5,-17,  2,-18;
/M: SY='C';  M= -8,-22, 96,-30,-30,-16,-30,-30,-19,-28,-14,-14,-22,-38,-30,-28,-10, -8,  1,-46,-26,-30;
/M: SY='A';  M= 34, -4,-11,-13, -7,-19, -1,-16,-13, -9,-16,-13, -1,-11, -7,-16, 18,  8, -4,-26,-19, -7;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='A';  M= 29, -5,-10,-10, -5,-19, -1,-15,-15,-10,-19,-15,  0,-10, -5,-15, 24, 12, -5,-30,-19, -5;
/M: SY='V';  M= -1,-29,-13,-28,-27, -3,-29,-29, 25,-19,  6,  7,-29,-17,-28,-20,-10, -1, 41,-30,-12,-28;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P';  M= -8,-20,-39,-10,  0,-30,-19,-20,-20,-10,-29,-20,-20, 86,-10,-20, -9,-10,-29,-30,-30,-10;
/M: SY='A';  M= 25, -7,-19,-11,  0,-25, -3,-15,-18,  4,-17,-11, -7, -6, -1, -7,  3, -5,-11,-21,-19, -1;
/M: SY='K';  M= -2,  4,-26,  4,  7,-28,-16,-11,-27, 33,-26,-12,  1,-10,  5, 17, -4, -5,-17,-23,-12,  6;
/M: SY='T';  M= 24, -5,-10,-15,-10,-15,-11,-20,-10,-10,-10,-10, -5,-10,-10,-15, 15, 26,  0,-25,-15,-10;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='L';  M= -9,-24, -6,-25,-17, -2,-29,-21,  8,-15, 23,  9,-23,-27,-17,-13,-22, -9,  8,-24, -6,-17;
/M: SY='D';  M=-18, 42,-30, 59, 22,-38,-12, -1,-38,  6,-29,-27, 17, -9,  2, -5, -1,-10,-29,-37,-19, 12;
/M: SY='Y';  M=  3,-18,-22,-24,-18, 22,-20,  0, -3,-14, -2, -3,-17,-23,-15,-15,-10, -7, -5, 10, 38,-18;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-16,-32,-28,  2,-32,-28, 32,-24, 19, 14,-28,-28,-26,-22,-16, -4, 39,-26, -6,-28;
/M: SY='K';  M=  3,  5,-25,  2,  5,-29, -6, -6,-24, 16,-24,-11,  6,-12, 11,  6,  0, -7,-20,-24,-15,  8;
/M: SY='Q';  M=  7, -1,-20, -4,  3,-25, -9,  3,-20,  0,-21,-10,  5,-12, 16,  3, 12,  0,-17,-27,-14,  9;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M=  3, -5,-25, -9,-15,-23, 36, -4,-27,-15,-21, -8,  4,-19,-12,-15, -1,-14,-22,-23,-20,-14;
/M: SY='Q';  M=  3, -5,-21, -8,  2,-25,-17, -8,-14,  8,-17, -5, -4,-12, 16,  5,  4,  3,-10,-24,-12,  9;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-19,-33,-27,  3,-33,-27, 33,-26, 25, 16,-27,-27,-24,-23,-19, -6, 32,-24, -4,-27;
/M: SY='G';  M=  3, -3,-18, -9,-13,-19, 13,-17,-18,-14,-19,-13,  3,-14,-12,-15, 13, 13,-11,-27,-19,-13;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='C';  M=-11,-20,109,-29,-29,-16,-30,-26,-28,-29,-19,-19,-20,-39,-29,-29,-11,-10,-10,-44,-22,-29;
/M: SY='V';  M= -1,-30,-11,-31,-30,  0,-31,-30, 31,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 49,-29, -9,-30;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='C';  M=  7, -8, 31,-16,-15,-16,-16,-21,-18,-16,-17,-15, -6,-19,-15,-18, 12, 18, -5,-36,-20,-15;
/M: SY='N';  M=-10, 15,-25, 14,  0,-23,-12, -7,-18, -6,-24,-18, 16, 10, -7,-10,  2,  1,-18,-35,-20, -5;
/M: SY='H';  M=-12, -3,-30, -3, -5,-25, 10, 40,-33, -2,-25, -8,  5,-18,  0, -1, -7,-18,-28,-25, -2, -5;
/M: SY='T';  M= 19,  0,-11, -9, -7,-16, -7,-15,-13, -9,-15,-13,  4,-11, -7,-13, 18, 21, -5,-29,-16, -7;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T';  M= -1, 10,-13,  0, -6,-14,-11,-10,-14, -7,-19,-14, 17,-13, -6, -7, 21, 32,-10,-34,-14, -6;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='M';  M=-10,-17,-24,-22,-10, -4,-25, -6,  9,-10,  7, 23,-15,-19, 10, -8,-13, -9,  1,-18, -1,  0;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-27,-38,-30,  0,-38,-30, 47,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,  2,-10, -8,-10, 24, 44, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='V';  M=  0, -9, -6,-16,-18, -9,-20,-19,  8,-16, -5, -2, -3,-23,-17,-16,  1,  3, 15,-32,-14,-18;
/M: SY='K';  M= -5, -2,-25, -4,  0,-26, -1,-14,-28, 22,-26,-13,  1,-12,  0, 10,  1,  1,-18,-23,-15,  0;
/M: SY='P';  M= -7,-23,-31,-17,-10,-20,-24,-23, -2,-14,-16, -9,-23, 51,-16,-21,-11, -7, -5,-29,-23,-17;
/M: SY='E';  M=-10, 19,-28, 31, 43,-32,-15, -1,-32,  5,-24,-23,  6, -4, 13, -4,  4, -7,-28,-34,-20, 28;
/M: SY='A';  M= 37, -9,-13,-16, -7,-21, -2,-18,-13,-10,-15,-13, -8,  1, -8,-18, 13,  2, -5,-24,-21, -8;
/M: SY='N';  M= -4, 19,-15,  5, -4,-16, -9, -5,-16, -5,-21,-16, 30,-15, -4, -5, 17, 23,-15,-36,-16, -4;
/M: SY='T';  M=  6,-10,-17,-18,-13,-12,-19,-19,  0,-13, -5,  0, -9, -2,-10,-15,  6, 20,  2,-26,-12,-13;
/M: SY='D';  M=-13, 36,-25, 38, 11,-31, -8,  2,-29,  0,-28,-22, 29,-13,  6, -5,  6, -2,-27,-37,-18,  8;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='D';  M=-17, 38,-30, 55, 32,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 14, -7,  6, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 19;
/M: SY='S';  M=  7,  0,-10, -3, -3,-17, -5,-13,-17,-10,-25,-17,  7,-10, -3,-10, 35, 28, -7,-37,-17, -3;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-23,-22, 39,-30, 13,  0,-13,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 71,-22;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M= -2,-28, 11,-31,-30, -3,-31,-30, 21,-22,  5,  5,-28,-31,-29,-22,-11, -2, 38,-33,-13,-30;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 31,-30, 39, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='A';  M= 30,-12, 26,-21,-15,-20, -8,-22,-16,-16,-14,-14,-11,-18,-15,-22,  7, -1, -4,-30,-23,-15;
/M: SY='H';  M=-20, -2,-30, -2,  0,-20,-20, 80,-30, -2,-20, -2,  8,-20, 10, 14,-10,-18,-28,-28, 14,  0;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='E';  M= -1,  9,-27, 17, 40,-29,-15, -5,-27,  4,-20,-19, -1,  3, 11, -6,  1, -8,-25,-29,-21, 25;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D';  M= -4, 29,-22, 31,  6,-29, -1, -4,-28, -4,-27,-23, 22,-13, -3,-10,  9,  0,-23,-36,-20,  1;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-19,-28,-22, -4,-26,-21, 21,-18, 12, 19,-24,-12,-18,-19,-14, -5, 23,-25, -8,-21;
/M: SY='D';  M=-12, 32,-25, 44, 13,-33,-10, -4,-33,  3,-29,-25, 15,-10,  0, -6,  8, -1,-23,-37,-18,  7;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F';  M=-12,-27,-20,-30,-23, 24,-29,-18, 12,-20, 17,  8,-23,-29,-24,-10,-19, -7, 14,-11, 10,-23;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K';  M=-13,  4,-30,  6, 11,-31,-19, -4,-29, 35,-27,-10,  2,-12, 18, 28, -7,-10,-23,-22,-11, 14;
/M: SY='F';  M=-16,-27,-23,-30,-23, 36,-30, -7,  8,-24, 23,  8,-24,-30,-23,-17,-24,-10,  1,  4, 34,-23;
/M: SY='K';  M=-12, -2,-30, -2,  8,-28,-20, -8,-30, 45,-28,-10,  0,-12, 10, 40,-10,-10,-20,-20,-10,  8;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-29,-10,-19,-29, 63,-20,-38,-19,-29,-19,  0,-19,-19,-19,  1,-15,-28,-21,-29,-19;
/M: SY='K';  M= -9, -1,-28, -1,  8,-28,-18, -9,-29, 42,-29,-11,  1,-11,  9, 29, -5, -7,-19,-22,-11,  8;
/M: SY='F';  M=-19,-28,-15,-35,-28, 59,-29,-13, -3,-25,  4, -3,-21,-31,-32,-19,-21,-11, -5, 19, 36,-27;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='L';  M=  3,-18,-16,-24,-18, -2,-24,-22, 11,-20, 17,  6,-17,-20,-16,-18, -7, 10, 11,-24, -7,-18;
/M: SY='G';  M= -3, -7,-24, -9,-14,-23, 27, -3,-27,-15,-21,-12, -1,-18,-10,-14,  2, -3,-18,-24,-17,-13;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V';  M=  1,-18,-19,-23,-14, -6,-27,-23, 17,-18,  8,  5,-17,-18,-15,-19, -6,  4, 18,-25, -8,-16;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M=-10,  8,-23,  3,  5,-22,-12,  0,-22, 22,-22,-10, 14,-13, 11, 23, -3, -6,-20,-22,-11,  7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='G';  M= -6,-10,-27,-10,-11,-23, 24,-12,-30, -3,-22,-14,  0,-19, -7, 11,  0,-10,-21,-23,-20,-11;
/M: SY='F';  M=-20,-28,-22,-36,-28, 70,-30,-12,  0,-26,  8,  0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 40,-28;
/M: SY='C';  M= -6,-21, 57,-28,-27,-11,-29,-28, -7,-25, -5, -7,-21,-33,-27,-24, -8, -1, 10,-40,-20,-27;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20,  0,-22;
/M: SY='E';  M= -9,  1,-25,  2, 20,-24,-19, -5,-25, 15,-20,-13,  1, -9, 12, 17,  3,  4,-19,-26,-14, 15;
/M: SY='N';  M=-12, 32,-22, 16,  0,-20, -4, 28,-22, -2,-28,-16, 50,-20,  2,  0,  6, -4,-30,-38,-12,  0;
/M: SY='D';  M= -8, 12,-20, 13,  5,-21,-18,-11,-17,  0,-17,-14,  5,-12, -4, -5,  5, 12, -8,-32,-14,  0;
/M: SY='V';  M= -2,-28,-16,-26,-24, -6,-28,-28, 21,-18,  3,  4,-28, -8,-26,-20,-10, -2, 35,-30,-14,-26;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N';  M= -3,  6,-20, -2, -1,-21,-15, -6,-14,  5,-18, -9, 11,-15,  7,  2,  5,  7,-11,-28,-13,  3;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M= -4, -4,-29, -5, -7,-32, 39, -9,-33,-10,-27,-14,  4,-17,  5,-10,  1,-16,-30,-21,-23, -1;
/M: SY='C';  M=-14,-22, 40,-31,-27, 16,-28,-17,-10,-24, -3,  0,-19,-32,-25,-21,-14, -8, -4,-19,  5,-25;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L';  M=-11,-19,-26,-22,-11, -9,-28,-15,  7, -4, 10,  8,-15,-21, -3,  5,-17, -9,  4,-21, -5, -9;
/M: SY='G';  M= -3,  9,-26, 10, -7,-29, 34,-12,-34,-12,-28,-21, 12,-17,-12,-14,  4, -9,-26,-28,-25,-10;
/M: SY='H';  M=-14, -2,-28, -6,-12, -2, -2, 26,-18,-10,-16, -8,  6,-24, -6, -8, -8,-12,-22, -6, 26,-12;
/M: SY='G';  M=  2, -8,-26, -8,-16,-28, 56,-18,-36,-18,-30,-20,  2,-18,-16,-18,  8,-12,-26,-24,-28,-16;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M=  2,  3,-17, -3, -2,-19, -9, -6,-13, -6,-19, -7, 10, -7,  3, -7, 15, 11,-13,-32,-16,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D';  M=-14, 30,-25, 45,  9,-31,-13, -7,-24, -5,-22,-21,  9,-14, -6,-12,  1, -6,-12,-38,-18,  1;
/M: SY='R';  M=  2, -6,-22, -7, -2,-24,  1, -7,-25,  4,-23,-13,  1,-15,  6, 16,  9, -2,-17,-26,-17,  0;
/M: SY='T';  M= -1,-14,-15,-19,-14, -2,-22,-19,  3,-19, 16,  3,-13,-19,-14,-15, -2, 17,  4,-26, -7,-14;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-24, -6, -5,-20, -7, -9,-21,  7,-19,-12,  0,-17, -1, 24,  2, -2,-12,-25,-14, -5;
/M: SY='Q';  M= -7, -7,-24,-10,  1,-17,-16,-10,  1, -8, -6,  3, -3,-14,  5,-10, -2, -3, -4,-26,-11,  2;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='T';  M=  2, -7,-22,-10, -2,-22,-17,-14,-11, -7,-16, -9, -6, 11,  4,-11,  8, 13,-11,-27,-16, -1;
/M: SY='V';  M= -6,-18,-18,-23,-19,  6,-24,-18, 11,-12,  3,  8,-13,-23,-17,-12, -8, -3, 15,-22, -3,-18;
/M: SY='P';  M=-10,  0,-27,  5,  3,-24,-18, -8,-14, -7,-13, -6, -6,  9,  5,-10, -4, -5,-15,-29,-16,  3;
/M: SY='Q';  M= -4,  8,-22,  9, 12,-32,-10,  2,-22,  1,-25,-12, 10,-11, 28,  0, 15,  1,-23,-31,-15, 20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	59 in 59 different sequences
Number of true positive hits	59 in 59 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	ExoN/MTase coactivator
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

59 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1), R1AB_BC279  (P0C6V9), R1AB_BC512  (P0C6W0),

R1AB_BCHK3  (P0C6W2), R1AB_BCHK4  (P0C6W3), R1AB_BCHK5  (P0C6W4), 
R1AB_BCHK9  (P0C6W5), R1AB_BCRP3  (P0C6W6), R1AB_CVBEN  (P0C6W7), 
R1AB_CVBLU  (P0C6W8), R1AB_CVBM   (P0C6W9), R1AB_CVBQ   (P0C6X0), 
R1AB_CVH22  (P0C6X1), R1AB_CVHN1  (P0C6X2), R1AB_CVHN2  (P0C6X3), 
R1AB_CVHN5  (P0C6X4), R1AB_CVHNL  (P0C6X5), R1AB_CVHOC  (P0C6X6), 
R1AB_CVM2   (P0C6X8), R1AB_CVMA5  (P0C6X9), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0), 
R1AB_CVPPU  (P0C6Y5), R1AB_FIPV   (Q98VG9), R1AB_IBVB   (P0C6Y1), 
R1AB_IBVBC  (P0C6Y2), R1AB_IBVM   (P0C6Y3), R1AB_MERS1  (K9N7C7), 
R1AB_PEDV7  (P0C6Y4), R1AB_SARS   (P0C6X7), R1AB_SARS2  (P0DTD1), 
R1A_BC133   (P0C6F7), R1A_BC279   (P0C6F5), R1A_BC512   (P0C6F6), 
R1A_BCHK3   (P0C6F8), R1A_BCHK4   (P0C6T4), R1A_BCHK5   (P0C6T5), 
R1A_BCHK9   (P0C6T6), R1A_BCRP3   (P0C6T7), R1A_CVBEN   (P0C6T8), 
R1A_CVBLU   (P0C6T9), R1A_CVBM(P0C6U0), R1A_CVBQ(P0C6U1), 
R1A_CVH22   (P0C6U2), R1A_CVHN1   (P0C6U3), R1A_CVHN2   (P0C6U4), 
R1A_CVHN5   (P0C6U5), R1A_CVHNL   (P0C6U6), R1A_CVHOC   (P0C6U7), 
R1A_CVM2(P0C6U9), R1A_CVMA5   (P0C6V0), R1A_CVMJH   (P0C6V1), 
R1A_CVPPU   (P0C6V2), R1A_IBVB(P0C6V3), R1A_IBVBC   (P0C6V4), 
R1A_IBVM(P0C6V5), R1A_MERS1   (K9N638), R1A_PEDV7   (P0C6V6), 
R1A_SARS(P0C6U8), R1A_SARS2   (P0DTC1)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

91 PDB

2FYG; 2G9T; 2GA6; 2XYQ; 2XYR; 2XYV; 3R24; 5C8S; 5C8T; 5C8U; 5NFY; 6W4H; 6W61; 6W75; 6WJT; 6WKQ; 6WKS; 6WQ3; 6WRZ; 6WVN; 6XKM; 6YZ1; 6ZCT; 6ZPE; 7BQ7; 7C2I; 7C2J; 7DIY; 7EIZ; 7JHE; 7JIB; 7JPE; 7JYY; 7JZ0; 7KOA; 7L6R; 7L6T; 7LW3; 7LW4; 7MC5; 7MC6; 7N0B; 7N0C; 7N0D; 7NH7; 7O7Y; 7O7Z; 7O80; 7O81; 7ORR; 7ORU; 7ORV; 7ORW; 7R1T; 7R1U; 7ULT; 8A23; 8BSD; 8BZN; 8BZV; 8C0G; 8C5M; 8EIR; 8F4S; 8F4Y; 8OSX; 8OT0; 8OTO; 8OTR; 8OV1; 8OV2; 8OV3; 8OV4; 8RV4; 8RV5; 8RV6; 8RV7; 8RV8; 8RV9; 8RVA; 8RVB; 8RZC; 8RZD; 8RZE; 8S8W; 8S8X; 8TYJ; 9EMJ; 9EML; 9EMV; 9EUN
» more