Home  |  Contact
Entry: PS51953

General information about the entry

Entry name [info] NIV_EXON
Accession [info] PS51953
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 07-APR-2021 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE;
02-JUN-2021 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51953
Associated ProRule [info] PRU01298

Name and characterization of the entry

Description [info] Nidovirus 3'-5' exoribonuclease (ExoN) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=217;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=212;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4458640; R2=0.0113829; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=594; N_SCORE=9.2; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=357; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -6, -9,-17,-10,-12, -7,-20,-13,  4,-15,  9, 10,-12,-20,-10,-14, -4,  4,  6,-28, -8,-11;
/M: SY='F';  M=-16,-27,-21,-32,-26, 46,-30,-11,  7,-23, 13,  4,-23,-30,-28,-17,-20, -8,  6,  5, 33,-26;
/M: SY='V';  M= -7,-25, -2,-28,-23, -5,-31,-25, 17,-17, 12,  8,-22,-26,-20,-17,-17, -7, 19,-27, -8,-23;
/M: SY='T';  M= -6, -8,-18,-14,-12, -5,-22,-11, -6,-10, -7, -1, -8, -1, -9,-11,  5, 25, -4,-20,  2,-12;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='R';  M=-12,-12,-24,-14, -6,-14,-21, -9, -8, 15,-10, -2, -7,-17,  0, 30,-10, -7, -2,-19, -7, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
/M: SY='D';  M=-12, 32,-24, 46, 20,-31, -9, -1,-31,  0,-25,-24, 14, -7,  3, -7,  5, -5,-24,-34,-17, 11; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='E';  M= -7, -2,-23,  1, 24, -3,-19, -2,-17, -1,-10,-11, -6, -9,  3, -6, -5, -8,-17,-12,  2, 13; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='A';  M= 23,-10, -2,-14, -3,-15, -9,-16, -9,-10, -3, -7,-11,-12, -8,-16,  1, -3, -3,-21,-16, -5; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='M';  M= -9,-17,-23,-17, -5, -8,-23,-13,  8,-10,  6,  9,-15, -3, -6, -8,-14, -8,  2,-21, -8, -8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='R';  M=-10, -6,-22, -7, -5,-16,-16, -7,-14,  6,-16, -9,  1, -1, -2, 20, -4, -1,-10,-24,-13, -6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='H';  M=-14, 10,-25, 10,  4,-19,-14, 28,-23,  7,-20, -9, 11,-15,  8,  7, -5,-10,-23,-21,  4,  4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V';  M= -1,-26,-10,-26,-25,  1,-26,-25, 25,-19, 14, 10,-26,-26,-25,-17,-11, -1, 39,-25, -7,-25; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='R';  M=-10, -5,-23, -7, -1,-20, -6, -6,-24, 15,-19, -9,  0,-14,  6, 27, -2, -1,-17,-19,-11,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='A';  M= 17, -7,-16, -9, -6,-20,  5,-15,-17,-10,-20,-14, -3,  5, -7,-15, 13,  2,-11,-25,-20, -7; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='W';  M=-12,-25,-32,-25,-19,  8,-18,-15, -9,-16, -7, -9,-24,-24,-13,-15,-20,-14,-15, 66, 23,-15; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='I';  M= -5,-22,-18,-26,-22, -3,-14,-19, 18,-19, 13, 16,-19,-21,-17,-18,-14, -8, 18,-20, -6,-21; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='G';  M=  0,-17,-18,-17,-22,-14, 20,-22, -6,-17,-10, -5,-12,-22,-22,-17, -4, -9,  7,-22,-18,-22; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='F';  M=-16,-27, 16,-37,-29, 42,-30,-22, -3,-29,  4,  0,-20,-31,-33,-23,-17,-10,  0,-10, 10,-29;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='V';  M=  5,-16,-15,-22,-20, -5,-21,-21, 16,-18,  7,  4,-11,-24,-19,-18, -7, -3, 21,-27,-11,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='F';  M= -1,-16,-20,-23,-21, 17,  8,-20,-16,-21, -9, -9, -9,-21,-25,-18, -3, -3,-10,-10, -2,-21;
/M: SY='F';  M=  8,-20, -8,-28,-19, 14,-18,-18,  0,-19,  8,  5,-17,-21,-19,-19, -8, -3,  2,-15, -1,-18;
/M: SY='H';  M= -8,  3,-26, -1, -2,-20,-14, 70,-26, -9,-20, -4, 13,-18,  6, -3, -4,-14,-25,-30,  9, -2;
/M: SY='V';  M= 13,-17,-16,-20,-10,-11,-20,-22, 10,-13,  0,  0,-18,-18,-15,-18, -3, -3, 19,-26,-14,-13;
/M: SY='R';  M= -9, -6, -5,-10, -5,-19,-22,  0,-19,  8,-18, -8, -2,-17, -2,  9, -2,  2,-12,-28, -9, -5;
/M: SY='H';  M=-11, -5,-30, -5, -4,-25,  9, 20,-33,  7,-25,-10,  3,-18,  0, 13, -7,-16,-26,-23, -8, -4;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D';  M=-11, 12,-27, 19, 15,-28,-14, -4,-23,  0,-22,-17,  4, 15,  7, -7, -1, -5,-24,-28,-18, 10; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='N';  M=  0,  5,-17, -4, -7,-13,-11,  5, -5, -9,-12, -6, 14,-14, -4, -9,  5,  4, -8,-27, -8, -7; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='V';  M= -2,-15, -1,-19,-18, -3,-21,-20, 12,-15,  2,  2,-14,-18,-17,-15, -2,  9, 20,-22, -8,-18; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-24, -9,-13,-23, 35,-17,-28,-15,-23,-16, -3, -1,-15,-16,  2, -5,-21,-20,-23,-15; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='T';  M= -1, -3,-13,-10,-10, -6,-19,-14,-10,-10,-11,-10, -1,-13, -9,-10, 17, 38, -3,-23,  1,-10;
/M: SY='N';  M=-10, 18,-22,  7,  4,-15,-10,  3,-11, -4,-11, -4, 29,-18,  0, -4, -1, -4,-20,-33,-15,  2;
/M: SY='H';  M=-10,-15,-23,-14, -7, -7,-13,  1, -7,-11,  0,  0,-12,-22,-10, -3,-12,-11, -3,-23, -5, -9;
/M: SY='P';  M=  7,-19,-28,-15, -6,-24,-16,-21,-11,-11,-20,-14,-19, 49,-13,-20, -5, -6,-12,-27,-25,-13;
/M: SY='L';  M= -9,-22,-24,-22,-18, -1, -2,-17, -4,-18, 16,  4,-17,-26,-17, -6,-19,-13, -6,-18, -8,-18;
/M: SY='Q';  M=-10,  4,-27,  1, 18,-31,-17,  7,-16,  6,-16,  2,  5,-11, 39,  5, -1, -9,-25,-24,-11, 28;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-20,-16,-17, -2,-26,-18, 16,-20, 21, 15,-20,-25,-17,-18,-18, -7, 16,-26, -6,-17;
/M: SY='G';  M= 15, -9,-22,-12,-15,-26, 41,-19,-29,-16,-24,-17, -2,-16,-15,-19,  8, -9,-19,-23,-26,-15;
/M: SY='F';  M=-14,-29,-21,-35,-27, 42,-31,-18, 14,-26, 15,  7,-23,-29,-29,-20,-20, -8, 12, -1, 22,-27;
/M: SY='S';  M=  0,-10,-17,-12,-10, -7,-12, -7, -3,-13,-12, -1, -2,-16, -4,-13, 15,  8, -2,-24,  0, -8;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='T';  M= -2, -3,-14,-12,-13,-10,-19,-17,  1,-13, -8, -6,  3,-15,-11,-13, 11, 24,  5,-31,-11,-13;
/M: SY='G';  M= -8,  5,-29, 11, -4,-29, 23,-11,-30,-12,-18,-15,  2,-17, -4,-13, -4,-15,-25,-26,-21, -4;
/M: SY='V';  M=  3,-21,-22,-24,-17, -7,-21, -9,  2,-13,  1,  1,-19,-22,-14,-14,-13, -9,  7, -2, -1,-16;
/M: SY='D';  M=-10, 20, -6, 21, 12,-28,-12, -4,-29,  3,-27,-21, 16,-14,  0, -4,  4, -4,-24,-37,-20,  6;
/M: SY='F';  M= -5,-19,-22,-25,-17, 24,-11,-11, -8,-18, -1, -3,-14,-23,-15,-15,-11,-10, -9, -2, 14,-15;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-16,-28,-25,  4,-29,-21, 23,-20, 12,  9,-24,-27,-22,-19,-11, -2, 30,-20,  4,-25;
/M: SY='V';  M=  2,-17,-15,-22,-22, -4,-23,-21, 19,-18,  8,  6,-12,-25,-20,-18, -8, -3, 24,-28,-10,-22;
/M: SY='T';  M=  1, -8,-20,-13, -2,-18,-20,-12, -6, -3, -9, -3, -6,-13,  6,  0,  2,  8, -4,-24,-11,  1;
/M: SY='P';  M= -5,-18,-32,-14, -7,-22, -9,-20,-15,-14,-15,-13,-17, 45,-13,-19, -8, -6,-20,-27,-23,-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='E';  M=-11,  6,-22, 10, 16,-21,-17, -4,-21,  8,-16,-13,  1,-10,  5, 14, -1, -1,-15,-25,-13,  9; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='G';  M= -4,-12,-26,-10,-11,-20, 23,-16,-22, -9,-14,-10, -7, -4,-12,-11, -7,-13,-19,-19,-19,-12; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='V';  M= -5,-15,  2,-18,-14, -8,-21,-15,  1, -7, -4,  1,-13,-20,-12, -9, -5, -3,  7,-23, -5,-14; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='V';  M= -2,-24,-18,-27,-23, 10,-24, -7,  6,-19,  0,  2,-20,-26,-22,-17,-12, -7, 16, -7,  4,-22;
/M: SY='L';  M= -9,-13,-21,-12,-16,  8,-25,-14,  7,-18,  9,  2,-16,-24,-19,-18,-14, -7,  9,-16,  7,-18;
/M: SY='T';  M= -4,  7,-18,  6,  1,-20,-14,-12,-19, -7,-20,-17,  6,  3, -5,-10, 15, 23,-13,-34,-17, -2;
/M: SY='E';  M= -2, 12,-24, 12, 31,-25,-12, -1,-25,  5,-21,-18, 12, -7, 10,  1,  5, -5,-24,-31,-19, 20;
/M: SY='D';  M=-11,  7,-29, 10,  7,-25, -6, -1,-26,  5,-23,-15,  4,-13,  0, -1, -5, -9,-22,-16,-11,  3;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-23,-11,-16,-12, 32,-17,-27,-17,-22,-16,  2,-19,-17,-16,  6, -3,-20,-21,-18,-16;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='N';  M= -7, 10,-19,  7, -1,-15,-10, -1,-14,  2,-16, -4, 12,-13,  0, -2,  3,  1,-13,-25, -7, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='S';  M=  4, -5, -3, -9, -5,-14,-11,  2,-10,-10,-12, -4, -1,-16, -5,-11,  6, -1, -4,-28,-11, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='I';  M=  0,-17,-16,-25,-19, 10,-22,-20, 11,-19,  7,  3,-13,-17,-18,-18, -5,  6, 11,-15,  0,-19; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='T';  M= -6, -6,-17, -8,  3, -2,-20,-13, -9, -1, -8, -7, -7,-12, -6, -4,  0,  9, -2,-20, -6, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='P';  M=  1,-13,-24,-12,-10,-14,  1,-11,-15, -6,-16,-10,-10,  5,-10, -8, -5, -8,-12,-14, -6,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='V';  M=  1,-25,-12,-26,-24,  0,-25,-24, 24,-19, 14, 10,-24,-24,-23,-18,-11, -2, 33,-23, -7,-24; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='P';  M=  4, -7,-23, -8, -3,-21,-11,-13,-14, -1,-19,-12, -4, 23, -6, -6, -2, -5,-14,-24,-19, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='A';  M= 26, -6,-14,-11, -3,-20, -5,-14,-15,  7,-15, -9, -5, -9, -3, -4,  5, -1, -6,-19,-15, -3; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-22, -4,  1,-20, -3, -6,-24, 23,-20, -9,  0,-11,  4, 26, -6, -9,-16,-15,-10,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='A';  M= 11,-12,-12,-14,-10, -9,-10,-15,  4, -9, -3, -2,-11,  3,-10,-13, -2, -2,  6,-15,-10,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='P';  M= -7,-11,-31, -6,  0,-26, -4,-15,-23,  5,-26,-15, -9, 36, -5, -5, -7,-10,-24,-22,-21, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='P';  M= -7,-14,-30, -9, -2,-23,-17,-17,-16, -9,-23,-16,-14, 63, -9,-16, -4,  0,-21,-26,-23, -9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='G';  M= -4,  8,-23, 13, -4,-27, 30,-11,-32,-11,-26,-20,  7,-13, -9,-13,  6, -9,-23,-26,-22, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -9,  2,-24,  8, 29,-18,-18, -3,-14,  0, -4, -3, -5, -7,  9, -4, -6, -9,-16,-24,-12, 19; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='Q';  M=-12,  1,-27, -3, 10,-19,-19,  5,-17,  3,-17, -3,  5,-14, 37,  4, -2, -9,-25,-18, -5, 24;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-26,-34,-25, 46,-23,-21, -8,-24, -4, -8,-21,-27,-29,-18,-16,-11, -9, 39, 22,-23;
/M: SY='R';  M= -9,  1,-24,  1, -1,-21,-17, -8,-20, 16,-19,-11,  2,-17,  0, 25, -4, -4,-10,-26,-13, -2;
/M: SY='H';  M=-19, -8,-30, -8, -7, -1,-24, 53,-18, -2,-13, -1, -4,-23,  2,  0,-14,-15,-20, -4, 41, -7;
/M: SY='L';  M=-12,-24,-22,-28,-17, 11,-27,-12, 14,-20, 25, 25,-21,-24, -8,-14,-21,-10,  5,-15,  3,-12;
/M: SY='K';  M= -9, -8,-24,-13, -9,-15,-22,-12,  0, 11, -9,  6, -3,-18, -4,  6,-10, -7,  2,-24, -9, -7;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='P';  M= -8,-13,-31, -8,  2,-27,-18,-12,-19,  2,-25,-14,-10, 35,  3,  1, -2, -5,-21,-28,-21, -1;
/M: SY='L';  M=-12,-18,-22,-17,-16,  3,-27,  1,  7,-21, 22,  9,-19,-27,-15,-15,-21,-10,  5,-18, 10,-16;
/M: SY='M';  M=-12,-20,-23,-25,-17,  6,-24, -4, 10, -7, 16, 32,-19,-22, -6, -7,-21,-10,  3,-12, 10,-12;
/M: SY='R';  M= -3, -9,-25, -9, -2,-19,-14,  0,-22,  8,-21,-12, -3, -2,  2, 20,  1, -4,-17,-23, -8, -3;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M= -8, -3,-25, -3, 11,-22,-19, -8,-14, 19,-17, -6, -2, -9, 10, 12, -5, -7,-13,-20, -9,  9; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= 21, -2,-18, -9,-11,-23, 22,-15,-22,-12,-22,-16,  5,-15,-11,-16, 11, -4,-15,-25,-23,-11;
/M: SY='Q';  M= -8, -7,-27, -7, 11,-23,-21, -2,-16,  8, -7, -2, -6,-15, 21, 16, -8, -9,-18,-21,-10, 14;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-32,  0, 19,-31,-19, -9,-24, 10,-25,-15, -7, 26, 11,  0, -5, -9,-26,-26,-20, 14;
/M: SY='W';  M= -4,-25,-36,-28,-20, -6, -8,-25,-13,-11,-16,-12,-23,-22,-15,-15,-21,-19,-16, 58,  6,-16;
/M: SY='N';  M=-10,  8,-25,  6,  4,-25,-12, 12,-25,  6,-26,-13, 15, -8, 11, 10,  5, -4,-24,-31,-12,  6;
/M: SY='V';  M=  2,-17,-18,-19,-11, -5,-24,-17, 10,-13,  1,  1,-16,-19,-14,-16, -4,  3, 15,-20,  0,-14;
/M: SY='V';  M= -5,-10, -1, -9,-13,-14,-22,-20, -2, -9, -7, -5,-12,-22,-15,-12, -3, -2, 10,-33,-14,-14;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-27, -3, -2,-15,-18,  0,-24, 15,-17,-11, -2,-19,  3, 36, -8, -9,-17,-15,  1, -3;
/M: SY='R';  M=-10,-12,-27,-11,  1,-18,-24,-14, -8,  2,-13, -7,-10,  4, -4,  6, -6, -1, -6,-26,-14, -4;
/M: SY='R';  M=-14,  3,-29,  1, 10,-26,-17, 14,-27, 20,-23, -9,  9,-15, 17, 29, -5,-10,-25,-25, -8, 11;
/M: SY='I';  M= -2,-20,-24,-26,-18, -9,-28,-10, 19,-13,  3,  8,-14,-19,-13,-16,-12, -8, 15,-23, -3,-18;
/M: SY='I';  M= -1,-28,-18,-32,-26,  1,-30,-26, 29,-25, 22, 14,-26,-26,-23,-23,-17, -5, 29,-24, -5,-26;
/M: SY='Q';  M=-12,-12,-25,-14, -2, -6,-24, 10, -8,-10,  3,  4, -9,-19, 13, -5,-10, -7,-13,-18,  2,  5;
/M: SY='M';  M=  1,-14,-21,-21,-14, -7,-14, -3, -3,-11, -3, 15,-12,-17, -5,-12, -4,  0, -4, -2, -1, -9;
/M: SY='M';  M=-13,-21,-23,-25,-18,  7,-27, 12,  9,-21, 15, 18,-15,-24,-12,-15,-19,-12,  4,-20,  8,-17;
/M: SY='C';  M=  7,-17, 12,-24,-19,-12,-18,-20,  2,-18, -5,  2,-14,-22,-15,-20,  1, -1,  9,-31,-15,-18;
/M: SY='D';  M= -6,  9,-24, 16,  5,-22,-16, -9,-17, -2,-10,-12, -1,-16, -5, -1, -5, -7, -9,-30,-15, -1;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='F';  M= -9, -3,-14,-10,-12, 13,-15,  0, -4,-11, -5, -4,  3,-17,-13, -8, -3,  2, -4,-11,  8,-12; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='L';  M= -4,-21,-15,-25,-17, 17,-21,-16, 13,-21, 20,  8,-17,-19,-18,-16,-15, -7,  8, -9,  4,-17; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='B';  M=  3,  7, -9,  5,  1,-21, -9, -5,-15,  0,-16,-10,  6,-12,  4, -5,  1, -4,-12,-24,-14,  3; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='T';  M= -3,  2,-18, -2, -6,-18,  2,-14,-19, -6,-18,-13,  3, -3, -8, -8,  7, 15,-13,-25,-15, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='T';  M= -5, -3,-14, -9,-10, -6,-16, -3, -2,-13,  3, -1,  1,-17, -9,-10,  0, 10, -2,-26, -6,-10; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='S';  M= -1, -3,-17, -2, -5,-15,-14,-12,-11, -6,-10, -9, -2,-17, -6, -1,  8,  6, -3,-31,-14, -6;
/M: SY='D';  M=-12, 32,-25, 35,  5,-29,  4, -3,-31, -4,-27,-23, 25,-14, -4, -9,  5, -1,-26,-36,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-12,-17,-17,-19,-14, -7,-13, -9, -9, -5, -3, -3,-11,-24, -9, 10,-11, -9, -6,-16,  1,-14;
/M: SY='V';  M= -8,-27,-14,-27,-20,  2,-28,-25,  8,-21,  3,  1,-24,  3,-24,-21,-15, -7, 10,-24, -9,-23;
/M: SY='V';  M= -5,-19, -4,-22,-21, -7,-27, -8, 10,-18,  0,  3,-16,-25,-19,-17, -5,  5, 22,-31, -6,-21;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-21,-35,-27, 59,-30,-15,  4,-27, 17,  4,-22,-30,-32,-19,-22,-10,  1,  6, 30,-27;
/M: SY='V';  M= -4,-28,-16,-30,-28,  5,-31,-22, 28,-20, 10, 10,-27,-29,-26,-20,-13, -3, 38,-20,  5,-28;
/M: SY='L';  M=-10,-23, -9,-28,-20, 15,-28,-21,  8,-26, 27,  8,-22,-27,-22,-19,-17,  2,  5,-19,  1,-20;
/M: SY='W';  M=-18,-31,-44,-31,-23,  7,-21,-20,-19, -8,-19,-16,-31,-27,-14,-11,-33,-24,-26,108, 30,-15;
/M: SY='A';  M= 21, -1, -6, -8, -8,-21,  7,-14,-19,-11,-21,-16,  5,-14, -8,-15, 16,  2,-11,-30,-22, -8;
/M: SY='G';  M=  3, -6,-26, -8, -8,-25, 19, 13,-30, -5,-24,-11,  1,-17, -6, -7, -2,-15,-23,-23,-12, -8;
/M: SY='G';  M= -6, -6,-29, -6, -5,-29, 22,-12,-33,  9,-28,-14,  1,-16,  0,  8, -2,-13,-25,-21,-20, -3;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-19,-21,-17, 15,-22,-15,  6,-23, 22,  6,-11,-26,-18,-16,-14, -5,  0,-20,  0,-17;
/M: SY='D';  M=-15, 32,-30, 47, 38,-35,-15,  0,-35,  5,-25,-25, 11, -5,  9, -5,  0,-10,-30,-35,-20, 24;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-20,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-28, 40, 18,-29,-29,-22,-21,-26, -8, 19,-22, -2,-23;
/M: SY='T';  M= -1, -3,-19, -7,  2,-17,-18,-15,-16, -2,-15,-13, -3,  3, -3,  0,  9, 23,-10,-28,-15, -2;
/M: SY='A';  M= 19, -9, -4,-18,-12, -5,-11,-19,-11,-14,-11,-11, -7,-14,-14,-17, 12, 15, -2,-23,-12,-12;
/M: SY='L';  M= -6,-26,-21,-31,-21,  4,-27,-16, 23,-23, 33, 29,-24,-24,-14,-19,-23, -9, 12,-20, -1,-18;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-25,-14, -6,-14,-23,-12, -9,  9, -6, -2, -6,-18, -2, 20, -7,  0, -6,-23, -8, -6;
/M: SY='Y';  M=-15,-12,-33,-11, -9, -1,-22,  2,-11, -9,-16,-11,-10, 20, -9,-13,-12, -9,-21, -4, 22,-13;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='F';  M=-12,-26,-16,-31,-24, 39,-26,-19, 10,-25, 19,  7,-21,-26,-28,-17,-18, -7, 10, -5, 12,-24; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='V';  M= -1,-20, -3,-23,-19, -1,-22,-20, 17,-18, 12,  7,-19,-20,-18,-17,-11, -3, 21,-20, -7,-19; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='K';  M=-11,  5,-29,  3,  9,-29,-17, 10,-27, 31,-27, -9,  9,-13, 15, 20, -6,-10,-24,-24, -7, 11;
/M: SY='I';  M=-11,-24,-28,-29,-19,  3,-32,-24, 19,-15,  7,  7,-18, -7,-17,-17,-17, -9, 10,-18, -2,-21;
/M: SY='G';  M= -1,-16,-24,-19,-21,-17, 18,-22, -5,-21,-12, -6, -8,-20,-18,-21,  0, -9, -1,-24,-18,-21;
/M: SY='G';  M= -3, -6,-26, -7,  1,-24,  7,-12,-24,  4,-20, -9, -3, -7, -3,  0, -2, -5,-19,-23,-18, -2;
/M: SY='E';  M=-11,  8,-28, 12, 23,-24,-20, -7,-13, -2,-15,-13,  4, -2,  3, -9, -3, -8,-16,-31,-17, 12;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Q';  M=  0, -7,-22, -8,  1,-17, -5, -3,-15,  1,-14, -6, -6,-14,  8,  0, -3, -8,-13,-12, -2,  3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='T';  M= -5, -7,-19,-11, -7,-16,-22,-11, -9, 10,-13, -4, -7,-16, -6,  3, -1, 11,  3,-26, -8, -7;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H';  M= -6, -7, -3, -7,  3,-13,-18,  4,-17,-10,-16,-10, -4,-17, -1,-10,  4, -3,-10,-31, -9,  1;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -4, -1,-14, -5, -6,-10,  3, -6, -8,  0, -7, -1,  3,-12, -5, -2, -4, -6, -7,-15, -9, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C';  M=-12, -9, 97,-15,-22,-23,-27,-25,-32,-25,-22,-22,-14,-35,-25,-27, -8,-10,-13,-48,-28,-24;
/M: SY='G';  M= -4,  0, -3, -4,-15,-25, 29,-17,-32,-17,-26,-19,  6,-21,-17,-17,  2, -6,-23,-30,-26,-16;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-26,  0,  5,-25,-16, -7,-27, 33,-27,-12,  8,-13,  7, 27, -3, -3,-19,-24,-12,  5;
/M: SY='R';  M= -5, -7,-25, -7,  7,-23,-17, -4,-22, 14,-17,-10, -3,-15, 12, 30, -1, -6,-15,-23,-13,  7;
/M: SY='A';  M= 39,-12,-13,-20,-12,-12, -5,-14, -8,-10, -8, -8,-12,-13,-10,-18,  5, -2, -2,-12, -5,-12;
/M: SY='T';  M=  0,-10, -1,-19,-17,  1,-22,-22, -5,-15, -6, -7, -9,-18,-18,-15,  8, 28,  6,-26, -7,-17;
/M: SY='F';  M= -9,-22, 15,-28,-25, 18,-27,-13, -5,-21, -3, -5,-19,-30,-24,-19,-12, -5,  1, -9, 18,-25;
/M: SY='F';  M=-18,-23,-24,-28,-24, 50,-29, -2, -1,-19,  4, -1,-18,-28,-24,-15,-17, -5, -5, 16, 50,-24;
/M: SY='S';  M= 10,  9,-13,  1, -3,-19, -3, -8,-17, -7,-24,-17, 19,-13, -3, -9, 25, 16,-12,-36,-19, -3;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='S';  M= -1,  4,-17,  5,  0,-20,-11,-11,-13, -2,-20,-13,  5,-10, -2, -7, 15,  8, -8,-31,-14, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='H';  M= -8, -7,-21, -5,  1,-16,-18, 22,-13, -6,-14, -5, -3, -9, -1, -3, -1, -6, -7,-28, -4, -2; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-25, -3,  8,-22,-11, -7,-23, 10,-18,-11, -1,-13,  7, 17,  1,  0,-18,-25,-14,  6;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='N';  M= -4,  5,-18,  1, -5,-20,  6, -7,-15, -7,-18,-11,  9,-15, -1, -8,  5, -1,-12,-26,-16, -3; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='H';  M= -5,  0,-21,  1,  6,-19,-16,  9,-16,  4,-16, -7, -1,-12,  8,  1,  0, -3,-13,-21, -2,  6; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='Y';  M=-12,-17, -9,-19,-18,  6,-14, -6,-13,-15,-12, -9,-15, -9,-16,-16, -9, -3,-14, -5, 19,-19;
/M: SY='Y';  M=  7,-14,-12,-20,-14,  4,-13, -9,-12, -5,-10, -7,-12,-20,-13,-10, -7, -7, -8, -5, 12,-14;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='W';  M=-15,-11,-13,-16,-12, -2,-20,  3,-21, -9,-18,-11, -6,-24, -4, -8,-15,-15,-22, 17,  6, -7;
/M: SY='Q';  M= -6, -7,-25,-12, -4,-17,-21,  3, -7,  2, -6,  0, -3,-17,  5,  2, -8, -6, -9,-23, -5, -1;
/M: SY='H';  M=-19,  0,-30,  0,  3,-23,-20, 88,-29, -7,-20,  0,  9,-19, 17,  1, -9,-19,-30,-29, 16,  5;
/M: SY='A';  M= 15,  1, -8, -7, -6,-20, -6, 11,-19,-10,-19,-12,  8,-15, -4,-11, 10, -1,-13,-31,-12, -6;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-13,-18,-15,-19, -5, 11,-26,-12, -5,-16,  4, -2,-17,-14, -9,-13,-14, -9, -7,-14,  3, -6;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -6,  0,-25, -1, -5,-24, 16,  5,-25, -9,-24,-13,  8, -2, -2, -9,  1,-10,-25,-24,-16, -4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C';  M=-12,-25, 14,-29,-22,  4,-30,-21,  0,-26,  7, -1,-23,-13,-23,-23,-18,-10, -2,-23, -4,-24;
/M: SY='D';  M= -3, 15,-21, 20,  0,-23,-14, -9,-15, -7,-13, -7,  1,-14, -7,-13,  0,  0, -6,-32,-15, -3;
/M: SY='Y';  M=-16,-14,-29,-15,-14, 11,-14, 19,-13, -5,-10, -4,-11,-25, -8, -5,-15,-13,-16,  8, 43,-14;
/M: SY='V';  M= -7,-26,-17,-30,-25, 11,-30,-25, 21,-24, 19, 10,-23,-26,-25,-20,-14,  1, 24,-21, -1,-25;
/M: SY='Y';  M=-12,-22,-23,-24,-21, 14,-30, -4, 12,-17, 10,  6,-20,-26,-15,-15,-15, -1,  7,  0, 34,-21;
/M: SY='N';  M=-13, 27, -4, 17, -1,-23, -8,  2,-26,  0,-27,-20, 36,-21, -3,  3,  3, -4,-26,-39,-20, -2;
/M: SY='P';  M= -4,-20,-32,-15, -7,-15,-20,-14,-11,-13,-13,-11,-20, 44,-11,-18,-11, -9,-18,-18, -8,-13;
/M: SY='Y';  M=-15, -8,-25,-13, -7,  7,-22, -3,-11,  2, -6, -3, -3,-22, -1,  7,-12, -9,-14,-10, 10, -5;
/M: SY='I';  M= -2,-26,-13,-34,-25,  3,-30,-25, 26,-26, 16, 14,-21,-23,-20,-25,-16, -8, 18,-21, -3,-25;
/M: SY='I';  M=-10,-25,-25,-31,-24, -2,-34, -9, 30,-25, 16, 15,-19,-23,-17,-22,-18,-10, 22,-23,  1,-24;
/M: SY='D';  M=-19, 49,-29, 64, 17,-37, -9,  1,-37,  0,-30,-29, 25,-11,  0, -9,  1, -9,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-20,-34,-27,  1,-33,-25, 35,-24, 20, 22,-25,-25,-21,-23,-18, -6, 32,-24, -4,-26;
/M: SY='Q';  M= -8,  3,-10,  4,  9,-33,-18,  0,-25,  4,-21, -9,  0,-15, 27,  7, -2, -9,-24,-27,-15, 17;
/M: SY='Q';  M= -8,  6,-26,  9,  7,-31, -4, 11,-26, -2,-23,-11,  6,-13, 21, -2,  5, -4,-25,-28,-11, 13;
/M: SY='W';  M= -8,-21,-40,-20,-20, -5, -4,-24,-24,-16,-21,-20,-23,-24,-16,-19,-23,-22,-26, 82,  9,-15;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='G';  M=  4, -8,-23, -9, -5,-21, 24,-16,-18,-13,-16,-11, -4,-13,-10,-16, -1,-12,-15,-19,-19, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='Y';  M=-15, -8,-23,-12,-10, 16,-21,  9, -6, -7, -6, -3, -4,-22, -1, -6,-10, -7,-13,  6, 36, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='T';  M=  0, -8,-11,-12,-10,-10,-17,-18, -1, -4, -8, -4, -7,-14,-10, -6,  8, 17, 10,-26,-10,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='G';  M= -1, -6,-23, -7,-11,-24, 35,-13,-28,-12,-22,-13,  0,-15, -5,-12,  3, -5,-21,-19,-20, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='N';  M= -1, 12,-17,  5,  1,-21, -4, -3,-22,  4,-29,-18, 23,-14,  2,  5, 20,  7,-18,-36,-18,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M=  1, -3,-18, -4,  7,-22,-16, -8,-12, -3,-16, -8, -2,-11, 13, -5, 12, 10, -8,-29,-14, 10;
/M: SY='T';  M= -5, -1,-18, -5,  0,-11,-17,-11,-10,  0,-13, -5,  2,-15, -4, -3,  5,  9, -5,-28,-11, -2;
/M: SY='N';  M= -9, 14, -2,  2,  0,-17,-12, -2,-15, -5,-17, -7, 22,-19, -2, -7,  3,  2,-17,-36,-17, -1;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='D';  M=-10, 34,-26, 42, 11,-32, -9, 12,-32, -3,-26,-22, 20,-13,  0, -9,  1, -9,-26,-36,-15,  5;
/M: SY='Q';  M=  1, -6,-22, -7, 10,-20,-15, -5,-11, -2, -7,  1, -6,-12, 12, -2,  1, -4,-12,-25,-13, 11;
/M: SY='I';  M= -9,-26,-23,-30,-25,  1,-33,-10, 28,-23, 15, 13,-21,-25,-19,-21,-17, -8, 23,-21,  5,-25;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N';  M= -9, 18,-23, 13,  4,-24,-10, -1,-25, 10,-26,-16, 23,-15,  6, 11,  7,  2,-22,-32,-16,  4;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A';  M= 13, -3, -8, -7, -1,-12, -5, -7, -7, -3, -7, -4, -3, -5,  4, -6,  5,  5, -4,-12, -8,  1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -5,-11,-20,-16,-14, -8,-22,-12, 11,-13, -4,  1, -4,-21, -6,-13, -2, -1, 11,-25, -4,-12;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-28,-10,-12,-28, 41,-15,-34, -6,-26,-16, -1,-18, -8, -3, -1,-16,-26,-20,-24,-11;
/M: SY='N';  M= -9, 10,-23,  3, -8,-17, -4, -1,-10,-10,-14, -3, 15,-17, -6,-10,  0,  0,-13,-30,-12, -8;
/M: SY='A';  M= 42, -7,-13,-15,  0,-21, -3,-17,-13, -7,-11,-11, -9, -9, -6,-17,  9, -1, -4,-21,-20, -3;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='V';  M= -7,  1,-18,  7, -2,-16,-22,-16, -3, -9, -8, -8, -8,-18,-13,-13, -2,  2, 11,-33,-14, -7;
/M: SY='A';  M= 27,-15,-18,-19,-10,-20, -9,-21, -8,-11,-13,-10,-15, 15,-13,-20,  2, -3, -2,-24,-21,-13;
/M: SY='S';  M=  4, -7,-14,-10, -7,-14, -9,-12, -4,-13,-16, -3,  1,-13, -3,-13, 23, 11, -1,-34,-14, -6;
/M: SY='A';  M= 23,-11, -6,-18,-16,-17,  1,-20, -8,-14,-12, -9, -8,-18,-16,-19,  5, -2,  3,-26,-20,-16;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='A';  M= 22,-15, 10,-23,-18,-14,-15,-24, -3,-16, -6, -6,-15,-20,-18,-20,  3,  5, 11,-28,-18,-18;
/M: SY='I';  M=-12,-14,-29,-23,-16, -9,-29,-18, 19, -7,  1,  6, -4,-19, -9, -3,-13, -9,  8,-23, -5,-16;
/M: SY='M';  M=-11,-20,-21,-29,-20,  4,-21,  3, 17,-10, 17, 52,-20,-21, -1,-10,-20,-10,  7,-14, 10,-11;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='R';  M= -5, -7,-26, -7,  3,-21, -6,  5,-24,  6,-18,-10, -2,-16,  2, 20, -5,-10,-16,-24,-12,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-33,-24,  6,-33,-24, 29,-28, 36, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 21,-22, -2,-24;
/M: SY='A';  M= 26,-18,-13,-25,-17,  0,-12,-22,  1,-17,  3, -2,-17,-18,-18,-20, -2, -3,  9,-18, -9,-17;
/M: SY='V';  M= -4,-18,-21,-21,-14,-12,-26,-19, 14, -7, -2,  5,-14,-19, -6,-10, -5, -3, 16,-26, -9,-11;
/M: SY='H';  M= -4,  4,-22, -1, -3,-17,-11, 33,-22, -3,-21, -9, 14,-18,  3,  4,  3, -6,-20,-27,  1, -3;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='D';  M=-11,  4,-23,  6,  5,-16,-17, -7, -8, -4, -6, -7,  1,-13, -1, -1, -5, -6, -9,-25,-11,  1; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='C';  M= -7,-16, 25,-22,-18,-10,-23, -1, -4,-19, -1,  5,-13,-24,-13,-17,-12,-10, -2,-29, -8,-17; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='F';  M=-20,-28,-22,-37,-28, 72,-30,-14,  0,-27,  8,  0,-20,-30,-35,-18,-20,-10, -2, 13, 38,-28;
/M: SY='V';  M= -5,-18,  4,-19, -9, -9,-26,-21,  4,-18,  4, -1,-18,-23,-15,-18, -7, -4, 10,-32,-13,-13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2021_03 which contains 565'254 sequence entries.


Total number of hits 33 in 33 different sequences
Number of true positive hits 33 in 33 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] ExoN
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
33 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1    ), R1AB_BC279  (P0C6V9    ), R1AB_BC512  (P0C6W0    ), 
R1AB_BCHK3  (P0C6W2    ), R1AB_BCHK4  (P0C6W3    ), R1AB_BCHK5  (P0C6W4    ), 
R1AB_BCHK9  (P0C6W5    ), R1AB_BCRP3  (P0C6W6    ), R1AB_BEV    (P0C6V7    ), 
R1AB_BRV1   (P0C6V8    ), R1AB_CVBEN  (P0C6W7    ), R1AB_CVBLU  (P0C6W8    ), 
R1AB_CVBM   (P0C6W9    ), R1AB_CVBQ   (P0C6X0    ), R1AB_CVH22  (P0C6X1    ), 
R1AB_CVHN1  (P0C6X2    ), R1AB_CVHN2  (P0C6X3    ), R1AB_CVHN5  (P0C6X4    ), 
R1AB_CVHNL  (P0C6X5    ), R1AB_CVHOC  (P0C6X6    ), R1AB_CVM2   (P0C6X8    ), 
R1AB_CVMA5  (P0C6X9    ), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0    ), R1AB_CVPPU  (P0C6Y5    ), 
R1AB_FIPV   (Q98VG9    ), R1AB_IBVB   (P0C6Y1    ), R1AB_IBVBC  (P0C6Y2    ), 
R1AB_IBVM   (P0C6Y3    ), R1AB_MERS1  (K9N7C7    ), R1AB_PEDV7  (P0C6Y4    ), 
R1AB_SARS   (P0C6X7    ), R1AB_SARS2  (P0DTD1    ), R1AB_WBV24  (Q008X6    )
» more

PDB
[Detailed view]
4 PDB

5C8S; 5C8T; 5C8U; 5NFY

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission