PROSITE entry PS51953
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NIV_EXON |
| Accession [info] | PS51953 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
07-APR-2021 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51953 |
| Associated ProRule [info] | PRU01298 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Nidovirus 3'-5' exoribonuclease (ExoN) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=217; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=212; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4458640; R2=0.0113829; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=594; N_SCORE=9.2; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=357; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -6, -9,-17,-10,-12, -7,-20,-13, 4,-15, 9, 10,-12,-20,-10,-14, -4, 4, 6,-28, -8,-11; /M: SY='F'; M=-16,-27,-21,-32,-26, 46,-30,-11, 7,-23, 13, 4,-23,-30,-28,-17,-20, -8, 6, 5, 33,-26; /M: SY='V'; M= -7,-25, -2,-28,-23, -5,-31,-25, 17,-17, 12, 8,-22,-26,-20,-17,-17, -7, 19,-27, -8,-23; /M: SY='T'; M= -6, -8,-18,-14,-12, -5,-22,-11, -6,-10, -7, -1, -8, -1, -9,-11, 5, 25, -4,-20, 2,-12; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='R'; M=-12,-12,-24,-14, -6,-14,-21, -9, -8, 15,-10, -2, -7,-17, 0, 30,-10, -7, -2,-19, -7, -6; D=-7; /I: I=-7; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15; /M: SY='D'; M=-12, 32,-24, 46, 20,-31, -9, -1,-31, 0,-25,-24, 14, -7, 3, -7, 5, -5,-24,-34,-17, 11; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='E'; M= -7, -2,-23, 1, 24, -3,-19, -2,-17, -1,-10,-11, -6, -9, 3, -6, -5, -8,-17,-12, 2, 13; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='A'; M= 23,-10, -2,-14, -3,-15, -9,-16, -9,-10, -3, -7,-11,-12, -8,-16, 1, -3, -3,-21,-16, -5; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='M'; M= -9,-17,-23,-17, -5, -8,-23,-13, 8,-10, 6, 9,-15, -3, -6, -8,-14, -8, 2,-21, -8, -8; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='R'; M=-10, -6,-22, -7, -5,-16,-16, -7,-14, 6,-16, -9, 1, -1, -2, 20, -4, -1,-10,-24,-13, -6; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='H'; M=-14, 10,-25, 10, 4,-19,-14, 28,-23, 7,-20, -9, 11,-15, 8, 7, -5,-10,-23,-21, 4, 4; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='V'; M= -1,-26,-10,-26,-25, 1,-26,-25, 25,-19, 14, 10,-26,-26,-25,-17,-11, -1, 39,-25, -7,-25; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='R'; M=-10, -5,-23, -7, -1,-20, -6, -6,-24, 15,-19, -9, 0,-14, 6, 27, -2, -1,-17,-19,-11, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='A'; M= 17, -7,-16, -9, -6,-20, 5,-15,-17,-10,-20,-14, -3, 5, -7,-15, 13, 2,-11,-25,-20, -7; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='W'; M=-12,-25,-32,-25,-19, 8,-18,-15, -9,-16, -7, -9,-24,-24,-13,-15,-20,-14,-15, 66, 23,-15; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='I'; M= -5,-22,-18,-26,-22, -3,-14,-19, 18,-19, 13, 16,-19,-21,-17,-18,-14, -8, 18,-20, -6,-21; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='G'; M= 0,-17,-18,-17,-22,-14, 20,-22, -6,-17,-10, -5,-12,-22,-22,-17, -4, -9, 7,-22,-18,-22; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='F'; M=-16,-27, 16,-37,-29, 42,-30,-22, -3,-29, 4, 0,-20,-31,-33,-23,-17,-10, 0,-10, 10,-29; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='V'; M= 5,-16,-15,-22,-20, -5,-21,-21, 16,-18, 7, 4,-11,-24,-19,-18, -7, -3, 21,-27,-11,-20; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='F'; M= -1,-16,-20,-23,-21, 17, 8,-20,-16,-21, -9, -9, -9,-21,-25,-18, -3, -3,-10,-10, -2,-21; /M: SY='F'; M= 8,-20, -8,-28,-19, 14,-18,-18, 0,-19, 8, 5,-17,-21,-19,-19, -8, -3, 2,-15, -1,-18; /M: SY='H'; M= -8, 3,-26, -1, -2,-20,-14, 70,-26, -9,-20, -4, 13,-18, 6, -3, -4,-14,-25,-30, 9, -2; /M: SY='V'; M= 13,-17,-16,-20,-10,-11,-20,-22, 10,-13, 0, 0,-18,-18,-15,-18, -3, -3, 19,-26,-14,-13; /M: SY='R'; M= -9, -6, -5,-10, -5,-19,-22, 0,-19, 8,-18, -8, -2,-17, -2, 9, -2, 2,-12,-28, -9, -5; /M: SY='H'; M=-11, -5,-30, -5, -4,-25, 9, 20,-33, 7,-25,-10, 3,-18, 0, 13, -7,-16,-26,-23, -8, -4; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M=-11, 12,-27, 19, 15,-28,-14, -4,-23, 0,-22,-17, 4, 15, 7, -7, -1, -5,-24,-28,-18, 10; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='N'; M= 0, 5,-17, -4, -7,-13,-11, 5, -5, -9,-12, -6, 14,-14, -4, -9, 5, 4, -8,-27, -8, -7; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='V'; M= -2,-15, -1,-19,-18, -3,-21,-20, 12,-15, 2, 2,-14,-18,-17,-15, -2, 9, 20,-22, -8,-18; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -1, -8,-24, -9,-13,-23, 35,-17,-28,-15,-23,-16, -3, -1,-15,-16, 2, -5,-21,-20,-23,-15; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='T'; M= -1, -3,-13,-10,-10, -6,-19,-14,-10,-10,-11,-10, -1,-13, -9,-10, 17, 38, -3,-23, 1,-10; /M: SY='N'; M=-10, 18,-22, 7, 4,-15,-10, 3,-11, -4,-11, -4, 29,-18, 0, -4, -1, -4,-20,-33,-15, 2; /M: SY='H'; M=-10,-15,-23,-14, -7, -7,-13, 1, -7,-11, 0, 0,-12,-22,-10, -3,-12,-11, -3,-23, -5, -9; /M: SY='P'; M= 7,-19,-28,-15, -6,-24,-16,-21,-11,-11,-20,-14,-19, 49,-13,-20, -5, -6,-12,-27,-25,-13; /M: SY='L'; M= -9,-22,-24,-22,-18, -1, -2,-17, -4,-18, 16, 4,-17,-26,-17, -6,-19,-13, -6,-18, -8,-18; /M: SY='Q'; M=-10, 4,-27, 1, 18,-31,-17, 7,-16, 6,-16, 2, 5,-11, 39, 5, -1, -9,-25,-24,-11, 28; /M: SY='L'; M= -9,-17,-20,-16,-17, -2,-26,-18, 16,-20, 21, 15,-20,-25,-17,-18,-18, -7, 16,-26, -6,-17; /M: SY='G'; M= 15, -9,-22,-12,-15,-26, 41,-19,-29,-16,-24,-17, -2,-16,-15,-19, 8, -9,-19,-23,-26,-15; /M: SY='F'; M=-14,-29,-21,-35,-27, 42,-31,-18, 14,-26, 15, 7,-23,-29,-29,-20,-20, -8, 12, -1, 22,-27; /M: SY='S'; M= 0,-10,-17,-12,-10, -7,-12, -7, -3,-13,-12, -1, -2,-16, -4,-13, 15, 8, -2,-24, 0, -8; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='T'; M= -2, -3,-14,-12,-13,-10,-19,-17, 1,-13, -8, -6, 3,-15,-11,-13, 11, 24, 5,-31,-11,-13; /M: SY='G'; M= -8, 5,-29, 11, -4,-29, 23,-11,-30,-12,-18,-15, 2,-17, -4,-13, -4,-15,-25,-26,-21, -4; /M: SY='V'; M= 3,-21,-22,-24,-17, -7,-21, -9, 2,-13, 1, 1,-19,-22,-14,-14,-13, -9, 7, -2, -1,-16; /M: SY='D'; M=-10, 20, -6, 21, 12,-28,-12, -4,-29, 3,-27,-21, 16,-14, 0, -4, 4, -4,-24,-37,-20, 6; /M: SY='F'; M= -5,-19,-22,-25,-17, 24,-11,-11, -8,-18, -1, -3,-14,-23,-15,-15,-11,-10, -9, -2, 14,-15; /M: SY='V'; M= -4,-26,-16,-28,-25, 4,-29,-21, 23,-20, 12, 9,-24,-27,-22,-19,-11, -2, 30,-20, 4,-25; /M: SY='V'; M= 2,-17,-15,-22,-22, -4,-23,-21, 19,-18, 8, 6,-12,-25,-20,-18, -8, -3, 24,-28,-10,-22; /M: SY='T'; M= 1, -8,-20,-13, -2,-18,-20,-12, -6, -3, -9, -3, -6,-13, 6, 0, 2, 8, -4,-24,-11, 1; /M: SY='P'; M= -5,-18,-32,-14, -7,-22, -9,-20,-15,-14,-15,-13,-17, 45,-13,-19, -8, -6,-20,-27,-23,-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='E'; M=-11, 6,-22, 10, 16,-21,-17, -4,-21, 8,-16,-13, 1,-10, 5, 14, -1, -1,-15,-25,-13, 9; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='G'; M= -4,-12,-26,-10,-11,-20, 23,-16,-22, -9,-14,-10, -7, -4,-12,-11, -7,-13,-19,-19,-19,-12; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='V'; M= -5,-15, 2,-18,-14, -8,-21,-15, 1, -7, -4, 1,-13,-20,-12, -9, -5, -3, 7,-23, -5,-14; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='V'; M= -2,-24,-18,-27,-23, 10,-24, -7, 6,-19, 0, 2,-20,-26,-22,-17,-12, -7, 16, -7, 4,-22; /M: SY='L'; M= -9,-13,-21,-12,-16, 8,-25,-14, 7,-18, 9, 2,-16,-24,-19,-18,-14, -7, 9,-16, 7,-18; /M: SY='T'; M= -4, 7,-18, 6, 1,-20,-14,-12,-19, -7,-20,-17, 6, 3, -5,-10, 15, 23,-13,-34,-17, -2; /M: SY='E'; M= -2, 12,-24, 12, 31,-25,-12, -1,-25, 5,-21,-18, 12, -7, 10, 1, 5, -5,-24,-31,-19, 20; /M: SY='D'; M=-11, 7,-29, 10, 7,-25, -6, -1,-26, 5,-23,-15, 4,-13, 0, -1, -5, -9,-22,-16,-11, 3; /M: SY='G'; M= -2, -7,-23,-11,-16,-12, 32,-17,-27,-17,-22,-16, 2,-19,-17,-16, 6, -3,-20,-21,-18,-16; /I: I=-5; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='N'; M= -7, 10,-19, 7, -1,-15,-10, -1,-14, 2,-16, -4, 12,-13, 0, -2, 3, 1,-13,-25, -7, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='S'; M= 4, -5, -3, -9, -5,-14,-11, 2,-10,-10,-12, -4, -1,-16, -5,-11, 6, -1, -4,-28,-11, -6; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='I'; M= 0,-17,-16,-25,-19, 10,-22,-20, 11,-19, 7, 3,-13,-17,-18,-18, -5, 6, 11,-15, 0,-19; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='T'; M= -6, -6,-17, -8, 3, -2,-20,-13, -9, -1, -8, -7, -7,-12, -6, -4, 0, 9, -2,-20, -6, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='P'; M= 1,-13,-24,-12,-10,-14, 1,-11,-15, -6,-16,-10,-10, 5,-10, -8, -5, -8,-12,-14, -6,-12; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='V'; M= 1,-25,-12,-26,-24, 0,-25,-24, 24,-19, 14, 10,-24,-24,-23,-18,-11, -2, 33,-23, -7,-24; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='P'; M= 4, -7,-23, -8, -3,-21,-11,-13,-14, -1,-19,-12, -4, 23, -6, -6, -2, -5,-14,-24,-19, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='A'; M= 26, -6,-14,-11, -3,-20, -5,-14,-15, 7,-15, -9, -5, -9, -3, -4, 5, -1, -6,-19,-15, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='R'; M= -9, -4,-22, -4, 1,-20, -3, -6,-24, 23,-20, -9, 0,-11, 4, 26, -6, -9,-16,-15,-10, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='A'; M= 11,-12,-12,-14,-10, -9,-10,-15, 4, -9, -3, -2,-11, 3,-10,-13, -2, -2, 6,-15,-10,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='P'; M= -7,-11,-31, -6, 0,-26, -4,-15,-23, 5,-26,-15, -9, 36, -5, -5, -7,-10,-24,-22,-21, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='P'; M= -7,-14,-30, -9, -2,-23,-17,-17,-16, -9,-23,-16,-14, 63, -9,-16, -4, 0,-21,-26,-23, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='G'; M= -4, 8,-23, 13, -4,-27, 30,-11,-32,-11,-26,-20, 7,-13, -9,-13, 6, -9,-23,-26,-22, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='E'; M= -9, 2,-24, 8, 29,-18,-18, -3,-14, 0, -4, -3, -5, -7, 9, -4, -6, -9,-16,-24,-12, 19; D=-5; /I: I=-5; DM=-9; /M: SY='Q'; M=-12, 1,-27, -3, 10,-19,-19, 5,-17, 3,-17, -3, 5,-14, 37, 4, -2, -9,-25,-18, -5, 24; /M: SY='F'; M=-15,-28,-26,-34,-25, 46,-23,-21, -8,-24, -4, -8,-21,-27,-29,-18,-16,-11, -9, 39, 22,-23; /M: SY='R'; M= -9, 1,-24, 1, -1,-21,-17, -8,-20, 16,-19,-11, 2,-17, 0, 25, -4, -4,-10,-26,-13, -2; /M: SY='H'; M=-19, -8,-30, -8, -7, -1,-24, 53,-18, -2,-13, -1, -4,-23, 2, 0,-14,-15,-20, -4, 41, -7; /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-28,-17, 11,-27,-12, 14,-20, 25, 25,-21,-24, -8,-14,-21,-10, 5,-15, 3,-12; /M: SY='K'; M= -9, -8,-24,-13, -9,-15,-22,-12, 0, 11, -9, 6, -3,-18, -4, 6,-10, -7, 2,-24, -9, -7; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='P'; M= -8,-13,-31, -8, 2,-27,-18,-12,-19, 2,-25,-14,-10, 35, 3, 1, -2, -5,-21,-28,-21, -1; /M: SY='L'; M=-12,-18,-22,-17,-16, 3,-27, 1, 7,-21, 22, 9,-19,-27,-15,-15,-21,-10, 5,-18, 10,-16; /M: SY='M'; M=-12,-20,-23,-25,-17, 6,-24, -4, 10, -7, 16, 32,-19,-22, -6, -7,-21,-10, 3,-12, 10,-12; /M: SY='R'; M= -3, -9,-25, -9, -2,-19,-14, 0,-22, 8,-21,-12, -3, -2, 2, 20, 1, -4,-17,-23, -8, -3; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -3, 11,-22,-19, -8,-14, 19,-17, -6, -2, -9, 10, 12, -5, -7,-13,-20, -9, 9; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 21, -2,-18, -9,-11,-23, 22,-15,-22,-12,-22,-16, 5,-15,-11,-16, 11, -4,-15,-25,-23,-11; /M: SY='Q'; M= -8, -7,-27, -7, 11,-23,-21, -2,-16, 8, -7, -2, -6,-15, 21, 16, -8, -9,-18,-21,-10, 14; /M: SY='P'; M= -6, -5,-32, 0, 19,-31,-19, -9,-24, 10,-25,-15, -7, 26, 11, 0, -5, -9,-26,-26,-20, 14; /M: SY='W'; M= -4,-25,-36,-28,-20, -6, -8,-25,-13,-11,-16,-12,-23,-22,-15,-15,-21,-19,-16, 58, 6,-16; /M: SY='N'; M=-10, 8,-25, 6, 4,-25,-12, 12,-25, 6,-26,-13, 15, -8, 11, 10, 5, -4,-24,-31,-12, 6; /M: SY='V'; M= 2,-17,-18,-19,-11, -5,-24,-17, 10,-13, 1, 1,-16,-19,-14,-16, -4, 3, 15,-20, 0,-14; /M: SY='V'; M= -5,-10, -1, -9,-13,-14,-22,-20, -2, -9, -7, -5,-12,-22,-15,-12, -3, -2, 10,-33,-14,-14; /M: SY='R'; M=-11, -4,-27, -3, -2,-15,-18, 0,-24, 15,-17,-11, -2,-19, 3, 36, -8, -9,-17,-15, 1, -3; /M: SY='R'; M=-10,-12,-27,-11, 1,-18,-24,-14, -8, 2,-13, -7,-10, 4, -4, 6, -6, -1, -6,-26,-14, -4; /M: SY='R'; M=-14, 3,-29, 1, 10,-26,-17, 14,-27, 20,-23, -9, 9,-15, 17, 29, -5,-10,-25,-25, -8, 11; /M: SY='I'; M= -2,-20,-24,-26,-18, -9,-28,-10, 19,-13, 3, 8,-14,-19,-13,-16,-12, -8, 15,-23, -3,-18; /M: SY='I'; M= -1,-28,-18,-32,-26, 1,-30,-26, 29,-25, 22, 14,-26,-26,-23,-23,-17, -5, 29,-24, -5,-26; /M: SY='Q'; M=-12,-12,-25,-14, -2, -6,-24, 10, -8,-10, 3, 4, -9,-19, 13, -5,-10, -7,-13,-18, 2, 5; /M: SY='M'; M= 1,-14,-21,-21,-14, -7,-14, -3, -3,-11, -3, 15,-12,-17, -5,-12, -4, 0, -4, -2, -1, -9; /M: SY='M'; M=-13,-21,-23,-25,-18, 7,-27, 12, 9,-21, 15, 18,-15,-24,-12,-15,-19,-12, 4,-20, 8,-17; /M: SY='C'; M= 7,-17, 12,-24,-19,-12,-18,-20, 2,-18, -5, 2,-14,-22,-15,-20, 1, -1, 9,-31,-15,-18; /M: SY='D'; M= -6, 9,-24, 16, 5,-22,-16, -9,-17, -2,-10,-12, -1,-16, -5, -1, -5, -7, -9,-30,-15, -1; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='F'; M= -9, -3,-14,-10,-12, 13,-15, 0, -4,-11, -5, -4, 3,-17,-13, -8, -3, 2, -4,-11, 8,-12; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='L'; M= -4,-21,-15,-25,-17, 17,-21,-16, 13,-21, 20, 8,-17,-19,-18,-16,-15, -7, 8, -9, 4,-17; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='B'; M= 3, 7, -9, 5, 1,-21, -9, -5,-15, 0,-16,-10, 6,-12, 4, -5, 1, -4,-12,-24,-14, 3; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='T'; M= -3, 2,-18, -2, -6,-18, 2,-14,-19, -6,-18,-13, 3, -3, -8, -8, 7, 15,-13,-25,-15, -8; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='T'; M= -5, -3,-14, -9,-10, -6,-16, -3, -2,-13, 3, -1, 1,-17, -9,-10, 0, 10, -2,-26, -6,-10; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='S'; M= -1, -3,-17, -2, -5,-15,-14,-12,-11, -6,-10, -9, -2,-17, -6, -1, 8, 6, -3,-31,-14, -6; /M: SY='D'; M=-12, 32,-25, 35, 5,-29, 4, -3,-31, -4,-27,-23, 25,-14, -4, -9, 5, -1,-26,-36,-20, 0; /M: SY='R'; M=-12,-17,-17,-19,-14, -7,-13, -9, -9, -5, -3, -3,-11,-24, -9, 10,-11, -9, -6,-16, 1,-14; /M: SY='V'; M= -8,-27,-14,-27,-20, 2,-28,-25, 8,-21, 3, 1,-24, 3,-24,-21,-15, -7, 10,-24, -9,-23; /M: SY='V'; M= -5,-19, -4,-22,-21, -7,-27, -8, 10,-18, 0, 3,-16,-25,-19,-17, -5, 5, 22,-31, -6,-21; /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-35,-27, 59,-30,-15, 4,-27, 17, 4,-22,-30,-32,-19,-22,-10, 1, 6, 30,-27; /M: SY='V'; M= -4,-28,-16,-30,-28, 5,-31,-22, 28,-20, 10, 10,-27,-29,-26,-20,-13, -3, 38,-20, 5,-28; /M: SY='L'; M=-10,-23, -9,-28,-20, 15,-28,-21, 8,-26, 27, 8,-22,-27,-22,-19,-17, 2, 5,-19, 1,-20; /M: SY='W'; M=-18,-31,-44,-31,-23, 7,-21,-20,-19, -8,-19,-16,-31,-27,-14,-11,-33,-24,-26,108, 30,-15; /M: SY='A'; M= 21, -1, -6, -8, -8,-21, 7,-14,-19,-11,-21,-16, 5,-14, -8,-15, 16, 2,-11,-30,-22, -8; /M: SY='G'; M= 3, -6,-26, -8, -8,-25, 19, 13,-30, -5,-24,-11, 1,-17, -6, -7, -2,-15,-23,-23,-12, -8; /M: SY='G'; M= -6, -6,-29, -6, -5,-29, 22,-12,-33, 9,-28,-14, 1,-16, 0, 8, -2,-13,-25,-21,-20, -3; /M: SY='L'; M= -9,-17,-19,-21,-17, 15,-22,-15, 6,-23, 22, 6,-11,-26,-18,-16,-14, -5, 0,-20, 0,-17; /M: SY='D'; M=-15, 32,-30, 47, 38,-35,-15, 0,-35, 5,-25,-25, 11, -5, 9, -5, 0,-10,-30,-35,-20, 24; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-31,-23, 7,-31,-23, 25,-28, 40, 18,-29,-29,-22,-21,-26, -8, 19,-22, -2,-23; /M: SY='T'; M= -1, -3,-19, -7, 2,-17,-18,-15,-16, -2,-15,-13, -3, 3, -3, 0, 9, 23,-10,-28,-15, -2; /M: SY='A'; M= 19, -9, -4,-18,-12, -5,-11,-19,-11,-14,-11,-11, -7,-14,-14,-17, 12, 15, -2,-23,-12,-12; /M: SY='L'; M= -6,-26,-21,-31,-21, 4,-27,-16, 23,-23, 33, 29,-24,-24,-14,-19,-23, -9, 12,-20, -1,-18; /M: SY='R'; M=-11,-12,-25,-14, -6,-14,-23,-12, -9, 9, -6, -2, -6,-18, -2, 20, -7, 0, -6,-23, -8, -6; /M: SY='Y'; M=-15,-12,-33,-11, -9, -1,-22, 2,-11, -9,-16,-11,-10, 20, -9,-13,-12, -9,-21, -4, 22,-13; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='F'; M=-12,-26,-16,-31,-24, 39,-26,-19, 10,-25, 19, 7,-21,-26,-28,-17,-18, -7, 10, -5, 12,-24; D=-14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='V'; M= -1,-20, -3,-23,-19, -1,-22,-20, 17,-18, 12, 7,-19,-20,-18,-17,-11, -3, 21,-20, -7,-19; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='K'; M=-11, 5,-29, 3, 9,-29,-17, 10,-27, 31,-27, -9, 9,-13, 15, 20, -6,-10,-24,-24, -7, 11; /M: SY='I'; M=-11,-24,-28,-29,-19, 3,-32,-24, 19,-15, 7, 7,-18, -7,-17,-17,-17, -9, 10,-18, -2,-21; /M: SY='G'; M= -1,-16,-24,-19,-21,-17, 18,-22, -5,-21,-12, -6, -8,-20,-18,-21, 0, -9, -1,-24,-18,-21; /M: SY='G'; M= -3, -6,-26, -7, 1,-24, 7,-12,-24, 4,-20, -9, -3, -7, -3, 0, -2, -5,-19,-23,-18, -2; /M: SY='E'; M=-11, 8,-28, 12, 23,-24,-20, -7,-13, -2,-15,-13, 4, -2, 3, -9, -3, -8,-16,-31,-17, 12; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Q'; M= 0, -7,-22, -8, 1,-17, -5, -3,-15, 1,-14, -6, -6,-14, 8, 0, -3, -8,-13,-12, -2, 3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='T'; M= -5, -7,-19,-11, -7,-16,-22,-11, -9, 10,-13, -4, -7,-16, -6, 3, -1, 11, 3,-26, -8, -7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='H'; M= -6, -7, -3, -7, 3,-13,-18, 4,-17,-10,-16,-10, -4,-17, -1,-10, 4, -3,-10,-31, -9, 1; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -4, -1,-14, -5, -6,-10, 3, -6, -8, 0, -7, -1, 3,-12, -5, -2, -4, -6, -7,-15, -9, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='C'; M=-12, -9, 97,-15,-22,-23,-27,-25,-32,-25,-22,-22,-14,-35,-25,-27, -8,-10,-13,-48,-28,-24; /M: SY='G'; M= -4, 0, -3, -4,-15,-25, 29,-17,-32,-17,-26,-19, 6,-21,-17,-17, 2, -6,-23,-30,-26,-16; /M: SY='K'; M=-10, 4,-26, 0, 5,-25,-16, -7,-27, 33,-27,-12, 8,-13, 7, 27, -3, -3,-19,-24,-12, 5; /M: SY='R'; M= -5, -7,-25, -7, 7,-23,-17, -4,-22, 14,-17,-10, -3,-15, 12, 30, -1, -6,-15,-23,-13, 7; /M: SY='A'; M= 39,-12,-13,-20,-12,-12, -5,-14, -8,-10, -8, -8,-12,-13,-10,-18, 5, -2, -2,-12, -5,-12; /M: SY='T'; M= 0,-10, -1,-19,-17, 1,-22,-22, -5,-15, -6, -7, -9,-18,-18,-15, 8, 28, 6,-26, -7,-17; /M: SY='F'; M= -9,-22, 15,-28,-25, 18,-27,-13, -5,-21, -3, -5,-19,-30,-24,-19,-12, -5, 1, -9, 18,-25; /M: SY='F'; M=-18,-23,-24,-28,-24, 50,-29, -2, -1,-19, 4, -1,-18,-28,-24,-15,-17, -5, -5, 16, 50,-24; /M: SY='S'; M= 10, 9,-13, 1, -3,-19, -3, -8,-17, -7,-24,-17, 19,-13, -3, -9, 25, 16,-12,-36,-19, -3; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='S'; M= -1, 4,-17, 5, 0,-20,-11,-11,-13, -2,-20,-13, 5,-10, -2, -7, 15, 8, -8,-31,-14, -2; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='H'; M= -8, -7,-21, -5, 1,-16,-18, 22,-13, -6,-14, -5, -3, -9, -1, -3, -1, -6, -7,-28, -4, -2; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -3, 8,-22,-11, -7,-23, 10,-18,-11, -1,-13, 7, 17, 1, 0,-18,-25,-14, 6; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='N'; M= -4, 5,-18, 1, -5,-20, 6, -7,-15, -7,-18,-11, 9,-15, -1, -8, 5, -1,-12,-26,-16, -3; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='H'; M= -5, 0,-21, 1, 6,-19,-16, 9,-16, 4,-16, -7, -1,-12, 8, 1, 0, -3,-13,-21, -2, 6; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-12,-17, -9,-19,-18, 6,-14, -6,-13,-15,-12, -9,-15, -9,-16,-16, -9, -3,-14, -5, 19,-19; /M: SY='Y'; M= 7,-14,-12,-20,-14, 4,-13, -9,-12, -5,-10, -7,-12,-20,-13,-10, -7, -7, -8, -5, 12,-14; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='W'; M=-15,-11,-13,-16,-12, -2,-20, 3,-21, -9,-18,-11, -6,-24, -4, -8,-15,-15,-22, 17, 6, -7; /M: SY='Q'; M= -6, -7,-25,-12, -4,-17,-21, 3, -7, 2, -6, 0, -3,-17, 5, 2, -8, -6, -9,-23, -5, -1; /M: SY='H'; M=-19, 0,-30, 0, 3,-23,-20, 88,-29, -7,-20, 0, 9,-19, 17, 1, -9,-19,-30,-29, 16, 5; /M: SY='A'; M= 15, 1, -8, -7, -6,-20, -6, 11,-19,-10,-19,-12, 8,-15, -4,-11, 10, -1,-13,-31,-12, -6; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-13,-18,-15,-19, -5, 11,-26,-12, -5,-16, 4, -2,-17,-14, -9,-13,-14, -9, -7,-14, 3, -6; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -6, 0,-25, -1, -5,-24, 16, 5,-25, -9,-24,-13, 8, -2, -2, -9, 1,-10,-25,-24,-16, -4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='C'; M=-12,-25, 14,-29,-22, 4,-30,-21, 0,-26, 7, -1,-23,-13,-23,-23,-18,-10, -2,-23, -4,-24; /M: SY='D'; M= -3, 15,-21, 20, 0,-23,-14, -9,-15, -7,-13, -7, 1,-14, -7,-13, 0, 0, -6,-32,-15, -3; /M: SY='Y'; M=-16,-14,-29,-15,-14, 11,-14, 19,-13, -5,-10, -4,-11,-25, -8, -5,-15,-13,-16, 8, 43,-14; /M: SY='V'; M= -7,-26,-17,-30,-25, 11,-30,-25, 21,-24, 19, 10,-23,-26,-25,-20,-14, 1, 24,-21, -1,-25; /M: SY='Y'; M=-12,-22,-23,-24,-21, 14,-30, -4, 12,-17, 10, 6,-20,-26,-15,-15,-15, -1, 7, 0, 34,-21; /M: SY='N'; M=-13, 27, -4, 17, -1,-23, -8, 2,-26, 0,-27,-20, 36,-21, -3, 3, 3, -4,-26,-39,-20, -2; /M: SY='P'; M= -4,-20,-32,-15, -7,-15,-20,-14,-11,-13,-13,-11,-20, 44,-11,-18,-11, -9,-18,-18, -8,-13; /M: SY='Y'; M=-15, -8,-25,-13, -7, 7,-22, -3,-11, 2, -6, -3, -3,-22, -1, 7,-12, -9,-14,-10, 10, -5; /M: SY='I'; M= -2,-26,-13,-34,-25, 3,-30,-25, 26,-26, 16, 14,-21,-23,-20,-25,-16, -8, 18,-21, -3,-25; /M: SY='I'; M=-10,-25,-25,-31,-24, -2,-34, -9, 30,-25, 16, 15,-19,-23,-17,-22,-18,-10, 22,-23, 1,-24; /M: SY='D'; M=-19, 49,-29, 64, 17,-37, -9, 1,-37, 0,-30,-29, 25,-11, 0, -9, 1, -9,-30,-40,-20, 9; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-34,-27, 1,-33,-25, 35,-24, 20, 22,-25,-25,-21,-23,-18, -6, 32,-24, -4,-26; /M: SY='Q'; M= -8, 3,-10, 4, 9,-33,-18, 0,-25, 4,-21, -9, 0,-15, 27, 7, -2, -9,-24,-27,-15, 17; /M: SY='Q'; M= -8, 6,-26, 9, 7,-31, -4, 11,-26, -2,-23,-11, 6,-13, 21, -2, 5, -4,-25,-28,-11, 13; /M: SY='W'; M= -8,-21,-40,-20,-20, -5, -4,-24,-24,-16,-21,-20,-23,-24,-16,-19,-23,-22,-26, 82, 9,-15; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='G'; M= 4, -8,-23, -9, -5,-21, 24,-16,-18,-13,-16,-11, -4,-13,-10,-16, -1,-12,-15,-19,-19, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='Y'; M=-15, -8,-23,-12,-10, 16,-21, 9, -6, -7, -6, -3, -4,-22, -1, -6,-10, -7,-13, 6, 36, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='T'; M= 0, -8,-11,-12,-10,-10,-17,-18, -1, -4, -8, -4, -7,-14,-10, -6, 8, 17, 10,-26,-10,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='G'; M= -1, -6,-23, -7,-11,-24, 35,-13,-28,-12,-22,-13, 0,-15, -5,-12, 3, -5,-21,-19,-20, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='N'; M= -1, 12,-17, 5, 1,-21, -4, -3,-22, 4,-29,-18, 23,-14, 2, 5, 20, 7,-18,-36,-18, 1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='Q'; M= 1, -3,-18, -4, 7,-22,-16, -8,-12, -3,-16, -8, -2,-11, 13, -5, 12, 10, -8,-29,-14, 10; /M: SY='T'; M= -5, -1,-18, -5, 0,-11,-17,-11,-10, 0,-13, -5, 2,-15, -4, -3, 5, 9, -5,-28,-11, -2; /M: SY='N'; M= -9, 14, -2, 2, 0,-17,-12, -2,-15, -5,-17, -7, 22,-19, -2, -7, 3, 2,-17,-36,-17, -1; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='D'; M=-10, 34,-26, 42, 11,-32, -9, 12,-32, -3,-26,-22, 20,-13, 0, -9, 1, -9,-26,-36,-15, 5; /M: SY='Q'; M= 1, -6,-22, -7, 10,-20,-15, -5,-11, -2, -7, 1, -6,-12, 12, -2, 1, -4,-12,-25,-13, 11; /M: SY='I'; M= -9,-26,-23,-30,-25, 1,-33,-10, 28,-23, 15, 13,-21,-25,-19,-21,-17, -8, 23,-21, 5,-25; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='N'; M= -9, 18,-23, 13, 4,-24,-10, -1,-25, 10,-26,-16, 23,-15, 6, 11, 7, 2,-22,-32,-16, 4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 13, -3, -8, -7, -1,-12, -5, -7, -7, -3, -7, -4, -3, -5, 4, -6, 5, 5, -4,-12, -8, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -5,-11,-20,-16,-14, -8,-22,-12, 11,-13, -4, 1, -4,-21, -6,-13, -2, -1, 11,-25, -4,-12; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='G'; M= 0, -9,-28,-10,-12,-28, 41,-15,-34, -6,-26,-16, -1,-18, -8, -3, -1,-16,-26,-20,-24,-11; /M: SY='N'; M= -9, 10,-23, 3, -8,-17, -4, -1,-10,-10,-14, -3, 15,-17, -6,-10, 0, 0,-13,-30,-12, -8; /M: SY='A'; M= 42, -7,-13,-15, 0,-21, -3,-17,-13, -7,-11,-11, -9, -9, -6,-17, 9, -1, -4,-21,-20, -3; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='V'; M= -7, 1,-18, 7, -2,-16,-22,-16, -3, -9, -8, -8, -8,-18,-13,-13, -2, 2, 11,-33,-14, -7; /M: SY='A'; M= 27,-15,-18,-19,-10,-20, -9,-21, -8,-11,-13,-10,-15, 15,-13,-20, 2, -3, -2,-24,-21,-13; /M: SY='S'; M= 4, -7,-14,-10, -7,-14, -9,-12, -4,-13,-16, -3, 1,-13, -3,-13, 23, 11, -1,-34,-14, -6; /M: SY='A'; M= 23,-11, -6,-18,-16,-17, 1,-20, -8,-14,-12, -9, -8,-18,-16,-19, 5, -2, 3,-26,-20,-16; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='A'; M= 22,-15, 10,-23,-18,-14,-15,-24, -3,-16, -6, -6,-15,-20,-18,-20, 3, 5, 11,-28,-18,-18; /M: SY='I'; M=-12,-14,-29,-23,-16, -9,-29,-18, 19, -7, 1, 6, -4,-19, -9, -3,-13, -9, 8,-23, -5,-16; /M: SY='M'; M=-11,-20,-21,-29,-20, 4,-21, 3, 17,-10, 17, 52,-20,-21, -1,-10,-20,-10, 7,-14, 10,-11; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='R'; M= -5, -7,-26, -7, 3,-21, -6, 5,-24, 6,-18,-10, -2,-16, 2, 20, -5,-10,-16,-24,-12, 0; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-24, 6,-33,-24, 29,-28, 36, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 21,-22, -2,-24; /M: SY='A'; M= 26,-18,-13,-25,-17, 0,-12,-22, 1,-17, 3, -2,-17,-18,-18,-20, -2, -3, 9,-18, -9,-17; /M: SY='V'; M= -4,-18,-21,-21,-14,-12,-26,-19, 14, -7, -2, 5,-14,-19, -6,-10, -5, -3, 16,-26, -9,-11; /M: SY='H'; M= -4, 4,-22, -1, -3,-17,-11, 33,-22, -3,-21, -9, 14,-18, 3, 4, 3, -6,-20,-27, 1, -3; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='D'; M=-11, 4,-23, 6, 5,-16,-17, -7, -8, -4, -6, -7, 1,-13, -1, -1, -5, -6, -9,-25,-11, 1; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='C'; M= -7,-16, 25,-22,-18,-10,-23, -1, -4,-19, -1, 5,-13,-24,-13,-17,-12,-10, -2,-29, -8,-17; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28, 72,-30,-14, 0,-27, 8, 0,-20,-30,-35,-18,-20,-10, -2, 13, 38,-28; /M: SY='V'; M= -5,-18, 4,-19, -9, -9,-26,-21, 4,-18, 4, -1,-18,-23,-15,-18, -7, -4, 10,-32,-13,-13; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 33 in 33 different sequences |
| Number of true positive hits | 33 in 33 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | ExoN |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
33 sequences
R1AB_BC133 (P0C6W1), R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BC512 (P0C6W0), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCHK4 (P0C6W3), R1AB_BCHK5 (P0C6W4), R1AB_BCHK9 (P0C6W5), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_BEV(P0C6V7), R1AB_BRV1 (P0C6V8), R1AB_CVBEN (P0C6W7), R1AB_CVBLU (P0C6W8), R1AB_CVBM (P0C6W9), R1AB_CVBQ (P0C6X0), R1AB_CVH22 (P0C6X1), R1AB_CVHN1 (P0C6X2), R1AB_CVHN2 (P0C6X3), R1AB_CVHN5 (P0C6X4), R1AB_CVHNL (P0C6X5), R1AB_CVHOC (P0C6X6), R1AB_CVM2 (P0C6X8), R1AB_CVMA5 (P0C6X9), R1AB_CVMJH (P0C6Y0), R1AB_CVPPU (P0C6Y5), R1AB_FIPV (Q98VG9), R1AB_IBVB (P0C6Y1), R1AB_IBVBC (P0C6Y2), R1AB_IBVM (P0C6Y3), R1AB_MERS1 (K9N7C7), R1AB_PEDV7 (P0C6Y4), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), R1AB_WBV24 (Q008X6)» more
|
| PDB [Detailed view] |
73 PDB
5C8S; 5C8T; 5C8U; 5NFY; 5SKW; 5SKX; 5SKY; 5SKZ; 5SL0; 5SL1; 5SL2; 5SL3; 5SL4; 5SL5; 5SL6; 5SL7; 5SL8; 5SL9; 5SLA; 5SLB; 5SLC; 5SLD; 5SLE; 5SLF; 5SLG; 5SLH; 5SLI; 5SLJ; 5SLK; 5SLL; 5SLM; 5SLN; 5SLO; 5SLP; 5SLQ; 5SLR; 5SLS; 5SLT; 5SLU; 5SLV; 5SLW; 5SLX; 5SLY; 5SLZ; 5SM0; 5SM1; 5SM2; 5SM3; 5SM4; 5SM5; 5SM6; 5SM7; 5SM8; 5SM9; 5SMA; 5SMB; 5SMC; 5SMD; 5SME; 5SMF; 5SMG; 5SMH; 5SMI; 5SMK; 7DIY; 7MC5; 7MC6; 7N0B; 7N0C; 7N0D; 7QGI; 7QIF; 7R2V » more |