PROSITE entry PS51958
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NENDOU |
| Accession [info] | PS51958 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
02-JUN-2021 CREATED;
02-JUN-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51958 |
| Associated ProRule [info] | PRU01303 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Nidoviral uridylate-specific endoribonuclease (NendoU) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=135; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1599960; R2=0.0243464; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=179; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-11,-19,-17,-19, -7,-14,-28,-18, -3, -8, 6, 3,-17,-19, -3, -9, -9, 4, -3,-25,-16, -8; /M: SY='P'; M= -9,-19,-25,-19, -9,-38,-20,-20,-28,-10,-28,-28,-20, 69,-10,-20, -9,-10,-19,-39,-29, -9; /M: SY='R'; M=-14, 0,-35, 2, 7,-28,-21, -7,-22, 4,-17,-16, -4,-20, 4, 19, -9,-10,-23,-33,-21, 4; /M: SY='S'; M= 5, 0,-12, 2, -2,-22, -7,-13,-18, -4,-25,-18, 7,-11, -3,-11, 28, 21,-15,-32,-21, -2; /M: M=-14, -8,-22, -3, -5,-19,-26,-17, -4,-14, -1, -3,-14,-18, -2,-15,-12, -4, -4,-30,-18, -5; /M: SY='M'; M=-12,-29,-19,-32,-24, 13,-24,-18, 6,-24, 10, 26,-24,-31,-14,-24,-19,-13, 4,-13, 1,-24; /M: SY='E'; M= -3, 3,-27, 8, 25,-21,-13, -2,-25, 4,-28,-19, 2,-12, 9, -5, 14, -3,-25,-26,-13, 20; /M: SY='T'; M= -4, -7,-21, -9, 1,-21,-20,-13,-15, 5,-16,-13, -2,-13, -2, 3, 4, 17,-10,-28,-17, 0; /M: SY='D'; M=-10, 18,-34, 28, 3,-35, 18,-14,-33,-13,-39,-29, 2,-19, -8,-19, 3,-12,-29,-41,-29, -2; /M: SY='F'; M=-15,-21,-27,-30,-17, 19,-25, -7,-12, -9, -8, -8,-16,-30,-13, 6,-14,-11,-17, -8, 7,-17; /M: SY='L'; M=-17,-30,-13,-33,-27, 5,-36,-24, 18,-27, 23, 14,-28,-30,-21,-22,-23,-10, 9,-18, -6,-27; /M: SY='E'; M= -4, 4,-28, 7, 12,-23,-14, -4,-22, -1,-27,-18, 1,-16, 2, -2, 2, -7,-20,-29,-13, 8; /M: SY='M'; M=-13,-26,-15,-28,-22, -4,-31,-21, 9,-21, 17, 23,-19,-26,-11,-18,-18, -2, 6,-23,-11,-21; /M: SY='D'; M=-11, 17,-28, 24, 8,-29,-13,-10,-21, -8,-27,-19, 9,-18, -2,-14, 4, -1,-21,-40,-24, 2; /M: SY='Q'; M= -5, -6,-11, -4, 0,-20,-20,-14,-10, -9,-13, -3, -7,-18, 1,-15, 1, 1, -8,-28,-18, -2; /M: SY='R'; M=-11, 7,-34, 8, 8,-30, -9, 1,-30, 5,-30,-23, 4,-17, 4, 11, -1, -8,-27,-34,-20, 4; /M: SY='E'; M= -5, -6,-18, 0, 4,-22,-20,-14, -8, -8,-12, -8,-12,-17, 1,-14, -5, -6, -5,-31,-18, 3; /M: SY='F'; M=-17,-29,-19,-36,-26, 45,-28, -5, -4,-26, -4, -4,-27,-31,-26,-27,-18,-19,-10, 8, 33,-26; /M: SY='I'; M= -9,-31,-10,-31,-28, -3,-35,-29, 27,-27, 21, 11,-31,-27,-23,-25,-19, -8, 20,-22,-11,-27; /M: SY='D'; M=-10, 12,-31, 17, 15,-28,-15, -2,-27, 4,-29,-18, 3,-15, 13, -5, 0, -9,-22,-31,-16, 13; /M: SY='K'; M= -8, 4,-30, 0, 12,-29,-17, -7,-27, 23,-29,-19, 6,-13, 7, 12, 3, -3,-22,-32,-21, 10; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Y'; M=-13,-19,-18,-22,-13, 13,-21, 6,-11,-11,-11,-10,-13,-15,-13,-10,-12,-13,-11, 2, 31,-13; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= -2, 2,-27, 0, 2,-25, 8, -7,-29, -2,-33,-21, 5,-16, -4, -8, 4, -9,-24,-30,-18, 0; /M: SY='L'; M=-13,-22,-21,-20, -7,-13,-27,-19, 1,-13, 9, 4,-23,-22, -7,-10,-17,-10, -2,-25,-14, -8; /M: SY='E'; M=-11, 8,-37, 14, 35,-30,-19, 2,-29, 12,-29,-18, 1,-12, 20, 3, -1,-10,-27,-30,-19, 29; /M: SY='D'; M=-11, 12,-31, 19, 8,-26,-10,-10,-22, -4,-27,-18, -1,-18, 2,-12, -3,-10,-20,-35,-21, 5; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='Y'; M=-10,-29,-14,-31,-21, 21,-26, -2, -2,-21, 0, -2,-24,-28,-19,-20,-16,-14, -5, 2, 30,-21; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='A'; M= 9, -9,-17,-12, -7,-23, 4,-14,-20, -3,-24,-15, -5,-15, -7, -6, 5, -6,-14,-30,-21, -7; /M: SY='F'; M=-17,-21,-14,-29,-23, 17,-22, -4, -6,-24, -2, -3,-17,-31,-19,-21,-16,-15,-11,-10, 7,-23; /M: SY='E'; M=-12, 0,-35, 3, 21,-30,-20, 9,-30, 0,-29,-21, -4, 14, 12, -6, -5,-12,-26,-31,-16, 17; /M: SY='H'; M=-19, 0,-29,-10, 1,-11,-20, 76,-30, -9,-29,-19, 9,-19, 11, 0, -9,-19,-29,-20, 18, 1; /M: SY='V'; M= 7,-27, -8,-27,-24,-11,-24,-27, 20,-20, 4, 3,-27,-17,-20,-25,-12, -3, 25,-28,-13,-20; /M: SY='V'; M= -7,-28, -5,-32,-28, 10,-28,-22, 13,-23, 5, 3,-28,-27,-22,-28,-15, -7, 14,-16, 0,-24; /M: SY='Y'; M=-12,-29,-15,-29,-23, 15,-30, -3, 6,-22, 1, -2,-24,-28,-21,-22,-16,-13, 4, -1, 30,-22; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='D'; M=-15, 28,-37, 41, 25,-35,-12, -6,-29, -3,-36,-25, 9,-16, 7,-13, 4, -8,-29,-42,-26, 17; /M: SY='F'; M= -9,-28,-14,-32,-28, 19,-30,-21, 14,-24, 4, 3,-26,-28,-24,-28,-16, -3, 14,-13, 5,-24; /M: SY='S'; M= -5, 10,-22, 7, 4,-27, -9, -7,-24, 8,-31,-20, 17,-13, 1, -3, 18, 5,-21,-35,-21, 2; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='K'; M=-11, 2,-30, -3, 4,-25, -2, 7,-30, 11,-31,-20, 4,-15, 7, 3, -1,-12,-25,-27,-14, 4; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='T'; M= 0, -9,-16,-11, -8,-23,-10,-18,-15, -3,-19,-15, -3, -4, -8,-10, 9, 21, -7,-31,-21, -8; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='T'; M= -6, -4,-17, -3, -4,-22,-20,-14,-11, -8,-13, -9, 1,-14, 1,-10, 4, 25, -4,-30,-20, -3; /M: SY='I'; M=-11,-33,-10,-33,-30, -3,-37,-30, 30,-27, 24, 13,-33,-27,-24,-27,-23, -7, 26,-23,-10,-27; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-30,-30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-32, 9,-35,-28, -7,-32,-27, 10,-25, 19, 12,-30,-27,-18,-24,-18, -7, 6,-22,-13,-27; /M: SY='H'; M=-18, -1,-29,-10, 0,-10,-19, 77,-29,-10,-30,-20, 9,-20, 9, 0, -9,-19,-29,-20, 19, 0; /M: SY='L'; M=-17,-24,-17,-28,-19, 0,-31, 5, 2,-22, 9, 3,-20,-25,-11,-15,-19, -8, -2,-19, 1,-19; /M: SY='I'; M=-11,-34,-10,-34,-29, -3,-36,-29, 25,-26, 25, 16,-34,-27,-20,-24,-24, -7, 22,-23,-10,-26; /M: SY='I'; M= -7,-24,-11,-25,-24, -2,-33,-26, 22,-23, 9, 4,-22,-24,-23,-24,-12, 7, 19,-21, -9,-23; /M: SY='G'; M= 11, -8,-16, -8,-10,-24, 24,-16,-26,-10,-32,-22, -3,-14,-10,-14, 19, -4,-21,-30,-24,-10; /M: SY='M'; M=-12,-22,-21,-24,-10, -9,-28,-13, -5, -8, 7, 9,-20,-22, 7, -2,-15,-10, -6,-20,-11, -7; /M: SY='Y'; M= -8,-21,-15,-24,-17, 9,-24, 1, -6,-16,-11, -6,-13,-25,-12,-18,-12,-12, -4, -5, 25,-15; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='R'; M= -7, -2,-25, -9, 0,-21, -6, -3,-22, 14,-19,-15, 4,-13, 3, 24, -3, -7,-20,-22,-15, 0; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='R'; M= -8,-11,-14,-15, -6,-10,-15, -7, -5, 2, 2, -2, -9,-12, -1, 12, -9, -5, -7,-14, -9, -6; D=-9; /I: I=-9; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18; /M: SY='Q'; M= -2, -8, -9, -9, -3, -7,-10, -5, -6, -2, -5, -1, -6, -8, 3, -4, 1, -3, -5,-12, -7, -2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='R'; M= -5, -2,-16, -6, 4,-16,-11, -1,-16, 14,-13, -8, -1, -7, 13, 15, -2, -5,-12,-14,-11, 6; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='E'; M= -1, -3,-12, -2, 2,-11,-10, -8, -7, 0, -8, 0, -4, -9, 1, -4, -1, 0, -5,-16,-10, 1; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= 2, 0,-11, -2, -5,-14, 12, -6,-16, -5,-19,-13, 4, -8, -5, -7, 9, -2,-13,-17,-13, -5; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='H'; M= -8, -2,-13, -7, -4,-11,-12, 5, -8, -1,-10, -7, 2, -4, -2, -3, -4, -5, -7,-16, -5, -3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='L'; M=-11,-22, -7,-23,-19, 4,-24,-17, 14,-19, 19, 9,-22,-19,-15,-15,-16, -7, 8,-10, -3,-19; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='T'; M= -5, -6,-12, -9, -5,-11,-14,-10, -2, 1, -6, -4, -2,-11, -4, -5, -2, 2, 1,-18,-10, -4; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='L'; M= -7,-27,-12,-29,-23, -3,-29,-19, 11,-22, 13, 13,-23,-26,-16,-19,-17, -8, 8,-20, -5,-22; /M: SY='E'; M=-11, -4,-32, -2, 14,-29,-20, -5,-28, 8,-27,-19, -7, 14, 12, -3, -4,-11,-22,-28,-16, 13; /M: SY='E'; M= -8, 2,-33, 6, 15,-31, -9, -4,-29, 0,-29,-22, -1, 0, 8, -2, 1, -7,-26,-33,-22, 12; /M: SY='F'; M=-10,-28,-14,-31,-25, 16,-28,-20, 10,-23, 7, 8,-26,-28,-20,-25,-14, -8, 7,-13, 3,-23; /M: SY='L'; M=-11,-33,-10,-33,-28, -4,-35,-29, 23,-25, 24, 15,-31,-26,-20,-23,-22, -2, 20,-23,-11,-25; /M: SY='P'; M= -5,-10,-21,-13, -8,-26,-14,-15,-16, -5,-22,-17, -4, 14, -6,-13, 2, -1,-11,-33,-22, -7; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='S'; M= 0,-11,-20,-11, -7,-19, -6,-11,-20, -4,-24,-15, -7, -1, -6,-11, 5, -4,-15,-26,-11, -7; /M: SY='D'; M=-16, 25,-37, 36, 14,-37, -7, -8,-30, -6,-37,-28, 10,-11, 0,-12, 1, -9,-29,-44,-28, 7; /M: SY='S'; M= 12, -9, -9, -9, -6,-14, -6,-11,-14, -6,-23,-15, -1,-13, -6,-12, 24, 7,-12,-25,-11, -6; /M: SY='T'; M= -2,-10,-14,-10,-14,-18,-20,-20, 3,-12, -9, -5, -6,-16,-11,-19, 0, 15, 10,-32,-17,-11; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='I'; M= -5,-17, -8,-18,-14, -6,-21,-17, 12, -8, 7, 4,-16,-14,-11,-12,-11, -2, 12,-16, -8,-12; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='H'; M= -9, -6,-20,-10, -2,-15,-14, 9,-17, 4,-16, -8, -3, 5, 2, 0, -6, -9,-13,-19, -6, -2; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='S'; M= 4, -9, -7,-13,-11,-18,-15,-14, -4,-10,-15, -8, -2,-17, -6,-14, 7, -1, -2,-28,-17, -9; /M: SY='Y'; M= -8,-22, -3,-26,-19, -2,-25, -7, -6,-12, -7, -3,-15,-24,-14,-17,-12,-10, -3,-12, 11,-18; /M: SY='F'; M= -7,-24,-11,-28,-22, 8,-26,-16, 3,-18, -2, -2,-21,-25,-19,-18,-12, 1, 5,-14, 4,-20; /M: SY='V'; M= -5,-22,-18,-23,-26, -8, 1,-24, 4,-25, -6, -6,-22,-25,-25,-26,-12,-13, 5,-23,-14,-25; /M: SY='T'; M= -1,-17,-11,-19,-18,-15,-23,-22, 5,-15, -1, -1,-11,-16,-14,-17, -4, 19, 11,-29,-16,-15; /M: SY='D'; M= -8, -1,-21, 4, -3,-15,-17,-11, -9,-12,-16,-13, -6,-20, -8,-18, 3, -5,-10,-27, -8, -5; /M: SY='A'; M= 6,-10, -8,-12, -4,-20,-14,-13,-13, -6,-15, -9, -6,-15, -1, -9, 6, -1,-10,-28,-18, -4; /M: SY='P'; M= -9, 0,-26, -1, -2,-29,-17,-11,-19, -6,-23,-16, 0, 6, -1,-12, -4, -6,-14,-36,-22, -2; /M: SY='G'; M= -4, 1,-22, 1, -4,-28, 14,-13,-28,-10,-31,-23, 4,-16, -9,-13, 6, 1,-23,-32,-25, -6; /M: SY='R'; M= -1,-12,-27,-16, -7,-28, 4,-14,-27, 5,-26,-21,-10, -6, -5, 6, -3,-11,-19,-31,-23, -7; /M: SY='S'; M= 20, -8, -9, -8, -6,-21, 7,-15,-19, -6,-28,-18, -3,-11, -6,-11, 24, 3,-14,-30,-21, -6; /M: SY='S'; M= 8,-10,-12,-13, -9,-10,-10, -6,-12, -9,-21,-12, -3,-16, -8,-13, 12, 0, -9,-23, -4, -8; /M: SY='K'; M= -7, -1,-28,-10, 9,-29,-19,-10,-29, 46,-29,-19, -1,-10, 9, 18, 1, -9,-19,-30,-20, 9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 11,-12, -4,-13, -7,-19, -9,-13,-10, -8,-15, -6, -9,-13, 0,-11, 5, 0, -4,-25,-17, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= -2,-25,-15,-26,-19,-12,-26,-23, 13,-14, 5, 5,-25,-20,-13,-16,-16, -4, 19,-28,-12,-14; /M: SY='C'; M= 0,-26, 72,-35,-35,-20,-28,-28,-10,-26,-10,-18,-25,-26,-26,-35, -6, 1, -8,-22,-20,-35; /M: SY='T'; M= 3, -7,-10, -7, -7,-20,-14,-17,-13, -7,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 18, 39, -6,-30,-20, -7; /M: SY='V'; M= -3,-31,-11,-31,-27, -3,-30,-22, 19,-21, 11, 8,-30,-23,-19,-25,-20, -5, 24,-21, 0,-21; /M: SY='V'; M= -6,-27,-11,-27,-25, -7,-32,-27, 22,-22, 12, 13,-24,-23,-18,-24,-15, 5, 23,-25,-12,-22; /M: SY='D'; M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20, 0,-20, 0,-10,-30,-50,-30, 10; /M: SY='I'; M=-10,-33,-10,-33,-28, -5,-35,-29, 24,-25, 23, 13,-32,-25,-21,-24,-22, -2, 23,-24,-11,-25; /M: SY='L'; M=-15,-30, -5,-32,-24, 3,-33,-13, 3,-20, 11, 1,-26,-27,-18,-17,-19, -8, 0,-10, 10,-24; /M: SY='L'; M= -9,-36, -8,-36,-26, -4,-33,-28, 15,-26, 29, 15,-36,-26,-18,-18,-23, -8, 8,-22,-12,-26; /M: SY='D'; M=-16, 18,-35, 27, 9,-38,-13, -9,-30, -8,-36,-27, 5, 9, 2,-16, -2, -9,-26,-44,-28, 5; /M: SY='D'; M=-15, 27,-36, 42, 20,-35,-12, -7,-28, -6,-34,-22, 7,-18, 8,-14, 3, -8,-27,-42,-26, 13; /M: SY='F'; M=-20,-33,-17,-39,-29, 40,-33,-14, 5,-29, 11, 5,-32,-36,-26,-26,-23,-17, -4, 2, 21,-29; /M: SY='V'; M= -9,-19,-20,-17,-12, -8,-25,-14, 5,-15, -3, -2,-20,-22,-12,-19,-15, -8, 8,-21, 0,-10; /M: SY='E'; M= 0, -1,-24, 1, 10,-27,-14,-11,-22, 1,-26,-17, -2, 1, 2, -7, 6, 0,-17,-33,-22, 7; /M: SY='I'; M=-14,-29,-15,-30,-23, 5,-35,-14, 15,-19, 10, 3,-26,-28,-21,-21,-20,-13, 11,-10, 12,-23; /M: SY='I'; M= -8,-33, -9,-33,-28, -5,-34,-29, 23,-25, 23, 12,-33,-25,-21,-23,-21, -5, 19,-23,-11,-25; /M: SY='K'; M=-11, -1,-28,-10, 5,-25,-19, 8,-28, 27,-27,-18, 4,-13, 10, 15, 0, -6,-21,-28,-13, 6; /M: SY='P'; M= 0, -5,-20, -6, -1,-28,-11,-10,-24, -3,-28,-20, 2, 15, 2,-10, 14, 3,-18,-33,-23, 0; /M: SY='Q'; M=-13,-12,-25,-12, 2,-19,-26,-10, -9, -8, -4, 1,-11, -9, 10, -8,-10, -9, -9,-26,-17, 3; /M: SY='D'; M=-13, 8,-24, 11, -1,-25,-18,-14,-15, -7,-18,-14, 4,-18, -6,-12, 0, 7,-13,-36,-22, -4; /M: SY='L'; M=-10,-23,-17,-25,-12,-13,-29,-19, 1, -9, 10, 5,-22,-21, -3, -7,-16, -8, 0,-24,-14,-11; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='S'; M= -2, 2,-16, 2, 1,-19, 3, -7,-19, -2,-22,-15, 7,-10, -2, -6, 10, 3,-16,-23,-16, 0; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='V'; M= -3,-11, 2,-15,-14,-11,-16,-14, 3, -5, -4, -3, -8,-13, -9,-13, -7, -2, 8,-19, -9,-11; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='V'; M= -1,-19, -9,-20,-18, -8,-21,-20, 17, -9, 4, 5,-19,-14,-12,-17,-13, -1, 23,-21, -8,-12; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20, 0,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 10,-20,-30,-20, 0; /M: SY='K'; M=-10, -3,-30,-12, 7,-28,-21,-10,-28, 43,-26,-15, -1,-12, 9, 22, -2,-10,-19,-29,-19, 7; /M: SY='V'; M= -1,-24, -2,-24,-26,-14,-28,-28, 19,-20, 3, 3,-25,-20,-19,-29,-15, 2, 27,-30,-13,-19; /M: SY='V'; M=-10,-27,-15,-29,-24, 0,-29, -8, 10,-20, -1, -1,-23,-24,-17,-24,-18, -6, 13, -6, 10,-19; /M: SY='K'; M=-12, 0,-28, -7, 5,-14,-20, -7,-23, 17,-24,-15, 2,-17, 3, 2, -1, -5,-19,-25,-12, 4; /M: SY='V'; M= -5,-31, -7,-32,-30, -2,-32,-28, 26,-24, 13, 11,-31,-25,-22,-29,-21, -5, 29,-24, -7,-24; /M: SY='N'; M= -9, -8,-15,-14,-12,-18,-21,-13, -7,-10,-10, 0, 4,-13, -8,-13, -1, 4, -6,-30,-17,-12; /M: SY='I'; M= -9,-32,-10,-32,-30, -3,-37,-30, 33,-27, 22, 12,-32,-27,-25,-28,-22, -7, 28,-23,-10,-27; /M: SY='D'; M=-20, 40,-40, 60, 20,-40,-10,-10,-30,-10,-40,-30, 10,-20, 0,-20, 0,-10,-30,-50,-30, 10; /M: SY='F'; M=-17,-24,-13,-32,-25, 29,-22, -4, -7,-25, -6, -6,-21,-33,-23,-25,-16,-17,-12, 0, 21,-25; /M: SY='K'; M= -7, -3,-27, -9, 5,-27,-13, -1,-28, 23,-26,-16, -1,-12, 12, 10, 0, -4,-19,-28,-17, 6; /M: SY='E'; M= -6, 0,-28, 6, 8,-28,-16,-12,-20, -5,-23,-12, -7, 4, 4,-13, -1, -7,-16,-34,-22, 6; /M: SY='I'; M=-11,-31, -1,-35,-30, 9,-32,-20, 13,-26, 3, -1,-30,-30,-25,-30,-20,-12, 10, 0, 7,-28; /M: SY='R'; M= -9, -1,-34, -7, 10,-29,-18, 1,-29, 17,-24,-16, 6,-15, 20, 29, 0, -8,-26,-29,-20, 11; /M: SY='F'; M=-21,-34,-17,-41,-29, 31,-33,-18, 4,-29, 10, 8,-33,-36,-23,-26,-24,-18, -5, 11, 14,-29; /M: SY='M'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 0,-30,-20, 10,-20, 20, 60,-20,-30, 0,-20,-20,-10, 10,-20,-10,-20; /M: SY='L'; M= -9,-28,-11,-30,-26, -8,-32,-26, 17,-22, 18, 10,-25,-24,-18,-21,-20, -2, 17,-26,-12,-22; /M: SY='W'; M=-28,-38,-20,-48,-30, 19,-30,-18,-16,-30,-16,-16,-38,-40,-22,-30,-28,-28,-26, 84, 22,-30; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='C'; M= 5,-20, 39,-25,-22, -7,-16,-18, -6,-18, -8,-11,-20,-19,-18,-22, -4, -6, -5,-13,-10,-22; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M= -7, 2,-23, -2, 6,-22, -5, -5,-22, 13,-23,-16, 5, -2, 3, 3, 0, -7,-18,-23,-16, 5; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='D'; M=-12, 22,-28, 32, 16,-26, -6, -5,-22, -4,-27,-20, 7,-13, 2,-11, 0, -7,-21,-32,-20, 10; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='G'; M= -5, 4,-22, 4, -1,-21, 17, -5,-25, -8,-27,-19, 4,-13, -5,-10, 2, -9,-21,-24,-17, -3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='K'; M= -9, 0,-28, -4, 5,-26,-18, 2,-25, 18,-25,-18, 1,-14, 8, 12, 0, -5,-20,-30,-16, 5; /M: SY='I'; M= -9,-14,-17,-12,-19,-13,-25,-23, 16,-21, 1, 0,-16,-24,-19,-25,-14, -7, 15,-30,-15,-18; /M: SY='Q'; M= 2, -7,-22, -8, 8,-24,-16, -6,-20, 9,-18, -2, -6,-12, 21, 2, 2, -7,-13,-25,-19, 10; /M: SY='T'; M= 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 10, 50, 0,-30,-20,-10; /M: SY='F'; M= -6,-26, -7,-33,-25, 31,-23,-14, -4,-24, -6, -3,-25,-31,-23,-26,-10,-13, -8, -3, 12,-25; /M: SY='Y'; M=-20,-30,-20,-30,-20, 30,-30, 20,-10,-20,-10,-10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-10, 20, 70,-20; /M: SY='P'; M=-12,-23,-27,-25,-15,-17,-23,-18,-22,-15,-22,-22,-23, 51,-15,-22,-13,-12,-17,-28,-16,-15; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of true positive hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NendoU |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
44 sequences
R1AB_BC133 (P0C6W1), R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BC512 (P0C6W0), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCHK4 (P0C6W3), R1AB_BCHK5 (P0C6W4), R1AB_BCHK9 (P0C6W5), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_BEV(P0C6V7), R1AB_BRV1 (P0C6V8), R1AB_CVBEN (P0C6W7), R1AB_CVBLU (P0C6W8), R1AB_CVBM (P0C6W9), R1AB_CVBQ (P0C6X0), R1AB_CVH22 (P0C6X1), R1AB_CVHN1 (P0C6X2), R1AB_CVHN2 (P0C6X3), R1AB_CVHN5 (P0C6X4), R1AB_CVHNL (P0C6X5), R1AB_CVHOC (P0C6X6), R1AB_CVM2 (P0C6X8), R1AB_CVMA5 (P0C6X9), R1AB_CVMJH (P0C6Y0), R1AB_CVPFS (P18457), R1AB_CVPPU (P0C6Y5), R1AB_FIPV (Q98VG9), R1AB_IBVB (P0C6Y1), R1AB_IBVBC (P0C6Y2), R1AB_IBVK (P12723), R1AB_IBVM (P0C6Y3), R1AB_MERS1 (K9N7C7), R1AB_PEDV7 (P0C6Y4), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), R1AB_WBV24 (Q008X6), RPOA_EAVBU (P19811), RPOA_LDVC (Q06502), RPOA_LDVP (Q83017), RPOA_PRRS1 (Q9YN02), RPOA_PRRSB (Q8B912), RPOA_PRRSL (Q04561), RPOA_PRRSR (Q9WJB2), RPOA_PRRSS (A0MD28), RPOA_SHFV (Q68772)» more
|
| PDB [Detailed view] |
62 PDB
2GTH; 2GTI; 2H85; 2OZK; 2RHB; 4RS4; 4S1T; 5EYI; 5F17; 5HBZ; 5HC1; 5S6X; 5S6Y; 5S6Z; 5S70; 5S71; 5S72; 5SA4; 5SA5; 5SA6; 5SA7; 5SA8; 5SA9; 5SAA; 5SAB; 5SAC; 5SAD; 5SAE; 5SAF; 5SAG; 5SAH; 5SAI; 5SBF; 6VWW; 6W01; 6WLC; 6WXC; 6X1B; 6X4I; 6XDH; 7DW6; 7K0R; 7K1L; 7K1O; 7K9P; 7KEG; 7KEH; 7KF4; 7ME0; 7N06; 7N33; 7N7R; 7N7U; 7N7W; 7N7Y; 7N83; 7RB0; 7RB2; 7TJ2; 7TQV; 8D34; 8U2X » more |