PROSITE entry PS51961
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | AV_NSP11N_COV_NSP15M |
| Accession [info] | PS51961 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
02-JUN-2021 CREATED;
02-JUN-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51961 |
| Associated ProRule [info] | PRU01306 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Arterivirus Nsp11 N-terminal/coronavirus NSP15 middle (AV-Nsp11N/CoV-Nsp15M) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=120; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8937274; R2=0.0192269; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=500; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=240; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M= 3, 8,-20, 4, 10,-24, -8, -6,-23, 10,-26,-16, 13,-10, 4, 2, 12, 1,-18,-31,-17, 7; /M: SY='I'; M= -5,-25,-23,-30,-27, -6,-12,-27, 22,-24, 7, 9,-19,-24,-23,-24,-13, -9, 22,-23,-10,-27; /M: SY='R'; M= -7, -3,-24, -5, -3,-22, 2, -8,-28, 10,-25,-15, 5,-16, 0, 22, 6, -1,-19,-26,-16, -3; /M: SY='T'; M= -1,-15, -4,-15,-11,-13,-18, -9, -9,-17, -5, -6,-12, -3,-12,-17, 0, 1, -6,-32,-14,-13; /M: SY='H'; M= -6,-10,-18,-13,-11,-10,-20, 15, -5,-14, -4, 2, -6,-20, -7,-10, 1, 5, 0,-30, -1,-10; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='E'; M=-11, 2,-27, 9, 19,-20,-18, -7,-16, -5, -7,-11, -4, 7, 1, -9, -8, -9,-19,-28,-16, 9; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='L'; M= -9,-21,-23,-22,-16, 3,-25,-19, 10,-21, 13, 5,-18, 0,-18,-18,-17, -8, 4,-21, -6,-18; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='K'; M= -9, 1,-26, -1, 6,-26,-17, -6,-25, 27,-25,-10, 5,-12, 12, 25, 0, -1,-19,-24,-12, 8; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-34,-27, 3,-34,-27, 35,-27, 26, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 30,-23, -3,-27; /M: SY='L'; M= 2,-25,-12,-28,-19, 9,-20,-20, 7,-25, 27, 8,-23,-26,-21,-20,-19, -8, 5,-18, -3,-19; /M: SY='R'; M=-16, 1,-29, -2, 2,-21,-18, 24,-27, 17,-22, -8, 9,-18, 11, 31, -7,-11,-24,-23, -1, 4; /M: SY='N'; M= -9, 36,-20, 18, -1,-21, 4, 8,-21, -2,-30,-20, 55,-20, -1, -2, 10, -1,-29,-39,-21, -1; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-29,-19, 9,-29,-20, 19,-29, 48, 19,-29,-29,-19,-20,-28, -9, 9,-21, -1,-19; /M: SY='G'; M= -3, 0,-28, -2, -9,-29, 47,-12,-35,-13,-29,-19, 9,-18, -9,-14, 2,-16,-30,-24,-27, -9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='V'; M= 1,-20,-10,-23,-20, -1,-21,-21, 22,-15, 8, 8,-19,-19,-19,-16, -8, -2, 30,-19, -6,-20; D=-9; /I: I=-9; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18; /M: SY='D'; M=-10, 17,-17, 26, 3,-19,-12, -4,-14, -4,-13,-12, 4,-11, -6, -9, -1, -2, -5,-26,-11, -2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='V'; M= 3,-18, 4,-23,-19, -5,-20,-20, 14,-17, 4, 4,-16,-18,-17,-18, -7, -3, 18,-20, -8,-19; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='C'; M= 4, -7, 30,-14,-13,-11,-15,-17,-13,-13,-10,-10, -7,-16,-13,-14, 4, 12, -3,-26,-14,-13; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='W'; M= -3,-11,-20,-14,-12, 6,-12, -1, -7, -8, -8, -7, -9,-17, -7, -9, -8, -6,-10, 25, 24,-11; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='K'; M= -6, 9,-18, 4, 2,-19, -3, -3,-19, 16,-21,-11, 16,-10, 2, 9, 1, -4,-17,-20,-11, 2; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='F'; M=-11,-11, -6,-17,-13, 20,-18, 5, -7,-16, 0, -2, -6,-18,-15,-10, -8, -2, -5,-10, 9,-13; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='V'; M= 0,-21, -7,-21,-21, 0,-21,-21, 21,-14, 7, 7,-21,-21,-21,-14, -7, 0, 36,-21, -7,-21; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='L'; M= -7,-21,-18,-25,-18, 4,-25,-18, 24,-21, 26, 14,-18,-18,-14,-18,-18, -7, 14,-14, 0,-18; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='W'; M=-20,-36,-42,-39,-29, 27,-23,-24,-14,-22,-12,-14,-34,-30,-24,-19,-34,-24,-22,111, 33,-22; /M: SY='D'; M=-20, 31,-30, 46, 10,-23,-15, 11,-31, -3,-23,-21, 11,-15, -2, -9, -5,-11,-26,-24, 4, 3; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 34,-30, 18, -1,-12, 1, 0,-19,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 26, 73,-21; /M: SY='E'; M= 5, 3,-20, 5, 18,-24,-11, -9,-21, 4,-21,-16, 1, -8, 5, -4, 12, 2,-14,-30,-18, 12; /M: SY='P'; M= -1, -8,-27, -8, -1,-24,-14,-10,-22, 10,-23,-14, -3, 15, -1, 15, -2, -6,-19,-25,-19, -4; /M: SY='D'; M=-12, 29,-27, 39, 27,-33,-11, 0,-32, 2,-27,-23, 16, -8, 9, -5, 6, -6,-28,-36,-19, 18; /M: SY='A'; M= 4, -6,-15,-11, -8,-13,-13,-11, -9, -7, -6, -6, 1,-18, -6, -1, 4, 3, -6,-28,-13, -8; /M: SY='P'; M= -8,-21,-31,-19,-11,-17,-26,-23, 2,-16,-10, -6,-19, 39,-15,-21,-10, -3, -5,-27,-18,-17; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='F'; M= -4,-18,-14,-21,-16, 22,-18, -9, 4,-17, 13, 4,-16,-19,-17,-13,-13, -6, 2, -1, 15,-16; D=-10; /I: I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='C'; M= -5, -7, 7,-10,-12,-10, -5, 2,-14,-12,-12, -7, -4,-17,-10,-11, 0, 1, -8,-20, -4,-12; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='T'; M= 0, -4,-12, -6, -5,-11,-10,-10, -6, -6,-12, -6, 1, -5, -4, -4, 11, 12, -2,-23,-11, -5; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='S'; M= 1, 0,-11, -6, -7, 3, -6, -6, -9, -9,-12, -9, 8,-12, -8, -8, 9, 5, -8,-17, -3, -7; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='T'; M= 0, 0, -7, -7, -7, -7,-14,-14, -7, -7, -7, -7, 0, -7, -7, -7, 14, 36, 0,-21, -7, -7; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='I'; M= -8,-14,-19,-17,-13, -1,-22,-10, 11, -2, 1, 4,-12,-15, -8, -6,-11, -6, 8, -8, 10,-13; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='G'; M= -3, -2,-27, -1, -4,-31, 25,-11,-32, 0,-27,-15, 2,-15, 2, -5, 2,-11,-25,-23,-21, -1; /M: SY='V'; M= -6,-30,-14,-33,-30, 20,-31,-27, 23,-23, 12, 9,-27,-29,-31,-21,-14, -3, 35,-19, 1,-30; /M: SY='C'; M= 1,-19, 91,-28,-26,-19,-25,-28,-24,-26,-15,-17,-19,-34,-26,-28, -7, -8, -7,-43,-27,-26; /M: SY='K'; M= -3, -6,-25, -6, 0,-24,-12,-13,-22, 17,-24,-10, -4, 4, 0, 7, 0, 0,-16,-25,-15, -1; /M: SY='Y'; M=-16,-23,-28,-26,-22, 19,-30, 4, 13,-16, 12, 13,-21,-27,-12,-15,-21,-10, 2, 9, 47,-20; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M=-10, 6,-25, 16, 6,-24,-11, -8,-20, -4,-21,-17, -3, 34, -4,-11, -4, -7,-21,-24,-18, -1; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='T'; M= -2,-11,-17,-16,-12, -9,-23,-20, 1, -9, 0, -2, -9,-12,-11,-11, 3, 18, 3,-26, -9,-12; /M: SY='D'; M=-14, 26,-30, 39, 35,-35,-15, 0,-33, 8,-25,-22, 10, -6, 13, -1, -1,-10,-29,-33,-19, 24; /M: SY='L'; M= -9,-26, -9,-30,-23, 18,-28,-22, 11,-26, 22, 8,-22,-28,-24,-20,-16, -4, 11,-19, 1,-23; /M: SY='A'; M= 9, 3,-12, -4, -4,-19,-14,-14, -6,-11,-11, -9, 3,-14, -8,-16, 1, -2, -5,-29,-16, -7; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= -2, 5,-25, 10, 16,-27, -7, -8,-26, 2,-26,-19, 4, 6, 3, -6, 8, -2,-23,-32,-21, 9; /M: SY='H'; M= -6, 11,-25, 14, 8,-26, -7, 22,-28, -3,-25,-15, 11, -8, 2, -6, 3, -8,-24,-32,-10, 4; /M: SY='W'; M=-10,-31,-26,-31,-23, 5,-27,-23, 10,-23, 18, 6,-31,-29,-18,-18,-27,-13, 7, 23, 5,-19; /M: SY='P'; M= -7, -4, -4, -9,-12,-17,-19,-15, -8,-13,-17,-12, 2, 6,-14,-15, -2, 1, -7,-35,-20,-14; /M: SY='V'; M= -1,-23,-13,-27,-26, -2,-29,-27, 24,-19, 7, 9,-22,-24,-24,-19, -5, 9, 36,-29, -9,-25; /M: SY='C'; M= -6,-26, 24,-30,-25, 1,-29,-25, 5,-27, 16, 4,-26,-32,-26,-23,-17, -7, 12,-30,-10,-25; /M: SY='F'; M=-13,-21,-18,-29,-23, 46,-26,-15, -2,-22, 2, -3,-14,-25,-27,-16, -7, 4, 1, -1, 22,-23; /M: SY='D'; M=-14, 40,-27, 51, 13,-34, -9, 3,-34, -2,-27,-25, 21,-11, -1, -9, 2, -5,-26,-38,-18, 6; /M: SY='N'; M= -8, 8,-28, 5, -4,-26, 12, -6,-21, -7,-22,-13, 14,-17, 1, -7, -1,-11,-22,-27,-19, -2; /M: SY='R'; M=-11, 3,-23, -2, 0,-20,-11, 0,-26, 15,-24,-14, 15,-18, 6, 37, 6, -1,-20,-29,-14, 0; /M: SY='B'; M=-13, 6,-26, 6, -7,-13,-21, -6, -2, -8, -9, -6, 3,-19, -6, -8, -7, -7, -3,-24, -1, -8; /M: SY='N'; M= -3, 4,-25, 2, 4,-24, -4, -8,-20, -2,-19,-14, 7, -2, 1, -5, 1, -3,-20,-28,-19, 2; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -3, 0,-19, 2,-11,-24, 41,-13,-31,-13,-23,-17, 2,-15,-13,-15, 0,-14,-23,-19,-22,-12; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= 13, -3,-10, -5, -1,-17, 2, -7,-13, -5,-15, -9, 1, -8, 4, -7, 14, 4, -8,-20,-13, 1; D=-8; /I: I=-8; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; /M: SY='F'; M= -9,-20,-16,-21,-17, 16,-16, -9, 6,-17, 14, 5,-18,-22,-17,-13,-15, -7, 5, -3, 15,-17; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -8, 10,-21, 17, 33,-24,-13, 1,-22, 5,-17,-14, 3, -3, 16, 0, 2, -6,-21,-23,-14, 25; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M= 0, -8,-16, -9, -3,-11,-11, -7,-13, 7, -8, -6, -4,-13, 0, 17, -1, -3, -8,-17, -8, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M=-15,-22,-15,-30,-22, 60,-22,-15, 0,-22, 7, 0,-15,-22,-30,-15,-15, -7, 0, 7, 22,-22; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M= -7, -8, -9,-12, -7, -8,-16, -9, -7, 1, -2, 3, -6,-14, -3, 7, -4, 5, -4,-19, -6, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 3, -1,-18, -5, 1,-17,-12, -8,-13, 3,-12, -7, 3,-13, 1, 2, 4, 3,-10,-25,-13, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='A'; M= 9,-15,-10,-20,-15, -8,-13,-20,-10,-14, -8, -8,-14,-17,-12,-16, -1, 5, -6, 8, -5,-12; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M=-13, -2,-29, 2, 3,-25,-17, -8,-24, 10,-24,-15, -1, 18, 2, 15, -5, -5,-22,-26,-17, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 33, 5,-25, -3, 7,-25, 0,-30,-23, 49,-17, 0, -3, 7, -3,-30,-40,-20, 3; /M: SY='A'; M= 17,-11,-13,-15,-12,-23, 17,-17,-25, -7,-19,-14, -5,-17,-11, -3, 2, -9,-14,-22,-22,-12; /M: SY='V'; M= -4,-30,-15,-31,-27, 3,-31,-27, 30,-24, 21, 14,-29,-29,-26,-21,-16, -4, 37,-26, -6,-27; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-28,-20, 14,-29,-14, 15,-23, 27, 12,-26,-29,-17,-17,-22, -8, 12,-12, 12,-19; /M: SY='I'; M= -4,-27,-15,-36,-28, 6,-32,-27, 30,-26, 12, 12,-21,-23,-23,-26,-15, -7, 24,-20, -2,-27; /M: SY='S'; M= 7, 2,-11, -1, -2,-19, -1,-11,-19,-10,-27,-18, 11,-11, -2,-10, 34, 23,-10,-38,-19, -2; /M: SY='T'; M= -3, 2,-20, -1, 0,-14,-17,-11, -9, -9, -3, -3, -1, -9, -5,-11, 0, 9, -8,-28,-12, -3; /M: SY='R'; M= -7, 1,-22, -4, -1,-22, -5, -6,-21, 2,-20,-11, 7,-15, 7, 10, 7, 7,-17,-27,-15, 2; /M: SY='K'; M= 4, -7, -7, -9, -1,-25,-15,-14,-22, 12,-23,-12, -6, -4, 0, 3, 0, -4,-14,-27,-17, -1; /M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-31,-26, 3,-32,-22, 29,-22, 13, 13,-25,-21,-22,-22,-16, -6, 29,-19, 3,-27; /M: SY='K'; M=-10, 4,-20, 5, 7,-29,-18, -4,-30, 32,-29,-13, 2,-12, 6, 18, -5, -8,-20,-26,-11, 6; /M: SY='K'; M= -3, -1,-18, -4, -1,-25, 3,-10,-28, 8,-26,-16, 4,-11, -2, 7, 2, -5,-21,-27,-19, -2; /M: SY='L'; M=-12,-22,-19,-23,-18, 7,-23, -3, 6,-20, 22, 8,-20,-28,-15,-12,-22,-10, 0,-11, 16,-18; /M: SY='S'; M= 3, -5,-10, -5, -4,-19, -6,-12,-19,-10,-25,-17, 1, -1, -2,-12, 23, 15,-13,-33,-16, -4; /I: I=-12; MD=-25; /M: M= -3,-11, -4,-14, -9,-10,-14, -5,-11, -5,-10, 0,-10, -5, -6, -8, -5, -4, -9,-17, -2, -9; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='I'; M= -2,-14,-13,-18,-14, -3,-17,-15, 17,-14, 4, 7, -9,-13,-10,-14, -2, -1, 14,-17, -4,-14; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='R'; M= -8, -7,-19, -6, 4,-14,-16, -8,-10, 13, -9, -4, -5,-12, 1, 16, -6, -6, -4,-17, -8, 1; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='G'; M= 2,-11,-25,-12,-11,-22, 18,-17,-18, -8,-19,-11, -6, -1,-11,-13, -2,-11,-15,-20,-19,-12; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='P'; M= -3,-20,-22,-17, -8,-20,-20,-20,-10,-14,-13, -9,-20, 43,-12,-20, -9, -8,-15,-28,-22,-13; /M: SY='Q'; M= -3, -8,-14,-11, -6,-15,-20,-13, -5, -6,-11, -5, -5,-12, 1, -9, 0, 0, -4,-26,-11, -4; /M: SY='H'; M=-12, -4,-13, -7, -5,-14,-11, 8,-22, 2,-20,-10, 3,-21, 3, 7, -5, -9,-21,-17, 5, -3; /M: SY='A'; M= 31,-14,-15,-21,-13,-15, 2,-20, -7,-15, 0, -5,-13,-15,-13,-20, 0, -5, -1,-20,-17,-13; /M: SY='G'; M= -7, -3,-24, -3, -8,-10, 5, -8,-17,-14, -9,-10, -1,-20,-10,-13, -1, -5,-15,-20, -3,-10; /M: SY='F'; M=-13,-27,-21,-30,-24, 26,-30,-11, 14,-23, 20, 9,-25,-30,-23,-18,-21, -8, 11, -2, 26,-24; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='N'; M= -5, 20,-14, 10, -2,-14, 7, 3,-15, -2,-19,-13, 32,-13, -2, -2, 5, -2,-19,-23,-14, -2; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= -1, -1,-14, -1, -7,-13, 12, -8,-14, -8,-11, -5, -1,-10, -7, -9, 1, 0,-10,-15,-10, -7; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='L'; M= -6,-23,-20,-25,-18, -1,-27,-11, 16,-18, 19, 17,-22,-25, -9,-15,-17, -7, 14,-20, 1,-14; /M: SY='I'; M= -6,-14,-21,-20,-20, -8,-25,-20, 19,-17, -1, 3, -7,-11,-19,-18, -8, -4, 18,-29,-12,-21; /M: SY='G'; M= -2,-17,-24,-17,-22,-19, 29,-22,-16,-17,-14, -9,-10,-23,-21,-13, -5,-13, -3,-23,-21,-22; /M: SY='E'; M=-10, 8,-27, 12, 14,-25,-16, -4,-19, -1,-19, -9, 3, 5, 6, -5, -1, -6,-20,-31,-18, 9; /M: SY='S'; M= 8, -1,-17, -4, -1,-21, -7,-12,-19, -1,-25,-16, 5, 0, -2, -6, 19, 12,-12,-32,-18, -2; /M: SY='V'; M= -5,-23,-17,-23,-22, -3,-29,-22, 20,-20, 11, 8,-23,-21,-22,-19,-12, -1, 28,-28, -8,-23; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='F'; M= -6, -8,-21, -9,-11, 5, 4,-14,-18, -9,-12,-10, -5,-18,-16,-10, -6,-10,-11,-12, -5,-12; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='B'; M= -4, 2,-13, 2, -4, -9,-13, -9, -3, -9, -1, -4, 1,-14, -8, -9, -2, 1, 0,-23, -9, -6; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='K'; M= -7, 3,-24, 5, 1,-25, 4, -7,-25, 7,-21,-12, 4,-13, 4, 4, 0, -6,-20,-22,-15, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -7, -8,-27, -4, -8,-22, -6,-17,-13, -5,-18,-11, -8, 8,-13,-11, -7, -8, -7,-28,-20,-12; /M: SY='V'; M= 4,-20, -7,-25,-23, -1,-25,-26, 12,-18, 2, 1,-18,-22,-22,-19, -1, 11, 25,-27, -9,-23; /M: SY='S'; M= 0, 6,-17, 1, 4,-21,-11, -7,-16, -2,-20,-13, 12,-12, 5, -4, 15, 12,-13,-32,-16, 5; /M: SY='F'; M=-19,-30,-29,-34,-26, 44,-28,-12, -2,-23, 6, -2,-25,-30,-26,-17,-25,-14, -8, 42, 39,-24; /M: SY='Y'; M=-19,-18,-33,-21,-21, 22,-24, 5, -7,-12, -8, -7,-16,-29,-13,-12,-21,-14,-17, 50, 54,-18; /M: SY='L'; M=-11,-28,-22,-32,-25, 19,-32,-17, 22,-25, 24, 12,-25,-28,-23,-20,-22, -8, 16, -9, 15,-25; /M: SY='Y'; M= -2,-14,-21,-19,-16, 14,-22, 0, -4,-11, -4, -4,-13,-21,-12,-13, -4, 7, -5, 4, 35,-16; /M: SY='K'; M= -7,-10,-23,-11, -2,-17,-23,-13, -7, 18,-10, 4,-10,-16, -2, 8,-10, -4, 1,-23, -9, -2; /M: SY='R'; M=-18,-13,-30,-14, -5, -5,-22, -5,-24, 21,-17, -9, -6,-20, 1, 39,-14,-11,-17, -3, 4, -4; /M: SY='V'; M= -6,-18,-20,-19,-13,-11,-26,-21, 6, 6, -2, 3,-17,-22,-12, 2,-12, -5, 17,-25, -9,-13; /M: SY='D'; M=-15, 36,-26, 38, 12,-30, -8, 3,-31, 7,-29,-23, 31,-14, 2, 3, 2, -6,-28,-36,-18, 7; /M: SY='G'; M= -1, -4,-29, -7,-18,-29, 62,-17,-38,-18,-30,-20, 7,-20,-18,-18, 1,-18,-30,-22,-29,-18; /M: SY='E'; M= 1, 2,-25, 5, 19,-26,-16, -8,-19, 8,-17,-12, -3, -9, 8, 0, -2, -8,-15,-26,-16, 13; /M: SY='F'; M= -6,-13,-23,-15,-15, 19,-21,-15, -5,-18, -5, -7,-12, -9,-21,-18, -9, -7, -4,-10, 7,-17; /M: SY='V'; M= -4,-20,-18,-21,-14,-12,-27,-18, 14, -9, 1, 6,-20,-23, -4, -7, -8, -4, 23,-27,-10, -9; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 41 in 41 different sequences |
| Number of true positive hits | 41 in 41 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | AV-Nsp11N/CoV-Nsp15M |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
41 sequences
R1AB_BC133 (P0C6W1), R1AB_BC279 (P0C6V9), R1AB_BC512 (P0C6W0), R1AB_BCHK3 (P0C6W2), R1AB_BCHK4 (P0C6W3), R1AB_BCHK5 (P0C6W4), R1AB_BCHK9 (P0C6W5), R1AB_BCRP3 (P0C6W6), R1AB_CVBEN (P0C6W7), R1AB_CVBLU (P0C6W8), R1AB_CVBM (P0C6W9), R1AB_CVBQ (P0C6X0), R1AB_CVH22 (P0C6X1), R1AB_CVHN1 (P0C6X2), R1AB_CVHN2 (P0C6X3), R1AB_CVHN5 (P0C6X4), R1AB_CVHNL (P0C6X5), R1AB_CVHOC (P0C6X6), R1AB_CVM2 (P0C6X8), R1AB_CVMA5 (P0C6X9), R1AB_CVMJH (P0C6Y0), R1AB_CVPFS (P18457), R1AB_CVPPU (P0C6Y5), R1AB_FIPV (Q98VG9), R1AB_IBVB (P0C6Y1), R1AB_IBVBC (P0C6Y2), R1AB_IBVK (P12723), R1AB_IBVM (P0C6Y3), R1AB_MERS1 (K9N7C7), R1AB_PEDV7 (P0C6Y4), R1AB_SARS (P0C6X7), R1AB_SARS2 (P0DTD1), RPOA_EAVBU (P19811), RPOA_LDVC (Q06502), RPOA_LDVP (Q83017), RPOA_PRRS1 (Q9YN02), RPOA_PRRSB (Q8B912), RPOA_PRRSL (Q04561), RPOA_PRRSR (Q9WJB2), RPOA_PRRSS (A0MD28), RPOA_SHFV (Q68772)» more
|
| PDB [Detailed view] |
63 PDB
2GRI; 2GTH; 2GTI; 2H85; 2IDY; 2OZK; 2RHB; 4RS4; 4S1T; 5EYI; 5F17; 5HBZ; 5HC1; 5S6X; 5S6Y; 5S6Z; 5S70; 5S71; 5S72; 5SA4; 5SA5; 5SA6; 5SA7; 5SA8; 5SA9; 5SAA; 5SAB; 5SAC; 5SAD; 5SAE; 5SAF; 5SAG; 5SAH; 5SAI; 5SBF; 6VWW; 6W01; 6WLC; 6WXC; 6X1B; 6X4I; 6XDH; 7K0R; 7K1L; 7K1O; 7K9P; 7KEG; 7KEH; 7KF4; 7ME0; 7N06; 7N33; 7N7R; 7N7U; 7N7W; 7N7Y; 7N83; 7RB0; 7RB2; 7TJ2; 7TQV; 8D34; 8U2X » more |