Home  |  Contact
Entry: PS51961

General information about the entry

Entry name [info] AV_NSP11N_COV_NSP15M
Accession [info] PS51961
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 02-JUN-2021 CREATED;
02-JUN-2021 DATA UPDATE;
02-JUN-2021 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51961
Associated ProRule [info] PRU01306

Name and characterization of the entry

Description [info] Arterivirus Nsp11 N-terminal/coronavirus NSP15 middle (AV-Nsp11N/CoV-Nsp15M) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=120;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8937274; R2=0.0192269; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=500; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=240; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N';  M=  3,  8,-20,  4, 10,-24, -8, -6,-23, 10,-26,-16, 13,-10,  4,  2, 12,  1,-18,-31,-17,  7;
/M: SY='I';  M= -5,-25,-23,-30,-27, -6,-12,-27, 22,-24,  7,  9,-19,-24,-23,-24,-13, -9, 22,-23,-10,-27;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-24, -5, -3,-22,  2, -8,-28, 10,-25,-15,  5,-16,  0, 22,  6, -1,-19,-26,-16, -3;
/M: SY='T';  M= -1,-15, -4,-15,-11,-13,-18, -9, -9,-17, -5, -6,-12, -3,-12,-17,  0,  1, -6,-32,-14,-13;
/M: SY='H';  M= -6,-10,-18,-13,-11,-10,-20, 15, -5,-14, -4,  2, -6,-20, -7,-10,  1,  5,  0,-30, -1,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='E';  M=-11,  2,-27,  9, 19,-20,-18, -7,-16, -5, -7,-11, -4,  7,  1, -9, -8, -9,-19,-28,-16,  9; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -9,-21,-23,-22,-16,  3,-25,-19, 10,-21, 13,  5,-18,  0,-18,-18,-17, -8,  4,-21, -6,-18; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -9,  1,-26, -1,  6,-26,-17, -6,-25, 27,-25,-10,  5,-12, 12, 25,  0, -1,-19,-24,-12,  8;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-21,-34,-27,  3,-34,-27, 35,-27, 26, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 30,-23, -3,-27;
/M: SY='L';  M=  2,-25,-12,-28,-19,  9,-20,-20,  7,-25, 27,  8,-23,-26,-21,-20,-19, -8,  5,-18, -3,-19;
/M: SY='R';  M=-16,  1,-29, -2,  2,-21,-18, 24,-27, 17,-22, -8,  9,-18, 11, 31, -7,-11,-24,-23, -1,  4;
/M: SY='N';  M= -9, 36,-20, 18, -1,-21,  4,  8,-21, -2,-30,-20, 55,-20, -1, -2, 10, -1,-29,-39,-21, -1;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-29,-19,  9,-29,-20, 19,-29, 48, 19,-29,-29,-19,-20,-28, -9,  9,-21, -1,-19;
/M: SY='G';  M= -3,  0,-28, -2, -9,-29, 47,-12,-35,-13,-29,-19,  9,-18, -9,-14,  2,-16,-30,-24,-27, -9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='V';  M=  1,-20,-10,-23,-20, -1,-21,-21, 22,-15,  8,  8,-19,-19,-19,-16, -8, -2, 30,-19, -6,-20; D=-9;
/I:         I=-9; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
/M: SY='D';  M=-10, 17,-17, 26,  3,-19,-12, -4,-14, -4,-13,-12,  4,-11, -6, -9, -1, -2, -5,-26,-11, -2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='V';  M=  3,-18,  4,-23,-19, -5,-20,-20, 14,-17,  4,  4,-16,-18,-17,-18, -7, -3, 18,-20, -8,-19; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='C';  M=  4, -7, 30,-14,-13,-11,-15,-17,-13,-13,-10,-10, -7,-16,-13,-14,  4, 12, -3,-26,-14,-13; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='W';  M= -3,-11,-20,-14,-12,  6,-12, -1, -7, -8, -8, -7, -9,-17, -7, -9, -8, -6,-10, 25, 24,-11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='K';  M= -6,  9,-18,  4,  2,-19, -3, -3,-19, 16,-21,-11, 16,-10,  2,  9,  1, -4,-17,-20,-11,  2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='F';  M=-11,-11, -6,-17,-13, 20,-18,  5, -7,-16,  0, -2, -6,-18,-15,-10, -8, -2, -5,-10,  9,-13; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='V';  M=  0,-21, -7,-21,-21,  0,-21,-21, 21,-14,  7,  7,-21,-21,-21,-14, -7,  0, 36,-21, -7,-21; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='L';  M= -7,-21,-18,-25,-18,  4,-25,-18, 24,-21, 26, 14,-18,-18,-14,-18,-18, -7, 14,-14,  0,-18; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='W';  M=-20,-36,-42,-39,-29, 27,-23,-24,-14,-22,-12,-14,-34,-30,-24,-19,-34,-24,-22,111, 33,-22;
/M: SY='D';  M=-20, 31,-30, 46, 10,-23,-15, 11,-31, -3,-23,-21, 11,-15, -2, -9, -5,-11,-26,-24,  4,  3;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-29,-22,-21, 34,-30, 18, -1,-12,  1,  0,-19,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 26, 73,-21;
/M: SY='E';  M=  5,  3,-20,  5, 18,-24,-11, -9,-21,  4,-21,-16,  1, -8,  5, -4, 12,  2,-14,-30,-18, 12;
/M: SY='P';  M= -1, -8,-27, -8, -1,-24,-14,-10,-22, 10,-23,-14, -3, 15, -1, 15, -2, -6,-19,-25,-19, -4;
/M: SY='D';  M=-12, 29,-27, 39, 27,-33,-11,  0,-32,  2,-27,-23, 16, -8,  9, -5,  6, -6,-28,-36,-19, 18;
/M: SY='A';  M=  4, -6,-15,-11, -8,-13,-13,-11, -9, -7, -6, -6,  1,-18, -6, -1,  4,  3, -6,-28,-13, -8;
/M: SY='P';  M= -8,-21,-31,-19,-11,-17,-26,-23,  2,-16,-10, -6,-19, 39,-15,-21,-10, -3, -5,-27,-18,-17;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='F';  M= -4,-18,-14,-21,-16, 22,-18, -9,  4,-17, 13,  4,-16,-19,-17,-13,-13, -6,  2, -1, 15,-16; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
/M: SY='C';  M= -5, -7,  7,-10,-12,-10, -5,  2,-14,-12,-12, -7, -4,-17,-10,-11,  0,  1, -8,-20, -4,-12; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='T';  M=  0, -4,-12, -6, -5,-11,-10,-10, -6, -6,-12, -6,  1, -5, -4, -4, 11, 12, -2,-23,-11, -5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='S';  M=  1,  0,-11, -6, -7,  3, -6, -6, -9, -9,-12, -9,  8,-12, -8, -8,  9,  5, -8,-17, -3, -7; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='T';  M=  0,  0, -7, -7, -7, -7,-14,-14, -7, -7, -7, -7,  0, -7, -7, -7, 14, 36,  0,-21, -7, -7; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='I';  M= -8,-14,-19,-17,-13, -1,-22,-10, 11, -2,  1,  4,-12,-15, -8, -6,-11, -6,  8, -8, 10,-13; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='G';  M= -3, -2,-27, -1, -4,-31, 25,-11,-32,  0,-27,-15,  2,-15,  2, -5,  2,-11,-25,-23,-21, -1;
/M: SY='V';  M= -6,-30,-14,-33,-30, 20,-31,-27, 23,-23, 12,  9,-27,-29,-31,-21,-14, -3, 35,-19,  1,-30;
/M: SY='C';  M=  1,-19, 91,-28,-26,-19,-25,-28,-24,-26,-15,-17,-19,-34,-26,-28, -7, -8, -7,-43,-27,-26;
/M: SY='K';  M= -3, -6,-25, -6,  0,-24,-12,-13,-22, 17,-24,-10, -4,  4,  0,  7,  0,  0,-16,-25,-15, -1;
/M: SY='Y';  M=-16,-23,-28,-26,-22, 19,-30,  4, 13,-16, 12, 13,-21,-27,-12,-15,-21,-10,  2,  9, 47,-20;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='P';  M=-10,  6,-25, 16,  6,-24,-11, -8,-20, -4,-21,-17, -3, 34, -4,-11, -4, -7,-21,-24,-18, -1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='T';  M= -2,-11,-17,-16,-12, -9,-23,-20,  1, -9,  0, -2, -9,-12,-11,-11,  3, 18,  3,-26, -9,-12;
/M: SY='D';  M=-14, 26,-30, 39, 35,-35,-15,  0,-33,  8,-25,-22, 10, -6, 13, -1, -1,-10,-29,-33,-19, 24;
/M: SY='L';  M= -9,-26, -9,-30,-23, 18,-28,-22, 11,-26, 22,  8,-22,-28,-24,-20,-16, -4, 11,-19,  1,-23;
/M: SY='A';  M=  9,  3,-12, -4, -4,-19,-14,-14, -6,-11,-11, -9,  3,-14, -8,-16,  1, -2, -5,-29,-16, -7;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M= -2,  5,-25, 10, 16,-27, -7, -8,-26,  2,-26,-19,  4,  6,  3, -6,  8, -2,-23,-32,-21,  9;
/M: SY='H';  M= -6, 11,-25, 14,  8,-26, -7, 22,-28, -3,-25,-15, 11, -8,  2, -6,  3, -8,-24,-32,-10,  4;
/M: SY='W';  M=-10,-31,-26,-31,-23,  5,-27,-23, 10,-23, 18,  6,-31,-29,-18,-18,-27,-13,  7, 23,  5,-19;
/M: SY='P';  M= -7, -4, -4, -9,-12,-17,-19,-15, -8,-13,-17,-12,  2,  6,-14,-15, -2,  1, -7,-35,-20,-14;
/M: SY='V';  M= -1,-23,-13,-27,-26, -2,-29,-27, 24,-19,  7,  9,-22,-24,-24,-19, -5,  9, 36,-29, -9,-25;
/M: SY='C';  M= -6,-26, 24,-30,-25,  1,-29,-25,  5,-27, 16,  4,-26,-32,-26,-23,-17, -7, 12,-30,-10,-25;
/M: SY='F';  M=-13,-21,-18,-29,-23, 46,-26,-15, -2,-22,  2, -3,-14,-25,-27,-16, -7,  4,  1, -1, 22,-23;
/M: SY='D';  M=-14, 40,-27, 51, 13,-34, -9,  3,-34, -2,-27,-25, 21,-11, -1, -9,  2, -5,-26,-38,-18,  6;
/M: SY='N';  M= -8,  8,-28,  5, -4,-26, 12, -6,-21, -7,-22,-13, 14,-17,  1, -7, -1,-11,-22,-27,-19, -2;
/M: SY='R';  M=-11,  3,-23, -2,  0,-20,-11,  0,-26, 15,-24,-14, 15,-18,  6, 37,  6, -1,-20,-29,-14,  0;
/M: SY='B';  M=-13,  6,-26,  6, -7,-13,-21, -6, -2, -8, -9, -6,  3,-19, -6, -8, -7, -7, -3,-24, -1, -8;
/M: SY='N';  M= -3,  4,-25,  2,  4,-24, -4, -8,-20, -2,-19,-14,  7, -2,  1, -5,  1, -3,-20,-28,-19,  2;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M= -3,  0,-19,  2,-11,-24, 41,-13,-31,-13,-23,-17,  2,-15,-13,-15,  0,-14,-23,-19,-22,-12; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S';  M= 13, -3,-10, -5, -1,-17,  2, -7,-13, -5,-15, -9,  1, -8,  4, -7, 14,  4, -8,-20,-13,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
/M: SY='F';  M= -9,-20,-16,-21,-17, 16,-16, -9,  6,-17, 14,  5,-18,-22,-17,-13,-15, -7,  5, -3, 15,-17; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E';  M= -8, 10,-21, 17, 33,-24,-13,  1,-22,  5,-17,-14,  3, -3, 16,  0,  2, -6,-21,-23,-14, 25; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='R';  M=  0, -8,-16, -9, -3,-11,-11, -7,-13,  7, -8, -6, -4,-13,  0, 17, -1, -3, -8,-17, -8, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='F';  M=-15,-22,-15,-30,-22, 60,-22,-15,  0,-22,  7,  0,-15,-22,-30,-15,-15, -7,  0,  7, 22,-22; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='R';  M= -7, -8, -9,-12, -7, -8,-16, -9, -7,  1, -2,  3, -6,-14, -3,  7, -4,  5, -4,-19, -6, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S';  M=  3, -1,-18, -5,  1,-17,-12, -8,-13,  3,-12, -7,  3,-13,  1,  2,  4,  3,-10,-25,-13,  1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='A';  M=  9,-15,-10,-20,-15, -8,-13,-20,-10,-14, -8, -8,-14,-17,-12,-16, -1,  5, -6,  8, -5,-12; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='P';  M=-13, -2,-29,  2,  3,-25,-17, -8,-24, 10,-24,-15, -1, 18,  2, 15, -5, -5,-22,-26,-17, -1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='N';  M=-13, 43,-23, 33,  5,-25, -3,  7,-25,  0,-30,-23, 49,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='A';  M= 17,-11,-13,-15,-12,-23, 17,-17,-25, -7,-19,-14, -5,-17,-11, -3,  2, -9,-14,-22,-22,-12;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-15,-31,-27,  3,-31,-27, 30,-24, 21, 14,-29,-29,-26,-21,-16, -4, 37,-26, -6,-27;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-28,-20, 14,-29,-14, 15,-23, 27, 12,-26,-29,-17,-17,-22, -8, 12,-12, 12,-19;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-15,-36,-28,  6,-32,-27, 30,-26, 12, 12,-21,-23,-23,-26,-15, -7, 24,-20, -2,-27;
/M: SY='S';  M=  7,  2,-11, -1, -2,-19, -1,-11,-19,-10,-27,-18, 11,-11, -2,-10, 34, 23,-10,-38,-19, -2;
/M: SY='T';  M= -3,  2,-20, -1,  0,-14,-17,-11, -9, -9, -3, -3, -1, -9, -5,-11,  0,  9, -8,-28,-12, -3;
/M: SY='R';  M= -7,  1,-22, -4, -1,-22, -5, -6,-21,  2,-20,-11,  7,-15,  7, 10,  7,  7,-17,-27,-15,  2;
/M: SY='K';  M=  4, -7, -7, -9, -1,-25,-15,-14,-22, 12,-23,-12, -6, -4,  0,  3,  0, -4,-14,-27,-17, -1;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-21,-31,-26,  3,-32,-22, 29,-22, 13, 13,-25,-21,-22,-22,-16, -6, 29,-19,  3,-27;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-20,  5,  7,-29,-18, -4,-30, 32,-29,-13,  2,-12,  6, 18, -5, -8,-20,-26,-11,  6;
/M: SY='K';  M= -3, -1,-18, -4, -1,-25,  3,-10,-28,  8,-26,-16,  4,-11, -2,  7,  2, -5,-21,-27,-19, -2;
/M: SY='L';  M=-12,-22,-19,-23,-18,  7,-23, -3,  6,-20, 22,  8,-20,-28,-15,-12,-22,-10,  0,-11, 16,-18;
/M: SY='S';  M=  3, -5,-10, -5, -4,-19, -6,-12,-19,-10,-25,-17,  1, -1, -2,-12, 23, 15,-13,-33,-16, -4;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M:         M= -3,-11, -4,-14, -9,-10,-14, -5,-11, -5,-10,  0,-10, -5, -6, -8, -5, -4, -9,-17, -2, -9; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='I';  M= -2,-14,-13,-18,-14, -3,-17,-15, 17,-14,  4,  7, -9,-13,-10,-14, -2, -1, 14,-17, -4,-14; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='R';  M= -8, -7,-19, -6,  4,-14,-16, -8,-10, 13, -9, -4, -5,-12,  1, 16, -6, -6, -4,-17, -8,  1; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G';  M=  2,-11,-25,-12,-11,-22, 18,-17,-18, -8,-19,-11, -6, -1,-11,-13, -2,-11,-15,-20,-19,-12; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='P';  M= -3,-20,-22,-17, -8,-20,-20,-20,-10,-14,-13, -9,-20, 43,-12,-20, -9, -8,-15,-28,-22,-13;
/M: SY='Q';  M= -3, -8,-14,-11, -6,-15,-20,-13, -5, -6,-11, -5, -5,-12,  1, -9,  0,  0, -4,-26,-11, -4;
/M: SY='H';  M=-12, -4,-13, -7, -5,-14,-11,  8,-22,  2,-20,-10,  3,-21,  3,  7, -5, -9,-21,-17,  5, -3;
/M: SY='A';  M= 31,-14,-15,-21,-13,-15,  2,-20, -7,-15,  0, -5,-13,-15,-13,-20,  0, -5, -1,-20,-17,-13;
/M: SY='G';  M= -7, -3,-24, -3, -8,-10,  5, -8,-17,-14, -9,-10, -1,-20,-10,-13, -1, -5,-15,-20, -3,-10;
/M: SY='F';  M=-13,-27,-21,-30,-24, 26,-30,-11, 14,-23, 20,  9,-25,-30,-23,-18,-21, -8, 11, -2, 26,-24;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='N';  M= -5, 20,-14, 10, -2,-14,  7,  3,-15, -2,-19,-13, 32,-13, -2, -2,  5, -2,-19,-23,-14, -2; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G';  M= -1, -1,-14, -1, -7,-13, 12, -8,-14, -8,-11, -5, -1,-10, -7, -9,  1,  0,-10,-15,-10, -7; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L';  M= -6,-23,-20,-25,-18, -1,-27,-11, 16,-18, 19, 17,-22,-25, -9,-15,-17, -7, 14,-20,  1,-14;
/M: SY='I';  M= -6,-14,-21,-20,-20, -8,-25,-20, 19,-17, -1,  3, -7,-11,-19,-18, -8, -4, 18,-29,-12,-21;
/M: SY='G';  M= -2,-17,-24,-17,-22,-19, 29,-22,-16,-17,-14, -9,-10,-23,-21,-13, -5,-13, -3,-23,-21,-22;
/M: SY='E';  M=-10,  8,-27, 12, 14,-25,-16, -4,-19, -1,-19, -9,  3,  5,  6, -5, -1, -6,-20,-31,-18,  9;
/M: SY='S';  M=  8, -1,-17, -4, -1,-21, -7,-12,-19, -1,-25,-16,  5,  0, -2, -6, 19, 12,-12,-32,-18, -2;
/M: SY='V';  M= -5,-23,-17,-23,-22, -3,-29,-22, 20,-20, 11,  8,-23,-21,-22,-19,-12, -1, 28,-28, -8,-23;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='F';  M= -6, -8,-21, -9,-11,  5,  4,-14,-18, -9,-12,-10, -5,-18,-16,-10, -6,-10,-11,-12, -5,-12; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='B';  M= -4,  2,-13,  2, -4, -9,-13, -9, -3, -9, -1, -4,  1,-14, -8, -9, -2,  1,  0,-23, -9, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='K';  M= -7,  3,-24,  5,  1,-25,  4, -7,-25,  7,-21,-12,  4,-13,  4,  4,  0, -6,-20,-22,-15,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P';  M= -7, -8,-27, -4, -8,-22, -6,-17,-13, -5,-18,-11, -8,  8,-13,-11, -7, -8, -7,-28,-20,-12;
/M: SY='V';  M=  4,-20, -7,-25,-23, -1,-25,-26, 12,-18,  2,  1,-18,-22,-22,-19, -1, 11, 25,-27, -9,-23;
/M: SY='S';  M=  0,  6,-17,  1,  4,-21,-11, -7,-16, -2,-20,-13, 12,-12,  5, -4, 15, 12,-13,-32,-16,  5;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-29,-34,-26, 44,-28,-12, -2,-23,  6, -2,-25,-30,-26,-17,-25,-14, -8, 42, 39,-24;
/M: SY='Y';  M=-19,-18,-33,-21,-21, 22,-24,  5, -7,-12, -8, -7,-16,-29,-13,-12,-21,-14,-17, 50, 54,-18;
/M: SY='L';  M=-11,-28,-22,-32,-25, 19,-32,-17, 22,-25, 24, 12,-25,-28,-23,-20,-22, -8, 16, -9, 15,-25;
/M: SY='Y';  M= -2,-14,-21,-19,-16, 14,-22,  0, -4,-11, -4, -4,-13,-21,-12,-13, -4,  7, -5,  4, 35,-16;
/M: SY='K';  M= -7,-10,-23,-11, -2,-17,-23,-13, -7, 18,-10,  4,-10,-16, -2,  8,-10, -4,  1,-23, -9, -2;
/M: SY='R';  M=-18,-13,-30,-14, -5, -5,-22, -5,-24, 21,-17, -9, -6,-20,  1, 39,-14,-11,-17, -3,  4, -4;
/M: SY='V';  M= -6,-18,-20,-19,-13,-11,-26,-21,  6,  6, -2,  3,-17,-22,-12,  2,-12, -5, 17,-25, -9,-13;
/M: SY='D';  M=-15, 36,-26, 38, 12,-30, -8,  3,-31,  7,-29,-23, 31,-14,  2,  3,  2, -6,-28,-36,-18,  7;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-29, -7,-18,-29, 62,-17,-38,-18,-30,-20,  7,-20,-18,-18,  1,-18,-30,-22,-29,-18;
/M: SY='E';  M=  1,  2,-25,  5, 19,-26,-16, -8,-19,  8,-17,-12, -3, -9,  8,  0, -2, -8,-15,-26,-16, 13;
/M: SY='F';  M= -6,-13,-23,-15,-15, 19,-21,-15, -5,-18, -5, -7,-12, -9,-21,-18, -9, -7, -4,-10,  7,-17;
/M: SY='V';  M= -4,-20,-18,-21,-14,-12,-27,-18, 14, -9,  1,  6,-20,-23, -4, -7, -8, -4, 23,-27,-10, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2021_03 which contains 565'254 sequence entries.


Total number of hits 41 in 41 different sequences
Number of true positive hits 41 in 41 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] AV-Nsp11N/CoV-Nsp15M
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
41 sequences

R1AB_BC133  (P0C6W1    ), R1AB_BC279  (P0C6V9    ), R1AB_BC512  (P0C6W0    ), 
R1AB_BCHK3  (P0C6W2    ), R1AB_BCHK4  (P0C6W3    ), R1AB_BCHK5  (P0C6W4    ), 
R1AB_BCHK9  (P0C6W5    ), R1AB_BCRP3  (P0C6W6    ), R1AB_CVBEN  (P0C6W7    ), 
R1AB_CVBLU  (P0C6W8    ), R1AB_CVBM   (P0C6W9    ), R1AB_CVBQ   (P0C6X0    ), 
R1AB_CVH22  (P0C6X1    ), R1AB_CVHN1  (P0C6X2    ), R1AB_CVHN2  (P0C6X3    ), 
R1AB_CVHN5  (P0C6X4    ), R1AB_CVHNL  (P0C6X5    ), R1AB_CVHOC  (P0C6X6    ), 
R1AB_CVM2   (P0C6X8    ), R1AB_CVMA5  (P0C6X9    ), R1AB_CVMJH  (P0C6Y0    ), 
R1AB_CVPFS  (P18457    ), R1AB_CVPPU  (P0C6Y5    ), R1AB_FIPV   (Q98VG9    ), 
R1AB_IBVB   (P0C6Y1    ), R1AB_IBVBC  (P0C6Y2    ), R1AB_IBVK   (P12723    ), 
R1AB_IBVM   (P0C6Y3    ), R1AB_MERS1  (K9N7C7    ), R1AB_PEDV7  (P0C6Y4    ), 
R1AB_SARS   (P0C6X7    ), R1AB_SARS2  (P0DTD1    ), RPOA_EAVBU  (P19811    ), 
RPOA_LDVC   (Q06502    ), RPOA_LDVP   (Q83017    ), RPOA_PRRS1  (Q9YN02    ), 
RPOA_PRRSB  (Q8B912    ), RPOA_PRRSL  (Q04561    ), RPOA_PRRSR  (Q9WJB2    ), 
RPOA_PRRSS  (A0MD28    ), RPOA_SHFV   (Q68772    )
» more

PDB
[Detailed view]
32 PDB

2GRI; 2GTH; 2GTI; 2H85; 2IDY; 2OZK; 2RHB; 4RS4; 4S1T; 5EYI; 5F17; 5HBZ; 5HC1; 5S6X; 5S6Y; 5S6Z; 5S70; 5S71; 5S72; 6VWW; 6W01; 6WLC; 6WXC; 6X1B; 6X4I; 6XDH; 7K1L; 7K1O; 7K9P; 7KEG; 7KEH; 7KF4
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission