Home  |  Contact
Entry: PS51981

General information about the entry

Entry name [info] ZF_RZ
Accession [info] PS51981
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 23-FEB-2022 CREATED;
23-FEB-2022 DATA UPDATE;
25-MAY-2022 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51981
Associated ProRule [info] PRU01325

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger RZ-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9835770; R2=0.0090168; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=612; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=390; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -4,-20,-16,-27,-19, -1,-23,-13, 15,-15, 13, 25,-19,-21,-11,-15,-13, -5, 12,-21, -3,-16;
/M: SY='P';  M= -5,-10,-24, -7, -2,-21,-15,-14,-17, -9,-21,-14, -9, 29, -7,-13,  2,  2,-18,-29,-19, -6;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-23,  7, 12,-22,-13,  0,-19, -2,-15,-11,  2,-11,  5, -4,  0, -6,-17,-28,-12,  8;
/M: SY='D';  M= -9, 19,-26, 26, 15,-28,-11, -4,-26,  2,-22,-17,  8, -8,  3, -5,  0, -7,-22,-32,-17,  8;
/M: SY='E';  M= -7, -1,-24,  1, 11,-18,-17, -6,-11, -5, -7, -4, -5,-10,  1, -8, -6, -8,-12,-25,-12,  6;
/M: SY='L';  M= -6,-16,-22,-18,-11, -3,-21,-13,  1, -8,  7,  6,-13,-20, -8, -3,-12, -6,  1,-20, -4,-10;
/M:         M=  0, -5,-20, -6,  0,-15,-14,-10,-11, -4,-11, -7, -4,-11, -3, -5, -1, -4, -8,-25,-12, -2;
/M: SY='E';  M= -2, -1,-21, -1,  9,-22,-15, -4,-16, -1,-13, -7, -3, -9,  7, -3,  0, -4,-14,-26,-13,  7;
/M: SY='V';  M=  5,-21,-19,-27,-20, -3,-24,-21, 17,-19,  7,  6,-18,-19,-17,-20, -8, -3, 18,-20, -4,-20;
/M: SY='M';  M= -6,-15,-21,-18,-11, -4,-21,-10, -1, -6,  1,  3,-12,-21, -6, -1,-10, -5,  1,-19, -3,-10;
/M: SY='R';  M= -3, -1,-23, -5,  1,-20,-11, -5,-17,  5,-17, -7,  3,-12,  4,  6,  0, -2,-14,-25,-12,  1;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='A';  M=  6, -5, -9, -7, -4, -7, -7, -5, -5, -5, -5, -4, -4, -7, -4, -7,  0, -2, -3,-10, -4, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='A';  M=  3, -7,-19,-10, -7,-10, -8,-11,-12, -7,-11, -8, -5,-14, -7, -9, -3, -5, -9, -7, -7, -7; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -2, -7,-19, -9, -3,-12,-13,-10, -6, -5, -5, -1, -6,-15, -4, -6, -4, -3, -4,-22, -9, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='G';  M= -1,-10,-22,-12,-11,-10,  5,-14,-15,-11,-12, -7, -5,-16,-11,-10, -2, -7,-10,-21,-13,-11;
/M:         M= -4, -9,-22,-11, -8,-10, -8,-10, -9,-10, -5, -3, -5,-18, -8, -7, -5, -5, -7,-20, -8, -9;
/M: SY='E';  M= -5, -1,-24, -1,  5,-19, -5, -5,-19, -4,-15,-10,  0,-11,  0, -5,  0, -3,-16,-25,-12,  2;
/M: SY='S';  M=  0, -4,-21, -7, -3,-19, -4, -9,-19, -1,-18,-11,  0,-11, -2,  0,  2,  0,-15,-22,-12, -3;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M= -2,-12,-20,-12,-14,-11,  7,-17,-10,-14, -8, -5, -9,-14,-15,-13, -3, -5, -4,-21,-14,-15; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='H';  M= -7, -4,-19, -6, -2,-16,-14, 17,-18, -1,-15, -6,  1,-15,  3,  4,  1, -1,-13,-25, -3, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='W';  M=-13,-28,-34,-30,-21,  6,-22,-21, -7,-16, -8, -7,-25,-22,-15,-13,-23,-17,-12, 57, 13,-16;
/M: SY='Y';  M=-17,-19,-28,-20,-19, 25,-26, 10, -4,-12, -2, -2,-17,-26,-12,-11,-17, -9,-10, 22, 54,-18;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -5, -8,-19,-10, -2,-14,-18, -9,-11,  4,-12, -5, -5,-15,  0,  4, -2,  0, -6,-22, -7, -2;
/M: SY='C';  M= -9,-19,103,-28,-26,-19,-28,-27,-27,-27,-18,-18,-18,-37,-27,-27, -9,-10, -9,-47,-28,-27;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M= -4,-11,-25, -8,  0,-25,-17,-14,-17, -4,-23,-14,-10, 34, -3,-10, -3, -5,-19,-29,-21, -4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='N';  M= -8, 16, 11,  3, -6,-19, -9, -3,-21, -6,-24,-17, 27,-23, -6, -6,  2, -4,-21,-37,-20, -7;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-27, -9,-18,-27, 56,-18,-35,-17,-27,-18,  1,-20,-17,-18,  0,-17,-26,-21,-26,-18;
/M: SY='H';  M=-17, -4,-28, -4, -2,-11,-21, 68,-23,-10,-14,  0,  4,-19,  5, -3,-10,-15,-24,-23, 19, -2;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -7,-20,-26,-18,-11,-11,-22,-18, -4,-12, -9, -6,-18, 18,-12,-14, -9, -5, -7,-18,-10,-14;
/M: SY='Y';  M=-17,-20, -7,-23,-22, 24,-28,  3, -5,-15, -3, -4,-17,-29,-17,-13,-16, -9, -8, 10, 45,-21;
/M: SY='V';  M=  2,-18,-10,-23,-18,  5,-18,-19,  1,-17,  0, -2,-14,-20,-19,-16, -2,  3,  7,-20, -3,-18;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-20,-34,-29,  1,-34,-28, 37,-24, 16, 15,-24,-25,-24,-24,-15, -5, 36,-24, -4,-29;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M=  0, -5,-21, -5,-13,-26, 39,-16,-31,-16,-24,-17,  0,-17,-14,-17,  2,-10,-23,-24,-24,-14; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M=-10, 19,-27, 22, 28,-29,-11,  1,-26,  4,-22,-17, 14, -9, 12, -1,  1, -8,-27,-32,-18, 20;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='C';  M=-10,-20,112,-30,-30,-18,-30,-29,-28,-29,-19,-19,-20,-39,-30,-29,-10,-10, -9,-46,-27,-30; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-28,-10,-18,-28, 59,-19,-36,-18,-27,-17,  0,-19,-18,-18,  1,-15,-27,-21,-27,-18;
/M: SY='R';  M= -8, -9,-26,-11, -5,-19, -4, -3,-18,  5,-12, -1, -3,-18,  4, 15, -7,-10,-16,-21,-11, -2;
/M: SY='P';  M=  3,-17,-30,-13, -4,-24,-16,-19,-15,-10,-21,-15,-16, 51, -9,-17, -5, -6,-18,-27,-24,-10;
/M: SY='M';  M= -7,-14,-20,-21,-17, -2,-19, -7,  8,-10,  5, 24,-11,-21, -7, -9,-12, -4,  5,-12,  0,-12;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-23,  2, 21,-25,-16, -5,-17,  1,-15, -9, -4, -9, 15, -4,  1, -4,-15,-27,-15, 18;
/M: SY='T';  M= -6, -8,-22, -9,  1,-15,-19,-11, -7, -2, -7, -4, -7,-14,  0, -1, -1,  3, -4,-26,-10,  0;
/M: SY='S';  M= 10, -6,-14, -8, -8,-18,  9,-14,-20,-10,-21,-15,  1,-15, -8,-11, 15,  3,-12,-27,-17, -8;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-25, -8, -1,-18,-20, -6,-18, 16,-17, -7, -1,-14,  5, 24, -4, -1,-12,-23, -9,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,116,-30,-29,-19,-30,-30,-29,-29,-19,-19,-20,-40,-29,-29,-10,-10,-10,-49,-29,-29;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='P';  M= -6,-16,-29,-14, -8,-16,-20,-15, -6,-12,-12, -8,-13, 34,-11,-16, -9, -7,-12,-26,-17,-12; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='E';  M=-11, 15,-25, 22, 25,-27,-14, -3,-25,  3,-19,-17,  7, -9,  8, -3,  0, -6,-22,-31,-17, 17; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='C';  M=-10,-20,117,-29,-29,-20,-29,-30,-30,-30,-20,-20,-19,-39,-29,-30, -9, -9,-10,-50,-30,-29;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G';  M= -4, -3,-28, -4,-10,-27, 34, -8,-33, -5,-27,-16,  6,-17, -8, -3,  0,-14,-26,-23,-22, -9;
/M: SY='A';  M= 15, -6,-15,-11, -2,-18,-11,-11,-10, -5, -9, -7, -5,-14, -3, -9,  3, -2, -4,-25,-15, -3;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -4, -6,-26, -5,  5,-22,-16,-11,-16, -1,-16,-10, -6, 10,  1, -4, -2, -1,-15,-26,-16,  2;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-25,-37,-29,  0,-37,-29, 43,-28, 19, 17,-22,-22,-22,-27,-18, -7, 32,-22, -2,-29;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-30, -8,-18,-30, 64,-19,-39,-18,-30,-20,  1,-20,-18,-17,  0,-19,-30,-21,-29,-18;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-29,-10,-17,-29, 61,-17,-38,-16,-29,-19,  0,-20,-17,-15,  0,-18,-29,-21,-28,-17;
/M: SY='E';  M= -4, -4,-20, -6,  3,-18,-13, -8,-13, -3,-11, -7, -2,-13,  2, -2,  2,  2,-10,-26,-12,  2;
/M: SY='N';  M= -7, 13,-22,  8,  1,-22, -1,  4,-23, -1,-24,-15, 20,-17,  3,  1,  6, -3,-23,-30,-13,  1;
/M: SY='H';  M=-17, -3,-28, -4, -3,-13,-20, 74,-24,-10,-16, -1,  4,-19,  5, -3,-10,-16,-24,-22, 22, -3;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-24, -6, -2,-18,-16, -6,-12,  5,-13, -6,  2,-17,  1,  9, -3, -3, -9,-24, -9, -2;
/M: SY='P';  M= -2,-17,-23,-17, -9,-12,-18,-14, -5,-15, -1, -3,-16, 12,-11,-15, -9, -6, -8,-24,-13,-12;
/M: SY='V';  M=  1,-15,-19,-17,-12, -8,-19,-16,  4,-13,  3,  1,-15,-17,-13,-12, -8, -4,  9,-25,-10,-13;
/M: SY='E';  M=  4,  0,-22,  0,  5,-23, -9, -5,-18, -2,-17,-11,  0, -6,  3, -4,  4, -2,-15,-27,-15,  3;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-27, -4,-11,-26, 37,-15,-32,-12,-25,-17,  2,-16,-11,-12,  2,-11,-24,-23,-24,-11;
/M: SY='N';  M=-10,  3,-20, -6,-10,  7,-12, -8, -9,-11,-11, -9, 12,-21,-13, -9, -2, -2,-10,-22, -5,-10;
/M: SY='R';  M= -6, -3,-23, -5, -1,-20,-13, -6,-17,  4,-16, -8,  1,-12,  5,  9,  1,  3,-13,-23,-11,  1;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='R';  M= -7, -8,-26, -8,  1,-18,-17,  0,-14,  2,-11, -5, -6,-10,  4,  7, -6, -7,-12,-22, -9,  1; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A';  M=  3,-11,-19,-15,-11, -6,-18,-14,  1,-11, -1,  0,-10,-17, -8,-12, -5, -1,  2,-19, -5,-10; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='R';  M= -7,  2,-22,  1,  4,-20,-11, -5,-18,  2,-17,-10,  3, -8,  4,  5,  2,  0,-15,-25,-12,  3; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='B';  M= -5,  4,-20,  3,  1,-17,-10, -5,-12, -5,-11, -8,  4,-12, -2, -6,  0, -2,-11,-25,-11, -2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M:         M= -4, -5,-11, -7, -5, -3, -9, -5, -4, -4, -3, -1, -3,-11, -3, -3, -3, -2, -3,-12, -3, -5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='S';  M= -1, -3,-19, -4,  1,-19, -7, -8,-18, -4,-16,-10, -1, -8, -1, -5,  3,  0,-14,-26,-14,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='D';  M=-12, 24,-28, 35, 20,-32,-12, -2,-30,  2,-24,-21,  9, -5,  4, -5,  0, -8,-25,-33,-18, 11;
/M: SY='R';  M= -9,-12,-24,-16, -6,-12,-19, -6, -7,  1, -3,  3, -8,-19,  3, 12,-10, -8, -7,-20, -6, -3;
/M: SY='T';  M= -2,  4,-19,  2, -3,-17,-10,-11,-15, -8,-13,-11,  2,-12, -5, -9,  8, 12, -9,-29,-14, -4;
/M: SY='Q';  M= -5, -5,-27, -5,  4,-25, -2, -5,-22,  2,-18, -9, -2, -9, 11,  5, -2, -9,-21,-23,-15,  6;
/M: SY='T';  M=  0, -6,-21, -9, -4,-15,-15,-12,-13, -2,-12, -7, -5, -6, -3, -3,  2,  7, -9,-24,-10, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2022_02 which contains 567'483 sequence entries.


Total number of hits 6 in 6 different sequences
Number of true positive hits 6 in 6 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] RZ-type
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
6 sequences

R213A_DANRE (A0A0R4IBK5), R213B_DANRE (A0A0R4I9Y1), RN213_HUMAN (Q63HN8    ), 
RN213_MOUSE (E9Q555    ), ZNFX1_HUMAN (Q9P2E3    ), ZNFX1_MOUSE (Q8R151    )
» more

PDB
[Detailed view]
2 PDB

6TAX; 6TAY

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission