 |
|
| Entry: PS51981 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_RZ |
| Accession [info] | PS51981 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
23-FEB-2022 CREATED;
23-FEB-2022 DATA UPDATE; 03-AUG-2022 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51981 |
| Associated ProRule [info] | PRU01325 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc finger RZ-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9835770; R2=0.0090168; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=612; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=390; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -4,-20,-16,-27,-19, -1,-23,-13, 15,-15, 13, 25,-19,-21,-11,-15,-13, -5, 12,-21, -3,-16; /M: SY='P'; M= -5,-10,-24, -7, -2,-21,-15,-14,-17, -9,-21,-14, -9, 29, -7,-13, 2, 2,-18,-29,-19, -6; /M: SY='E'; M= -7, 4,-23, 7, 12,-22,-13, 0,-19, -2,-15,-11, 2,-11, 5, -4, 0, -6,-17,-28,-12, 8; /M: SY='D'; M= -9, 19,-26, 26, 15,-28,-11, -4,-26, 2,-22,-17, 8, -8, 3, -5, 0, -7,-22,-32,-17, 8; /M: SY='E'; M= -7, -1,-24, 1, 11,-18,-17, -6,-11, -5, -7, -4, -5,-10, 1, -8, -6, -8,-12,-25,-12, 6; /M: SY='L'; M= -6,-16,-22,-18,-11, -3,-21,-13, 1, -8, 7, 6,-13,-20, -8, -3,-12, -6, 1,-20, -4,-10; /M: M= 0, -5,-20, -6, 0,-15,-14,-10,-11, -4,-11, -7, -4,-11, -3, -5, -1, -4, -8,-25,-12, -2; /M: SY='E'; M= -2, -1,-21, -1, 9,-22,-15, -4,-16, -1,-13, -7, -3, -9, 7, -3, 0, -4,-14,-26,-13, 7; /M: SY='V'; M= 5,-21,-19,-27,-20, -3,-24,-21, 17,-19, 7, 6,-18,-19,-17,-20, -8, -3, 18,-20, -4,-20; /M: SY='M'; M= -6,-15,-21,-18,-11, -4,-21,-10, -1, -6, 1, 3,-12,-21, -6, -1,-10, -5, 1,-19, -3,-10; /M: SY='R'; M= -3, -1,-23, -5, 1,-20,-11, -5,-17, 5,-17, -7, 3,-12, 4, 6, 0, -2,-14,-25,-12, 1; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 6, -5, -9, -7, -4, -7, -7, -5, -5, -5, -5, -4, -4, -7, -4, -7, 0, -2, -3,-10, -4, -5; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='A'; M= 3, -7,-19,-10, -7,-10, -8,-11,-12, -7,-11, -8, -5,-14, -7, -9, -3, -5, -9, -7, -7, -7; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: M= -2, -7,-19, -9, -3,-12,-13,-10, -6, -5, -5, -1, -6,-15, -4, -6, -4, -3, -4,-22, -9, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='G'; M= -1,-10,-22,-12,-11,-10, 5,-14,-15,-11,-12, -7, -5,-16,-11,-10, -2, -7,-10,-21,-13,-11; /M: M= -4, -9,-22,-11, -8,-10, -8,-10, -9,-10, -5, -3, -5,-18, -8, -7, -5, -5, -7,-20, -8, -9; /M: SY='E'; M= -5, -1,-24, -1, 5,-19, -5, -5,-19, -4,-15,-10, 0,-11, 0, -5, 0, -3,-16,-25,-12, 2; /M: SY='S'; M= 0, -4,-21, -7, -3,-19, -4, -9,-19, -1,-18,-11, 0,-11, -2, 0, 2, 0,-15,-22,-12, -3; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -2,-12,-20,-12,-14,-11, 7,-17,-10,-14, -8, -5, -9,-14,-15,-13, -3, -5, -4,-21,-14,-15; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='H'; M= -7, -4,-19, -6, -2,-16,-14, 17,-18, -1,-15, -6, 1,-15, 3, 4, 1, -1,-13,-25, -3, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='W'; M=-13,-28,-34,-30,-21, 6,-22,-21, -7,-16, -8, -7,-25,-22,-15,-13,-23,-17,-12, 57, 13,-16; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-28,-20,-19, 25,-26, 10, -4,-12, -2, -2,-17,-26,-12,-11,-17, -9,-10, 22, 54,-18; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='K'; M= -5, -8,-19,-10, -2,-14,-18, -9,-11, 4,-12, -5, -5,-15, 0, 4, -2, 0, -6,-22, -7, -2; /M: SY='C'; M= -9,-19,103,-28,-26,-19,-28,-27,-27,-27,-18,-18,-18,-37,-27,-27, -9,-10, -9,-47,-28,-27; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M= -4,-11,-25, -8, 0,-25,-17,-14,-17, -4,-23,-14,-10, 34, -3,-10, -3, -5,-19,-29,-21, -4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='N'; M= -8, 16, 11, 3, -6,-19, -9, -3,-21, -6,-24,-17, 27,-23, -6, -6, 2, -4,-21,-37,-20, -7; /M: SY='G'; M= -1, -8,-27, -9,-18,-27, 56,-18,-35,-17,-27,-18, 1,-20,-17,-18, 0,-17,-26,-21,-26,-18; /M: SY='H'; M=-17, -4,-28, -4, -2,-11,-21, 68,-23,-10,-14, 0, 4,-19, 5, -3,-10,-15,-24,-23, 19, -2; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -7,-20,-26,-18,-11,-11,-22,-18, -4,-12, -9, -6,-18, 18,-12,-14, -9, -5, -7,-18,-10,-14; /M: SY='Y'; M=-17,-20, -7,-23,-22, 24,-28, 3, -5,-15, -3, -4,-17,-29,-17,-13,-16, -9, -8, 10, 45,-21; /M: SY='V'; M= 2,-18,-10,-23,-18, 5,-18,-19, 1,-17, 0, -2,-14,-20,-19,-16, -2, 3, 7,-20, -3,-18; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-34,-29, 1,-34,-28, 37,-24, 16, 15,-24,-25,-24,-24,-15, -5, 36,-24, -4,-29; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='G'; M= 0, -5,-21, -5,-13,-26, 39,-16,-31,-16,-24,-17, 0,-17,-14,-17, 2,-10,-23,-24,-24,-14; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M=-10, 19,-27, 22, 28,-29,-11, 1,-26, 4,-22,-17, 14, -9, 12, -1, 1, -8,-27,-32,-18, 20; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='C'; M=-10,-20,112,-30,-30,-18,-30,-29,-28,-29,-19,-19,-20,-39,-30,-29,-10,-10, -9,-46,-27,-30; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 0, -9,-28,-10,-18,-28, 59,-19,-36,-18,-27,-17, 0,-19,-18,-18, 1,-15,-27,-21,-27,-18; /M: SY='R'; M= -8, -9,-26,-11, -5,-19, -4, -3,-18, 5,-12, -1, -3,-18, 4, 15, -7,-10,-16,-21,-11, -2; /M: SY='P'; M= 3,-17,-30,-13, -4,-24,-16,-19,-15,-10,-21,-15,-16, 51, -9,-17, -5, -6,-18,-27,-24,-10; /M: SY='M'; M= -7,-14,-20,-21,-17, -2,-19, -7, 8,-10, 5, 24,-11,-21, -7, -9,-12, -4, 5,-12, 0,-12; /M: SY='E'; M= -6, -1,-23, 2, 21,-25,-16, -5,-17, 1,-15, -9, -4, -9, 15, -4, 1, -4,-15,-27,-15, 18; /M: SY='T'; M= -6, -8,-22, -9, 1,-15,-19,-11, -7, -2, -7, -4, -7,-14, 0, -1, -1, 3, -4,-26,-10, 0; /M: SY='S'; M= 10, -6,-14, -8, -8,-18, 9,-14,-20,-10,-21,-15, 1,-15, -8,-11, 15, 3,-12,-27,-17, -8; /M: SY='R'; M=-11, -6,-25, -8, -1,-18,-20, -6,-18, 16,-17, -7, -1,-14, 5, 24, -4, -1,-12,-23, -9, 0; /M: SY='C'; M=-10,-20,116,-30,-29,-19,-30,-30,-29,-29,-19,-19,-20,-40,-29,-29,-10,-10,-10,-49,-29,-29; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='P'; M= -6,-16,-29,-14, -8,-16,-20,-15, -6,-12,-12, -8,-13, 34,-11,-16, -9, -7,-12,-26,-17,-12; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='E'; M=-11, 15,-25, 22, 25,-27,-14, -3,-25, 3,-19,-17, 7, -9, 8, -3, 0, -6,-22,-31,-17, 17; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-29,-29,-20,-29,-30,-30,-30,-20,-20,-19,-39,-29,-30, -9, -9,-10,-50,-30,-29; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -4, -3,-28, -4,-10,-27, 34, -8,-33, -5,-27,-16, 6,-17, -8, -3, 0,-14,-26,-23,-22, -9; /M: SY='A'; M= 15, -6,-15,-11, -2,-18,-11,-11,-10, -5, -9, -7, -5,-14, -3, -9, 3, -2, -4,-25,-15, -3; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -4, -6,-26, -5, 5,-22,-16,-11,-16, -1,-16,-10, -6, 10, 1, -4, -2, -1,-15,-26,-16, 2; /M: SY='I'; M= -8,-29,-25,-37,-29, 0,-37,-29, 43,-28, 19, 17,-22,-22,-22,-27,-18, -7, 32,-22, -2,-29; /M: SY='G'; M= -1, -8,-30, -8,-18,-30, 64,-19,-39,-18,-30,-20, 1,-20,-18,-17, 0,-19,-30,-21,-29,-18; /M: SY='G'; M= -1, -9,-29,-10,-17,-29, 61,-17,-38,-16,-29,-19, 0,-20,-17,-15, 0,-18,-29,-21,-28,-17; /M: SY='E'; M= -4, -4,-20, -6, 3,-18,-13, -8,-13, -3,-11, -7, -2,-13, 2, -2, 2, 2,-10,-26,-12, 2; /M: SY='N'; M= -7, 13,-22, 8, 1,-22, -1, 4,-23, -1,-24,-15, 20,-17, 3, 1, 6, -3,-23,-30,-13, 1; /M: SY='H'; M=-17, -3,-28, -4, -3,-13,-20, 74,-24,-10,-16, -1, 4,-19, 5, -3,-10,-16,-24,-22, 22, -3; /M: SY='R'; M= -7, -3,-24, -6, -2,-18,-16, -6,-12, 5,-13, -6, 2,-17, 1, 9, -3, -3, -9,-24, -9, -2; /M: SY='P'; M= -2,-17,-23,-17, -9,-12,-18,-14, -5,-15, -1, -3,-16, 12,-11,-15, -9, -6, -8,-24,-13,-12; /M: SY='V'; M= 1,-15,-19,-17,-12, -8,-19,-16, 4,-13, 3, 1,-15,-17,-13,-12, -8, -4, 9,-25,-10,-13; /M: SY='E'; M= 4, 0,-22, 0, 5,-23, -9, -5,-18, -2,-17,-11, 0, -6, 3, -4, 4, -2,-15,-27,-15, 3; /M: SY='G'; M= -2, -4,-27, -4,-11,-26, 37,-15,-32,-12,-25,-17, 2,-16,-11,-12, 2,-11,-24,-23,-24,-11; /M: SY='N'; M=-10, 3,-20, -6,-10, 7,-12, -8, -9,-11,-11, -9, 12,-21,-13, -9, -2, -2,-10,-22, -5,-10; /M: SY='R'; M= -6, -3,-23, -5, -1,-20,-13, -6,-17, 4,-16, -8, 1,-12, 5, 9, 1, 3,-13,-23,-11, 1; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='R'; M= -7, -8,-26, -8, 1,-18,-17, 0,-14, 2,-11, -5, -6,-10, 4, 7, -6, -7,-12,-22, -9, 1; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='A'; M= 3,-11,-19,-15,-11, -6,-18,-14, 1,-11, -1, 0,-10,-17, -8,-12, -5, -1, 2,-19, -5,-10; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='R'; M= -7, 2,-22, 1, 4,-20,-11, -5,-18, 2,-17,-10, 3, -8, 4, 5, 2, 0,-15,-25,-12, 3; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='B'; M= -5, 4,-20, 3, 1,-17,-10, -5,-12, -5,-11, -8, 4,-12, -2, -6, 0, -2,-11,-25,-11, -2; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: M= -4, -5,-11, -7, -5, -3, -9, -5, -4, -4, -3, -1, -3,-11, -3, -3, -3, -2, -3,-12, -3, -5; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='S'; M= -1, -3,-19, -4, 1,-19, -7, -8,-18, -4,-16,-10, -1, -8, -1, -5, 3, 0,-14,-26,-14, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='D'; M=-12, 24,-28, 35, 20,-32,-12, -2,-30, 2,-24,-21, 9, -5, 4, -5, 0, -8,-25,-33,-18, 11; /M: SY='R'; M= -9,-12,-24,-16, -6,-12,-19, -6, -7, 1, -3, 3, -8,-19, 3, 12,-10, -8, -7,-20, -6, -3; /M: SY='T'; M= -2, 4,-19, 2, -3,-17,-10,-11,-15, -8,-13,-11, 2,-12, -5, -9, 8, 12, -9,-29,-14, -4; /M: SY='Q'; M= -5, -5,-27, -5, 4,-25, -2, -5,-22, 2,-18, -9, -2, -9, 11, 5, -2, -9,-21,-23,-15, 6; /M: SY='T'; M= 0, -6,-21, -9, -4,-15,-15,-12,-13, -2,-12, -7, -5, -6, -3, -3, 2, 7, -9,-24,-10, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 6 in 6 different sequences |
| Number of true positive hits | 6 in 6 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | RZ-type |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
6 sequences
R213A_DANRE (A0A0R4IBK5), R213B_DANRE (A0A0R4I9Y1), RN213_HUMAN (Q63HN8 ), RN213_MOUSE (E9Q555 ), ZNFX1_HUMAN (Q9P2E3 ), ZNFX1_MOUSE (Q8R151 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
6TAX; 6TAY |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission