PROSITE entry PS51996
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | TR_MART |
| Accession [info] | PS51996 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
03-AUG-2022 CREATED;
03-AUG-2022 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51996 |
| Associated ProRule [info] | PRU01340 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Toxin-related mono-ADP-ribosyltransferase (TR mART) core domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=191; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=191; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8251305; R2=0.0202186; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=306; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -9, 1,-27, 2, 10,-19,-20, -3,-12, 2,-10, -3, -1,-11, 8, -3, -6, -8,-14,-23, -7, 8; /M: SY='D'; M= -9, 14,-20, 17, 5,-24,-11, -5,-20, -1,-19,-14, 8,-15, 1, -5, 0, -6,-16,-30,-13, 2; /M: SY='F'; M=-12,-24,-21,-28,-19, 32,-27,-15, 4,-22, 14, 4,-21,-26,-23,-17,-18, -6, 2, 1, 18,-19; /M: M= -5, -8,-23,-11, -9, -8,-15,-14, -7, -1, -5, -4, -5,-19, -9, -1, -8, -5, -4,-21, -6,-10; /M: SY='N'; M= -9, 9,-24, 6, 2,-16, -3, -7,-19, -3,-17,-13, 12,-17, -5, -4, -1, -4,-17,-28,-15, -2; /M: SY='D'; M= -5, 2,-21, 4, 1,-21,-13, -3,-15, -4,-14, -6, -1,-11, 1, -9, -3, -8,-13,-27,-12, 0; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='W'; M= -9,-21,-24,-23,-18, 5,-13,-17, -1,-17, -2, -2,-18,-15,-15,-16,-14, -9, -4, 25, 6,-16; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M= -5, 7,-23, 5, 10,-24,-10, -4,-23, 13,-22,-13, 9, -8, 9, 9, 1, -2,-20,-25,-14, 9; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='E'; M= -5, 7,-24, 7, 12,-22,-15, -1,-20, 5,-17,-10, 6,-12, 6, 2, 1, -4,-17,-27,-11, 9; /M: SY='E'; M= 5, 2,-23, 4, 10,-25,-11,-11,-20, 3,-16,-13, -3, -5, 2, -5, 1, -3,-15,-26,-17, 6; /M: SY='A'; M= 22, -4,-17,-10, -4,-20, -6,-10,-16, 1,-16, -8, -3,-12, -1, -7, 5, -3, -9,-22,-14, -3; /M: SY='K'; M= -7, 6,-25, 8, 10,-23,-17, -4,-23, 15,-19,-10, 2,-11, 4, 5, -2, -2,-17,-25, -9, 6; /M: SY='K'; M= -2, 1,-24, 2, 11,-25,-16, -8,-21, 15,-18,-10, -2,-11, 9, 8, -1, -5,-16,-25,-13, 10; /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-36,-28, 18,-22,-24,-17,-20,-16,-17,-35,-29,-21,-19,-35,-26,-25,121, 32,-20; /M: SY='G'; M= 3, -6,-22, -9, -8,-20, 11,-13,-14,-13,-13, -9, 1,-17, -6,-14, 2, -6,-13,-25,-18, -7; /M: SY='K'; M= -3, 4,-23, 0, 0,-22, -9, -4,-19, 10,-19, -9, 7,-15, 0, 4, -1, -4,-15,-27,-13, 0; /M: SY='K'; M= -3, -5,-25, -5, 8,-24,-15,-11,-20, 13,-20,-11, -4, -3, 5, 9, -1, -2,-14,-25,-15, 5; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='E'; M= -7, 4,-22, 3, 8,-19, -7, 4,-20, 6,-18, -9, 7,-11, 7, 6, -1, -6,-19,-18, -9, 7; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='Y'; M= -6, -4,-17, -5, -2, -3,-12, 0, -4, -5, -3, -3, -3,-12, -2, -6, -5, -5, -7, -9, 6, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -3, -7,-18, -7, -1,-12, -9, -3, -7, -2, -5, -1, -5, -6, -1, -4, -5, -6, -7,-17, -7, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= -8, -1,-21, 2, 1,-12,-15, -7,-12, 0,-11, -9, -3, -7, -2, 1, -5, -5, -9,-14, -6, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='W'; M=-12,-14,-27,-13, -8, -5,-19, -5, -9, -4, -6, -5,-13,-11, -6, -3,-16,-12,-12, 16, 6, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= -6,-11,-24,-10, -3, -8,-17,-12, -7, -7, -8, -6,-10, 2, -6,-10, -6, -6, -9,-19, -5, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='R'; M= -4, -3,-22, -6, -1,-17,-10, -3,-16, 3,-17, -5, 1, -9, 4, 5, 1, -2,-15,-16, -8, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='K'; M=-10, 4,-25, 2, 1,-16, -6, -4,-20, 7,-19,-11, 7, -9, -1, 1, -5, -7,-20,-20, -6, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='L'; M=-12,-26,-23,-28,-19, 16,-29,-14, 15,-23, 26, 14,-25,-27,-18,-18,-23,-10, 8, -7, 13,-19; /M: SY='T'; M= -2, 4,-18, 0, 0,-15,-15, -9,-17, 0,-18,-13, 5,-12, -2, -2, 12, 17,-11,-27, -7, -2; /M: SY='D'; M= -4, 9,-26, 13, 6,-27,-10, -7,-24, 0,-24,-18, 4, 4, -2, -5, 3, -2,-20,-31,-18, 1; /M: SY='E'; M= -1, 8,-21, 8, 13,-21, -8, -6,-22, 0,-20,-16, 9,-11, 3, -5, 9, 2,-18,-30,-16, 8; /M: SY='E'; M=-11, 11,-29, 15, 31,-31,-17, 14,-28, 9,-22,-13, 7, -8, 23, 3, -1,-10,-29,-28,-12, 26; /M: SY='K'; M= -3, -7,-19, -8, -4,-19,-11,-11,-13, 3,-10, -6, -7,-17, -6, -2, -7, -9, -8,-25,-12, -6; /M: M= -4, -9,-23,-11, -4,-16,-11,-14, -4, -8, -8, -2, -6,-16, -5, -6, -2, -3, -1,-26,-13, -6; /M: SY='A'; M= 33, -9,-15,-16, -9,-20, 2,-18,-13, -9,-14,-11, -8,-12, -8,-17, 8, -2, -6,-16,-18, -8; /M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-34,-25, 5,-33,-23, 32,-28, 33, 22,-26,-26,-20,-23,-24, -9, 21,-21, -1,-24; /M: SY='N'; M= -9, -1,-23, -5, -2,-11,-15, 0,-10, -2, -8, -3, 2,-19, -1, 2, -6, -4,-10,-21, 0, -3; /M: SY='N'; M= -1, 1,-17, -1, -4,-16, -2, -6,-19, -7,-15,-10, 2,-18, -5, -8, -1, -7,-15,-24,-11, -5; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20, 28,-29, 19, -2,-13, 1, 0,-19,-29,-11,-11,-20,-12,-11, 27, 67,-19; /M: SY='T'; M= -2, -7, -5,-14,-12,-10,-21,-18, -6,-10, -7, -5, -5,-15,-10,-11, 9, 24, -1,-27, -8,-11; /M: SY='N'; M= 1, 1,-22, -3, -2,-23, -3, -6,-20, 3,-19,-11, 5,-14, 1, 2, 4, 0,-15,-26,-15, -1; /M: SY='N'; M= -5, 13,-22, 11, 6,-24, -4, -2,-21, -2,-21,-15, 17,-12, 5, -5, 8, -1,-22,-33,-18, 6; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='G'; M= -5, -1,-21, 1, -4,-13, 7,-10,-15, -9, -9, -9, -2,-15, -9,-11, -5,-10,-13,-18,-10, -7; D=-7; /I: I=-7; DM=-14; /M: SY='Y'; M= -9,-13,-25,-14,-13, 9,-19, 20,-10, -8,-10, -5, -9,-23, -6, -8, -7, -7,-13, 4, 41,-13; /M: SY='Q'; M= -4, -2,-22, -4, 1,-19,-16, -4,-15, 2,-18, -9, 0,-14, 7, 2, 6, 5,-11,-22, -7, 3; /M: SY='E'; M= -6, -1,-28, 4, 16,-22,-19, -5,-19, 0,-15,-13, -7, 4, 2, -7, -6, -8,-18,-21,-12, 8; /M: SY='I'; M= -8,-27,-24,-34,-26, 12,-32,-23, 29,-26, 18, 16,-21,-23,-21,-23,-17, -8, 19,-16, 4,-25; /M: SY='N'; M= -8, 32,-19, 17, 0,-20, -3, 5,-20, -1,-27,-18, 46,-17, 1, -2, 12, 6,-25,-38,-18, 1; /M: SY='N'; M= -8, 5,-24, 3, 4,-15,-12, -4,-20, 3,-18,-13, 8,-10, 2, 3, 0, -3,-19,-25,-10, 2; /M: SY='Y'; M= 2,-18,-22,-21,-16, 13,-20, -3, -2,-12, -3, -3,-15,-19,-13,-14, -7, -5, -3, 1, 28,-17; /M: SY='L'; M= -6,-25,-12,-26,-19, 3,-26,-19, 15,-25, 29, 15,-23,-26,-17,-19,-17, -4, 12,-25, -5,-19; /M: SY='R'; M=-11, -9,-27,-11, 1,-20,-20, -5,-20, 19,-15, -7, -3,-17, 9, 40, -7, -7,-15,-21,-10, 2; /M: SY='N'; M= -5, 4,-24, 2, 4,-23, -1, -6,-20, 3,-18, -7, 6,-13, 4, -2, 2, -4,-19,-27,-16, 4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='N'; M= -4, 0,-22, -2, 2,-20, -8, -2,-16, 2,-17, -9, 5,-10, 5, 4, 0, -4,-15,-22,-11, 2; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='B'; M= -1, 5,-21, 4, -3,-19, 5, -3,-21, -1,-17,-12, 5,-11, -5, -4, -2, -8,-17,-20,-11, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: M= -8, -7, -7,-10, -8, -1, -5, -6,-10, -6, -7, -5, -3,-16, -7, -1, -6, -6, -7,-11, 0, -8; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='E'; M= -2, 0,-12, 0, 4, -8,-10, -6, -7, -5, -6, -4, -2, -5, -2, -7, 2, 2, -6,-16, -7, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='R'; M= -6, 0,-18, 1, 1,-11, -6, -2,-15, 2,-12, -9, 0, -5, -2, 4, -3, -5,-13,-16, -6, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= -6, 3,-18, 4, 4,-13,-12, 1,-10, 0,-11, -5, 1, -7, 3, -3, -1, -3,-10,-17, -3, 3; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -6, -2,-17, -4, -5, -8,-15, -4, -1, -7, -5, -1, -2,-14, -4, -8, -5, -3, -2,-12, -1, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='Y'; M=-10, -4,-21, -7, -7, -1,-13, -2, -6, -5, -7, -5, -2,-13, -5, -6, -7, -4, -9, -8, 11, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='E'; M= -7, -3,-23, -3, 3,-17, -8, -9, -9, -3,-12, -5, -2, -2, -4, -6, -4, -7, -9,-24,-14, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -6, -6,-23, -6, -1, -9, -8, 0,-15, -7,-10, -8, -3, -9, -5, -4, -4, -7,-14,-20, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='N'; M= -7, 3,-24, 1, 0,-15, -7, -5,-17, -6,-13,-10, 4,-13, -4, -8, -1, -4,-16,-27,-11, -3; /M: SY='E'; M= -7, -4,-25, -4, 5, -5,-18, -8,-16, -4,-14,-12, -3, 1, -5, -6, -4, -6,-16,-20, -6, -1; /M: SY='H'; M= -8, 5,-25, 6, 9,-19,-13, 10,-23, 1,-20,-12, 4,-11, 7, -2, 1, -4,-21,-24, -4, 7; /M: SY='L'; M=-10,-18,-23,-24,-16, 9,-22,-13, 9,-19, 17, 13,-14,-23,-13,-14,-17, -9, 2,-16, 2,-15; /M: SY='E'; M=-10, 4,-26, 5, 11,-21,-19, -6,-16, 8,-14, -9, 1,-13, 5, 2, -3, -5,-14,-26, -9, 7; /M: SY='A'; M= 8, -1,-20, -5, 4,-18,-12, -9,-17, 5,-18,-11, 1, -9, 2, -3, 3, -1,-13,-22,-11, 3; /M: SY='Y'; M=-13, -7,-27, -6, -3, 0,-20, 0,-12, -4, -6, -4, -8,-19, 0, -4,-12,-10,-14,-10, 10, -2; /M: SY='I'; M= -7,-21,-24,-26,-20, -4,-30, -3, 20,-21, 9, 10,-15,-22,-13,-19,-13, -6, 15,-22, 3,-19; /M: SY='K'; M= -8, 3,-25, 0, 9,-11,-15, -4,-21, 11,-19,-12, 5,-14, 2, 7, -3, -5,-19,-19, -5, 6; /M: SY='N'; M= -9, -1,-18, -5, -5, -9,-19, 1, -6,-10, -4, -3, 3,-20, -4, -7, -6, -4,-10,-23, 0, -6; /M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-34,-25, 4,-33,-24, 32,-28, 32, 20,-25,-25,-20,-24,-23, -9, 21,-21, -1,-24; /M: SY='D'; M= -8, 16,-23, 20, 6,-25,-15, -8,-20, -2,-20,-16, 8,-12, 0, -4, 6, 5,-14,-33,-15, 2; /M: SY='R'; M= -5, 7,-23, 7, 10,-24,-12, 0,-25, 10,-25,-15, 10,-12, 6, 11, 8, 0,-19,-30,-15, 7; /M: SY='A'; M= 31,-12,-15,-20,-13,-17, 4,-19, -9,-14, -6, -5,-10,-14,-12,-19, 4, -2, -2,-21,-18,-13; /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-34,-24, 20,-31,-21, 22,-29, 35, 17,-26,-28,-23,-21,-25,-10, 13,-15, 5,-24; /M: SY='Q'; M= -4, 5,-23, 2, 6,-23,-11, 0,-20, 6,-21,-11, 9,-13, 11, 1, 5, -3,-19,-28,-13, 8; /M: SY='K'; M= -6, 0,-24, -2, 1,-21,-17, -9,-18, 20,-15, -8, 2,-15, 1, 14, -6, -6,-13,-25,-11, 1; /M: SY='L'; M= -3,-11,-20,-13, -5, -6,-16,-13, -3,-11, 9, 1, -9,-19, -9,-10, -7, -2, -5,-24, -9, -6; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='K'; M= -4, -7,-22, -7, 0,-19,-13,-12,-13, 4,-17, -8, -5, 4, -3, 0, 0, -2, -8,-26,-15, -3; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='I'; M= -2,-18,-22,-22,-15, -3,-24,-18, 11,-18, 6, 3,-14,-11,-13,-17, -8, -2, 6,-21, -5,-16; /M: SY='P'; M= -2, -3,-23, -1, -1,-21,-10,-12,-19, -3,-22,-14, -2, 10, -4, -7, 6, 5,-15,-29,-16, -4; /M: SY='E'; M=-11, 4,-26, 7, 10,-17,-16, 1,-21, 5,-19,-13, 1,-11, 4, 2, -2, -4,-18,-21, -2, 6; /M: SY='N'; M= -8, 5,-13, 3, 0,-24, -9, -4,-21, -3,-21,-13, 9,-10, 2, -3, 3, -3,-19,-32,-17, 1; /M: SY='M'; M= -4,-16,-23,-19,-16,-11, -5,-11, 1,-17, 0, 2,-11,-20,-12,-15, -7, -4, 1,-22, -8,-16; /M: SY='T'; M= -7,-12,-20,-18,-14, 3,-25,-14, 4,-11, -2, 0,-11,-18,-12,-12, -3, 9, 5,-16, 6,-14; /M: SY='V'; M= 2,-23,-12,-25,-24, -3,-22,-26, 17,-19, 10, 6,-23,-25,-24,-18, -6, 6, 30,-28,-10,-24; /M: SY='Y'; M=-19,-22,-23,-24,-22, 35,-30, 11, 0,-14, 1, 0,-20,-30,-16,-13,-19,-10, -7, 22, 66,-22; /M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-13, -5, -8,-22, 0,-21, 19,-15, -7, -5,-22, 3, 46,-11, -7,-14,-12, 5, -5; /M: SY='G'; M= -5, -6,-21,-10,-14,-14, 25,-13,-27,-13,-21,-15, 2,-21,-14, -9, -3,-12,-22,-16,-14,-14; /M: SY='V'; M= -3, -8,-13, -8, -6, -9,-22,-18, -1,-12, -3, -4,-11,-18,-11,-14, 0, 7, 8,-29,-11, -8; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='D'; M= -3, 7,-21, 9, 6,-23, -4, -4,-22, -1,-21,-15, 6, -2, 1, -3, 6, 1,-18,-27,-16, 2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='B'; M= -5, 16,-12, 16, 4,-14, -3, 0,-14, 0,-15,-12, 15, -4, 0, -2, 4, -1,-13,-19,-10, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='E'; M= -5, -1,-14, 0, 4,-11, -5, -2,-11, 2, -5, -4, -2, -8, 0, 1, -4, -5, -9,-14, -6, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='E'; M= -6, 2,-20, 6, 15,-18,-13, -2,-16, 1,-13,-10, -2, 2, 10, -3, -1, -3,-17,-12, -7, 12; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='A'; M= 3, -9,-16,-12, -8,-10, -8,-13, -4, -4, -1, 0, -7,-14, -7, -5, -4, -1, -1,-18, -9, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='I'; M= -6,-17,-22,-20,-14, -2,-18,-17, 3,-14, 3, 3,-14, -6,-12,-12, -9, -2, 1,-19, -6,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='B'; M= 1, 11,-19, 11, 4,-21,-10, -7,-17, 1,-14,-11, 6,-11, -2, -6, 2, 0,-13,-27,-14, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= -4, 9,-26, 11, 10,-27,-10, -4,-27, 8,-25,-17, 6, -8, 5, 4, 2, -6,-22,-22,-15, 7; /M: SY='F'; M= -9,-25,-19,-31,-25, 25,-28,-21, 15,-24, 13, 6,-19,-26,-26,-20,-14, -4, 15,-12, 8,-25; /M: SY='R'; M= -8, -6,-25, -7, 4,-14,-20, -3,-12, 6, -7, -3, -4,-16, 2, 7, -7, -6,-11,-21, -4, 1; /M: SY='E'; M= -7, 1,-25, 2, 13,-12,-17, -3,-20, 3,-16,-12, 0, -8, 2, -2, -2, -7,-19,-22, -7, 7; /M: SY='Q'; M= -7, 1,-25, -1, 5,-23,-14, 2,-19, 9,-16, -6, 4,-14, 11, 8, -3, -5,-17,-25,-10, 7; /M: SY='F'; M= -9,-22,-24,-28,-21, 19,-20,-13, 4,-18, 8, 7,-17,-24,-18,-14,-17, -9, -1, 2, 14,-20; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-24, -1, 4,-17,-20, -6, -8, -4, -6, -5, 0,-13, 6, -5, -3, -1,-11,-25, -8, 5; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= -3, 4,-27, 2,-11,-27, 39,-11,-32,-12,-26,-19, 13,-19,-12,-11, 2,-13,-27,-26,-25,-12; /M: SY='Q'; M= -4, 5,-23, 4, 5,-26, -7, -6,-24, 8,-22,-12, 7,-13, 9, 5, 5, 0,-19,-27,-15, 7; /M: SY='V'; M= -3, -9,-20,-12,-10,-12,-19,-18, 5,-13, -3, -1, -8,-14,-11,-14, -1, 3, 7,-28,-12,-12; /M: SY='I'; M=-11,-21,-23,-26,-21, 11,-26,-16, 12,-16, 7, 5,-15,-24,-18,-12,-13, -3, 10,-12, 10,-21; /M: SY='R'; M= -9,-13,-22,-16, -8, -4,-24, -8, -4, -3, -5, -2, -9,-19, -6, 3, -5, 1, 0,-19, 1, -8; /M: SY='E'; M=-14, 4,-27, 8, 11, -6,-18, -5,-17, -4,-10, -9, -1,-14, 1, -7, -7,-10,-17,-20, -4, 6; /M: SY='P'; M= -6, -4,-28, -2, -4,-17, -3, -5,-24, -3,-21,-14, -3, 3, -7, -3, -5,-10,-21,-23,-12, -7; /M: SY='G'; M= 4, 1,-22, -4, -5,-22, 17, -9,-25, -8,-24,-15, 9,-16, -1, -8, 8, -6,-21,-26,-20, -3; /M: SY='F'; M=-19,-25,-22,-33,-26, 61,-29, -6, -1,-24, 6, 0,-18,-29,-30,-16,-18, -8, -4, 12, 40,-26; /M: SY='M'; M= -5,-19,-20,-24,-16, 0,-24,-16, 11,-13, 15, 17,-17,-20,-11,-12,-12, -1, 7,-21, -3,-14; /M: SY='S'; M= 9, 4,-13, 5, 1,-20, -2,-10,-21, -9,-28,-20, 9,-10, -2,-11, 32, 14,-11,-37,-19, 0; /M: SY='T'; M= 2, -5,-12,-13,-12, -8,-20,-19, -5,-12, -6, -7, -4,-13,-11,-12, 14, 37, 3,-27, -7,-12; /M: SY='S'; M= 7, 0,-12, -2, -1,-20, -1, -7,-20,-10,-27,-18, 8,-11, 0, -9, 33, 19,-11,-37,-17, -1; /M: SY='L'; M= -6,-21,-23,-23,-13, 0,-25,-14, 7,-16, 19, 9,-20,-18,-12, -8,-17, -6, 2,-17, 1,-14; /M: SY='B'; M= -8, 3,-21, 2, -6,-15,-13,-11,-10, -4,-10, -7, 2,-18, -8, -6, -1, 3, -5,-28,-10, -8; /M: SY='K'; M= -6, 0,-26, 0, 6,-22,-15, -7,-21, 9,-24,-14, 2, 6, 2, 2, 1, -3,-19,-27,-15, 3; /M: M= -3, 0,-23, -1, 0,-12,-12,-12,-14, -7,-15,-11, -1, -5, -5,-11, 0, -2,-11,-25,-12, -3; /M: SY='A'; M= 2,-11,-21,-12, -9,-12,-15,-15, -6, -7,-11, -7,-10,-12, -9, -9, -2, -3, -1,-16, -8, -9; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='A'; M= 15,-11,-17,-16,-11,-10,-12,-13, -2,-11, -4, -2,-10,-15, -9,-15, 0, -2, 1,-20, -8,-11; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='Q'; M= -6, -5,-22, -8, -2, -8,-10, -4,-12, -2,-13, -6, -1,-15, 4, -2, -2, -6,-13,-11, -3, 1; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='E'; M= -1, 2,-15, 3, 6,-15, -9, -1,-16, 1,-15,-11, 3, -9, 2, 2, 6, 0,-11,-22,-10, 4; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='F'; M= -9, -9,-13,-12, -6, 22,-14, -7, -5, -8, -2, -4, -5,-10,-12, -6, -6, -4, -6, -2, 8, -7; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='A'; M= 6, 1,-11, -2, -2,-11, -3, -7,-12, 0,-12, -8, 3, -9, -3, -2, 6, 2, -7,-17, -9, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='G'; M= -4, -3,-24, -1, -1,-20, 3,-12,-23, 0,-20,-14, -3, 3, -6, -4, -1, -7,-18,-22,-16, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='R'; M=-11, 3,-24, 0, 1,-18,-10, -4,-18, 3,-16,-10, 7,-18, 4, 9, -2, -4,-16,-24,-10, 2; /M: SY='P'; M=-10, -1,-31, 3, 0,-26, -5, -9,-25, 3,-24,-16, 0, 14, -3, 0, -6,-10,-25,-25,-17, -3; /M: SY='V'; M= -5,-19,-18,-24,-19, -3,-26,-23, 16,-17, 6, 6,-16,-20,-17,-16, -5, 9, 19,-25, -6,-20; /M: SY='L'; M= -5,-23,-22,-27,-18, 4,-28,-20, 20,-23, 22, 12,-20,-23,-17,-20,-17, -7, 13,-19, 0,-19; /M: SY='F'; M=-10,-26,-19,-31,-25, 24,-30,-19, 15,-24, 18, 10,-23,-27,-25,-19,-16, -2, 15,-11, 11,-24; /M: SY='K'; M= -9, 0,-26, 0, 11,-25,-16, 0,-24, 20,-23,-10, 2,-12, 8, 16, -2, -4,-18,-25,-11, 9; /M: SY='I'; M= -9,-29,-23,-35,-26, 10,-33,-25, 29,-27, 22, 15,-24,-25,-22,-23,-20, -7, 21,-12, 2,-26; /M: SY='K'; M=-10, -7,-26, -9, 1,-11,-21, -9,-19, 14,-16, -9, -5,-15, 2, 12, -5, 1,-15,-10, 0, 1; /M: SY='I'; M= -5,-22,-20,-26,-22, -2,-24,-24, 19,-23, 14, 8,-18,-22,-19,-21, -9, 3, 17,-25, -6,-22; /M: SY='P'; M= -7, -8, -5, -9, -4,-25,-13,-16,-23, -6,-25,-17, -5, 22, -8,-10, -3, -5,-22,-32,-24, -8; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='K'; M= -3, 0,-17, 0, 5,-16, -7, -5,-17, 13,-17, -9, 2, -7, 5, 8, 0, -3,-13,-10, -8, 5; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='G'; M= -1, -2,-16, -3, -8,-14, 20, -8,-17, -7,-14,-10, 1,-11, -8, -8, 0, -6,-12,-12,-10, -8; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='T'; M= -7, -1,-21, -6, -6,-13,-14, -5,-13, -3,-10, -7, 2,-14, -4, -3, 1, 8,-11,-26, -7, -6; /M: SY='G'; M= 2,-10,-29,-12,-19,-25, 50,-20,-34,-18,-27,-19, -2,-20,-18,-19, -1,-15,-26, -8,-23,-18; /M: SY='A'; M= 12,-14,-19,-20,-13,-11,-11,-15, -3, -7, -5, -2,-10,-16,-10, -8, -2, -3, 2,-21,-11,-13; /M: SY='Y'; M=-15, -5,-23, -1, -7, -2,-23, -1,-12,-11, -8, -8, -9, -6, -9,-10,-11, -6,-14,-13, 12,-10; /M: SY='I'; M= -6,-26,-24,-32,-24, -1,-33,-24, 31,-22, 15, 14,-21,-18,-19,-22,-16, -6, 23,-20, -1,-24; /M: SY='D'; M= -1, 6,-23, 9, 4,-24, -1, -7,-24, -3,-23,-17, 3, -9, 0, -7, 7, -3,-18,-27,-14, 1; /M: SY='S'; M= 1, 0,-21, -3, -3,-15, -4,-11,-17, -7,-17,-11, 1, -9, -6,-10, 6, 3,-12,-25,-12, -5; /M: SY='F'; M=-11,-18,-23,-22,-19, 18,-26,-11, 8,-16, 7, 4,-13,-25,-18,-14,-14, -7, 4, -8, 17,-19; /M: SY='S'; M= 9, -1,-14, -2, -2,-20, 1,-12,-18,-10,-23,-17, 6,-10, -4,-12, 25, 12,-10,-35,-20, -3; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: M= -4, -3,-21, -5, 0,-10, -5, -2,-13, -5,-10, -6, 0,-14, -1, -5, -3, -7,-13,-18, -6, -1; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='Y'; M=-13,-11,-23,-13,-13, 18,-20, -3, -5,-10, -1, -2,-10,-22,-14, -8,-13, -8, -6, -2, 22,-14; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='P'; M= -1, -6,-27, -4, 5,-26,-11, -8,-21, 2,-24,-14, -5, 25, 2, -6, -1, -6,-22,-25,-19, 2; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='N'; M= -6, 11,-24, 11, 7,-25, 7, -6,-28, 0,-25,-18, 13,-13, -1, -3, 7, -4,-23,-31,-20, 3; /M: SY='E'; M=-10, 10,-28, 14, 43,-30,-19, 2,-26, 10,-21,-15, 4, -4, 25, 3, 1, -7,-28,-28,-17, 34; /M: SY='Q'; M= -1, -7,-24, -7, 4,-16,-19, -6,-12, 5, -9, -5, -8,-15, 6, 2, -5, -7,-10,-17, -2, 4; /M: SY='E'; M= -9, 6,-29, 14, 47,-28,-19, -2,-26, 10,-20,-17, 0, -3, 17, 3, 2, -8,-26,-29,-18, 32; /M: SY='V'; M= -6,-26,-18,-32,-26, 3,-30,-23, 29,-21, 16, 20,-23,-24,-20,-20,-14, -2, 30,-24, -4,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-21, 9,-30,-20, 21,-29, 46, 21,-29,-29,-20,-20,-29,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M=-12,-29,-25,-35,-26, 20,-34,-22, 27,-29, 28, 15,-24,-26,-23,-23,-24,-10, 15,-12, 10,-26; /M: SY='P'; M=-10, 2,-33, 7, 4,-29,-12,-11,-24, -3,-29,-20, 2, 40, -5, -9, -4, -8,-28,-32,-25, -3; /M: SY='P'; M= -7, -9,-29, -8, 0,-25,-15, -6,-20, 6,-20, -9, -5, 16, 5, 9, -5, -7,-21,-25,-17, 0; /M: SY='G'; M= -7, 5,-26, -1,-11,-17, 24, -1,-26,-12,-23,-14, 13,-20,-10,-11, 0,-10,-25,-22,-12,-11; /M: SY='T'; M= -2, -5,-17, -7, 1, -5,-17, -8,-12, -9,-10,-10, -4,-13, -4,-10, 11, 16, -8,-21, 1, -2; /M: SY='R'; M= -8, -8,-21, -9, -3,-11,-20, -7,-11, 5,-11, -2, -6,-17, -3, 8, -2, 1, -4,-23, -5, -4; /M: SY='F'; M=-17,-27,-23,-33,-26, 45,-30,-10, 8,-23, 12, 6,-22,-29,-26,-18,-20, -9, 4, 7, 35,-26; /M: SY='K'; M=-10, -6,-26, -7, 1,-19,-22, 3,-14, 13,-15, -4, -3,-16, 8, 13, -8, -7,-11,-21, -3, 3; /M: SY='V'; M= -3,-28,-20,-31,-26, -2,-32,-27, 31,-21, 11, 11,-24,-20,-23,-22,-14, -5, 32,-23, -4,-27; /M: SY='D'; M= -9, 7,-22, 10, 9,-17,-17,-11,-12, -7,-11,-12, 1,-13, -4,-11, 1, 2, -8,-30,-14, 2; /M: SY='N'; M= -9, 8,-25, 6, 3,-24,-10, 0,-23, 11,-23,-13, 12,-15, 6, 12, 2, -4,-20,-29,-13, 3; /M: SY='I'; M= -4,-22,-22,-28,-19, 2,-28,-20, 19,-17, 8, 10,-17,-21,-16,-15,-11, -4, 16,-19, 0,-19; /M: SY='S'; M= -2, -2,-16, -2, 0,-18,-14,-12,-11, -5,-15, -8, -3,-14, -3, -7, 7, 5, -5,-29,-12, -2; /M: M= -7, -5,-26, -6, -1,-13,-19, -8, -6, -3, -8, -6, -4,-13, -3, -3, -6, -6, -8,-20, -2, -4; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='V'; M= -3, -6,-16, -9,-12,-10,-17,-10, 1,-14, -5, -3, -3,-17,-11,-14, -2, 0, 3,-26, -7,-13; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='T'; M= -2, -9,-16,-10, -7,-12,-10,-14, -4, -8, -7, -5, -7, -2, -6, -9, 3, 6, -1,-22,-11, -8; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: M= -6, 0,-16, -1, 0,-12,-13, -7, -1, -3, -7, -4, 0, -6, -1, -4, -2, -4, -3,-18, -8, -2; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='N'; M= -6, 8,-20, 6, 5,-21, -3, -5,-20, 6,-19,-12, 11,-11, 3, 1, 3, 1,-18,-24,-14, 4; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='G'; M= -1, -4,-21, -6, -9,-18, 26,-13,-24,-10,-20,-13, 2,-15, -8,-11, 3, -6,-18,-20,-18, -8; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='K'; M= -6, -6,-23, -7, -4,-20, -9, -3,-15, 5,-16, -5, -2,-14, 0, 3, -2, -5, -9,-25,-11, -3; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='N'; M= -7, 8,-23, 5, 10,-20,-15, 2,-20, 1,-20,-13, 11, -8, 5, -1, 5, 5,-19,-30,-12, 7; /M: SY='Y'; M=-14,-10,-23,-11, -4, -9,-23, 1,-13, 2,-10, -5, -8,-17, 4, 6,-11, -8,-14, -7, 11, -2; /M: SY='I'; M= -9,-26,-24,-30,-22, 12,-31,-18, 20,-21, 20, 11,-21,-25,-19,-17,-19, -8, 12,-12, 10,-22; /M: SY='V'; M= -8,-14,-24,-17,-11, -9,-19,-14, 2, -3, -1, 2,-11,-20, -7, -4,-11, -7, 3,-20, -4,-10; /M: SY='I'; M= -6,-29,-21,-33,-26, 3,-32,-24, 31,-26, 26, 17,-25,-26,-21,-23,-20, -7, 26,-21, -1,-25; /M: SY='E'; M=-11, 7,-27, 11, 16,-23,-17, -4,-22, 8,-20,-14, 3,-12, 8, 7, -1, -4,-19,-23,-10, 11; /M: SY='A'; M= 17, -5,-16, -8, 0,-21, -3,-14,-14, -8,-14,-11, -5,-12, -2,-13, 9, 2, -6,-26,-18, -1; /M: SY='T'; M= -4, -7,-21,-10, -6,-13,-21,-16, 0, -8, -8, -5, -6,-12, -7, -9, 2, 7, 1,-27, -9, -8; /M: SY='M'; M= -4,-14,-22,-17,-13,-12,-12,-17, 0,-10, 0, 1,-11,-12,-11,-11, -9, -4, 1,-25,-12,-13; /M: SY='M'; M= -7,-13,-23,-18,-11, -7,-23,-12, 4, -1, 1, 10,-10,-18, -5, -3,-10, -4, 1,-20, -2, -9; /M: SY='R'; M= -2, -7,-22,-10, -4,-18,-10, -9,-17, 4,-14, -7, -4,-12, 2, 6, 2, 3,-12,-22, -9, -2; /M: SY='S'; M= -3, 1,-10, 1, 5,-20,-11,-10,-18, -5,-14,-12, 2,-15, 0, -8, 6, 2,-14,-31,-16, 2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of true positive hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | TR mART core |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
44 sequences
AEXT_AERSA (Q93Q17), ALT_BPT2(Q38424), ALT_BPT4(P12726), ALT_BPT6(Q38433), ARC3_CBCP (Q00901), ARC3_CBDP (P15879), ARC3_HATLI (Q46134), CRAX_BACCE (Q4MV79), EDIN_STAAU (P24121), EFV_ENTFA (Q838U8), EXOS_PSEAE (G3XDA1), EXOT_PSEAE (Q9I788), MAV_MYCA1 (A0QLI5), NAR1_HUMAN (P52961), NAR1_MOUSE (Q60935), NAR1_RABIT (Q03515), NAR2A_MOUSE (P17981), NAR2A_RAT (P17982), NAR2B_MOUSE (O35975), NAR2B_RAT (P20974), NAR3_HUMAN (Q13508), NAR3_MOUSE (Q8R2G4), NAR4_HUMAN (Q93070), NAR4_MOUSE (Q9CRA0), NAR4_PANTR (Q95NE0), NAR5_BOVIN (Q0VC22), NAR5_HUMAN (Q96L15), NAR5_MOUSE (P70352), NAR5_RAT(Q5XHY4), NARE_CHICK (Q92080), NRT1_CHICK (P55806), NRT2_CHICK (P55807), PHXA_PHOLL (Q7N8B1), SPVB_SALCH (P17450), SPVB_SALDU (P24419), SPVB_SALEN (P55220), SPVB_SALT1 (D0ZHS9), SPVB_SALTM (P21454), TRE1_PSEPG (B0KTG9), TRE1_SERP5 (A8GG78), VIS_VIBS1 (A3UNN4), YR217_MIMIV (Q5UQB2), YR390_MIMIV (Q5UQ44), YR392_MIMIV (Q5UQ42)» more
|
| PDB [Detailed view] |
37 PDB
1G24; 1GXY; 1GXZ; 1GY0; 1GZE; 1GZF; 1OG1; 1OG3; 1OG4; 1R45; 1R4B; 1UZI; 2A78; 2A9K; 2BOV; 2C89; 2C8A; 2C8B; 2C8C; 2C8D; 2C8E; 2C8F; 2C8G; 2C8H; 2GWL; 2GWM; 3BW8; 4FK7; 4FXQ; 4GF1; 4XZJ; 4XZK; 4Y1W; 4YC0; 6DRE; 6DRH; 6GNN » more |