PROSITE logo

PROSITE entry PS52007


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] PADR1
Accession [info] PS52007
Entry type [info] MATRIX
Date [info] PADR1 domain profile. CREATED;
DATA UPDATE;
INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC52007
Associated ProRule [info] PRU01351

Name and characterization of the entry

Description [info] Generated from MSF file: '/work/www/psmaker/tmp/pfmake.input.483415'.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=136;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=131;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0736284; R2=0.0120261; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=784; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=369; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K';  M= -9, -9,-23,-11, -4,-14,-23,-14,-12, 13, -2, -1, -9,-16, -3, 10, -9,  3, -7,-22, -7, -4;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-20, -1,  2,-25,  0,-11,-26, 12,-30,-16,  5,-11,  2,  5, 16,  4,-16,-30,-17,  2;
/M: SY='D';  M=-11, 16,-30, 26, 26,-33,  2, -5,-35,  5,-26,-22,  6, -8,  5, -4, -1,-12,-29,-30,-21, 15;
/M: SY='T';  M=  5,  3,-19,  0,  0,-22,-15,-15,-20, 10,-19,-12,  0,-10, -3,  1,  6, 14,-10,-26,-13, -1;
/M: SY='D';  M=-12, 16,-25, 17, 13,-20,-15, -3,-18,  1,-11,-12, 14,-15,  1, -3, -5, -7,-20,-31,-15,  7;
/M: SY='E';  M=-10,  4,-30,  8, 32,-32,-20, -2,-28, 26,-24,-12,  0, -6, 25, 14, -4,-10,-26,-24,-14, 28;
/M: SY='E';  M=-10,  5,-30, 14, 30,-26,-17, -4,-26,  1,-23,-20, -2, 15,  7, -7,  1, -7,-26,-28,-15, 17;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S';  M= -4,  5,-19,  8,  9,-22,-15,-11,-17,  2,-20,-14,  1,-12, -1, -4, 10,  6, -7,-33,-16,  4;
/M: SY='K';  M=-10, -8,-28, -8,  7,-20,-24,-10,-11, 15, -6, -1, -8,-14, 10,  8,-12,-10,-12,-21, -8,  8;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-10,  5,-30, 10, 38,-32,-20, -2,-28, 23,-23,-14,  0, -5, 23, 11, -3,-10,-27,-25,-15, 30;
/M: SY='K';  M=-10, -2,-29, -1, 13,-29,-21, -5,-23, 31,-20, -6, -3,-11, 20, 19, -9,-10,-20,-21,-10, 17;
/M: SY='R';  M= -4, -2,-26, -4,  7,-22,-16, -6,-23, 21,-18,-10,  1,-14,  6, 27, -5, -8,-17,-23,-13,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-20,-30,-20,  6,-26,-12, 20,-22, 38, 36,-26,-26,-12,-16,-26,-10, 10,-20,  0,-16;
/M: SY='K';  M= -3,  0,-28,  0, 14,-29,-18,-10,-28, 38,-27,-11, -1, -9,  9, 21, -7, -9,-19,-21,-12, 11;
/M: SY='E';  M=  4, 13,-25, 18, 23,-30,-12, -7,-27,  8,-21,-18,  2, -7,  5, -3,  1, -7,-20,-28,-18, 14;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='N';  M=  0, 13,-15,  5,  1,-21, -6, -3,-18, -5,-25,-16, 23,-13,  5, -5, 22, 16,-17,-36,-17,  3;
/M: SY='D';  M=-15, 29,-30, 41, 23,-36,-15, -2,-35, 14,-28,-22, 11, -9, 10,  2, -2,-10,-28,-32,-17, 17;
/M: SY='L';  M=  8,-15,-17,-18, -6, -6,-19,-18,  1,-16, 15,  2,-16,-18,-11,-16, -7,  2,  1,-23,-10, -8;
/M: SY='L';  M=-12,-27,-25,-30,-23, 13,-33,-12, 22,-24, 27, 14,-25,-27,-18,-20,-24,-10, 11, -6, 22,-23;
/M: SY='W';  M=-20,-36,-43,-38,-29, 24,-23,-23,-14,-20,-13,-14,-34,-30,-22,-19,-34,-24,-23,113, 36,-22;
/M: SY='E';  M= -6, 10,-26, 10, 11,-26, -7,  2,-28, 11,-24,-16, 11,-13,  4, 11, -1, -9,-23,-28,-15,  6;
/M: SY='I';  M=-13,-28,-26,-34,-26, 21,-34,-18, 26,-27, 23, 14,-23,-26,-22,-22,-23,-10, 13, -7, 18,-26;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10,  0,-14, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='D';  M=-18, 42,-30, 59, 20,-40,-12,  2,-37,  2,-28,-25, 17,-10,  9, -7,  0,-10,-30,-37,-18, 15;
/M: SY='D';  M=-12, 11,-30, 18, 18,-28,-12, -8,-21,  6,-19,-15,  3,-10,  3, -4, -5,-11,-19,-28,-16,  9;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-22,-33,-23, 19,-32,-22, 22,-30, 39, 17,-27,-28,-23,-22,-27,-10, 12,-15,  5,-23;
/M: SY='K';  M=-10,  2,-30,  3, 18,-30,-20, -8,-30, 44,-28,-12,  0, -8, 12, 25, -8,-10,-22,-22,-12, 15;
/M: SY='K';  M= -8,  5,-24,  1,  4,-24,-14, -6,-25, 26,-27,-13, 11,-13,  5, 23,  2,  0,-19,-26,-13,  4;
/M: SY='M';  M= -7,-16,-22,-19,-13,  1,-23,  7, -1, -5,  2, 11,-14,-22, -8, -6,-14, -9,  0,-15, 10,-12;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='C';  M= -6,-24, 21,-27,-24,-10,-27,-23,  3,-20, -3,  5,-24,-12,-22,-21,-12, -6, 14,-34,-17,-24;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-19, -4, -2,-14,-13, -6,-18,  7,-23,-13,  1,-13,  0,  1, 14, 10,-12,-22,  0, -2;
/M: SY='T';  M=  2, -3,-17, -9, -5,-17,-17,-17,-12,  5,-16, -9, -1,-11, -4, -1, 10, 21, -4,-27,-11, -5;
/M: SY='N';  M=  7, 17,-19, 11,  2,-25, -5, -5,-22,  4,-24,-17, 19,-13, -1, -3,  9, -1,-18,-31,-18,  0;
/M: SY='D';  M=-15, 26,-30, 39, 34,-35,-15, -2,-35, 12,-26,-23,  9, -6,  9,  0, -2,-10,-28,-33,-18, 22;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-23,-33,-23,  6,-32,-22, 30,-28, 38, 23,-26,-26,-18,-22,-26,-10, 16,-20,  0,-22;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M=-13,  2,-25,  4,  3,-21,-17, -6,-18, 19,-17, -8,  1,-12,  3, 23, -8, -8,-13,-20, -9,  1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-26, 11, 28,-24,-18, -6,-15, -1,-17,-14,  4, -7,  7, -7,  4, -5,-17,-31,-17, 17;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-23,-33,-23,  5,-30,-17, 28,-24, 34, 31,-25,-25,-14,-20,-25,-10, 15,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='E';  M= -9, -7,-28, -7, 10,-19,-23,-11, -6,  6,-11, -5, -5,-12,  3,  6, -4, -7, -7,-25,-11,  4;
/M: SY='F';  M=  5,-18,-17,-22, -9, 16,-20,-18, -2,-17,  4, -3,-16,-19,-18,-17, -8, -6,  2,-13, -1,-12;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='E';  M= -7,  8,-27,  7, 18,-28, -1, -4,-28, 12,-26,-16, 11,-10, 10,  4,  2, -8,-26,-28,-18, 14;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='D';  M=-13, 22,-27, 32, 21,-36,-13,  3,-28,  4,-24,-16,  9, -9, 24, -1,  2, -8,-27,-29,-15, 22; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='I';  M= -3,-12,-13,-12, -9, -6,-14,-13,  8,-10, -2,  0,-10,  7, -9,-11, -4, -2,  6,-15, -8,-11; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='V';  M= -3,-17,-20,-20,-19,-12,-11,-24,  3,-17, -6, -3,-14, -5,-19,-18, -1,  8, 10,-27,-15,-20;
/M: SY='P';  M= -5, -6,-23, -5, -2,-21,-14,  4,-21, -5,-24,-14, -1, 13, -1, -1, 10,  7,-18,-32,-13, -4;
/M: SY='G';  M= -3,  3,-27,  8, -2,-30, 37,-13,-36,-12,-29,-22,  5,-15, -9,-15,  6,-12,-27,-27,-26, -5;
/M: SY='P';  M= -7,  1,-31,  9,  7,-30,  7,-13,-30, -8,-29,-22, -2, 20, -5,-14,  2, -9,-28,-30,-26, -1;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-20,  7, 21,-20,-16, -7,-20,  0,-18,-16,  8, -7,  5, -5, 12, 17,-17,-32,-16, 13;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='E';  M=  1,  1,-19,  3,  8,-18,-11, -7,-16,  0,-10,-10, -1,-11,  1,  3,  2, -3,-12,-24,-13,  4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='H';  M= -4,  8,-27,  7,  6,-28,-13, 12,-24,  6,-24,-12,  8, -1, 10,  0, -2, -9,-24,-28,-12,  7;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-20,-33,-26,  4,-33,-26, 31,-27, 31, 17,-27,-27,-23,-23,-22, -7, 27,-23, -3,-26;
/M: SY='L';  M=-12,-28,-21,-31,-22, 15,-30,-21, 17,-21, 25, 12,-23,-27,-21,-11,-22, -9, 13,-16,  2,-22;
/M: SY='D';  M=-18, 44,-30, 62, 26,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 17, -8,  3, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 15;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  4,-24,-20,  0,-28, 29,-21, -8,  0,-17, 18, 55, -8,-10,-22,-20,-10,  8;
/M: SY='C';  M= -5,-22, 24,-27,-24, -5,-28,-26,  4,-23,  8,  1,-22,-29,-24,-21,-10,  3, 16,-33,-13,-24;
/M: SY='A';  M= 30,-13,  5,-20,-14,-17, -8,-21, -7,-14,-11, -9,-12,-17,-14,-20,  9,  2,  5,-28,-20,-14;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='G';  M= -4, -5,-13,-10,-16,-19, 24,-16,-23,-18,-14,-12,  3,-22,-16,-16, -2, -6,-18,-27,-21,-16;
/M: SY='M';  M= -1,-21,-18,-28,-18,  0,-20, -9, 15,-16, 24, 38,-21,-21, -7,-14,-18, -8,  8,-20, -3,-13;
/M: SY='L';  M=  5,-18,-15,-25,-17, -3,-19,-16,  9,-17, 17, 17,-18,-20,-12,-16, -9,  3,  9,-22, -7,-14;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 30,-12,  7,-19,-11,-21, -7,-21,-15,-13,-16,-14,-11, -3,-12,-21,  7, -1, -6,-27,-23,-12;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-25,-28,-18,  2,-30,-22, 19,-27, 32, 14,-27, -9,-18,-22,-25,-10,  7,-22, -5,-20;
/M: SY='E';  M= -1,-11,-26,-11,  4,-16, -9,-15, -6, -9,  0, -3,-11,-15, -5,-12, -9,-10, -8,-23,-13, -1;
/M: SY='P';  M= -7,-17,-28,-15, -8,-16,-21,-18, -5,-11,-10, -7,-13, 22, -9, -9, -4, -1, -9,-28,-16,-12;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M= -4, -4,-27,  1, 16,-29,-14, -8,-23,  2,-26,-16, -3, 20, 12, -4,  8, -2,-24,-30,-20, 12;
/M: SY='E';  M= -6, -3,-21, -3, 14,-17,-22,-11,-10,  3, -9, -2, -7,-11,  2, -3,  0,  6, -4,-28,-13,  8;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S';  M=  9,  1,-15, -1, -2,-22,  7,-10,-22, -6,-28,-18, 11,-12, -2, -8, 26, 10,-14,-34,-20, -2;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -2, -7, -3,-10,-19,-27, 43,-18,-35,-19,-28,-20,  3,-23,-19,-19,  2,-14,-25,-28,-28,-19;
/M: SY='Q';  M=-11, -3,-29, -4,  9,-27,-13, 13,-23,  9,-20, -3,  0,-13, 32,  7, -4,-12,-26,-19, -5, 20;
/M: SY='L';  M=-13,-28,-23,-33,-24, 25,-31,-15, 18,-26, 28, 17,-24,-28,-22,-20,-24,-10,  9, -8, 16,-23;
/M: SY='V';  M=  2,-23,-16,-25,-23,  0,-25,-19, 18,-18,  3,  4,-20,-24,-19,-19, -5, -1, 24,-19,  3,-23;
/M: SY='F';  M=-17,-27,-21,-32,-27, 51,-30, -9,  5,-22,  7,  2,-22,-30,-29,-17,-18, -8,  5, 10, 39,-27;
/M: SY='N';  M= -9, 11,-24,  5,  3,-21,-12,  9,-22, 13,-26,-12, 19,-16, 10,  8,  3, -4,-23,-25, -4,  6;
/M: SY='S';  M=  0,  1,-21, -1, -2,-25, 12,-11,-28,  5,-30,-17,  9,-13, -2,  0, 14,  0,-19,-29,-20, -2;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D';  M= -6, 10,-24, 16,  0,-28, 13, -8,-33, -4,-28,-21,  9,-14, -4,  0, 10, -4,-23,-31,-21, -3;
/M: SY='A';  M= 17, -9,-18,-15, -8,-20,  2,-15,-13,-11, -8, -6, -8,-14, -2,-14,  4,  2, -8,-22,-16, -5;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-12,-20,-25,-22,-17,  1,-29,  0,  9, -9,  1,  5,-17,-25, -7, -4,-14, -8,  9, -9, 19,-15;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T';  M= -4,  7,-16, -1, -2,-18,-14,  4,-17, -6,-19,-11, 13,-13,  4, -5, 16, 22,-14,-32,-10,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D';  M=-17, 23,-27, 26,  1,-11,-14,  9,-21, -3,-20,-17, 16,-19, -3, -7, -4, -7,-23,-16, 15, -3;
/M: SY='V';  M=  1,-22,-19,-25,-20, -5,-26, -5, 16,-20, 11,  9,-18,-23,-17,-19,-12, -7, 18,-25, -3,-20;
/M: SY='S';  M=  7,  0,-10, -3, -3,-17, -6,-13,-17,-10,-24,-17,  7,-10, -3,-10, 34, 29, -7,-37,-17, -3;
/M: SY='E';  M= 14,  2,-22,  4, 32,-26,-12, -8,-22,  2,-16,-16, -4, -4,  8, -8,  4, -6,-18,-26,-20, 20;
/M: SY='W';  M=-20,-37,-47,-37,-28, 13,-22,-22,-17,-18,-17,-17,-37,-30,-18,-18,-37,-27,-27,131, 38,-20;
/M: SY='T';  M=  4, -3,-10, -8, -8,-13,-12,-17,-10,-11,-16,-12,  1,-12, -8,-11, 25, 31,  1,-34,-14, -8;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T';  M= -3, -3,-14,-12,-13, -9,-16,-10,  1,-10, -5,  8,  2,-17, -7,-10,  6, 15,  3,-30,-10,-10;
/M: SY='Y';  M=-10, -9,-24,-13,-12,  5,-22, 11, -7, -2, -9, -3, -5,-23, -8, -4,-10, -8, -6, -7, 23,-12;
/M: SY='E';  M= -3, -3,-21, -3,  8,-18,-16,-11,-17,  7,-13, -9, -2,-12,  2,  1,  6,  5,-12,-28,-13,  5;
/M: SY='T';  M=  3, -5,-14, -9, -2,-11,-17,-16, -9,-11, -4, -8, -4,-12, -7,-11, 12, 24, -3,-29,-12, -4;
/M: SY='K';  M= -8, -4,-26, -5,  6,-25,-21, -7,-18, 20,-14, -4, -4,-12, 18, 12, -5, -1,-16,-22, -9, 12;
/M: SY='E';  M= -2, 18,-21, 15, 19,-24,-12, -4,-22,  0,-20,-18, 16, -9,  3, -6,  8,  6,-21,-32,-18, 11;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='T';  M= -7,  3,-22,  2, -7,-17,-19,-15, -3,-12,-13, -9,  2, -4,-11,-15,  2,  5, -1,-32,-15,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='K';  M= -3, -1,-19, -3,  0,-21, -3,-11,-22, 15,-23,-11,  2,-10,  0,  7,  6,  5,-14,-22,-13,  0; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='K';  M= -1,  3,-28,  8, 14,-30,-15,-10,-26, 18,-25,-16, -2,  7,  4,  4, -4, -8,-21,-26,-18,  8;
/M: SY='W';  M=-16,-31,-13,-35,-28, 14,-23,-27,-17,-22,-14,-16,-29,-29,-24,-20,-25,-14,-19, 74, 16,-22;
/M: SY='K';  M= -7,-12,-24,-12,  1,-17,-26,-16,  1,  7, -8,  0,-12,-16,  0, -1, -9, -7,  6,-24,-10, -1;
/M: SY='V';  M= -4,-21,-18,-28,-24, -3,-31,-27, 26,-21,  8,  8,-18,-20,-20,-21, -5, 10, 28,-26, -6,-24;
/M: SY='P';  M= -7,-17,-35, -8,  0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 74, -8,-18, -2, -5,-27,-32,-28, -8;
/M: SY='K';  M=-14, 11,-30, 15, 15,-29,-18, 20,-32, 21,-26,-12,  6,-11,  9, 12, -7,-12,-25,-27, -6, 11;
/M: SY='E';  M=-11,  5,-30, 13, 43,-28,-12, -2,-31, 11,-21,-18,  0, -5, 15,  9, -2,-11,-28,-28,-19, 28;
/M: SY='F';  M=-11,-23,-18,-29,-21, 25,-27,-19,  8,-24, 24, 11,-20,-25,-22,-17,-16,  3,  5,-14,  6,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  3,-25,  4, 11,-25,-18, -2,-27, 21,-24,-13,  3,-11,  7, 19,  0,  1,-19,-26,-11,  8;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='E';  M=  4, 12,-17,  8, 16,-20, -6, -2,-18,  0,-19,-15, 16, -8,  4, -4,  9, -1,-18,-28,-17, 10; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='L';  M= -7,-13,-17,-11,  0, -5,-20,-12,  2, -4, 12,  4,-14,-16, -6, -5,-14, -7,  2,-18, -6, -3; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='Y';  M=-12,-18,-24,-22,-17,  3,-27,  7, 13,-17, 10, 13,-13,-21, -9,-15,-15, -7,  4,-11, 18,-17; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='K';  M= -5,  4,-24,  2,  4,-26,-11, -8,-24, 18,-30,-16, 10,  2,  3,  8,  7,  0,-20,-30,-17,  3;
/M: SY='W';  M=-18,-31,-30,-34,-26, 39,-27,-14, -2,-23,  6, -2,-27,-30,-25,-18,-27,-16, -9, 48, 36,-24;
/M: SY='L';  M=-12,-17,-22,-21,-13,  9,-25,-12,  6,-20, 23,  9,-13,-26, -8,-13,-19, -9, -3,-18,  1,-10;
/M: SY='K';  M=-12, 15,-28, 14, 10,-30,-15, -5,-30, 34,-30,-15, 13,-12,  7, 19, -5, -8,-23,-26,-13,  8;
/M: SY='K';  M= -4, -6,-21, -9, -4,-18,-18,-14,-11,  9,-18, -8,  0,-13, -1,  7,  7,  8, -6,-27,-11, -4;
/M: SY='V';  M= -9,-21,-21,-22,-14,  5,-27,-10,  7,-13,  7,  6,-19,-24, -3,-11,-13, -7,  8,-13,  7, -8;
/M: SY='K';  M=-12, -5,-28, -6,  4,-13,-22,-12,-25, 37,-24, -8, -3,-13,  2, 22,-12,-10,-17,-15, -4,  4;
/M: SY='S';  M=  0, -4,-17, -8, -2, -3,-15,-12, -6,-11,-12, -9,  2,-17,-10,-12,  6,  1, -1,-28,-11, -5;
/M: SY='K';  M= -8,-12,-25,-14, -4,-20,-26,-15, -1, 14,-11,  1,-10,-16,  4,  5,-10, -8,  3,-22, -8, -1;
/M: SY='K';  M=-11,-11,-30,-12, -2,-20,-22,-11,-11, 19,-15,  3, -9,  2,  2, 14,-13,-10,-11,-22,-11, -2;
/M: SY='P';  M= -2, -6,-24, -3,  5,-27,-11, -2,-21, -5,-27,-14, -1, 17, 11, -8, 14,  3,-21,-32,-18,  6;
/M: SY='D';  M=-12, 23,-27, 33, 26,-31,-16, -4,-31,  7,-24,-21,  8, -7,  6, -2,  2,  0,-24,-33,-17, 16;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='I';  M= -3,-29,-20,-33,-27,  1,-32,-28, 34,-25, 20, 15,-25,-25,-23,-24,-17, -6, 31,-23, -5,-27;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-20,-33,-26, 44,-30,-15,  9,-26, 19,  7,-24,-30,-29,-18,-22, -9,  7,  0, 25,-26;
/M: SY='P';  M=-12,-14,-34,-12, -5,-22,-21,-14,-11, -3,-20,-11, -9, 38, -6,  1,-10, -9,-18,-27,-20,-10;
/M: SY='P';  M=-10,-12,-35, -8, -5,-22, -5,-12,-22, -6,-27,-17, -9, 42, -9,-13, -8,-11,-27,-22,-15,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_02 which contains 569'516 sequence entries.


Total number of hits 18 in 18 different sequences
Number of true positive hits 18 in 18 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PADR1 zinc-binding
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
18 sequences

PARP1_ARATH (Q9ZP54    ), PARP1_BOVIN (P18493    ), PARP1_CAEEL (Q9N4H4    ), 
PARP1_CHICK (P26446    ), PARP1_CRIGR (Q9R152    ), PARP1_DANRE (Q5RHR0    ), 
PARP1_HUMAN (P09874    ), PARP1_MAIZE (Q9ZSV1    ), PARP1_MOUSE (P11103    ), 
PARP1_ORYSJ (Q7EYV7    ), PARP1_RAT   (P27008    ), PARP1_XENLA (P31669    ), 
PARP3_ARATH (Q9FK91    ), PARP3_MEDTR (Q1SGF1    ), PARP3_ORYSJ (Q0E0Q3    ), 
PARP3_SOYBN (Q9SWB4    ), PARP_DROME  (P35875    ), PARP_SARPE  (Q11208    )
» more

PDB
[Detailed view]
10 PDB

2JVN; 2RIQ; 4DQY; 4OPX; 4OQA; 4OQB; 7S68; 7S6H; 7S6M; 7S81