PROSITE entry PS52025
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GL_BHV |
| Accession [info] | PS52025 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
13-SEP-2023 CREATED;
13-SEP-2023 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52024 |
| Associated ProRule [info] | PRU01369 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Betaherpesvirus glycoprotein L (gL) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=208; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=203; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1991761; R2=0.0139952; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=701; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=308; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='V'; M= -6,-16,-21,-16, -7,-15,-25,-14, 4, -2, 1, 5,-16,-21, 4, -3,-10, -6, 9,-24, -9, -1; /M: SY='E'; M=-10, 6,-27, 5, 17,-21,-16, -4,-18, 5,-14,-12, 8, -1, 4, -1, -5, -7,-22,-29,-16, 10; /M: SY='H'; M= -2, 2,-21, 3, 1,-20,-15, 8,-16, -8,-10, -7, 1,-14, 5, -8, 3, 3,-14,-29, -8, 2; /M: SY='E'; M= 0, 9,-22, 11, 17,-25,-15,-10,-23, 7,-19,-16, 2, -7, 3, -2, 5, 7,-16,-28,-16, 10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='I'; M=-11,-18,-28,-23,-15,-11,-29,-19, 10, -8, -2, 2,-11, -6, -9, 2,-10, -1, 4,-23, -8,-16; /M: SY='E'; M= 0, 4,-24, 9, 23,-25,-17, -9,-19, 7,-16,-13, -4, -9, 4, -3, -2, -7,-11,-28,-17, 13; /M: SY='A'; M= 20,-10,-14,-18,-13,-10,-11,-17, 1,-15, 5, -1, -7,-19,-13,-17, -3, -3, 4,-24,-14,-13; /M: SY='V'; M= 4,-19,-16,-25,-19, -3,-24,-23, 14,-20, 14, 6,-18,-20,-17,-19, -6, 8, 15,-24, -7,-19; /M: SY='I'; M= -3,-22,-25,-28,-18, -7,-27,-19, 15,-11, 9, 7,-15,-20,-11, -1,-14, -8, 9,-20, -6,-18; /M: SY='N'; M= -6, 10,-21, 4, 1,-21, -7, -1,-24, 10,-27,-16, 22,-16, 4, 18, 12, 3,-20,-33,-16, 1; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Y'; M= -2,-15,-18,-21,-17, 14,-22, -9, -2,-15, 3, -2,-13,-21,-15,-14, -4, 10, -2, -5, 20,-17; /M: SY='N'; M=-10, 20,-23, 8, 2,-21,-10, 3,-17, 6,-19,-11, 31,-18, 8, 4, 1, -4,-24,-32,-15, 5; /M: SY='G'; M= 11, -5,-18, -7,-10,-24, 29,-15,-27,-14,-28,-19, 3,-14,-10,-15, 20, 1,-17,-29,-24,-10; /M: SY='E'; M= -7, 12,-24, 18, 28,-28,-15, -5,-28, 9,-24,-19, 5, -6, 9, 0, 7, 2,-22,-32,-17, 18; /M: SY='T'; M= 4, -8,-13,-12, -4,-12,-20,-19, -2, -9, -6, -6, -9,-14,-11,-12, 7, 21, 9,-29,-13, -7; /M: SY='F'; M=-17,-26,-26,-28,-21, 39,-28, -9, 0,-21, 7, 0,-21,-11,-24,-17,-20,-10, -6, 5, 30,-23; /M: SY='Q'; M= -3, 2,-19, -3, 1,-20,-13, -4,-13, -6,-12, -7, 8,-15, 13, -4, 11, 7,-14,-30,-13, 7; /M: SY='P'; M=-10,-20,-31,-16, -8,-16,-13,-17,-12,-11, -4, -6,-18, 23,-11, -6,-15,-11,-16,-24,-18,-13; /M: SY='L'; M=-10,-10,-22, -9, -4, -6,-26,-16, 5,-18, 18, 4,-14,-19,-11,-16,-13, -1, 1,-25, -7, -8; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='H'; M= -7, -4,-12, -6, -4, 1,-12, 10,-10, -1, -7, -3, -1,-10, -3, 0, -2, 2, -7,-11, 4, -4; D=-9; /I: I=-9; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; /M: SY='D'; M= -8, 7,-18, 13, -3,-12, -3, -5,-12, -7,-11,-10, -1,-14, -8,-10, -4, -7, -6,-16, -2, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='D'; M= -8, 22,-18, 32, 15,-23, -7, -2,-23, 0,-20,-18, 10, -6, 2, -6, 6, -2,-18,-27,-14, 9; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='G'; M= 1, 4,-14, 0, -6,-17, 20, -7,-20, -8,-21,-14, 12,-11, -6, -8, 12, -1,-16,-22,-17, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='W'; M=-11,-16,-29,-13, -8, -9,-14, 3,-15,-10,-17,-11,-14, 14, -6,-11,-15,-14,-21, 25, 2, -8; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='L'; M= 3,-13,-13,-18,-13, -2,-17,-16, 10,-15, 12, 5,-12,-13,-11,-14, -6, 4, 7,-15, -4,-13; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='R'; M=-12, -1,-25, 2, 20,-21,-17, -1,-25, 22,-18,-11, 0, -9, 11, 32, -5, -8,-20,-20,-11, 14; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='P'; M= -8,-17,-34, -8, 0,-25,-17,-17,-17, -8,-25,-17,-17, 76, -8,-17, -8, -8,-25,-25,-25, -8; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='I'; M=-12,-17,-24,-18,-19, 9,-30,-21, 17,-24, 17, 7,-17,-24,-21,-21,-18, -9, 13,-20, 0,-21; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='Y'; M= -7, -3,-14, -2, -8, -1,-15, -5, 5, -8, -1, -1, -6,-12, -8,-10, -7, -4, 4, -8, 8, -9; D=-10; /I: I=-10; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-19, -4, 3, -6,-14, 0,-13, 5,-12, -4, 4,-12, 13, 4, -3, -6,-15,-12, -2, 9; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='V'; M= 3,-15,-15,-15,-12, -3,-16,-11, 3,-10, -4, -2,-15, 0,-12,-13, -6, -3, 7,-11, 2,-14; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='P'; M= -6, -5,-21, -8, -6,-13,-15,-12, -2, -9,-11, -7, -1, 20, -7,-12, -2, 1, -9,-21,-13, -9; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='Y'; M= 3,-10,-15,-13, -9, -4,-12, -6, -1, -5, -6, -3, -6,-13, -5, -2, 1, -1, -1,-11, 4, -9; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='P'; M=-12, -2,-24, 4, 0,-13,-14, -3,-16, -1,-16,-12, -6, 17, -3, -1, -7, -7,-17,-13, 0, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='D'; M=-13, 20,-25, 21, 5,-24, -9, 0,-24, 3,-25,-19, 20, 3, 0, 5, 0, -6,-25,-30,-18, 1; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='W'; M= -8,-14,-30,-14, -7, -9, 2,-12,-15,-13,-16,-12,-10,-19, -9,-15, -6,-11,-17, 11, 4, -9; /M: SY='D'; M=-15, 17,-30, 21, 10,-31,-14, -1,-29, 13,-27,-17, 12, -1, 9, 12, -3, -9,-27,-30,-17, 8; /M: SY='F'; M=-13,-28,-22,-33,-26, 30,-31,-17, 17,-25, 20, 10,-24,-29,-26,-20,-21, -8, 13, -5, 20,-26; /M: SY='S'; M= 4, -8,-15,-11, -8,-14, -9,-11, -3,-13,-15, -2, 1,-13, -3,-13, 22, 11, -1,-34,-14, -6; /M: SY='S'; M= -1, 2,-18, 0, 12,-24,-14, -6,-19, -2,-20,-12, 3, -8, 16, -3, 18, 16,-15,-30,-15, 14; /M: SY='L'; M=-11,-25,-23,-29,-19, 2,-28,-15, 17,-18, 30, 22,-22,-25,-12, -7,-24,-10, 9,-20, -1,-17; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20, 0,-26; /M: SY='R'; M=-16,-15,-27,-15, -5,-12,-23, -7,-15, 14, 0, -1, -9,-22, 1, 38,-16,-10,-11,-20, -7, -5; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-28,-20,-15, 27,-28, 12, -3,-10, -1, 0,-17,-27, -4, -9,-17,-10,-11, 19, 58,-12; /M: SY='K'; M=-11, -3,-29, -1, 11,-25,-20, 6,-26, 15,-23,-12, -2, 5, 6, 12, -4, -3,-22,-26,-10, 6; /M: SY='P'; M=-11,-11,-31, -8, 0,-24,-20,-13,-23, 11,-24,-14, -8, 28, -1, 15, -6, -1,-21,-26,-18, -4; /M: SY='P'; M= 3,-15,-21,-15, -9,-15,-17,-20, -6,-14, -9, -8,-13, 16,-12,-17, 2, 7, -4,-29,-18,-12; /M: SY='Y'; M=-10, -9,-22,-13,-11, 4,-24, -1, -9, -1, -9, -6, -9,-19, -7, -4, -2, 15, -7, -3, 29,-11; /M: SY='G'; M= -6,-11,-31,-12,-10,-26, 17,-19,-21, 0,-23,-11, -5, -4,-10, -7, -7,-14,-18,-21,-20,-11; /M: SY='E'; M= -9, 10,-27, 16, 19,-29, -5, 8,-31, 5,-26,-17, 6,-10, 6, -1, 3, -8,-25,-30,-14, 12; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='H'; M= 1,-16,-24,-18, -9, -5,-18, 2,-12,-10, -4, -4,-11, -3, -9, -3, -9, -9,-11,-20, -5,-11; /M: SY='P'; M= 1, -6,-26, -5, -4,-10,-15,-14,-19, -6,-17,-14, -8, 13,-10, -5, -5, -7,-16,-21,-13, -8; /M: SY='S'; M= -3, 7,-19, 8, 1,-20,-10, -8,-18, -1,-17,-13, 9,-14, -2, -4, 11, 4,-14,-34,-15, 0; /M: SY='P'; M= -8,-12,-26,-11, -2,-20,-19,-11,-14, -4,-12, -8, -9, 13, 3, 1, -2, 2,-16,-27,-15, -1; /M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30, 0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30; /M: SY='H'; M=-12,-12,-27,-11, 3,-13,-23, 7, -8, -5, 2, 7,-12, -3, -1, -6,-15,-12,-12,-25, -5, -1; /M: SY='V'; M= -6,-30,-17,-31,-26, 4,-31,-26, 29,-26, 28, 16,-29,-29,-24,-21,-20, -6, 30,-24, -4,-26; /M: SY='D'; M=-15, 41,-25, 49, 12,-32,-10, -1,-32, -2,-27,-25, 23,-12, -2, -8, 5, 1,-25,-38,-18, 5; /M: SY='D'; M=-19, 35,-30, 50, 23,-35,-13, 0,-37, 6,-27,-25, 14,-10, 5, 4, -2,-10,-28,-35,-18, 13; /M: SY='E'; M= -3, 12,-25, 19, 36,-28,-16, -5,-26, 3,-19,-19, 2, -4, 9, -5, 4, -1,-22,-30,-19, 23; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-17, 20,-27, 46, 26,-29,-29,-17,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='D'; M=-11, 24,-27, 35, 28,-33,-13, -3,-33, 7,-27,-23, 10, -7, 7, -2, 5, -5,-26,-35,-19, 18; /M: SY='T'; M=-10, -1,-23, -4, -3, -9,-23,-10, -7, -9, -8, -4, -3,-14, 5, -9, -1, 6, -8,-22, -4, 1; /M: SY='F'; M=-10,-30,-17,-33,-26, 28,-30,-23, 17,-27, 26, 11,-27,-30,-29,-20,-21, -7, 19,-14, 6,-26; /M: SY='A'; M= 17,-11,-15,-15,-10, -8, -9,-11, -7,-13, -6, -7, -8,-16, -8,-15, 9, 3, -3,-19, -2,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='H'; M=-18, -8,-30, -8, -5, -4,-24, 55,-17, -7,-12, 0, -3,-22, 10, -2,-12,-15,-22, -5, 38, -1; /M: SY='N'; M=-12, 42,-22, 28, 3,-23, -2, 8,-23, 0,-30,-22, 54,-18, 0, -2, 8, -2,-30,-40,-20, 2; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M= -8, -8,-32, -2, 15,-27,-20,-14,-21, -4,-24,-18,-11, 49, -2,-13, -2, 0,-25,-30,-24, 4; /M: SY='B'; M= -4, 31,-23, 28, 14,-27, -6, 1,-26, 0,-26,-21, 30,-13, 2, -6, 6, -4,-26,-36,-20, 8; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -9, 0,-20,-20, 15,-30, 24,-20, -9, 1,-20, 10, 60,-10,-11,-21,-21, -6, 0; /M: SY='T'; M= 6,-10,-10,-17,-16, -8,-20,-23, 1,-13, -4, -4,-10,-16,-16,-14, 10, 30, 14,-29,-11,-16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 21,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-28,-30,-23,-20,-28,-10, 8,-15, 5,-22; /M: SY='T'; M= 9, -2,-10,-10, -9,-13,-14,-19,-11,-10,-13,-11, 0,-10, -9,-12, 21, 38, -1,-30,-13, -9; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M=-12,-28,-23,-35,-25, 16,-31,-20, 26,-27, 30, 23,-24,-25,-20,-21,-24,-10, 15,-15, 5,-23; /M: SY='R'; M=-12, -5,-28, -5, 4,-24,-18, -5,-29, 33,-25,-11, 1,-15, 9, 44, -4, -6,-19,-22,-11, 4; /M: SY='S'; M= -1, 15,-16, 20, 4,-24, -6, -9,-24, -7,-27,-21, 11,-10, -2,-10, 25, 16,-14,-38,-18, 1; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M=-11, 24,-27, 35, 28,-33,-13, -3,-33, 7,-27,-23, 10, -7, 7, -2, 5, -5,-26,-35,-19, 18; /M: SY='S'; M= -1, -4,-18, -5, -4,-20, 2,-10,-24, 0,-25,-16, 5,-14, -1, 11, 18, 10,-14,-30,-17, -4; /M: SY='A'; M= 25, -8,-18,-12, -2,-23, 5,-15,-20, -3,-16,-13, -6,-12, -5, -4, 4, -6,-11,-21,-20, -4; /M: SY='P'; M=-10, 0,-31, 7, 4,-28,-15, 4,-26, -1,-29,-17, -2, 30, -1, -8, 0, -7,-26,-32,-17, -1; /M: SY='B'; M=-13, 22,-26, 22, 4,-26,-11, -3,-25, 1,-26,-20, 21, 2, -2, 1, 3, 1,-25,-35,-19, 0; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='M'; M= -8,-26,-18,-30,-22, 4,-26,-13, 22,-20, 31, 35,-26,-26,-13,-16,-23, -8, 16,-22, -2,-17; /M: SY='N'; M= -2, 5,-20, 0, -1,-23, 2,-10,-25, 8,-28,-16, 12,-13, -1, 2, 12, 6,-18,-30,-17, -1; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-39,-30, 60,-31,-23, 10,-29, 11, 4,-21,-29,-36,-21,-19, -9, 10, 1, 21,-30; /M: SY='M'; M=-12,-26,-20,-32,-22, 17,-26,-12, 17,-22, 31, 33,-24,-26,-15,-16,-24,-10, 8,-15, 5,-17; /M: SY='N'; M=-11, 13,-26, 4, 0,-24, 3, 2,-26, 6,-26,-14, 25,-19, 8, 17, 1, -7,-27,-28,-17, 2; /M: SY='G'; M= -1, -3,-29, -6,-17,-29, 60,-16,-37,-17,-30,-20, 9,-20,-17,-17, 1,-17,-30,-23,-29,-17; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 45,-30, 8, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23; /M: SY='S'; M= 0, 6,-17, 4, 10,-23, -9, -5,-20, -3,-24,-15, 11,-10, 11, -4, 21, 13,-17,-34,-17, 11; /M: SY='E'; M=-10, 2,-27, 4, 27,-29,-20, 0,-24, 10,-18,-11, 0, -8, 27, 12, 2, -1,-24,-25,-14, 26; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='D'; M= -7, 2,-24, 8, -6,-19, 6,-13,-18,-16, -5,-11, -2,-19,-11,-16, -3, -8,-15,-29,-16, -8; /M: SY='D'; M= -3, 14,-25, 22, 4,-24,-11, -6,-24, -6,-23,-20, 3, 3, -4,-13, 4, -4,-20,-27,-10, -1; /M: SY='H'; M= -9, 3,-26, 6, -1,-24, -5, 18,-27,-10,-24,-15, 4, 2, -3,-10, 5, -1,-23,-32,-10, -4; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='K'; M= -2, -1,-14, -1, 0,-15, 4, -7,-16, 10,-16, -8, 1, -7, 0, 4, 2, -3,-11,-13, -9, 0; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='P'; M= -1, -4,-18, -4, -5,-17,-10,-12, -9, -9,-20,-13, 2, 14, -7,-11, 8, 3, -8,-30,-18, -7; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='S'; M= 7,-12,-16,-17,-15,-14, -3,-21, -1,-16,-10, -6, -7,-16,-14,-18, 10, 8, 6,-28,-15,-15; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-36,-29, 1,-36,-29, 40,-27, 22, 17,-24,-24,-23,-26,-19, -7, 33,-23, -3,-29; /M: SY='Y'; M=-15,-21,-23,-26,-21, 35,-28, -3, 1,-19, 9, 1,-18,-27,-20,-14,-15, -1, -3, 8, 40,-21; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='V'; M= -5,-27,-16,-29,-26, -3,-30,-26, 24,-14, 7, 9,-24,-27,-22, -8,-12, -3, 36,-27, -8,-26; /M: SY='D'; M=-16, 27,-29, 36, 27,-31,-14, 1,-33, 8,-25,-22, 15,-10, 8, 7, 0, -9,-28,-34,-18, 17; /M: SY='D'; M=-11, 33,-24, 36, 17,-29, -7, 1,-29, 0,-28,-24, 27,-11, 3, -6, 9, -2,-27,-38,-20, 10; /M: SY='V'; M= -4,-11,-16,-15,-15, -8,-23,-18, 7, -6, 0, 1, -8,-23,-15, -8, -6, 3, 16,-29,-10,-15; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M=-15, -7,-28, -9, 0,-15,-22, 1,-21, 19,-17, -7, -3,-17, 12, 32, -7, -3,-18,-13, 5, 3; /M: SY='E'; M= 2, 0,-24, 2, 18,-29, -4, -7,-25, 7,-23,-14, 0, -8, 13, 0, 6, -5,-21,-26,-18, 15; /M: SY='Y'; M=-20,-14,-30,-14,-14, 16,-27, 42, -8,-10, -6, 0,-12,-27, -4, -7,-17,-13,-16, 13, 63,-14; /M: SY='D'; M= -8, 32,-21, 35, 8,-28, -4, 0,-28, -3,-30,-24, 28,-13, 0, -7, 15, 2,-24,-40,-20, 4; /M: SY='L'; M=-11,-27,-25,-25,-17, 7,-28,-14, 11,-24, 30, 11,-27,-11,-17,-19,-25,-10, 1,-14, 7,-18; /M: SY='E'; M=-10, -4,-25, -2, 21,-17,-21, -5,-14, 2, -4, 0, -7,-11, 7, 5, -6, -3,-14,-26,-12, 13; /M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -2, 11,-19,-21, -1,-26, 30,-21,-10, -3,-14, 9, 31,-10,-10,-20,-15, 1, 8; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20, 0,-22; /M: SY='N'; M= -5, 8,-21, 1, -1,-20,-12, -9,-19, 2,-24,-16, 15, 3, -3, -3, 10, 14,-17,-32,-17, -3; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 14, 0,-13, 1, 0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21; /M: SY='T'; M= 1, -7,-16,-12,-14,-15, 6,-20,-13,-14,-15,-11, -3,-16,-14,-14, 13, 19, -2,-29,-17,-14; /M: SY='N'; M= -8, 14,-23, 4, -3,-21, 2, -4,-24, 7,-26,-16, 25,-17, -2, 8, 5, 2,-22,-30,-17, -3; /M: SY='D'; M= -9, 34,-22, 37, 9,-29, -4, 0,-29, -3,-30,-24, 30,-13, 0, -7, 13, 1,-25,-40,-20, 4; /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-37,-28, 14,-36,-27, 35,-29, 22, 16,-23,-24,-24,-26,-20, -9, 24,-16, 4,-28; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='T'; M= 4,-15,-12,-20,-18, -5,-22,-23, 7,-16, 6, 1,-15,-19,-18,-16, 2, 19, 17,-27,-10,-18; /M: SY='E'; M=-12, 16,-30, 28, 54,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 3, -2, 17, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 35; /M: SY='N'; M=-11, 35,-21, 18, 0,-20, -2, 21,-21, -1,-29,-18, 54,-20, 1, 0, 8, -2,-30,-39,-15, 0; /M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30, 0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30; /M: SY='L'; M= 1,-27,-20,-31,-23, 1,-28,-24, 25,-25, 26, 14,-24,-24,-20,-23,-18, -7, 20,-22, -5,-23; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 58,-30,-20, 6,-30, 23, 6,-23,-30,-34,-20,-23,-10, 3, 0, 20,-27; /M: SY='D'; M=-16, 33,-30, 49, 37,-36,-14, 0,-36, 4,-26,-26, 12, -6, 8, -6, 0,-10,-30,-36,-20, 23; /M: SY='F'; M=-13,-30,-20,-36,-27, 38,-31,-23, 16,-28, 22, 9,-24,-29,-31,-21,-21, -8, 14, -8, 12,-27; /M: SY='N'; M= 0, 6,-19, 0, -9,-21, 17, -9,-20,-11,-25,-16, 18,-18, -9,-11, 13, 0,-15,-33,-22, -9; /M: SY='P'; M= -2,-19,-31,-19,-11,-18,-23, -6, 2,-16,-10, -3,-14, 25,-10,-20,-10,-10, -7,-25,-12,-15; /M: SY='P'; M= -7,-14,-34, -7, 1,-28,-17,-17,-21, -2,-30,-19,-13, 60, -6,-12, -2, -5,-25,-30,-26, -6; /M: SY='S'; M= 1, -8,-21, -5, 2,-21, -1,-15,-16,-10,-22,-15, -4, 3, -6,-13, 12, 2, -9,-32,-21, -3; /M: SY='H'; M=-12, 0,-23, -6, -5,-11,-18, 12, -6,-12, 5, 2, 8,-23, 2, -7,-10, -9,-14,-28, -4, -2; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='M'; M=-10,-19,-16,-26,-19, 20,-20,-10, 14,-15, 12, 22,-14,-17,-13,-13,-14, -7, 8, -7, 8,-15; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='S'; M= 8, -1,-17, -4, -7,-16, 7, -7,-19,-10,-24,-16, 8,-15, -6,-12, 19, 5,-14,-26,-10, -7; /M: SY='V'; M= 2,-27,-15,-32,-27, 10,-27,-27, 23,-22, 9, 7,-24,-26,-27,-21,-10, -3, 32,-21, -4,-27; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 45, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 15,-21, -1,-21; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-33,-28, 2,-33,-28, 35,-25, 19, 15,-27,-27,-25,-23,-16, -5, 38,-25, -5,-28; /M: SY='Y'; M= 5,-21,-19,-24,-19, 6,-22, -9, 7,-17, 13, 4,-21,-24,-16,-17,-13, -6, 7, -6, 18,-19; /M: SY='L'; M= -7,-30,-18,-31,-24, 6,-31,-24, 26,-27, 35, 17,-29,-29,-23,-21,-23, -7, 24,-23, -3,-24; /M: SY='R'; M=-12, -2,-27, 1, 18,-23,-17, -2,-28, 18,-22,-15, 2,-12, 11, 36, 1, -5,-21,-26,-15, 12; /M: SY='N'; M=-11, 34,-21, 17, 0,-20, -3, 22,-21, -1,-29,-17, 53,-20, 1, 0, 7, -3,-30,-39,-14, 0; /M: SY='E'; M= -8, 12,-26, 11, 23,-24,-14, -3,-22, 1,-23,-18, 14, 7, 5, -5, 4, 2,-25,-33,-20, 13; /M: SY='E'; M= 3, 6,-25, 7, 12,-27,-13, 8,-26, 11,-21,-13, 2,-10, 5, 1, -2, -9,-19,-26,-11, 7; /M: SY='T'; M= -5, -7,-21,-13, -8,-15,-23,-20, -6, -3,-12, -7, -6, 4, -8, -8, 5, 23, -4,-27,-12,-10; /M: SY='R'; M=-11, 0,-29, -2, 1,-26, -4, -7,-30, 28,-27,-13, 7,-15, 4, 29, -6,-10,-23,-22,-14, 1; /M: SY='T'; M= 5,-14,-15,-22,-18, -7,-21,-20, 10,-15, 2, 8,-12,-16,-13,-16, 2, 16, 14,-25, -9,-16; /M: SY='E'; M= -8, 7,-23, 5, 17,-23,-18, 10,-21, 0,-18,-11, 8,-10, 13, -2, 6, 9,-21,-30,-10, 14; /M: SY='R'; M=-11, -3,-27, -2, 10,-24,-17, -5,-28, 27,-25,-13, 2,-13, 10, 36, -1, -5,-20,-24,-13, 8; /M: SY='V'; M= 1,-26,-20,-29,-23, -7,-28,-27, 24,-20, 5, 7,-23, -8,-22,-23,-11, -4, 27,-26,-11,-25; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-33,-28, 2,-33,-28, 34,-24, 19, 14,-27,-27,-26,-23,-16, -4, 38,-26, -6,-28; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -9,-30,-22,-36,-29, 14,-34,-27, 33,-27, 19, 14,-24,-26,-26,-24,-18, -7, 29,-18, 2,-29; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='P'; M=-10, -6,-32, 3, 3,-27,-15,-14,-20, -7,-25,-18,-11, 61, -7,-15, -7, -8,-25,-27,-24, -5; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='T'; M= -6,-12,-13,-17,-15, 7,-21, -2, 0,-14, -2, 0, -9,-18,-15,-11, -2, 10, 8,-19, 2,-15; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='N'; M= -7, 9,-21, 2, 2,-17,-13, 9,-13, -7,-18,-11, 18,-14, 0, -7, 9, 6,-15,-33,-10, 0; /M: SY='G'; M= 6, -4,-18, -4, -8,-24, 28,-14,-28,-14,-30,-20, 6,-14, -8,-14, 24, 4,-18,-32,-24, -8; /M: SY='L'; M=-10,-27,-23,-33,-23, 5,-30,-17, 28,-24, 34, 31,-25,-25,-14,-20,-25,-10, 15,-20, 0,-20; /M: SY='T'; M= 0, 6,-14, -1, -2,-18,-11, -9,-16, -6,-20,-13, 12,-11, 4, -6, 21, 26,-11,-33,-14, 1; /M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-30,-21, 7,-28,-18, 21,-25, 39, 25,-28,-28,-18,-18,-25, -9, 16,-21, -1,-20; /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 69,-30,-20, 3,-30, 17, 3,-22,-30,-37,-20,-22,-10, 2, 5, 25,-28; /M: SY='D'; M=-20, 32,-30, 47, 10,-22,-15, 5,-30, -3,-22,-22, 10,-15, -3,-10, -5,-10,-25,-22, 6, 2; /M: SY='A'; M= 28, -8,-16,-16,-13,-21, 17,-20,-18,-13,-16,-13, -6,-13,-13,-18, 9, 2, -8,-22,-21,-13; /M: SY='L'; M= -7,-22,-19,-26,-19, 3,-29,-22, 16,-24, 28, 12,-20,-23,-17,-19,-14, 7, 10,-23, -3,-19; /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20, 24,-30, 8, 6,-16, 15, 6,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -4, 15, 56,-20; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='C'; M= -1,-20, 25,-26,-20, -6,-25,-23, -4,-24, 12, 0,-20,-28,-20,-21,-11, 1, 1,-31,-13,-20; /M: SY='V'; M= -5,-30,-15,-30,-25, 5,-30,-25, 25,-25, 29, 15,-30,-30,-25,-20,-19, -5, 31,-25, -5,-25; /M: SY='R'; M=-16,-10,-28,-10, 0,-18,-22, -6,-22, 26,-12, -5, -5,-19, 5, 45,-13,-10,-15,-20, -8, 0; /M: SY='Y'; M= -7, -4,-21, -4, 6, -4,-21, -2,-13, -5,-12,-11, -5,-14, -1, -7, 5, 13,-12,-13, 14, 1; /M: SY='F'; M=-16,-30,-23,-39,-29, 48,-33,-23, 17,-30, 18, 8,-21,-27,-32,-23,-21,-10, 10, -3, 17,-29; /M: SY='F'; M= -9,-16, -3,-20,-15, 6,-23, -1, -6,-22, 6, 0,-12,-24,-15,-15, -7, 0, -4,-24, 0,-15; /M: SY='R'; M=-10,-16,-24,-15, -6,-12, -9,-13,-10, -4, 2, -2,-12,-22, -7, 10,-13,-10, -5,-23,-12, -8; /M: SY='R'; M=-13, -9,-27,-10, -5,-12,-21, 13,-15, 7,-15, -5, -2,-18, 2, 16, -5, -7,-13,-17, 8, -5; /M: SY='H'; M=-11,-11,-23,-17,-14, -3,-25, 18, 1,-13, -1, 10, -7,-19, -5,-11, -6, 4, -3,-18, 14,-12; /M: SY='G'; M= -4, 9,-25, 8, -4,-29, 27, -8,-31, -9,-29,-19, 13,-16, -2,-10, 8, -8,-27,-29,-23, -3; /M: SY='L'; M= -2,-27,-17,-31,-23, 22,-25,-22, 11,-25, 24, 8,-24,-27,-25,-20,-18, -7, 12,-14, 3,-23; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M=-10, 28,-25, 34, 15,-31, 1, -2,-32, -2,-28,-24, 19,-11, 1, -8, 8, -5,-27,-36,-21, 8; /M: SY='T'; M= -7,-16,-19,-20,-13, 2,-25,-18, 0,-15, 2, -1,-15, -8,-11,-13, -4, 10, 2,-21, -5,-12; /M: SY='D'; M= -8, 23,-30, 36, 11,-35,-11, -8,-31, -4,-27,-25, 5, 17, -4,-14, -1, -9,-26,-35,-23, 2; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 44, 18,-30,-30,-22,-20,-27, -8, 16,-22, -2,-22; /M: SY='I'; M= -6,-26,-22,-31,-24, 0,-31,-25, 30,-26, 21, 14,-21,-23,-19,-23,-14, -5, 23,-24, -4,-24; /M: SY='R'; M=-14, 8,-30, 14, 6,-31, -3, -3,-33, 14,-26,-15, 5,-14, 10, 20, -4,-12,-26,-25,-16, 7; /M: SY='H'; M=-13, -6,-24, -6, 3,-17,-22, 20,-18, 3,-14, -5, -2,-17, 3, 16, -5, -4,-10,-27, -3, 0; /M: SY='L'; M= -9,-27,-19,-30,-21, 6,-27,-15, 21,-23, 36, 31,-27,-27,-15,-17,-25, -9, 15,-21, -1,-18; /M: SY='E'; M=-15, 8,-30, 15, 19,-25,-21, -5,-20, 7,-16,-13, 2,-11, 6, 12, -6,-10,-18,-28,-14, 10; /M: SY='K'; M= -6, 1,-22, 2, 2,-20,-17,-12,-19, 12,-14, -9, -1,-13, -1, 5, 1, 4,-12,-27,-11, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M=-15, 4,-27, -2, -2,-10,-16, 10,-18, 7,-18, -9, 13,-21, 10, 19, -5, -7,-22,-13, 10, 1; /M: SY='A'; M= 8, 3,-20, 5, 8,-22,-11,-11,-18, -1,-12,-12, -2,-11, -1, -8, 4, -3,-12,-28,-16, 3; /M: SY='R'; M= -7, -4,-23, -1, -5,-19, -8,-12,-16, 2,-13, -9, -4,-18, -6, 5, -2, -5, -7,-27,-14, -6; /M: SY='L'; M=-13,-30,-21,-34,-24, 28,-31,-21, 19,-30, 35, 14,-26,-29,-26,-21,-26,-10, 10,-12, 8,-24; /M: SY='P'; M= -7,-17,-35, -8, 0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 74, -8,-18, -2, -5,-27,-32,-28, -8; /M: SY='F'; M= -2, -8,-23,-10,-12, 6, -4,-17,-17,-16,-12,-12, -7, -6,-19,-17, -3, -3,-12,-16, -6,-15; /M: SY='R'; M=-11,-12,-27, -8, 8,-17,-23,-10,-13, 3, -8, -7,-12, 0, -1, 13,-10, -8, -9,-26,-15, 1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 17 in 17 different sequences |
| Number of true positive hits | 17 in 17 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | gL betaherpesvirus-type |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
17 sequences
GL_GPCMV(O92277), GL_HCMV1(Q68667), GL_HCMV2(Q68668), GL_HCMV3(Q68669), GL_HCMV4(Q68670), GL_HCMV5(Q68671), GL_HCMV6(Q68672), GL_HCMV7(Q68673), GL_HCMV8(Q68674), GL_HCMVA(P16832), GL_HCMVM(F5HCH8), GL_HCMVP(Q68666), GL_HHV6U(P52508), GL_HHV6Z(P52526), GL_HHV7J(P52509), GL_MUHVK(P52513), GL_MUHVS(P52514)» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
5VOB; 5VOC; 5VOD; 7LBE; 7LBF; 7LBG; 7M30; 7RAM; 7T4Q; 7T4R; 7T4S |