PROSITE logo

PROSITE entry PS52025


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] GL_BHV
Accession [info] PS52025
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 13-SEP-2023 CREATED;
13-SEP-2023 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC52024
Associated ProRule [info] PRU01369

Name and characterization of the entry

Description [info] Betaherpesvirus glycoprotein L (gL) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=208;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=203;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1991761; R2=0.0139952; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=701; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=308; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V';  M= -6,-16,-21,-16, -7,-15,-25,-14,  4, -2,  1,  5,-16,-21,  4, -3,-10, -6,  9,-24, -9, -1;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-27,  5, 17,-21,-16, -4,-18,  5,-14,-12,  8, -1,  4, -1, -5, -7,-22,-29,-16, 10;
/M: SY='H';  M= -2,  2,-21,  3,  1,-20,-15,  8,-16, -8,-10, -7,  1,-14,  5, -8,  3,  3,-14,-29, -8,  2;
/M: SY='E';  M=  0,  9,-22, 11, 17,-25,-15,-10,-23,  7,-19,-16,  2, -7,  3, -2,  5,  7,-16,-28,-16, 10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='I';  M=-11,-18,-28,-23,-15,-11,-29,-19, 10, -8, -2,  2,-11, -6, -9,  2,-10, -1,  4,-23, -8,-16;
/M: SY='E';  M=  0,  4,-24,  9, 23,-25,-17, -9,-19,  7,-16,-13, -4, -9,  4, -3, -2, -7,-11,-28,-17, 13;
/M: SY='A';  M= 20,-10,-14,-18,-13,-10,-11,-17,  1,-15,  5, -1, -7,-19,-13,-17, -3, -3,  4,-24,-14,-13;
/M: SY='V';  M=  4,-19,-16,-25,-19, -3,-24,-23, 14,-20, 14,  6,-18,-20,-17,-19, -6,  8, 15,-24, -7,-19;
/M: SY='I';  M= -3,-22,-25,-28,-18, -7,-27,-19, 15,-11,  9,  7,-15,-20,-11, -1,-14, -8,  9,-20, -6,-18;
/M: SY='N';  M= -6, 10,-21,  4,  1,-21, -7, -1,-24, 10,-27,-16, 22,-16,  4, 18, 12,  3,-20,-33,-16,  1;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y';  M= -2,-15,-18,-21,-17, 14,-22, -9, -2,-15,  3, -2,-13,-21,-15,-14, -4, 10, -2, -5, 20,-17;
/M: SY='N';  M=-10, 20,-23,  8,  2,-21,-10,  3,-17,  6,-19,-11, 31,-18,  8,  4,  1, -4,-24,-32,-15,  5;
/M: SY='G';  M= 11, -5,-18, -7,-10,-24, 29,-15,-27,-14,-28,-19,  3,-14,-10,-15, 20,  1,-17,-29,-24,-10;
/M: SY='E';  M= -7, 12,-24, 18, 28,-28,-15, -5,-28,  9,-24,-19,  5, -6,  9,  0,  7,  2,-22,-32,-17, 18;
/M: SY='T';  M=  4, -8,-13,-12, -4,-12,-20,-19, -2, -9, -6, -6, -9,-14,-11,-12,  7, 21,  9,-29,-13, -7;
/M: SY='F';  M=-17,-26,-26,-28,-21, 39,-28, -9,  0,-21,  7,  0,-21,-11,-24,-17,-20,-10, -6,  5, 30,-23;
/M: SY='Q';  M= -3,  2,-19, -3,  1,-20,-13, -4,-13, -6,-12, -7,  8,-15, 13, -4, 11,  7,-14,-30,-13,  7;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-31,-16, -8,-16,-13,-17,-12,-11, -4, -6,-18, 23,-11, -6,-15,-11,-16,-24,-18,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-10,-22, -9, -4, -6,-26,-16,  5,-18, 18,  4,-14,-19,-11,-16,-13, -1,  1,-25, -7, -8;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='H';  M= -7, -4,-12, -6, -4,  1,-12, 10,-10, -1, -7, -3, -1,-10, -3,  0, -2,  2, -7,-11,  4, -4; D=-9;
/I:         I=-9; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
/M: SY='D';  M= -8,  7,-18, 13, -3,-12, -3, -5,-12, -7,-11,-10, -1,-14, -8,-10, -4, -7, -6,-16, -2, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='D';  M= -8, 22,-18, 32, 15,-23, -7, -2,-23,  0,-20,-18, 10, -6,  2, -6,  6, -2,-18,-27,-14,  9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='G';  M=  1,  4,-14,  0, -6,-17, 20, -7,-20, -8,-21,-14, 12,-11, -6, -8, 12, -1,-16,-22,-17, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='W';  M=-11,-16,-29,-13, -8, -9,-14,  3,-15,-10,-17,-11,-14, 14, -6,-11,-15,-14,-21, 25,  2, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='L';  M=  3,-13,-13,-18,-13, -2,-17,-16, 10,-15, 12,  5,-12,-13,-11,-14, -6,  4,  7,-15, -4,-13; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='R';  M=-12, -1,-25,  2, 20,-21,-17, -1,-25, 22,-18,-11,  0, -9, 11, 32, -5, -8,-20,-20,-11, 14; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-34, -8,  0,-25,-17,-17,-17, -8,-25,-17,-17, 76, -8,-17, -8, -8,-25,-25,-25, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='I';  M=-12,-17,-24,-18,-19,  9,-30,-21, 17,-24, 17,  7,-17,-24,-21,-21,-18, -9, 13,-20,  0,-21;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='Y';  M= -7, -3,-14, -2, -8, -1,-15, -5,  5, -8, -1, -1, -6,-12, -8,-10, -7, -4,  4, -8,  8, -9; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
/M: SY='Q';  M= -9,  0,-19, -4,  3, -6,-14,  0,-13,  5,-12, -4,  4,-12, 13,  4, -3, -6,-15,-12, -2,  9; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='V';  M=  3,-15,-15,-15,-12, -3,-16,-11,  3,-10, -4, -2,-15,  0,-12,-13, -6, -3,  7,-11,  2,-14; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-21, -8, -6,-13,-15,-12, -2, -9,-11, -7, -1, 20, -7,-12, -2,  1, -9,-21,-13, -9; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='Y';  M=  3,-10,-15,-13, -9, -4,-12, -6, -1, -5, -6, -3, -6,-13, -5, -2,  1, -1, -1,-11,  4, -9; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='P';  M=-12, -2,-24,  4,  0,-13,-14, -3,-16, -1,-16,-12, -6, 17, -3, -1, -7, -7,-17,-13,  0, -4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='D';  M=-13, 20,-25, 21,  5,-24, -9,  0,-24,  3,-25,-19, 20,  3,  0,  5,  0, -6,-25,-30,-18,  1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='W';  M= -8,-14,-30,-14, -7, -9,  2,-12,-15,-13,-16,-12,-10,-19, -9,-15, -6,-11,-17, 11,  4, -9;
/M: SY='D';  M=-15, 17,-30, 21, 10,-31,-14, -1,-29, 13,-27,-17, 12, -1,  9, 12, -3, -9,-27,-30,-17,  8;
/M: SY='F';  M=-13,-28,-22,-33,-26, 30,-31,-17, 17,-25, 20, 10,-24,-29,-26,-20,-21, -8, 13, -5, 20,-26;
/M: SY='S';  M=  4, -8,-15,-11, -8,-14, -9,-11, -3,-13,-15, -2,  1,-13, -3,-13, 22, 11, -1,-34,-14, -6;
/M: SY='S';  M= -1,  2,-18,  0, 12,-24,-14, -6,-19, -2,-20,-12,  3, -8, 16, -3, 18, 16,-15,-30,-15, 14;
/M: SY='L';  M=-11,-25,-23,-29,-19,  2,-28,-15, 17,-18, 30, 22,-22,-25,-12, -7,-24,-10,  9,-20, -1,-17;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-26,-36,-26,  4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20,  0,-26;
/M: SY='R';  M=-16,-15,-27,-15, -5,-12,-23, -7,-15, 14,  0, -1, -9,-22,  1, 38,-16,-10,-11,-20, -7, -5;
/M: SY='Y';  M=-18,-19,-28,-20,-15, 27,-28, 12, -3,-10, -1,  0,-17,-27, -4, -9,-17,-10,-11, 19, 58,-12;
/M: SY='K';  M=-11, -3,-29, -1, 11,-25,-20,  6,-26, 15,-23,-12, -2,  5,  6, 12, -4, -3,-22,-26,-10,  6;
/M: SY='P';  M=-11,-11,-31, -8,  0,-24,-20,-13,-23, 11,-24,-14, -8, 28, -1, 15, -6, -1,-21,-26,-18, -4;
/M: SY='P';  M=  3,-15,-21,-15, -9,-15,-17,-20, -6,-14, -9, -8,-13, 16,-12,-17,  2,  7, -4,-29,-18,-12;
/M: SY='Y';  M=-10, -9,-22,-13,-11,  4,-24, -1, -9, -1, -9, -6, -9,-19, -7, -4, -2, 15, -7, -3, 29,-11;
/M: SY='G';  M= -6,-11,-31,-12,-10,-26, 17,-19,-21,  0,-23,-11, -5, -4,-10, -7, -7,-14,-18,-21,-20,-11;
/M: SY='E';  M= -9, 10,-27, 16, 19,-29, -5,  8,-31,  5,-26,-17,  6,-10,  6, -1,  3, -8,-25,-30,-14, 12;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='H';  M=  1,-16,-24,-18, -9, -5,-18,  2,-12,-10, -4, -4,-11, -3, -9, -3, -9, -9,-11,-20, -5,-11;
/M: SY='P';  M=  1, -6,-26, -5, -4,-10,-15,-14,-19, -6,-17,-14, -8, 13,-10, -5, -5, -7,-16,-21,-13, -8;
/M: SY='S';  M= -3,  7,-19,  8,  1,-20,-10, -8,-18, -1,-17,-13,  9,-14, -2, -4, 11,  4,-14,-34,-15,  0;
/M: SY='P';  M= -8,-12,-26,-11, -2,-20,-19,-11,-14, -4,-12, -8, -9, 13,  3,  1, -2,  2,-16,-27,-15, -1;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-25,-37,-30,  0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30;
/M: SY='H';  M=-12,-12,-27,-11,  3,-13,-23,  7, -8, -5,  2,  7,-12, -3, -1, -6,-15,-12,-12,-25, -5, -1;
/M: SY='V';  M= -6,-30,-17,-31,-26,  4,-31,-26, 29,-26, 28, 16,-29,-29,-24,-21,-20, -6, 30,-24, -4,-26;
/M: SY='D';  M=-15, 41,-25, 49, 12,-32,-10, -1,-32, -2,-27,-25, 23,-12, -2, -8,  5,  1,-25,-38,-18,  5;
/M: SY='D';  M=-19, 35,-30, 50, 23,-35,-13,  0,-37,  6,-27,-25, 14,-10,  5,  4, -2,-10,-28,-35,-18, 13;
/M: SY='E';  M= -3, 12,-25, 19, 36,-28,-16, -5,-26,  3,-19,-19,  2, -4,  9, -5,  4, -1,-22,-30,-19, 23;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-17, 20,-27, 46, 26,-29,-29,-17,-19,-29,-10, 10,-20,  0,-19;
/M: SY='D';  M=-11, 24,-27, 35, 28,-33,-13, -3,-33,  7,-27,-23, 10, -7,  7, -2,  5, -5,-26,-35,-19, 18;
/M: SY='T';  M=-10, -1,-23, -4, -3, -9,-23,-10, -7, -9, -8, -4, -3,-14,  5, -9, -1,  6, -8,-22, -4,  1;
/M: SY='F';  M=-10,-30,-17,-33,-26, 28,-30,-23, 17,-27, 26, 11,-27,-30,-29,-20,-21, -7, 19,-14,  6,-26;
/M: SY='A';  M= 17,-11,-15,-15,-10, -8, -9,-11, -7,-13, -6, -7, -8,-16, -8,-15,  9,  3, -3,-19, -2,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='H';  M=-18, -8,-30, -8, -5, -4,-24, 55,-17, -7,-12,  0, -3,-22, 10, -2,-12,-15,-22, -5, 38, -1;
/M: SY='N';  M=-12, 42,-22, 28,  3,-23, -2,  8,-23,  0,-30,-22, 54,-18,  0, -2,  8, -2,-30,-40,-20,  2;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M= -8, -8,-32, -2, 15,-27,-20,-14,-21, -4,-24,-18,-11, 49, -2,-13, -2,  0,-25,-30,-24,  4;
/M: SY='B';  M= -4, 31,-23, 28, 14,-27, -6,  1,-26,  0,-26,-21, 30,-13,  2, -6,  6, -4,-26,-36,-20,  8;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-20, -9,-30, -9,  0,-20,-20, 15,-30, 24,-20, -9,  1,-20, 10, 60,-10,-11,-21,-21, -6,  0;
/M: SY='T';  M=  6,-10,-10,-17,-16, -8,-20,-23,  1,-13, -4, -4,-10,-16,-16,-14, 10, 30, 14,-29,-11,-16;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 21,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-28,-30,-23,-20,-28,-10,  8,-15,  5,-22;
/M: SY='T';  M=  9, -2,-10,-10, -9,-13,-14,-19,-11,-10,-13,-11,  0,-10, -9,-12, 21, 38, -1,-30,-13, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20,  0,-22;
/M: SY='L';  M=-12,-28,-23,-35,-25, 16,-31,-20, 26,-27, 30, 23,-24,-25,-20,-21,-24,-10, 15,-15,  5,-23;
/M: SY='R';  M=-12, -5,-28, -5,  4,-24,-18, -5,-29, 33,-25,-11,  1,-15,  9, 44, -4, -6,-19,-22,-11,  4;
/M: SY='S';  M= -1, 15,-16, 20,  4,-24, -6, -9,-24, -7,-27,-21, 11,-10, -2,-10, 25, 16,-14,-38,-18,  1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-11, 24,-27, 35, 28,-33,-13, -3,-33,  7,-27,-23, 10, -7,  7, -2,  5, -5,-26,-35,-19, 18;
/M: SY='S';  M= -1, -4,-18, -5, -4,-20,  2,-10,-24,  0,-25,-16,  5,-14, -1, 11, 18, 10,-14,-30,-17, -4;
/M: SY='A';  M= 25, -8,-18,-12, -2,-23,  5,-15,-20, -3,-16,-13, -6,-12, -5, -4,  4, -6,-11,-21,-20, -4;
/M: SY='P';  M=-10,  0,-31,  7,  4,-28,-15,  4,-26, -1,-29,-17, -2, 30, -1, -8,  0, -7,-26,-32,-17, -1;
/M: SY='B';  M=-13, 22,-26, 22,  4,-26,-11, -3,-25,  1,-26,-20, 21,  2, -2,  1,  3,  1,-25,-35,-19,  0;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='M';  M= -8,-26,-18,-30,-22,  4,-26,-13, 22,-20, 31, 35,-26,-26,-13,-16,-23, -8, 16,-22, -2,-17;
/M: SY='N';  M= -2,  5,-20,  0, -1,-23,  2,-10,-25,  8,-28,-16, 12,-13, -1,  2, 12,  6,-18,-30,-17, -1;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-20,-39,-30, 60,-31,-23, 10,-29, 11,  4,-21,-29,-36,-21,-19, -9, 10,  1, 21,-30;
/M: SY='M';  M=-12,-26,-20,-32,-22, 17,-26,-12, 17,-22, 31, 33,-24,-26,-15,-16,-24,-10,  8,-15,  5,-17;
/M: SY='N';  M=-11, 13,-26,  4,  0,-24,  3,  2,-26,  6,-26,-14, 25,-19,  8, 17,  1, -7,-27,-28,-17,  2;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-29, -6,-17,-29, 60,-16,-37,-17,-30,-20,  9,-20,-17,-17,  1,-17,-30,-23,-29,-17;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-26,-23, 45,-30,  8,  0,-16,  3,  0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23;
/M: SY='S';  M=  0,  6,-17,  4, 10,-23, -9, -5,-20, -3,-24,-15, 11,-10, 11, -4, 21, 13,-17,-34,-17, 11;
/M: SY='E';  M=-10,  2,-27,  4, 27,-29,-20,  0,-24, 10,-18,-11,  0, -8, 27, 12,  2, -1,-24,-25,-14, 26;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D';  M= -7,  2,-24,  8, -6,-19,  6,-13,-18,-16, -5,-11, -2,-19,-11,-16, -3, -8,-15,-29,-16, -8;
/M: SY='D';  M= -3, 14,-25, 22,  4,-24,-11, -6,-24, -6,-23,-20,  3,  3, -4,-13,  4, -4,-20,-27,-10, -1;
/M: SY='H';  M= -9,  3,-26,  6, -1,-24, -5, 18,-27,-10,-24,-15,  4,  2, -3,-10,  5, -1,-23,-32,-10, -4;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-14, -1,  0,-15,  4, -7,-16, 10,-16, -8,  1, -7,  0,  4,  2, -3,-11,-13, -9,  0; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -1, -4,-18, -4, -5,-17,-10,-12, -9, -9,-20,-13,  2, 14, -7,-11,  8,  3, -8,-30,-18, -7; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='S';  M=  7,-12,-16,-17,-15,-14, -3,-21, -1,-16,-10, -6, -7,-16,-14,-18, 10,  8,  6,-28,-15,-15;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-36,-29,  1,-36,-29, 40,-27, 22, 17,-24,-24,-23,-26,-19, -7, 33,-23, -3,-29;
/M: SY='Y';  M=-15,-21,-23,-26,-21, 35,-28, -3,  1,-19,  9,  1,-18,-27,-20,-14,-15, -1, -3,  8, 40,-21;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V';  M= -5,-27,-16,-29,-26, -3,-30,-26, 24,-14,  7,  9,-24,-27,-22, -8,-12, -3, 36,-27, -8,-26;
/M: SY='D';  M=-16, 27,-29, 36, 27,-31,-14,  1,-33,  8,-25,-22, 15,-10,  8,  7,  0, -9,-28,-34,-18, 17;
/M: SY='D';  M=-11, 33,-24, 36, 17,-29, -7,  1,-29,  0,-28,-24, 27,-11,  3, -6,  9, -2,-27,-38,-20, 10;
/M: SY='V';  M= -4,-11,-16,-15,-15, -8,-23,-18,  7, -6,  0,  1, -8,-23,-15, -8, -6,  3, 16,-29,-10,-15;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-15, -7,-28, -9,  0,-15,-22,  1,-21, 19,-17, -7, -3,-17, 12, 32, -7, -3,-18,-13,  5,  3;
/M: SY='E';  M=  2,  0,-24,  2, 18,-29, -4, -7,-25,  7,-23,-14,  0, -8, 13,  0,  6, -5,-21,-26,-18, 15;
/M: SY='Y';  M=-20,-14,-30,-14,-14, 16,-27, 42, -8,-10, -6,  0,-12,-27, -4, -7,-17,-13,-16, 13, 63,-14;
/M: SY='D';  M= -8, 32,-21, 35,  8,-28, -4,  0,-28, -3,-30,-24, 28,-13,  0, -7, 15,  2,-24,-40,-20,  4;
/M: SY='L';  M=-11,-27,-25,-25,-17,  7,-28,-14, 11,-24, 30, 11,-27,-11,-17,-19,-25,-10,  1,-14,  7,-18;
/M: SY='E';  M=-10, -4,-25, -2, 21,-17,-21, -5,-14,  2, -4,  0, -7,-11,  7,  5, -6, -3,-14,-26,-12, 13;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -2, 11,-19,-21, -1,-26, 30,-21,-10, -3,-14,  9, 31,-10,-10,-20,-15,  1,  8;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20,  0,-22;
/M: SY='N';  M= -5,  8,-21,  1, -1,-20,-12, -9,-19,  2,-24,-16, 15,  3, -3, -3, 10, 14,-17,-32,-17, -3;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 14,  0,-13,  1,  0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21;
/M: SY='T';  M=  1, -7,-16,-12,-14,-15,  6,-20,-13,-14,-15,-11, -3,-16,-14,-14, 13, 19, -2,-29,-17,-14;
/M: SY='N';  M= -8, 14,-23,  4, -3,-21,  2, -4,-24,  7,-26,-16, 25,-17, -2,  8,  5,  2,-22,-30,-17, -3;
/M: SY='D';  M= -9, 34,-22, 37,  9,-29, -4,  0,-29, -3,-30,-24, 30,-13,  0, -7, 13,  1,-25,-40,-20,  4;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-24,-37,-28, 14,-36,-27, 35,-29, 22, 16,-23,-24,-24,-26,-20, -9, 24,-16,  4,-28;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='T';  M=  4,-15,-12,-20,-18, -5,-22,-23,  7,-16,  6,  1,-15,-19,-18,-16,  2, 19, 17,-27,-10,-18;
/M: SY='E';  M=-12, 16,-30, 28, 54,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  3, -2, 17, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 35;
/M: SY='N';  M=-11, 35,-21, 18,  0,-20, -2, 21,-21, -1,-29,-18, 54,-20,  1,  0,  8, -2,-30,-39,-15,  0;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-16,-33,-30,  0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30;
/M: SY='L';  M=  1,-27,-20,-31,-23,  1,-28,-24, 25,-25, 26, 14,-24,-24,-20,-23,-18, -7, 20,-22, -5,-23;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-20,-37,-27, 58,-30,-20,  6,-30, 23,  6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,  3,  0, 20,-27;
/M: SY='D';  M=-16, 33,-30, 49, 37,-36,-14,  0,-36,  4,-26,-26, 12, -6,  8, -6,  0,-10,-30,-36,-20, 23;
/M: SY='F';  M=-13,-30,-20,-36,-27, 38,-31,-23, 16,-28, 22,  9,-24,-29,-31,-21,-21, -8, 14, -8, 12,-27;
/M: SY='N';  M=  0,  6,-19,  0, -9,-21, 17, -9,-20,-11,-25,-16, 18,-18, -9,-11, 13,  0,-15,-33,-22, -9;
/M: SY='P';  M= -2,-19,-31,-19,-11,-18,-23, -6,  2,-16,-10, -3,-14, 25,-10,-20,-10,-10, -7,-25,-12,-15;
/M: SY='P';  M= -7,-14,-34, -7,  1,-28,-17,-17,-21, -2,-30,-19,-13, 60, -6,-12, -2, -5,-25,-30,-26, -6;
/M: SY='S';  M=  1, -8,-21, -5,  2,-21, -1,-15,-16,-10,-22,-15, -4,  3, -6,-13, 12,  2, -9,-32,-21, -3;
/M: SY='H';  M=-12,  0,-23, -6, -5,-11,-18, 12, -6,-12,  5,  2,  8,-23,  2, -7,-10, -9,-14,-28, -4, -2;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='M';  M=-10,-19,-16,-26,-19, 20,-20,-10, 14,-15, 12, 22,-14,-17,-13,-13,-14, -7,  8, -7,  8,-15; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='S';  M=  8, -1,-17, -4, -7,-16,  7, -7,-19,-10,-24,-16,  8,-15, -6,-12, 19,  5,-14,-26,-10, -7;
/M: SY='V';  M=  2,-27,-15,-32,-27, 10,-27,-27, 23,-22,  9,  7,-24,-26,-27,-21,-10, -3, 32,-21, -4,-27;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 45, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 15,-21, -1,-21;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-18,-33,-28,  2,-33,-28, 35,-25, 19, 15,-27,-27,-25,-23,-16, -5, 38,-25, -5,-28;
/M: SY='Y';  M=  5,-21,-19,-24,-19,  6,-22, -9,  7,-17, 13,  4,-21,-24,-16,-17,-13, -6,  7, -6, 18,-19;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-18,-31,-24,  6,-31,-24, 26,-27, 35, 17,-29,-29,-23,-21,-23, -7, 24,-23, -3,-24;
/M: SY='R';  M=-12, -2,-27,  1, 18,-23,-17, -2,-28, 18,-22,-15,  2,-12, 11, 36,  1, -5,-21,-26,-15, 12;
/M: SY='N';  M=-11, 34,-21, 17,  0,-20, -3, 22,-21, -1,-29,-17, 53,-20,  1,  0,  7, -3,-30,-39,-14,  0;
/M: SY='E';  M= -8, 12,-26, 11, 23,-24,-14, -3,-22,  1,-23,-18, 14,  7,  5, -5,  4,  2,-25,-33,-20, 13;
/M: SY='E';  M=  3,  6,-25,  7, 12,-27,-13,  8,-26, 11,-21,-13,  2,-10,  5,  1, -2, -9,-19,-26,-11,  7;
/M: SY='T';  M= -5, -7,-21,-13, -8,-15,-23,-20, -6, -3,-12, -7, -6,  4, -8, -8,  5, 23, -4,-27,-12,-10;
/M: SY='R';  M=-11,  0,-29, -2,  1,-26, -4, -7,-30, 28,-27,-13,  7,-15,  4, 29, -6,-10,-23,-22,-14,  1;
/M: SY='T';  M=  5,-14,-15,-22,-18, -7,-21,-20, 10,-15,  2,  8,-12,-16,-13,-16,  2, 16, 14,-25, -9,-16;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-23,  5, 17,-23,-18, 10,-21,  0,-18,-11,  8,-10, 13, -2,  6,  9,-21,-30,-10, 14;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-27, -2, 10,-24,-17, -5,-28, 27,-25,-13,  2,-13, 10, 36, -1, -5,-20,-24,-13,  8;
/M: SY='V';  M=  1,-26,-20,-29,-23, -7,-28,-27, 24,-20,  5,  7,-23, -8,-22,-23,-11, -4, 27,-26,-11,-25;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-17,-33,-28,  2,-33,-28, 34,-24, 19, 14,-27,-27,-26,-23,-16, -4, 38,-26, -6,-28;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-22,-36,-29, 14,-34,-27, 33,-27, 19, 14,-24,-26,-26,-24,-18, -7, 29,-18,  2,-29;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='P';  M=-10, -6,-32,  3,  3,-27,-15,-14,-20, -7,-25,-18,-11, 61, -7,-15, -7, -8,-25,-27,-24, -5; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='T';  M= -6,-12,-13,-17,-15,  7,-21, -2,  0,-14, -2,  0, -9,-18,-15,-11, -2, 10,  8,-19,  2,-15; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='N';  M= -7,  9,-21,  2,  2,-17,-13,  9,-13, -7,-18,-11, 18,-14,  0, -7,  9,  6,-15,-33,-10,  0;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-18, -4, -8,-24, 28,-14,-28,-14,-30,-20,  6,-14, -8,-14, 24,  4,-18,-32,-24, -8;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-23,-33,-23,  5,-30,-17, 28,-24, 34, 31,-25,-25,-14,-20,-25,-10, 15,-20,  0,-20;
/M: SY='T';  M=  0,  6,-14, -1, -2,-18,-11, -9,-16, -6,-20,-13, 12,-11,  4, -6, 21, 26,-11,-33,-14,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-19,-30,-21,  7,-28,-18, 21,-25, 39, 25,-28,-28,-18,-18,-25, -9, 16,-21, -1,-20;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-20,-38,-28, 69,-30,-20,  3,-30, 17,  3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,  2,  5, 25,-28;
/M: SY='D';  M=-20, 32,-30, 47, 10,-22,-15,  5,-30, -3,-22,-22, 10,-15, -3,-10, -5,-10,-25,-22,  6,  2;
/M: SY='A';  M= 28, -8,-16,-16,-13,-21, 17,-20,-18,-13,-16,-13, -6,-13,-13,-18,  9,  2, -8,-22,-21,-13;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-19,-26,-19,  3,-29,-22, 16,-24, 28, 12,-20,-23,-17,-19,-14,  7, 10,-23, -3,-19;
/M: SY='Y';  M=-17,-23,-27,-23,-20, 24,-30,  8,  6,-16, 15,  6,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -4, 15, 56,-20;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='C';  M= -1,-20, 25,-26,-20, -6,-25,-23, -4,-24, 12,  0,-20,-28,-20,-21,-11,  1,  1,-31,-13,-20;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-15,-30,-25,  5,-30,-25, 25,-25, 29, 15,-30,-30,-25,-20,-19, -5, 31,-25, -5,-25;
/M: SY='R';  M=-16,-10,-28,-10,  0,-18,-22, -6,-22, 26,-12, -5, -5,-19,  5, 45,-13,-10,-15,-20, -8,  0;
/M: SY='Y';  M= -7, -4,-21, -4,  6, -4,-21, -2,-13, -5,-12,-11, -5,-14, -1, -7,  5, 13,-12,-13, 14,  1;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-23,-39,-29, 48,-33,-23, 17,-30, 18,  8,-21,-27,-32,-23,-21,-10, 10, -3, 17,-29;
/M: SY='F';  M= -9,-16, -3,-20,-15,  6,-23, -1, -6,-22,  6,  0,-12,-24,-15,-15, -7,  0, -4,-24,  0,-15;
/M: SY='R';  M=-10,-16,-24,-15, -6,-12, -9,-13,-10, -4,  2, -2,-12,-22, -7, 10,-13,-10, -5,-23,-12, -8;
/M: SY='R';  M=-13, -9,-27,-10, -5,-12,-21, 13,-15,  7,-15, -5, -2,-18,  2, 16, -5, -7,-13,-17,  8, -5;
/M: SY='H';  M=-11,-11,-23,-17,-14, -3,-25, 18,  1,-13, -1, 10, -7,-19, -5,-11, -6,  4, -3,-18, 14,-12;
/M: SY='G';  M= -4,  9,-25,  8, -4,-29, 27, -8,-31, -9,-29,-19, 13,-16, -2,-10,  8, -8,-27,-29,-23, -3;
/M: SY='L';  M= -2,-27,-17,-31,-23, 22,-25,-22, 11,-25, 24,  8,-24,-27,-25,-20,-18, -7, 12,-14,  3,-23;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-10, 28,-25, 34, 15,-31,  1, -2,-32, -2,-28,-24, 19,-11,  1, -8,  8, -5,-27,-36,-21,  8;
/M: SY='T';  M= -7,-16,-19,-20,-13,  2,-25,-18,  0,-15,  2, -1,-15, -8,-11,-13, -4, 10,  2,-21, -5,-12;
/M: SY='D';  M= -8, 23,-30, 36, 11,-35,-11, -8,-31, -4,-27,-25,  5, 17, -4,-14, -1, -9,-26,-35,-23,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 44, 18,-30,-30,-22,-20,-27, -8, 16,-22, -2,-22;
/M: SY='I';  M= -6,-26,-22,-31,-24,  0,-31,-25, 30,-26, 21, 14,-21,-23,-19,-23,-14, -5, 23,-24, -4,-24;
/M: SY='R';  M=-14,  8,-30, 14,  6,-31, -3, -3,-33, 14,-26,-15,  5,-14, 10, 20, -4,-12,-26,-25,-16,  7;
/M: SY='H';  M=-13, -6,-24, -6,  3,-17,-22, 20,-18,  3,-14, -5, -2,-17,  3, 16, -5, -4,-10,-27, -3,  0;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-19,-30,-21,  6,-27,-15, 21,-23, 36, 31,-27,-27,-15,-17,-25, -9, 15,-21, -1,-18;
/M: SY='E';  M=-15,  8,-30, 15, 19,-25,-21, -5,-20,  7,-16,-13,  2,-11,  6, 12, -6,-10,-18,-28,-14, 10;
/M: SY='K';  M= -6,  1,-22,  2,  2,-20,-17,-12,-19, 12,-14, -9, -1,-13, -1,  5,  1,  4,-12,-27,-11,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R';  M=-15,  4,-27, -2, -2,-10,-16, 10,-18,  7,-18, -9, 13,-21, 10, 19, -5, -7,-22,-13, 10,  1;
/M: SY='A';  M=  8,  3,-20,  5,  8,-22,-11,-11,-18, -1,-12,-12, -2,-11, -1, -8,  4, -3,-12,-28,-16,  3;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-23, -1, -5,-19, -8,-12,-16,  2,-13, -9, -4,-18, -6,  5, -2, -5, -7,-27,-14, -6;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-21,-34,-24, 28,-31,-21, 19,-30, 35, 14,-26,-29,-26,-21,-26,-10, 10,-12,  8,-24;
/M: SY='P';  M= -7,-17,-35, -8,  0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 74, -8,-18, -2, -5,-27,-32,-28, -8;
/M: SY='F';  M= -2, -8,-23,-10,-12,  6, -4,-17,-17,-16,-12,-12, -7, -6,-19,-17, -3, -3,-12,-16, -6,-15;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-27, -8,  8,-17,-23,-10,-13,  3, -8, -7,-12,  0, -1, 13,-10, -8, -9,-26,-15,  1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 17 in 17 different sequences
Number of true positive hits 17 in 17 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] gL betaherpesvirus-type
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
17 sequences

GL_GPCMV(O92277), GL_HCMV1(Q68667), GL_HCMV2(Q68668), 
GL_HCMV3(Q68669), GL_HCMV4(Q68670), GL_HCMV5(Q68671), 
GL_HCMV6(Q68672), GL_HCMV7(Q68673), GL_HCMV8(Q68674), 
GL_HCMVA(P16832), GL_HCMVM(F5HCH8), GL_HCMVP(Q68666), 
GL_HHV6U(P52508), GL_HHV6Z(P52526), GL_HHV7J(P52509), 
GL_MUHVK(P52513), GL_MUHVS(P52514)
» more

PDB
[Detailed view]
11 PDB

5VOB; 5VOC; 5VOD; 7LBE; 7LBF; 7LBG; 7M30; 7RAM; 7T4Q; 7T4R; 7T4S