PROSITE entry PS52044
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | VLRF1 |
Accession [info] | PS52044 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
02-OCT-2024 CREATED;
02-OCT-2024 DATA UPDATE; 02-OCT-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC52044 |
Associated ProRule [info] | PRU01389 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Vms1-like release factor 1 (VLRF1) domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=147; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=142; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3554733; R2=0.0163412; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=254; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M= -9, 1,-28, 5, 0,-27, 3, -9,-31, 7,-27,-18, 3, -4, -1, 13, 1, -8,-23,-27,-19, -3; /M: SY='P'; M=-12, -7,-32, -1, 1,-24,-20,-10,-13, -8,-11, -4,-12, 28, 2,-13,-11,-10,-20,-27,-18, 0; /M: SY='R'; M= 4,-13,-23,-16, -9, -9, -3,-14,-18, 2,-10, -7, -8,-18, -8, 7, -6, -9,-11,-17,-10, -9; /M: SY='Q'; M=-13, 2,-28, 5, 6,-24,-22, 5,-10, -4, -6, -1, -3,-16, 21, -4, -8,-11,-17,-23, -4, 12; /M: SY='C'; M= -7,-14, 8,-16,-11,-13,-24,-12, -9, -5, -8, -4,-13,-24, -4, -7, -6, -5, -3,-25, -4, -8; /M: SY='L'; M= 11,-24,-15,-27,-19, -2,-20,-22, 12,-21, 22, 8,-24,-24,-19,-20,-13, -5, 15,-22, -9,-19; /M: SY='I'; M=-10,-26, 1,-31,-26, 3,-32,-18, 19,-23, 11, 13,-23,-28,-20,-22,-17, -8, 17,-19, 6,-25; /M: SY='F'; M=-12,-30,-17,-35,-28, 41,-30,-23, 13,-27, 18, 7,-25,-30,-33,-20,-19, -7, 17, -9, 11,-28; /M: SY='M'; M= -8,-19,-20,-24,-17, 4,-21, -4, 10,-15, 17, 27,-18,-23, -7,-13,-13, -5, 4,-15, 10,-13; /M: SY='V'; M= 7,-27,-16,-29,-24, -1,-23,-26, 15,-20, 9, 4,-27,-26,-23,-20,-12, -5, 25, -7, -6,-23; /M: SY='Q'; M= 3, 0,-25, -2, 6,-27, 6, -6,-25, 1,-21,-13, 4,-13, 8, 4, 2, -9,-22,-24,-19, 6; /M: SY='G'; M= 21, -7,-16,-10,-10,-23, 23,-17,-23,-13,-23,-16, 0,-13,-10,-17, 16, 0,-13,-26,-23,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M= -9, 3,-27, 5, -1,-15,-17, 53,-24, -8,-17, -6, 4,-18, 2, -6, -7,-14,-22,-21, 17, -3; /M: SY='F'; M= -7,-27,-20,-37,-27, 51,-27,-22, 7,-27, 8, 2,-18,-25,-32,-22,-15, -8, 5, 0, 17,-27; /M: SY='A'; M= 34,-12,-10,-20,-13,-15, -8,-22, -4,-12, -7, -7,-12,-13,-13,-18, 8, 8, 8,-23,-17,-13; /M: SY='G'; M= 8,-15,-21,-20,-18, -5, 11,-20,-10,-19,-12, -9, -7,-18,-18,-20, 2, -6, -6,-19,-12,-18; /M: SY='A'; M= 22,-13,-14,-18,-14,-16, 4,-18, -6,-13,-10, -2,-10,-16,-12,-17, 7, -1, 3,-25,-18,-13; /M: SY='I'; M=-12,-29,-29,-36,-26, 3,-30,-21, 26,-23, 18, 24,-25,-23,-15,-22,-25,-13, 12, 8, 5,-22; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-17,-25,-26,-33,-24, 33,-24, -2, 0,-20, 6, 16,-20,-26,-19,-15,-22,-14, -4, 17, 19,-19; /M: SY='Q'; M=-13, 14,-29, 16, 19,-34,-16, 21,-26, 4,-23, -9, 11,-12, 32, 3, 0,-10,-30,-28, -9, 25; /M: SY='G'; M= -9, 7,-30, 10, 5,-29, 17, -8,-33, -4,-27,-20, 7, -3, -4, -4, -1,-13,-29,-28,-24, 0; /M: SY='R'; M=-11, 2,-23, 7, -2,-19,-17, -8,-16, 2,-12,-10, -1,-18, -4, 13, -1, -4, -7,-30,-13, -4; /M: SY='E'; M=-13, 22,-29, 31, 38,-32,-15, 0,-32, 11,-25,-22, 12, -6, 12, 1, 0, -9,-29,-33,-19, 25; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='V'; M= -6,-13,-14,-18,-18, 7,-19,-13, 11,-15, 9, 10, -9,-22,-17,-13,-10, -4, 14,-20, -3,-17; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='V'; M= -6,-23,-17,-24,-20, 3,-23,-21, 11,-18, 12, 4,-23,-23,-19,-16,-15, -2, 14, 5, 0,-19; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='T'; M= 7, -8,-14,-11, -5, -5,-15, -9, -5, -7, -6, -6, -9,-13, -7,-11, 3, 10, 1,-14, 3, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='H'; M=-18, 8,-30, 11, 8,-28,-18, 64,-29, -4,-22, -5, 9,-16, 19, 1, -6,-16,-30,-29, 7, 10; /M: SY='K'; M= -8, -5,-27, -8, 0,-22,-23,-15,-14, 28,-19, -5, -3,-12, 2, 14, -7, -1, -9,-22, -8, 0; /M: SY='T'; M= 12, -2,-10, -7, -6,-16, -8,-16,-14,-10,-19,-14, 3,-10, -6,-12, 27, 30, -4,-33,-16, -6; /M: SY='F'; M=-17,-25,-23,-34,-22, 53,-30,-17, 2,-24, 7, 2,-17,-26,-23,-17,-17,-10, -1, 2, 21,-19; /M: SY='H'; M=-14, 0,-30, 2, 8,-25, -6, 48,-32, 1,-23, -8, 5,-15, 7, 1, -7,-17,-28,-27, 1, 5; /M: SY='R'; M= -7, -2,-25, -7, -2,-20,-14, -2,-25, 19,-20,-12, 8,-18, 5, 44, -4, -7,-18,-23,-13, -2; /M: SY='Y'; M=-18,-10,-28,-14,-17, 22,-25, 18, -3, -8, -5, -3, -7,-28, -8, -8,-15, -8,-13, 19, 64,-17; /M: SY='T'; M= -3,-11,-15,-17,-14, -9,-23,-18, 2, -3, -3, 6,-11,-17,-10, -6, 1, 18, 11,-27, -8,-12; /M: SY='T'; M= 7,-12,-10,-17,-16, -9,-18,-22, 3,-14, -6, -4,-10,-17,-16,-15, 11, 22, 16,-31,-13,-16; /M: SY='R'; M=-18, -2,-28, -5, 0,-20,-17, 2,-28, 25,-22,-12, 10,-20, 8, 59, -7, -8,-22,-23,-12, 0; /M: SY='R'; M= 7, -7,-24,-10, -5,-23, 0, 5,-25, 7,-20,-10, -2,-15, -1, 10, -2,-10,-17,-22,-11, -5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -8, -3,-24, -5, 4,-21,-17, -7,-17, 33,-17, 3, -3,-10, 7, 19,-10, -8,-12,-17, -7, 5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Q'; M= -2, 2,-25, -2, 8,-30,-14, 3,-20, 9,-20, -7, 7,-14, 29, 16, 1, -7,-23,-23,-13, 18; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= -8, -9,-24,-13,-12, -7, 7,-15,-24, -1,-18,-12, -3,-18,-12, 4, -2, -1,-16,-17,-10,-12; /M: SY='A'; M= 18, -8,-13,-12, -7,-18, -6,-14,-13, -5,-17,-12, -3,-14, -5, -2, 16, 6, -2,-29,-17, -7; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='G'; M= 4, -3,-13, -3, -6,-17, 22,-10,-20,-10,-21,-14, 4,-10, -6,-10, 15, 1,-13,-21,-17, -6; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='A'; M= 16,-10,-11,-14, -6,-10, -8,-11, -2, -9, 4, 0,-10,-11, -1,-11, -2, -3, -1,-14, -9, -4; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='Q'; M= -6,-12,-28,-14, -4,-20,-21, 0, -7, 3,-11, 3, -8, 0, 4, 2, -9,-10,-10,-23, -8, -2; /M: SY='D'; M=-14, 35,-27, 48, 15,-35,-10, -3,-35, 6,-30,-25, 15,-10, 2, -4, 4, -5,-25,-37,-18, 8; /M: SY='H'; M= 11, 2,-18, -6, -7,-12, -8, 12,-15, -8,-16,-10, 9,-17, -4,-10, 5, -2,-14,-20, 2, -7; /M: SY='T'; M= -1,-12,-19,-16,-11,-10,-11,-11, -8,-12, 4, -1,-10,-19, -7, -6, -4, 6, -5,-23, -9,-10; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= 6, -4,-14, -6, -5,-16, 16,-10,-17, 1,-14, -8, -2, -8, -5, -4, 0, -7,-11,-12,-13, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -9, -4,-30, -4, 2,-28, -1,-11,-32, 32,-28,-12, 0,-14, 4, 26, -8,-12,-22,-20,-14, 2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -3, -5,-24, -6, -5,-24, 17,-12,-28, 11,-23,-12, -1,-13, -4, 8, -4,-12,-19,-17,-16, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 19, -4,-21,-10, -9,-25, 19,-16,-23, -6,-21,-15, 1,-10,-10,-13, 4, -8,-16,-23,-22,-10; /M: SY='A'; M= 19, -8,-18,-13, -4,-21,-10,-16,-11, 6,-16, -8, -5,-11, -3, -4, 5, -1, -4,-23,-15, -4; /M: SY='N'; M= -7, 10,-21, 4, 1,-21, -8, 19,-24, 3,-27,-14, 21,-16, 4, 8, 11, 0,-22,-34,-10, 1; /M: SY='S'; M= 1, -3,-16, -3, 0,-20, -6, -7,-23, 2,-27,-17, 7,-13, 3, 15, 25, 11,-13,-34,-17, 0; /M: SY='A'; M= 39,-12,-13,-20,-12,-12, -5,-14, -8,-10, -8, -8,-12,-13,-10,-18, 5, -2, -2,-12, -5,-12; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 23, -3,-10, -6, -3,-20, 0,-13,-17,-10,-24,-17, 4,-10, -3,-13, 31, 14, -7,-34,-20, -3; /M: SY='R'; M= -1, 1,-22, -3, -1,-23, -1, -4,-24, 5,-24,-14, 10,-16, 6, 16, 8, -2,-19,-27,-17, 1; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 44, 18,-30,-30,-22,-20,-27, -8, 16,-22, -2,-22; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16, -6,-11,-23, -6,-15, 11, 2, -1, -9,-23, 1, 42,-16,-10,-11,-20, -7, -6; /M: SY='Y'; M= -9,-17,-27,-18,-15, 15,-24, 11, -6, -4, -5, -3,-15,-25, -7, 0,-14, -8,-10, 15, 51,-15; /M: SY='N'; M=-10, 35,-22, 20, 9,-22, -3, 8,-22, 2,-28,-20, 51,-17, 3, 0, 8, -2,-30,-38,-20, 6; /M: SY='E'; M= 1, 5,-24, 9, 38,-25,-17, -6,-24, 4,-17,-17, -2, -3, 11, -5, 5, 1,-21,-28,-18, 25; /M: SY='A'; M= 23,-10,-17,-17, -6,-21,-11,-14, -4, -9,-10, -4, -7,-12, 5,-14, 6, -2, -3,-22,-15, -1; /M: SY='A'; M= 25, -6,-16,-12, 2,-20, -8,-14,-12, 0,-11, -4, -8, -9, -2,-10, 3, -1, -6,-22,-16, 0; /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-27,-16, 12,-27,-13, 11,-22, 30, 18,-23,-26, -9,-14,-23,-10, 2,-15, 3,-11; /M: SY='Y'; M=-15,-12,-28,-15, -8, 5,-26, 9,-10, 7,-11, -2, -8,-20, -5, 3,-15,-12,-11, -6, 21, -8; /M: SY='E'; M= -9, 4,-28, 7, 29,-28,-20, -7,-28, 27,-24,-14, 0, -6, 12, 13, -3, -4,-22,-25,-14, 20; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M=-17, 36,-30, 51, 25,-37,-13, -2,-37, 10,-28,-25, 14, -8, 5, -2, -2,-10,-28,-35,-18, 15; /M: SY='I'; M= 2,-27,-21,-33,-25, -2,-30,-27, 32,-25, 18, 13,-22,-22,-20,-25,-15, -6, 26,-22, -5,-25; /M: SY='Q'; M= -3, 3,-25, -2, 7,-28,-14, 0,-22, 16,-22, -8, 8,-14, 22, 20, -1, -7,-22,-23,-13, 13; /M: SY='D'; M= -7, 2,-23, 5, 0,-22, -4, -6,-21, -4,-15,-12, 4,-16, 3, 3, 4, -3,-17,-29,-15, 1; /M: SY='V'; M= -8,-17,-20,-20,-14, -7,-26,-19, 5, -3, 5, 4,-15,-21,-11, 2,-10, 2, 10,-24, -7,-14; /M: SY='L'; M= -1,-26,-18,-29,-19, 12,-24,-18, 13,-25, 33, 17,-25,-26,-18,-19,-21, -8, 7,-17, 0,-18; /M: SY='A'; M= 15, -4,-18, -9, -1,-22,-11,-15,-19, 13,-20,-11, -2,-10, -1, 1, 7, 6, -9,-24,-15, -1; /M: SY='D'; M= 3, 7,-22, 8, -1,-26, 6,-13,-27, 0,-24,-17, 4,-12, -6, -7, 7, 2,-17,-28,-19, -4; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='P'; M= -5, -9,-18, -8, -3,-11,-13,-10, -1, 2, -8, -3, -7, 14, -3, -4, -7, -5, -5,-12, -8, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='D'; M= -2, 7,-12, 10, 10,-13, -8, -4,-11, -1, -9, -9, 2, -4, 1, -5, 3, 0, -8,-17, -9, 5; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='W'; M= -5,-28,-31,-29,-21, 4,-15,-22, -9,-17, -4, -9,-28,-22,-15,-17,-25,-18,-14, 73, 13,-15; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='E'; M= 1, 0,-21, 2, 15,-23, -3, -8,-23, 12,-21,-13, 0, -7, 5, 3, 3, -5,-17,-22,-15, 10; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='K'; M= -8, -2,-24, -1, 5,-23,-15, 7,-23, 20,-24, -9, 0, 1, 5, 11, -3, -7,-18,-22, -7, 4; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='L'; M= 3,-15,-18,-17,-13, -5, -3,-10, -6,-11, 5, -1,-12,-19,-10, -6, -9, -8, -5,-12, -1,-13; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='L'; M=-13,-24,-23,-24,-14, 1,-27,-14, 4,-11, 28, 11,-21,-27,-11, 8,-24,-10, 1,-20, -3,-14; /M: SY='E'; M= -7, -7,-28, -3, 11,-24,-10,-10,-20, 2,-14,-10, -7, 3, 5, -3, -4, -8,-20,-26,-17, 7; /M: SY='E'; M= -1, 1,-25, 1, 21,-25,-17, -8,-25, 16,-19,-14, -2, -8, 8, 13, 0, -2,-18,-25,-15, 14; /M: SY='C'; M= 7, -8, 12,-15,-13,-20, -4,-21,-22, -6,-18,-14, -6,-18,-13,-11, 4, 7,-10,-29,-19,-13; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='D'; M=-11, 7,-27, 15, 15,-18, -7, -1,-23, -2,-18,-16, -1, 1, 1, -8, -4, -9,-22,-17, -3, 7; D=-11; /I: I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; /M: SY='T'; M= -5, -2,-15, -8, -6, -8,-17,-12, -6, -2, -1, -3, 0,-14, -6, -3, 0, 14, -4,-23, -7, -6; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='I'; M= 3,-22,-17,-28,-21, -2,-24,-23, 25,-20, 13, 10,-18,-18,-17,-21,-11, -5, 23,-19, -5,-21; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='F'; M=-13, -8,-20, -8, -9, 17,-21,-12, -7, -8, 4, -2,-10,-19,-15, -7,-14, -8, -6,-10, 5,-11; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='I'; M= 0,-19,-18,-23,-16, -1,-21,-17, 11,-12, 9, 5,-15,-19,-13, -5,-11, -6, 10,-17, -5,-16; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='R'; M=-15,-14,-27,-14, -3,-14,-23, 2,-13, 6, 2, 1, -9,-21, 9, 28,-15,-11,-13,-21, -5, 0; /M: SY='A'; M= 33,-16, -2,-24,-15,-15, -6,-23,-14,-14,-13,-13,-16,-16,-14,-21, 0, -6, -6, 2,-14,-14; /M: SY='L'; M= 5,-20,-24,-22,-12,-11,-20,-19, 2,-14, 7, 0,-18, 2,-12,-12,-12, -7, -2,-22,-13,-14; /M: SY='N'; M= 0, 1,-19, -5, -8,-18, -1, -8,-15, -2,-19,-12, 11,-19, -6, 5, 6, -1, -9,-30,-17, -8; /M: SY='C'; M= 0,-12, 28,-15,-15,-12,-16,-15,-16,-17,-19,-15, -7,-24,-14,-17, 13, 5, -4,-34,-11,-15; /M: SY='N'; M= -5, 3,-26, 3, 6,-25, 6, 3,-27, -7,-27,-18, 10, 2, -1, -9, 8, -5,-26,-32,-19, 1; /M: SY='N'; M=-11, 13,-21, 7, -1,-19,-14, -3,-22, 6,-21,-15, 18,-16, 0, 18, 6, 11,-18,-31,-14, -2; /M: SY='R'; M= 3, 0,-18, -5, -2,-19,-10, -8,-20, 8,-21,-13, 7,-14, 0, 14, 10, 8,-13,-28,-15, -2; /M: SY='L'; M= -5,-19,-19,-20,-13, -3,-22,-17, 7,-16, 17, 6,-15,-21,-11,-13, -8, -2, 4,-25, -6,-13; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='F'; M=-15,-16,-24,-19,-21, 24,-29,-14, 10,-21, 5, 1,-16,-25,-23,-19,-15, -8, 8, -7, 17,-22; /M: SY='F'; M=-12,-25,-18,-30,-22, 42,-25,-18, 3,-27, 16, 3,-18,-27,-27,-18,-13, -5, 1, -7, 13,-22; /M: SY='H'; M=-13, -7,-27, -8, -5, -3, -4, 26,-22,-12,-15, -7, -2,-19, -6, -9, -6, -9,-20,-14, 13, -7; /M: SY='G'; M= 9, 7,-21, 3, -1,-27, 10, -7,-24, -6,-23,-15, 10,-14, 3,-10, 9, -5,-20,-28,-20, 1; /M: SY='Q'; M= 1, 8,-23, 6, 9,-30,-11, 0,-22, 5,-23,-11, 9,-12, 22, 3, 8, -3,-21,-27,-15, 15; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='G'; M= 5, -5,-15, -6, -3,-16, 6,-10,-15, 2,-14, -8, -4, 3, -4, -4, -1, -6,-11,-13,-13, -4; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='G'; M= 8, -9,-11,-11,-12,-11, 13,-13, -7,-10, -8, -5, -6,-12,-12,-12, 0, -5, 0,-13,-13,-12; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='G'; M= 10, -5,-20, -7, -4,-24, 15,-16,-25, -2,-23,-15, -1,-13, -7, -8, 9, 0,-16,-25,-20, -6; /M: SY='A'; M= 8,-17, 6,-21,-17,-11, -8,-21, -6,-20, 1, -4,-15,-23,-17,-20, -2, -3, 1,-29,-16,-17; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M= 3,-12,-22, -8, -2,-19,-10,-14,-12, -7,-17,-12,-12, 45, -7,-14, -4, -5,-15,-19,-19, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M=-10,-27,-25,-30,-22, 14,-26,-22, 11,-25, 14, 4,-21,-25,-20,-21,-16, -8, 3, 7, 6,-21; /M: SY='E'; M= 1, 2,-25, 2, 17,-27,-12, -5,-22, 2,-22,-15, 3, 6, 12, -2, 5, -4,-22,-28,-19, 14; /M: SY='R'; M=-14, -6,-29, -6, 2,-23,-20, 9,-27, 20,-23, -9, -1, -4, 6, 30, -7, -5,-21,-24, -7, 0; /M: SY='R'; M= -1, 2,-24, -1, -4,-24, 6, -7,-27, 7,-24,-15, 9,-16, -2, 14, 2, -7,-20,-25,-18, -4; /M: SY='D'; M= -8, 33,-27, 45, 15,-37,-10, -1,-32, 0,-25,-22, 12,-10, 8, -8, 2, -8,-25,-34,-18, 12; /M: SY='P'; M=-15, -8,-35, -3, 5,-18,-20, -9,-24, 0,-22,-15,-10, 11, 5, 2,-11,-13,-27, 2, -9, 4; /M: SY='R'; M=-16, -9,-32, -7, 4,-26,-20, -3,-27, 23,-23,-10, -3, 0, 14, 42, -8,-10,-23,-22,-13, 5; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='L'; M= -8,-21,-21,-23,-13, -2,-26,-14, 17,-19, 25, 14,-18,-20, -4,-14,-18, -8, 6,-17, -2, -9; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='W'; M=-11,-14,-26,-14, -8, -4,-15, -6,-17, 4,-17,-11,-10,-18, -2, 11, -8, -8,-16, 23, 12, -6; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M=-11, 11,-22, 10, 0,-21,-14, -5,-21, 5,-20,-15, 12,-17, -1, 15, 4, 2,-13,-32,-15, -2; /M: SY='I'; M=-12,-25,-28,-34,-22, 11,-35,-21, 28,-24, 11, 12,-17,-21,-11,-21,-17,-10, 14,-14, 5,-19; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='F'; M=-12,-25,-18,-29,-23, 25,-28, -5, 9,-24, 14, 7,-21,-28,-25,-17,-17, -8, 14,-15, 9,-23; /M: SY='H'; M= -4, -5,-20, -8, -1,-13,-20, 19,-13,-11, -4, -3, -3,-15, -2, -8, -1, 7,-11,-27, -1, -3; /M: SY='T'; M= 0, -9,-13,-16,-15, -9,-21,-21, 4,-15, -5, -4, -6,-15,-13,-15, 12, 28, 11,-30,-10,-15; /M: SY='R'; M=-14, -1,-31, -2, 4,-25,-18, 9,-27, 22,-26,-11, 5, 1, 6, 23, -8,-10,-24,-25,-10, 2; /M: SY='R'; M=-15, -2,-30, 1, 22,-26,-20, 2,-28, 21,-20,-12, 0,-12, 21, 39, -5,-10,-25,-23,-13, 19; /M: SY='P'; M= 1,-17,-27,-13, -6,-22,-16,-20,-11,-12,-21,-14,-16, 44,-12,-18, 0, -3,-11,-30,-24,-12; /M: SY='N'; M= -9, 17,-19, 10, -1,-19,-13, -6,-20, 1,-20,-16, 19,-14, -3, 6, 9, 18,-16,-33,-14, -3; /M: SY='F'; M=-15,-22,-23,-28,-19, 33,-28, -4, 2,-20, 3, 3,-15,-25,-15,-14,-15,-10, 0, -7, 15,-15; /M: SY='S'; M= 1, -2,-21, -3, -3,-20, -5,-11,-19, -4,-13,-10, -1,-15, 0, 1, 4, 3,-13,-26,-15, -2; /M: SY='E'; M=-12, 7,-30, 14, 42,-28,-20, 14,-30, 13,-22,-15, 2, -5, 17, 5, -3,-12,-28,-28,-12, 29; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-24, 6,-33,-24, 30,-28, 36, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 21,-22, -2,-24; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-20, -5, 10,-16,-17, -5, -9, 0, -1, -1, -7,-12, 11, -1, -4, -5,-12,-21, -8, 10; D=-10; /I: I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='R'; M= -5, -1,-22, 0, 2,-20,-13, -4,-23, 18,-17,-11, 1,-13, 4, 32, -4, -7,-15,-19,-11, 1; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='C'; M= 11,-18, 20,-23,-20,-10,-17,-23, 2,-16, -3, -3,-18,-22,-20,-19, -3, -2, 16,-27,-15,-20; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='W'; M=-13,-23,-27,-25,-18, 4,-23,-14, 4,-11, 4, 1,-20,-22,-12, -4,-21,-12, -2, 25, 13,-16; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='H'; M= -1, -4, -6, -6, 0,-22,-15, 13,-21, 8,-18, -6, -2,-14, 7, 3, -4, -9,-16,-22, -6, 2; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='K'; M= -9, -3,-24, -1, 13,-18,-18, -7,-18, 19,-10, -6, -5,-10, 6, 16, -9, -8,-14,-19, -9, 9; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= -3,-13,-19,-16,-11,-13,-24,-18, 5, -4, -6, 0,-10,-17, -5, -7, 1, 8, 10,-27, -9, -9; /M: SY='Y'; M= -2, -8,-21,-13, -8, -6,-20, -3,-11, -2,-10, -6, -7,-17, 1, 3, 1, 11, -9,-10, 13, -6; /M: SY='P'; M= -9,-21,-27,-18,-13,-13,-11,-18, -7,-12, 1, -3,-18, 5,-14, -5,-15,-10, -7,-24,-15,-15; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 7 in 7 different sequences |
Number of true positive hits | 7 in 7 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | VLRF1 |
Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
7 sequences
ANKZ1_BOVIN (Q58CQ5), ANKZ1_HUMAN (Q9H8Y5), ANKZ1_MOUSE (Q80UU1), ANKZ1_RAT (Q66H85), VMS1_CAEEL (P34511), VMS1_SCHPO (O74977), VMS1_YEAST (Q04311)» more
|
PDB [Detailed view] |
3 PDB
5WHG; 6R86; 6R87 |