PROSITE entry PS52044

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	VLRF1
Accession [info]	PS52044
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	02-OCT-2024 CREATED; 02-OCT-2024 DATA UPDATE; 02-OCT-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52044
Associated ProRule [info]	PRU01389

Name and characterization of the entry

Description [info]

Vms1-like release factor 1 (VLRF1) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=147;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=142;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3554733; R2=0.0163412; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=254; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R';  M= -9,  1,-28,  5,  0,-27,  3, -9,-31,  7,-27,-18,  3, -4, -1, 13,  1, -8,-23,-27,-19, -3;
/M: SY='P';  M=-12, -7,-32, -1,  1,-24,-20,-10,-13, -8,-11, -4,-12, 28,  2,-13,-11,-10,-20,-27,-18,  0;
/M: SY='R';  M=  4,-13,-23,-16, -9, -9, -3,-14,-18,  2,-10, -7, -8,-18, -8,  7, -6, -9,-11,-17,-10, -9;
/M: SY='Q';  M=-13,  2,-28,  5,  6,-24,-22,  5,-10, -4, -6, -1, -3,-16, 21, -4, -8,-11,-17,-23, -4, 12;
/M: SY='C';  M= -7,-14,  8,-16,-11,-13,-24,-12, -9, -5, -8, -4,-13,-24, -4, -7, -6, -5, -3,-25, -4, -8;
/M: SY='L';  M= 11,-24,-15,-27,-19, -2,-20,-22, 12,-21, 22,  8,-24,-24,-19,-20,-13, -5, 15,-22, -9,-19;
/M: SY='I';  M=-10,-26,  1,-31,-26,  3,-32,-18, 19,-23, 11, 13,-23,-28,-20,-22,-17, -8, 17,-19,  6,-25;
/M: SY='F';  M=-12,-30,-17,-35,-28, 41,-30,-23, 13,-27, 18,  7,-25,-30,-33,-20,-19, -7, 17, -9, 11,-28;
/M: SY='M';  M= -8,-19,-20,-24,-17,  4,-21, -4, 10,-15, 17, 27,-18,-23, -7,-13,-13, -5,  4,-15, 10,-13;
/M: SY='V';  M=  7,-27,-16,-29,-24, -1,-23,-26, 15,-20,  9,  4,-27,-26,-23,-20,-12, -5, 25, -7, -6,-23;
/M: SY='Q';  M=  3,  0,-25, -2,  6,-27,  6, -6,-25,  1,-21,-13,  4,-13,  8,  4,  2, -9,-22,-24,-19,  6;
/M: SY='G';  M= 21, -7,-16,-10,-10,-23, 23,-17,-23,-13,-23,-16,  0,-13,-10,-17, 16,  0,-13,-26,-23,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H';  M= -9,  3,-27,  5, -1,-15,-17, 53,-24, -8,-17, -6,  4,-18,  2, -6, -7,-14,-22,-21, 17, -3;
/M: SY='F';  M= -7,-27,-20,-37,-27, 51,-27,-22,  7,-27,  8,  2,-18,-25,-32,-22,-15, -8,  5,  0, 17,-27;
/M: SY='A';  M= 34,-12,-10,-20,-13,-15, -8,-22, -4,-12, -7, -7,-12,-13,-13,-18,  8,  8,  8,-23,-17,-13;
/M: SY='G';  M=  8,-15,-21,-20,-18, -5, 11,-20,-10,-19,-12, -9, -7,-18,-18,-20,  2, -6, -6,-19,-12,-18;
/M: SY='A';  M= 22,-13,-14,-18,-14,-16,  4,-18, -6,-13,-10, -2,-10,-16,-12,-17,  7, -1,  3,-25,-18,-13;
/M: SY='I';  M=-12,-29,-29,-36,-26,  3,-30,-21, 26,-23, 18, 24,-25,-23,-15,-22,-25,-13, 12,  8,  5,-22;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F';  M=-17,-25,-26,-33,-24, 33,-24, -2,  0,-20,  6, 16,-20,-26,-19,-15,-22,-14, -4, 17, 19,-19;
/M: SY='Q';  M=-13, 14,-29, 16, 19,-34,-16, 21,-26,  4,-23, -9, 11,-12, 32,  3,  0,-10,-30,-28, -9, 25;
/M: SY='G';  M= -9,  7,-30, 10,  5,-29, 17, -8,-33, -4,-27,-20,  7, -3, -4, -4, -1,-13,-29,-28,-24,  0;
/M: SY='R';  M=-11,  2,-23,  7, -2,-19,-17, -8,-16,  2,-12,-10, -1,-18, -4, 13, -1, -4, -7,-30,-13, -4;
/M: SY='E';  M=-13, 22,-29, 31, 38,-32,-15,  0,-32, 11,-25,-22, 12, -6, 12,  1,  0, -9,-29,-33,-19, 25;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='V';  M= -6,-13,-14,-18,-18,  7,-19,-13, 11,-15,  9, 10, -9,-22,-17,-13,-10, -4, 14,-20, -3,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='V';  M= -6,-23,-17,-24,-20,  3,-23,-21, 11,-18, 12,  4,-23,-23,-19,-16,-15, -2, 14,  5,  0,-19; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='T';  M=  7, -8,-14,-11, -5, -5,-15, -9, -5, -7, -6, -6, -9,-13, -7,-11,  3, 10,  1,-14,  3, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='H';  M=-18,  8,-30, 11,  8,-28,-18, 64,-29, -4,-22, -5,  9,-16, 19,  1, -6,-16,-30,-29,  7, 10;
/M: SY='K';  M= -8, -5,-27, -8,  0,-22,-23,-15,-14, 28,-19, -5, -3,-12,  2, 14, -7, -1, -9,-22, -8,  0;
/M: SY='T';  M= 12, -2,-10, -7, -6,-16, -8,-16,-14,-10,-19,-14,  3,-10, -6,-12, 27, 30, -4,-33,-16, -6;
/M: SY='F';  M=-17,-25,-23,-34,-22, 53,-30,-17,  2,-24,  7,  2,-17,-26,-23,-17,-17,-10, -1,  2, 21,-19;
/M: SY='H';  M=-14,  0,-30,  2,  8,-25, -6, 48,-32,  1,-23, -8,  5,-15,  7,  1, -7,-17,-28,-27,  1,  5;
/M: SY='R';  M= -7, -2,-25, -7, -2,-20,-14, -2,-25, 19,-20,-12,  8,-18,  5, 44, -4, -7,-18,-23,-13, -2;
/M: SY='Y';  M=-18,-10,-28,-14,-17, 22,-25, 18, -3, -8, -5, -3, -7,-28, -8, -8,-15, -8,-13, 19, 64,-17;
/M: SY='T';  M= -3,-11,-15,-17,-14, -9,-23,-18,  2, -3, -3,  6,-11,-17,-10, -6,  1, 18, 11,-27, -8,-12;
/M: SY='T';  M=  7,-12,-10,-17,-16, -9,-18,-22,  3,-14, -6, -4,-10,-17,-16,-15, 11, 22, 16,-31,-13,-16;
/M: SY='R';  M=-18, -2,-28, -5,  0,-20,-17,  2,-28, 25,-22,-12, 10,-20,  8, 59, -7, -8,-22,-23,-12,  0;
/M: SY='R';  M=  7, -7,-24,-10, -5,-23,  0,  5,-25,  7,-20,-10, -2,-15, -1, 10, -2,-10,-17,-22,-11, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M= -8, -3,-24, -5,  4,-21,-17, -7,-17, 33,-17,  3, -3,-10,  7, 19,-10, -8,-12,-17, -7,  5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q';  M= -2,  2,-25, -2,  8,-30,-14,  3,-20,  9,-20, -7,  7,-14, 29, 16,  1, -7,-23,-23,-13, 18;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M= -8, -9,-24,-13,-12, -7,  7,-15,-24, -1,-18,-12, -3,-18,-12,  4, -2, -1,-16,-17,-10,-12;
/M: SY='A';  M= 18, -8,-13,-12, -7,-18, -6,-14,-13, -5,-17,-12, -3,-14, -5, -2, 16,  6, -2,-29,-17, -7;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M=  4, -3,-13, -3, -6,-17, 22,-10,-20,-10,-21,-14,  4,-10, -6,-10, 15,  1,-13,-21,-17, -6; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 16,-10,-11,-14, -6,-10, -8,-11, -2, -9,  4,  0,-10,-11, -1,-11, -2, -3, -1,-14, -9, -4; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='Q';  M= -6,-12,-28,-14, -4,-20,-21,  0, -7,  3,-11,  3, -8,  0,  4,  2, -9,-10,-10,-23, -8, -2;
/M: SY='D';  M=-14, 35,-27, 48, 15,-35,-10, -3,-35,  6,-30,-25, 15,-10,  2, -4,  4, -5,-25,-37,-18,  8;
/M: SY='H';  M= 11,  2,-18, -6, -7,-12, -8, 12,-15, -8,-16,-10,  9,-17, -4,-10,  5, -2,-14,-20,  2, -7;
/M: SY='T';  M= -1,-12,-19,-16,-11,-10,-11,-11, -8,-12,  4, -1,-10,-19, -7, -6, -4,  6, -5,-23, -9,-10;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-14, -6, -5,-16, 16,-10,-17,  1,-14, -8, -2, -8, -5, -4,  0, -7,-11,-12,-13, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M= -9, -4,-30, -4,  2,-28, -1,-11,-32, 32,-28,-12,  0,-14,  4, 26, -8,-12,-22,-20,-14,  2;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -3, -5,-24, -6, -5,-24, 17,-12,-28, 11,-23,-12, -1,-13, -4,  8, -4,-12,-19,-17,-16, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 19, -4,-21,-10, -9,-25, 19,-16,-23, -6,-21,-15,  1,-10,-10,-13,  4, -8,-16,-23,-22,-10;
/M: SY='A';  M= 19, -8,-18,-13, -4,-21,-10,-16,-11,  6,-16, -8, -5,-11, -3, -4,  5, -1, -4,-23,-15, -4;
/M: SY='N';  M= -7, 10,-21,  4,  1,-21, -8, 19,-24,  3,-27,-14, 21,-16,  4,  8, 11,  0,-22,-34,-10,  1;
/M: SY='S';  M=  1, -3,-16, -3,  0,-20, -6, -7,-23,  2,-27,-17,  7,-13,  3, 15, 25, 11,-13,-34,-17,  0;
/M: SY='A';  M= 39,-12,-13,-20,-12,-12, -5,-14, -8,-10, -8, -8,-12,-13,-10,-18,  5, -2, -2,-12, -5,-12;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S';  M= 23, -3,-10, -6, -3,-20,  0,-13,-17,-10,-24,-17,  4,-10, -3,-13, 31, 14, -7,-34,-20, -3;
/M: SY='R';  M= -1,  1,-22, -3, -1,-23, -1, -4,-24,  5,-24,-14, 10,-16,  6, 16,  8, -2,-19,-27,-17,  1;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 44, 18,-30,-30,-22,-20,-27, -8, 16,-22, -2,-22;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-17,-16,-27,-16, -6,-11,-23, -6,-15, 11,  2, -1, -9,-23,  1, 42,-16,-10,-11,-20, -7, -6;
/M: SY='Y';  M= -9,-17,-27,-18,-15, 15,-24, 11, -6, -4, -5, -3,-15,-25, -7,  0,-14, -8,-10, 15, 51,-15;
/M: SY='N';  M=-10, 35,-22, 20,  9,-22, -3,  8,-22,  2,-28,-20, 51,-17,  3,  0,  8, -2,-30,-38,-20,  6;
/M: SY='E';  M=  1,  5,-24,  9, 38,-25,-17, -6,-24,  4,-17,-17, -2, -3, 11, -5,  5,  1,-21,-28,-18, 25;
/M: SY='A';  M= 23,-10,-17,-17, -6,-21,-11,-14, -4, -9,-10, -4, -7,-12,  5,-14,  6, -2, -3,-22,-15, -1;
/M: SY='A';  M= 25, -6,-16,-12,  2,-20, -8,-14,-12,  0,-11, -4, -8, -9, -2,-10,  3, -1, -6,-22,-16,  0;
/M: SY='L';  M=-12,-24,-22,-27,-16, 12,-27,-13, 11,-22, 30, 18,-23,-26, -9,-14,-23,-10,  2,-15,  3,-11;
/M: SY='Y';  M=-15,-12,-28,-15, -8,  5,-26,  9,-10,  7,-11, -2, -8,-20, -5,  3,-15,-12,-11, -6, 21, -8;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-28,  7, 29,-28,-20, -7,-28, 27,-24,-14,  0, -6, 12, 13, -3, -4,-22,-25,-14, 20;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D';  M=-17, 36,-30, 51, 25,-37,-13, -2,-37, 10,-28,-25, 14, -8,  5, -2, -2,-10,-28,-35,-18, 15;
/M: SY='I';  M=  2,-27,-21,-33,-25, -2,-30,-27, 32,-25, 18, 13,-22,-22,-20,-25,-15, -6, 26,-22, -5,-25;
/M: SY='Q';  M= -3,  3,-25, -2,  7,-28,-14,  0,-22, 16,-22, -8,  8,-14, 22, 20, -1, -7,-22,-23,-13, 13;
/M: SY='D';  M= -7,  2,-23,  5,  0,-22, -4, -6,-21, -4,-15,-12,  4,-16,  3,  3,  4, -3,-17,-29,-15,  1;
/M: SY='V';  M= -8,-17,-20,-20,-14, -7,-26,-19,  5, -3,  5,  4,-15,-21,-11,  2,-10,  2, 10,-24, -7,-14;
/M: SY='L';  M= -1,-26,-18,-29,-19, 12,-24,-18, 13,-25, 33, 17,-25,-26,-18,-19,-21, -8,  7,-17,  0,-18;
/M: SY='A';  M= 15, -4,-18, -9, -1,-22,-11,-15,-19, 13,-20,-11, -2,-10, -1,  1,  7,  6, -9,-24,-15, -1;
/M: SY='D';  M=  3,  7,-22,  8, -1,-26,  6,-13,-27,  0,-24,-17,  4,-12, -6, -7,  7,  2,-17,-28,-19, -4;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='P';  M= -5, -9,-18, -8, -3,-11,-13,-10, -1,  2, -8, -3, -7, 14, -3, -4, -7, -5, -5,-12, -8, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
/M: SY='D';  M= -2,  7,-12, 10, 10,-13, -8, -4,-11, -1, -9, -9,  2, -4,  1, -5,  3,  0, -8,-17, -9,  5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='W';  M= -5,-28,-31,-29,-21,  4,-15,-22, -9,-17, -4, -9,-28,-22,-15,-17,-25,-18,-14, 73, 13,-15; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='E';  M=  1,  0,-21,  2, 15,-23, -3, -8,-23, 12,-21,-13,  0, -7,  5,  3,  3, -5,-17,-22,-15, 10; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='K';  M= -8, -2,-24, -1,  5,-23,-15,  7,-23, 20,-24, -9,  0,  1,  5, 11, -3, -7,-18,-22, -7,  4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='L';  M=  3,-15,-18,-17,-13, -5, -3,-10, -6,-11,  5, -1,-12,-19,-10, -6, -9, -8, -5,-12, -1,-13; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='L';  M=-13,-24,-23,-24,-14,  1,-27,-14,  4,-11, 28, 11,-21,-27,-11,  8,-24,-10,  1,-20, -3,-14;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-28, -3, 11,-24,-10,-10,-20,  2,-14,-10, -7,  3,  5, -3, -4, -8,-20,-26,-17,  7;
/M: SY='E';  M= -1,  1,-25,  1, 21,-25,-17, -8,-25, 16,-19,-14, -2, -8,  8, 13,  0, -2,-18,-25,-15, 14;
/M: SY='C';  M=  7, -8, 12,-15,-13,-20, -4,-21,-22, -6,-18,-14, -6,-18,-13,-11,  4,  7,-10,-29,-19,-13;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='D';  M=-11,  7,-27, 15, 15,-18, -7, -1,-23, -2,-18,-16, -1,  1,  1, -8, -4, -9,-22,-17, -3,  7; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='T';  M= -5, -2,-15, -8, -6, -8,-17,-12, -6, -2, -1, -3,  0,-14, -6, -3,  0, 14, -4,-23, -7, -6; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='I';  M=  3,-22,-17,-28,-21, -2,-24,-23, 25,-20, 13, 10,-18,-18,-17,-21,-11, -5, 23,-19, -5,-21; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F';  M=-13, -8,-20, -8, -9, 17,-21,-12, -7, -8,  4, -2,-10,-19,-15, -7,-14, -8, -6,-10,  5,-11; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='I';  M=  0,-19,-18,-23,-16, -1,-21,-17, 11,-12,  9,  5,-15,-19,-13, -5,-11, -6, 10,-17, -5,-16; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='R';  M=-15,-14,-27,-14, -3,-14,-23,  2,-13,  6,  2,  1, -9,-21,  9, 28,-15,-11,-13,-21, -5,  0;
/M: SY='A';  M= 33,-16, -2,-24,-15,-15, -6,-23,-14,-14,-13,-13,-16,-16,-14,-21,  0, -6, -6,  2,-14,-14;
/M: SY='L';  M=  5,-20,-24,-22,-12,-11,-20,-19,  2,-14,  7,  0,-18,  2,-12,-12,-12, -7, -2,-22,-13,-14;
/M: SY='N';  M=  0,  1,-19, -5, -8,-18, -1, -8,-15, -2,-19,-12, 11,-19, -6,  5,  6, -1, -9,-30,-17, -8;
/M: SY='C';  M=  0,-12, 28,-15,-15,-12,-16,-15,-16,-17,-19,-15, -7,-24,-14,-17, 13,  5, -4,-34,-11,-15;
/M: SY='N';  M= -5,  3,-26,  3,  6,-25,  6,  3,-27, -7,-27,-18, 10,  2, -1, -9,  8, -5,-26,-32,-19,  1;
/M: SY='N';  M=-11, 13,-21,  7, -1,-19,-14, -3,-22,  6,-21,-15, 18,-16,  0, 18,  6, 11,-18,-31,-14, -2;
/M: SY='R';  M=  3,  0,-18, -5, -2,-19,-10, -8,-20,  8,-21,-13,  7,-14,  0, 14, 10,  8,-13,-28,-15, -2;
/M: SY='L';  M= -5,-19,-19,-20,-13, -3,-22,-17,  7,-16, 17,  6,-15,-21,-11,-13, -8, -2,  4,-25, -6,-13;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='F';  M=-15,-16,-24,-19,-21, 24,-29,-14, 10,-21,  5,  1,-16,-25,-23,-19,-15, -8,  8, -7, 17,-22;
/M: SY='F';  M=-12,-25,-18,-30,-22, 42,-25,-18,  3,-27, 16,  3,-18,-27,-27,-18,-13, -5,  1, -7, 13,-22;
/M: SY='H';  M=-13, -7,-27, -8, -5, -3, -4, 26,-22,-12,-15, -7, -2,-19, -6, -9, -6, -9,-20,-14, 13, -7;
/M: SY='G';  M=  9,  7,-21,  3, -1,-27, 10, -7,-24, -6,-23,-15, 10,-14,  3,-10,  9, -5,-20,-28,-20,  1;
/M: SY='Q';  M=  1,  8,-23,  6,  9,-30,-11,  0,-22,  5,-23,-11,  9,-12, 22,  3,  8, -3,-21,-27,-15, 15;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M=  5, -5,-15, -6, -3,-16,  6,-10,-15,  2,-14, -8, -4,  3, -4, -4, -1, -6,-11,-13,-13, -4; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  8, -9,-11,-11,-12,-11, 13,-13, -7,-10, -8, -5, -6,-12,-12,-12,  0, -5,  0,-13,-13,-12; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='G';  M= 10, -5,-20, -7, -4,-24, 15,-16,-25, -2,-23,-15, -1,-13, -7, -8,  9,  0,-16,-25,-20, -6;
/M: SY='A';  M=  8,-17,  6,-21,-17,-11, -8,-21, -6,-20,  1, -4,-15,-23,-17,-20, -2, -3,  1,-29,-16,-17;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M=  3,-12,-22, -8, -2,-19,-10,-14,-12, -7,-17,-12,-12, 45, -7,-14, -4, -5,-15,-19,-19, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-10,-27,-25,-30,-22, 14,-26,-22, 11,-25, 14,  4,-21,-25,-20,-21,-16, -8,  3,  7,  6,-21;
/M: SY='E';  M=  1,  2,-25,  2, 17,-27,-12, -5,-22,  2,-22,-15,  3,  6, 12, -2,  5, -4,-22,-28,-19, 14;
/M: SY='R';  M=-14, -6,-29, -6,  2,-23,-20,  9,-27, 20,-23, -9, -1, -4,  6, 30, -7, -5,-21,-24, -7,  0;
/M: SY='R';  M= -1,  2,-24, -1, -4,-24,  6, -7,-27,  7,-24,-15,  9,-16, -2, 14,  2, -7,-20,-25,-18, -4;
/M: SY='D';  M= -8, 33,-27, 45, 15,-37,-10, -1,-32,  0,-25,-22, 12,-10,  8, -8,  2, -8,-25,-34,-18, 12;
/M: SY='P';  M=-15, -8,-35, -3,  5,-18,-20, -9,-24,  0,-22,-15,-10, 11,  5,  2,-11,-13,-27,  2, -9,  4;
/M: SY='R';  M=-16, -9,-32, -7,  4,-26,-20, -3,-27, 23,-23,-10, -3,  0, 14, 42, -8,-10,-23,-22,-13,  5;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-21,-23,-13, -2,-26,-14, 17,-19, 25, 14,-18,-20, -4,-14,-18, -8,  6,-17, -2, -9; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='W';  M=-11,-14,-26,-14, -8, -4,-15, -6,-17,  4,-17,-11,-10,-18, -2, 11, -8, -8,-16, 23, 12, -6; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='R';  M=-11, 11,-22, 10,  0,-21,-14, -5,-21,  5,-20,-15, 12,-17, -1, 15,  4,  2,-13,-32,-15, -2;
/M: SY='I';  M=-12,-25,-28,-34,-22, 11,-35,-21, 28,-24, 11, 12,-17,-21,-11,-21,-17,-10, 14,-14,  5,-19;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='F';  M=-12,-25,-18,-29,-23, 25,-28, -5,  9,-24, 14,  7,-21,-28,-25,-17,-17, -8, 14,-15,  9,-23;
/M: SY='H';  M= -4, -5,-20, -8, -1,-13,-20, 19,-13,-11, -4, -3, -3,-15, -2, -8, -1,  7,-11,-27, -1, -3;
/M: SY='T';  M=  0, -9,-13,-16,-15, -9,-21,-21,  4,-15, -5, -4, -6,-15,-13,-15, 12, 28, 11,-30,-10,-15;
/M: SY='R';  M=-14, -1,-31, -2,  4,-25,-18,  9,-27, 22,-26,-11,  5,  1,  6, 23, -8,-10,-24,-25,-10,  2;
/M: SY='R';  M=-15, -2,-30,  1, 22,-26,-20,  2,-28, 21,-20,-12,  0,-12, 21, 39, -5,-10,-25,-23,-13, 19;
/M: SY='P';  M=  1,-17,-27,-13, -6,-22,-16,-20,-11,-12,-21,-14,-16, 44,-12,-18,  0, -3,-11,-30,-24,-12;
/M: SY='N';  M= -9, 17,-19, 10, -1,-19,-13, -6,-20,  1,-20,-16, 19,-14, -3,  6,  9, 18,-16,-33,-14, -3;
/M: SY='F';  M=-15,-22,-23,-28,-19, 33,-28, -4,  2,-20,  3,  3,-15,-25,-15,-14,-15,-10,  0, -7, 15,-15;
/M: SY='S';  M=  1, -2,-21, -3, -3,-20, -5,-11,-19, -4,-13,-10, -1,-15,  0,  1,  4,  3,-13,-26,-15, -2;
/M: SY='E';  M=-12,  7,-30, 14, 42,-28,-20, 14,-30, 13,-22,-15,  2, -5, 17,  5, -3,-12,-28,-28,-12, 29;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-33,-24,  6,-33,-24, 30,-28, 36, 18,-27,-27,-22,-23,-24, -8, 21,-22, -2,-24;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='Q';  M= -6, -6,-20, -5, 10,-16,-17, -5, -9,  0, -1, -1, -7,-12, 11, -1, -4, -5,-12,-21, -8, 10; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
/M: SY='R';  M= -5, -1,-22,  0,  2,-20,-13, -4,-23, 18,-17,-11,  1,-13,  4, 32, -4, -7,-15,-19,-11,  1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='C';  M= 11,-18, 20,-23,-20,-10,-17,-23,  2,-16, -3, -3,-18,-22,-20,-19, -3, -2, 16,-27,-15,-20; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='W';  M=-13,-23,-27,-25,-18,  4,-23,-14,  4,-11,  4,  1,-20,-22,-12, -4,-21,-12, -2, 25, 13,-16; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='H';  M= -1, -4, -6, -6,  0,-22,-15, 13,-21,  8,-18, -6, -2,-14,  7,  3, -4, -9,-16,-22, -6,  2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='K';  M= -9, -3,-24, -1, 13,-18,-18, -7,-18, 19,-10, -6, -5,-10,  6, 16, -9, -8,-14,-19, -9,  9; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='V';  M= -3,-13,-19,-16,-11,-13,-24,-18,  5, -4, -6,  0,-10,-17, -5, -7,  1,  8, 10,-27, -9, -9;
/M: SY='Y';  M= -2, -8,-21,-13, -8, -6,-20, -3,-11, -2,-10, -6, -7,-17,  1,  3,  1, 11, -9,-10, 13, -6;
/M: SY='P';  M= -9,-21,-27,-18,-13,-13,-11,-18, -7,-12,  1, -3,-18,  5,-14, -5,-15,-10, -7,-24,-15,-15;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	7 in 7 different sequences
Number of true positive hits	7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	VLRF1
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

7 sequences

ANKZ1_BOVIN (Q58CQ5), ANKZ1_HUMAN (Q9H8Y5), ANKZ1_MOUSE (Q80UU1),

ANKZ1_RAT   (Q66H85), VMS1_CAEEL  (P34511), VMS1_SCHPO  (O74977), 
VMS1_YEAST  (Q04311)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

3 PDB

5WHG; 6R86; 6R87