PROSITE entry PS52059

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52059

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	BACT_RHOGAP
Accession [info]	PS52059
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	18-JUN-2025 CREATED; 18-JUN-2025 DATA UPDATE; 18-JUN-2025 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52059
Associated ProRule [info]	PRU01404

Name and characterization of the entry

Description [info]

Bacterial Rho GTPase-activating protein (GAP) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=132;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=127;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0361509; R2=0.0152776; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=620; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=293; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M= -3,  4,-17, 10, -3,-18,-13,-12,-11,-12,-11,-12,  0,-17, -8,-13, 10,  4, -2,-35,-15, -6;
/M: SY='S';  M=  0,-16,-12,-18,-16, 10,-16,-18, -1,-18, -9, -7, -9,-21,-18,-15, 11,  7,  9,-25, -5,-16;
/M: SY='G';  M= 15, -9,-21,-10, -8,-25, 16,-18,-23,-13,-24,-17, -4,  6,-10,-18, 11, -2,-16,-27,-25,-10;
/M: SY='A';  M= 14,  6,-19,  8,  8,-24,-11,-13,-15, -5,-14,-14, -4,-11, -5,-14,  3, -4, -6,-28,-19,  1;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-22, 17, 25,-25,-15, -7,-21, -1,-20,-17,  2, -9,  4, -7,  8, -1,-13,-34,-19, 14;
/M: SY='I';  M= -6,-22,-21,-27,-20,  8,-26,-21, 18,-24, 10,  6,-14,-21,-17,-21, -5, -2, 11,-21, -1,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 12,-32,-20, -6,-28, 43,-28, -8,  0,-10, 19, 26, -8,-10,-22,-20,-10, 16;
/M: SY='Q';  M=-12, -2,-30, -2, 16,-36,-20,  8,-22, 14,-20, -2,  0,-12, 51, 21, -2,-10,-28,-20,-10, 33;
/M: SY='M';  M=-10,-24,-26,-24,-14, -4,-24,-14,  9,-19, 19, 20,-24,  6,-11,-17,-22,-10, -1,-23, -8,-14;
/M: SY='M';  M=  6,-22,-16,-28,-19, -2,-19,-15, 14,-17, 19, 24,-22,-22,-12,-17,-14, -6, 13,-21, -6,-16;
/M: SY='L';  M=  5,-19,-19,-22,-12, -5,-21,-18,  3,-10, 20,  7,-19,-21,-12,-11,-16, -8,  2,-20, -7,-12;
/M: SY='Q';  M=-13, 16,-30, 24, 30,-38,-17,  5,-28,  7,-23,-13,  6, -8, 33,  2,  0,-10,-30,-28,-15, 32;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I';  M=  4,-10,-19,-15, -6,-14,-17,-12,  5, -2, -3,  2, -7,-10,  3, -6, -5, -6,  1,-15, -7, -3; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 38, -8,-10,-18,-10,-18, -5,-20,-10,-10,-10,-10, -8,-10,-10,-18, 12, 12,  0,-22,-18,-10;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-14,  6,-22;
/M: SY='P';  M= -8,-13,-35, -7, -1,-30, -3,-17,-27,  5,-30,-17,-11, 42, -6, -6, -8,-12,-27,-25,-24, -6;
/M: SY='G';  M= -3,-10,-23,-11, -9,-18,  7,-13,-17, -1,-11,  0, -5,-17, -6, -4, -2, -7,-12,-24,-15, -7;
/M: SY='T';  M= -6,-13,-18,-16,-13,  4,-22, -8, -1,-16,  5, -1,-11,-21,-11,-13,  0, 13, -2,-14, 13,-13;
/M: SY='M';  M=-10,-19,-23,-22,-12, -4,-25,-12,  6, -3, 20, 22,-19,-22, -7, -4,-22,-10,  2,-20, -3, -9;
/M: SY='R';  M=-10, -6,-30, -6,  0,-30,  9, -6,-31, 12,-25,-11,  0,-16, 13, 20, -4,-13,-26,-20,-17,  5;
/M: SY='G';  M= -2, -5,-24, -8, -7,-27, 23,-13,-27,-10,-22,-12,  0,-15,  3,-10,  6,  2,-22,-23,-19, -2;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='L';  M= -9,-23,-17,-26,-19, 19,-24,-17, 16,-23, 25, 11,-19,-21,-19,-17,-19, -8,  9, -9,  6,-19; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='P';  M=  4, -2,-22,  2, -2,-22,  3,-12,-19, -7,-19,-15, -5, 19, -7,-14, -1, -7,-17,-21,-19, -6; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K';  M= -8,  0,-23,  0, 10,-25,-15, -2,-20, 26,-20, -5,  0, -8, 21, 17, -5, -8,-18,-15, -8, 16; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='N';  M= 10, 13,-19,  6, 14,-23, -6, -4,-20, -1,-21,-17, 17,-10,  3, -7, 11,  0,-19,-31,-20,  8;
/M: SY='S';  M= -2,  7,-17,  1,  3,-23,-11, -4,-17, -3,-21,-12, 14,-12, 14, -3, 18, 17,-16,-32,-14,  8;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-22,-32,-22,  5,-29,-16, 26,-24, 36, 31,-25,-25,-14,-19,-25,-10, 14,-20,  0,-19;
/M: SY='D';  M=-11, 26,-21, 32,  6,-26,-15, -9,-26, -5,-21,-21, 11,-10, -5,-10,  9, 18,-16,-35,-15,  1;
/M: SY='G';  M= 18,-11,-24,-14,-13,-26, 30,-20,-25,-15,-22,-16, -7,  0,-15,-20,  2,-11,-18,-21,-26,-15;
/M: SY='E';  M=-10, 18,-27, 20, 43,-27,-14,  3,-27,  7,-23,-20, 17, -6, 14,  0,  3, -7,-30,-33,-20, 29;
/M: SY='Q';  M= -3, -6,-21, -8, -3,-21, -1, -6,-18, -2,-18, -3,  0,-14,  9,  4,  9,  4,-14,-27,-14,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=  6, -8,-24,-10, -2,-27,  2, -7,-24,  4,-19, -9, -3,-15, 11, 13,  0, -9,-19,-20,-17,  3;
/M: SY='K';  M=-11,  1,-30,  4, 22,-29,-20, -6,-30, 36,-26,-13,  0, -9, 13, 27, -7,-10,-23,-23,-13, 17;
/M: SY='B';  M=-13, 39,-25, 36, 15,-28, -6,  5,-28,  1,-29,-23, 38,-14,  3, -3,  5, -5,-30,-39,-20,  9;
/M: SY='H';  M=-20, -8,-27,-11, -8,  8,-23, 67,-22,-16,-12,  0,  2,-23, -4, -6,-13,-17,-22,-19, 23, -8;
/M: SY='Q';  M=  3, 11,-21, 12,  7,-29,-11, -5,-22, -2,-21,-14,  5,-10, 13, -6, 11,  5,-17,-29,-16, 10;
/M: SY='Q';  M= -9,  0,-26,  3, 22,-28,-16,  1,-26, 12,-22,-12,  2,-10, 23, 21,  5, -4,-23,-27,-15, 21;
/M: SY='L';  M=-12,-27,-20,-32,-22, 25,-27,-14, 15,-24, 32, 26,-25,-27,-19,-17,-25,-10,  8,-13,  7,-20;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='T';  M=  6,  0,-10, -4, -4,-16, -9,-14,-16,-10,-21,-16,  6,-10, -4,-10, 31, 33, -6,-36,-16, -4;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='N';  M= -8, 33,-20, 29,  6,-26, -3,  2,-26, -2,-30,-23, 36,-15,  0, -5, 15,  2,-25,-40,-20,  3;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P';  M=  7,-17,-31,-13, -3,-27,-14,-20,-17,-10,-24,-17,-17, 61,-10,-20, -4, -7,-21,-27,-27,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='S';  M=  8, -2,-15, -2, -5,-22, 17,-12,-25,-12,-30,-20,  8,-12, -5,-12, 30, 10,-15,-35,-22, -5;
/M: SY='L';  M= -5,-23,-18,-23,-15,  3,-23,-18, 10,-25, 30, 10,-20,-25,-15,-18,-13, -3,  5,-25, -5,-15;
/M: SY='M';  M=  1,-18,  6,-27,-20, -9,-21,-17,  8,-19,  1, 14,-14,-21,-12,-20, -5, -4,  7,-29,-11,-17;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='A';  M= 18,  6,-18, -4,  0,-25, -5, -4,-15, -2,-18,-10, 12,-13, 10, -7,  8, -2,-16,-26,-18,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-28, 15,-30,-22,  3,-30,-22,  8,-30, 33, 10,-28,-32,-22,-22,-25,-10,  5,-27, -7,-22;
/M: SY='Q';  M=  0, -6,-24, -7,  9,-31,-18,  0,-11,  3,-14,  0, -6,-13, 37,  1,  0, -7,-14,-21,-11, 23;
/M: SY='G';  M= 10, -3,-22, -7,-13,-25, 37,-15,-29,-14,-26,-18,  7,-17,-13,-16, 10, -7,-21,-26,-25,-13;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-33,-25,  5,-33,-25, 30,-28, 34, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 23,-22, -2,-25;
/M: SY='R';  M=-11, -2,-21,-10,-11,-11,-16, -3, -4,  2, -7,  8,  6,-22, -3, 14, -7, -5, -2,-27,-10, -8;
/M: SY='Q';  M= -3,  0,-27,  0,  4,-27,-19, -9,-11,  9,-15, -5, -2,-12, 13,  1, -5, -9,-12,-23,-11,  7;
/M: SY='G';  M= -8,-21,-28,-26,-25,  6, 15,-23, -5,-25, -6, -4,-11,-22,-25,-23,-11,-15, -6,-13, -7,-25;
/M: SY='C';  M= -1,-11, 14,-10, -7,-23,-13,-18,-22,-15,-28,-20, -6, 10,-10,-18, 14,  4,-16,-40,-25,-10;
/M: SY='Q';  M= -9, -1,-30,  2, 18,-32,  2, -2,-29,  5,-22,-12,  0,-11, 22,  8, -1,-12,-29,-23,-18, 19;
/M: SY='A';  M= 11,-14,-22,-18,-13,-20,  4,-17, -5,-13,-10, -3,-10,-17, -4,-16, -1, -8, -2,-21,-16, -9;
/M: SY='E';  M=-10,  2,-32,  9, 35,-30,-20, -7,-28, 17,-25,-17, -4, 14, 12,  5, -5,-10,-27,-27,-19, 22;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Q';  M=  1,  0,-20,  0, 17,-26,-12,  2,-15,  5,-14, -4, -1, -6, 29,  2,  1, -6,-18,-16,-10, 23; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -4,-21,-17,-21,-14,  1,-21,-17,  9,-24, 27,  9,-19,-24,-14,-17,-10, -1,  4,-26, -6,-14;
/M: SY='R';  M=-15,  6,-27,  1,  5,-25,-14,  5,-25, 17,-23,-10, 17,-18, 20, 36, -2, -7,-25,-26,-13, 10;
/M: SY='D';  M=  4,  9,-22, 11,  8,-23,-15,-12,-13, -6,-13,-13,  0,-10, -3,-14,  2,  1,-10,-29,-16,  2;
/M: SY='Q';  M=-13, -9,-28, -6, 11, -9,-25,  5, -9, -3, -1, -1,-11,-17, 16, -4,-11,-10,-17, -9, 14, 12;
/M: SY='A';  M= 36,-16,-10,-23,-16,-14, -8,-23,  1,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20,  4,  0, 14,-23,-17,-16;
/M: SY='T';  M= 10, -3,-13, -9, -9,-17,  1,-18,-17,-11,-18,-14,  1,-11, -9,-13, 21, 25, -7,-30,-17, -9;
/M: SY='R';  M=  7, -7,-19,-12, -9,-19,  2,-14,-21,  0,-17,-12, -2,-15, -6,  9,  5,  7,-11,-23,-16, -9;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='L';  M= -9,-22,-20,-23,-14,  1,-27,-18,  8,-15, 30, 12,-22,-24,-14,-11,-21, -3,  4,-21, -3,-14;
/M: SY='N';  M=  1, 22,-21, 13, 15,-23, -6,  2,-21,  1,-23,-18, 30,-12,  4, -4,  7, -3,-24,-33,-20, 10;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-25,-17, -8,-15,-26,-12, -1,  1, -6,  0, -6,-16,  4, 14, -4,  5, -3,-22, -7, -5;
/M: SY='P';  M= -4, -9,-29, -4,  6,-30,-14, -9,-20, -4,-27,-14, -6, 33, 12, -9,  7, -1,-24,-30,-22,  7;
/M: SY='I';  M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='G';  M=  7,-12, 11,-17,-21,-26, 32,-22,-32,-21,-24,-18, -7,-23,-21,-22, -1,-14,-19,-27,-28,-21;
/M: SY='G';  M=  8,-12,-24,-14,-20,-25, 47,-21,-27,-18,-22,-15, -5,-20,-20,-20,  0,-14,-16,-21,-26,-20;
/M: SY='I';  M= -5,-15,-28,-20,-20, -9,-30,-24, 28,-23,  8,  8,-12,-17,-16,-26,-13, -9, 17,-23, -6,-21;
/M: SY='P';  M=  4,-14,-29,-13, -3,-24,-14,-14,-20,  1,-21,-14,-12, 31, -4,  5, -4, -7,-19,-24,-22, -7;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-20,-35,-25, 47,-30,-20,  9,-30, 29,  9,-25,-30,-31,-20,-25,-10,  5, -4, 16,-25;
/M: SY='Q';  M=  1,  0,-19,  0,  9,-29, -9, -1,-20, -1,-25,-11,  5,-10, 28, -1, 21,  6,-19,-31,-15, 19;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,  2,-10, -8,-10, 24, 44, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='C';  M=  3,-20, 24,-27,-24,-10,-26,-27,  4,-21, -3, -3,-19,-26,-23,-23, -4,  3, 16,-33,-16,-24;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 22, -3,-19, -5, 13,-25, -9,-13,-19,  7,-17,-13, -5, -7,  2, -5,  3, -5,-12,-23,-18,  8;
/M: SY='A';  M= 27,-19,-10,-25,-19,-11,-14,-25,  9,-15, -1, -1,-19,-19,-19,-20,  1,  0, 23,-25,-15,-19;
/M: SY='S';  M=  3,  3,-16,  4, 15,-21, -9, -9,-21, -4,-23,-18,  5, -7,  4, -7, 25, 17,-14,-35,-18,  9;
/M: SY='Q';  M=  2, -3,-25, -4, 14,-28,-15, -2,-22, 11,-18, -9, -2,-11, 21, 17,  0, -8,-20,-22,-14, 16;
/M: SY='W';  M=-17,-26,-32,-26,-20, 11,-26,  4, -3,-19,  8,  1,-25,-29,-13,-15,-27,-17,-12, 38, 31,-17;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-15,-32,-28,  2,-32,-28, 31,-23, 19, 13,-28,-28,-27,-22,-15, -3, 39,-27, -7,-28;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D';  M= -8,  5,-16,  9, -2,-10,-15, -9, -7,-10,  4, -4, -3,-13, -8,-10, -5,  4, -5,-22, -7, -5; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -2,  7,-16, 10,  6,-21, -7, -6,-21, 11,-23,-14,  6, -8,  3,  4, 10,  2,-13,-24,-12,  4; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='S';  M=  6, -4,-16, -2,  0,-22, -4,-12,-20,-10,-30,-20,  4,  9, -2,-12, 31, 14,-14,-38,-22, -2;
/M: SY='P';  M= -5,-12,-29,-10, -8,-24,  2,-20,-22,-12,-24,-17, -9, 35,-12,-17,  1,  4,-22,-28,-24,-12;
/M: SY='E';  M=-10, -3,-25,  2, 21,-20,-22, 20,-15, -3,-13, -7, -5,-13,  5, -5, -5,-10,-10,-30, -6, 11;
/M: SY='E';  M=-12,  5,-27, 13, 18,-21,-21, -5,-14, -6,  1, -6, -5,-14,  7, -8,-10,-10,-17,-28,-12, 13;
/M: SY='L';  M=-11,-27,-21,-27,-17,  6,-29,-17, 13,-21, 40, 16,-26,-29,-16, -7,-27,-10,  6,-20, -1,-17;
/M: SY='T';  M= -8, -3,-19, -8, -3,-17,-20,-12,-19, 13,-17,-10,  0,-13, -1, 20,  6, 22, -9,-25,-10, -3;
/M: SY='Q';  M=-10,  5,-30,  9, 39,-35,-20,  5,-25, 10,-20, -9,  0, -5, 41,  5,  0,-10,-30,-25,-15, 40;
/M: SY='A';  M= 33,-16,-16,-26,-16,-14,-11,-23,  7,-16, -1, -1,-13,-13,-13,-23,  1, -3,  9,-20,-14,-16;
/M: SY='A';  M= 18,-16,-12,-23,-17, -9,-15,-19,  7,-13,  1,  9,-16,-17,-14,-17,  0,  5, 16,-24,-12,-16;
/M: SY='N';  M= -6, 13,-21, 11,  1,-23,-11, -6,-19,  9,-24,-14, 15,-15, -1,  2,  6, -1,-12,-33,-16,  0;
/M: SY='Q';  M=-10,  2,-30,  5, 27,-35,-20,  2,-25, 21,-23, -8,  0, -8, 36, 13, -3,-10,-27,-22,-12, 32;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='H';  M=-18,  0,-30,  0,  2,-22,-20, 73,-30,  5,-22, -2,  8,-18, 10,  7,-10,-18,-28,-28, 13,  2;
/M: SY='A';  M=  6,-12,-18,-16,-14,-18,  2,-18, -8,-12,-11, -5,-10,-18, -8,-14,  2,  3,  2,-25,-16,-11;
/M: SY='I';  M=  4,-26,-18,-31,-24, -1,-27,-26, 26,-23, 19, 12,-23,-23,-21,-23,-14, -5, 25,-23, -7,-24;
/M: SY='M';  M= 16,-15,-17,-24,-16,-12, -1,-11,  1,-11,  2, 22,-14,-16, -6,-15, -5, -7,  1,-20,-12,-11;
/M: SY='Q';  M= -7,  5,-27,  8,  7,-32,  1, -5,-29, 11,-28,-14,  4,-12, 14,  4,  3, -7,-24,-26,-17, 10;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-30, 12, 43,-32,-20,  1,-28, 16,-21,-14,  0, -4, 29,  7, -1,-10,-29,-26,-16, 36;
/M: SY='V';  M= -5,-28,-15,-30,-25,  3,-28,-20, 25,-20, 24, 25,-28,-28,-20,-18,-18, -5, 29,-25, -5,-22;
/M: SY='A';  M= 18, -5,-21, -9,  3,-28,-11,-10,-18, 12,-18, -8, -5,-10, 13,  1,  2, -5,-13,-20,-15,  8;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='N';  M= -5, 11,-13,  6,  4,-14, -5,  3,-12,  8,-15, -7, 17, -8,  8,  5,  1, -2,-14,-16, -8,  6; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -9,-15,-19,-11,-15, -2,-26,-19, 12,-22, 24,  8,-21,-26,-19,-18,-19, -7, 14,-27, -7,-17;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-17,-24,-17,  4,-27,-20, 12,-24, 33, 12,-22,-24,-17,-17,-16,  7,  7,-23, -3,-17;
/M: SY='R';  M=  9, -6,-19, -8,  1,-24, -9, -6,-20,  5,-20,-11,  0,-13, 11, 14, 10,  0,-14,-25,-15,  5;
/M: SY='E';  M=-13, -7,-28, -4, 15,-18,-22, 11,-16,  1, -3, -2, -6,-15, 13, 10,-11,-11,-18,-24, -6, 12;
/M: SY='A';  M= 17,-18,-15,-26,-16, -1,-13,-15,  4,-16, 11, 14,-17,-18,-12,-18, -8, -5,  4,-17, -7,-14;
/M: SY='V';  M= -4,-15,-17,-11,  3,-11,-26,-19,  8, -9, -1, -1,-19,-19,-11,-13, -6, -4, 20,-30,-14, -4;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-30,  8, 29,-30,-20, -6,-30, 35,-26,-14,  0, -6, 14, 19, -6,-10,-24,-24,-14, 21;
/M: SY='A';  M= 12,-14,-17,-20,-14,-13,-15,-20,  8,-17, -7, -3, -6,-14,-10,-20, 10,  4,  7,-28,-13,-14;
/M: SY='E';  M=-10,  8,-30, 16, 49,-30,-20, -2,-30, 19,-22,-18,  0, -2, 18,  7, -2,-10,-28,-28,-18, 33;
/M: SY='V';  M= 19,-23,-10,-26,-23, -7,-19,-26, 15,-16,  3,  3,-23,-23,-23,-20, -3,  0, 31,-26,-14,-23;
/M: SY='G';  M= 12, -6,-21, -9, -8,-26, 22,-16,-27, -2,-25,-16, -1,-14, -8, -9,  8, -5,-17,-24,-22, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	9 in 9 different sequences
Number of true positive hits	9 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Bacterial Rho-GAP
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

9 sequences

AEXT_AERSA  (Q93Q17), EXOS_PSEAE  (G3XDA1), EXOT_PSEAE  (Q9I788),

SPTP_SALPA  (Q5PEA9), SPTP_SALTI  (P74851), SPTP_SALTY  (P74873), 
YOPE_YEREN  (P31492), YOPE_YERPE  (P31493), YOPE_YERPS  (P08008)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

3 PDB

pdb_00001g4u; pdb_00001g4w; pdb_00001hy5