PROSITE entry PS52075
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52075
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | IFN_I |
| Accession [info] | PS52075 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
28-JAN-2026 CREATED;
28-JAN-2026 DATA UPDATE; 28-JAN-2026 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC52075 |
| Associated ProRule [info] | PRU01420 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Interferon (IFN) type-I family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=163; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=158; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2505548; R2=0.0139900; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=554; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=304; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='C'; M=-11,-20,104,-29,-29,-15,-30,-25,-27,-28,-18,-18,-20,-39,-28,-28,-11,-10,-10,-41,-18,-29; /M: SY='D'; M=-15, 25,-26, 32, 9,-30,-13, -1,-25, 3,-23,-17, 15,-15, 5, 3, -1, -7,-19,-34,-16, 6; /M: SY='W'; M=-15,-31,-31,-32,-23, 11,-25,-16, 4,-22, 17, 9,-31,-29,-16,-18,-31,-17, -6, 43, 20,-19; /M: SY='L'; M= -9,-22,-29,-22,-11,-11,-27,-18, 9,-19, 10, 5,-20, 8, -6,-18,-16, -9, -2,-23,-10,-11; /M: SY='Q'; M= -2, 3,-25, 3, 8,-31, -6, -3,-24, 3,-20,-10, 1,-12, 21, 4, 3, -3,-22,-24,-15, 14; /M: SY='H'; M=-13, 8,-22, 4, -4, -8,-17, 27,-21,-10,-16, -9, 11,-17, -4, -6, 2, 6,-18,-28, 2, -5; /M: SY='H'; M=-12, -9,-24, -9, -7,-10,-21, 34,-12, -6, -9, 0, -4,-21, -2, -3, -7, -9, -9,-22, 12, -7; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='S'; M= -5, -9,-19,-12, -6, -1,-16, -7, -6, -5,-11, -5, -4,-14, -1, -6, 4, 0, -6,-15, 4, -4; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='L'; M= -9,-15,-22,-15, -6,-10,-13, -8, -4, -9, 11, 5,-13,-19, 5, 0,-14,-10, -8,-17, -7, -1; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='H'; M= -7, -1,-24, 1, 4,-22, 3, 16,-25, -6,-22,-13, 4, -1, 0, -6, 2, -8,-23,-25,-11, 0; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='N'; M= -5, 15,-18, 5, -4,-17, -7, 14,-15, -7,-23,-13, 28,-19, -2, -5, 12, 2,-15,-37,-12, -4; /M: SY='R'; M= -6,-12,-24,-14, -8,-10, -9,-13,-19, 12,-16, -8, -7,-19, -6, 19, -8, -9, -9,-18, -9, -8; /M: SY='R'; M=-12, -3,-28, 0, 20,-24,-21, -4,-22, 17,-18,-10, -4,-12, 14, 24, -5, -9,-16,-25,-13, 16; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='T'; M= 11, -7, 3,-13,-11,-10,-12,-13,-11,-11,-11,-10, -6,-14,-10,-14, 10, 15, -3,-21, -6,-11; D=-13; /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='L'; M=-11,-17,-21,-17, -8, -4,-23, 4, 1,-12, 18, 11,-14,-21, -1, -1,-18,-10, -4,-19, 0, -6; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='M'; M= -7, -2,-23, -3, -4,-19, -7, -7, -7, -2,-10, 4, -3,-13, 4, -6, -3, -7, -8,-22,-10, -1; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='L'; M= -2,-27,-19,-29,-19, 6,-26,-20, 17,-27, 41, 16,-27,-27,-19,-20,-25, -9, 9,-20, -3,-19; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21, 8,-31,-20, 24,-29, 44, 22,-28,-28,-19,-21,-28,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='A'; M= 5, -6,-24, -8, -8,-19, -1,-14,-23, -1,-18,-14, -5,-16, -6, 5, -2, -4,-15, -5,-12, -8; /M: SY='Q'; M= -9, 3,-26, 6, 12,-31,-17, 0,-19, 7,-16, -5, 0,-12, 30, 4, 0, -6,-22,-25,-11, 21; /M: SY='M'; M= -9,-21,-20,-29,-20, 1,-25,-11, 20,-17, 24, 37,-20,-21, -8,-15,-18, -3, 11,-21, -1,-15; /M: SY='G'; M= -6,-10,-23,-13,-16,-15, 13,-12,-13,-11, -8, -1, -3,-22,-12, -4, -6,-10, -9,-24,-16,-14; /M: SY='G'; M= -6,-10,-24,-11,-10,-19, 12,-13,-24, -4,-15,-11, -3,-19, -7, 10, 0, -3,-16,-23,-17,-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='I'; M= -4,-11,-18,-16,-13, -9, -8,-15, 3,-11, -5, -1, -5,-13, -9, -6, 0, 2, 2,-19, -8,-13; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='F'; M= -3,-11,-11,-14,-11, 14,-13,-12, -5,-15, -2, -5, -5,-15,-13,-11, 6, 8, -2,-15, 0,-11; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='P'; M= -8,-12,-28, -6, 5,-20,-16,-10,-14, -7,-16,-12,-13, 49, -5,-13, -8, -8,-21,-23,-19, -3; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='F'; M= -4, -9,-16,-11,-12, 18,-16, -8, -4,-14, 3, -3,-10,-18,-15,-13, -8, -5, -4, -5, 11,-13; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='S'; M= 1, -1,-17, 0, -2,-16,-10, 5,-16, -6,-12, -9, 2,-14, -1, 0, 7, 0,-11,-27, -9, -3; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='C'; M=-10,-22, 86,-32,-30,-16,-32,-30,-12,-30,-11,-11,-20,-36,-28,-30,-12,-10, -1,-43,-23,-30; /M: SY='L'; M= -7,-19,-19,-18, -7, 0,-24,-16, 6,-21, 26, 7,-19,-22,-12,-15,-13, 0, 2,-25, -6, -9; /M: SY='K'; M= -9, -2,-27, -2, 8,-28,-18, -6,-26, 33,-26, -7, 0,-12, 15, 26, -3, -7,-19,-22,-11, 11; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M=-14, 23,-27, 34, 8,-25, -3, 1,-28, -3,-22,-18, 8,-13, 2, -8, -3,-10,-24,-22, -5, 4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='R'; M=-14, 0,-24, -6, -4,-15,-16, -1,-15, 13,-15, -8, 11,-18, 3, 34, -5, -7,-14,-22,-10, -4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='H'; M= -2, -8,-15,-11, -9, -8,-15, 20, -4, -9, -4, 6, -5,-15, -4, -7, -3, -1, -1,-19, 3, -8; D=-8; /I: I=-8; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; /M: SY='D'; M=-12, 28,-22, 32, 9,-25, -7, 0,-24, -1,-23,-19, 20, 0, -1, -6, 1, -5,-23,-29,-16, 4; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M=-12,-23,-16,-30,-23, 43,-24,-18, 9,-22, 9, 4,-16,-22,-27,-17,-14, -7, 9, 0, 15,-23; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='D'; M= -5, 1,-19, 4, 2,-18, 2, -8,-19, 1,-13,-10, 0,-11, -2, 1, 0, -5,-14,-21,-13, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M=-14,-23,-17,-30,-23, 50,-24,-17, 6,-23, 10, 3,-15,-22,-28,-17,-15, -8, 4, 3, 19,-23; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M= -9,-18,-35, -9, 0,-26,-18,-18,-18, -9,-26,-18,-18, 79, -9,-18, -9, -9,-26,-26,-26, -9; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='Q'; M= -9, -5,-23, -4, 9,-15,-20, 0,-12, 4, -7, -3, -6,-12, 16, 2, -5, -3,-15,-13, 3, 12; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= -2, 5,-19, 11, 32,-23,-11, -3,-23, 2,-21,-18, 3, -3, 11, -3, 14, 2,-19,-30,-18, 21; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='I'; M= -2,-16,-25,-18, 0, -9,-27,-18, 13,-16, 11, 5,-16,-16, -8,-18,-13, -8, 6,-23, -8, -6; /M: SY='F'; M=-14,-22,-21,-28,-20, 43,-25,-14, -3,-17, 5, -1,-16,-26,-25,-12,-13, -7, -3, -1, 21,-20; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='D'; M=-11, 21,-23, 26, 8,-27,-11, -3,-23, -1,-22,-17, 12, 2, 4, -6, 3, 0,-22,-29,-16, 6; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='G'; M= -2, 3,-23, 7, -6,-16, 10, -8,-20,-11,-12,-12, -2,-16,-10,-14, -4,-10,-16,-17, -6, -9; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='N'; M= 0, 4,-20, -4, -6,-18, -2, -5,-10, -6,-15, -8, 12,-14, 0, -7, 3, 0,-12,-24,-13, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='Q'; M=-10, -3,-27, -3, 13,-27,-20, 14,-11, 1,-13, 0, -1,-10, 33, 2, -4,-10,-19,-20, -5, 22; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='F'; M=-16,-25,-25,-30,-21, 36,-29, -7, 2,-25, 7, 2,-18,-12,-25,-19,-19,-11, -3, -7, 14,-23; /M: SY='Q'; M=-11, -4,-10, -5, 11,-29,-21, 14,-19, 0,-15, 3, -4,-15, 31, 0, -5,-11,-23,-26, -8, 20; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='K'; M= -7, -6, -2, -7, -2,-19,-18,-13,-16, 21,-17, -7, -6,-14, -2, 10, -8, -7, -6,-20,-10, -2; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='R'; M= 5, 2,-17, 2, 6,-18, -9, -6,-18, 5,-14,-11, 0, -9, 2, 11, 1, -3,-12,-19,-13, 2; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='E'; M=-11, 10,-28, 17, 21,-32,-16, -1,-29, 12,-25,-16, 5, -6, 18, 11, 2, -7,-25,-29,-16, 18; /M: SY='A'; M= 21, -9,-19,-15, -4,-22,-12,-15, -8, 3,-12, -5, -7,-11, 2, -6, 1, -3, -4,-20,-14, -2; /M: SY='I'; M= 0,-16,-21,-23,-19, -6,-24,-20, 21,-21, 7, 6, -8,-20,-15,-21, -6, -3, 14,-26, -8,-19; /M: SY='A'; M= 11,-17,-15,-20,-14, -9,-15,-19, 5,-18, 3, -1,-13,-15,-13,-18, 3, 2, 7,-27,-13,-14; /M: SY='V'; M= -5,-26,-13,-31,-27, 25,-28,-25, 14,-22, 7, 4,-23,-27,-31,-19,-10, 2, 26,-16, 3,-27; /M: SY='I'; M= -5,-26,-19,-29,-23, 4,-29,-24, 24,-25, 23, 12,-23,-25,-21,-21,-14, -4, 22,-24, -4,-23; /M: SY='H'; M=-18,-12,-30,-13,-10, -1,-26, 33, -9, -2, -9, 0, -7,-23, -1, 4,-15,-13,-13, -5, 33,-10; /M: SY='E'; M=-12, 11,-30, 20, 43,-31,-19, 1,-30, 11,-21,-17, 2, -5, 21, 8, -1,-10,-29,-29,-18, 32; /M: SY='M'; M= 4,-14,-16,-21,-14, -8,-16,-12, 8,-13, 2, 17,-10,-16, -6,-14, 2, 5, 7,-26, -9,-11; /M: SY='L'; M= -8,-26,-23,-30,-21, 2,-30,-22, 26,-27, 28, 17,-21,-24,-17,-22,-18, -6, 15,-22, -2,-21; /M: SY='Q'; M= -9, -4,-26, -6, 7,-24,-19, 5,-14, 8,-16, 4, -3,-13, 32, 6, -1, -6,-19,-17, -1, 19; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-27, -4, 8,-24, -9, -2,-14, -4, -6, -3, 0,-16, 20, -3, -6,-10,-21,-23,-13, 14; /M: SY='I'; M= 0,-19,-22,-29,-22, -5,-28,-23, 25,-20, 9, 15,-14,-16,-14,-22, -7, 5, 17,-22, -5,-20; /M: SY='F'; M=-13,-19,-19,-27,-18, 36,-26,-16, -2,-20, 6, 0,-14,-23,-18,-14,-10, 3, -3, -6, 12,-15; /M: SY='N'; M= -1, 5, -3, -4, -6,-20,-14, -8,-14, -2,-18,-10, 11,-19, -1, -5, 3, 3,-10,-32,-16, -3; /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24, 6,-34,-24, 31,-30, 39, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 17,-20, 0,-24; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29; /M: SY='D'; M= -9, 15,-23, 18, 12,-25,-10, -2,-28, 5,-26,-20, 14,-12, 4, 10, 10, 1,-21,-34,-17, 7; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='T'; M= -1, 0,-20, -2, -4,-19, -8, -1,-17,-10,-10, -8, -1,-15, -1,-10, 3, 7,-12,-27,-10, -3; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='D'; M=-11, 17,-25, 21, 19,-28,-13, -3,-28, 20,-24,-16, 11, -8, 7, 9, -3, -8,-23,-26,-14, 13; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='D'; M= -8, 17,-22, 20, 9,-23, 1, -2,-23, -3,-20,-12, 13,-11, 0, -7, 4, -5,-20,-29,-17, 4; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='S'; M= 12, -3,-15, -4, -3,-22, 7,-13,-22, -5,-28,-18, 5,-11, -3, -8, 26, 9,-12,-33,-20, -3; /M: SY='S'; M= 10,-10,-15,-12,-11,-16, 1,-17, -7,-15,-17,-10, -2,-15,-10,-16, 18, 7, 1,-32,-18,-11; /M: SY='A'; M= 18,-18,-14,-22,-17,-12,-16,-24, 4,-14, -5, -3,-18, -6,-18,-19, 1, 4, 16,-26,-16,-18; /M: SY='P'; M= 8, -6,-24, -9, -6,-23, -3,-16,-18,-10,-22,-16, -2, 23,-10,-16, 3, 2,-18,-28,-23,-10; /M: SY='W'; M=-17,-38,-44,-38,-30, 9,-22,-30,-13,-20,-14,-15,-38,-30,-21,-20,-36,-26,-19,123, 24,-21; /M: SY='D'; M=-13, 33,-27, 42, 13,-32, -2, -4,-33, -3,-27,-25, 18,-11, -2, -9, 3, -3,-26,-36,-20, 5; /M: SY='E'; M= 4, 7,-24, 7, 28,-27,-13, -4,-23, 8,-20,-15, 5, -7, 12, -1, 3, -6,-22,-27,-18, 20; /M: SY='T'; M= -6, 8,-21, 9, 9,-23,-17,-11,-23, 9,-21,-15, 4, -9, 1, 3, 8, 16,-14,-30,-13, 5; /M: SY='K'; M=-11, -8,-26,-11, -6,-12,-23, 0, -5, 5, 1, 3, -4,-19, -3, 2,-15,-10, -8,-23, -3, -6; /M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-29,-21, 7,-28,-22, 13,-25, 30, 11,-28,-28,-20,-19,-23, -4, 8, -2, 1,-20; /M: SY='E'; M= -3, 18,-25, 27, 32,-30,-12, -4,-29, 2,-23,-22, 6, -5, 8, -7, 6, -5,-24,-33,-20, 20; /M: SY='D'; M=-11, 14,-26, 15, 6,-27, -5, -6,-30, 14,-26,-17, 11,-13, 1, 11, 0, -2,-22,-28,-16, 3; /M: SY='F'; M=-17,-30,-21,-39,-29, 60,-31,-21, 9,-30, 17, 5,-21,-29,-35,-21,-21,-10, 5, 2, 22,-29; /M: SY='L'; M=-12,-22,-17,-23,-16, 5,-25, -7, 5,-15, 19, 13,-20,-26,-11, -6,-18, -8, 0,-13, 11,-15; /M: SY='T'; M= 2, 1,-17,-10,-11,-12,-15,-14, 0,-12,-10, -7, 9,-14, -9,-13, 10, 16, -1,-30,-12,-11; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='E'; M= -5, -4,-20, -4, 6,-15, -9,-11, -4, -7, -9, -6, -3,-14, -5,-10, -3, -6, -1,-25,-14, 0; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22, 7,-30,-20, 25,-26, 39, 24,-28,-28,-19,-20,-25, -9, 17,-21, -1,-21; /M: SY='Y'; M=-17, -8,-28, -9, -2, 9,-24, 27,-14, -8, -9, -3, -5,-21, 2, -6,-12,-12,-19, -4, 30, -2; /M: SY='Q'; M=-15, 5,-30, 9, 17,-31,-19, 13,-28, 16,-22,-10, 4,-12, 25, 20, -4,-11,-27,-25, -9, 20; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-30, 1, 22,-36,-20, 7,-23, 13,-20, -4, 0,-10, 49, 16, -1,-10,-29,-21,-11, 35; /M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-25, 5,-33,-24, 32,-28, 34, 20,-26,-26,-21,-23,-24, -9, 22,-21, -1,-24; /M: SY='N'; M=-12, 16,-23, 10, 4,-17,-12, 2,-15, 0,-12, -6, 21,-18, 1, 3, -3, -6,-19,-32,-14, 2; /M: SY='D'; M=-13, 20,-29, 26, 20,-32, -4, 11,-32, 0,-25,-18, 14,-11, 11, -4, 0,-11,-30,-32,-16, 15; /M: SY='L'; M= -3,-24,-20,-25,-14, 0,-25,-16, 11,-22, 34, 14,-24,-25, -9,-16,-21, -9, 4,-20, -4,-11; /M: SY='E'; M= -8, 5,-27, 6, 19,-28, -4, -3,-28, 10,-25,-15, 7,-10, 13, 9, 3, -7,-25,-27,-18, 15; /M: SY='A'; M= 22, -3,-12, -6, 2,-20, -5,-14,-16, -8,-19,-15, 0, -9, -3,-13, 21, 12, -7,-30,-19, 0; /M: SY='C'; M= -9,-21,106,-30,-30,-18,-30,-30,-23,-29,-17,-17,-21,-39,-30,-29,-10, -9, -3,-48,-28,-30; /M: SY='V'; M= -5,-27,-16,-29,-26, 8,-17,-24, 15,-23, 15, 9,-25,-28,-27,-20,-15, -6, 24,-21, -5,-26; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='M'; M= -5, -8,-13,-11, -3, -4,-14, -5, 9, -6, 5, 15, -8, -8, -1, -7, -7, -4, 4,-12, -2, -3; D=-8; /I: I=-8; MI=-16; MD=-16; IM=-16; DM=-16; /M: SY='Q'; M= -7, 7,-16, 11, 15,-20, -9, 3,-14, 4,-12, -6, 2, -4, 20, 2, 0, -5,-16,-14, -8, 18; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='E'; M= -5, 4,-16, 7, 24,-16, -8, -2,-16, 9,-12,-10, 0, -2, 8, 3, -1, -6,-15,-15,-10, 16; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='V'; M= -3,-10,-10, -8, -1, -4,-14,-10, 6, -7, 5, 2,-11,-11, -7, -8, -6, -3, 10,-15, -6, -4; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='G'; M= -4, -3,-17, -2, 2,-14, 10, -7,-18, 3,-14, -9, -1, -8, -2, 1, -3, -8,-14, -6,-10, 0; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='V'; M= -2, -8,-10, -7, -1, -7,-14,-10, 2, 1, -2, 0, -9,-10, -5, -3, -4, -2, 9,-15, -6, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='E'; M= -4, 6,-14, 6, 14,-13, -2, -2,-12, 0,-11, -9, 7, -5, 3, -3, 1, -3,-13,-16,-10, 8; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='E'; M= -8, 8,-16, 13, 17,-16, -6, -1,-18, 5,-12,-11, 3, -4, 5, 6, -1, -6,-15,-16,-10, 10; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='T'; M= 5, -4,-13, -8, -1, -5,-12,-13,-11, -9,-12,-10, -2,-10, -6,-10, 13, 15, -5,-23, -9, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -7,-10,-25, -9, -5,-13,-18, 2,-14, -9,-16,-10, -9, 25, -6,-12, -3, 4,-16,-18, -2, -9; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='L'; M= -4, -9,-21,-11, -6,-11,-16,-11, -7, -2, 1, -2, -6, -5, -6, 1,-11, -7, -9,-21,-10, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='M'; M= -7,-12,-19,-17,-13, -8, -5, 9, 0,-10, 1, 27, -8,-16, -1, -9, -7, -8, -3,-21, -3, -7; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='K'; M= -5, 7,-24, 3, 3,-23,-11, -5,-23, 14,-29,-16, 14, -2, 2, 6, 7, 0,-21,-29,-14, 2; /M: SY='E'; M= 0, -6,-23, -5, 14,-19,-19,-11,-15, -1, -9,-10, -8, -1, 0, -1, -2, 0,-12,-26,-16, 6; /M: SY='D'; M=-13, 26,-24, 29, 9,-25,-12, -1,-19, -3,-18,-12, 17,-15, -2, -8, -1, -6,-15,-36,-17, 3; /M: SY='S'; M= 0, -5,-16, -7, -3, -7, -9,-10,-19, -1,-23,-15, 3,-14, -4, 2, 20, 9,-11,-28,-11, -3; /M: SY='R'; M=-10,-17,-28,-19,-10,-13,-25,-16, 3, -2, -3, 0,-11, -5, -6, 4,-10, -7, -1,-23, -9,-12; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M=-10,-21,-20,-24,-17, 6,-26,-16, 15,-26, 40, 15,-18,-29,-17,-17,-25, -9, 5,-23, -3,-17; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='A'; M= 10, -5,-11, -7, 0,-12, -9, 1, -6, -6, -6, -4, -6, -9, -3, -8, 1, -2, 0,-17, -7, -2; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='L'; M= -4,-20,-10,-20,-16, 4,-20,-16, 16,-17, 21, 10,-20,-20,-16,-13,-14, -4, 19,-16, -3,-16; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M=-13, -7,-29, -8, -2,-22, -9, 7,-25, 20,-19, -1, -1,-17, 5, 28,-10,-12,-19,-21, -7, -1; /M: SY='R'; M= -7, -6,-24, -6, 2,-21,-16, -9,-21, 21,-18, -9, -1,-15, 4, 23, 0, -3,-14,-25,-11, 2; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 69,-30,-11, 0,-26, 8, 0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 14, 41,-28; /M: SY='Q'; M= -9, -5,-26, -5, 8,-17, -9, -4,-24, 6,-20,-10, -1,-14, 14, 10, 0, -7,-21,-20,-10, 11; /M: SY='R'; M=-15, -1,-26, -5, 0,-20,-17, -2,-26, 24,-21,-11, 8,-18, 6, 48, -4, -2,-19,-24,-11, 0; /M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-35,-27, 3,-35,-27, 37,-29, 29, 19,-25,-25,-21,-25,-22, -9, 26,-21, -1,-27; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='T'; M= 2, -4,-16,-10, -6,-14,-17, -3,-13, -5, -9, -7, -2,-13, -5, -6, 8, 19, -6,-28, -7, -6; /M: SY='M'; M= -3, -8,-22,-13, -8,-11,-18, 1, -5, -2, 4, 8, -5,-20, -4, -3,-12, -9, -7,-23, -5, -6; /M: SY='Y'; M=-12,-22,-22,-26,-23, 21,-30, -7, 11,-17, 5, 3,-20,-26,-19,-16,-13, 0, 11, 1, 33,-23; /M: SY='L'; M= -9,-25,-20,-24,-11, 4,-29,-19, 15,-24, 36, 14,-26,-26,-16,-18,-24, -9, 10,-23, -4,-14; /M: SY='M'; M= -9,-11, -7,-18, -9,-15,-24,-11, -4, 0, -6, 9, -9,-18, 2, 1, -7, 0, -4,-25, -9, -5; /M: SY='E'; M= -2, 3,-24, 2, 16,-26,-14, -6,-19, 11,-19,-11, 3,-11, 10, 3, -1, -7,-15,-26,-16, 13; /M: SY='K'; M= -9, -1,-27, -2, 12,-25,-20, -7,-21, 27,-20, -3, -2,-10, 13, 15, -5, -3,-17,-23,-10, 13; /M: SY='K'; M= -9, 10,-28, 8, 16,-28, -5, -4,-29, 21,-28,-16, 14,-11, 7, 10, -2, -9,-26,-27,-17, 11; /M: SY='Y'; M=-15, -9,-10, -8,-14, 9,-24, 8,-11,-11,-10, -9,-11,-26,-10,-12, -9, -6,-12, 3, 42,-15; /M: SY='S'; M= 11, -3,-12, -4, -1,-20, -2,-10,-20, -5,-26,-17, 6,-11, 0, -1, 30, 14,-10,-35,-19, -1; /M: SY='P'; M= -4, -8,-24, -6, -7,-10,-19, -5,-13,-12,-15,-11, -9, 11,-12,-15, -3, -1, -9,-26,-10,-11; /M: SY='C'; M= -4,-14, 72,-22,-19,-22,-24, -9,-27,-21,-19,-14,-13,-31,-14,-21, -7,-10,-13,-41,-21,-17; /M: SY='A'; M= 34, -8,-13,-14, -9,-21, 9,-18,-16,-11,-17,-14, -4,-11, -9,-18, 16, 2, -6,-25,-21, -9; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='E'; M= -9, 5,-28, 9, 35,-29,-20, -4,-27, 18,-21,-14, 0, -5, 19, 7, 0, -3,-24,-26,-15, 27; /M: SY='I'; M= 1,-27,-19,-32,-25, 0,-30,-27, 30,-24, 20, 13,-24,-24,-22,-24,-15, -6, 28,-23, -6,-25; /M: SY='V'; M= -3,-30,-14,-31,-28, 2,-31,-28, 30,-23, 21, 13,-29,-29,-27,-21,-16, -3, 38,-27, -7,-28; /M: SY='R'; M=-16,-10,-26,-13, -4,-16,-20, -2,-21, 20,-14, -1, -3,-19, 6, 50, -8, -3,-14,-21, -9, -2; /M: SY='K'; M= 9,-11,-19,-14, -7,-19,-16,-16,-10, 13,-13, -5,-10,-16, -5, 8, -4, -5, 2,-22,-13, -7; /M: SY='E'; M=-13, 13,-30, 23, 47,-30,-19, 0,-31, 11,-21,-20, 3, -4, 16, 7, -1,-10,-29,-30,-19, 31; /M: SY='I'; M= -6,-27,-23,-34,-28, -1,-35,-29, 38,-25, 14, 14,-20,-21,-21,-25,-13, -1, 32,-24, -4,-28; /M: SY='M'; M=-11,-18,-25,-22,-12, -6,-25,-11, 7, 0, 12, 22,-16,-20, -4, 3,-19,-10, 2,-20, -3, -9; /M: SY='R'; M=-14, -8,-26, -7, 5,-18,-19, -4,-23, 16,-13, -9, -2,-17, 7, 41, -5, -6,-17,-24,-11, 3; /M: SY='S'; M= -6, -7, -1,-11,-11, -5,-15, -2,-14,-10,-17,-11, 2,-22,-10, -4, 6, 0, -6,-30, -9,-11; /M: SY='F'; M=-14,-29,-20,-34,-24, 39,-29,-18, 11,-28, 29, 16,-24,-29,-26,-19,-24,-10, 6, -7, 13,-23; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='S'; M= -3, 5,-20, 5, 14,-19,-10, 0,-20, -2,-23,-16, 9,-11, 10, -4, 16, 4,-19,-28, -8, 12; /M: SY='F'; M=-13,-15,-26,-17, -2, 4,-26, -9, -3, -9, 2, 2,-11,-19, 3, -2,-11, -9, -8,-15, 0, 1; /M: SY='A'; M= 6,-15,-16,-17,-11, -8,-15,-17, 2,-19, 5, -1, -9,-18,-10,-17, 6, 4, 2,-28,-11,-11; /M: SY='E'; M= -8, 8,-26, 9, 16,-26,-17, -5,-21, 2,-20,-14, 5, 3, 9, -2, 3, 3,-21,-30,-17, 12; /M: SY='N'; M=-11, -5,-21,-14,-13, 3,-21,-11, 1,-13, 4, -1, 5,-22,-12, -5, -8, 0, -4,-23, -4,-13; /M: SY='L'; M=-13,-26,-21,-29,-19, 24,-29,-19, 8,-20, 29, 11,-23,-27,-21,-14,-25,-10, 3,-12, 7,-19; /M: SY='Q'; M= 0, -4,-21, -7, 2,-24,-17, 5,-15, 3,-17, -5, -2,-14, 14, 0, 4, 1,-11,-26, -8, 7; /M: SY='E'; M= 3, -4,-24, -5, 13,-16, -7, -9,-22, 3,-17,-12, -5,-11, 5, -3, -2, -9,-18,-19,-12, 10; /M: SY='H'; M=-10, -4,-24, -4, 4,-17,-14, 10,-21, 2,-18, -9, 0,-15, 8, 10, 3, 0,-18,-21, 0, 4; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -7,-21,-19,-26,-19, 3,-28,-19, 16,-23, 28, 17,-20,-23,-15,-18,-15, 5, 10,-23, -3,-18; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, -1,-16,-21, 13,-27, 24,-19, -8, -1,-20, 8, 47,-11,-11,-20,-16, 3, -1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 83 in 83 different sequences |
| Number of true positive hits | 83 in 83 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | IFN type-I |
| Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
83 sequences
IFN10_HUMAN (P01566), IFN14_HUMAN (P01570), IFN16_HUMAN (P05015), IFN17_HUMAN (P01571), IFN21_HUMAN (P01568), IFNA1_BOVIN (P07348), IFNA1_CANLF (P81255), IFNA1_CHICK (P42165), IFNA1_HORSE (P05003), IFNA1_HUMAN (P0DY56), IFNA1_MOUSE (P01572), IFNA1_PIG (P49879), IFNA1_RAT (P05011), IFNA2_HORSE (P05004), IFNA2_HUMAN (P01563), IFNA2_MOUSE (P01573), IFNA3_CANLF (O97945), IFNA3_CHICK (Q90872), IFNA3_HORSE (P05005), IFNA3_ONCMY (P0DMS7), IFNA4_HORSE (P05006), IFNA4_HUMAN (P05014), IFNA4_MOUSE (P07351), IFNA5_HUMAN (P01569), IFNA5_MOUSE (P07349), IFNA6_HUMAN (P05013), IFNA6_MOUSE (P07350), IFNA7_HUMAN (P01567), IFNA7_MOUSE (P06799), IFNA8_HUMAN (P32881), IFNA9_MOUSE (P09235), IFNAA_BOVIN (P05007), IFNAB_BOVIN (P05008), IFNAB_MOUSE (Q61716), IFNAC_BOVIN (P05009), IFNAC_MOUSE (Q80SS5), IFNAD_BOVIN (P05010), IFNAD_HUMAN (A0A087WWS6), IFNAD_MOUSE (Q80SU4), IFNAF_BOVIN (P49876), IFNAG_BOVIN (P49877), IFNAH_BOVIN (P49878), IFNA_FELCA (P35849), IFNA_MELGA (P51527), IFNB2_BOVIN (P01576), IFNB3_BOVIN (P01577), IFNB_BOVIN (P01578), IFNB_CHICK (Q90873), IFNB_FELCA (Q9N2J0), IFNB_HORSE (P05012), IFNB_HUMAN (P01574), IFNB_MACFA (O77812), IFNB_MOUSE (P01575), IFNB_RAT(P70499), IFNB_TACAC (Q6XZW6), IFNE_HUMAN (Q86WN2), IFNE_MOUSE (Q80ZF2), IFNE_PIG(A7UHZ5), IFNK_HUMAN (Q9P0W0), IFNK_MOUSE (Q7TSL0), IFNT1_BOVIN (P15696), IFNT1_SHEEP (P56828), IFNT2_BOVIN (P56830), IFNT2_SHEEP (P56829), IFNT3_BOVIN (P56831), IFNT3_SHEEP (P56832), IFNT4_SHEEP (Q28594), IFNT5_SHEEP (Q28595), IFNT6_SHEEP (Q29429), IFNT7_SHEEP (Q08071), IFNT8_SHEEP (Q08072), IFNT9_SHEEP (Q08070), IFNTA_SHEEP (Q08053), IFNTB_SHEEP (P28169), IFNT_CAPHI (P28171), IFNT_CEREL (O46633), IFNT_GIRCA (Q95187), IFNT_OVIMO (P28172), IFNW1_BOVIN (P07352), IFNW1_HORSE (P05001), IFNW1_HUMAN (P05000), IFNW2_HORSE (P05002), IFN_ANAPL (P51526)» more
|
| PDB [Detailed view] |
20 PDB
pdb_00001au1; pdb_00001b5l; pdb_00001ifa; pdb_00001itf; pdb_00001rh2; pdb_00001wu3; pdb_00002hym; pdb_00002kz1; pdb_00002lag; pdb_00002lms; pdb_00003oq3; pdb_00003s9d; pdb_00003se3; pdb_00003se4; pdb_00003ux9; pdb_00003wcy; pdb_00004ypg; pdb_00004z5r; pdb_00006jhd; pdb_00007e0e » more |