PROSITE entry PS52076

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52076

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	IFN_II
Accession [info]	PS52076
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	28-JAN-2026 CREATED; 28-JAN-2026 DATA UPDATE; 28-JAN-2026 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52075
Associated ProRule [info]	PRU01421

Name and characterization of the entry

Description [info]

Interferon (IFN) type-II family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=151;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=146;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5993304; R2=0.0093066; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=688; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=420; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -9,-10,-31, -7,  2,-25,-18,  0,-16, -8,-18,-10, -7, 31,  7,-10, -4, -8,-24,-28,-16,  2;
/M: SY='D';  M= -1,  2,-25,  4,  3,-26, -5,-12,-16, -2,-16,-10, -3,-13,  0, -8, -3, -9,-11,-26,-16,  1;
/M: SY='N';  M= -9, 15,-24, 10, 14,-23,-12, -1,-22,  2,-24,-18, 21,  1,  5,  0,  5,  2,-25,-33,-19,  9;
/M: SY='M';  M= -9,-25,-18,-30,-24, 11,-26,-12, 20,-18, 20, 30,-24,-26,-16,-15,-19, -7, 19,-17,  5,-20;
/M: SY='N';  M=-12,  9,-24,  3, -4,-11,-16, -6,-13,  5,-17,-10, 15,-18, -5,  5, -3, -3,-12,-27, -9, -5;
/M: SY='K';  M=-11, -2,-29,  0, 16,-25,-20, -6,-27, 31,-22,-11, -1,-11, 10, 29, -7, -9,-20,-23,-12, 12;
/M: SY='T';  M= -4, 10,-19,  8, 12,-22,-13, -8,-22,  3,-22,-17,  9, -9,  2, -3, 14, 15,-16,-33,-16,  7;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-27,-36,-27, -1,-36,-28, 41,-28, 19, 17,-19,-20,-19,-27,-17, -6, 25,-20, -2,-27;
/M: SY='E';  M=-12, 10,-28, 16, 32,-30,-19,  5,-24,  4,-16,-12,  1, -8, 22, -1, -2, -8,-26,-28,-14, 27;
/M: SY='N';  M= -7, 14,-22,  8,  8,-23, -9,  5,-20,  4,-25,-14, 24,-14,  8,  4,  9, -1,-22,-33,-15,  7;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M=-10, -5,-26, -6,  5,-18,-21, -8,-13, 14, -4, -2, -4,-16,  6,  8,-12, -9,-14,-23, -9,  6;
/M: SY='Q';  M=  1,  2,-24,  1, 10,-27,-11, -6,-19,  8,-19, -9,  2,-12, 14,  1,  0, -7,-16,-25,-15, 12;
/M: SY='H';  M=-20, -8,-30, -8, -8,  1,-24, 67,-18,-10,-12,  0, -2,-24,  2, -4,-14,-16,-22, -5, 45, -8;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-25,-22, 41,-30,  8,  1,-16,  5,  1,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 23, 64,-22;
/M: SY='N';  M=-11,  8,-26,  0,  0,-21,-16,  6,-17, 15,-22, -8, 17,-16,  2, 10, -4, -5,-17,-28, -8,  0;
/M: SY='I';  M=  6,-14,-20,-22,-15,-11,-22,-22, 11,-11, -2,  1, -9,-14,-11,-15,  0,  6,  9,-24, -9,-15;
/M: SY='S';  M=  0,  6,-17,  4,  2,-21, -3, -9,-22, -6,-26,-18, 12, -7, -2, -5, 21, 13,-16,-35,-19, -1;
/M: SY='N';  M= -9, 15,-24, 13, -2,-24,  5, -1,-26, -3,-22,-16, 17,-16, -5, -6,  3, -1,-22,-31,-16, -4;
/M: SY='S';  M= -5, -4,-23, -3, -3,-21,-18, -8,-11, -2,-18, -9, -3,  0, -2, -7,  4,  3, -7,-30,-13, -4;
/M: SY='D';  M=-14, 21,-30, 32, 31,-33,-18, -1,-26,  3,-21,-18,  6, -7, 15, -5, -2,-10,-25,-32,-17, 23;
/M: SY='L';  M=-11,-26,-23,-27,-20, -1,-27,-20,  8,-11, 11,  5,-23,-27,-16,  2,-20, -9, 11, -4, -2,-19;
/M: SY='F';  M= -1,-18,-20,-24,-12, 29,-20, -4, -9,-18, -3, -5,-12,-16,-20,-16, -9, -9, -7, -7, 10,-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='N';  M=-10, 28,-22, 23,  8,-23,  1,  3,-24,  2,-26,-19, 33,-14,  1, -1,  4, -5,-26,-32,-18,  4; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  5, -6,-24, -8,-16,-26, 51,-16,-32,-16,-25,-17,  3,-17,-16,-17,  2,-15,-24,-19,-26,-16; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -8,  1,-29, -1, -1,-28,  8,  2,-32, 18,-29,-13,  7,-15,  0,  9, -5,-13,-25,-23,-13, -1;
/M: SY='P';  M= -5,-15,-32, -8, -1,-27,-16,-18,-19,-10,-29,-19,-13, 64, -8,-17,  2,  0,-24,-32,-27, -8;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-16,-31,-26,  4,-31,-26, 28,-25, 26, 15,-29,-29,-25,-21,-19, -5, 33,-25, -5,-26;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-20,-39,-29, 72,-30,-20,  2,-30, 14,  2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,  1,  7, 27,-29;
/M: SY='P';  M= -4,-18,-22,-15, -9, -9,-18,-17, -3,-19,  5, -3,-15,  6,-11,-17, -3,  0, -6,-29,-14,-11;
/M: SY='R';  M= -9,  8,-25,  8,  9,-26, -8, -4,-29, 17,-27,-16, 11,-13,  5, 19,  3, -4,-22,-29,-16,  6;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='I';  M= -6,-15,-15,-18,-15, -2,-21, -4, 19,-15,  6,  8,-10,-13,-10,-13,-10, -6, 14,-15,  1,-15; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -7,-19,-15,-19,-13,  6,-17,-13,  8,-17, 24,  8,-19,-18,-12,-12,-19, -8,  2,  3,  3,-12; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='K';  M=-14, 12,-29, 16, 16,-29,-17,  8,-31, 22,-26,-15,  8,-12,  9, 18, -6,-11,-25,-28,-11, 11;
/M: SY='N';  M= -7, 13,-24,  9,  3,-22,-12,  0,-19, -3,-23,-15, 16,  0,  6, -6,  4,  1,-23,-28,-11,  3;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='W';  M=-14,-31,-28,-33,-24, 21,-25,-21,  4,-24, 18,  6,-29,-28,-21,-18,-29,-15, -4, 37, 14,-20; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='B';  M= -2, 13,-13, 11,  3,-15, -4, -2,-15,  4,-16,-11, 13, -8,  0,  0,  6,  2,-12,-21,-11,  1; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='K';  M=  0, -7,-23, -8, -3,-21,  2,-12,-19,  9,-14, -7, -5,-13,  1,  2, -5, -7,-14,-19,-13, -1; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='E';  M= -9,  9,-27, 11, 28,-28,-15, -2,-27, 17,-25,-16,  8, -8, 15, 10,  3, -6,-25,-29,-16, 21;
/M: SY='E';  M=-11,  3,-10,  8, 17,-21,-21, -8,-15, -5, -9, -5, -6,-13,  1,-10, -7, -9,-13,-32,-16,  9;
/M: SY='S';  M=  1,  0,-20,  2, 13,-24, -3, -9,-23, -5,-25,-18,  3, -3,  5, -8, 19,  9,-18,-33,-20,  9;
/M: SY='D';  M= -5, 11, -8, 15, 10,-26, -9, -9,-25, -6,-18,-13,  1,-13, -3,-12,  0, -4,-18,-32,-19,  3;
/M: SY='K';  M=-12,  4,-29,  4, 12,-29,-18,  0,-23, 23,-21, -3,  3,-12, 22, 19, -6,-10,-22,-23,-11, 17;
/M: SY='K';  M= -9, -1,-25, -5,  0,-20,-16, -5,-17, 21,-17,  0,  3,-15,  5, 19, -5, -5,-14,-25,-10,  2;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-24,-35,-27,  3,-35,-27, 37,-29, 28, 19,-25,-25,-21,-25,-22, -9, 26,-21, -1,-27;
/M: SY='L';  M=-13,-29,-23,-34,-24, 26,-30,-19, 17,-27, 28, 15,-25,-28,-23,-20,-25,-11,  8, -2, 13,-23;
/M: SY='M';  M=-10,-16,-23,-21, -8,-10,-22, -1,  8, -8, 14, 34,-16,-19, 14, -6,-16,-10, -2,-20, -3,  3;
/M: SY='S';  M=  2,  7,-18,  7, -2,-24, 11, -3,-27,-10,-29,-20, 13,-13, -3,-11, 23,  5,-19,-36,-20, -3;
/M: SY='Q';  M=  1, -9,-24,-10, -1,-25, -1,-10,-11, -8,-15, -6, -5,-14,  9,-10,  2, -7,-10,-24,-16,  4;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-21,-35,-29,  0,-34,-27, 39,-24, 16, 20,-24,-24,-22,-24,-16, -6, 36,-24, -4,-28;
/M: SY='L';  M= -7,-29,-18,-31,-24,  5,-30,-21, 26,-25, 32, 22,-28,-28,-21,-20,-22, -7, 23,-23, -3,-23;
/M: SY='D';  M= -6, 21,-22, 23, 20,-28, -8, -1,-27,  0,-27,-21, 19, -9,  8, -5, 14,  1,-24,-36,-19, 14;
/M: SY='F';  M= -4,-18,-15,-26,-21, 19,-25,-22,  6,-20,  2, -1,-13,-21,-23,-17, -1, 13, 11,-17,  2,-21;
/M: SY='Y';  M=-18,-18,-28,-19,-19, 26,-29, 16, -1,-10, -1, -1,-18,-28,-10,-10,-16, -3, -9, 23, 70,-19;
/M: SY='E';  M=-11, -7,-24, -5, 11,  2,-22,-10,-10, -9, -3, -7, -8,-15, -5, -8, -6, -7,-11,-21, -5,  4;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-26,  6,  6,-26,-17, -8,-28, 27,-26,-14,  4,-12,  6, 25, -1,  0,-18,-26,-12,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-25,-35,-25,  8,-35,-25, 33,-30, 35, 19,-25,-25,-21,-25,-25,-10, 19,-19,  1,-25;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-22,-38,-28, 52,-32,-22, 12,-30, 21,  8,-22,-28,-32,-22,-22,-10,  7, -1, 19,-28;
/M: SY='E';  M= -7,  8,-27,  9, 11,-29,  5, -6,-29,  4,-25,-16,  8,-12,  6, -2,  2, -5,-25,-27,-19,  8;
/M: SY='N';  M=-12, 11,-26,  8,  5,-25,-16, 10,-18,  4,-20, -9, 15,-16, 12,  7, -2, -8,-19,-30,-11,  7;
/M: SY='M';  M=-11,-23,-20,-31,-21, 10,-23, -6, 18,-16, 25, 46,-22,-23, -8,-13,-22,-10,  9,-17,  3,-14;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-26,-12,  0,-14,-24,-11,-10, 11,  4,  2,-12,-18,  2, 12,-17,-10, -9,-21, -7,  0;
/M: SY='D';  M=-13, 27,-28, 30, 11,-32, -2, -3,-33, 11,-30,-21, 20,-13,  1,  2,  0, -9,-27,-32,-19,  6;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='Q';  M=-11, 17,-25, 16, 13,-29,-14,  7,-24,  8,-23,-12, 15,-11, 20,  4,  2, -4,-25,-28,-12, 16; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='T';  M=  4, -9, -9,-12, -8, -4,-11,-12,  0,-12,  7,  0, -8,-12, -8,-10,  1,  8,  1,-17, -6, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='E';  M=  1, -8,-17, -6,  3,-14,  0,-11,-10, -7, -8, -7, -8,  0, -6,-10, -3, -6, -7,-18,-14, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='D';  M= -7, 18,-18, 22,  7,-21,  1, -3,-22,  0,-19,-16, 13, -9, -1, -4,  4, -2,-18,-24,-14,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-8;
/M: SY='Q';  M= -2, -1,-26,  0, 20,-31,-10, -2,-21,  3,-18, -9, -3, -9, 26, -1,  2, -6,-21,-24,-16, 23;
/M: SY='E';  M=  5,  6,-21, 10, 14,-24,-12, -9,-20, -1,-17,-16, -1,-10,  0, -5,  5, -3,-11,-30,-18,  7;
/M: SY='I';  M= -4,-20,-17,-26,-22, -3,-28,-24, 22,-20, 10, 10,-17,-20,-18,-19, -5,  8, 22,-26, -6,-21;
/M: SY='R';  M=-12, -5,-28, -5,  5,-26,-19, -4,-24, 27,-23, -8,  0,-14, 16, 34, -4, -7,-18,-22,-10,  8;
/M: SY='E';  M= -6,  8,-21,  4, 12,-22,-13, -6,-23,  9,-23,-15, 12,-11,  5,  8, 10,  9,-18,-31,-15,  8;
/M: SY='S';  M= -3,  4,-20,  4,  5,-24, -4, -4,-25,  3,-27,-16, 11,-13,  8,  8, 17,  4,-19,-32,-17,  6;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-20,-30,-21,  5,-29,-19, 23,-25, 34, 23,-25,-26,-17,-19,-22, -5, 15,-21, -1,-20;
/M: SY='B';  M= -3, 11,-23, 10, 10,-25,-11, -2,-23,  7,-22,-12, 11,-12,  8,  6,  5, -3,-20,-30,-16,  8;
/M: SY='Y';  M=-14, -7,-25, -6,-10, -1,-24, 19, -6,-10, -8, -3, -7,-22, -5,-10, -8, -5, -6,-10, 26,-10;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-22,-36,-30,  0,-36,-30, 41,-26, 17, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='M';  M=-11,-12,-26,-12,  1,-11,-24, -6, -6,  6,  4,  8,-13,-18,  5,  2,-16,-10, -9,-17,  0,  3;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='K';  M= -6,  2,-18,  2,  9,-18, -4, -6,-19, 11,-16,-10,  3, -8,  3,  8,  0, -1,-15,-18,-11,  6; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='K';  M= -8,  2,-21,  4, 15,-20,-14,  8,-21, 21,-18, -8,  1, -6,  9, 12, -5, -8,-17,-17, -5, 12; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='I';  M= -4,-20,-13,-23,-19,  1,-22,-18, 23,-16, 14, 14,-18,-18,-15,-15,-12, -4, 23,-17, -3,-18; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='Q';  M= -7,  2,-26,  3, 20,-31,-18, -2,-24, 17,-23, -9,  1, -8, 26, 10,  3, -1,-22,-25,-13, 23;
/M: SY='D';  M=-14, 14,-27, 18, 12,-21,-16,  7,-23,  7,-17, -5,  6,-13,  4,  0, -7,-10,-20,-28, -9,  7;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-28,-17, 20,-26, 41, 25,-27,-27,-16,-18,-26, -7, 11,-20,  0,-18;
/M: SY='R';  M=-15, -8,-28,-12, -2, -8,-22, -5,-16, 14,-14, -5, -1,-18,  7, 27,-10, -9,-15,-17, -4,  1;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='K';  M= -1, -5,-19, -7,  4,-19,-18,-11, -9,  6,-11, -5, -5,-10,  6,  0,  1,  5, -5,-22,-10,  5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='H';  M=-13,  3,-26,  0,  2,-22,-17, 38,-26,  7,-22, -7, 11,-16,  9, 12, -2, -6,-23,-28,  1,  3;
/M: SY='Y';  M=-18,-18,-26,-21,-14, 22,-26,  1,-11, -1, -3, -2,-12,-25,-11, 11,-17,-11,-10, -1, 23,-14;
/M: SY='F';  M=-14,-25,-23,-30,-24, 47,-28, -5,  1,-21,  9,  1,-20,-28,-25,-16,-19, -9, -3, 12, 42,-24;
/M: SY='N';  M= -5,  7,-22,  2,  0,-20, -9,  1,-18, -3,-21,-13, 17, -4,  2, -1,  9,  1,-20,-33,-16,  0;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-27,  6, 16,-28, 15, -8,-31,  1,-26,-19,  7,-11,  1, -5,  4, -9,-27,-28,-22,  9;
/M: SY='Q';  M= -3,  2,-24,  1, 11,-27,-12, -3,-23, 10,-24,-13,  7, -6, 16, 11,  6, -2,-21,-28,-16, 12;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=  0,  1,-25,  4, 14,-27,-10, -8,-23,  5,-21,-14, -2,  0,  8, -3,  3, -5,-20,-27,-18, 11;
/M: SY='K';  M= -2,  0,-25,  0, 16,-26,-15,-10,-22, 18,-20,-11, -2, -9,  8,  7, -1, -1,-16,-24,-14, 12;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-21,-21,-13, -4,-27,-19,  7, -5, 20,  9,-21,-24,-13, -5,-21, -8,  7,-22, -5,-13;
/M: SY='R';  M=-13,-20,-28,-20,-10, -6,-24,-14, -6,  3,  8,  4,-17,-23, -6, 11,-22,-12, -8, -1, -1, -8;
/M: SY='D';  M=-12, 12,-25, 14, 14,-28,-17,  3,-25,  7,-21,-13,  7,-11, 14,  7,  2,  2,-22,-29,-12, 14;
/M: SY='D';  M= -8,  7,-28, 12, 11,-21, -4,  7,-26, -2,-18,-12,  1,-13,  1, -5, -4,-11,-22,-22, -4,  5;
/M: SY='L';  M= -6,-28,-19,-32,-22, 27,-27,-20, 11,-28, 31, 11,-25,-28,-25,-20,-22, -9,  6,-11,  7,-22;
/M: SY='Q';  M=-11,  0,-29,  2, 24,-30,-20,  8,-21, 14,-18, -2, -1, -9, 32, 10, -4,-10,-25,-23,-10, 28;
/M: SY='B';  M= -8, 17,-22, 15,  4,-25,-12, -6,-24,  8,-25,-18, 16, -7,  0,  2,  7,  8,-19,-33,-16,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='W';  M= -8,-17,-32,-20,-12,-11,-16, -6,-15, -4,-16, -9,-13,-19, -4, -2,-13,-10,-16, 27,  4, -9;
/M: SY='E';  M=  2,  8,-23,  9, 12,-27,-11, -1,-25,  9,-23,-15,  6,-10,  7,  3,  4, -4,-19,-28,-15,  9;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-26,-37,-29,  9,-37,-26, 39,-27, 16, 15,-22,-23,-23,-26,-18, -8, 28,-16,  6,-29;
/M: SY='E';  M= -8,  1,-29,  5, 25,-31,-18, -4,-26, 17,-25,-13, -1,  3, 20,  8,  1, -7,-25,-26,-16, 22;
/M: SY='V';  M= -5,-18,-15,-21,-14, -1,-25,-17, 12,-13,  6, 15,-18,-21,-14,-13, -7,  4, 20,-25, -7,-14;
/M: SY='N';  M= -9, 31,-21, 29,  5,-26, -1,  0,-26, -3,-29,-22, 33,-15, -2, -6, 12,  3,-25,-38,-20,  2;
/M: SY='D';  M=-15, 43,-26, 44, 11,-31, -6,  4,-31,  3,-30,-25, 37,-14,  1, -4,  4, -6,-29,-39,-19,  6;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-28,-14, -8,-14,-11, -6,-16,-11,-10, -8,-12, 16,-10, -8, -9, -6,-17,-24,-13,-12;
/M: SY='I';  M= -7,-12,-23,-18,-11,-13,-26,-16, 10, -7, -1,  4, -8,-18, -1, -9, -6,  1,  7,-24, -7, -7;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='R';  M= -8, -6,-24, -6, -1,-22, -5, -6,-28, 15,-25,-14,  3,-16,  4, 33,  6, -2,-18,-26,-15, -1;
/M: SY='K';  M= -9, -1,-30, -1,  8,-31,-10, -9,-30, 39,-29,-10,  0,-11, 11, 23, -8,-11,-22,-20,-12,  9;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-33,-24, 14,-32,-23, 26,-30, 37, 18,-27,-28,-22,-22,-26,-10, 16,-18,  2,-24;
/M: SY='W';  M=-11, -7,-28,-14,-14,  3,-13, -6,-15,-14,-16,-13,  1,-23,-12,-12, -7, -9,-20, 25,  5,-11;
/M: SY='E';  M= -8,  8,-28, 17, 51,-29,-18, -1,-28,  8,-21,-19,  1, -2, 20, -1,  4, -7,-28,-31,-19, 36;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 24,-30,-20, 16,-30, 42, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-14,  6,-22;
/M: SY='I';  M= -9,-19,-30,-21,-11,-14,-28,-20, 10, -8, -1,  3,-15,  4, -7,-12,-13, -9,  1,-23, -9,-12;
/M: SY='R';  M=-13, -9,-31,-12, -2,-19,-21, -8,-15,  9,-17, -6, -5,-17, 12, 14, -9, -7,-17,  3, -4,  4;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-15,-31,-26,  3,-30,-25, 28,-24, 24, 16,-29,-29,-25,-20,-18, -5, 34,-25, -5,-26;
/M: SY='Y';  M=-15,-23,-25,-25,-21, 23,-28,  5,  8,-15, 11, 13,-22,-28,-13,-13,-20, -9,  2,  9, 46,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 13,-27, 16, 27,-26,-15,  9,-28,  8,-22,-17, 11,-10, 10, 10, -1, -9,-26,-30,-15, 17;
/M: SY='E';  M=-11,  4,-28, 10, 28,-22,-21, -5,-23, 12,-14,-11, -2, -9, 12,  3, -7,-10,-22,-25,-12, 20;
/M: SY='A';  M= 32,-16,-13,-23,-13,-11, -9,-20, -1,-16,  8, -1,-16,-16,-13,-20, -2, -3,  3,-20,-14,-13;
/M: SY='S';  M=  2, -7,-14, -8, -7, -9,-10, -8,-10,-12,-13, -7,  0,-15, -4,-11, 20, 15, -5,-28, -4, -6;
/M: SY='P';  M= -4,-12,-25, -8, -2,-21,-15,-14,-17, -3,-19,-13, -7, 20, -4, -3,  4,  0,-16,-30,-19, -5;
/M: SY='L';  M= -6,-20,-23,-21, -7, -3,-26,-17,  7,-12, 23,  9,-20,-22,-10, -9,-20, -9,  2,-21, -5,-10;
/M: SY='S';  M= 13, -5,-18, -6,  0,-23, -7,-14,-20,  3,-25,-15,  0,  2, -1, -5, 16,  5,-12,-30,-19, -1;
/M: SY='N';  M= -9, 22,-22, 15,  5,-21, -9,  0,-20,  4,-21,-15, 28,-16,  1,  0,  4, -2,-22,-34,-16,  3;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='M';  M= -5, -5,-14, -7, -1, -6,-13, -6,  1,  1,  1,  4, -3, -9, -2, -1, -7, -5, -2,-12, -4, -2; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='M';  M= -6, -3,-15, -6, -2,-10,-13, -5, -4,  2,  1,  3, -2,-12,  3,  1, -6, -2, -7,-16, -5,  1; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='M';  M=-10,-13,-24,-15, -3,-11,-24,-10, -3,  4,  5, 10,-12,-18,  1,  6,-14, -6, -5,-21, -6, -2;
/M: SY='R';  M=-14,  7,-29,  7,  8,-27,-10,  0,-29, 18,-24,-13, 10,-15, 13, 29, -4, -9,-25,-25,-14,  9;
/M: SY='R';  M=-13,  1,-29, -1,  6,-26,-18, -4,-29, 38,-27,-11,  6,-14,  9, 40, -8, -9,-21,-22,-11,  6;
/M: SY='R';  M=-19, -7,-30, -6,  8,-21,-20,  0,-30, 27,-20,-11,  0,-17, 11, 61, -9,-10,-21,-21,-11,  5;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 57,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 33,-22,-10,  0,-18, 10, 63,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='R';  M=-10, -7,-23, -7,  0,-20,-13, -3,-27, 17,-23,-13,  3,-17,  7, 43,  7,  0,-17,-27,-13,  0;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  6,-26,-20,  3,-27, 24,-20, -7,  0,-17, 25, 52, -7,-10,-23,-20,-10, 12;
/M: SY='Q';  M= -5, -4,-23, -8,  3,-24,-18, -1,-12,  4,-13,  1, -1,-15, 23,  8,  0, -1,-12,-24,-11, 12;
/M: SY='A';  M= 10, -7,-18,-14, -7,-14,-14,-11, -6, -8,  0,  0, -5,-16,  0, -6, -1,  2, -6,-23,-12, -4;
/M: SY='R';  M=-11, -7,-22,-12, -5,  4,-19, -8,-17,  4,-14, -8,  0,-18, -1, 11, -1,  1,-13,-17, -1, -3;
/M: SY='R';  M=-11, -5,-29, -6,  3,-25,-17, -3,-26, 21,-22,-11,  2, -6, 12, 38, -6, -9,-21,-22,-13,  4;
/M: SY='G';  M=  1,-17,-19,-20,-18,-10,  6,-18, -4,-18,  2,  5,-13,-21,-15,-17, -5, -4,  1,-24,-14,-17;
/M: SY='R';  M=-12, -4,-29, -4,  6,-26,-19, -5,-29, 36,-26,-10,  1,-14, 12, 41, -6, -8,-20,-21,-11,  7;
/M: SY='R';  M= -5, -5,-20, -8, -6,-16, -9,-10,-15, -1,-15,-10,  4,-17, -3, 11,  8,  6,-10,-29,-14, -6;
/M: SY='A';  M=  6, -8,-23,-10, -1,-21,-14,  3,-18,  5,-14, -7, -5, -8,  3,  6, -2, -7,-14,-23,-10, -1;
/M: SY='S';  M=  3, -9,-20,-11, -6,-18, -8,-15, -9, -9,-14, -8, -3, -7, -3,-11, 11,  5, -7,-29,-15, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2026_01 which contains 574'627 sequence entries.

Total number of hits	49 in 49 different sequences
Number of true positive hits	49 in 49 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

49 sequences

IFNG1_CARAU (B5B3U4), IFNG1_ORYLA (H2N2P1), IFNGR_CARAU (C8AW45),

IFNG_AILME  (Q4ZH68), IFNG_ANAPL  (Q9YGB9), IFNG_BOSIN  (Q866Y6), 
IFNG_BOVIN  (P07353), IFNG_BUBBU  (Q8SPW9), IFNG_BUBCA  (Q2PE75), 
IFNG_CALJA  (P28341), IFNG_CAMBA  (Q865W6), IFNG_CANLF  (P42161), 
IFNG_CAPHI  (P79154), IFNG_CERAT  (P42162), IFNG_CEREL  (P28333), 
IFNG_CHICK  (P49708), IFNG_COTJA  (O57571), IFNG_DASNO  (Q1WM28), 
IFNG_EQUAS  (O77763), IFNG_FELCA  (P46402), IFNG_HORSE  (P42160), 
IFNG_HUMAN  (P01579), IFNG_LAMGL  (Q865X1), IFNG_MACFA  (P63309), 
IFNG_MACMU  (P63310), IFNG_MACNE  (P63311), IFNG_MACTH  (Q5I6S9), 
IFNG_MARMO  (O35735), IFNG_MELGA  (O57603), IFNG_MERUN  (Q62574), 
IFNG_MESAU  (O35497), IFNG_MOSBE  (Q647G2), IFNG_MOUSE  (P01580), 
IFNG_MUSPF  (A4PIZ9), IFNG_NUMME  (O73915), IFNG_PANTR  (Q9TTB0), 
IFNG_PAPAN  (Q865Y4), IFNG_PAROL  (B3IXK1), IFNG_PERMA  (Q7TSP4), 
IFNG_PHACO  (O57608), IFNG_PHOSU  (Q5CCK0), IFNG_PIG(P17803), 
IFNG_RABIT  (P30123), IFNG_RAT(P01581), IFNG_SAISC  (Q8MKF5), 
IFNG_SHEEP  (P17773), IFNG_SIGHI  (Q9QXX2), IFNG_TURTR  (Q9TV67), 
IFNG_VULVU  (Q25BC0)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

12 PDB

pdb_00001d9c; pdb_00001d9g; pdb_00001eku; pdb_00001fg9; pdb_00001fyh; pdb_00001hig; pdb_00001rfb; pdb_00002rig; pdb_00003bes; pdb_00006e3k; pdb_00006e3l; pdb_00006f1e