PROSITE entry PS52077

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS52077

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	IFN_III
Accession [info]	PS52077
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	28-JAN-2026 CREATED; 28-JAN-2026 DATA UPDATE; 28-JAN-2026 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC52075
Associated ProRule [info]	PRU01422

Name and characterization of the entry

Description [info]

Interferon (IFN) type-III family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=162;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=157;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9307351; R2=0.0127869; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=671; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=358; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10,  0,-14, 10, 47,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='G';  M= -7,  5,-26,  9, -2,-27, 14, -8,-33, -1,-27,-19,  6,-16, -4,  8,  6, -6,-23,-29,-21, -4;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H';  M=-11, -8,-23, -8, -5,-12,-18, 44,-15,-15, -4,  1,  0,-20,  0, -7, -4, -8,-15,-30,  6, -5;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/M: SY='A';  M= 24, -5,-13, -9, -6,-21,  9,-15,-19,-11,-22,-16,  1,-11, -6,-15, 23,  7, -9,-30,-21, -6;
/M: SY='Q';  M=-14, -1,-30, -1, 10,-30,-20, 27,-26, 16,-22, -4,  3,-14, 29, 20, -6,-13,-26,-23, -2, 18;
/M: SY='F';  M=-20,-25,-25,-30,-25, 56,-30, -1,  0,-20,  5,  0,-20,-30,-26,-15,-20,-10, -5, 20, 54,-25;
/M: SY='K';  M=-13, -3,-30, -3, 10,-30,-20, -3,-28, 36,-25, -8,  0,-13, 21, 36, -8,-10,-22,-20,-10, 14;
/M: SY='S';  M=  3, -7,-12, -9, -7,  2, -7,-12,-16,-14,-21,-16,  3,-14, -9,-12, 27, 13, -8,-29, -9, -7;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-24,-26,-16,  1,-28,-20, 11,-26, 32, 11,-28, -3,-18,-20,-26,-10,  1,-22, -7,-18;
/M: SY='S';  M= 14,  0,-15,  1, 13,-23, -5,-10,-20, -5,-23,-18,  3, -7,  3,-10, 23,  8,-13,-33,-20,  8;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R';  M=-13,-10,-28,-10,  3,-20,-22, -4,-16, 16, -6, -1, -7,-18, 16, 26,-12,-10,-16,-20, -8,  8;
/M: SY='E';  M= -7,  7,-25, 12, 42,-25,-20, -5,-25,  5,-17,-17,  0, -3, 12, -3,  5,  6,-22,-30,-17, 27;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M= 13, -4,-22, -8,  6,-30,-12, -6,-18, 11,-18, -6, -4,-10, 21,  3,  2, -6,-16,-20,-14, 14;
/M: SY='A';  M= 45, -9,-10,-17, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 14,  3, -1,-23,-20, -9;
/M: SY='F';  M=  3,-25,-15,-33,-25, 36,-22,-22,  4,-23,  5,  0,-20,-25,-30,-20,-10, -5, 11, -7,  8,-25;
/M: SY='K';  M=-12, -9,-34, -9,  1,-21,-20,-14,-28, 34,-28,-12, -9,-14,  3, 19,-17,-14,-22, 18, -1,  3;
/M: SY='R';  M=  1, -7,-25, -9,  1,-23,-15, -9,-25, 26,-21,-10, -3,-14,  5, 33, -5, -7,-15,-20,-13,  1;
/M: SY='A';  M= 21,-17,-15,-25,-15, -8,-12,-16,  4,-15, 12, 13,-17,-17,-10,-18, -7, -5,  5,-20,-10,-13;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 42,-26,-10,  0,-14, 10, 46,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='D';  M=-15, 34,-30, 49, 24,-37, -2, -3,-38,  0,-28,-27, 13, -9,  2, -9,  0,-11,-30,-35,-21, 13;
/M: SY='A';  M= 18, -8,-20,-13, -1,-24,-10, -8,-17,  5,-15, -8, -5,-13, 11, 10,  3, -5,-12,-20,-15,  4;
/M: SY='F';  M=-15,-27,-25,-32,-24, 29,-32,-12, 17,-25, 22, 10,-23,-28,-22,-19,-23,-10,  7,  0, 27,-24;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='E';  M=-12, 17,-30, 27, 41,-32,-18, -2,-32, 16,-24,-20,  4, -4, 13,  4, -2,-10,-28,-30,-18, 27;
/M: SY='E';  M= -6, -6,-24, -6,  9,-18,-18,-10, -9, -1,-14, -9, -1,-12,  3,  5,  6, -1, -8,-29,-13,  4;
/M: SY='L';  M=  6,-23,-17,-27,-17,  0,-20,-16, 12,-20, 28, 21,-23,-23,-13,-18,-17, -7,  7,-20, -5,-15;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-21,-26,-16,  5,-29,-19, 13,-19, 39, 16,-26,-27,-16,-13,-27,-10,  6,-20, -1,-16;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L';  M=-10,-14,-25,-12,  7,-11,-25, -8, -1,-11, 17,  7,-16,-19,  9, -8,-16,-10, -9,-22, -7,  8;
/M: SY='K';  M=-10, -3,-26, -5,  3,-23,-20,-10,-26, 31,-23,-10,  0,-13,  6, 31, -3,  3,-16,-22,-10,  3;
/M: SY='N';  M=-14, 44,-24, 39,  8,-28, -4,  6,-28,  0,-30,-24, 45,-16,  0, -4,  6, -4,-30,-40,-20,  4;
/M: SY='C';  M=-14,-21, 35,-27,-21,-11,-25,-19,-18,-13, -9, -4,-19,-31,-15, -3,-17,-13,-11,-11,-11,-19;
/M: SY='R';  M= -5, -3,-22, -3,  3,-23,-12, -7,-26, 21,-27,-14,  4,-13,  6, 25, 10,  2,-16,-28,-14,  3;
/M: SY='C';  M=-13,-23, 84,-33,-30,  6,-30,-27,-22,-30,-12,-15,-20,-37,-33,-27,-13,-10, -7,-34,-14,-30;
/M: SY='R';  M= -8,  5,-21,  1,  0,-20, -9,  5,-24,  7,-26,-15, 18,-17,  4, 23, 11,  2,-19,-32,-14,  0;
/M: SY='S';  M=  3, -5,-18, -5, -2,-20,-10,-15,-18,-10,-26,-18,  0, 16, -5,-13, 23, 19,-13,-35,-20, -5;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-31, -8,  0,-21,-20, 18,-29, 16,-21, -9, -1, -5,  7, 44,-10,-12,-23,-23, -6, -1;
/M: SY='L';  M=-11,-25,-21,-25,-16,  1,-27,-16,  8,-13, 27, 11,-22,-27,-14,  3,-22, -9,  8,-21, -4,-16;
/M: SY='F';  M=-19, -9,-24,-12,-17, 39,-26,-16, -4,-22,  1, -5,-10,-24,-27,-19,-15,-10, -4, -7, 13,-20;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P';  M=-10,-13,-34, -7,  0,-27,-17,  8,-22,-10,-28,-16,-10, 53, -4,-14, -4, -8,-27,-31,-18, -7;
/M: SY='R';  M=-17,-10,-30,-10, -3,-21, -8, -3,-31, 23,-21,-11,  0,-20,  6, 58, -9,-11,-21,-20,-13, -3;
/M: SY='P';  M=  4, -2,-24, -6, -2,-23,-13,-14,-18,  5,-22,-14,  1, 15, -4, -4,  2,  4,-16,-27,-19, -4;
/M: SY='W';  M=-12,-30,-40,-30,-22,  2,-15,-25,-20,-17,-23,-20,-27,-25,-15,-17,-19,-17,-25,101, 17,-15;
/M: SY='D';  M=-12, 37,-25, 52, 15,-35, -7, -3,-35, -3,-30,-27, 17,-10,  0,-10, 10, -2,-25,-40,-20,  7;
/M: SY='L';  M=-10,-27, 14,-32,-25,  0,-32,-25, 14,-30, 25, 10,-25,-30,-23,-25,-23,-10,  9,-28, -8,-25;
/M: SY='R';  M= 16, -8,-20,-13, -3,-22,-10,-12,-20, 15,-17,-10, -5,-13,  0, 18,  0, -5,-10,-20,-15, -3;
/M: SY='Q';  M=-13, -4,-29, -2, 19,-26,-21,  1,-20, 10,-11, -4, -4,-13, 28, 19, -7,-10,-22,-22,-11, 22;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M= -8, -3,-26, -3, 10,-30,-16,  3,-23, 11,-22, -7,  2,-13, 34, 21,  6, -3,-23,-24,-12, 21;
/M: SY='V';  M= -5,-22,-15,-22,-22, -5,-27,  4, 14,-17,  2,  7,-20,-27,-20,-15,-10, -5, 29,-30, -2,-22;
/M: SY='R';  M=-11,-15,-27,-13, -4,-21,-23,-10,-10,  4,-14, -5,-12,  4,  6, 14, -8, -7, -6,-25,-14, -2;
/M: SY='E';  M=  3, 14,-25, 21, 33,-30,-13, -5,-27,  3,-20,-20,  2, -5,  8, -7,  3, -7,-22,-30,-20, 20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M= -7,-20,-35,-17,-12,-23, -1,-22, -9,-17,-19,-11,-15, 37,-15,-22,-10,-13,-17,-25,-23,-17;
/M: SY='V';  M= -5,-16,-20,-22,-17, -8,-28,-22, 13, -5,  0,  7,-14,-18,-13, -9, -6,  6, 16,-25, -7,-16;
/M: SY='A';  M= 37,-14,-12,-22,-12,-13, -7,-20, -3,-14,  3, -3,-14,-14,-12,-20,  1, -2,  2,-20,-16,-12;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='L';  M= -5,-22,-13,-22,-17,  5,-22,-17, 17,-20, 28, 13,-22,-22,-17,-15,-18, -5, 16,-17, -2,-17; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='E';  M= -7,  5,-22, 11, 36,-24,-15,  2,-20,  7,-15,-11,  0, -2, 23,  2,  0, -7,-22,-20,-13, 30; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='A';  M= 37, -7, -7,-15, -7,-15,  0,-15, -7, -7, -7, -7, -7, -7, -7,-15,  7,  0,  0,-15,-15, -7; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='E';  M=-13, 20,-30, 33, 50,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  5, -3, 15, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 32;
/M: SY='L';  M=  8,-25,-15,-27,-19,  0,-22,-22, 14,-23, 26, 10,-25,-25,-19,-20,-16, -5, 16,-22, -7,-19;
/M: SY='A';  M= 19,  6,-20,  5,  4,-30, -7, -8,-19, -3,-17,-12, -1,-10, 10,-10,  5, -5,-14,-24,-17,  7;
/M: SY='L';  M=  6,-25,-17,-27,-17,  2,-22,-20, 12,-25, 34, 12,-25,-25,-17,-20,-20, -7,  7,-20, -5,-17;
/M: SY='T';  M=  0, -8,-10,-15,-15, -7,-23,-23,  0,-13, -5, -5, -8,-15,-15,-13, 12, 37, 13,-30,-10,-15;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='K';  M= -3,  0,-20, -2,  3,-23,-15,-12,-23, 21,-26,-13,  3,-10,  3, 11, 10, 11,-13,-27,-13,  3;
/M: SY='V';  M=  0,-25,-15,-25,-27, -8, -4,-27, 12,-20,  0,  2,-22,-27,-27,-20, -7, -5, 29,-27,-15,-27;
/M: SY='L';  M=-12,-32,-26,-32,-22, 10,-28,-22, 12,-28, 35, 12,-32,-30,-20,-20,-32,-14,  2, 15,  6,-20;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='E';  M=-11,  7,-23, 13, 29,-21,-15, 26,-24,  2,-16,-11,  4, -6, 12, -1, -3,-10,-23,-24, -5, 19; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='R';  M=  8,  3,-15, -5, -3,-16, -5, -4,-15,  5,-14,-10,  9,-12, -1, 12,  3, -3,-11,-20,-13, -3; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='T';  M=  7, -7,-13,-14,-11,-12,-15,-17, -3,-13, -9, -3, -3,-12, -8,-14, 16, 23,  2,-29,-12,-10;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='N';  M= 12, 11,-11,  0, -4,-14, -2, -4,-11, -4,-14,-11, 18,-11, -4, -7,  8,  4,-10,-23,-14, -4; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-13, 16,-32, 29, 21,-34, -4, -7,-33, -2,-27,-24,  3, 14,  0,-11, -2,-11,-30,-33,-24,  9;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='T';  M= -3, -8, -9,-12, -9, -1,-16,-13,  1,-12,  9,  1, -8,-12, -9, -9,  0, 18,  3,-17, -4, -9; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='T';  M= -6,  1,-13,  2, -4, -7,-14,-10, -4,-10,  5, -2, -4,-12, -7, -9, -3,  7, -3,-19, -6, -6; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -6,-11,-32, -6,  4,-30,-16,-11,-20, -6,-28,-16, -9, 47,  8,-11,  3, -4,-26,-30,-23,  3;
/M: SY='A';  M= 21,-10,-20,-15,-10,-23, 14,-16,-22, -4,-17,-13, -5,-15, -8,  0,  3, -7,-12,-20,-20,-10;
/M: SY='L';  M=  6,-25,-17,-27,-17,  2,-22,-20, 12,-25, 34, 12,-25,-25,-17,-20,-20, -7,  7,-20, -5,-17;
/M: SY='G';  M= 14, -7,-20,-10, -6,-22, 19,-18,-21,-12,-17,-14, -5,-14,-11,-16,  5, -2,-12,-23,-22, -8;
/M: SY='D';  M=-11, 13,-28, 21, 18,-29,-17, -9,-26, -2,-24,-21,  1, 18,  0,-10,  2,  2,-24,-33,-21,  7;
/M: SY='I';  M= -5,-23,-19,-30,-26, -2,-32,-28, 30,-22, 10, 10,-19,-21,-21,-22, -8,  7, 29,-25, -5,-26;
/M: SY='L';  M=-10,-28, 11,-30,-22,  3,-30,-22,  9,-30, 34, 11,-28,-32,-22,-22,-26,-10,  6,-27, -7,-22;
/M: SY='D';  M=-11, 16,-30, 25, 22,-35,  2, -2,-33,  1,-25,-19,  6, -9, 14, -5,  0,-12,-30,-29,-20, 18;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Q';  M= -7,  0,-22,  0, 15,-30,-15,  7,-15,  7,-15,  0,  0, -7, 44,  7,  0, -7,-22,-15, -7, 30; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-30, -7,  0,-22,-15,-15,-15, -7,-22,-15,-15, 67, -7,-15, -7, -7,-22,-22,-22, -7; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-15,-22,-15,  7,-22,-15, 15,-22, 37, 15,-22,-22,-15,-15,-22, -7,  7,-15,  0,-15; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='H';  M=  1, -2,-18, -4, -2,-15,-10, 47,-18, -7,-13, -2,  3,-13,  3, -4, -3,-10,-16,-20,  6, -2; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -7,-14,-15,-22,-17, 15,-25,-20,  0,-20, 10,  0,-12,-20,-19,-15, -2, 21,  3,-18,  2,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='H';  M=  9, -3,-16, -7, -5,-18,-11, 19,-18,-10,-17, -9,  3,-13, -2, -9, 12,  9,-11,-29, -5, -5;
/M: SY='H';  M=  0, -3,-25, -5,  2,-24,-15, 49,-23, -6,-17, -3,  3,-15, 16, -3, -3,-13,-22,-25,  3,  6;
/M: SY='I';  M=  8,-25,-20,-33,-25, -5,-27,-27, 30,-23, 10, 10,-20,-20,-20,-25,-10, -5, 27,-22, -7,-25;
/M: SY='H';  M= -9,-12,-27,-12, -7,-18,  0, 12,-15,-14, -1,  1, -7,-21,  4, -9,-11,-15,-18,-22, -6, -2;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-20,  2, 13,-22,-10, -5,-25,  5,-25,-17,  5,-10,  7, 13, 18,  6,-17,-33,-17,  9;
/M: SY='D';  M=-15, 24,-30, 34, 20,-40,-15,  5,-30,  5,-25,-14, 10,-10, 31,  0,  0,-10,-30,-30,-15, 26;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-17,-31,-23, 12,-30,-23, 21,-27, 37, 16,-29,-30,-24,-20,-24, -7, 20,-21, -1,-23;
/M: SY='R';  M=  1, -7,-25, -9,  4,-27,-15, -2,-21, 13,-17, -7, -3,-14, 22, 26, -1, -7,-18,-20,-13, 11;
/M: SY='A';  M= 24,  6,-14,  2, -3,-22, -6,-16,-17, -8,-14,-14, -1,-10, -8,-16, 10,  8, -7,-27,-18, -6;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M= -8,-24,-21,-29,-21,  3,-31,-23, 23,-26, 28, 14,-21,-23,-18,-21,-17,  2, 14,-22, -2,-21;
/M: SY='Q';  M=  3,  0,-26,  1, 24,-33,-16,  1,-20,  6,-18, -7, -2, -7, 34,  1,  2, -8,-23,-23,-15, 29;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='P';  M= -7,-19,-21,-16, -9, -5,-19,-15,  2,-16, 12,  2,-19, 15,-12,-15,-16, -7, -5,-18, -9,-12; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Q';  M= -7,  2,-22,  4, 24,-27,-15,  5,-17,  7,-15, -4,  0, -5, 36,  5,  0, -7,-22,-17,-10, 30; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='P';  M=  5,-13,-23, -9, -2,-20,-11,-15,-13, -7,-18,-13,-13, 46, -7,-15, -3, -5,-16,-20,-20, -7; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='T';  M=  0, -8,-13,-13,-10, -7,-18,-18, -4,-15,  1, -4, -6,-15,-10,-13, 12, 28,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='A';  M= 34, -8,-14,-16, -8,-20, -4,  7,-14,-10,-12, -8, -6,-12, -6,-16,  6, -4, -7,-22,-11, -8;
/M: SY='Q';  M= -9, -4,-30, -2, 11,-30,  8, -4,-31,  6,-23,-13,  0,-14, 14, 14, -3,-13,-27,-22,-18, 11;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='R';  M= -9, -7,-23, -7, -4,-19,  8, -6,-26, 13,-19,-10,  0,-14,  0, 26, -5,-10,-18,-16,-13, -4; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -1, -7,-18, -5, -2,-17,-10,-13,-14, -8,-20,-14, -4, 26, -5,-11, 10, 11,-13,-26,-17, -5; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='S';  M=  1, -3,-16, -3,  0,-20, -6, -7,-23,  2,-27,-17,  7,-13,  3, 15, 25, 11,-13,-34,-17,  0;
/M: SY='G';  M= -9,-10,-30,-10,-11,-25, 28,-11,-35,  3,-25,-15,  0,-20, -6, 22, -5,-15,-25,-20,-21,-11;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 40, 17,-30,-30,-23,-20,-25, -7, 20,-23, -3,-23;
/M: SY='H';  M=-11, -7,-28, -5,  0,-23,-16, 24,-25, -1,-25,-12,  0, 10,  3,  8,  0, -7,-24,-30, -8, -3;
/M: SY='H';  M=-15, -5,-30, -5, -5,-23,  3, 43,-33, -2,-23, -8,  5,-20,  2, 13, -7,-17,-27,-25, -1, -5;
/M: SY='W';  M= -2,-32,-40,-35,-25,  2,-15,-27,-17,-17,-17,-17,-32,-25,-17,-20,-27,-22,-22,106, 17,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-22,-23,-22,-10, -3,-27,-12, 10,-20, 32, 15,-22,-25,  1,-12,-22,-10,  0,-20, -3, -4;
/M: SY='H';  M=-15, -1,-30, -1,  6,-24,-21, 46,-26, 10,-21, -3,  3,-16, 20,  9, -8,-15,-26,-21,  9, 10;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10,  0,-18, 10, 61,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='L';  M=-13,-25,-23,-25,-15,  2,-27,-15,  7,-14, 32, 12,-22,-27,-12,  3,-25,-10,  2,-20, -3,-15;
/M: SY='Q';  M=-13,  0,-30,  0, 13,-33,-20, 29,-25, 14,-22, -2,  3,-13, 36, 12, -5,-13,-28,-23, -2, 23;
/M: SY='E';  M= -8,  5,-26,  8, 31,-26,-20, -7,-26, 16,-20,-15,  0, -5, 11,  6,  2,  3,-21,-27,-15, 21;
/M: SY='A';  M= 34,-13,-18,-17, -7,-23, -5,-20,-13,-10,-15,-13,-13, 16,-10,-20,  5, -3, -8,-23,-23,-10;
/M: SY='R';  M=-13, -9,-33, -6,  6,-29,-20, -6,-25, 18,-25,-11, -6, 18, 14, 21, -8,-10,-25,-23,-16,  7;
/M: SY='K';  M= -8, -3,-26, -3,  5,-25,-16, -7,-28, 32,-27,-12,  2,-13,  8, 32,  0, -4,-18,-24,-12,  5;
/M: SY='K';  M=  6, -3,-25, -5,  5,-27,-15,-13,-25, 34,-25,-10, -3,-10,  5, 17, -5, -7,-15,-20,-13,  5;
/M: SY='E';  M=-13, 20,-30, 33, 50,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  5, -3, 15, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 32;
/M: SY='T';  M=  6,  0,-10, -4, -4,-16, -9,-14,-16,-10,-21,-16,  6,-10, -4,-10, 31, 33, -6,-36,-16, -4;
/M: SY='P';  M= 11,-16,-29,-14, -4,-26,-13,-20,-16,-10,-23,-16,-16, 54,-10,-20, -3, -6,-19,-26,-26,-10;
/M: SY='G';  M= -5,-10,-30,-10,-15,-27, 47,-15,-37, -7,-27,-17,  0,-20,-12,  3, -3,-17,-27,-20,-25,-15;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M=-13,-25,-23,-25,-15,  2,-27,-15,  7,-14, 32, 12,-22,-27,-12,  3,-25,-10,  2,-20, -3,-15;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-30, 15, 47,-30,-20, -3,-30, 20,-23,-17,  0, -3, 17,  8, -3,-10,-27,-27,-17, 32;
/M: SY='A';  M= 41, -2,-13, -9, -6,-23, -1,-17,-14, -9,-13,-13, -6,-10, -9,-19,  9, -1, -4,-23,-20, -7;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M= 11,-26,-10,-28,-26, -4,-23,-28, 21,-18,  6,  6,-26,-26,-26,-20, -6,  0, 39,-28,-12,-26;
/M: SY='T';  M= -2,-14,-14,-22,-20, -5,-27,-25, 14,-17,  2,  2,-12,-17,-17,-17,  3, 24, 20,-28, -8,-20;
/M: SY='F';  M=-12,-24,-18,-29,-22, 43,-24,-18,  0,-26, 11,  0,-16,-26,-27,-18,-10, -4,  0, -7, 13,-22;
/M: SY='N';  M=-12, 31,-22, 16,  0,-20, -4, 30,-22, -2,-28,-16, 49,-20,  2,  0,  6, -4,-30,-38,-11,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-20,-37,-27, 62,-30,-20,  5,-30, 20,  5,-23,-30,-35,-20,-23,-10,  3,  2, 22,-27;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  7,-27,-20,  3,-27, 23,-20, -7,  0,-17, 27, 49, -7,-10,-23,-20,-10, 14;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 41, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 19,-22, -2,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='T';  M= -1,  5,-13, -6, -9,-10,-16,-13, -8,-10, -7, -8,  9,-15, -9,-10, 11, 29, -5,-30,-12, -9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M=-16,-16,-28,-16, -8, -8,-16, -8,-21, 10,-16,-10,-10,-18,  0, 31,-16,-13,-18, 28,  3, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-17, 40,-30, 57, 30,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 15, -7,  5, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 18;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-15,  2,-28, -1,  3,-23,-16, -2,-28, 31,-25,-12, 11,-17,  8, 44, -6, -8,-22,-24,-12,  3;
/M: SY='C';  M=-11,-23, 64,-29,-26, -6,-30,-21,-13,-27,  1, -7,-23,-36,-25,-25,-16,-10, -5,-32, -8,-26;
/M: SY='V';  M= 24,-20,-10,-25,-20,-10,-16,-25, 11,-15,  0,  0,-20,-20,-20,-20,  0,  0, 26,-25,-15,-20;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='H';  M= -8, 10,-23, 11,  7,-27,-11, 26,-25, -3,-25,-12, 13,-13, 16, -2, 10, -3,-24,-33, -7, 10;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-25, -7,-10,-25, 32,-13,-33, -6,-28,-18,  3,-17, -8,  3,  8, -7,-23,-25,-23,-10;
/M: SY='D';  M=-11, 24,-29, 32, 16,-33, 10, -4,-35, -3,-28,-24, 16,-12, -1, -9,  1,-11,-30,-33,-23,  8;
/M: SY='P';  M=-12, -3,-29,  4,  2,-22,-21, -9,-12,-10, -3, -6,-10, 10,  4,-12,-12,-10,-18,-27,-14,  2;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M= -4,-21,-15,-23,-17,  0,-27,-22, 14,-20, 19,  8,-22,-24,-19,-17,-11,  7, 19,-26, -7,-18;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2026_01 which contains 574'627 sequence entries.

Total number of hits	7 in 7 different sequences
Number of true positive hits	7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

7 sequences

IFNL1_HUMAN (Q8IU54), IFNL2_HUMAN (Q8IZJ0), IFNL2_MOUSE (Q4VK74),

IFNL3_CHICK (B4ER10), IFNL3_HUMAN (Q8IZI9), IFNL3_MOUSE (Q8CGK6), 
IFNL4_HUMAN (K9M1U5)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

6 PDB

pdb_00003hhc; pdb_00003og4; pdb_00003og6; pdb_00005t5w; pdb_00009bpu; pdb_00009bpv