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PROSITE entry PS01277
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General information about the entry
Entry name [info] | RIBONUCLEASE_PH |
Accession [info] | PS01277 |
Entry type [info] | PATTERN |
Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
01-APR-2006 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00983 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Ribonuclease PH signature. |
Pattern [info] |
[CA]-[DE]-[LIVM](2)-[NQV]-[GTA]-D-[GA]-[SG]-x(2,3)-[TAVLC]-[AT]. |
Numerical results [info]
Total number of hits | 418 in 418 different sequences |
Number of true positive hits | 418 in 418 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 8 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.12 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Version [info] | 2 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
418 sequences
EXOS4_CAEBR (A8WQQ5), EXOS4_CAEEL (Q17533), RNPH_ACAM1 (B0CAB9), RNPH_ACIAD (Q6FFX5), RNPH_ACIB3 (B7H2J6), RNPH_ACIB5 (B7IBN8), RNPH_ACIBC (B2I029), RNPH_ACIBS (B0VMP4), RNPH_ACIBT (A3M0U3), RNPH_ACIBY (B0V5W8), RNPH_ACTP2 (A3MYC7), RNPH_ACTP7 (B3GZP5), RNPH_ACTPJ (B0BRL3), RNPH_ACTSZ (A6VLF1), RNPH_AFIC5 (B6JCH9), RNPH_AGRFC (Q8UIG8), RNPH_ALCBS (Q0VT66), RNPH_ALIF1 (Q5E8P0), RNPH_ALIFM (B5FFE2), RNPH_ALISL (B6EPI9), RNPH_ALKEH (Q0A5V1), RNPH_ALLAM (B9JZG3), RNPH_ALTMD (B4S201), RNPH_ANAD2 (B8J5H5), RNPH_ANADE (Q2IEX1), RNPH_ANADF (A7HFW3), RNPH_ANASK (B4UBI2), RNPH_ANOFW (B7GH12), RNPH_AQUAE (O67069), RNPH_AROAE (Q5P5J6), RNPH_AZOC5 (A8HV93), RNPH_AZOSB (A1KCM3), RNPH_AZOVD (C1DI48), RNPH_BACAA (C3PA74), RNPH_BACAC (C3L7T5), RNPH_BACAN (Q81LA9), RNPH_BACC0 (B7JQ74), RNPH_BACC1 (Q72ZT1), RNPH_BACC2 (B7IIZ1), RNPH_BACC3 (C1ETS9), RNPH_BACC4 (B7HEB3), RNPH_BACC7 (B7HQP4), RNPH_BACCN (A7GTG6), RNPH_BACCQ (B9IZ73), RNPH_BACCR (Q817P3), RNPH_BACCZ (Q633V4), RNPH_BACHK (Q6HD42), RNPH_BACLD 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|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
8 sequences
CER7L_ARATH (Q9LDM2), CER7_ARATH (Q9M209), MTR3_SCHPO (Q9P7R3), RNPH_DICT6 (B5YEU4), RNPH_FRACC (Q2JEN8), RNPH_GLOC7 (B7KB81), RNPH_PARS2 (A8L766), RNPH_THEYD (B5YFY8)» more |
PDB [Detailed view] |
11 PDB
1OYP; 1OYR; 1OYS; 1R6L; 1R6M; 1UDN; 1UDO; 1UDQ; 1UDS; 3B4T; 3DD6 |