PROSITE entry PS01180

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS01180
Entry name [info]	CUB
Accession [info]	PS01180
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1997 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00908
Associated ProRule [info]	PRU00059

Name and characterization of the entry

Description [info]

CUB domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=113;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=110;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4270475; R2=0.0141260; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6357.4711914; R2=6.2621794; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=501; H_SCORE=9495; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=360; H_SCORE=8612; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-210; MD=-210; IM=0; DM=0;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0;
/M: SY='C';  M= -6,-19,112,-29,-29,-20,-28,-29,-29,-29,-19,-19,-19,-38,-29,-29, -9, -9, -9,-48,-29,-29;
/M: SY='G';  M=  2, -7,-25, -7,-12,-27, 46,-15,-34,-15,-30,-19,  2,-17,-13,-15,  9,-10,-25,-24,-26,-13;
/M: SY='G';  M= -5, -4,-28, -4, -9,-23, 37,-12,-34,-12,-25,-18,  2,-18,-12, -9,  0,-14,-26,-21,-20,-11;
/M: SY='T';  M= -7, -2,-20, -4, -3, -9,-19, -8, -9, -3,-11, -8,  0,-17, -5, -2,  0,  4, -5,-24, -6, -4;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-32,-24, 19,-31,-22, 21,-27, 28, 13,-26,-28,-24,-21,-22, -8, 16,-15,  6,-24;
/M: SY='R';  M=-10, -7,-24, -9, -3, -8,-19,-10,-16,  5,-13, -8, -5,-10, -1,  7, -2,  4,-12,-19, -3, -3;
/M: SY='B';  M= -3,  5,-22,  5,  3,-20,-11, -9,-16, -3,-15,-12,  4,-11, -2, -7,  3,  3,-13,-28,-13,  0;
/M: SY='T';  M= -2,  2,-20,  2,  2,-17,-15, -8,-15, -7,-15,-11,  0, -4, -1,-10,  8,  9,-12,-27, -9,  0;
/I:         I=-5; MI=0;
/M: SY='S';  M= -5, -1,-21, -4, -2,-13,-15, -6,-13, -5,-18,-11,  4, -4,  0, -7,  9,  8,-13,-25, -6, -2;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-28, -7,-15,-28, 52,-18,-36,-15,-28,-19,  1,-18,-15,-15,  2,-12,-27,-22,-26,-15;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-23,-10, -3, -8,-21, -1, -9, -3,-10, -5, -5,-18, -4,  2, -4,  0, -6,-16,  0, -4;
/M: SY='I';  M=-11,-29,-26,-37,-28, 12,-36,-24, 36,-27, 20, 17,-22,-24,-22,-25,-20, -9, 23,-14,  8,-28;
/M: SY='S';  M=  5, -5,-15, -9, -5,-11,-13,-12,-11, -7,-15,-10, -1,-13, -2, -9, 14, 14, -6,-26, -9, -3;
/M: SY='S';  M=  5,  1,-12, -1, -2,-17, -5, -2,-18,-10,-25,-16,  9,-12, -1, -9, 30, 20,-11,-35,-12, -2;
/M: SY='P';  M= -5,-19,-34,-13, -5,-18,-19,-14,-15,-11,-21,-15,-18, 55,-10,-18, -9, -8,-22,-20,-11,-12;
/M: SY='N';  M=-10, 15,-26, 11,  6,-23,  2,  3,-26,  3,-24,-16, 21,-16,  2,  1,  1, -8,-26,-29,-14,  3;
/M: SY='Y';  M=-14,-22,-30,-24,-22, 25,-13,  2, -8,-16, -5, -5,-19,-28,-17,-14,-18,-13,-13, 29, 47,-21;
/M: SY='P';  M= -9,-20,-38,-12, -3,-27,-15,-20,-17,-12,-25,-17,-19, 74,-11,-20,-10,-11,-26,-29,-28,-12;
/I:         MD=-40;
/M: SY='N';  M=-10, 14,-24, 13,  7,-26, -6,  1,-26, 10,-25,-14, 15,-13,  6,  8,  2, -4,-23,-29,-15,  6; D=-4;
/I:         MD=-40;
/M: SY='R';  M= -1,  1, -3,  0,  0, -2, -1,  0, -3,  3, -3, -1,  2, -2,  1,  3,  0, -1, -2, -3, -1,  0; D=-4;
/I:         MD=-40;
/M: SY='D';  M= -4,  7,-20,  9,  7,-21, -5, -5,-18, -1,-19,-14,  5,  7,  0, -5,  3, -4,-17,-24,-16,  3; D=-4;
/I:         MD=-40;
/M: SY='Y';  M=-16,-17,-24,-17,-17, 26,-24, 15,  0, -9,  0,  0,-16,-24, -9, -9,-16, -8, -8, 24, 63,-17; D=-4;
/I:         MD=-40;
/M: SY='P';  M= -8, -4,-26,  2,  5,-23,-14, -9,-19,  0,-22,-14, -6, 33, -2, -6, -2, -4,-20,-25,-18, -1; D=-4;
/I:         MD=-40;
/M: SY='N';  M= -5,  6,-22,  6,  5,-21, -3, -6,-21,  0,-21,-15,  8,  7, -1, -2,  2, -4,-20,-25,-18,  1; D=-4;
/I:         MD=-40;
/M: SY='N';  M= -4, 19,-17, 14,  2,-19,  2,  2,-20, -3,-23,-16, 24,-13, -1, -4,  9,  0,-20,-28,-14,  0; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0;
/M: SY='T';  M= -4, -9,-19,-13, -6,-12,-20,-12, -5, -1, -4,  4, -7,-15,  1, -3,  0,  8, -3,-24, -8, -2;
/M: SY='E';  M= -9, 11,-26, 11, 17,-22,-15,  5,-22,  4,-19,-14, 11,-13,  8,  5, -1, -6,-22,-27, -9, 11;
/M: SY='C';  M=-10,-19,112,-29,-29,-20,-30,-29,-29,-28,-19,-19,-19,-38,-29,-28, -9, -8, -9,-49,-29,-29;
/M: SY='V';  M= -5,-10,-18,-10, -6, -9,-24,-16,  5,-12, -3, -3,-11,-19,-12,-14, -2,  4, 13,-28, -8,-10;
/M: SY='W';  M=-19,-34,-44,-34,-27, 15,-23,-17,-14,-17,-14,-14,-34,-29,-17,-17,-33,-23,-24,113, 42,-20;
/M: SY='T';  M= -7, -8,-20,-10, -4,-14,-21, -6, -8, -3, -5, -3, -6,-17,  1,  4, -1,  7, -3,-26, -8, -3;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-28,-38,-29,  4,-38,-28, 44,-30, 24, 19,-22,-22,-21,-28,-21,-10, 27,-19,  1,-29;
/M: SY='Q';  M= -7, -5,-22, -4,  8,-18,-20, -8,-13,  1,-11, -7, -5,-14,  9,  4,  2,  2, -9,-26,-11,  8;
/M: SY='V';  M= 15,-19,-13,-24,-19, -8,-14,-21,  8,-16,  5,  6,-19,-20,-17,-18, -4,  0, 17,-24,-12,-18;
/M: SY='P';  M= -9, -2,-30,  5, 13,-27,-18,-13,-23,  3,-25,-18, -6, 30, -1, -7, -2, -1,-22,-30,-21,  4;
/M: SY='P';  M= -8, -5,-31,  0, 11,-24,-19,-11,-19, -1,-21,-16, -7, 29, -1, -7, -4, -5,-22,-27,-17,  2;
/M: SY='G';  M= -4, -5,-29, -5, -9,-28, 44, -7,-35,-12,-27,-15,  3,-18,-10,-13, -1,-17,-28,-23,-23,-10;
/I:         I=-5; MI=-55; MD=-55;
/M: SY='F';  M= -2, -2, -2, -3, -2,  6, -3,  0,  0, -2,  1,  0, -2, -3, -3, -2, -2, -1,  0,  2,  5, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-55; MD=-55;
/M: SY='Q';  M= -1,  0, -2,  0,  1, -2, -1,  1, -1,  1, -1,  0,  0, -1,  3,  1,  0, -1, -2, -1, -1,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-55; MD=-55;
/M: SY='Y';  M=-13,-11,-24,-12, -4,  6,-22, 15,-11, -8, -8, -3, -7,-20, -1, -3, -6, -7,-12,-11, 17, -4; D=-5;
/M: SY='R';  M=-10, -7,-25, -9, -2,-20,-16,  3,-18, 11,-16, -4, -2,-16,  4, 19, -4, -3,-12,-24, -8, -1;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-17,-33,-29,  1,-33,-29, 36,-24, 16, 14,-27,-27,-26,-23,-15, -4, 41,-26, -6,-29;
/M: SY='E';  M= -7, -8,-23,-10,  1,-12,-16, -5, -8, -3, -9, -3, -5,-15, -2, -4, -2, -2, -7,-24, -8, -1;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-20,-32,-23, 11,-31,-22, 24,-29, 40, 18,-28,-29,-22,-21,-26, -9, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='Q';  M= -3,  1,-21, -3,  2,-21,-15, -1,-15,  3,-18, -8,  4,-14, 11,  4,  6,  3,-13,-26, -9,  6;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-23,-38,-28, 55,-32,-21, 10,-27, 12,  4,-19,-27,-32,-17,-20,-10,  6,  1, 20,-28;
/M: SY='Q';  M= -9, -5,-26, -5,  7,-20,-22, -5, -9, -6, -6, -3, -6, -2, 10, -7, -4, -1,-13,-26,-11,  8;
/M: SY='D';  M= -8,  8,-26, 13,  7,-22, -9,  4,-25, -5,-23,-16,  4, -2,  2, -9,  4, -2,-22,-27, -8,  3;
/I:         I=-6; MI=-63; MD=-63;
/M: SY='P';  M= -1, -2, -4, -1,  1, -2, -3, -2,  0, -1, -1, -1, -2,  2,  0, -2, -1, -1, -1, -3, -2,  0; D=-6;
/M: SY='F';  M=-17,-28,-20,-35,-25, 51,-29,-14,  6,-28, 21, 10,-22,-29,-30,-19,-22,-10,  2, -2, 19,-25;
/M: SY='D';  M=-13, 24,-27, 30, 25,-27,-11,  4,-29,  1,-23,-20, 16,-10,  7, -5,  1, -9,-27,-33,-17, 16;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-22,-28,-22,  3,-31,-22, 26,-26, 31, 18,-24,-26,-19,-21,-22, -7, 18,-22, -2,-22;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-26,  9, 30,-20,-19, -1,-20,  2,-14,-12, -1, -8, 11, -4,  0, -3,-20,-25, -9, 20;
/I:         MD=-46;
/M: SY='D';  M= -4,  1,-14,  3,  1,-17, -6, -7,-18, -3,-16,-13,  0, -7, -3, -2,  2, -3,-14,-22,-10, -2; D=-4;
/I:         MD=-46;
/M: SY='H';  M= -3,  6,-18,  7,  8,-20, -7, 16,-21, -2,-20,-12,  7,-10,  5, -4,  8, -2,-17,-26, -8,  5; D=-4;
/I:         MD=-46;
/M: SY='D';  M= -6,  6,-21, 10,  8,-21,-13, -6,-17,  0,-16,-12,  1,  0,  3,  0,  2,  0,-15,-24,-12,  5; D=-4;
/I:         MD=-46;
/M: SY='E';  M= -4,  2,-18,  2,  4,-15, -2, -7,-16, -4,-12,-10,  3,-12, -1, -2,  3, -2,-13,-23,-13,  1; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,114,-30,-30,-19,-30,-30,-28,-30,-17,-18,-20,-40,-30,-30,-11,-10, -9,-49,-29,-30;
/M: SY='R';  M= -5, -9,-22,-11, -8,-17, -3,-14,-19, -4,-16,-11, -5,-11, -7,  0, -7, -9,-16,-13,-13, -9;
/M: SY='Y';  M=-15,-12,-30,-11,-11,  8,-24,  8,-10,  2, -9, -3,-13,-23, -3, -3,-15,-10,-14, 17, 43, -9;
/M: SY='D';  M=-16, 39,-29, 56, 26,-37,-11,  0,-37,  1,-28,-27, 16, -8,  4, -8,  2, -8,-29,-38,-20, 15;
/M: SY='Y';  M=-13,-18,-26,-19,-16, 19,-24, 10, -4,-12, -2, -2,-16,-26, -8,-11,-12, -7,-10, 17, 51,-15;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-17,-31,-26,  4,-31,-26, 28,-25, 28, 15,-29,-29,-25,-21,-20, -5, 31,-25, -5,-26;
/M: SY='E';  M= -8,  4,-28,  8, 35,-22,-17, -3,-24,  8,-18,-13, -1, -6, 13,  0, -2, -9,-23,-25,-15, 24;
/M: SY='I';  M= -4,-29,-21,-35,-29,  0,-34,-29, 39,-26, 17, 15,-24,-24,-24,-25,-16, -6, 36,-24, -4,-29;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-26,-16, -9, -3,-22, -5, -9,  2, -7, -4, -6,-21, -2, 15,-10, -7,-10, -7,  8, -8;
/M: SY='D';  M= -8, 26,-25, 35, 12,-30, -9, -5,-28,  0,-22,-21, 12,-12, -1, -8,  2, -6,-21,-34,-18,  5;
/M: SY='G';  M= -3,  2,-28,  3, -7,-30, 41,-13,-35,-12,-29,-20,  7,-17, -9,-14,  4,-13,-28,-26,-26, -8;
/I:         I=-5; MI=0;
/M: SY='P';  M= -7, -4,-28, -2,  3,-26,-12,-11,-23,  9,-25,-14, -2, 12,  1,  4, -2, -4,-20,-25,-18,  1;
/M: SY='I';  M= -7,-12,-20,-15,-12, -6,-23,-12,  7,-14,  7,  3, -8,-22,-10,-11, -8, -1,  6,-26, -7,-12;
/M: SY='L';  M=-11,-22,-24,-24,-19,  5,-18,-12,  8,-21, 13,  7,-18,-25,-18,-15,-18,-11,  5,-14,  2,-19;
/M: SY='G';  M= -2,-10,-28,-11,-15,-25, 48,-16,-30,-16,-21,-10, -2,-19,-15,-15, -3,-17,-24,-21,-24,-15;
/M: SY='R';  M=-14, -8,-31, -7,  4,-24,-21, -8,-25, 28,-23,-10, -3, -2,  6, 36,-10, -9,-19,-22,-12,  2;
/M: SY='F';  M=-15,-26,-23,-32,-25, 42,-30, -8,  9,-22, 10,  7,-21,-28,-24,-18,-19, -9,  3,  7, 36,-25;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-23, -8,-14,-29, 56,-19,-38,-18,-29,-20,  0,-19,-17,-19,  1,-17,-28,-23,-29,-15;
/M: SY='N';  M= -7,  2,-26,  1, -1,-22,  5,  1,-26,  1,-24,-14,  6,-14,  2,  1,  1, -7,-23,-22, -8, -1;
/M: SY='E';  M= -7, -6,-25, -7,  1,-18, -8, -9,-12, -2,-12, -7, -3,-15, -2, -4, -3, -5,-11,-25,-12, -1;
/M: SY='T';  M= -4,-11,-22,-13, -9, -6,-10,-14, -9, -9, -2, -5, -8,-15,-10, -8, -3,  0, -7,-20, -5,-10;
/M: SY='P';  M= -9,-20,-34,-16, -7,-16,-19,-19,-10,-14,-16,-10,-18, 52,-13,-20,-10, -8,-18,-26,-20,-13;
/M: SY='P';  M= -4, -1,-27,  4,  9,-23, -9, -9,-20, -6,-18,-15, -6, 10, -4,-12, -2, -6,-17,-28,-17,  1;
/I:         MD=-55;
/M: SY='P';  M= -2, -4,-19, -2, -3,-15,-14,-13, -7, -8,-10, -8, -6,  7, -8,-10, -2, -1, -5,-24,-14, -7; D=-5;
/I:         MD=-55;
/M: SY='I';  M= -3,-15,-16,-17,-11, -6,-16,-14, 10,-12,  6,  5,-12,-14, -7,-10, -7, -4,  9,-17, -6,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0;
/M: SY='I';  M=-12,-19,-26,-24,-20,  6,-30,-15, 18,-16,  9,  7,-14,-23,-16,-15,-17, -9, 10,-13, 10,-20;
/M: SY='S';  M=  3, -5,-17, -7,  0,-19,-12, -9,-14, -2,-17, -9,  0,-13,  4,  3, 15, 10, -7,-30,-15,  1;
/M: SY='S';  M=  5, -1,-12, -5, -4,-14, -6,-13,-16,-10,-21,-15,  6,-12, -5, -9, 26, 23, -8,-33,-15, -5;
/I:         I=-6; MI=-63; MD=-63;
/M: SY='Q';  M=  0, -3,-11, -3,  1,-12, -7, -1, -6,  0,-10, -4,  0, -2,  7, -2,  4,  0, -7,-14, -6,  3; D=-6;
/M: SY='S';  M=  0, -1,-19, -2, -6,-20, 13, -8,-24,-12,-24,-16,  4,-14, -6,-12, 16,  9,-16,-28,-14, -7;
/M: SY='N';  M= -6, 25,-19, 15,  0,-21, -1,  5,-22, -4,-29,-19, 37,-13, -1, -5, 15,  4,-24,-38,-19, -1;
/M: SY='R';  M= -2, -5,-22, -8, -3,-18,-14,-10,-10,  0,-14, -7,  0,-15,  2,  4,  2,  0, -7,-26,-13, -2;
/M: SY='M';  M= -4,-24,-19,-30,-21,  2,-23,-12, 20,-18, 26, 36,-23,-23,-11,-16,-20, -8, 14,-21, -3,-16;
/M: SY='T';  M=-10,-11,-23,-11, -8, -1,-21,-14, -7,-12,  0, -2,-12,-19, -9, -9, -7,  1, -6, -5, -1, -8;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-20,-33,-27,  3,-33,-25, 34,-26, 25, 19,-26,-26,-22,-23,-20, -7, 30,-23, -3,-26;
/M: SY='K';  M= -9, -6,-24, -7,  4,-17,-22,-12,-11, 12,-10, -5, -4,-14,  0, 10, -6, -1, -8,-25,-10,  1;
/M: SY='F';  M=-19,-27,-22,-34,-26, 58,-29,-11,  2,-24, 12,  3,-20,-29,-30,-15,-21,-10, -1,  9, 34,-26;
/M: SY='R';  M= -8,-11,-22,-13, -8,-11,-22,  1, -6,  0, -8, -1, -7,-19, -1,  4, -5, -4, -2,-22, -2, -6;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-14, -4, -2,-18, -9,-10,-19, -2,-23,-16,  7,-12, -1,  5, 25, 21,-10,-34,-16, -2;
/I:         I=-5; MI=-55; MD=-55;
/M: SY='D';  M=-15, 38,-26, 52, 17,-34,-10, -2,-34,  0,-27,-26, 16,-10,  0, -7,  4, -3,-25,-37,-18,  8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-55; MD=-55;
/M: SY='S';  M=  0, -2,-21, -4, -2,-10, -4, -8,-17, -7,-16,-13,  3, -7, -6, -6,  5, -2,-15,-24,-11, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-55; MD=-55;
/M: SY='S';  M=  6,  0,-15, -2, -1,-20,  4, -5,-21, -9,-23,-16,  6,-11, -3,-10, 20, 11,-14,-31,-17, -2; D=-5;
/M: SY='H';  M= -6,-12,-23,-16,-14, -8,-15,  3, -1,-14, -6, -1, -5,-21,-12,-12, -8, -8,  1,-18, -3,-14;
/M: SY='Q';  M= -5,  0,-24,  0,  7,-22,-16, -5,-18,  0,-20,-12,  1,  3,  8, -3,  5,  3,-18,-26,-11,  6;
/M: SY='K';  M=  3, -2,-24, -3,  1,-23,  1,-10,-25,  8,-20,-13,  0,-14, -2,  6,  0, -7,-17,-22,-15, -1;
/I:         I=-5; MI=0;
/M: SY='R';  M= -7, -5,-23, -5,  2,-20,-13, -5,-22, 12,-17,-10,  1,-15,  3, 19,  2,  0,-15,-26,-12,  1;
/M: SY='G';  M= -3, -9,-28, -9,-15,-21, 38,-15,-31,-15,-27,-18, -1, -9,-15,-14,  2,-12,-25,-20,-20,-16;
/M: SY='F';  M=-17,-25,-21,-32,-26, 63,-28,-13, -2,-25,  6, -1,-18,-28,-32,-18,-17, -8, -2,  9, 34,-26;
/M: SY='K';  M= -3, -1,-23, -2,  5,-17,-16, -5,-17,  5,-16, -8, -1,-10,  3,  3,  0, -1,-13,-25,-11,  4;
/M: SY='A';  M= 27,-14,-14,-23,-14,-14,-13,-22,  5,-15, -3, -3,-12,-14,-13,-21,  4,  2, 10,-23,-14,-15;
/M: SY='T';  M= -5, -3,-22, -6, -5,-10,-18, -3,-11, -1,-13, -8, -1,-14, -4, -1,  1,  3, -8,-20,  2, -6;
/M: SY='Y';  M=-15,-19,-21,-24,-22, 35,-23,  1, -3,-18,  1, -2,-15,-28,-20,-15,-16,-10, -7,  9, 41,-22;
/M: SY='Y';  M= -9,-12,-23,-14, -6, -1,-17, -8, -6, -7, -5, -1, -9,-17, -5, -2, -7, -6, -5,-16,  2, -7;
/M: SY='A';  M= 10,-10,-16,-13, -8,-14, -9,-17,-10, -5,-11, -7, -8,-15, -8, -9,  2, -2, -2,-23,-13, -8;
/M: SY='V';  M= -9, -6,-12, -4, -6,-15,-26,-18,  4,-13, -4, -4,-10,-19,-12,-15, -7, -4,  9,-31,-13,-10;
/I:         E1=0; MI=*;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	608 in 206 different sequences
Number of true positive hits	608 in 206 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	14
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	97.75 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	27
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann, P_Bucher
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CUB
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

206 sequences

AGRB3_HUMAN (O60242), AGRG6_DANRE (C6KFA3), AGRG6_HUMAN (Q86SQ4),

AGRG6_MOUSE (Q6F3F9), AQN1_PIG(P26322), AQN3_PIG(P24020), 
ASTL_CHICK  (P0DJJ2), ASTL_COTJA  (P42662), ATRN1_HUMAN (Q5VV63), 
ATRN1_MOUSE (Q6A051), ATRN_HUMAN  (O75882), ATRN_MOUSE  (Q9WU60), 
ATRN_RAT(Q99J86), AWN_HORSE   (P80720), AWN_PIG (P26776), 
BMP1_HUMAN  (P13497), BMP1_MOUSE  (P98063), BMP1_XENLA  (P98070), 
BMPH_STRPU  (P98069), BP10_PARLI  (P42674), C1RA_MOUSE  (Q8CG16), 
C1RB_MOUSE  (Q8CFG9), C1RL_HUMAN  (Q9NZP8), C1RL_MOUSE  (Q3UZ09), 
C1RL_RAT(Q6IE64), C1R_HUMAN   (P00736), C1R_MACFA   (Q4R577), 
C1R_PANTR   (Q5R1W3), C1R_PONAB   (Q5R544), C1S_BOVIN   (Q0VCX1), 
C1S_HUMAN   (P09871), C1S_PIG (Q69DK8), C1S_RAT (Q6P6T1), 
CASP_MESAU  (P15156), CDCP2_HUMAN (Q5VXM1), CDCP2_MOUSE (Q8BQH6), 
CDP_ACRMI   (B3EX01), CPP1_ACRMI  (B8V7S0), CPP2_ACRMI  (B8VIV4), 
CS1A_MOUSE  (Q8CG14), CS1B_MOUSE  (Q8CFG8), CSMD1_HUMAN (Q96PZ7), 
CSMD1_MOUSE (Q923L3), CSMD2_HUMAN (Q7Z408), CSMD3_HUMAN (Q7Z407), 
CSMD3_MOUSE (Q80T79), CUBN_CAEEL  (Q20911), CUBN_CANLF  (Q9TU53), 
CUBN_DROME  (Q9W332), CUBN_HUMAN  (O60494), CUBN_MOUSE  (Q9JLB4), 
CUBN_PIG(F1RWC3), CUBN_RAT(O70244), CUZD1_HUMAN (Q86UP6), 
CUZD1_MOUSE (P70412), CUZD1_RAT   (Q9QZT0), DCBD1_HUMAN (Q8N8Z6), 
DCBD1_MOUSE (Q9D4J3), DCBD2_HUMAN (Q96PD2), DCBD2_MOUSE (Q91ZV3), 
DCBD2_RAT   (Q91ZV2), DMBT1_HUMAN (Q9UGM3), DMBT1_MOUSE (Q60997), 
DMBT1_PIG   (Q4A3R3), DMBT1_RABIT (Q95218), DMBT1_RAT   (Q8CIZ5), 
DMBTL_MOUSE (Q8BZE1), ENTK_BOVIN  (P98072), ENTK_HUMAN  (P98073), 
ENTK_MOUSE  (P97435), ENTK_PIG(P98074), FBP1_STRPU  (P10079), 
FBP3_STRPU  (P49013), KREM1_HUMAN (Q96MU8), KREM1_MOUSE (Q99N43), 
KREM1_RAT   (Q924S4), KREM1_XENLA (Q90Y90), KREM2_HUMAN (Q8NCW0), 
KREM2_MOUSE (Q8K1S7), LRP10_HUMAN (Q7Z4F1), LRP10_MOUSE (Q7TQH7), 
LRP12_HUMAN (Q9Y561), LRP12_MACFA (Q9BE74), LRP12_MOUSE (Q8BUJ9), 
LRP12_PONAB (Q5R662), LRP3_HUMAN  (O75074), LRP3_RAT(O88204), 
MASP1_HUMAN (P48740), MASP1_MOUSE (P98064), MASP1_RAT   (Q8CHN8), 
MASP2_HUMAN (O00187), MASP2_MOUSE (Q91WP0), MASP2_RAT   (Q9JJS8), 
MEGF8_HUMAN (Q7Z7M0), MEGF8_MOUSE (P60882), MEGF8_RAT   (Q9QYP0), 
MFRP_HUMAN  (Q9BY79), MFRP_MOUSE  (Q8K480), MIG13_CAEEL (G5EF33), 
NAS23_CAEEL (Q7Z0M7), NAS26_CAEEL (Q22710), NAS27_CAEEL (O17264), 
NAS28_CAEEL (P98061), NAS29_CAEEL (Q20958), NAS31_CAEEL (Q7JLI1), 
NAS34_CAEEL (Q21059), NAS35_BRUMA (A8Q2D1), NAS35_CAEEL (P98060), 
NAS35_HAECO (D5FM34), NAS35_TELCI (A0A0C5PRQ1), NAS36_BRUMA (D5FM38), 
NAS36_CAEBR (Q61EX6), NAS36_CAEEL (Q18206), NAS36_HAECO (D5FM37), 
NAS37_CAEEL (Q93243), NAS38_CAEEL (Q20942), NAS39_CAEEL (Q20176), 
NETO1_HUMAN (Q8TDF5), NETO1_MOUSE (Q8R4I7), NETO2_HUMAN (Q8NC67), 
NETO2_MOUSE (Q8BNJ6), NETO2_RAT   (C6K2K4), NRP1A_DANRE (Q8QFX6), 
NRP1_CHICK  (P79795), NRP1_HUMAN  (O14786), NRP1_MOUSE  (P97333), 
NRP1_RAT(Q9QWJ9), NRP1_XENLA  (P28824), NRP2_HUMAN  (O60462), 
NRP2_MOUSE  (O35375), NRP2_RAT(O35276), OVCH1_HUMAN (Q7RTY7), 
OVCH2_BUFJA (Q90WD8), OVCH2_HUMAN (Q7RTZ1), OVCH2_MOUSE (Q7M761), 
OVCH2_RHIAE (Q66TN7), OVCH2_XENLA (P79953), OVCH_HALRO  (A0A182C2Z2), 
PAMR1_BOVIN (Q5E9P5), PAMR1_HUMAN (Q6UXH9), PAMR1_MOUSE (Q8BU25), 
PAMR1_PONAB (Q5RDI1), PAMR1_XENTR (Q6DIV5), PCOC1_HUMAN (Q15113), 
PCOC1_MOUSE (Q61398), PCOC1_RAT   (O08628), PCOC2_HUMAN (Q9UKZ9), 
PCOC2_MOUSE (Q8R4W6), PDGFC_CHICK (Q9I946), PDGFC_GEKJA (A8WCC4), 
PDGFC_HUMAN (Q9NRA1), PDGFC_MOUSE (Q8CI19), PDGFC_RAT   (Q9EQX6), 
PDGFD_HUMAN (Q9GZP0), PDGFD_MOUSE (Q925I7), PDGFD_PONAB (Q5RA73), 
PDGFD_RABIT (Q6V9H4), PDGFD_RAT   (Q9EQT1), PSP1_PIG(P35495), 
PSP2_PIG(P35496), RP43_RIFPA  (Q9NH13), SCUB1_HUMAN (Q8IWY4), 
SCUB1_MOUSE (Q6NZL8), SCUB2_DANRE (Q5G872), SCUB2_HUMAN (Q9NQ36), 
SCUB2_MOUSE (Q9JJS0), SCUB3_HUMAN (Q8IX30), SCUB3_MOUSE (Q66PY1), 
SE6L1_HUMAN (Q9BYH1), SE6L1_MOUSE (Q6P1D5), SE6L2_BOVIN (Q29RN8), 
SE6L2_HUMAN (Q6UXD5), SE6L2_MOUSE (Q4V9Z5), SEZ6_BOVIN  (A0JNA2), 
SEZ6_HUMAN  (Q53EL9), SEZ6_MOUSE  (Q7TSK2), SEZ6_XENLA  (Q6AX42), 
SOL1_CAEEL  (Q93212), SPAD1_BOVIN (P29392), SPADH_HUMAN (A0A494C103), 
SPAN_STRPU  (P98068), SPMI_PIG(Q28920), ST14_BOVIN  (Q0IIH7), 
ST14_HUMAN  (Q9Y5Y6), ST14_MOUSE  (P56677), TAG53_CAEEL (Q19981), 
TLD_DROME   (P25723), TLL1_CHICK  (Q9DER7), TLL1_DANRE  (O57460), 
TLL1_HUMAN  (O43897), TLL1_MOUSE  (Q62381), TLL1_XENLA  (Q8JI28), 
TLL2_HUMAN  (Q9Y6L7), TLL2_MOUSE  (Q9WVM6), TLL2_XENLA  (O57382), 
TMPS6_HUMAN (Q8IU80), TMPS6_MOUSE (Q9DBI0), TMPS7_HUMAN (Q7RTY8), 
TMPS7_MOUSE (Q8BIK6), TMPS7_RAT   (P86091), TOK_DROME   (Q9VC47), 
TSG6_HUMAN  (P98066), TSG6_MOUSE  (O08859), TSG6_RABIT  (P98065), 
UVS2_XENLA  (P42664), Z13_BOVIN   (P82292)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

14 sequences

AGRB3_MOUSE (Q80ZF8), ATS13_HUMAN (Q76LX8), ATS13_MOUSE (Q769J6),

BARK_DROME  (M9NDE3), CDCP1_HUMAN (Q9H5V8), CDCP1_MOUSE (Q5U462), 
CUB1_PLARH  (A0A6B9L3R4), CUB2_PLARH  (A0A6B9KZ30), CUBT_TRIIF  (Q45KX2), 
NAS30_CAEEL (Q9N2V2), NAS32_CAEEL (O16977), NAS33_CAEEL (P55114), 
SP34_APIME  (Q8MQS8), YE2H4_CAEEL (Q19040)

» more

PDB
[Detailed view]

55 PDB

1NT0; 1NZI; 1SFP; 1SPP; 1SZB; 2QQK; 2QQL; 2QQM; 2QQO; 2WNO; 3DEM; 3KQ4;
» more