PROSITE entry PS01327
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General information about the entry
Entry name [info] | MSCL |
Accession [info] | PS01327 |
Entry type [info] | PATTERN |
Date [info] |
01-JUL-1999 CREATED;
01-APR-2006 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC01030 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Large-conductance mechanosensitive channels mscL family signature. |
Pattern [info] |
[KR]-G-N-[LIVM](2)-D-[LIVM]-A-[LIVM]-[GA]-[LIVM](3)-G. |
Numerical results [info]
Total number of hits | 362 in 362 different sequences |
Number of true positive hits | 362 in 362 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 22 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 94.27 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Version [info] | 2 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
362 sequences
MSCL1_RHILO (Q98DH7), MSCL2_RHILO (Q98DG5), MSCL3_RHILO (Q98B79), MSCL_ACIAD (Q6FE93), MSCL_ACIB3 (B7GWU1), MSCL_ACIB5 (B7I868), MSCL_ACIBC (B2HYF5), MSCL_ACIBS (B0VRV0), MSCL_ACIBT (A3M8J6), MSCL_ACIBY (B0V4Z4), MSCL_ACIET (B9MDX6), MSCL_ACISJ (A1W457), MSCL_ACTP2 (A3N2P0), MSCL_ACTP7 (B3H2I9), MSCL_ACTPJ (B0BRR8), MSCL_ACTSZ (A6VKX7), MSCL_AERHH (A0KNB2), MSCL_AERS4 (A4SJT9), MSCL_AFIC5 (B6JGA5), MSCL_AGRFC (Q8UHY0), MSCL_ALKOO (A8MGZ0), MSCL_ANAD2 (B8J6V0), MSCL_ANASK (B4UD86), MSCL_ANOFW (B7GLN3), MSCL_AROAE (Q5P4W4), MSCL_AZOSB (A1KC82), MSCL_AZOVD (C1DER3), MSCL_BACAA (C3PBD7), MSCL_BACAC (C3L9Y0), MSCL_BACAH (A0RJR6), MSCL_BACAN (Q81KR6), MSCL_BACC0 (B7JS48), MSCL_BACC1 (Q72Z61), MSCL_BACC2 (B7IKT7), MSCL_BACC3 (C1EV23), MSCL_BACC4 (B7H732), MSCL_BACC7 (B7HSK8), MSCL_BACCN (A7GTU7), MSCL_BACCQ (B9J176), MSCL_BACCR (Q816Z0), MSCL_BACCZ (Q633B8), MSCL_BACFN (Q5LGV7), MSCL_BACFR (Q64XQ8), MSCL_BACHK (Q6HCK7), MSCL_BACLD (Q65E27), MSCL_BACMK (A9VKI1), MSCL_BACP2 (A8FI71), MSCL_BACSU 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MSCL_CERS5 (A4WVB7), MSCL_CHLAA (A9WJI9), MSCL_CHLAD (B8G6C2), MSCL_CHLCH (Q3ANR9), MSCL_CHLL3 (Q3B3W2), MSCL_CHLP8 (B3QN57), MSCL_CHLPB (B3EL80), MSCL_CHLPD (A1BFW8), MSCL_CHLPM (A4SEF1), MSCL_CHLTE (Q8KD14), MSCL_CHRVO (Q7NYB4), MSCL_CITK8 (A8AQI5), MSCL_CLOP1 (Q0TUQ9), MSCL_CLOPE (P53380), MSCL_CLOPS (Q0SWK0), MSCL_CROS8 (A7MPE5), MSCL_CUPMC (Q1LIC3), MSCL_CUPNH (Q0K6A4), MSCL_CUPPJ (Q46WM9), MSCL_CYTH3 (Q11TN7), MSCL_DEHMB (A5FPV4), MSCL_DEHMC (Q3ZYR8), MSCL_DELAS (A9BX57), MSCL_DESHD (B8FTI4), MSCL_DESHY (Q24Y14), MSCL_DINSH (A8LLI0), MSCL_ECO24 (A7ZSH9), MSCL_ECO27 (B7UK14), MSCL_ECO45 (B7MCQ6), MSCL_ECO55 (B7LHZ2), MSCL_ECO57 (P0A743), MSCL_ECO5E (B5YT10), MSCL_ECO7I (B7NLL0), MSCL_ECO81 (B7N0T1), MSCL_ECO8A (B7M0Z6), MSCL_ECOBW (C4ZUE5), MSCL_ECODH (B1X6E2), MSCL_ECOHS (A8A595), MSCL_ECOK1 (A1AGI2), MSCL_ECOL5 (Q0TCH1), MSCL_ECOL6 (Q8FD11), MSCL_ECOLC (B1IQ09), MSCL_ECOLI (P0A742), MSCL_ECOLU (B7NDR2), MSCL_ECOSE (B6I204), MSCL_ECOSM (B1LGP7), MSCL_ECOUT (Q1R642), MSCL_ENT38 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|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
22 sequences
MSCL_BORBR (Q7WDW9), MSCL_BORPA (Q7W2W9), MSCL_BORPD (A9HW97), MSCL_BORPE (Q7W079), MSCL_BRAHW (C0QYW6), MSCL_CHLL2 (B3ECJ4), MSCL_CLOB8 (A6M387), MSCL_CLOTE (Q898L6), MSCL_DECAR (Q47AR9), MSCL_ENTFA (Q82ZB4), MSCL_FLAPJ (A6GYI6), MSCL_GEODF (B9M9E4), MSCL_HYPNA (Q0C5R9), MSCL_METSB (B8EJ45), MSCL_NITV9 (B8DR67), MSCL_OENOB (Q04FK1), MSCL_SYNE7 (Q31LP8), MSCL_SYNJA (Q2JSN8), MSCL_SYNJB (Q2JLN5), MSCL_SYNP6 (Q5N075), MSCL_THIDA (Q3SG48), MSCL_ZYMMO (Q5NNP2)» more |
PDB [Detailed view] |
3 PDB
2OAR; 3HZQ; 6CTD |