Entry: PS01327

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General information about the entry

Entry name [info] MSCL
Accession [info] PS01327
Entry type [info] PATTERN
Date [info] JUL-1999 (CREATED); APR-2006 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC01030

Name and characterization of the entry

Description [info] Large-conductance mechanosensitive channels mscL family signature.
Pattern [info]
[KR]-G-N-[LIVM](2)-D-[LIVM]-A-[LIVM]-[GA]-[LIVM](3)-G.

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 362 in 362 different sequences
Number of true positive hits 362 in 362 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 22
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 94.27 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
362 sequences

MSCL1_RHILO (Q98DH7), MSCL2_RHILO (Q98DG5), MSCL3_RHILO (Q98B79), 
MSCL_ACIAC  (A1TTF7), MSCL_ACIAD  (Q6FE93), MSCL_ACIB3  (B7GWU1), 
MSCL_ACIB5  (B7I868), MSCL_ACIBC  (B2HYF5), MSCL_ACIBS  (B0VRV0), 
MSCL_ACIBT  (A3M8J6), MSCL_ACIBY  (B0V4Z4), MSCL_ACIET  (B9MDX6), 
MSCL_ACISJ  (A1W457), MSCL_ACTP2  (A3N2P0), MSCL_ACTP7  (B3H2I9), 
MSCL_ACTPJ  (B0BRR8), MSCL_ACTSZ  (A6VKX7), MSCL_AERHH  (A0KNB2), 
MSCL_AERS4  (A4SJT9), MSCL_AGRRK  (B9J924), MSCL_AGRT5  (Q8UHY0), 
MSCL_ALKOO  (A8MGZ0), MSCL_ANAD2  (B8J6V0), MSCL_ANASK  (B4UD86), 
MSCL_ANOFW  (B7GLN3), MSCL_AROAE  (Q5P4W4), MSCL_AZOSB  (A1KC82), 
MSCL_AZOVD  (C1DER3), MSCL_BACA2  (A7Z9K9), MSCL_BACAA  (C3PBD7), 
MSCL_BACAC  (C3L9Y0), MSCL_BACAH  (A0RJR6), MSCL_BACAN  (Q81KR6), 
MSCL_BACC0  (B7JS48), MSCL_BACC1  (Q72Z61), MSCL_BACC2  (B7IKT7), 
MSCL_BACC3  (C1EV23), MSCL_BACC4  (B7H732), MSCL_BACC7  (B7HSK8), 
MSCL_BACCN  (A7GTU7), MSCL_BACCQ  (B9J176), MSCL_BACCR  (Q816Z0), 
MSCL_BACCZ  (Q633B8), MSCL_BACFN  (Q5LGV7), MSCL_BACFR  (Q64XQ8), 
MSCL_BACHK  (Q6HCK7), MSCL_BACLD  (Q65E27), MSCL_BACP2  (A8FI71), 
MSCL_BACSU  (P94585), MSCL_BACTN  (Q89ZV7), MSCL_BACV8  (A6L685), 
MSCL_BACWK  (A9VKI1), MSCL_BARBK  (A1URL2), MSCL_BARHE  (Q6G4F8), 
MSCL_BARQU  (Q6G160), MSCL_BART1  (A9IQ78), MSCL_BDEBA  (Q6MRC6), 
MSCL_BEII9  (B2ID03), MSCL_BRADU  (Q89K46), MSCL_BRASO  (A4YWD8), 
MSCL_BREBN  (C0Z921), MSCL_BRUA1  (B2S9G8), MSCL_BRUA2  (Q2YPJ2), 
MSCL_BRUAB  (Q57F40), MSCL_BRUC2  (A9M8A1), MSCL_BRUMB  (C0RH35), 
MSCL_BRUME  (Q8YFB7), MSCL_BRUO2  (A5VNQ9), MSCL_BRUSI  (B0CJU8), 
MSCL_BRUSU  (Q8G2K1), MSCL_BURA4  (B1YS18), MSCL_BURCA  (Q1BHB3), 
MSCL_BURCC  (B1JTX9), MSCL_BURCH  (A0K875), MSCL_BURCJ  (B4EC31), 
MSCL_BURCM  (Q0BEC9), MSCL_BURM1  (A9AIS5), MSCL_BURM7  (A3MKN7), 
MSCL_BURM9  (A2SBC7), MSCL_BURMA  (Q62JH4), MSCL_BURMS  (A1V513), 
MSCL_BURP0  (A3NWF4), MSCL_BURP1  (Q3JR90), MSCL_BURP6  (A3NAN4), 
MSCL_BURP8  (B2JGJ7), MSCL_BURPP  (B2T3W8), MSCL_BURPS  (Q63T62), 
MSCL_BURS3  (Q39FB0), MSCL_BURTA  (Q2SWU6), MSCL_BURVG  (A4JF27), 
MSCL_BURXL  (Q13Z35), MSCL_CAMC1  (A7ZCB7), MSCL_CAMC5  (A7GXI2), 
MSCL_CAMHC  (A7I339), MSCL_CAUCN  (B8H6A4), MSCL_CAUCR  (Q9A2H6), 
MSCL_CAUSK  (B0T274), MSCL_CHLAA  (A9WJI9), MSCL_CHLAD  (B8G6C2), 
MSCL_CHLCH  (Q3ANR9), MSCL_CHLP8  (B3QN57), MSCL_CHLPB  (B3EL80), 
MSCL_CHLPD  (A1BFW8), MSCL_CHLTE  (Q8KD14), MSCL_CHRVO  (Q7NYB4), 
MSCL_CITK8  (A8AQI5), MSCL_CLOHI  (Q9X722), MSCL_CLOP1  (Q0TUQ9), 
MSCL_CLOPE  (P53380), MSCL_CLOPS  (Q0SWK0), MSCL_CROS8  (A7MPE5), 
MSCL_CUPNH  (Q0K6A4), MSCL_CUPPJ  (Q46WM9), MSCL_CYTH3  (Q11TN7), 
MSCL_DEHSB  (A5FPV4), MSCL_DEHSC  (Q3ZYR8), MSCL_DELAS  (A9BX57), 
MSCL_DESHD  (B8FTI4), MSCL_DESHY  (Q24Y14), MSCL_DINSH  (A8LLI0), 
MSCL_ECO24  (A7ZSH9), MSCL_ECO27  (B7UK14), MSCL_ECO45  (B7MCQ6), 
MSCL_ECO55  (B7LHZ2), MSCL_ECO57  (P0A743), MSCL_ECO5E  (B5YT10), 
MSCL_ECO7I  (B7NLL0), MSCL_ECO81  (B7N0T1), MSCL_ECO8A  (B7M0Z6), 
MSCL_ECOBW  (C4ZUE5), MSCL_ECODH  (B1X6E2), MSCL_ECOHS  (A8A595), 
MSCL_ECOK1  (A1AGI2), MSCL_ECOL5  (Q0TCH1), MSCL_ECOL6  (Q8FD11), 
MSCL_ECOLC  (B1IQ09), MSCL_ECOLI  (P0A742), MSCL_ECOLU  (B7NDR2), 
MSCL_ECOSE  (B6I204), MSCL_ECOSM  (B1LGP7), MSCL_ECOUT  (Q1R642), 
MSCL_ENT38  (A4WF99), MSCL_ERWT9  (B2VK97), MSCL_ESCF3  (B7LRQ7), 
MSCL_EXIS2  (B1YKK2), MSCL_EXISA  (C4KYQ8), MSCL_FLAJ1  (A5FKC3), 
MSCL_FUSNN  (Q8RFE0), MSCL_GEOKA  (Q5L081), MSCL_GEOLS  (B3EA78), 
MSCL_GEOMG  (Q39SN1), MSCL_GEOSL  (Q749E9), MSCL_GEOSW  (C5DA22), 
MSCL_GEOTN  (A4IMP7), MSCL_GLUOX  (Q5FNB7), MSCL_HAEDU  (Q7VKA0), 
MSCL_HAEI8  (Q4QMW0), MSCL_HAEIE  (A5UEB0), MSCL_HAEIG  (A5UH89), 
MSCL_HAEIN  (P44789), MSCL_HERA2  (A9B815), MSCL_HERAR  (A4G9H5), 
MSCL_HISS1  (Q0I185), MSCL_HISS2  (B0UWZ1), MSCL_JANMA  (A6T365), 
MSCL_KLEP3  (B5XNC0), MSCL_KLEP7  (A6TEU4), MSCL_LACAC  (Q5FLW0), 
MSCL_LACBA  (Q03SF6), MSCL_LACC3  (Q034S0), MSCL_LACCB  (B3WAS8), 
MSCL_LACF3  (B2GEU1), MSCL_LACGA  (Q041C3), MSCL_LACH4  (A8YTR2), 
MSCL_LACJO  (Q74HV9), MSCL_LACLA  (Q9CDW0), MSCL_LACLM  (A2RNQ7), 
MSCL_LACLS  (Q02W23), MSCL_LACPL  (Q88X97), MSCL_LACRD  (A5VIB3), 
MSCL_LACRJ  (B2G5U0), MSCL_LACS1  (Q1WVR1), MSCL_LACSS  (Q38V39), 
MSCL_LARHH  (C1DBZ0), MSCL_LEGPA  (Q5X1Y7), MSCL_LEGPC  (A5IEQ9), 
MSCL_LEGPH  (Q5ZSH7), MSCL_LEGPL  (Q5WTR2), MSCL_LEPCP  (B1Y2I5), 
MSCL_LEUCK  (B1MZU9), MSCL_LEUMM  (Q03YJ0), MSCL_LISIN  (Q929V3), 
MSCL_LISMC  (C1KX17), MSCL_LISMF  (Q71XV0), MSCL_LISMH  (B8DH65), 
MSCL_LISMO  (Q8Y5J6), MSCL_LISW6  (A0AKH0), MSCL_LYSSC  (B1HRA8), 
MSCL_MACCJ  (B9EBV2), MSCL_MANSM  (Q65QF7), MSCL_METC4  (B7KPQ5), 
MSCL_METEP  (A9W5W6), MSCL_METFK  (Q1H3M0), MSCL_METPB  (B1ZC68), 
MSCL_METPP  (A2SE21), MSCL_METRJ  (B1M0R9), MSCL_MYCBO  (P0A5K9), 
MSCL_MYCBP  (A1KHC1), MSCL_MYCBT  (C1ALX4), MSCL_MYCLB  (B8ZU13), 
MSCL_MYCLE  (Q9Z5G4), MSCL_MYCMM  (B2HEA6), MSCL_MYCTA  (A5U127), 
MSCL_MYCTO  (P9WJN4), MSCL_MYCTU  (P9WJN5), MSCL_MYCUA  (A0PWB0), 
MSCL_NITHX  (Q1QL44), MSCL_NITWN  (Q3SRA3), MSCL_NOVAD  (Q2G9Z8), 
MSCL_OCEIH  (Q8CUT6), MSCL_OCHA4  (A6WVY7), MSCL_OLICO  (B6JGA5), 
MSCL_PARD8  (A6L898), MSCL_PARDP  (A1B4B3), MSCL_PARL1  (A7HR02), 
MSCL_PASMU  (P57950), MSCL_PECAS  (Q6CZZ8), MSCL_PECCA  (O68284), 
MSCL_PECCP  (C6DFR9), MSCL_PEDPA  (Q03D91), MSCL_PELLD  (Q3B3W2), 
MSCL_PELPB  (B4SGK3), MSCL_PELPD  (A1APN2), MSCL_PHEZH  (B4RCK7), 
MSCL_POLNA  (A1VK53), MSCL_PORG3  (B2RJU3), MSCL_PORGI  (Q7MUZ1), 
MSCL_PROA2  (B4S9H4), MSCL_PROMH  (B4F1L3), MSCL_PROVI  (A4SEF1), 
MSCL_PSE14  (Q48DU1), MSCL_PSEA7  (A6VC02), MSCL_PSEA8  (B7V0F9), 
MSCL_PSEAB  (Q02G63), MSCL_PSEAE  (Q9HVH7), MSCL_PSEE4  (Q1I4K7), 
MSCL_PSEF5  (Q4K5Q6), MSCL_PSEFL  (O68286), MSCL_PSEFS  (C3K2E3), 
MSCL_PSEP1  (A5W917), MSCL_PSEPF  (Q3K6I0), MSCL_PSEPG  (B0KHQ5), 
MSCL_PSEPK  (Q88E23), MSCL_PSEPW  (B1J2X0), MSCL_PSESM  (Q87WB2), 
MSCL_PSEU2  (Q4ZNG6), MSCL_PSYA2  (Q4FUU9), MSCL_PSYCK  (Q1QDU6), 
MSCL_PSYWF  (A5WCE5), MSCL_RALME  (Q1LIC3), MSCL_RALPJ  (B2UDT8), 
MSCL_RALSO  (Q8XVA1), MSCL_RENSM  (A9WMF7), MSCL_RHIE6  (B3PNR8), 
MSCL_RHIEC  (Q2KCQ1), MSCL_RHIL3  (Q1MLQ8), MSCL_RHILW  (B5ZPK8), 
MSCL_RHIME  (Q92S72), MSCL_RHISN  (C3MFT5), MSCL_RHOP2  (Q2IWV4), 
MSCL_RHOPA  (Q6N6D0), MSCL_RHOPB  (Q214K6), MSCL_RHOPS  (Q136W9), 
MSCL_RHOS1  (A3PMB5), MSCL_RHOS4  (Q3IZY4), MSCL_RHOS5  (A4WVB7), 
MSCL_ROSDO  (Q16BG3), MSCL_ROSS1  (A5UVR8), MSCL_RUEPO  (Q5LMR7), 
MSCL_SALA4  (B5F7R7), MSCL_SALAR  (A9MN76), MSCL_SALCH  (Q57J60), 
MSCL_SALDC  (B5FJI6), MSCL_SALEP  (B5R1E7), MSCL_SALG2  (B5RH45), 
MSCL_SALHS  (B4TJY1), MSCL_SALNS  (B4SUR2), MSCL_SALPA  (Q5PIT4), 
MSCL_SALPB  (A9N8B5), MSCL_SALPC  (C0PZV3), MSCL_SALPK  (B5BGV7), 
MSCL_SALSV  (B4TXB4), MSCL_SALTI  (P0A1X9), MSCL_SALTY  (P0A1X8), 
MSCL_SERP5  (A8GKG9), MSCL_SHEB2  (B8ECI1), MSCL_SHEB5  (A3CZU7), 
MSCL_SHEB8  (A6WT30), MSCL_SHEB9  (A9L4L5), MSCL_SHEON  (Q8EJE5), 
MSCL_SHEPC  (A4YAR8), MSCL_SHESA  (A0KSJ1), MSCL_SHESM  (Q0HMW6), 
MSCL_SHESR  (Q0HQW4), MSCL_SHESW  (A1RFK8), MSCL_SHIB3  (B2U2R0), 
MSCL_SHIBS  (Q31VY6), MSCL_SHISS  (Q3YWW9), MSCL_SINMW  (A6U5U5), 
MSCL_SODGM  (Q2NQQ0), MSCL_SPHAL  (Q1GUG3), MSCL_SPHWW  (A5VBY5), 
MSCL_STAA1  (A7X204), MSCL_STAA2  (A6U1G8), MSCL_STAA3  (Q2FH87), 
MSCL_STAA8  (P68805), MSCL_STAA9  (A5ISN0), MSCL_STAAB  (Q2YXW9), 
MSCL_STAAC  (Q5HG71), MSCL_STAAE  (A6QGQ0), MSCL_STAAM  (P68803), 
MSCL_STAAN  (P68804), MSCL_STAAR  (Q6GH57), MSCL_STAAS  (Q6G9L1), 
MSCL_STAAW  (P68806), MSCL_STACT  (B9DP78), MSCL_STAEQ  (Q5HPJ2), 
MSCL_STAES  (Q8CPC4), MSCL_STAHJ  (Q4L656), MSCL_STAS1  (Q49XE2), 
MSCL_STRM5  (B4STT2), MSCL_STRMK  (B2FSD7), MSCL_SYMTH  (Q67PL7), 
MSCL_SYNAS  (Q2LUI9), MSCL_SYNWW  (Q0AWD5), MSCL_SYNY3  (P73553), 
MSCL_THISH  (B8GTM8), MSCL_TOLAT  (C4LE79), MSCL_VARPS  (C5CQL2), 
MSCL_VIBC3  (A5F037), MSCL_VIBCH  (Q9KLX9), MSCL_VIBCM  (C3LVM7), 
MSCL_XANAC  (Q8PHE9), MSCL_XANC5  (Q3BQ08), MSCL_XANC8  (Q4UXZ0), 
MSCL_XANCB  (B0RPI5), MSCL_XANCP  (Q8P626), MSCL_XANOM  (Q2P0I7), 
MSCL_XANOP  (B2SWL6), MSCL_XANOR  (Q5GXD6), MSCL_XYLF2  (B2I658), 
MSCL_XYLFA  (Q9PHA5), MSCL_XYLFM  (B0U1E0), MSCL_XYLFT  (Q87FA1), 
MSCL_YERE8  (A1JRZ6), MSCL_YERP3  (A7FNK6), MSCL_YERPA  (Q1C2X5), 
MSCL_YERPE  (Q8ZJ83), MSCL_YERPG  (A9R923), MSCL_YERPN  (Q1CCX2), 
MSCL_YERPP  (A4TH19), MSCL_YERPS  (Q664V0)
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UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
22 sequences

MSCL_BORBR  (Q7WDW9), MSCL_BORPA  (Q7W2W9), MSCL_BORPD  (A9HW97), 
MSCL_BORPE  (Q7W079), MSCL_BRAHW  (C0QYW6), MSCL_CHLL2  (B3ECJ4), 
MSCL_CLOB8  (A6M387), MSCL_CLOTE  (Q898L6), MSCL_DECAR  (Q47AR9), 
MSCL_DESVM  (B8DR67), MSCL_ENTFA  (Q82ZB4), MSCL_FLAPJ  (A6GYI6), 
MSCL_GEODF  (B9M9E4), MSCL_HYPNA  (Q0C5R9), MSCL_METSB  (B8EJ45), 
MSCL_OENOB  (Q04FK1), MSCL_SYNE7  (Q31LP8), MSCL_SYNJA  (Q2JSN8), 
MSCL_SYNJB  (Q2JLN5), MSCL_SYNP6  (Q5N075), MSCL_THIDA  (Q3SG48), 
MSCL_ZYMMO  (Q5NNP2)
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PDB
[Detailed view]
2 PDB

2OAR; 3HZQ

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