Entry: PS50032

General information about the entry

Entry name [info] KA1
Accession [info] PS50032
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUN-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50032
Associated ProRule [info] PRU00565

Name and characterization of the entry

Description [info] Kinase associated domain 1 (KA1) profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1002729; R2=0.0181136; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2252.86284; R2=13.85287; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=365; N_SCORE=8.7; H_SCORE=6346; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=243; N_SCORE=6.5; H_SCORE=5630; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S'; M=  4,  4,-22,  5, -2,-25,  2, -7,-23, -5,-20,-15,  3, -9, -3, -9,  7, -1,-17,-29,-17, -3;
/M: SY='D'; M= -7, -1,-25,  5, -1,-20, -9,-14,-12,-10, -9, -9, -6, -7, -8,-13, -5, -6, -8,-29,-16, -5;
/M:         M= -5, -6,-24, -8, -7,-12, -5,-11,-12, -7, -9, -5, -3,-14, -4, -7, -4, -7,-11,-23,-11, -6;
/M: SY='S'; M= -3, -4,-24, -4,  0,-20,  0,-13,-20, -7,-15,-13, -1, -3, -6, -7,  2, -1,-17,-27,-18, -4;
/M: SY='G'; M= -4,  2,-25,  3,  2,-27,  7,-10,-28,  1,-26,-17,  4, -5, -1, -1,  5, -3,-22,-28,-20,  0;
/M: SY='S'; M=  1, -2,-21, -3,  3,-19,-14, -2,-13, -8,-12, -7, -2, -5,  1,-10,  4,  3,-11,-29,-13,  1;
/M: SY='V'; M=  2,-15,-19,-17, -9,-11,-20,-19,  3,-13, -1, -2,-13, -6,-13,-14, -2,  2,  6,-28,-14,-12;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-16,-30,-26,  1,-29,-24, 28,-23, 20, 17,-26,-27,-22,-20,-15, -4, 32,-26, -6,-25;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -3, 10,-22,-20,  4,-26, 25,-22, -9,  0,-13, 11, 23, -7, -8,-20,-21, -6,  9;
/M: SY='F'; M=-19,-31,-24,-40,-30, 66,-29,-22, -2,-28,  6, -2,-23,-30,-37,-20,-22,-12, -2, 29, 28,-29;
/M: SY='E'; M= -9, 11,-28, 19, 52,-29,-17,  0,-29,  8,-21,-20,  5, -2, 17, -1,  3, -7,-29,-31,-20, 35;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-36,-27,  5,-34,-25, 37,-27, 25, 22,-23,-24,-20,-24,-21, -9, 25,-20,  0,-26;
/M: SY='E'; M=-12,  0,-29,  4, 29,-19,-22, 11,-22,  2,-14, -8, -3,-10, 22,  0, -5,-11,-25,-21, -5, 25;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-33,-27,  3,-33,-27, 33,-26, 24, 16,-27,-27,-24,-23,-18, -6, 33,-24, -4,-27;
/M: SY='C'; M= -9,-21, 19,-25,-24,  2,-29,-16, -2,-15, -5, -4,-20,-30,-22,-16,-11, -3,  9,-19,  7,-24;
/M: SY='K'; M=-10, -3,-28, -3,  7,-27,-20, -7,-25, 35,-24, -8, -1,-12, 14, 28, -7, -6,-17,-21,-10, 10;
/M: SY='V'; M= -4,-19,-15,-23,-21, -1,-25,-21, 17,-20, 15,  9,-17,-24,-19,-17, -9,  4, 21,-27, -7,-20;
/M: SY='P'; M=-11, -8,-33, -2, 15,-28,-19, -8,-25,  9,-25,-16, -7, 29,  8,  9, -5, -9,-26,-27,-20,  8;
/M: SY='R'; M=-12,  0,-27,  0,  5,-18,-13, -7,-14,  2, -9, -8,  2,-17, -1,  9, -8, -9,-14,-26,-13,  1;
/M: SY='L'; M= -8,-11,-22, -9, -4, -8,-18,-14, -2,-13,  4,  0,-12,-11,-11,-13,-10, -6, -1,-26,-11, -8;
/M: SY='G'; M= -6, -1,-25, -2, -6,-20,  9, -4,-25, -1,-23,-14,  4,-14, -6, -4,  2, -4,-20,-22, -9, -7;
/M: SY='L'; M= -8,-21,-23,-23,-18,  4,-18,-11,  7,-19, 19,  7,-18,-26,-16,-15,-19,-10,  1,-12, 10,-18;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='L'; M= -6,-13,-21,-16,-12, -4,-20,  1,  0,-11,  5,  2, -7,-23, -9, -3,-10, -6,  0,-20,  2,-12; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-20, -9,-15,-18, 38,-15,-22,-15,-17,-12, -3,-16,-15,-15,  1,-11,-14,-17,-20,-15; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-26,  3,-33,-25, 33,-26, 27, 19,-26,-26,-22,-23,-20, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='D'; M=-16, 14,-28, 20,  9,-28,-16, 11,-28,  5,-20,-13,  7,-14, 12, 12, -2, -6,-23,-29,-10,  8;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-33,-23, 37,-30,-18,  8,-21, 18,  8,-20,-27,-25, -9,-21,-10,  4, -6, 13,-23;
/M: SY='K'; M=-12,  0,-29, -2,  9,-29,-19,  2,-24, 25,-21, -6,  3,-14, 24, 25, -6,-10,-23,-22, -9, 16;
/M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10,  0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='I'; M= -7,-27,-21,-31,-24,  0,-31,-23, 29,-20, 21, 19,-24,-25,-19,-19,-19, -7, 25,-23, -3,-23;
/M: SY='S'; M=  2, -1,-12, -1,  2,-22, -6,-11,-23,  0,-23,-16,  2,-13, -1,  0, 14,  5,-14,-32,-18,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D'; M= -9, 16,-26, 17,  3,-27, -7, -6,-24, -5,-28,-21, 16, 15, -4,-11,  6,  1,-25,-36,-22, -2;
/M: SY='T'; M=  5, -7,-19,-11, -3,-17,-13, -8,-11, -7,-10, -4, -5,-11,  7, -8,  7,  9,-10,-22, -7,  1;
/M: SY='W'; M=-16,-31,-33,-33,-25, 22,-25,-20, -3,-23,  3, -4,-29,-29,-21,-19,-27,-17,-11, 60, 25,-21;
/M: SY='Q'; M= -3,-10,-23,-11, -5,-16,-17, -4, -2,-11,  4,  5, -9,-19,  6,-10, -9, -9, -5,-23, -8,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-29,-24, 51,-30,  3,  0,-19,  4,  0,-20,-30,-23,-14,-20,-10, -6, 21, 59,-24;
/M: SY='K'; M=-12,-12,-27,-12, -2,-12,-23,-11,-13, 17, -2,  0,-10,-18,  2, 17,-16,-10,-11,-19, -5, -1;
/M: SY='D'; M=-12, 14,-25, 15, 11,-18,-15, -4,-23,  2,-20,-14, 10, -7,  0,  0,  1, -1,-20,-29,-14,  5;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-33,-25, 11,-32,-22, 28,-27, 32, 20,-26,-27,-21,-22,-24, -9, 19,-19,  1,-24;
/M: SY='C'; M= 12,-19, 24,-27,-22, -7,-20,-23, -4,-20, -6, -6,-18,-25,-21,-23, -5, -5,  8,-26,-11,-22;
/M: SY='S'; M=  3,  3,-19,  4,  9,-24,-12,-10,-20,  4,-21,-14,  2,-10,  5, -2, 12,  7,-12,-30,-16,  7;
/M: SY='Q'; M=  5, -2,-24, -3,  4,-25,-10, -1,-21,  6,-15, -9, -2,-13,  9,  8, -2, -8,-16,-23,-12,  5;
/M: SY='I'; M=-12,-30,-27,-39,-29, 20,-37,-27, 35,-30, 21, 15,-21,-23,-25,-27,-21,-10, 21,-13,  7,-29;
/M: SY='L'; M= -5,-22,-19,-24,-16,  2,-24,-10, 11,-24, 28, 14,-20,-25,-14,-17,-16, -6,  5,-24, -2,-15;
/M: SY='R'; M= -8,  6,-23,  4,  3,-18,-15, -3,-21,  5,-20,-13,  9,-14,  2, 10,  4,  3,-16,-28,-11,  1;
/M: SY='E'; M= -8,  6,-26,  9, 19,-21,-13, -3,-24,  6,-19,-12,  3,-10, 10,  3,  1, -7,-21,-26,-14, 15;
/M: SY='L'; M= -8,-22,  1,-24,-19,  1,-27,-19,  8,-26, 30, 12,-24,-29,-19,-20,-23,-10,  4,-26, -7,-19;
/M: SY='R'; M=-12,  0,-28,  0, 11,-26,-10, -3,-28, 20,-23,-12,  4,-13, 12, 26, -3, -7,-23,-23,-14, 10;
/M: SY='L'; M= -1,-27,-17,-29,-22,  6,-22,-22, 15,-24, 27, 13,-26,-27,-22,-20,-19, -7, 16,-21, -4,-21;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 29 in 29 different sequences
Number of true positive hits 29 in 29 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] KA1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
29 sequences

AMPKA_DICDI (Q54YF2), KIN10_ARATH (Q38997), KIN11_ARATH (P92958), 
KIN1_SCHPO  (P22987), KIN1_YEAST  (P13185), KIN2_YEAST  (P13186), 
MARK1_HUMAN (Q9P0L2), MARK1_MOUSE (Q8VHJ5), MARK1_RAT   (O08678), 
MARK2_HUMAN (Q7KZI7), MARK2_MOUSE (Q05512), MARK2_RAT   (O08679), 
MARK3_HUMAN (P27448), MARK3_MOUSE (Q03141), MARK3_RAT   (Q8VHF0), 
MARK4_HUMAN (Q96L34), MARK4_MOUSE (Q8CIP4), MELK_CAEEL  (U4PR86), 
MELK_DANRE  (F1QGZ6), MELK_HUMAN  (Q14680), MELK_MOUSE  (Q61846), 
MELK_XENLA  (Q91821), MELK_XENTR  (Q28GW8), MRKA_DICDI  (Q54DF2), 
MRKB_DICDI  (Q54MV2), MRKC_DICDI  (Q54TA3), PAR1_CAEBR  (A8WYE4), 
PAR1_CAEEL  (Q9TW45), RKIN1_SECCE (Q02723)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

1UL7; 1V5S; 3OSE

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission