Entry: PS50041
General information about the entry
Entry nameC_TYPE_LECTIN_2
Accession numberPS50041
Entry typeMATRIX
DateNOV-1997 (CREATED); NOV-1997 (DATA UPDATE); DEC-2011 (INFO UPDATE).
PROSITE DocumentationPDOC00537
Associated ProRulePRU00040
Name and characterization of the entry
DescriptionC-type lectin domain profile.
Matrix / Profile
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX'; LENGTH=117; TOPOLOGY=LINEAR;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=13; N2=113;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.218; R2=0.0128; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=647; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=545; N_SCORE=7.2; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; I=-20; D=-20;

                A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V   B   Z   X
/I:         B1=0;
/M: SY='Y'; M=-11, -7,-10,-14,-16,-10,-12,-18,  9, -1,  0,-10,  0, 22,-18,-11, -6,  8, 34, -4,-13,-12, -6;
/M: SY='G'; M= -2,  0,  3,  1,-17,  5,  4,  6, -1,-18,-15,  0, -9,-18, -8,  1, -6,-16,-11,-16,  1,  4, -5;
/M: SY='G'; M=  0, -3,  3, -1,-14, -5, -5, 13, -8,-18,-15, -4,-10,-15,-10,  3, -3,-17,-13,-13,  0, -5, -5;
/M: SY='H'; M= -6,  4, -1, -6,-17,  0, -3,-11, 11,-13,-12,  1, -5, -5,-12, -3, -5, -1,  8,-12, -4, -2, -5;
/M: SY='C'; M= -6,-18,-11,-18, 65,-16,-16,-19,-18,-20,-14,-18,-13,-13,-25, -3, -3,-33,-18, -8,-11,-16,-12;
/M: SY='Y'; M=-15, -9,-15,-17,-23,-10,-16,-24, 11,  0,  0,-10,  0, 26,-23,-15, -6, 20, 57, -6,-16,-16, -7;
/M: SY='Y'; M= -9,  0, -9,-13,-23, -5, -9,-18,  4, -8, -4, -1, -2,  1,-19,-12, -8,  6, 16, -9,-12, -8, -8;
/M: SY='F'; M= -5,-15,-16,-25,-17,-19,-19,-22,-10,  6,  9,-19,  4, 25,-19,-12, -6, -4, 13,  4,-20,-19, -7;
/M: SY='S'; M= -4, -9,  0, -8,-16, -7, -5, -8, -4, -9,-10,-10, -6,  0,-12,  4,  0,-19, -4, -7, -5, -6, -5;
/I:         MD=-18;
/M: SY='t'; D=-3; M= -4,  3, -1, -3,-18,  4,  4,-13, -5,-13,-12,  4, -5,-17, -5,  2,  3,-22,-10,-11, -2,  4, -5;
/I:         MD=-18;
/M: SY='e'; D=-3; M= -4, -3,  0,  4,-17,  1,  7, -8, -1,-14,-11, -1, -8,-15, -9,  2, -1,-20, -8,-10,  2,  4, -5;
/I:         MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; I=-8;
/M: SY='r'; D=-3; M= -2,  7, -4, -7,-21,  0, -1, -9, -8,-15,-13,  5, -7,-16, -1, -1, -2,-17,-10,-12, -7, -2, -6;
/I:         DM=-18;
/M: SY='k'; D=-3; M= -7, 10, -5, -9,-21,  1, -1,-17, -6, -9, -5, 10,  3,-11,-14, -8, -6,-18, -5, -7, -7,  0, -7;
/I:         DM=-18;
/M: SY='t'; D=-3; M=  0, -6,  4, -3,-13, -1, -1,-11, -6,-13,-16, -6,-11,-14, -6, 16, 20,-28,-11, -8,  0, -2, -2;
/I:         DM=-18;
/M: SY='w'; D=-3; M=-17,-16,-31,-33,-39,-17,-25,-19,-21,-13,-12,-17,-12, 17,-26,-31,-22,104, 27,-21,-32,-17,-15;
/I:         DM=-18;
/M: SY='a'; D=-3; M=  0, -6,  3,  1,-19,  0,  2, -9,  3,-15,-14, -4, -8,-15,-11,  2, -2,-24, -8,-12,  2,  0, -6;
/I:         DM=-18;
/M: SY='e'; D=-3; M= -9, -3,  6, 20,-24,  8, 20,-10,  1,-24,-18,  1,-15,-25, -8,  0, -6,-26,-13,-21, 14, 14, -8;
/I:         DM=-18;
/M: SY='A'; M= 37,-18, -8,-18, -4,-10,-10, -1,-18,-10,-10,-11,-10,-14,-11,  9,  0,-20,-17, -1, -9,-10, -1;
/M: SY='E'; M=-10,  9,  4,  9,-24,  9, 16,-15,  3,-21,-15,  6,-11,-22,-11, -1, -6,-26,-11,-20,  5, 12, -8;
/M: SY='L'; M= -3,  0, -3, -8,-20,  2,  0,-15, -5,-11, -6, -1, -3,-11,-14, -2, -3,-18, -6,-10, -6,  0, -7;
/M: SY='F'; M= -1,-11, -6,-10,-16,-12, -9,-15, -8, -7, -6,-11, -7,  5,-18, -1,  0,-12,  6, -3, -7,-10, -6;
/M: SY='C'; M= -9,-27,-18,-27,108,-27,-27,-28,-27,-27,-18,-27,-18,-17,-37, -9, -9,-45,-25, -9,-18,-27,-18;
/I:         MI=-32; MD=-32; IM=-32; I=-6;
/M: SY='q'; D=-6; M= -6,  7, -3, -6,-22, 10,  0,-11, -4,-12,-10,  4, -2,-18,-12, -3, -3,-18, -7,-12, -5,  4, -7;
/I:         DM=-32;
/M: SY='Q'; M= -6,  5, -1, -2,-21, 10,  5,-12, -2,-17,-14,  3, -5,-20,-13, -1, -6,-18,-10,-16, -2,  7, -8;
/M: SY='Q'; M= -6,  0,  0, -4,-20,  8,  4,-17,  2,-13, -9,  1, -2,-17,-14, -5, -7,-23, -6,-14, -2,  5, -8;
/I:         MI=-24; MD=-24; IM=-24; I=-5;
/M: SY='r'; D=-5; M= -1,  2,  1,  0, -6,  1,  0, -2,  4, -5, -3,  0,  0, -5, -4, -1, -1, -6, -1, -4,  0,  0, -2;
/I:         MD=-24; DM=-24;
/M: SY='p'; D=-5; M= -1, -1,  0, -1, -5, -1,  0, -3, -2, -3, -4,  0, -3, -3,  5,  0,  0, -5, -2, -4, -1, -1, -1;
/I:         MD=-24; DM=-24;
/M: SY='g'; D=-5; M= -4, -4,  5, -3,-23, -6, -7, 19, -5,-24,-21, -6,-13,-16,-16,  2, -8,-18,-11,-20, -1, -7, -7;
/I:         MD=-24; DM=-24;
/M: SY='g'; D=-5; M= 13,-15, -2,-10,-17,-12,-12, 24,-16,-21,-17,-13,-13,-20,-13,  9,  0,-22,-20,-12, -7,-12, -4;
/I:         DM=-24;
/M: SY='H'; M= -7, -1, 11,  8,-23,  4,  2,-13, 24,-23,-21, -4,-11,-21,-11,  2, -2,-30, -4,-20,  9,  1, -7;
/I:         MI=-32; MD=-10; IM=-32; I=-6;
/M: SY='l'; D=0; M=  0, -1, -1, -1, -1,  0,  0, -1,  0,  0,  0, -1,  0,  0, -1,  0,  0, -1,  0,  0, -1,  0,  0;
/I:         DM=-10;
/M: SY='L'; M=-10,-20,-29,-30,-20,-20,-20,-30,-20, 22, 47,-30, 19, 10,-29,-29,-10,-19,  0, 11,-30,-20,-10;
/M: SY='V'; M= 11,-19,-20,-25,-12,-19,-20,-19,-23, 12,  9,-18,  5, -5,-22, -5,  1,-25,-10, 21,-21,-19, -6;
/M: SY='S'; M=  9,-11,  0, -6,-12, -5, -5, -8,-14,-11,-17, -9,-12,-16,-12, 22, 17,-33,-16, -1, -3, -5, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-21,-34,-27,-21,-26,-35,-28, 37, 12,-25, 13, -1, -9,-17, -8,-22, -4, 25,-28,-27,-10;
/M: SY='Q'; M= -9,  4,  1,  0,-24, 10,  5,-18,  9,-17,-11,  0, -5,-20,-15, -4, -4,-25, -6,-17,  0,  6, -8;
/M: SY='S'; M=  0, -8, 18, 14,-15,  0,  3, -4, -5,-21,-27, -6,-20,-22,-11, 24, 12,-38,-18,-15, 15,  1, -3;
/I:         MD=-20;
/M: SY='q'; D=-4; M= -3,  0, -7, -7,-26,  6,  5,-14, -6,-15,-13,  0, -7,-19, -2, -4, -7,-17, -9,-16, -8,  4, -8;
/I:         MD=-20;
/M: SY='e'; D=-4; M=  2, -6,  0,  5,-22,  3, 16,-11, -1,-20,-15,  0,-13,-19, -9,  1, -5,-23, -9,-17,  3,  9, -6;
/I:         MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=-8;
/M: SY='e'; D=-4; M= -9,  0,  0, 18,-28, 18, 54,-18,  1,-28,-19,  9,-18,-28,  0,  0, -9,-28,-18,-28,  9, 36, -9;
/I:         DM=-20;
/M: SY='q'; D=-4; M= -4, -4,  4, -6,-23, 12,  0,-13, -1, -7, -9, -4, -2,-18,-15, -2, -6,-23, -9,-13, -1,  5, -8;
/I:         DM=-20;
/M: SY='e'; D=-4; M=  1,  0, 10, 11,-21,  4, 13, -9, -4,-23,-22,  5,-15,-25, -9,  6, -1,-30,-17,-18, 12,  9, -6;
/I:         DM=-20;
/M: SY='f'; D=-4; M=-11,-18,-18,-33,-19,-31,-25,-25,-14, -1,  6,-24, -1, 58,-26,-15, -7,  6, 27,  0,-25,-25, -8;
/I:         DM=-20;
/M: SY='L'; M= -4,-21,-26,-30,-19,-20,-23,-30,-23, 26, 29,-25, 15,  2,-26,-20, -6,-22, -3, 23,-28,-22, -9;
/M: SY='T'; M= -1, -3, -1, -9,-20, -1, -6,-14, -6, -9,-10, -5, -5,-12,-17,  0,  1,-14, -6, -7, -5, -4, -7;
/M: SY='S'; M= -4,  1,  4,  2,-21,  8,  7,-11, -3,-20,-20,  2,-12,-19,-12, 10,  2,-27,-10,-16,  2,  7, -6;
/M: SY='L'; M=-10, -6,-12,-18,-22, -6,-11,-25,  1,  1,  8,-11,  6, -2,-22,-14, -6,-16,  4, -2,-16,-10, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-18,-18,-26,-17,-18,-21,-22,-21, 17, 12,-19, 10, -1,-22, -9,  0,-23, -6, 18,-21,-20, -7;
/M: SY='K'; M= -5,  4,  1, -5,-23, -1, -1, -7, -7,-19,-20,  4,-11,-20, -6,  2,  0,-26,-14,-14, -3, -2, -7;
/I:         MD=-21;
/M: SY='a'; D=-4; M=  0,  0,  1,  0,-23,  1,  4, -9, -3,-20,-18,  2,-12,-18, -6,  1, -4,-22, -9,-17,  0,  1, -7;
/I:         MD=-21;
/M: SY='s'; D=-4; M= -5, -5, -2, -8,-17, -5, -4,-13, -7, -5, -6, -6, -3, -4,-13,  0,  0,-20, -4, -4, -6, -5, -6;
/I:         MD=-21;
/M: SY='n'; D=-4; M= -2, -3,  1, -3,-11, -4, -3, -2, -5, -5, -6, -3, -4, -6, -3,  0,  0,-13, -7, -5, -1, -4, -4;
/I:         MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=-8;
/M: SY='s'; D=-4; M=  0, -2,  1,  0,-13,  2,  1, -9, -6,-11,-12,  0, -8,-11, -9,  6,  3,-19, -8, -7,  0,  1, -4;
/I:         DM=-21;
/M: SY='y'; D=-4; M= -8, -5,  2, -1,-23, -3, -2,-13,  2,-11,-13, -5, -8, -7,-12, -2, -4,-14,  8,-13,  0, -5, -8;
/I:         DM=-21;
/M: SY='V'; M= -3,-16,-16,-24,-17,-15,-19,-23,-12,  4,  1,-17,  1, 10,-22, -7, -1, -7,  9,  6,-20,-17, -7;
/M: SY='W'; M=-20,-19,-38,-38,-47,-20,-29,-20,-26,-18,-17,-19,-18, 13,-29,-38,-28,138, 32,-27,-38,-20,-19;
/M: SY='I'; M= -9,-26,-20,-36,-26,-18,-27,-36,-27, 40, 22,-27, 19,  0,-20,-18, -6,-20,  0, 25,-27,-26, -9;
/M: SY='G'; M=  2,-19,  1, -9,-28,-18,-18, 61,-18,-37,-28,-18,-19,-28,-19,  1,-17,-20,-28,-27, -8,-18, -9;
/M: SY='L'; M= -7,-20,-26,-29,-20,-18,-21,-23,-20, 18, 37,-27, 18,  4,-27,-25,-10,-20, -2, 10,-27,-20, -9;
/M: SY='N'; M= -7,  5, 14, -1,-20,  4, -1,-12,  7,-17,-18, -1,-10,-14,-16,  7,  4,-29, -8,-16,  4,  0, -6;
/M: SY='D'; M=-12, -3,  6, 26,-26,  0,  9,-15, -2,-24,-19,  1,-17,-21,-13, -1, -6,-26, -5,-19, 18,  3, -8;
/M: SY='I'; M= -9, -5, -2, -4,-20, -2, -3,-14,-10, -8, -9, -6, -4,-18, -9, -5, -6,-28,-14, -8, -4, -4, -9;
/I:         MD=-21;
/M: SY='t'; D=-4; M= -3, -3,  3,  0,-17, -2, -2, -4, -7,-13,-13, -2, -8,-15, -7,  1,  1,-17,-10,-11,  1, -2, -5;
/I:         MD=-21;
/M: SY='t'; D=-4; M= -1, -5,  0, -6,-14, -3, -4,-12, -8, -3, -4, -3, -1, -8, -9,  0,  2,-18, -7, -2, -2, -3, -4;
/I:         MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; I=-8;
/M: SY='e'; D=-4; M= -5,  0, 10,  9,-23,  5, 14, -5, -3,-22,-20,  3,-15,-23, -5,  3, -4,-27,-17,-21,  9,  9, -7;
/I:         DM=-21;
/M: SY='g'; D=-4; M= -3, -7,  2, -2,-17, -9, -6, 20,-10,-27,-22, -5,-14,-24,-15,  0,-10,-25,-20,-20, -1, -8, -9;
/I:         DM=-21;
/M: SY='k'; D=-4; M= -5,  0,  3,  5,-23,  0,  4, -5, -3,-22,-20,  3,-12,-22, -8,  1, -2,-25,-12,-17,  4,  2, -7;
/I:         DM=-21;
/M: SY='W'; M=-17,-16,-25,-34,-33,-23,-25,-24,-18, -8, -5,-19, -7, 32,-27,-25,-17, 61, 27,-13,-30,-21,-13;
/M: SY='T'; M= -9,  3, -3, -4,-23,  5,  4,-21, -2,-12,-10,  0, -5,-16,-13, -2,  1,-25, -8, -9, -3,  3, -8;
/M: SY='W'; M=-20,-18,-36,-33,-47,-18,-27,-20,-25,-19,-18,-18,-18,  9,-29,-36,-27,133, 31,-28,-34,-18,-18;
/M: SY='S'; M=  2,-10, -8,-15,-15,-10,-12,-16,-16,  0, -7,-10, -1, -8,-13,  8,  8,-28,-10,  7,-12,-11, -5;
/M: SY='D'; M=-10, -9, 18, 35,-22, -3,  6,  0, -3,-28,-24, -3,-21,-28,-11,  5, -1,-33,-18,-21, 28,  1, -7;
/M: SY='G'; M=  0,-11,  2, -4,-23,-12,-12, 38,-14,-29,-24,-11,-16,-24,-16,  3, -8,-21,-22,-21, -3,-12, -7;
/I:         MD=-20;
/M: SY='t'; D=-5; M=  0, -6,  4,  0,-14, -1,  0, -6, -6,-15,-15, -5,-11,-16, -9, 13, 13,-27,-12,-10,  3,  0, -3;
/I:         MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; I=-8;
/M: SY='p'; D=-5; M= -3, -5, -8, -7,-18, -4, -1,-13, -9, -7,-10, -4, -6,-13, 11,  0,  1,-21,-12, -6, -9, -4, -5;
/I:         DM=-20;
/M: SY='v'; D=-5; M= -4,-13,-17,-20,-15,-14,-14,-22,-16, 10,  7,-14,  7,  0,-19, -8,  0,-17, -4, 14,-18,-14, -7;
/I:         DM=-20;
/M: SY='S'; M= -5, -1, 10,  6,-20,  2,  3, -7, -2,-15,-17, -2,-11,-20,-12,  6,  0,-28,-13,-14,  7,  2, -6;
/M: SY='Y'; M=-12,-11,-16,-23,-22,-15,-18,-24,  4, -2,  0,-13,  0, 34,-24,-15, -8, 14, 46, -6,-19,-18, -8;
/M: SY='T'; M= -4,  0, -3, -5,-18,  0,  3,-17,-11,-12,-10,  1, -7,-12,-11,  3,  9,-21, -9, -7, -3,  1, -5;
/M: SY='N'; M= -7, -2, 36, 11,-18, -1, -1, -4,  9,-17,-22, -2,-15,-12,-17,  6, -1,-29, -9,-22, 23, -2, -8;
/M: SY='W'; M=-18,-18,-36,-36,-44,-18,-27,-18,-26,-17,-17,-18,-17,  9,-27,-35,-26,133, 27,-26,-36,-18,-18;
/I:         MD=-20;
/M: SY='a'; D=-3; M=  4, -4,  0, -2,-14, -4, -2, -3, -5,-16,-13, -3,-10,-15,-14,  0, -5,-19, -7,-12,  0, -4, -6;
/I:         MD=-20;
/M: SY='p'; D=-3; M= -1, -4, -6, -5,-21, -4,  0,-13,-12,-13,-14, -1,-10,-16, 13,  0,  2,-21,-13,-12, -6, -3, -5;
/I:         MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; I=-8;
/M: SY='g'; D=-3; M=  0, -9,  5, -2,-17, -8, -7, 23, -9,-19,-15, -8,-10,-16,-12,  1, -5,-17,-16,-15,  0, -8, -5;
/I:         MD=-15; DM=-15;
/M: SY='e'; D=-3; M= -7,  3,  0,  5,-24, 20, 24,-15,  0,-19,-16,  7, -8,-24, -1,  0, -6,-20,-10,-21,  2, 21, -7;
/I:         MD=-15; DM=-15;
/M: SY='p'; D=-3; M= -7,-15,-14, -7,-31, -7,  0,-16,-15,-15,-23, -7,-15,-23, 63, -6, -7,-25,-23,-22,-14, -7, -7;
/I:         MD=-15; DM=-15;
/M: SY='n'; D=-3; M= -7,  0, 16, 15,-19,  0,  2, -2, -1,-21,-21,  0,-16,-20,-11,  4, -1,-23,-13,-18, 16,  0, -6;
/I:         MD=-15; DM=-15;
/M: SY='n'; D=-3; M= -5, -3, 13,  1,-15, -5, -5,  1, -1,-12,-13, -5, -8, -9,-12,  2, -2,-19, -9,-13,  6, -5, -6;
/I:         MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=-8;
/M: SY='k'; D=-3; M= -2,  2,  0, -3,-11,  0,  0, -4, -1, -7, -6,  1, -3, -8, -7,  0, -1,-11, -4, -6, -2,  0, -3;
/I:         DM=-20;
/M: SY='g'; D=-3; M=  0, -5,  2, -5,-17, -5, -7,  8, -8,-15,-13, -6, -8,-12,-14,  1, -4,-17,-11,-11, -2, -6, -6;
/I:         DM=-20;
/M: SY='e'; D=-3; M= -3,  1,  5,  1,-17,  3,  5, -3, -4,-15,-13,  1, -9,-16,-10,  1, -2,-20,-11,-13,  2,  4, -6;
/I:         DM=-20;
/M: SY='r'; D=-3; M= -4,  5,  4,  0,-22,  0,  1,  0, -7,-22,-21,  4,-13,-21, -4,  2, -3,-24,-16,-17,  0,  0, -6;
/I:         DM=-20;
/M: SY='E'; M= -4, -2,  0,  5,-24, 11, 24, -4,  0,-24,-19,  3,-13,-24, -6,  0, -8,-22,-13,-23,  2, 17, -7;
/M: SY='D'; M=-11, -2,  8, 17,-18, -2,  2, -9,  2,-22,-16, -1,-14,-18,-13, -3, -7,-24, -6,-19, 14,  0, -8;
/M: SY='C'; M= -8,-26,-17,-26,105,-26,-26,-26,-26,-26,-17,-26,-17,-17,-35, -8, -8,-44,-26, -8,-17,-26,-17;
/M: SY='V'; M=  4,-17,-20,-23,-11,-22,-22,-11,-23, 13,  2,-16,  4, -4,-22, -6, -2,-23,-11, 26,-21,-22, -7;
/M: SY='E'; M=  0, -8, -6, -7,-16, -2,  2,-14, -3, -7, -7, -7, -4, -9,-13,  2,  1,-21, -5, -2, -7,  0, -5;
/M: SY='L'; M= -6,-17,-20,-28,-18,-14,-20,-24,-15, 21, 22,-20, 22,  7,-21,-17, -7,-16,  0, 14,-23,-18, -8;
/I:         MD=-24;
/M: SY='y'; D=-5; M= -7,  1,  0, -5,-20, -1, -2,-16, -2,-10,-11,  0, -7, -6,-14,  0,  1,-12,  4, -9, -3, -3, -6;
/I:         MD=-24;
/M: SY='s'; D=-5; M=  0, -8, -5,-11,-19, -6, -9, -4,-14, -8,-11, -8, -7,-12, -8,  2,  2,-13, -9, -5, -9, -8, -5;
/I:         MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; I=-8;
/M: SY='g'; D=-5; M= -1, -8,  0, -8,-21, -9,-11, 32,-12,-23,-16, -8,-10,-19,-15, -2,-12,-16,-18,-17, -7,-10, -7;
/I:         DM=-24;
/M: SY='K'; M= -8, 11, -5, -8,-18,  5,  0,-18,  0,-14, -9, 10, -1,-13,-14, -8, -7,-17, -2,-12, -7,  1, -8;
/M: SY='W'; M=-17,-17,-35,-35,-44,-17,-26,-17,-26,-17,-17,-17,-17,  8,-26,-35,-26,132, 26,-26,-35,-17,-17;
/M: SY='N'; M= -8,  6, 21,  7,-20,  1,  1, -5,  2,-19,-20,  4,-12,-17,-14,  1, -4,-24,-12,-19, 14,  0, -8;
/M: SY='D'; M=-12, -6, 12, 36,-22, -3,  8,-10, -3,-23,-20, -2,-19,-25,-11,  1, -3,-32,-15,-16, 27,  2, -7;
/M: SY='E'; M= -6,  0, -2,  0,-20, -2,  2,-17, -6, -7, -7,  0, -5,-14,-13, -3, -3,-22, -7, -5, -1, -1, -7;
/M: SY='N'; M= -5, -5,  5,  0,-22, -4,  0,-10,  1,-16,-17, -4,-11,-13,  1,  0, -3,-22, -7,-15,  2, -3, -7;
/M: SY='C'; M= -8,-26,-17,-26,105,-26,-26,-26,-26,-26,-17,-26,-17,-17,-35, -8, -8,-44,-26, -8,-17,-26,-17;
/M: SY='E'; M= -6, -1,  7,  5,-20,  2,  6, -4, -1,-18,-15, -2,-11,-18,-10,  2, -2,-24,-12,-16,  5,  3, -6;
/M: SY='K'; M= -6,  3, -2,  0,-20,  6,  4,-15,  0,-13,-13,  4, -6,-15,-12, -1, -4,-16, -1,-10, -1,  4, -7;
/M: SY='K'; M= -6,  6, -2, -4,-21,  4,  2,-15, -1,-14,-14,  7, -6,-15, -4, -2, -2,-18, -5,-13, -4,  2, -6;
/M: SY='L'; M= -8,  4, -5,-11,-18, -3, -6,-18, -1, -6,  1,  1,  1, -3,-18,-12, -7,-13,  2, -7, -8, -6, -8;
/M: SY='P'; M= -4, -2, -3, -8,-22, -6, -5, -5, -8,-13,-11, -4, -8,-12,  5, -4, -5,-18,-10,-14, -7, -7, -7;
/M: SY='F'; M= -5,-13,-15,-22,-19,-17,-17,-18, -7, -3, -1,-14, -3, 26,-21, -9, -5, 16, 26, -3,-18,-17, -7;
/M: SY='V'; M= -3,-19,-19,-26,-15,-19,-22,-26,-22, 27, 15,-20, 11,  0,-20,-11, -2,-20, -4, 26,-23,-22, -7;
/M: SY='C'; M= -8,-24,-16,-24, 99,-24,-24,-24,-24,-24,-16,-24,-16,-16,-33, -8, -8,-41,-24, -8,-16,-24,-16;
/M: SY='K'; M= -6, 12,  0,  4,-20, 12, 18,-13, -3,-19,-17, 22, -8,-21, -4, -3, -6,-15, -9,-16,  2, 15, -6;
/I:         E1=0;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 01, total number of sequence entries in that release: 534242.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 680 hits in 581 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 680 hits in 581 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 18
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 28
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 97.42 %
Comments
  • MATRIX_TYPE: protein_domain
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: K_Hofmann
  • Taxonomic range: Archaebacteria, Eukaryotes, Eukaryotic viruses
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 10
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: C-type lectin
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-ProtTrue positive hits:
209L2_MACMU (Q8MIS5), A16_ANOGA   (Q93118), A29AB_DROME (O46197), 
A29AB_DROSI (Q9U968), A40_VACCC   (P21063), A40_VACCW   (P24765), 
ABA1_CRYAB  (P81111), ABA2_CRYAB  (P81112), ABA3_CRYAB  (P81113), 
ABA4_CRYAB  (P81114), ABBA_CRYAB  (P81115), ABBB_CRYAB  (P81116), 
ACAL_ANSAN  (P83300), AGGA1_DEIAC (Q8JIV9), AGGA2_DEIAC (Q8AYA5), 
AGGA_CALRH  (Q9I841), AGGB1_DEIAC (Q8AYA4), AGGB2_DEIAC (Q8AYA3), 
AGGB_CALRH  (Q9I840), AGKCA_DEIAC (Q9DEA2), AGKCB_DEIAC (Q9DEA1), 
AJL2_ANGJA  (Q90WJ8), ASGR1_HUMAN (P07306), ASGR1_MOUSE (P34927), 
ASGR1_PONAB (Q5RBQ8), ASGR1_RAT   (P02706), ASGR2_HUMAN (P07307), 
ASGR2_MOUSE (P24721), ASGR2_RAT   (P08290), ATRN1_HUMAN (Q5VV63), 
ATRN1_MOUSE (Q6A051), ATRN_HUMAN  (O75882), ATRN_MOUSE  (Q9WU60), 
ATRN_RAT    (Q99J86), BJCA_BOTJA  (Q56EB1), BJCB_BOTJA  (Q56EB0), 
BOTA_BOTIN  (P0C929), BOTB_BOTIN  (P0C930), C1QR1_HUMAN (Q9NPY3), 
C1QR1_MOUSE (O89103), C1QR1_RAT   (Q9ET61), C209A_MOUSE (Q91ZX1), 
C209B_MOUSE (Q8CJ91), C209C_MOUSE (Q91ZW9), C209D_MOUSE (Q91ZW8), 
C209E_MOUSE (Q91ZW7), CD209_CHLAE (P60883), CD209_GORGO (Q8HXZ8), 
CD209_HUMAN (Q9NNX6), CD209_HYLLA (Q8HY03), CD209_HYLSY (Q8HY02), 
CD209_MACMU (Q95J96), CD209_MACNE (Q95LC6), CD209_NOMCO (Q8HY01), 
CD209_PANTR (Q8HXZ7), CD209_PAPHA (Q8HY04), CD209_PONPY (Q8HY00), 
CD248_HUMAN (Q9HCU0), CD248_MOUSE (Q91V98), CD302_BOVIN (A8WH74), 
CD302_HUMAN (Q8IX05), CD302_MOUSE (Q9DCG2), CD302_PIG   (A8WH75), 
CD302_RAT   (Q5FVR3), CD302_TRIVU (A8WH72), CD69_HUMAN  (Q07108), 
CD69_MOUSE  (P37217), CD72_HUMAN  (P21854), CHBBA_CROHO (P81508), 
CHBBB_CROHO (P81509), CHODL_HUMAN (Q9H9P2), CHODL_MOUSE (Q9CXM0), 
CL12A_HUMAN (Q5QGZ9), CL12B_BOVIN (Q2NL33), CL12B_HUMAN (Q2HXU8), 
CL12B_MOUSE (Q149M0), CL160_CAEBR (A8XP79), CL160_CAEEL (P34393), 
CL161_CAEEL (P34472), CL162_CAEEL (P34312), CL17A_HUMAN (Q6ZS10), 
CL180_CAEEL (Q19970), CL18A_HUMAN (A5D8T8), CL18A_MOUSE (Q7TSQ1), 
CL18B_HUMAN (Q6UXF7), CL18C_HUMAN (Q8NCF0), CL19A_HUMAN (Q6UXS0), 
CL2D2_RAT   (A4KWA5), CL2D3_RAT   (A4KWA6), CL2D5_RAT   (Q925N7), 
CL2D6_RAT   (A4KWA8), CL2DB_RAT   (Q0H8B9), CL2DR_RAT   (Q5M9I1), 
CL43_BOVIN  (P42916), CL46_BOVIN  (Q8MHZ9), CLC10_HUMAN (Q8IUN9), 
CLC11_HUMAN (Q9Y240), CLC11_MOUSE (O88200), CLC11_RAT   (O88201), 
CLC14_HUMAN (Q86T13), CLC14_MOUSE (Q8VCP9), CLC1A_BOVIN (Q0VCS6), 
CLC1A_HUMAN (Q8NC01), CLC1A_MOUSE (Q8BWY2), CLC1B_HUMAN (Q9P126), 
CLC1B_MOUSE (Q9JL99), CLC2A_HUMAN (Q6UVW9), CLC2B_HUMAN (Q92478), 
CLC2D_HUMAN (Q9UHP7), CLC2D_MOUSE (Q91V08), CLC2E_MOUSE (Q80XD9), 
CLC2F_MOUSE (Q8VI21), CLC2G_MOUSE (Q9D676), CLC2H_MOUSE (Q8C1T8), 
CLC2I_MOUSE (Q9WVF9), CLC2L_HUMAN (P0C7M8), CLC2L_MOUSE (P0C7M9), 
CLC2L_RAT   (Q0ZCA7), CLC3A_BOVIN (Q28008), CLC3A_HUMAN (O75596), 
CLC3A_MOUSE (Q9EPW4), CLC3A_XENLA (Q66KU1), CLC4A_HUMAN (Q9UMR7), 
CLC4A_MOUSE (Q9QZ15), CLC4A_RAT   (Q67EQ0), CLC4C_HUMAN (Q8WTT0), 
CLC4D_HUMAN (Q8WXI8), CLC4D_MOUSE (Q9Z2H6), CLC4D_RAT   (Q69FH1), 
CLC4E_HUMAN (Q9ULY5), CLC4E_MOUSE (Q9R0Q8), CLC4E_RAT   (Q67EQ1), 
CLC4F_HUMAN (Q8N1N0), CLC4F_MOUSE (P70194), CLC4F_RAT   (P10716), 
CLC4G_HUMAN (Q6UXB4), CLC4G_MOUSE (Q8BNX1), CLC4K_HUMAN (Q9UJ71), 
CLC4K_MOUSE (Q8VBX4), CLC4M_GORGO (Q8HY06), CLC4M_HUMAN (Q9H2X3), 
CLC4M_HYLLA (Q8HY12), CLC4M_HYLSY (Q8HY11), CLC4M_NOMCO (Q8HY10), 
CLC4M_PANTR (Q8HYC0), CLC5A_HUMAN (Q9NY25), CLC5A_MOUSE (Q9R007), 
CLC5A_PIG   (Q9GLF3), CLC6A_BOVIN (Q3LUH2), CLC6A_HUMAN (Q6EIG7), 
CLC6A_MOUSE (Q9JKF4), CLC6A_RAT   (D3ZWT9), CLC7A_BOVIN (Q49BZ4), 
CLC7A_HUMAN (Q9BXN2), CLC7A_MACMU (Q8HZR8), CLC7A_MOUSE (Q6QLQ4), 
CLC87_CAEBR (A8WUV1), CLC87_CAEEL (Q9XVS3), CLC88_CAEEL (Q86NG3), 
CLC91_CAEEL (Q94417), CLC9A_HUMAN (Q6UXN8), CLC9A_MOUSE (Q8BRU4), 
CLC9A_RAT   (D4AD02), CLEC1_BITGA (Q6T7B7), CLEC1_BUNFA (Q90WI8), 
CLEC1_BUNMU (Q90WI6), CLEC2_BITGA (Q6T7B6), CLEC2_BUNFA (Q90WI7), 
CLEC2_BUNMU (A1XXJ9), CLEC3_BITGA (Q6T7B5), CLEC3_DABRU (Q4PRD0), 
CLEC4_DABRU (Q4PRC9), CLEC5_DABRU (Q4PRC8), CLEC6_DABRU (Q4PRC7), 
CLEC7_DABRU (Q4PRC6), CLECA_PHIOL (Q09GJ8), CLECB_PHIOL (Q09GK0), 
CLEC_CERRY  (D8VNS6), COL10_CHICK (Q2LK95), COL10_HUMAN (Q9Y6Z7), 
COL10_MOUSE (Q8CF98), COL10_XENTR (Q5M8X6), COL11_BOVIN (Q17QH6), 
COL11_CHICK (Q2LK94), COL11_DANRE (Q5U3G1), COL11_HUMAN (Q9BWP8), 
COL11_MOUSE (Q3SXB8), COL11_XENLA (Q7T0T0), COL12_BOVIN (A6QP79), 
COL12_CHICK (Q2LK54), COL12_DANRE (A5PMY6), COL12_HUMAN (Q5KU26), 
COL12_MOUSE (Q8K4Q8), COL12_RAT   (Q4V885), CONG_BOVIN  (P23805), 
CRC0_CRODU  (Q719L8), CRC1_CRODU  (Q719L9), CSPG2_BOVIN (P81282), 
CSPG2_CHICK (Q90953), CSPG2_HUMAN (P13611), CSPG2_MACNE (Q28858), 
CSPG2_MOUSE (Q62059), CSPG2_RAT   (Q9ERB4), CTL1_BITAR  (Q6X5T5), 
CTL1_ECHCS  (Q6X5S9), CTL1_ECHOC  (Q6X5T0), CTL1_ECHPL  (Q6X5S3), 
CTL27_ECHOC (Q6X5S5), CTL2_BITAR  (Q6X5T4), CTL2_ECHOC  (Q6X5S7), 
CTL3_ECHCS  (Q6X5S8), CTL4_ECHPL  (Q6X5S2), CTL5_BITAR  (Q6X5T3), 
CTL5_ECHPL  (Q6X5S1), CTL6_BITAR  (Q6X5T2), CTL7_ECHPL  (Q6X5S0), 
CTL8_BITAR  (Q6X5T1), CTL8_ECHCS  (Q6X5S6), CTL9_ECHCS  (Q6X5S4), 
CVXA_CRODU  (O93426), CVXB_CRODU  (O93427), DABA_DABRU  (Q38L02), 
DCAL1_DRONO (P84615), DCAL2_DRONO (P84616), ECHA_ECHCA  (Q7T248), 
ECHA_ECHCS  (P81017), ECHB_ECHCA  (Q7T247), ECHB_ECHCS  (P81996), 
EM16A_ECHML (Q7T2Q1), EM16B_ECHML (Q7T2Q0), EMBP1_CAVPO (P22032), 
EMBP2_CAVPO (P35709), FCER2_HUMAN (P06734), FCER2_MOUSE (P20693), 
FICA_GLOBR  (Q9YGN5), FICB_GLOBR  (Q9YGN4), FLOA_PROFL  (Q8AV97), 
FLOB_PROFL  (Q8AV98), FREM1_HUMAN (Q5H8C1), FREM1_MOUSE (Q684R7), 
GPIBA_BOTJA (Q9PSM6), GPIBB_BOTJA (Q9PSM5), HMU_HALWD   (Q18DN4), 
IDD_HUMAN   (P98153), IDD_MOUSE   (P98154), ISP2_HEMAM  (P05140), 
ISP2_OSMMO  (Q01758), IXA_GLOHA   (Q7SZV0), IXA_PROFL   (Q7LZ71), 
IXXA_GLOHA  (Q9DG39), IXXA_PROFL  (P23806), IXXA_VIRST  (Q71RR4), 
IXXB1_VIRST (Q71RR2), IXXB2_VIRST (Q71RR1), IXXB3_VIRST (Q71RR0), 
IXXB_GLOHA  (Q9DG31), IXXB_PROFL  (P23807), JENA_PROJR  (E2DQZ6), 
JENB_PROJR  (E2DQZ5), KLRA1_MOUSE (P20937), KLRA2_MOUSE (Q60660), 
KLRA3_MOUSE (Q64329), KLRA4_MOUSE (Q60651), KLRA5_MOUSE (Q60652), 
KLRA6_MOUSE (Q60653), KLRA7_MOUSE (Q60654), KLRA8_MOUSE (Q60682), 
KLRB1_HUMAN (Q12918), KLRBA_MOUSE (P27811), KLRBA_RAT   (P27471), 
KLRBC_MOUSE (P27814), KLRBF_MOUSE (Q8VD98), KLRBF_RAT   (Q63378), 
KLRBG_MOUSE (Q0ZUP1), KLRBG_RAT   (Q0ZUP0), KLRD1_BOVIN (Q863H3), 
KLRD1_CANFA (Q38HS3), KLRD1_HUMAN (Q13241), KLRD1_MACMU (Q9MZK9), 
KLRD1_MOUSE (O54707), KLRD1_PANTR (Q9MZ41), KLRD1_PONPY (Q8MHY9), 
KLRD1_RAT   (O35778), KLRF1_HUMAN (Q9NZS2), KLRF1_MACFA (Q8MI05), 
KLRF2_HUMAN (D3W0D1), KLRG1_HUMAN (Q96E93), KLRG1_MOUSE (O88713), 
KLRG1_RAT   (Q64335), KLRG2_HUMAN (A4D1S0), KLRG2_MOUSE (Q3UM83), 
KRBBA_MOUSE (P27812), KRBBA_RAT   (A4KWA1), KRBBB_MOUSE (Q99JB4), 
KRBBB_RAT   (Q5NKN4), KRBBC_RAT   (Q5NKN2), LAYN_CRIGR  (Q9Z209), 
LAYN_HUMAN  (Q6UX15), LAYN_MOUSE  (Q8C351), LC1_DABRU   (Q4PRD1), 
LC1_MACLB   (Q7T045), LC2_DABRU   (Q4PRD2), LC2_MACLB   (Q696W1), 
LEC1_ENHPO  (A7X3W1), LEC1_LAPHA  (A3FM55), LEC1_LEIMD  (A7X401), 
LEC1_LIOPO  (A7X3Z4), LEC1_PHIOL  (A7X406), LEC1_SISCA  (B0VXV0), 
LEC2_ENHPO  (A7X3W6), LEC2_LIOPO  (A7X3Z7), LEC2_MEGRO  (P17346), 
LEC2_PHIOL  (A7X409), LEC2_SISCA  (B0VXV1), LEC3_ENHPO  (A7X3X0), 
LEC3_LIOPO  (A7X413), LEC3_MEGRO  (P07439), LEC3_SISCA  (B0VXV2), 
LEC4_ENHPO  (A7X3X3), LEC5_ENHPO  (A7X3X8), LEC6_ENHPO  (A7X3Y2), 
LEC7_ENHPO  (A7X3Y6), LECA1_MACLB (B4XSY4), LECA2_MACLB (B4XSZ2), 
LECA3_MACLB (B4XSZ3), LECA4_MACLB (B4XSZ4), LECA5_MACLB (B4XSZ5), 
LECA6_MACLB (B4XSZ6), LECA7_MACLB (B4XSZ7), LECA8_MACLB (B4XSZ8), 
LECA9_MACLB (B4XSZ9), LECAA_BOTAS (P0DJC8), LECAA_MACLB (B4XSY5), 
LECAB_BOTAS (P0DJC9), LECAB_MACLB (B4XSY6), LECAC_MACLB (B4XSY7), 
LECAD_MACLB (B4XSY8), LECAE_MACLB (B4XSY9), LECAF_MACLB (B4XSZ0), 
LECAG_MACLB (B4XSZ1), LECA_PLEWA  (Q02988), LECA_SARPE  (P05047), 
LECB1_MACLB (B4XT00), LECB2_MACLB (B4XT01), LECB3_MACLB (B4XT02), 
LECB4_MACLB (B4XT03), LECB6_MACLB (B4XT05), LECB7_MACLB (B4XT06), 
LECB8_MACLB (B4XT07), LECB9_MACLB (B4XT08), LECBA_BITAR (Q7LZK5), 
LECBA_BOTJA (P22029), LECBB_BITAR (Q7LZK8), LECBB_BOTJA (P22030), 
LECC_POLMI  (P16108), LECE_ANTCR  (P06027), LECG_BITAR  (Q9PSN0), 
LECG_BOTIN  (Q6QX33), LECG_BOTJR  (P83519), LECG_BOTPA  (P86970), 
LECG_CROAT  (P21963), LECG_CRORU  (P84987), LECG_LACST  (Q9PSM4), 
LECG_VIRST  (Q9YGP1), LECH_CHICK  (P02707), LEC_THRJA   (A7X3Z0), 
LFC_CARRO   (Q26422), LFC_TACTR   (P28175), LIT1_MOUSE  (P43137), 
LIT2_MOUSE  (Q08731), LITH_BOVIN  (P23132), LITH_PIG    (Q29191), 
LITH_RAT    (P10758), LPSBP_PERAM (P26305), LY75_HUMAN  (O60449), 
LY75_MESAU  (Q920P9), LY75_MOUSE  (Q60767), LYAM1_BOVIN (P98131), 
LYAM1_HUMAN (P14151), LYAM1_MACMU (Q95198), LYAM1_MOUSE (P18337), 
LYAM1_PANTR (Q95237), LYAM1_PAPHA (Q28768), LYAM1_PONPY (Q95235), 
LYAM1_RAT   (P30836), LYAM2_BOVIN (P98107), LYAM2_CANFA (P33730), 
LYAM2_HORSE (Q95LG1), LYAM2_HUMAN (P16581), LYAM2_MOUSE (Q00690), 
LYAM2_PIG   (P98110), LYAM2_RABIT (P27113), LYAM2_RAT   (P98105), 
LYAM3_BOVIN (P42201), LYAM3_HUMAN (P16109), LYAM3_MOUSE (Q01102), 
LYAM3_RAT   (P98106), LYAM3_SHEEP (P98109), MBL1_MOUSE  (P39039), 
MBL1_PIG    (Q5U9S1), MBL1_RAT    (P19999), MBL2_BOVIN  (O02659), 
MBL2_CALJA  (Q66S61), MBL2_CHLAE  (Q66S37), MBL2_GORGO  (Q66S60), 
MBL2_HUMAN  (P11226), MBL2_HYLLA  (Q66S54), MBL2_MACFA  (Q66S50), 
MBL2_MOUSE  (P41317), MBL2_NOMCO  (Q66S58), MBL2_PANTR  (Q66S63), 
MBL2_PAPPA  (Q66S65), MBL2_PIG    (Q9XSW3), MBL2_PONPY  (Q66S64), 
MBL2_RAT    (P08661), MBL2_SAGOE  (Q66S62), MBL2_TRACR  (Q66S45), 
MBL2_TRAOB  (Q66S41), MMGL_MOUSE  (P49300), MMGL_RAT    (P49301), 
MMHA_GLOBL  (Q9YGG9), MMHB_GLOBL  (Q9YI92), MRC1_HUMAN  (P22897), 
MRC1_MOUSE  (Q61830), MRC2_HUMAN  (Q9UBG0), MRC2_MOUSE  (Q64449), 
MRC2_RAT    (Q4TU93), MUCA_PROMU  (Q6TPH0), MUCB_PROMU  (Q6TPG9), 
NATTE_THANI (Q66S03), NCAN_HUMAN  (O14594), NCAN_MOUSE  (P55066), 
NCAN_PANTR  (Q5IS41), NCAN_RAT    (P55067), NKG2A_HUMAN (P26715), 
NKG2A_MACMU (Q9MZJ3), NKG2A_PANTR (Q95MI5), NKG2C_HUMAN (P26717), 
NKG2C_MACMU (Q9MZK6), NKG2C_PANTR (Q9GME8), NKG2D_HUMAN (P26718), 
NKG2D_MACFA (P61252), NKG2D_MACMU (Q9MZJ7), NKG2D_MOUSE (O54709), 
NKG2D_PANTR (Q9MZ37), NKG2D_PIG   (Q9GLF5), NKG2D_PONPY (Q8MJH1), 
NKG2D_RAT   (O70215), NKG2E_HUMAN (Q07444), NKG2E_PANTR (Q95MI4), 
OC17_CHICK  (Q9PRS8), OLR1_BOVIN  (P79391), OLR1_HUMAN  (P78380), 
OLR1_MOUSE  (Q9EQ09), OLR1_PIG    (Q9TTK7), OLR1_RABIT  (Q9XTA8), 
OLR1_RAT    (O70156), PBCG_MESAU  (Q92778), PGCA_BOVIN  (P13608), 
PGCA_CANFA  (Q28343), PGCA_CHICK  (P07898), PGCA_HUMAN  (P16112), 
PGCA_MOUSE  (Q61282), PGCA_RAT    (P07897), PGCB_BOVIN  (Q28062), 
PGCB_HUMAN  (Q96GW7), PGCB_MOUSE  (Q61361), PGCB_RAT    (P55068), 
PK1L2_HUMAN (Q7Z442), PK1L2_MOUSE (Q7TN88), PKD1_HUMAN  (P98161), 
PKD1_MOUSE  (O08852), PLA2R_BOVIN (P49259), PLA2R_HUMAN (Q13018), 
PLA2R_MOUSE (Q62028), PLA2R_PONAB (Q5R880), PLA2R_RABIT (P49260), 
PLCL_MYTGA  (P86854), PLC_HALLA   (P82596), PLI10_BOTMO (B1A4Q0), 
PLI11_BOTNU (B1A4Q5), PLI2_LACMU  (B1A4R0), PLI3_BOTMO  (B1A4P6), 
PLI4_BOTMO  (B1A4P7), PLI5_BOTMO  (B1A4P8), PLI6_BOTNU  (B1A4Q3), 
PLI8_BOTMO  (B1A4P9), PLI9_LACMU  (B1A4R4), PLIA1_BOTNU (B1A4Q2), 
PLIA4_CRODU (B1A4Q6), PLIA_BOTJR  (B2D1Y0), PLIA_GLOBS  (P82142), 
PLIA_PROFL  (P21755), PLIB4_CRODU (B1A4Q9), PLIB_PROFL  (P21756), 
PLILP_ELAQU (Q8AXS4), PLIP_BOTMO  (Q8AYA2), PLI_ATRNM   (A1XRN2), 
PLI_BOTAL   (B1A4M7), PLI_BOTER   (B1A4N2), PLI_BOTJA   (B1A4N8), 
PLI_BOTJR   (B1A4P2), PM27_STRPU  (Q26616), PRG2_HUMAN  (P13727), 
PRG2_MOUSE  (Q61878), PRG2_RAT    (Q63189), PRG3_HUMAN  (Q9Y2Y8), 
PRG3_MOUSE  (Q9JL95), RCAL1_RHEAM (P84617), RCAL2_RHEAM (P84618), 
REG1A_HUMAN (P05451), REG1B_HUMAN (P48304), REG3A_HUMAN (Q06141), 
REG3A_MOUSE (O09037), REG3A_RAT   (P35231), REG3B_MOUSE (P35230), 
REG3B_RAT   (P25031), REG3G_HUMAN (Q6UW15), REG3G_MOUSE (O09049), 
REG3G_RAT   (P42854), REG4_HUMAN  (Q9BYZ8), REG4_MOUSE  (Q9D8G5), 
REG4_RAT    (Q68AX7), RHCA_CALRH  (P81397), RHCB_CALRH  (P81398), 
SCAL1_STRCA (P83514), SCAL2_STRCA (P83515), SFPA2_HUMAN (Q8IWL1), 
SFTA1_HUMAN (Q8IWL2), SFTPA_BOVIN (Q6RXL1), SFTPA_CANFA (P06908), 
SFTPA_CAVPO (P50403), SFTPA_HORSE (Q95L88), SFTPA_MACMU (Q9TUC5), 
SFTPA_MOUSE (P35242), SFTPA_PIG   (P49874), SFTPA_RABIT (P12842), 
SFTPA_RAT   (P08427), SFTPA_SHEEP (Q9TT06), SFTPD_BOVIN (P35246), 
SFTPD_HUMAN (P35247), SFTPD_MACMU (Q1PBC5), SFTPD_MOUSE (P50404), 
SFTPD_PIG   (Q9N1X4), SFTPD_RAT   (P35248), SJL1_STIJA  (Q7M3Y0), 
SM30A_STRPU (Q26646), SM30_HEMPU  (Q25116), SM30_STRPU  (P28163), 
SM34_LYTPI  (Q05904), SM41_HEMPU  (Q26264), SM50_STRPU  (P11994), 
STAA_VIRST  (Q71RQ1), STAB1_VIRST (Q71RQ0), STAB2_VIRST (Q71RP9), 
STAB3_VIRST (Q71RP8), STBA1_VIRST (Q71RQ7), STBB1_VIRST (Q71RQ9), 
STBB2_VIRST (Q71RQ8), SUREJ_STRPU (Q26627), SVLEC_DEIAC (Q8JIV8), 
TETN_BOVIN  (Q2KIS7), TETN_CARSP  (P26258), TETN_HUMAN  (P05452), 
TETN_MOUSE  (P43025), TMVAA_PROMU (Q8JGT7), TMVAB_PROMU (Q8JGT6), 
TRBM_CANFA  (Q5W7P8), TRBM_HUMAN  (P07204), TRBM_MOUSE  (P15306), 
TRBM_SAISC  (Q71U07), TRIMA_PROMU (Q5FZI6), TRIMB_PROMU (Q5FZI5), 
V008_FOWPN  (P14370), V239_FOWPN  (P14371), XA1_DEIAC   (Q9IAM1), 
XA2_DEIAC   (Q9DEF9), XB1_DEIAC   (Q8JIW1), XB2_DEIAC   (Q9DEF8), 
Y1523_ARATH (Q9C823), YA021_HUMAN (Q6ZU45)
False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile):
A34_VACCC   (P21057), A34_VACCW   (P24761), A34_VAR67   (P33851), 
CD72_MOUSE  (P21855), CL12A_MOUSE (Q504P2), CLCL1_HUMAN (Q8IZS7), 
GP42_EBVA8  (Q1HVG2), GP42_EBVB9  (P03205), GP42_EBVG   (P0C6Z5), 
PK1L3_HUMAN (Q7Z443), PK1L3_MOUSE (Q2EG98), PLIB1_CRODU (B1A4Q8), 
UPL5_ARATH  (Q9SU29), V001_FOWPN  (Q9ICH6), V003_FOWPN  (Q9ICC1), 
V198_FOWPN  (Q9J535), VG51_EHV2   (Q66653), VGA7_ALHV1  (O36400)
`Potential' hits (partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences):
BAT_BOTAL   (P0C8I9), BIT2_BITAR  (P0C8I8), BOTR_BOTJA  (P22028), 
CA114_ECHCA (Q9PRP7), CA117_ECHCA (Q9PRP8), CLEC1_DABRR (P86533), 
CLEC2_DABRR (P86534), CVXB_CROAT  (P0CV88), IXXA_BOTJA  (Q9PS05), 
IXXB_BOTJA  (Q9PS06), LC11_VIPAA  (P0C8J2), LC12_VIPAA  (P0C8J3), 
LC21_VIPAA  (P0C8J4), LC22_VIPAA  (P0C8J5), LC22_VIPAP  (Q7LZ24), 
LEBCA_MACLB (P84038), LEBCB_MACLB (P84037), LECG_BOTJA  (Q9PRY7), 
LECJ3_BOTJA (P0C6S5), MULR_ECHML  (P81798), OPXA_OPHHA  (P0C8J0), 
OPXB_OPHHA  (P0C8J1), PGCA_PIG    (Q29011), PGCA_RABIT  (Q28670), 
PGCB_FELCA  (P41725), TMC47_THAMA (P69438), TOKAA_PROTO (Q7LZK6), 
TOKAB_PROTO (Q7LZI6)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]
1AFA; 1AFB; 1AFD; 1B08; 1B6E; 1BCH; 1BCJ; 1BJ3; 1BUU; 1BV4; 1BYF; 1C3A; 1DV8; 1E87; 1E8I; 1EGG; 1EGI; 1ESL; 1FIF; 1FIH; 1FM5; 1FVU; 1G1Q; 1G1R; 1G1S; 1G1T; 1GIE; 1GZ2; 1H8U; 1HLI; 1HLJ; 1HQ8; 1HTN; 1HUP; 1HYR; 1IJK; 1IOD; 1IXX; 1J34; 1J35; 1JSK; 1JWI; 1JZN; 1K9I; 1K9J; 1KCG; 1KJA; 1KJB; 1KJD; 1KJE; 1KMB; 1KWT; 1KWU; 1KWV; 1KWW; 1KWX; 1KWY; 1KWZ; 1KX0; 1KX1; 1KZA; 1KZB; 1KZC; 1KZD; 1KZE; 1LIT; 1MPU; 1MSB; 1MUQ; 1OZ7; 1P4L; 1PW9; 1PWB; 1QDD; 1QO3; 1R13; 1R14; 1RDI; 1RDJ; 1RDK; 1RDL; 1RDM; 1RDN; 1RDO; 1RJH; 1RTM; 1SB2; 1SL4; 1SL5; 1SL6; 1T8C; 1T8D; 1TDQ; 1TLG; 1TN3; 1U0N; 1U0O; 1UEX; 1UKM; 1UMR; 1UOS; 1UV0; 1V4L; 1V7P; 1WT9; 1X2T; 1X2W; 1XAR; 1XPH; 1Y17; 1YPO; 1YPQ; 1YPU; 1YTT; 1YXJ; 1YXK; 1Z0Y; 2AFP; 2B6B; 2BPD; 2BPE; 2BPH; 2BRS; 2C6U; 2CL8; 2E3X; 2GGU; 2GGX; 2GO0; 2H2R; 2H2T; 2IDP; 2IJ6; 2ILO; 2ILW; 2IM4; 2IMV; 2IMX; 2IMY; 2INM; 2INO; 2IT5; 2IT6; 2KMB; 2KV3; 2MSB; 2ORJ; 2ORK; 2OS9; 2OX8; 2OX9; 2RIA; 2RIB; 2RIC; 2RID; 2RIE; 2VRP; 2XR5; 2XR6; 2YHF; 3BDW; 3BX4; 3C22; 3C8J; 3C8K; 3CAD; 3CCK; 3CDG; 3CFW; 3CII; 3DBZ; 3FF7; 3FF8; 3FF9; 3G81; 3G83; 3G84; 3GPR; 3HUP; 3IKN; 3IKP; 3IKQ; 3IKR; 3KMB; 3KQG; 3M9Z; 3P5D; 3P5E; 3P5F; 3P5G; 3P5H; 3P5I; 3P7F; 3P7G; 3P7H; 3PAK; 3PAQ; 3PAR; 3PBF; 3T3A; 4KMB;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)


If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or