Entry: PS50051

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MCM_2
Accession [info] PS50051
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-1997 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00662

Name and characterization of the entry

Description [info] MCM family domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=207;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=202;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.1582; R2=.01270854; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-35735.67456; R2=66.21893; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=931; N_SCORE=12.0; H_SCORE=44191; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=656; N_SCORE=8.5; H_SCORE=7704; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-37,-28,  6,-36,-28, 39,-29, 24, 18,-23,-24,-22,-26,-21, -9, 27,-20,  0,-28;
/M: SY='Y'; M=-17,-20,-28,-21,-18, 27,-24,  9, -1,-14,  0, -1,-17,-27,-14,-13,-17,-11, -7, 14, 51,-19;
/M: SY='E'; M=-12, 22,-27, 28, 29,-30,-13,  8,-30,  5,-25,-20, 15, -8, 10, -2,  4, -7,-28,-34,-16, 19;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-27,-11, -5,-15,-22, -4, -8, 10, -7, -1,  0,-19,  1, 19,-11, -9, -8,-23, -7, -4;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-24,  6,-33,-24, 30,-30, 39, 20,-27,-27,-20,-23,-26,-10, 18,-20,  0,-24;
/M: SY='A'; M= 16,-12, -4,-18,-13,-11, -8,-19, -6,-16,-12, -9, -7,-16,-13,-18, 12,  5,  2,-28,-15,-13;
/M: SY='K'; M=  3,  5,-21,  0,  1,-23,-10, -7,-22, 13,-22,-13,  9,-13,  3, 13,  4,  1,-16,-26,-15,  1;
/M: SY='S'; M= 14, -1,-10, -2, -1,-20,  0,-11,-19,-10,-28,-19,  8,-10, -1,-11, 37, 18, -9,-38,-20, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24,  5,-33,-21, 32,-27, 34, 25,-25,-25,-17,-23,-25,-10, 18,-20,  0,-23;
/M: SY='A'; M= 39,-12,-11,-21,-12, -8, -4,-19, -9,-12, -9, -9,-10,-12,-13,-19,  8,  0, -1,-18,-14,-12;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='S'; M=  7,  3,-13,  2,  8,-21, -4, -9,-20, -7,-26,-19,  9, -9,  2, -8, 30, 16,-13,-37,-19,  5;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-29,-39,-30,  0,-39,-30, 49,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 31,-21, -1,-30;
/M: SY='Y'; M=-20,-18,-29,-19,-18, 27,-28, 29, -5,-12, -2,  0,-15,-28, -9, -9,-18,-12,-12, 19, 67,-18;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-30, -5, -6,-30, 54,-16,-38,-15,-28,-20,  0,-16,-13,-16,  0,-18,-30,-22,-28, -9;
/M: SY='H'; M=-14,  9,-26,  3, -3,-19, -9, 55,-23, -8,-19, -4, 21,-20,  4, -3, -3,-12,-26,-32,  3, -2;
/M: SY='E'; M=-11, 12,-27, 20, 23,-25,-18,  0,-23,  1,-13,-14,  1,-11,  5,  0, -4, -8,-19,-30,-14, 13;
/M: SY='D'; M=-17, 25,-30, 38, 14,-25,-16,  3,-27, -3,-22,-21,  8,-13,  0,-10, -4,-10,-24,-21, -4,  6;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-36,-29,  0,-35,-28, 41,-25, 17, 19,-23,-23,-22,-25,-17, -7, 36,-23, -3,-29;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='K'; M=-11, -3,-28, -4,  5,-25,-20,-10,-26, 37,-23, -9, -1,-13,  7, 31, -8, -5,-17,-21,-10,  5;
/M: SY='G'; M= 28,-10,-18,-15,-14,-24, 29,-20,-23,-14,-19,-14, -5,-14,-14,-20,  7, -8,-13,-21,-24,-14;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-34,-26,  1,-35,-27, 35,-27, 24, 16,-25,-21,-22,-25,-20, -8, 27,-23, -3,-27;
/M: SY='L'; M= 10,-24,-16,-27,-18,  0,-21,-21, 11,-23, 28, 10,-24,-24,-18,-20,-16, -6, 10,-21, -7,-18;
/M: SY='L'; M= -8,-26, 21,-30,-23,  0,-29,-23,  4,-29, 28,  7,-26,-32,-23,-23,-23,-10,  4,-29, -9,-23;
/M: SY='M'; M= -1,-17,-20,-20, -8, -9,-20, -8,  4,-13, 15, 17,-16,-20,  5,-10,-12, -7, -2,-21, -6, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-19, 20,-29, 49, 22,-30,-30,-19,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F'; M=-14,-29,-19,-36,-27, 47,-29,-19, 10,-26, 18, 12,-23,-29,-31,-19,-20, -9, 10, -4, 16,-26;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-29,-10,-19,-30, 67,-20,-39,-20,-30,-20,  0,-20,-19,-20,  1,-19,-29,-21,-30,-19;
/M: SY='G'; M=  2,-10,-29,-10,-20,-30, 67,-20,-39,-20,-29,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-19,-29,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M=  1,-13,-14,-15,-11,-10,-21,-20,  5,-12, -5, -3,-12,-15,-15,-14,  4, 10, 17,-31,-14,-13;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-29,  8, 12,-27,-15,  4,-27,  7,-25,-16,  5,  7,  4,  7, -1, -7,-24,-30,-15,  6;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 10,-30,-20, -8,-29, 46,-29, -9,  0,-11, 13, 32, -9,-10,-21,-20,-10, 11;
/M: SY='N'; M= -9, 10,-23,  6,  1,-20,-14, -5,-15,  4,-18,-11, 15,-16,  1,  5,  2,  0,-14,-31,-14,  0;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-21,-22,-16,  6,-25,-14,  5,-21, 12,  3,-17, -8,-18,-17,-13, -2,  3,-22, -3,-18;
/I:         MD=-27;
/M: SY='P'; M= -5, -3,-27, -2,  4,-24,  2, -5,-25,  1,-24,-15,  2,  9, -2, -1, -1, -8,-23,-25,-19, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D'; M= -8, 17,-28, 20, 11,-30,  6, -4,-32,  1,-26,-20, 13, -9,  1, -3,  1,-10,-28,-30,-21,  6;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-29, -8,-11,-28, 37,-15,-36,  1,-29,-17,  0,-18, -9,  2, -1,-15,-26,-21,-23,-11;
/M: SY='H'; M= -8, -8,-23,-12,-10,-14,-13,  9, -6,-13, -5,  9, -5,-12, -2,-11, -4, -1, -8,-26, -5, -8;
/M: SY='R'; M= -9,  1,-24, -2,  2,-21,-16,  5,-24, 18,-22,-10,  7,-15,  5, 20,  1, -1,-18,-27, -9,  2;
/M: SY='I'; M=-11,-26,-24,-30,-22, 10,-31,-19, 21,-21, 19, 11,-21,-25,-19,-14,-18, -8, 14,-15,  7,-22;
/M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10,  0,-20,-19,  0,-30, 29,-20,-10,  0,-20, 10, 67, -8, -9,-20,-21,-10,  0;
/M: SY='G'; M=  3,-10,-28,-10,-19,-29, 64,-20,-38,-19,-29,-20,  0,-19,-19,-20,  2,-17,-28,-21,-29,-19;
/M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 63, 23,-38,-10,  0,-38,  1,-29,-29, 20,-10,  2, -9,  0,-10,-30,-39,-20, 12;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30,  0,-39,-30, 47,-29, 21, 19,-21,-21,-21,-29,-20, -9, 30,-21, -1,-30;
/M: SY='N'; M=-11, 36,-21, 18,  0,-20, -2, 19,-21, -1,-29,-18, 55,-20,  1,  0,  8, -2,-30,-39,-16,  0;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-33,-28,  1,-33,-28, 35,-24, 19, 16,-26,-26,-24,-23,-16, -5, 37,-25, -5,-28;
/M: SY='L'; M=-10,-27, 21,-30,-23,  1,-30,-22,  5,-29, 28, 10,-27,-33,-22,-23,-24,-10,  4,-29, -9,-23;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-31,-21,  6,-29,-16, 24,-25, 38, 30,-26,-26,-15,-19,-26,-10, 13,-20,  0,-19;
/M: SY='V'; M= -7,-26, 18,-31,-26, -3,-29,-24, 13,-24, 13, 12,-25,-30,-23,-22,-16, -7, 19,-31,-11,-25;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G'; M=  5, -5,-20, -5,-10,-25, 35,-15,-30,-15,-30,-20,  5,-15,-10,-15, 20,  0,-20,-30,-25,-10;
/M: SY='T'; M=  0, -8,-10,-15,-15, -7,-23,-23,  1,-13, -5, -5, -8,-15,-15,-13, 12, 36, 14,-30,-10,-15;
/M: SY='A'; M= 38, -7,-10,-14, -7,-20,  0,-17,-13,-10,-16,-13, -4,-10, -7,-17, 19,  6, -3,-26,-20, -7;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-34,-24, 23,-31,-21, 21,-29, 34, 17,-26,-28,-24,-21,-25,-10, 12,-14,  6,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K'; M=-12, -3,-29, -3,  9,-29,-19, -3,-27, 34,-25, -8,  0,-13, 21, 34, -6, -9,-22,-21,-10, 14;
/M: SY='Y'; M= -7,-18,-24,-22,-18, 27,-24, 12, -4,-14, -2, -2,-16,-26,-14,-13,-14, -9, -8, 12, 47,-18;
/M: SY='V'; M= -2,-29,-13,-31,-29,  0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-28,-28,-28,-21,-11,  0, 46,-28, -8,-29;
/M: SY='E'; M=-13, -6,-15, -4,  9, -8,-24,  7,-11, -9, -2,  0, -9,-17, -1,-10,-12,-11,-13,-22,  1,  3;
/M: SY='N'; M=-11, 16,-22,  8,  9,-25,-12,  3,-26, 20,-28,-15, 24,-15,  7, 15, -1, -6,-25,-30,-15,  7;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-13,-30,-24,  9,-31,-25, 18,-24, 15,  8,-19,-24,-22,-21,-12,  4, 17,-21, -1,-24;
/M: SY='A'; M= 26,-10,-10,-16,-11,-15, -7,-19, -6,-12,-10, -9, -8,-14,-11,-17, 14,  9,  5,-27,-17,-11;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-37, -9,  0,-29,-19,-11,-21,-10,-29,-19,-16, 76, -8,-18, -7, -9,-29,-31,-26, -9;
/M: SY='R'; M=-17,-16,-28,-17, -7,-12,-24, -7,-11, 12, -2, -1, -8,-22,  1, 41,-15,-10, -9,-20, -7, -7;
/M: SY='A'; M= 29, -9,-17,-15,-13,-24, 26,-19,-22,-14,-19,-14, -5,-14,-13,-19,  8, -6,-12,-21,-24,-13;
/M: SY='I'; M= -5,-25,-21,-28,-21, -7,-32,-23, 28,-18,  8, 12,-21,-23,-10,-18,-12, -5, 28,-25, -6,-17;
/M: SY='Y'; M=-10,-18,-25,-20,-17, 24,-24,  6, -4,-13, -4, -4,-16,-19,-13,-13,-10, -6, -9, 12, 47,-18;
/M: SY='T'; M=  3, -1,-10,-11,-10,-11,-19,-20,-10,-10,-10,-10, -1,-10,-10,-11, 19, 47,  0,-29,-11,-10;
/M: SY='T'; M=  5,  0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,  5,-10, -5,-10, 30, 35, -5,-35,-15, -5;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-13, -3,-30, -3,  8,-28,-20, -4,-29, 38,-25, -9,  0,-13, 17, 40, -9,-10,-21,-20,-10, 11;
/M: SY='G'; M=  6,-10,-27,-11,-19,-29, 61,-20,-36,-19,-27,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-17,-26,-20,-29,-19;
/M: SY='S'; M= 16, -1,-10, -3, -1,-20,  0,-11,-19,-10,-27,-19,  7,-10, -1,-11, 36, 17, -9,-37,-20, -1;
/M: SY='S'; M=  9, -1,-11, -1, -1,-21,  5,-11,-21,-11,-30,-20,  9,-11, -1,-11, 37, 17,-11,-39,-21, -1;
/M: SY='A'; M= 32,-10,-17,-16,-14,-24, 25,-20,-21,-14,-17,-14, -6,-14,-14,-20,  6, -7,-11,-20,-24,-14;
/M: SY='V'; M= 11,-25,-10,-27,-25, -5,-23,-27, 20,-18,  5,  5,-25,-25,-25,-20, -4,  0, 38,-28,-12,-25;
/M: SY='G'; M=  1,-10,-29,-10,-20,-30, 68,-20,-39,-20,-29,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-19,-29,-20,-30,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 49, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 11,-20,  0,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='A'; M= 48,-10,-11,-20,-10,-20, -1,-19,-11, -9,-10,-10,-10,-10, -9,-18,  9,  0, -1,-20,-20,-10;
/M: SY='A'; M= 19,-12,-17,-16,-12, -3,-10, -5, -8,-10,-10, -8,-10,-17, -8,-15,  5,  0, -5, -7, 13,-12;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-13,-31,-30,  0,-31,-30, 33,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 47,-29, -9,-30;
/M: SY='T'; M= -6,-11,-17,-18,-12, -9,-22,-13,  2, -7,  0, 10,-10,-17, -3, -3,  0, 16,  5,-25, -7, -8;
/M: SY='R'; M=-11, -4,-25, -6,  2,-22,-18, -7,-26, 26,-23,-11,  1,-14,  6, 37,  0,  2,-16,-24,-11,  2;
/M: SY='D'; M=-20, 46,-30, 64, 18,-38,-10,  7,-39, -1,-29,-28, 20,-11,  1, -9,  0,-10,-30,-39,-17,  9;
/M: SY='P'; M= -8,-10,-31, -4, 10,-29,-20,-10,-18,  1,-23,-12,-10, 30, 11, -5, -3, -7,-21,-27,-20,  8;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-25,  9, 26,-22,-21, -8,-12, -1,-12,-10, -5,-10,  4, -8, -2, -7, -8,-31,-16, 15;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,  3,-10, -7,-10, 25, 42, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='G'; M=-10, -3,-29, -4, -7,-23, 17, -4,-33,  6,-26,-14,  4,-18, -5, 14, -5,-14,-25,-21,-16, -7;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-29, 16, 44,-32,-18,  3,-27,  9,-21,-15,  4, -4, 28,  2,  1, -9,-30,-28,-17, 36;
/M: SY='F'; M=-16,-26,-27,-29,-19, 19,-25,-15, -3,-12, 11,  5,-21,-27,-16,  3,-23,-13, -5, 11,  9,-17;
/M: SY='V'; M= -7,-18,-18,-21,-18, -6,-26,-18,  7, -6, -1,  1,-14,-22,-14,  4, -5,  7, 17,-24, -5,-18;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-31,-20, 24,-29, 44, 23,-28,-28,-19,-21,-28,-10, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 18, 54,-32,-20,  1,-29, 10,-20,-17,  0, -2, 25,  1,  0,-10,-30,-29,-19, 39;
/M: SY='A'; M= 23, -8,-16,-13,-12,-21, 17,-18,-19,-13,-18,-13, -3,-13,-11,-17, 12,  4,-10,-24,-21,-12;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-26,-13, 19,-23, 38, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10,  9,-17,  0,-17;
/M: SY='V'; M= -1,-29,-11,-30,-29,  0,-29,-26, 29,-19, 11, 16,-29,-29,-26,-19,-11, -1, 45,-29, -9,-27;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-29,-19,  9,-29,-20, 18,-29, 47, 18,-28,-29,-19,-20,-27, -9,  9,-21, -1,-19;
/M: SY='A'; M= 41, -8,-10,-15, -8,-20,  0,-18,-12,-10,-15,-12, -5,-10, -8,-18, 17,  5, -2,-25,-20, -8;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='N'; M=-11,  6,-27,  0, -3,-24,  7, -2,-27,  8,-25,-13, 18,-19,  3, 18, -1, -9,-25,-26,-17, -2;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30,  0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30;
/M: SY='C'; M= -6,-24, 73,-30,-30,-13,-30,-30, -8,-26, -9, -9,-24,-36,-30,-26,-10, -6, 12,-43,-23,-30;
/M: SY='C'; M= -6,-21, 92,-29,-27,-16,-28,-28,-22,-29,-10,-14,-21,-37,-27,-28,-11, -9, -7,-44,-25,-27;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='N'; M= -5, 23,-20, 19,  4,-24, -5, -1,-25,  0,-27,-20, 27,-15,  1,  3, 13,  3,-22,-36,-18,  1;
/M: SY='D'; M=-15, 27,-28, 41, 26,-31,-16, -3,-28,  0,-18,-19,  7, -9,  4, -8, -3,-10,-23,-34,-18, 15;
/M: SY='S'; M=  1, -1,-20, -1,  4,-23,-12, -7,-14, -2,-18, -7,  1,-12, 10, -2, 12,  2,-11,-30,-14,  6;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-24, 47, 11,-31,-13, -6,-31, -3,-24,-24, 14,-10, -3,-10,  6,  7,-21,-37,-17,  4;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  3,-23,-20,  1,-29, 27,-20, -9,  0,-19, 17, 62, -9,-10,-21,-20,-10,  6;
/M: SY='T'; M=  3,-12,-10,-15,-15, -9,-18,-21,  3,-14, -8, -5, -9,-18,-15,-14, 14, 22, 17,-33,-13,-15;
/M: SY='A'; M= 29,-14,-11,-20,-14,-14, -9,-21,  1,-13, -7, -5,-12,-15,-14,-19,  8,  3, 12,-25,-17,-14;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 41,-30, 29, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20,  0,-27;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='A'; M= 26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25,  9,-15,  0,  0,-20,-20,-20,-20,  0,  0, 24,-25,-15,-20;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='Q'; M= -9, -1,-30, -1, 17,-39,-13,  8,-22,  8,-21, -2,  0,-11, 54,  8,  0,-11,-30,-20,-12, 35;
/M: SY='T'; M=  0, -1,-12, -8, -7,-13,-16,-17,-13, -7,-15,-12,  2,-11, -7, -4, 21, 40, -3,-31,-12, -7;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-37,-29,  1,-37,-29, 42,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 33,-22, -2,-29;
/M: SY='S'; M=  8,  0,-10, -2, -2,-18, -4,-12,-18,-10,-26,-18,  8,-10, -2,-10, 36, 26, -8,-38,-18, -2;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-29,-40,-30,  0,-40,-30, 49,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 31,-20,  0,-30;
/M: SY='A'; M= 34, -6,-10,-14, -8,-19, -2,-18,-12,-10,-15,-12, -4,-10, -8,-16, 18, 11, -2,-26,-19, -8;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='G'; M=  0,-11,-29,-11,-20,-29, 67,-20,-38,-20,-29,-19, -1,-20,-20,-20,  0,-19,-27,-20,-29,-20;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30,  0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30;
/M: SY='V'; M= -7,-10,-21,-15,-11,-12,-25, -4,  4, -7, -3,  2, -6,-18, -4, -8, -5,  3,  5,-26, -5, -9;
/M: SY='T'; M= 14, -5,  3,-15,-12,-14,-15,-21,-12,-12,-11,-11, -5,-13,-12,-15, 14, 29, -1,-29,-15,-12;
/M: SY='T'; M= -1, -1,-15, -8, -5,-15,-17,-13,-12, -5,-14,-10,  2,-12,  0, -2, 17, 29, -5,-30,-12, -3;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-29,-19,  9,-30,-20, 19,-29, 47, 19,-30,-26,-20,-20,-29,-10,  9,-20, -1,-20;
/M: SY='N'; M=-10, 31,-22, 15,  3,-24, -1,  9,-21,  1,-28,-16, 47,-18, 11,  1,  8, -3,-30,-36,-18,  7;
/M: SY='A'; M= 42, -8,-10,-17, -8,-20, -1,-18,-12,-10,-13,-12, -7,-10, -8,-18, 15,  5, -2,-23,-20, -8;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='C'; M= -2,-10, 53,-20,-19,-16,-23,-25,-20,-20,-16,-15,-10,-25,-19,-20,  6, 17, -5,-40,-21,-19;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10, -2, -2,-19, -3,-12,-18,-10,-26,-18,  8,-10, -2,-10, 36, 23, -8,-38,-19, -2;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 28,-30, 42, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 15,-20,  0,-23;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='A'; M= 47, -9,-10,-18, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 12,  2, -1,-22,-20, -9;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-37, -9,  0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17, 81, -9,-19, -5, -7,-28,-31,-29, -9;
/M: SY='I'; M=  1,-23,-20,-30,-25, -3,-29,-26, 30,-22, 12, 11,-18,-22,-21,-23,-12, -5, 28,-24, -7,-25;
/M: SY='Y'; M=-10,-12,-28,-13,-11,  4,  7, -5,-19,-14,-15,-12, -6,-22,-13,-13, -7,-11,-19,  2, 14,-13;
/M: SY='G'; M=  2, -8,-26, -8,-16,-28, 57,-18,-36,-18,-30,-20,  2,-18,-16,-18,  7,-13,-26,-24,-28,-16;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-29, -7,  3,-23,-20,  7,-28, 24,-20, -8,  1,-18, 16, 52, -7, -8,-21,-21, -8,  5;
/M: SY='Y'; M=-20,-24,-34,-25,-22, 25,-28,  9, -2,-13, -3, -3,-24,-30,-12,-13,-24,-14,-12, 51, 68,-20;
/M: SY='D'; M=-16, 46,-26, 49, 11,-31, -6,  4,-31,  0,-30,-26, 37,-14,  0, -6,  4, -6,-30,-40,-20,  6;
/M: SY='P'; M=-11, -7,-30, -2,  7,-25,-19,-10,-21,  4,-21,-13, -7, 21,  4,  7, -5, -6,-21,-27,-18,  2;
/M: SY='R'; M= -6,  0,-20, -2, -2,-15,-13, -5,-18,  5,-19,-10,  5,-15,  0, 10,  9,  8,-13,-26, -6, -2;
/M: SY='R'; M=-12,-13,-26,-14, -5,-13,-24,-12,-10, 14,  0,  2,-10,-19, -1, 19,-15, -7, -7,-21, -6, -4;
/M: SY='T'; M= -1, -2,-20, -4, -5,-20, -6,-16,-18,-10,-22,-16,  1, 10, -8,-13, 15, 20,-14,-32,-19, -8;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-26,-18,-10,  0,-26,-19,  0,-18,  5, -2,-20, 12,-17,-18,-15, -6, -4,-22, -9,-14;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='T'; M=  0, -6,-19,-11, -5,-14,-10, -8, -8, -2, -8, -1, -3,-13, -3, -3,  0,  2, -6,-23,-10, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M=-13, 15,-29, 22, 30,-31,-17,  3,-28, 10,-23,-15,  7, -8, 22,  3, -1, -9,-28,-26,-12, 26;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='D'; M= -9, 24,-26, 25,  9,-31,  1,  1,-28, -1,-27,-19, 22,-13, 10, -5,  5, -7,-28,-33,-19, 10;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 20,-29,-18, 17,-28, 41, 21,-27,-29,-21,-19,-27,-10,  8,-15,  5,-21;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-26, -8,  0,-24,-16,-12,-15, -7,-21, -8, -8, 29,  3,-11,  6,  5,-18,-30,-19, -1;
/M: SY='P'; M=  5,  3,-25,  7, 11,-27,-12, -1,-23, -5,-21,-17, -3, 12,  0,-12,  2, -6,-20,-29,-18,  4;
/M: SY='P'; M=  5, -9,-22,-10, -4,-21,-14,-18,-16,-10,-21,-16, -8, 30, -8,-15, 10, 14,-13,-30,-21, -8;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,  8,-29,-17, 22,-26, 43, 27,-28,-28,-16,-19,-28,-10, 11,-20,  0,-19;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 47,-30, 67, 19,-39,-10,  0,-40,  1,-30,-29, 19,-10,  0, -7,  0,-10,-30,-39,-20, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,  6,-30,-19, 27,-27, 38, 26,-26,-26,-17,-20,-26,-10, 16,-20,  0,-21;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-34,-25, 19,-33,-23, 25,-29, 32, 16,-26,-27,-24,-23,-24, -9, 17,-16,  4,-25;
/M: SY='F'; M=-18,-27, -3,-35,-27, 48,-29,-17, -7,-25,  0, -5,-21,-31,-30,-19,-20,-12, -7, 15, 25,-25;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-27,  3,-33,-27, 34,-27, 27, 17,-27,-27,-23,-23,-20, -7, 30,-23, -3,-27;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-15,-31,-27,  1,-30,-24, 30,-21, 18, 20,-27,-27,-23,-20,-15, -4, 37,-26, -6,-26;
/M: SY='L'; M=-10,-18,-22,-19,-10, -7,-26,-15,  1, -1, 13,  6,-17,-23, -6,  4,-17, -7,  2,-22, -6, -9;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E'; M=-11,  0,-28,  3, 18,-24,-21, -7,-19,  5,-15,-11, -3,  0, 10,  6, -3, -2,-19,-27,-15, 13;
/M: SY='M'; M= -7,-18,  2,-21,-15,-12,-24,  0, -3,-15, -6,  4,-15,-13, -8,-15,-10, -9,  1,-29, -8,-13;
/M: SY='D'; M=-15, 44,-26, 50, 12,-32, -6,  3,-32, -1,-30,-26, 33,-13,  0, -7,  5, -5,-29,-40,-20,  6;
/M: SY='E'; M= -8, -2,-30,  5, 32,-26,-19, -6,-23,  5,-19,-14, -6, 15,  9,  1, -4, -9,-23,-28,-20, 19;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-22,  5,  7,-18,-20,-13, -7, -5, -9, -7, -5,-13, -4,-11, -1, -1, -1,-30,-14,  1;
/M: SY='R'; M= -6, -3,-22, -7, -5,-12,-18, -7, -9, -1,-11, -6,  1,-17,  2,  3, -1,  1, -8,-22, -5, -2;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='R'; M=-13, -9,-27, -8,  7,-13,-22, -2,-15, 10, -8, -4, -8,-17,  6, 22,-10, -9,-13,-16,  0,  4;
/M: SY='R'; M= -4, -3,-24, -5,  9,-22,-16,  2,-19, 10,-16, -3,  0,-13, 12, 14, -1, -5,-16,-24,-11,  9;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/M: SY='A'; M= 44, -9,-10,-17, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 14,  3, -1,-23,-20, -9;
/M: SY='R'; M=-12,  7,-27,  8, 12,-26,-16,  3,-28, 20,-24,-13,  9,-12, 10, 22, -1, -5,-23,-27,-12, 10;
/M: SY='H'; M=-20, -7,-28, -9, -6, -1,-22, 65,-24, -9,-14, -1,  3,-22,  1,  5,-12,-17,-23,-21, 18, -6;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-33,-29,  1,-33,-29, 34,-24, 18, 14,-27,-27,-26,-23,-15, -4, 39,-26, -6,-29;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 111 in 111 different sequences
Number of true positive hits 111 in 111 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
111 sequences

MC6ZA_XENLA (Q498J7), MC6ZB_XENLA (Q7ZY18), MCM2_ARATH  (Q9LPD9), 
MCM2_DROME  (P49735), MCM2_HUMAN  (P49736), MCM2_MOUSE  (P97310), 
MCM2_ORYSI  (B8BKI8), MCM2_ORYSJ  (Q2R482), MCM2_SCHPO  (P40377), 
MCM2_XENLA  (P55861), MCM2_XENTR  (Q6DIH3), MCM2_YEAST  (P29469), 
MCM31_MAIZE (Q43704), MCM32_MAIZE (Q9SX04), MCM33_MAIZE (Q9SX03), 
MCM3M_XENLA (P49739), MCM3Z_XENLA (Q7ZXZ0), MCM3Z_XENTR (Q28BS0), 
MCM3_ARATH  (Q9FL33), MCM3_BOVIN  (A4FUD9), MCM3_CHICK  (Q5ZMN2), 
MCM3_DROME  (Q9XYU1), MCM3_ENTHI  (Q24849), MCM3_HUMAN  (P25205), 
MCM3_MOUSE  (P25206), MCM3_ORYSI  (B8AZ99), MCM3_ORYSJ  (Q0DHC4), 
MCM3_PONAB  (Q5R8G6), MCM3_SCHPO  (P30666), MCM3_YEAST  (P24279), 
MCM4A_XENLA (Q5XK83), MCM4B_XENLA (P30664), MCM4_ARATH  (Q0WVF5), 
MCM4_DROME  (Q26454), MCM4_HUMAN  (P33991), MCM4_MOUSE  (P49717), 
MCM4_ORYSJ  (Q5JKB0), MCM4_SCHPO  (P29458), MCM4_XENTR  (Q6GL41), 
MCM4_YEAST  (P30665), MCM5A_XENLA (P55862), MCM5B_XENLA (Q6PCI7), 
MCM5_ARATH  (O80786), MCM5_BOVIN  (Q0V8B7), MCM5_CAEEL  (Q21902), 
MCM5_DICDI  (Q54CP4), MCM5_DROME  (Q9VGW6), MCM5_HUMAN  (P33992), 
MCM5_MOUSE  (P49718), MCM5_ORYSI  (B8AEH3), MCM5_ORYSJ  (Q6KAJ4), 
MCM5_SCHPO  (P41389), MCM5_XENTR  (Q561P5), MCM5_YEAST  (P29496), 
MCM6M_XENLA (Q5FWY4), MCM6M_XENTR (Q28CM3), MCM6Z_XENTR (Q6P1V8), 
MCM6_ANOGA  (Q7Q0Q1), MCM6_ARATH  (F4KAB8), MCM6_BOVIN  (Q2KIZ8), 
MCM6_CAEBR  (Q61J08), MCM6_CAEEL  (P34647), MCM6_DICDI  (Q86B14), 
MCM6_DROME  (Q9V461), MCM6_DROPS  (Q29JI9), MCM6_HUMAN  (Q14566), 
MCM6_MOUSE  (P97311), MCM6_ORYSI  (B8AZX3), MCM6_ORYSJ  (Q6F353), 
MCM6_RAT    (Q62724), MCM6_SCHPO  (P49731), MCM6_YEAST  (P53091), 
MCM7A_XENLA (Q91876), MCM7B_XENLA (Q7ZXB1), MCM7_ARATH  (P43299), 
MCM7_BOVIN  (Q3ZBH9), MCM7_DROME  (Q9XYU0), MCM7_HUMAN  (P33993), 
MCM7_MOUSE  (Q61881), MCM7_ORYSI  (B8BMI1), MCM7_ORYSJ  (Q2QNM1), 
MCM7_SCHPO  (O75001), MCM7_XENTR  (Q6NX31), MCM7_YEAST  (P38132), 
MCM8_ARATH  (Q9SF37), MCM8_BOVIN  (E1BPX4), MCM8_CHICK  (I0IUP3), 
MCM8_HUMAN  (Q9UJA3), MCM8_MOUSE  (Q9CWV1), MCM8_ORYSI  (B8AZ14), 
MCM8_ORYSJ  (B9FKM7), MCM8_RAT    (D3ZVK1), MCM8_XENLA  (Q5F310), 
MCM8_XENTR  (Q0V9Q6), MCM9_ARATH  (F4IFF3), MCM9_BOVIN  (F1N2W9), 
MCM9_CHICK  (I0IUP4), MCM9_DANRE  (F1QDI9), MCM9_HUMAN  (Q9NXL9), 
MCM9_MOUSE  (Q2KHI9), MCM9_ORYSI  (B8B406), MCM9_ORYSJ  (Q69QA6), 
MCM9_RAT    (F1M5F3), MCM9_XENLA  (Q6NRM6), MCM9_XENTR  (F6RIX4), 
MCMR_DROME  (Q9VF30), MCM_SULSO   (Q9UXG1), Y1489_METJA (Q58884), 
Y3513_METJA (Q60275), Y363_METJA  (Q57809), Y961_METJA  (Q58371)
» More

PDB
[Detailed view]
2 PDB

3F9V; 4FDG

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission