Entry: PS50061

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ETS_DOMAIN_3
Accession [info] PS50061
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-1997 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00374
Associated ProRule [info] PRU00237

Name and characterization of the entry

Description [info] Ets-domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8862; R2=0.01123296; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2528.19934; R2=28.94020; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=677; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19574; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=499; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16998; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30,  0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 26, 41, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='C'; M= -4, -7, 27,-10, -7,-23,-17,-17,-27,  4,-27,-17, -4,-20, -7, -3,  5, -1,-13,-36,-20, -7;
/M: SY='E'; M= 16,  0,-17,  1, 17,-23, -7,-10,-20, -3,-20,-17,  0, -7,  4,-10, 17,  4,-14,-30,-20, 11;
/M: SY='H'; M=-13,  5, 25, -4,-10,-20,-17, 27,-27,-14,-23,-13, 15,-27, -7,-10, -4,-10,-23,-40,-10,-10;
/M: SY='Q'; M= 12, -3,-17,-10,  0,-24,-14,-10,-13, -3,-13, -7, -3,-10, 14, -6, 10, 14,-10,-23,-13,  7;
/M: SY='S'; M=  0, 17,-17, 24,  7,-27, -3, -7,-27, -7,-30,-23, 13,-10,  0,-10, 26, 10,-17,-40,-20,  3;
/M: SY='C'; M=-10,-27, 27,-33,-30, 22,-30,-27,  1,-27,  1, -3,-23,-33,-33,-23,-13, -7, 14,-22, -2,-30;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='S'; M=  0,  3,-17,  4, 17,-20,-13,-10,-20, -3,-20,-17,  3, -7,  4, -7, 20, 19,-14,-33,-17, 11;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='T'; M= -3, -7,-16, -8,  5,-13,-23,-17, -2, -7, -6, -6,-10,-14, -8,-10,  4, 14,  8,-30,-13, -1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M= -7, 17,-17, 18,  0,-20,-17,-13,-20, -7,-17,-17,  7,-10, -7,-10, 13, 29,-10,-33,-13, -3;
/M: SY='N'; M= -7, 12,-27, 10, 14,-27, 18, -4,-30, -4,-27,-20, 19,-13,  0, -7,  3,-10,-30,-30,-23,  7;
/M: SY='G'; M= -7,-20,-37,-20,-23,-16, 39,-23,-33,-20,-27,-20,-14,-23,-20,-20,-14,-23,-30, 39, -9,-20;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-14, 20,-24, 41, 32,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,  3,-10, -7,-10, 27, 40, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E'; M=-13,  3,-30, 10, 39,-27,-20,  0,-30, 17,-20,-17,  0, -7, 17, 24, -3,-10,-27,-27,-17, 26;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R'; M=-17,-17,-27,-17, -7,-10,-23, -7,-13,  9,  4,  0,-10,-23,  0, 39,-17,-10,-10,-20, -7, -7;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M=-10,  7,-30, 13, 43,-30,-20, -3,-30, 24,-23,-17,  0, -3, 17, 10, -3,-10,-27,-27,-17, 30;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N'; M= -4, 28,-17, 14,  0,-20,  0,  4,-20, -3,-30,-20, 45,-17,  0, -3, 19,  6,-24,-40,-20,  0;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='N'; M= 11,  9,-20, -1,  0,-23, -7, -7,-20, 14,-23,-13, 15,-13,  0,  4,  3, -3,-16,-26,-17,  0;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E'; M=-13, 22,-30, 35, 48,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  6, -3, 14, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 31;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='A'; M= 33,-10,-17,-17,-13,-23, 24,-20,-20,-13,-17,-13, -7,-13,-13,-20,  7, -7,-10,-20,-23,-13;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='K'; M= -7, -3,-30, -3,  0,-30, 11,-13,-33, 26,-30,-13,  0,-13,  0, 13, -7,-13,-23,-20,-17,  0;
/M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 37,  7,-27, -3,  7,-27,  0,-30,-23, 46,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,  0,-33,-20, 40,-23, 20, 34,-20,-20,-13,-23,-20,-10, 23,-20,  0,-23;
/M: SY='I'; M=-10,-27,-27,-37,-27,  0,-34,-21, 41,-24, 20, 32,-20,-20,-14,-24,-20,-10, 24,-20,  0,-24;
/M: SY='H'; M= -4,  0,-17, -3, -3,-17,-13, 25,-20,-10,-20,-10,  7,-13,  0, -7, 16, 15,-14,-33, -3, -3;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='V'; M=  0,-20,-10,-23,-23, -3,-27,-27, 16,-17,  3,  3,-20,-23,-23,-17,  0, 17, 33,-30,-10,-23;
/M: SY='H'; M= 15, -3,-16, -7, -3,-20, -6, 20,-20,-10,-20,-10,  3,-13,  0,-10, 14,  1,-13,-30, -8, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  6,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='A'; M= 33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,  4,-13, -3, -3,-17,-17,-17,-20,  3,  0, 17,-23,-17,-17;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R'; M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10,  0,-13, 10, 44,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D'; M=-13, 22,-23, 35,  3,-26,-17,-10,-16, -7,-16,-16,  3,-17,-10,-13, -3, -7, -2,-37,-17, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 99 in 99 different sequences
Number of true positive hits 99 in 99 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DNA_BIND
Feature description [info] ETS
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
99 sequences

E74EA_DROME (P20105), E74EB_DROME (P11536), E74EF_DROVI (Q7M3M6), 
EHF_BOVIN   (Q32LN0), EHF_HUMAN   (Q9NZC4), EHF_MOUSE   (O70273), 
EHF_PANPA   (A1YG61), EHF_PANTR   (A2T737), ELF1_BOVIN  (A0JN51), 
ELF1_HUMAN  (P32519), ELF1_MOUSE  (Q60775), ELF2_HUMAN  (Q15723), 
ELF2_MOUSE  (Q9JHC9), ELF3_HUMAN  (P78545), ELF3_MOUSE  (Q3UPW2), 
ELF3_RAT    (Q4V7E1), ELF4_HUMAN  (Q99607), ELF4_MOUSE  (Q9Z2U4), 
ELF5_BOVIN  (Q58DT0), ELF5_HUMAN  (Q9UKW6), ELF5_MOUSE  (Q8VDK3), 
ELG_DROME   (Q04688), ELK1_HUMAN  (P19419), ELK1_MOUSE  (P41969), 
ELK3_HUMAN  (P41970), ELK3_MOUSE  (P41971), ELK4_HUMAN  (P28324), 
ELK4_MOUSE  (P41158), ERF_HUMAN   (P50548), ERF_MOUSE   (P70459), 
ERG_CHICK   (Q90837), ERG_HUMAN   (P11308), ERG_LYTVA   (Q01414), 
ERG_MOUSE   (P81270), ETS1A_CHICK (P13474), ETS1A_XENLA (P18755), 
ETS1B_CHICK (P15062), ETS1B_XENLA (P18756), ETS1_HUMAN  (P14921), 
ETS1_MOUSE  (P27577), ETS1_RAT    (P41156), ETS2A_XENLA (P19102), 
ETS2B_XENLA (Q91712), ETS2_BOVIN  (A1A4L6), ETS2_CHICK  (P10157), 
ETS2_HUMAN  (P15036), ETS2_LYTVA  (P29773), ETS2_MOUSE  (P15037), 
ETS3_DROME  (P29774), ETS4_DROME  (P29775), ETS6_DROME  (P29776), 
ETV1_BOVIN  (Q2KIC2), ETV1_HUMAN  (P50549), ETV1_MOUSE  (P41164), 
ETV2_HUMAN  (O00321), ETV2_MOUSE  (P41163), ETV3L_HUMAN (Q6ZN32), 
ETV3_ATEGE  (A2D4Z7), ETV3_GORGO  (A1YF15), ETV3_HUMAN  (P41162), 
ETV3_MOUSE  (Q8R4Z4), ETV3_PANPA  (A1YG91), ETV3_PANTR  (A2T762), 
ETV4_DANRE  (Q9PUQ1), ETV4_HUMAN  (P43268), ETV4_MOUSE  (P28322), 
ETV5_HUMAN  (P41161), ETV5_MOUSE  (Q9CXC9), ETV6_BOVIN  (Q0VC65), 
ETV6_HUMAN  (P41212), ETV6_MOUSE  (P97360), ETV7_HUMAN  (Q9Y603), 
FEV_DANRE   (A3FEM2), FEV_HUMAN   (Q99581), FEV_MOUSE   (Q8QZW2), 
FEV_RAT     (O70132), FLI1_BOVIN  (Q29RS8), FLI1_HUMAN  (Q01543), 
FLI1_MOUSE  (P26323), FLI1_XENLA  (P41157), GABPA_HUMAN (Q06546), 
GABPA_MOUSE (Q00422), MYBE_AVILE  (P01105), PNT1_DROME  (P51022), 
PNT2_DROME  (P51023), POK_DROME   (Q01842), SPDEF_HUMAN (O95238), 
SPDEF_MOUSE (Q9WTP3), SPI1_HUMAN  (P17947), SPI1_MOUSE  (P17433), 
SPI1_PIG    (Q6PKU1), SPI1_RAT    (Q6BDS1), SPIB_HUMAN  (Q01892), 
SPIB_MOUSE  (O35906), SPIB_PALPA  (Q9I8M6), SPIB_RAT    (Q5EBA3), 
SPIC_BOVIN  (Q1RML4), SPIC_HUMAN  (Q8N5J4), SPIC_MOUSE  (Q6P3D7)
» More

PDB
[Detailed view]
40 PDB

1AWC; 1BC7; 1BC8; 1DUX; 1FLI; 1GVJ; 1HBX; 1K6O; 1K78; 1K79; 1K7A; 1MD0; 1MDM; 1PUE; 1R36; 1WWX; 1YO5; 2DAO; 2LF7; 2LF8; 2MD5; 2NNY; 2STT; 2STW; 2YPR; 3JTG; 3MFK; 3RI4; 3ZP5; 4AVP; 4BNC; 4BQA; 4CO8; 4IRG; 4IRH; 4IRI; 4L0Y; 4L0Z; 4L18; 4MHG
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission