Due to maintenance work, this service will be unavailable from Mon Nov 11 17:30 until Tue Nov 12 09:00 CET. Apologies for the inconvenience.

PROSITE entry PS50061

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ETS_DOMAIN_3
Accession [info]	PS50061
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1997 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00374
Associated ProRule [info]	PRU00237

Name and characterization of the entry

Description [info]

Ets-domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8862000; R2=0.0112330; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9472.6230469; R2=8.7140341; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=678; H_SCORE=15381; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=500; H_SCORE=13830; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-37,-30,  0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 26, 41, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='C';  M= -4, -7, 27,-10, -7,-23,-17,-17,-27,  4,-27,-17, -4,-20, -7, -3,  5, -1,-13,-36,-20, -7;
/M: SY='E';  M= 16,  0,-17,  1, 17,-23, -7,-10,-20, -3,-20,-17,  0, -7,  4,-10, 17,  4,-14,-30,-20, 11;
/M: SY='H';  M=-13,  5, 25, -4,-10,-20,-17, 27,-27,-14,-23,-13, 15,-27, -7,-10, -4,-10,-23,-40,-10,-10;
/M: SY='Q';  M= 12, -3,-17,-10,  0,-24,-14,-10,-13, -3,-13, -7, -3,-10, 14, -6, 10, 14,-10,-23,-13,  7;
/M: SY='S';  M=  0, 17,-17, 24,  7,-27, -3, -7,-27, -7,-30,-23, 13,-10,  0,-10, 26, 10,-17,-40,-20,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-27, 27,-33,-30, 22,-30,-27,  1,-27,  1, -3,-23,-33,-33,-23,-13, -7, 14,-22, -2,-30;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-17,  4, 17,-20,-13,-10,-20, -3,-20,-17,  3, -7,  4, -7, 20, 19,-14,-33,-17, 11;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-16, -8,  5,-13,-23,-17, -2, -7, -6, -6,-10,-14, -8,-10,  4, 14,  8,-30,-13, -1;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T';  M= -7, 17,-17, 18,  0,-20,-17,-13,-20, -7,-17,-17,  7,-10, -7,-10, 13, 29,-10,-33,-13, -3;
/M: SY='N';  M= -7, 12,-27, 10, 14,-27, 18, -4,-30, -4,-27,-20, 19,-13,  0, -7,  3,-10,-30,-30,-23,  7;
/M: SY='G';  M= -7,-20,-37,-20,-23,-16, 39,-23,-33,-20,-27,-20,-14,-23,-20,-20,-14,-23,-30, 39, -9,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-14, 20,-24, 41, 32,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,  3,-10, -7,-10, 27, 40, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E';  M=-13,  3,-30, 10, 39,-27,-20,  0,-30, 17,-20,-17,  0, -7, 17, 24, -3,-10,-27,-27,-17, 26;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-17,-17,-27,-17, -7,-10,-23, -7,-13,  9,  4,  0,-10,-23,  0, 39,-17,-10,-10,-20, -7, -7;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-30, 13, 43,-30,-20, -3,-30, 24,-23,-17,  0, -3, 17, 10, -3,-10,-27,-27,-17, 30;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N';  M= -4, 28,-17, 14,  0,-20,  0,  4,-20, -3,-30,-20, 45,-17,  0, -3, 19,  6,-24,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='N';  M= 11,  9,-20, -1,  0,-23, -7, -7,-20, 14,-23,-13, 15,-13,  0,  4,  3, -3,-16,-26,-17,  0;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E';  M=-13, 22,-30, 35, 48,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  6, -3, 14, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 31;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='A';  M= 33,-10,-17,-17,-13,-23, 24,-20,-20,-13,-17,-13, -7,-13,-13,-20,  7, -7,-10,-20,-23,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='K';  M= -7, -3,-30, -3,  0,-30, 11,-13,-33, 26,-30,-13,  0,-13,  0, 13, -7,-13,-23,-20,-17,  0;
/M: SY='N';  M=-13, 43,-23, 37,  7,-27, -3,  7,-27,  0,-30,-23, 46,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-27,-37,-27,  0,-33,-20, 40,-23, 20, 34,-20,-20,-13,-23,-20,-10, 23,-20,  0,-23;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-27,-37,-27,  0,-34,-21, 41,-24, 20, 32,-20,-20,-14,-24,-20,-10, 24,-20,  0,-24;
/M: SY='H';  M= -4,  0,-17, -3, -3,-17,-13, 25,-20,-10,-20,-10,  7,-13,  0, -7, 16, 15,-14,-33, -3, -3;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='V';  M=  0,-20,-10,-23,-23, -3,-27,-27, 16,-17,  3,  3,-20,-23,-23,-17,  0, 17, 33,-30,-10,-23;
/M: SY='H';  M= 15, -3,-16, -7, -3,-20, -6, 20,-20,-10,-20,-10,  3,-13,  0,-10, 14,  1,-13,-30, -8, -3;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  6,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='A';  M= 33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,  4,-13, -3, -3,-17,-17,-17,-20,  3,  0, 17,-23,-17,-17;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10,  0,-13, 10, 44,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D';  M=-13, 22,-23, 35,  3,-26,-17,-10,-16, -7,-16,-16,  3,-17,-10,-13, -3, -7, -2,-37,-17, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	105 in 105 different sequences
Number of true positive hits	105 in 105 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DNA_BIND
Feature description [info]	ETS
Version [info]	7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

105 sequences

AST1_CAEEL  (Q22355), E74EA_DROME (P20105), E74EB_DROME (P11536),

E74EF_DROVI (Q7M3M6), EHF_BOVIN   (Q32LN0), EHF_HUMAN   (Q9NZC4), 
EHF_MOUSE   (O70273), EHF_PANPA   (A1YG61), EHF_PANTR   (A2T737), 
ELF1_BOVIN  (A0JN51), ELF1_HUMAN  (P32519), ELF1_MOUSE  (Q60775), 
ELF2_HUMAN  (Q15723), ELF2_MOUSE  (Q9JHC9), ELF3_HUMAN  (P78545), 
ELF3_MOUSE  (Q3UPW2), ELF3_RAT(Q4V7E1), ELF4_HUMAN  (Q99607), 
ELF4_MOUSE  (Q9Z2U4), ELF5_BOVIN  (Q58DT0), ELF5_HUMAN  (Q9UKW6), 
ELF5_MOUSE  (Q8VDK3), ELG_DROME   (Q04688), ELK1_HUMAN  (P19419), 
ELK1_MOUSE  (P41969), ELK1_RAT(A4GTP4), ELK3_HUMAN  (P41970), 
ELK3_MOUSE  (P41971), ELK4_HUMAN  (P28324), ELK4_MOUSE  (P41158), 
ERFL_HUMAN  (A0A1W2PQ73), ERF_HUMAN   (P50548), ERF_MOUSE   (P70459), 
ERG_CHICK   (Q90837), ERG_HUMAN   (P11308), ERG_LYTVA   (Q01414), 
ERG_MOUSE   (P81270), ET96B_DROME (Q8MRW5), ETS1A_CHICK (P13474), 
ETS1A_XENLA (P18755), ETS1B_CHICK (P15062), ETS1B_XENLA (P18756), 
ETS1_HUMAN  (P14921), ETS1_MOUSE  (P27577), ETS1_RAT(P41156), 
ETS2A_XENLA (P19102), ETS2B_XENLA (Q91712), ETS2_BOVIN  (A1A4L6), 
ETS2_CHICK  (P10157), ETS2_HUMAN  (P15036), ETS2_LYTVA  (P29773), 
ETS2_MOUSE  (P15037), ETS3_DROME  (P29774), ETS4_CAEEL  (A8WFJ9), 
ETS4_DROME  (P29775), ETS5_CAEEL  (Q18579), ETS6_DROME  (P29776), 
ETS7_CAEEL  (O01519), ETV1_BOVIN  (Q2KIC2), ETV1_HUMAN  (P50549), 
ETV1_MOUSE  (P41164), ETV2_HUMAN  (O00321), ETV2_MOUSE  (P41163), 
ETV3L_HUMAN (Q6ZN32), ETV3_ATEGE  (A2D4Z7), ETV3_GORGO  (A1YF15), 
ETV3_HUMAN  (P41162), ETV3_MOUSE  (Q8R4Z4), ETV3_PANPA  (A1YG91), 
ETV3_PANTR  (A2T762), ETV4_DANRE  (Q9PUQ1), ETV4_HUMAN  (P43268), 
ETV4_MOUSE  (P28322), ETV5_HUMAN  (P41161), ETV5_MOUSE  (Q9CXC9), 
ETV6_BOVIN  (Q0VC65), ETV6_HUMAN  (P41212), ETV6_MOUSE  (P97360), 
ETV7_HUMAN  (Q9Y603), FEV_DANRE   (A3FEM2), FEV_HUMAN   (Q99581), 
FEV_MOUSE   (Q8QZW2), FEV_RAT (O70132), FLI1_BOVIN  (Q29RS8), 
FLI1_HUMAN  (Q01543), FLI1_MOUSE  (P26323), FLI1_XENLA  (P41157), 
GABPA_HUMAN (Q06546), GABPA_MOUSE (Q00422), MYBE_AVILE  (P01105), 
PNT_DROME   (P51023), POK_DROME   (Q01842), SPDEF_HUMAN (O95238), 
SPDEF_MOUSE (Q9WTP3), SPI1_HUMAN  (P17947), SPI1_MOUSE  (P17433), 
SPI1_PIG(Q6PKU1), SPI1_RAT(Q6BDS1), SPIB_HUMAN  (Q01892), 
SPIB_MOUSE  (O35906), SPIB_PALPA  (Q9I8M6), SPIB_RAT(Q5EBA3), 
SPIC_BOVIN  (Q1RML4), SPIC_HUMAN  (Q8N5J4), SPIC_MOUSE  (Q6P3D7)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

104 PDB

1AWC; 1BC7; 1BC8; 1DUX; 1FLI; 1GVJ; 1HBX; 1K6O; 1K78; 1K79; 1K7A; 1MD0; 1MDM; 1PUE; 1R36; 1WWX; 1YO5; 2DAO; 2LF7; 2LF8; 2MD5; 2NNY; 2STT; 2STW; 2YPR; 3JTG; 3MFK; 3RI4; 3WTS; 3WTT; 3WTU; 3WTV; 3WTW; 3WTX; 3WTY; 3WTZ; 3WU0; 3WU1; 3ZP5; 4AVP; 4BNC; 4BQA; 4CO8; 4IRG; 4IRH; 4IRI; 4L0Y; 4L0Z; 4L18; 4LG0; 4MHG; 4UNO; 4UUV; 5E8G; 5E8I; 5ILS; 5ILU; 5ILV; 5JVT; 5W3G; 5YBC; 5YBD; 5ZMC; 6DA1; 6DAT; 6VG2; 6VG8; 6VGD; 6VGE; 6VGG; 7JSA; 7JSL; 8BZM; 8E3K; 8E3R; 8E4H; 8E5Y; 8E66; 8E67; 8EBH; 8EE9; 8EJ6; 8EJ8; 8EK3; 8EK8; 8EKJ; 8EKU; 8EKV; 8EKZ; 8EM9; 8EMD; 8ENG; 8EO1; 8EO4; 8EQG; 8EQK; 8EQL; 8EVH; 8EVI; 8EVJ; 8SMH; 8SMJ; 8SP1; 8T9U
» more