PROSITE entry PS50061

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ETS_DOMAIN_3
Accession [info]	PS50061
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1997 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00374
Associated ProRule [info]	PRU00237

Name and characterization of the entry

Description [info]

Ets-domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8862000; R2=0.0112330; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9472.6230469; R2=8.7140341; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=678; H_SCORE=15381; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=500; H_SCORE=13830; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-23,-37,-30,  0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 26, 41, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='C';  M= -4, -7, 27,-10, -7,-23,-17,-17,-27,  4,-27,-17, -4,-20, -7, -3,  5, -1,-13,-36,-20, -7;
/M: SY='E';  M= 16,  0,-17,  1, 17,-23, -7,-10,-20, -3,-20,-17,  0, -7,  4,-10, 17,  4,-14,-30,-20, 11;
/M: SY='H';  M=-13,  5, 25, -4,-10,-20,-17, 27,-27,-14,-23,-13, 15,-27, -7,-10, -4,-10,-23,-40,-10,-10;
/M: SY='Q';  M= 12, -3,-17,-10,  0,-24,-14,-10,-13, -3,-13, -7, -3,-10, 14, -6, 10, 14,-10,-23,-13,  7;
/M: SY='S';  M=  0, 17,-17, 24,  7,-27, -3, -7,-27, -7,-30,-23, 13,-10,  0,-10, 26, 10,-17,-40,-20,  3;
/M: SY='C';  M=-10,-27, 27,-33,-30, 22,-30,-27,  1,-27,  1, -3,-23,-33,-33,-23,-13, -7, 14,-22, -2,-30;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-17,  4, 17,-20,-13,-10,-20, -3,-20,-17,  3, -7,  4, -7, 20, 19,-14,-33,-17, 11;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-16, -8,  5,-13,-23,-17, -2, -7, -6, -6,-10,-14, -8,-10,  4, 14,  8,-30,-13, -1;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T';  M= -7, 17,-17, 18,  0,-20,-17,-13,-20, -7,-17,-17,  7,-10, -7,-10, 13, 29,-10,-33,-13, -3;
/M: SY='N';  M= -7, 12,-27, 10, 14,-27, 18, -4,-30, -4,-27,-20, 19,-13,  0, -7,  3,-10,-30,-30,-23,  7;
/M: SY='G';  M= -7,-20,-37,-20,-23,-16, 39,-23,-33,-20,-27,-20,-14,-23,-20,-20,-14,-23,-30, 39, -9,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-14, 20,-24, 41, 32,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-13,-17,-13,-10,-17,-13,  3,-10, -7,-10, 27, 40, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E';  M=-13,  3,-30, 10, 39,-27,-20,  0,-30, 17,-20,-17,  0, -7, 17, 24, -3,-10,-27,-27,-17, 26;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-17,-17,-27,-17, -7,-10,-23, -7,-13,  9,  4,  0,-10,-23,  0, 39,-17,-10,-10,-20, -7, -7;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-30, 13, 43,-30,-20, -3,-30, 24,-23,-17,  0, -3, 17, 10, -3,-10,-27,-27,-17, 30;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N';  M= -4, 28,-17, 14,  0,-20,  0,  4,-20, -3,-30,-20, 45,-17,  0, -3, 19,  6,-24,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='N';  M= 11,  9,-20, -1,  0,-23, -7, -7,-20, 14,-23,-13, 15,-13,  0,  4,  3, -3,-16,-26,-17,  0;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E';  M=-13, 22,-30, 35, 48,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  6, -3, 14, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 31;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='A';  M= 33,-10,-17,-17,-13,-23, 24,-20,-20,-13,-17,-13, -7,-13,-13,-20,  7, -7,-10,-20,-23,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='K';  M= -7, -3,-30, -3,  0,-30, 11,-13,-33, 26,-30,-13,  0,-13,  0, 13, -7,-13,-23,-20,-17,  0;
/M: SY='N';  M=-13, 43,-23, 37,  7,-27, -3,  7,-27,  0,-30,-23, 46,-17,  0, -3,  7, -3,-30,-40,-20,  3;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-27,-37,-27,  0,-33,-20, 40,-23, 20, 34,-20,-20,-13,-23,-20,-10, 23,-20,  0,-23;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-27,-37,-27,  0,-34,-21, 41,-24, 20, 32,-20,-20,-14,-24,-20,-10, 24,-20,  0,-24;
/M: SY='H';  M= -4,  0,-17, -3, -3,-17,-13, 25,-20,-10,-20,-10,  7,-13,  0, -7, 16, 15,-14,-33, -3, -3;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='V';  M=  0,-20,-10,-23,-23, -3,-27,-27, 16,-17,  3,  3,-20,-23,-23,-17,  0, 17, 33,-30,-10,-23;
/M: SY='H';  M= 15, -3,-16, -7, -3,-20, -6, 20,-20,-10,-20,-10,  3,-13,  0,-10, 14,  1,-13,-30, -8, -3;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  6,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='A';  M= 33,-17,-10,-23,-17,-13,-10,-23,  4,-13, -3, -3,-17,-17,-17,-20,  3,  0, 17,-23,-17,-17;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 43,-27,-10,  0,-13, 10, 44,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='D';  M=-13, 22,-23, 35,  3,-26,-17,-10,-16, -7,-16,-16,  3,-17,-10,-13, -3, -7, -2,-37,-17, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	105 in 105 different sequences
Number of true positive hits	105 in 105 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DNA_BIND
Feature description [info]	ETS
Version [info]	7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

105 sequences

AST1_CAEEL  (Q22355), E74EA_DROME (P20105), E74EB_DROME (P11536),

E74EF_DROVI (Q7M3M6), EHF_BOVIN   (Q32LN0), EHF_HUMAN   (Q9NZC4), 
EHF_MOUSE   (O70273), EHF_PANPA   (A1YG61), EHF_PANTR   (A2T737), 
ELF1_BOVIN  (A0JN51), ELF1_HUMAN  (P32519), ELF1_MOUSE  (Q60775), 
ELF2_HUMAN  (Q15723), ELF2_MOUSE  (Q9JHC9), ELF3_HUMAN  (P78545), 
ELF3_MOUSE  (Q3UPW2), ELF3_RAT(Q4V7E1), ELF4_HUMAN  (Q99607), 
ELF4_MOUSE  (Q9Z2U4), ELF5_BOVIN  (Q58DT0), ELF5_HUMAN  (Q9UKW6), 
ELF5_MOUSE  (Q8VDK3), ELG_DROME   (Q04688), ELK1_HUMAN  (P19419), 
ELK1_MOUSE  (P41969), ELK1_RAT(A4GTP4), ELK3_HUMAN  (P41970), 
ELK3_MOUSE  (P41971), ELK4_HUMAN  (P28324), ELK4_MOUSE  (P41158), 
ERFL_HUMAN  (A0A1W2PQ73), ERF_HUMAN   (P50548), ERF_MOUSE   (P70459), 
ERG_CHICK   (Q90837), ERG_HUMAN   (P11308), ERG_LYTVA   (Q01414), 
ERG_MOUSE   (P81270), ET96B_DROME (Q8MRW5), ETS1A_CHICK (P13474), 
ETS1A_XENLA (P18755), ETS1B_CHICK (P15062), ETS1B_XENLA (P18756), 
ETS1_HUMAN  (P14921), ETS1_MOUSE  (P27577), ETS1_RAT(P41156), 
ETS2A_XENLA (P19102), ETS2B_XENLA (Q91712), ETS2_BOVIN  (A1A4L6), 
ETS2_CHICK  (P10157), ETS2_HUMAN  (P15036), ETS2_LYTVA  (P29773), 
ETS2_MOUSE  (P15037), ETS3_DROME  (P29774), ETS4_CAEEL  (A8WFJ9), 
ETS4_DROME  (P29775), ETS5_CAEEL  (Q18579), ETS6_DROME  (P29776), 
ETS7_CAEEL  (O01519), ETV1_BOVIN  (Q2KIC2), ETV1_HUMAN  (P50549), 
ETV1_MOUSE  (P41164), ETV2_HUMAN  (O00321), ETV2_MOUSE  (P41163), 
ETV3L_HUMAN (Q6ZN32), ETV3_ATEGE  (A2D4Z7), ETV3_GORGO  (A1YF15), 
ETV3_HUMAN  (P41162), ETV3_MOUSE  (Q8R4Z4), ETV3_PANPA  (A1YG91), 
ETV3_PANTR  (A2T762), ETV4_DANRE  (Q9PUQ1), ETV4_HUMAN  (P43268), 
ETV4_MOUSE  (P28322), ETV5_HUMAN  (P41161), ETV5_MOUSE  (Q9CXC9), 
ETV6_BOVIN  (Q0VC65), ETV6_HUMAN  (P41212), ETV6_MOUSE  (P97360), 
ETV7_HUMAN  (Q9Y603), FEV_DANRE   (A3FEM2), FEV_HUMAN   (Q99581), 
FEV_MOUSE   (Q8QZW2), FEV_RAT (O70132), FLI1_BOVIN  (Q29RS8), 
FLI1_HUMAN  (Q01543), FLI1_MOUSE  (P26323), FLI1_XENLA  (P41157), 
GABPA_HUMAN (Q06546), GABPA_MOUSE (Q00422), MYBE_AVILE  (P01105), 
PNT_DROME   (P51023), POK_DROME   (Q01842), SPDEF_HUMAN (O95238), 
SPDEF_MOUSE (Q9WTP3), SPI1_HUMAN  (P17947), SPI1_MOUSE  (P17433), 
SPI1_PIG(Q6PKU1), SPI1_RAT(Q6BDS1), SPIB_HUMAN  (Q01892), 
SPIB_MOUSE  (O35906), SPIB_PALPA  (Q9I8M6), SPIB_RAT(Q5EBA3), 
SPIC_BOVIN  (Q1RML4), SPIC_HUMAN  (Q8N5J4), SPIC_MOUSE  (Q6P3D7)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

104 PDB

1AWC; 1BC7; 1BC8; 1DUX; 1FLI; 1GVJ; 1HBX; 1K6O; 1K78; 1K79; 1K7A; 1MD0; 1MDM; 1PUE; 1R36; 1WWX; 1YO5; 2DAO; 2LF7; 2LF8; 2MD5; 2NNY; 2STT; 2STW; 2YPR; 3JTG; 3MFK; 3RI4; 3WTS; 3WTT; 3WTU; 3WTV; 3WTW; 3WTX; 3WTY; 3WTZ; 3WU0; 3WU1; 3ZP5; 4AVP; 4BNC; 4BQA; 4CO8; 4IRG; 4IRH; 4IRI; 4L0Y; 4L0Z; 4L18; 4LG0; 4MHG; 4UNO; 4UUV; 5E8G; 5E8I; 5ILS; 5ILU; 5ILV; 5JVT; 5W3G; 5YBC; 5YBD; 5ZMC; 6DA1; 6DAT; 6VG2; 6VG8; 6VGD; 6VGE; 6VGG; 7JSA; 7JSL; 8BZM; 8E3K; 8E3R; 8E4H; 8E5Y; 8E66; 8E67; 8EBH; 8EE9; 8EJ6; 8EJ8; 8EK3; 8EK8; 8EKJ; 8EKU; 8EKV; 8EKZ; 8EM9; 8EMD; 8ENG; 8EO1; 8EO4; 8EQG; 8EQK; 8EQL; 8EVH; 8EVI; 8EVJ; 8SMH; 8SMJ; 8SP1; 8T9U
» more