Entry: PS50070

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] KRINGLE_2
Accession [info] PS50070
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-1997 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00020
Associated ProRule [info] PRU00121

Name and characterization of the entry

Description [info] Kringle domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=79;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=74;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.7529; R2=.00952475; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-3432.90349; R2=27.88296; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=813; N_SCORE=8.5; H_SCORE=16308; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=603; N_SCORE=6.5; H_SCORE=13381; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-15, 29,-30, 44, 37,-36,-15,  1,-34,  5,-25,-24, 10, -6, 13, -4,  0,-10,-30,-34,-19, 25;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y'; M=-11,-21,-25,-25,-20, 16,-27, -1, 10,-12,  9, 15,-20,-25,-12,-12,-18, -9,  3,  1, 31,-18;
/M: SY='H'; M=-13, -8,-26, -9,  0, -9,-23, 16,-13, -2, -9, -1, -5,-15,  2,  2, -8, -6,-13,-19,  4, -1;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-11, -4,-14,-29, 45,-17,-38,-18,-28,-21,  0,-21,-17,-19, -1,-17,-27,-26,-28,-16;
/M: SY='N'; M= -9, 19,-22, 11,  2,-22,-10,  1,-19,  4,-22,-14, 26,-17,  5,  5,  5,  0,-21,-32,-14,  3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M=-10, -1,-27,  1, 17,-26,-19,  0,-19, 11,-16, -7, -2,-11, 16,  8, -4, -8,-17,-25,-11, 16;
/M: SY='S'; M= -1,  8,-18,  3, -2,-19,  5, -6,-22, -7,-25,-17, 16,-15, -2, -7, 17,  6,-18,-33,-18, -2;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R'; M=-18, -7,-30, -7,  3,-21,-19,  1,-27, 25,-18, -7,  0,-18, 12, 54, -9,-10,-20,-21,-10,  4;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M= -4,  2,-18, -4, -3,-17,-18,-12,-16,  5,-16,-10,  5,-10, -3,  1,  8, 21, -9,-28,-11, -4;
/M: SY='V'; M= -1,-19,-19,-22,-17, -2,-21,-13,  5,-12,  2,  5,-16,-21,-13,-12, -7, -1,  9,-13,  0,-16;
/M: SY='S'; M= 14,  6,-13,  2, -1,-20, -1, -9,-19, -8,-25,-18, 12,-12, -3,-10, 25, 10,-12,-35,-19, -2;
/M: SY='T'; M= -5, -8,-17,-14,-10,-10,-23,-15, -4, -2, -7, -4, -7,-15, -9, -3,  3, 20,  5,-27, -8,-10;
/M: SY='T'; M=  0,  2,-12, -6, -9,-12,-19,-19,-10,-10,-11,-10,  1,-10, -9,-11, 17, 41, -1,-30,-11, -9;
/M: SY='V'; M= -4,-12,-20,-14, -5,-12,-22,-13, -2, -2, -5,  0,-11,-17, -7, -2, -4,  3,  5,-20, -9, -7;
/M: SY='S'; M=  5,  0,-13, -5, -5,-17, -6,-11,-15, -7,-19,-12,  6,-12, -4, -9, 22, 21, -8,-33,-15, -5;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-19,-30, 68,-20,-40,-19,-30,-20,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-19;
/M: SY='R'; M= -5,-16,-23,-19,-11,-11,-23,-10,  0, -1, -1,  1,-10,-19, -7,  8, -9, -4,  3,-23, -7,-11;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-26, -3,  7,-23,-19,-13,-19,  1,-21,-14, -5, 19,  1, -5,  4,  9,-17,-29,-18,  2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M= -9, -6,-27, -7, 10,-29,-22,  3,-11,  0, -7,  3, -5,-14, 40,  2, -4, -8,-20,-21, -8, 25;
/M: SY='A'; M=  6, -6,-22, -8,  0,-21, -9, -8,-18,  1,-17,-10, -2, -1, -1,  3,  3, -3,-14,-26,-16, -2;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='N'; M=  3, 17,-18, 16,  2,-24, -2, -5,-23, -4,-26,-20, 18,-13, -2, -6, 16,  4,-17,-36,-20,  0;
/M: SY='S'; M= 15, -3,-13, -5, -1,-20, -4, -9,-17, -7,-22,-15,  3,-11,  0, -9, 25, 11, -9,-33,-18, -1;
/M: SY='L'; M=  5,-15,-20,-15,  3, -8,-20,-15,  0,-15, 18,  3,-18,-18, -8,-15,-13, -8, -3,-23,-10, -3;
/M: SY='T'; M= -2, -8,-18,-12, -5, -6,-20,-10, -5,-11, -7, -4, -6,-12, -6,-12,  6, 14, -3,-22, -2, -7;
/M: SY='P'; M= -7,-20,-34,-13, -3,-23,-21,-20,-12,-12,-18,-13,-20, 60,-11,-19,-10, -7,-18,-29,-24,-11;
/M: SY='H'; M=-16, -1,-28, -1, -2,-17,-20, 68,-22, -8,-14,  0,  6,-20,  5, -2, -9,-15,-23,-28, 14, -2;
/M: SY='R'; M= -6, -8,-26, -8,  1,-20,-15, -7,-19,  8,-15, -8, -5,-16,  8, 14, -4, -5,-15,-13, -9,  3;
/M: SY='H'; M=-16, -3,-31, -2,  1,-22,-20, 59,-26, -3,-19, -4,  4, -4,  8,  0,-10,-16,-27,-28,  6,  1;
/I:         I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='S'; M= -6, -1,-24, -2,  1,-21,-11, -9,-15,  0,-18,-10,  3, -6,  2,  0,  4,  1,-13,-29,-15,  0;
/M: SY='Y'; M=-18,-18,-27,-22,-15, 22,-27,  1, -7, -2, -4, -1,-12,-24,-12,  6,-16,-10, -8,  1, 28,-15;
/M: SY='T'; M= -4, -3,-16,-10,-10,-10,-20, -8, -3,-13, -6, -5,  1,-15, -8,-11,  8, 21, -2,-28, -6,-10;
/M: SY='P'; M= -1,-15,-31,-10, -2,-23,-15,-18,-18,-10,-24,-16,-14, 52, -7,-17, -3, -5,-22,-27,-23, -7;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-26,  5, 22,-23,-13,  1,-25,  0,-20,-16,  0, -9,  8, -2,  3, -2,-22,-19,-12, 15;
/M: SY='R'; M= -9,  4,-22, -3, -2,-11,-15, -4,-18,  7,-18,-12, 11,-15, -1, 12,  2,  5,-15,-23, -5, -3;
/M: SY='Y'; M=-13, -9,-25,-13,-12, 16,-20,  6,-12,-12,-10, -8, -3,-11,-13, -9, -8, -7,-15, -6, 20,-13;
/M: SY='P'; M= -9, -4,-34,  3,  2,-29,-16,-13,-22, -4,-27,-19, -5, 49, -6,-11, -5, -8,-27,-31,-25, -5;
/M: SY='N'; M=  3,  5, -5,  0, -6,-22, -1, -8,-23, -8,-21,-16, 10,-19, -6, -9,  3, -6,-19,-25,-19, -6;
/I:         MD=-23;
/M: SY='A'; M= 13, -8,-20,-11, -3,-20,-10,-15,-11,  5,-12, -6, -7,-12, -2, -4,  0, -4, -5,-22,-14, -3; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -8,  4,-26,  5, -7,-23, 18,-11,-24,-10,-14,-13,  6,-17,-10,-11, -5,-12,-21,-26,-19, -8; D=-4;
/I:         DM=-23;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-22,-27,-20,  5,-13,-20,  9,-28, 34, 12,-24,-28,-21,-20,-24,-12,  3,-19, -4,-20;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-26,  6, 16,-24,-18, -7,-20, 11,-19,-12,  3, -9,  7,  8, -1, -1,-17,-27,-14, 11;
/M: SY='E'; M=-12,  3,-28,  6, 22,-23,-19, 17,-22,  9,-16, -2,  0,-10, 12,  6, -7,-12,-21,-27, -7, 15;
/M: SY='N'; M= -9, 39,-20, 19,  0,-20,  0,  9,-20,  0,-30,-20, 58,-20,  0,  0, 10,  0,-29,-40,-20,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 13,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-22;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  1,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 69,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D'; M=-20, 48,-30, 67, 19,-39,-10,  0,-40,  1,-30,-29, 19,-10,  0, -7,  0,-10,-30,-39,-20, 10;
/M: SY='G'; M=  4,  1,-25, -3,-11,-25, 33,-12,-30,-10,-26,-18, 10,-16,-11,-10,  4,-10,-24,-23,-24,-11;
/M: SY='D'; M=-11, 24,-26, 35, 21,-32,-12, -3,-30,  3,-25,-21, 10,-10,  6, -4,  4, -6,-23,-34,-18, 13;
/M: SY='E'; M= -1, -8,-24, -7,  7,-20,-18,-14,-11,  1,-13, -9, -8,  0, -1, -3, -2, -2, -8,-26,-16,  1;
/M: SY='R'; M= -2, -2,-24, -5,  1,-23, -3,  0,-26,  8,-22,-12,  5,-15,  4, 17,  2, -5,-19,-25,-14,  1;
/I:         I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='P'; M= -8,-20,-39,-11, -1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-20, 85,-10,-20, -9,-10,-28,-30,-29,-10;
/M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-39,-30, 11,-20,-28,-19,-20,-19,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,146, 32,-20;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-28,-24,-21, 39,-30, 15, -1,-15,  1,  0,-19,-30,-16,-12,-20,-10, -9, 22, 65,-21;
/M: SY='T'; M=  0, -7,-10,-15,-15, -8,-22,-22, -1,-12, -5, -5, -7,-15,-15,-12, 13, 38, 12,-30,-10,-15;
/M: SY='T'; M= -2, -9,-16,-16,-11, -8,-16,-14, -5,-10, -2,  4, -7,-15, -5, -8,  5, 20, -1,-25, -8, -8;
/I:         I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='D'; M=-12, 35,-26, 42,  9,-32,  0, -1,-33, -1,-29,-25, 25,-14, -1, -6,  3, -8,-28,-36,-20,  4;
/M: SY='P'; M= -9,-16,-34, -9, -1,-26,-16,-16,-19, -8,-23,-16,-15, 56, -5,-13, -6, -8,-25,-29,-25, -7;
/M: SY='R'; M= -7,  3,-23,  3,  7,-25,-10, -5,-24,  8,-22,-14,  6, -8,  6,  9,  3, -2,-20,-28,-16,  6;
/M: SY='V'; M= -6,-18,-21,-20,-15, -8,-23,-19,  7, -5,  1,  4,-17,-20,-11, -8,-10, -3, 13,-22, -5,-14;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='R'; M=-15,-11,-27,-10, -3,-13,-21, -7,-19, 10,-10, -7, -5,-12,  0, 34, -9, -5,-14,-22, -9, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='W'; M=-16,-31,-34,-33,-25, 21,-24,-20, -8,-17, -7, -8,-28,-28,-21,-12,-25,-16,-10, 66, 25,-21;
/M: SY='E'; M=-10, 17,-30, 27, 41,-33,-13,  0,-31,  6,-23,-20,  4, -5, 17, -3,  0,-10,-29,-30,-19, 29;
/M: SY='Y'; M=-17,-18,-27,-19,-13, 28,-28,  8, -2,-12,  0, -2,-18,-26,-12,-11,-16, -9, -8, 15, 54,-15;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-8; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='D'; M= -7, 23,-24, 24,  6,-28, -7, -1,-24,  0,-24,-15, 18,-10,  3, -5,  5, -3,-22,-34,-18,  4;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-34,-26,  3,-34,-26, 34,-27, 26, 18,-24,-25,-21,-24,-20, -6, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='P'; M= -7, -9,-30, -6,  1,-26,-18,-10,-20,  0,-25,-15, -7, 39, -2, -6, -2, -1,-23,-29,-20, -3;
/M: SY='R'; M= -7, -2,-25, -2,  5,-22,-17, -3,-18,  8,-17, -8, -1,-12, 13, 14,  0, -3,-15,-23, -9,  7;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 219 in 94 different sequences
Number of true positive hits 219 in 94 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 38
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Kringle
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
94 sequences

APOA_HUMAN  (P08519), APOA_MACMU  (P14417), FA12_BOVIN  (P98140), 
FA12_CAVPO  (Q04962), FA12_HUMAN  (P00748), FA12_MOUSE  (Q80YC5), 
FA12_PIG    (O97507), FA12_RAT    (D3ZTE0), HABP2_BOVIN (Q5E9Z2), 
HABP2_HUMAN (Q14520), HABP2_MOUSE (Q8K0D2), HABP2_RAT   (Q6L711), 
HGFA_CANFA  (Q6QNF4), HGFA_HUMAN  (Q04756), HGFA_MOUSE  (Q9R098), 
HGFL_BOVIN  (Q24K22), HGFL_HUMAN  (P26927), HGFL_MOUSE  (P26928), 
HGF_BOVIN   (Q76BS1), HGF_CANFA   (Q867B7), HGF_FELCA   (Q9BH09), 
HGF_HUMAN   (P14210), HGF_MOUSE   (Q08048), HGF_RAT     (P17945), 
KREM1_HUMAN (Q96MU8), KREM1_MOUSE (Q99N43), KREM1_RAT   (Q924S4), 
KREM1_XENLA (Q90Y90), KREM2_HUMAN (Q8NCW0), KREM2_MOUSE (Q8K1S7), 
LPAL2_HUMAN (Q16609), MST1L_HUMAN (Q2TV78), MUSK_CHICK  (Q8AXY6), 
NETR_GORGO  (Q5G270), NETR_HUMAN  (P56730), NETR_MACMU  (Q5G267), 
NETR_MOUSE  (O08762), NETR_NOMLE  (Q5G268), NETR_PANTR  (Q5G271), 
NETR_PONPY  (Q5G269), NETR_RAT    (G3V801), NETR_SAGLB  (Q5G265), 
NETR_TRAPH  (Q5G266), P3IP1_BOVIN (Q1RMT9), P3IP1_DANRE (Q7SXB3), 
P3IP1_HUMAN (Q96FE7), P3IP1_MOUSE (Q7TMJ8), P3IP1_PONAB (Q5RCS3), 
P3IP1_RAT   (Q56A20), PLMN_BOVIN  (P06868), PLMN_CANFA  (P80009), 
PLMN_CAPHI  (Q7M323), PLMN_ERIEU  (Q29485), PLMN_HORSE  (P80010), 
PLMN_HUMAN  (P00747), PLMN_MACEU  (O18783), PLMN_MACMU  (P12545), 
PLMN_MOUSE  (P20918), PLMN_PETMA  (P33574), PLMN_PIG    (P06867), 
PLMN_PONAB  (Q5R8X6), PLMN_RAT    (Q01177), PLMN_SHEEP  (P81286), 
ROR1_DROME  (Q24488), ROR1_HUMAN  (Q01973), ROR1_MOUSE  (Q9Z139), 
ROR2_DROME  (Q9V6K3), ROR2_HUMAN  (Q01974), ROR2_MOUSE  (Q9Z138), 
THRB_BOVIN  (P00735), THRB_HUMAN  (P00734), THRB_MOUSE  (P19221), 
THRB_PIG    (Q19AZ8), THRB_PONAB  (Q5R537), THRB_RAT    (P18292), 
TPA_BOVIN   (Q28198), TPA_HUMAN   (P00750), TPA_MOUSE   (P11214), 
TPA_PIG     (Q8SQ23), TPA_PONAB   (Q5R8J0), TPA_RAT     (P19637), 
UROK_BOVIN  (Q05589), UROK_CHICK  (P15120), UROK_HUMAN  (P00749), 
UROK_MOUSE  (P06869), UROK_PAPCY  (P16227), UROK_PIG    (P04185), 
UROK_PONAB  (Q5RF29), UROK_RABIT  (Q8MHY7), UROK_RAT    (P29598), 
URT1_DESRO  (P98119), URT2_DESRO  (P15638), URTB_DESRO  (P98121), 
URTG_DESRO  (P49150)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

THRB_SALSA  (P84122)

		
PDB
[Detailed view]
64 PDB

1A0H; 1B2I; 1BHT; 1CEA; 1CEB; 1GMN; 1GMO; 1GP9; 1HPJ; 1HPK; 1I5K; 1I71; 1JFN; 1KDU; 1KI0; 1KIV; 1KRN; 1NK1; 1NL1; 1NL2; 1PK2; 1PK4; 1PKR; 1PMK; 1PML; 1TPK; 1URK; 2DOH; 2DOI; 2FD6; 2FEB; 2HPP; 2HPQ; 2I9A; 2I9B; 2K4R; 2K51; 2KNF; 2L0S; 2PF1; 2PF2; 2PK4; 2QJ2; 2QJ4; 2SPT; 3BT1; 3BT2; 3E6P; 3HN4; 3K65; 3KIV; 3LAQ; 3MKP; 3NXP; 3SP8; 3U73; 4A5T; 4DUR; 4DUU; 4HZH; 4IUA; 4K24; 4KIV; 5HPG
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission