![]() |
|
|||||||
| Entry: PS50127 |
| General information about the entry | |
|---|---|
| Entry name | UBIQUITIN_CONJUGAT_2 |
| Accession number | PS50127 |
| Entry type | MATRIX |
| Date | DEC-2001 (CREATED); DEC-2001 (DATA UPDATE); DEC-2011 (INFO UPDATE). |
| PROSITE Documentation | PDOC00163 |
| Associated ProRule | PRU00388 |
| Name and characterization of the entry | |
| Description | Ubiquitin-conjugating enzymes family profile. |
| Matrix / Profile | /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=134;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.1178; R2=.01323497; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=633; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=482; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z
/I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-25, -9, -2,-13,-19, -7,-16, 16,-14, -6, -1,-17, 1, 18, -6, -4,-13,-20, -4, -2;
/M: SY='R'; M=-15,-12,-26,-13, -4,-13,-20, -5,-21, 16,-10, -6, -4,-20, 3, 47, -9, -6,-14,-21, -8, -4;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-30,-20, 4,-32,-22, 25,-26, 35, 17,-26,-26,-19,-20,-24, -9, 16,-21, -2,-20;
/M: SY='M'; M= -7,-14,-20,-19, -8, -8,-23, -7, 0, -5, 6, 14,-13,-19, 5, -3,-13, -7, -4,-19, -3, -2;
/M: SY='K'; M= -7, -2,-28, -1, 13,-27,-19, -7,-27, 33,-24,-10, -2,-11, 11, 26, -7, -9,-20,-20,-12, 11;
/M: SY='E'; M=-12, 15,-30, 26, 50,-32,-18, 1,-31, 8,-22,-20, 3, -2, 21, -1, 0,-10,-30,-31,-19, 35;
/M: SY='L'; M=-10,-25,-21,-28,-20, 17,-28,-16, 10,-19, 22, 9,-22,-27,-19,-12,-20, -7, 7,-12, 9,-20;
/M: SY='K'; M= 2, -1,-23, -3, 7,-24,-15, -7,-20, 17,-19, -7, -2,-11, 7, 9, 0, -2,-14,-24,-12, 6;
/M: SY='D'; M= -9, 10,-26, 15, 14,-26,-13, -3,-25, 7,-18,-15, 5,-12, 6, 7, 0, -5,-20,-29,-15, 9;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-21,-30,-22, 3,-23,-21, 13,-25, 23, 13,-26,-27,-18,-20,-23,-11, 7, 1, 0,-20;
/M: SY='Q'; M= -5, -5,-12, -6, 0,-23,-18, -8,-13, 0,-13, -5, -5,-17, 8, 3, -3, -4,-10,-27,-13, 3;
/M: SY='K'; M= -9, 1,-27, 3, 15,-26,-19, -5,-23, 22,-18, -9, -1,-11, 12, 16, -6, -8,-19,-24,-12, 13;
/I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='D'; M=-12, 21,-23, 25, 10,-29,-10, -2,-26, 2,-23,-18, 12, -9, 2, -3, -1, -7,-22,-32,-17, 5; D=-6;
/I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -6,-15,-31,-11, -3,-24,-18,-12,-16, -6,-22,-13,-14, 43, -7,-13, -6, -4,-18,-28,-20, -8;
/M: SY='P'; M= -6,-17,-28,-14, -6,-20,-18,-18, -9, -9,-15, -8,-15, 30, -8,-11, -6, -3,-10,-28,-20,-10;
/M: SY='P'; M= -2, -2,-22, 1, 2,-18,-16,-12,-16, -5,-16,-12, -6, 5, -3, -9, -2, -3,-13,-27,-16, -2;
/M: SY='G'; M= -3, -4,-25, -7,-13,-20, 33, -8,-29,-13,-25,-14, 5,-18,-11,-13, 4, -9,-23,-23,-17,-12;
/M: SY='F'; M=-10,-26, -6,-33,-27, 21,-27,-22, 11,-26, 7, 3,-20,-27,-27,-23,-15, -7, 11,-13, 8,-27;
/M: SY='S'; M= -3, -4,-19, -6, -4,-14,-14, 0,-14, -1,-18,-10, 2,-16, -1, 1, 11, 6, -8,-27, -4, -4;
/M: SY='A'; M= 21, -9,-15,-16,-13,-15, -5,-16, -3,-14, -6, -5, -7,-17,-13,-18, 2, -3, 4,-25,-16,-14;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-25, -9, -3,-17, 3,-13,-18, -4,-18,-11, -3,-15, -3, -6, 0, -7,-14,-17,-13, -3;
/M: SY='P'; M= -9,-20,-31,-17, -8,-15,-20,-20, -7,-14, -9, -8,-19, 36,-12,-16,-11, -5,-13,-26,-18,-13;
/M: SY='V'; M= -5,-12,-15,-15,-13, -9,-22,-14, 5, -9, -1, 2, -9,-21,-11,-10, -4, 0, 11,-27, -8,-12;
/M: SY='D'; M= -8, 13,-27, 21, 16,-27, -9, -6,-25, 1,-23,-19, 4, -5, 1, -7, 2, -7,-21,-29,-15, 8;
/M: SY='D'; M=-13, 25,-23, 29, 21,-26, -9, 0,-30, 2,-25,-22, 19,-12, 3, -2, 2, -7,-27,-34,-18, 12;
/I: MD=-15;
/M: SY='D'; M= -2, 8,-13, 10, 5,-15, -5, -4,-15, 2,-15,-11, 6, -5, 0, -2, 6, 1,-11,-18, -9, 2; D=-3;
/I: I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='N'; M= -8, 30,-22, 25, 3,-25, -3, 1,-23, -2,-26,-20, 32,-15, -1, -5, 7, -2,-24,-36,-19, 1; D=-3;
/I: DM=-15;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-32,-23, 6,-30,-21, 24,-25, 29, 20,-25,-26,-17,-20,-23, -9, 16,-14, 0,-21;
/M: SY='F'; M=-11,-14,-16,-20,-14, 13,-23, -6, -3,-14, 1, 6,-11,-22, -8, -9, -8, -1, -4,-13, 9,-10;
/M: SY='E'; M=-11, -1,-28, 1, 12,-20,-20, 8,-18, 3,-15, -7, -1,-10, 8, 1, -5, -7,-19,-19, -5, 9;
/M: SY='W'; M=-18,-36,-40,-38,-28, 23,-24,-27,-10,-21, -7,-11,-33,-29,-23,-19,-33,-23,-18, 96, 25,-22;
/M: SY='Q'; M=-10, 1,-25, -1, 4,-18,-15, 4,-17, 2,-16, -8, 5,-15, 8, 1, 0, -2,-17,-24, -6, 5;
/M: SY='V'; M= 10,-20, -7,-24,-20, -8, -9,-23, 4,-18, -3, -2,-18,-22,-21,-20, -4, -4, 15,-24,-13,-21;
/M: SY='T'; M= -3,-12,-19,-16,-11, -8,-19,-18, 4,-13, 0, 1,-10,-16,-12,-14, -1, 9, 6,-26, -9,-12;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-37,-29, 12,-33,-27, 35,-28, 18, 16,-21,-23,-24,-26,-19, -9, 24,-17, 3,-29;
/I: MD=-21;
/M: SY='M'; M= -6,-13,-23,-16,-10, -6,-22, -9, 1, -9, -2, 5,-11, -7, -7, -9, -7, -4, -1,-22, -5,-10; D=-4;
/I: MD=-21;
/M: SY='G'; M= -1,-10,-27,-10,-18,-27, 60,-18,-35,-17,-27,-18, -1,-19,-18,-16, 0,-18,-26,-19,-27,-18; D=-4;
/I: MD=-21;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-35,-11, -2,-26,-20,-19,-16, -7,-24,-16,-18, 68, -9,-16, -9, -7,-22,-28,-25, -9; D=-4;
/I: I=-8; MI=-5; MD=-21; IM=-5; DM=-21;
/M: SY='P'; M= -4, -1,-27, 4, 8,-25,-15,-10,-21, 1,-21,-16, -4, 19, 0, -4, -1, -3,-20,-28,-19, 2; D=-4;
/I: DM=-21;
/M: SY='D'; M=-13, 25,-29, 36, 12,-33, 6, -1,-36, -1,-27,-23, 13,-12, -1, -6, -1,-12,-29,-32,-19, 5; D=-4;
/I: DM=-21;
/M: SY='T'; M= 2, -1,-12, -7, -6,-14, -8,-16,-15,-10,-17,-13, 2, -8, -7,-10, 22, 34, -6,-31,-14, -7; D=-4;
/I: DM=-21;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-32,-15, -8,-15,-22,-18, -4,-16, -5, -6,-19, 37,-13,-20,-14, -9,-13,-25,-15,-14;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-31,-24,-22, 32,-29, 11, -2,-13, -1, -2,-22,-30,-14,-12,-22,-12,-11, 42, 70,-21;
/I: I=-10; MI=-50; MD=-50; IM=-50;
/M: SY='E'; M= -1, 9,-26, 12, 32,-29,-14, 0,-25, 7,-20,-15, 3, -6, 16, -1, 2, -7,-24,-27,-17, 24; D=-6;
/I: I=-10; MI=-50; IM=-50; DM=-50;
/M: SY='G'; M= -5, 6,-28, 5,-10,-28, 41,-12,-35,-11,-29,-20, 10,-18,-13,-13, 1,-13,-28,-24,-23,-12;
/M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-10,-17,-28, 60,-16,-37,-17,-27,-17, -1,-19,-17,-16, -1,-19,-28,-20,-27,-17;
/M: SY='V'; M= -4,-20,-17,-24,-18, 4,-27,-20, 12,-16, 6, 4,-18,-22,-17,-15, -7, 3, 17,-21, -2,-17;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-26,-36,-28, 61,-29,-14, -1,-25, 5, -2,-22,-30,-32,-18,-22,-12, -5, 29, 38,-27;
/M: SY='K'; M=-11, 0,-26, -1, 9,-18,-19, -1,-21, 16,-18, -9, 3,-12, 5, 13, -5, -7,-18,-24, -9, 7;
/M: SY='L'; M= 1,-26,-19,-30,-23, 6,-21,-23, 17,-24, 21, 11,-23,-25,-22,-21,-16, -7, 16,-19, -4,-22;
/M: SY='T'; M= -8, 2,-23, 2, 3,-21,-17, -8,-16, 4,-16,-10, 2,-13, 2, 4, 3, 5,-11,-28,-12, 2;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-21,-34,-26, 3,-32,-23, 34,-25, 25, 23,-25,-25,-20,-22,-20, -8, 27,-22, -2,-25;
/M: SY='E'; M= -9, 6,-24, 8, 12,-17,-18, 7,-20, -1,-16,-12, 4,-12, 3, -3, 1, -2,-18,-26, -5, 7;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-16,-37,-28, 50,-31,-21, 10,-29, 16, 6,-22,-29,-33,-21,-21, -9, 8, -3, 18,-28;
/I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='P'; M= -8,-11,-33, -6, -1,-27,-11,-17,-21, -9,-28,-19,-10, 59, -9,-16, -4, -5,-26,-29,-26, -8; D=-6;
/I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -7, 7,-27, 13, 21,-27,-16, -4,-23, 1,-21,-16, 0, 4, 5, -6, 2, -4,-20,-31,-18, 12;
/M: SY='D'; M= -8, 23,-25, 26, 14,-29, -8, 1,-28, 3,-25,-19, 16,-11, 3, -4, 3, -5,-23,-33,-17, 8;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-30,-21,-21, 31,-30, 17, -1,-11, 0, -1,-21,-30,-12,-11,-21,-11,-10, 33, 76,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 89,-10,-19,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='F'; M=-12,-11,-21,-18,-16, 24,-22, -7, 0,-16, 0, 2, -5,-23,-17,-13,-10, -5, -3, -8, 15,-16;
/I: MD=-15;
/M: SY='K'; M= -2, 1,-24, 0, 9,-26,-11, -9,-23, 22,-25,-12, 4,-10, 6, 11, 2, -4,-17,-25,-14, 7; D=-6;
/I: MD=-15;
/M: SY='P'; M= -4,-15,-34, -7, -1,-27,-16,-18,-19,-10,-26,-18,-15, 65, -9,-18, -4, -6,-25,-30,-27, -8;
/I: I=-5; MI=-10; IM=-10; DM=-15;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='K'; M= -5, -3,-24, -6, 2,-19,-18, -8,-20, 21,-21, -8, 0,-13, 6, 13, 0, 0,-14,-22, -7, 3;
/M: SY='V'; M= -4,-27, -4,-31,-27, 3,-28,-26, 21,-23, 12, 10,-25,-28,-26,-21,-13, -4, 29,-26, -7,-27;
/M: SY='R'; M= -2, -8,-18,-11, -5,-18, -9,-12,-18, 6,-15, -9, -4,-16, -3, 12, -1, 0,-10,-23,-12, -5;
/M: SY='F'; M=-19,-28,-17,-37,-26, 68,-29,-19, -1,-28, 9, 1,-19,-29,-34,-19,-19,-10, -1, 5, 25,-26;
/M: SY='V'; M= -7,-15,-17,-18,-14, -8,-27,-19, 9,-11, 5, 4,-14,-18,-13, -9, -9, 1, 10,-26, -8,-15;
/M: SY='T'; M= 0, -1,-16, -8, -7,-15,-16,-13,-10, -9,-15,-11, 3, -4, -6,-10, 15, 26, -5,-31,-13, -7;
/I: I=-4; MI=-20; MD=-20; IM=-20;
/M: SY='K'; M= -8, -3,-29, -2, 7,-26,-16, -9,-24, 23,-24,-11, -1, 4, 4, 16, -6, -8,-19,-24,-15, 4; D=-1;
/I: DM=-20;
/M: SY='I'; M= -9,-23,-23,-31,-24, 0,-30,-20, 30,-20, 15, 22,-17,-20,-16,-18,-17, -8, 22,-22, -3,-22;
/M: SY='Y'; M=-17,-24,-29,-27,-23, 34,-21, -5, -7,-19, -3, -5,-19,-26,-21,-15,-20,-13,-12, 33, 37,-21;
/M: SY='H'; M=-19, 0,-29, -1, -1,-19,-20, 85,-27, -8,-19, 0, 9,-20, 9, 3, -9,-16,-27,-29, 16, -1;
/M: SY='P'; M=-10,-19,-32,-11, -3,-24,-20,-19,-19,-11,-27,-19,-17, 75,-12,-20,-10, -9,-27,-29,-26,-11;
/M: SY='N'; M=-10, 31,-21, 15, 0,-17, -1, 8,-19, -1,-25,-17, 47,-20, -1, -1, 7, -2,-27,-36,-17, -1;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-34,-29, 0,-35,-29, 38,-25, 16, 15,-25,-22,-24,-25,-16, -6, 36,-25, -5,-29;
/M: SY='D'; M=-12, 16,-25, 18, -1,-10,-11, 5,-20, -5,-20,-16, 13,-18, -4, -8, 1, -4,-20,-18, 9, -4;
/M: SY='S'; M= 3, -6,-22, -5, 4,-19,-13,-12,-15, -5,-18,-14, -3, 7, -2, -8, 9, 2,-13,-30,-18, 0;
/I: MD=-23;
/M: SY='N'; M= -5, 10,-20, 8, 2,-19,-12, -5,-16, -1,-17,-11, 11,-12, 1, -3, 4, 1,-13,-30,-14, 1; D=-4;
/I: I=-5; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -1,-10,-25,-10,-19,-28, 61,-19,-37,-19,-28,-19, -1,-17,-19,-19, -1,-18,-28,-20,-28,-19; D=-4;
/I: DM=-23;
/M: SY='S'; M= 2, 2,-20, 0, 8,-21,-11, -6,-20, 4,-20,-14, 5,-11, 3, 4, 10, 5,-13,-30,-15, 5;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-34,-28, 3,-34,-28, 36,-26, 20, 15,-24,-24,-23,-25,-17, -6, 31,-23, -3,-28;
/M: SY='C'; M=-11,-15,101,-22,-25,-20,-28,-23,-30,-27,-20,-19,-16,-37,-26,-27,-10,-10,-12,-46,-24,-26;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-30,-21, 6,-30,-22, 22,-28, 39, 17,-27,-25,-20,-21,-25, -9, 13,-21, -2,-21;
/M: SY='D'; M=-10, 25,-25, 34, 12,-31, -9, -2,-31, 1,-29,-23, 15, -4, 1, -4, 8, -2,-24,-37,-19, 6;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-25,-33,-26, -2,-34,-25, 36,-23, 16, 19,-20,-21,-18,-22,-17, -8, 27,-22, -3,-25;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-16,-29,-21, 4,-29,-20, 20,-28, 34, 15,-25,-27,-19,-21,-22, -8, 12,-22, -3,-21;
/M: SY='K'; M=-11, 4,-27, 3, 5,-21,-10, 7,-25, 10,-22,-11, 8,-14, 7, 8, -3, -8,-23,-24, -8, 5;
/M: SY='D'; M= -5, 10,-25, 12, 11,-26,-12, -2,-22, 0,-21,-15, 7, -5, 9, -2, 2, -4,-21,-27,-13, 9;
/I: I=-5; MI=-10; IM=-10; DM=-20; MD=-20;
/M: SY='Q'; M= -9, 7,-24, 4, 5,-25,-15, 2,-22, 10,-21,-10, 9,-13, 12, 11, 2, 3,-19,-27,-11, 7;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='S'; M= 4, 0,-15, -3, -1,-19, -8,-10,-18, -2,-22,-15, 7,-10, 0, -1, 22, 15,-11,-33,-16, -1;
/I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='P'; M= -4,-16,-34,-10, -1,-27,-17,-18,-18, -8,-26,-18,-15, 66, -9,-15, -6, -7,-24,-29,-26, -9; D=-6;
/I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A'; M= 17,-10,-15,-16, -8,-13,-10,-16, -2,-11, -6, -2, -8,-15, -9,-15, 4, 2, 3,-24,-13, -9;
/M: SY='Y'; M=-13,-21,-23,-24,-17, 8,-26, -1, 2,-18, 9, 7,-18,-25, -9,-14,-18, -7, -4, 4, 18,-14;
/M: SY='T'; M= -5, 13,-18, 13, 3,-22,-12,-10,-22, -2,-21,-17, 9,-10, -2, -6, 14, 20,-14,-33,-15, 1;
/M: SY='I'; M= -7,-27,-20,-30,-24, 3,-32,-19, 27,-25, 24, 16,-24,-26,-20,-21,-18, -5, 24,-22, -1,-24;
/M: SY='K'; M= -2, -3,-20, -3, 5,-20,-16, -9,-17, 7,-17, -9, -1,-13, 3, 7, 2, -2,-12,-26,-12, 3;
/M: SY='S'; M= 1, 1,-20, -3, 1,-21,-14, -6,-18, 4,-20,-11, 3,-12, 4, -1, 9, 9,-13,-22,-11, 3;
/M: SY='V'; M= 1,-26,-16,-31,-25, -5,-30,-27, 28,-20, 10, 10,-22,-23,-20,-21,-12, -5, 30,-25, -8,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-17,-31,-22, 11,-30,-20, 20,-28, 38, 18,-28,-29,-21,-20,-26, -9, 14,-19, 1,-22;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-20,-20,-11, -3,-26,-14, 8,-18, 20, 9,-16,-22,-10,-12,-13, 1, 5,-24, -5,-11;
/M: SY='S'; M= 8, -2,-15, -4, -1,-20, 3,-12,-18, -9,-23,-14, 4,-12, -3,-11, 23, 10,-10,-31,-19, -2;
/I: I=-10; MI=-15; IM=-15; DM=-20; MD=-20;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-25,-35,-26, 1,-34,-27, 35,-28, 25, 17,-23,-21,-20,-26,-20, -9, 24,-21, -2,-26;
/M: SY='Q'; M= -9,-13,-12,-14, -3,-22,-21,-10, -8, -6, -9, -1,-10,-12, 12, -3, -7, -9,-11,-22,-12, 3;
/M: SY='S'; M= 6, -3,-13, -5, -1,-15, -8,-10,-17, -6,-18,-12, 2,-14, -1, -4, 15, 4,-10,-29,-15, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-31,-21, 10,-29,-19, 20,-28, 42, 21,-29,-29,-19,-19,-28,-10, 12,-16, 1,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-30,-20, 12,-29,-19, 18,-27, 39, 19,-27,-25,-19,-19,-26, -9, 9,-19, 1,-20;
/M: SY='S'; M= 0, 3, -3, -3, -6,-15,-12, -9,-14, -9,-15,-11, 7,-17, -6,-10, 9, 7,-11,-32,-13, -6;
/M: SY='D'; M= -4, 17,-23, 23, 16,-26,-10, -2,-27, 0,-23,-20, 8,-10, 2, -7, 7, -1,-20,-31,-13, 8;
/M: SY='P'; M= -5,-17,-33,-11, -3,-25,-19,-20,-17,-10,-25,-17,-17, 65,-11,-19, -9, -9,-23,-28,-26,-11;
/M: SY='N'; M=-10, 32,-23, 24, 14,-25, -6, 5,-23, 1,-26,-20, 38,-15, 4, -2, 6, -4,-28,-37,-20, 9;
/I: I=-7; MI=-20; IM=-20; DM=-20; MD=-20;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-30, -8, -3,-23,-19,-19,-14,-11,-19,-14,-14, 47,-11,-18, -9, -6,-20,-29,-22,-10;
/M: SY='D'; M= -6, 18,-23, 19, 11,-25,-10, -3,-23, 0,-22,-17, 15,-12, 4, -5, 7, 1,-21,-32,-16, 8;
/M: SY='D'; M= -7, 19,-22, 28, 10,-29, -8, 0,-29, -3,-28,-22, 12, -7, 3, -5, 15, 2,-21,-37,-18, 6;
/M: SY='P'; M= -6,-19,-37,-10, -1,-29,-17,-20,-20,-10,-29,-19,-18, 80,-10,-20, -7, -9,-28,-30,-29,-10;
/M: SY='L'; M= 13,-18,-17,-23,-12, -8,-17,-17, 5,-17, 14, 6,-18,-19, -6,-17, -9, -6, 3,-20, -9,-10;
/M: SY='N'; M= -9, 27,-21, 21, 2,-23, -8, 1,-18, -1,-24,-17, 31,-18, 0, -2, 5, -3,-18,-36,-18, 0;
/M: SY='A'; M= 7,-11,-21,-14, -8,-17,-10,-18, -3,-11,-12, -7, -7, -1,-11,-16, 1, -2, 0,-27,-17,-11;
/M: SY='E'; M=-12, 19,-27, 31, 32,-30,-17, -4,-26, 2,-20,-20, 3, -6, 7, -6, 0, -8,-21,-34,-19, 19;
/M: SY='A'; M= 26,-18,-14,-25,-18,-12,-11,-23, 8,-16, 0, 1,-16,-16,-15,-21, -1, -3, 14,-22,-14,-17;
/M: SY='A'; M= 36,-12,-12,-20,-12,-16, 0,-19,-12,-12,-11,-11,-11,-13,-11,-19, 6, -2, -4,-10,-14,-11;
/M: SY='R'; M= -9, 0,-24, -1, 7,-21,-18, 6,-17, 8,-16, -6, 2,-14, 8, 10, -2, -4,-14,-26, -8, 6;
/M: SY='M'; M= -9, -9,-24, -9, 0,-12,-22, -6, 1,-11, 9, 12,-11,-17, 4,-10,-11, -7, -5,-25, -7, 1;
/M: SY='Y'; M=-16,-22,-28,-24,-20, 28,-27, 3, -1,-15, 3, 2,-20,-27,-14,-13,-20,-12, -8, 25, 46,-18;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-18, -8, 1,-18,-20, -9,-13, 9,-10, -2, -5,-16, 3, 11, -5, -5,-10,-25,-11, 1;
/M: SY='E'; M=-11, 8,-27, 10, 16,-26,-18, 1,-24, 15,-22,-13, 7,-11, 9, 12, -1, -3,-20,-28,-12, 12;
/M: SY='B'; M=-12, 32,-25, 30, 8,-28, -4, 3,-28, 2,-29,-22, 32,-15, 2, -2, 5, -5,-28,-34,-18, 5;
/M: SY='R'; M=-16, -5,-31, -3, 4,-18,-22, 3,-22, 20,-19, -9, -3,-10, 6, 27,-10,-11,-19,-17, 1, 2;
/M: SY='E'; M= -2, 0,-25, 2, 13,-25,-17, -7,-19, 8,-17,-11, -3, -5, 9, 5, -2, -7,-15,-26,-16, 10;
/M: SY='E'; M= -6, 0,-25, 3, 24,-22,-18, -6,-18, 8,-13, -9, -3, -9, 8, 1, -3, -6,-16,-27,-15, 16;
/M: SY='Y'; M=-15,-23,-25,-28,-23, 44,-28, 2, 0,-17, 3, 0,-18,-28,-21,-14,-18,-10, -5, 15, 49,-23;
/M: SY='E'; M= -6, 2,-20, 2, 12,-20,-17, -7,-15, 5,-15, -9, 1,-14, 1, -1, -3, -6,-10,-27,-13, 6;
/M: SY='K'; M= -1, -4,-24, -6, 3,-22,-11, -8,-22, 15,-20,-10, 0,-14, 6, 15, 0, -5,-15,-23,-13, 4;
/I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
|
| Numerical results | |
| |
| Comments | |
| |
| Cross-references | |
| UniProtKB/Swiss-Prot | True positive hits:AKTIP_AEDAE (Q17PP1), AKTIP_ANOGA (Q7PRH1), AKTIP_CHICK (Q5ZJJ5), AKTIP_CULQU (B0X6E8), AKTIP_DANRE (Q7ZYX1), AKTIP_HUMAN (Q9H8T0), AKTIP_MACFA (Q4R5E1), AKTIP_MOUSE (Q64362), AKTIP_NEMVE (A7RRG3), AKTIP_PONAB (Q5RE48), AKTIP_RAT (Q5FVH4), AKTIP_SALSA (B5X1G6), AKTIP_XENTR (Q28IA3), AKTP1_DROAN (B3MEZ6), AKTP1_DROER (B3N6U7), AKTP1_DROGR (B4J613), AKTP1_DROME (Q7K4V4), AKTP1_DROMO (B4KMF8), AKTP1_DROPE (B4H581), AKTP1_DROPS (Q28XA5), AKTP1_DROSE (B4HT57), AKTP1_DROSI (B4QHS6), AKTP1_DROVI (B4LNV5), AKTP1_DROWI (B4MQY1), AKTP1_DROYA (B4NWM2), AKTP2_DROAN (B3MGT3), AKTP2_DROER (B3NK72), AKTP2_DROGR (B4JWF5), AKTP2_DROME (A1ZBR5), AKTP2_DROMO (B4KS18), AKTP2_DROPE (B4GD81), AKTP2_DROPS (Q28YD9), AKTP2_DROSE (B4HPU1), AKTP2_DROSI (B4QEJ9), AKTP2_DROVI (B4LPP8), AKTP2_DROWI (B4MRW2), AKTP2_DROYA (B4PAP8), AKTPA_XENLA (Q498F8), AKTPB_XENLA (Q5XGV8), BIRC6_HUMAN (Q9NR09), COP10_ARATH (Q9LJD7), MMS2_SCHPO (O74983), MMS2_YEAST (P53152), PEX4_ARATH (Q8LGF7), RCE1_ARATH (Q9SDY5), SCE1_ARATH (Q42551), STP22_YEAST (P25604), U2D2B_MOUSE (Q6ZWY6), U2D2B_RAT (P70711), U2D2L_HUMAN (Q8IWF7), U2QL1_DROME (Q9VM35), U2QL1_HUMAN (A1L167), U2QL1_MOUSE (A0PJN4), UB12L_ARATH (Q9ZU75), UB2D1_BOVIN (Q2TA10), UB2D1_HUMAN (P51668), UB2D1_MOUSE (P61080), UB2D1_RAT (D3ZDK2), UB2D2_BOVIN (Q1RMX2), UB2D2_HUMAN (P62837), UB2D2_MOUSE (P62838), UB2D2_PIG (Q06AA9), UB2D2_RAT (P62839), UB2D2_XENLA (P62840), UB2D3_BOVIN (Q3ZCF7), UB2D3_HUMAN (P61077), UB2D3_MACFA (Q4R5N4), UB2D3_MOUSE (P61079), UB2D3_PONAB (Q5R4V7), UB2D3_RAT (P61078), UB2D4_HUMAN (Q9Y2X8), UB2D4_XENLA (A5PKP9), UB2E1_HUMAN (P51965), UB2E1_MOUSE (P52482), UB2E2_HUMAN (Q96LR5), UB2E2_MOUSE (Q91W82), UB2E3_BOVIN (Q2T9X7), UB2E3_HUMAN (Q969T4), UB2E3_MOUSE (P52483), UB2FA_MOUSE (Q9CY34), UB2FB_MOUSE (Q3UWQ3), UB2G1_HUMAN (P62253), UB2G1_MACFA (Q4R5Y8), UB2G1_MOUSE (P62254), UB2G1_RAT (P62255), UB2G2_BOVIN (Q17QG5), UB2G2_HUMAN (P60604), UB2G2_MOUSE (P60605), UB2G2_PONAB (Q5RF84), UB2J1_HUMAN (Q9Y385), UB2J1_MOUSE (Q9JJZ4), UB2J2_BOVIN (Q2TA03), UB2J2_DICDI (Q54LP7), UB2J2_HUMAN (Q8N2K1), UB2J2_MOUSE (Q6P073), UB2JL_DICDI (Q54AK6), UB2L3_BOVIN (Q3MHP1), UB2L3_HUMAN (P68036), UB2L3_MOUSE (P68037), UB2L3_PONAB (Q5R5I4), UB2L6_BOVIN (A5PJC4), UB2L6_HUMAN (O14933), UB2L6_MOUSE (Q9QZU9), UB2L6_RAT (Q4V8J2), UB2Q1_HUMAN (Q7Z7E8), UB2Q1_MOUSE (Q7TSS2), UB2Q2_BOVIN (Q32L27), UB2Q2_HUMAN (Q8WVN8), UB2Q2_MOUSE (Q8K2Z8), UB2Q2_RABIT (Q7YQJ9), UB2R1_HUMAN (P49427), UB2R1_MOUSE (Q8CFI2), UB2R2_HUMAN (Q712K3), UB2R2_MOUSE (Q6ZWZ2), UB2R2_RABIT (Q29503), UB2SA_XENLA (A1L3K1), UB2SB_XENLA (Q8AVU2), UB2SC_XENLA (Q76EZ2), UB2V1_BOVIN (Q3SZ52), UB2V1_CHICK (Q90879), UB2V1_HUMAN (Q13404), UB2V1_MOUSE (Q9CZY3), UB2V1_PONAB (Q5R4Z6), UB2V2_BOVIN (Q3SZ43), UB2V2_CHICK (Q5F3Z3), UB2V2_DANRE (Q6PEH5), UB2V2_HUMAN (Q15819), UB2V2_MOUSE (Q9D2M8), UB2V2_PONAB (Q5R6C9), UB2V2_RAT (Q7M767), UB2V2_XENLA (Q7ZYP0), UBC10_ARATH (P35133), UBC11_ARATH (P35134), UBC11_SCHPO (O00103), UBC11_YEAST (P52492), UBC12_ARATH (Q9C9Y7), UBC12_ASHGO (Q75AF2), UBC12_BOVIN (A3KN22), UBC12_CAEEL (Q9XVK5), UBC12_CANGA (Q6FVQ8), UBC12_DICDI (Q54TI6), UBC12_DROME (Q9VSF3), UBC12_HUMAN (P61081), UBC12_KLULA (Q6CSW8), UBC12_MOUSE (P61082), UBC12_SCHPO (O74549), UBC12_XENLA (Q6DCZ9), UBC12_XENTR (Q6P8D9), UBC12_YARLI (Q6C9W0), UBC12_YEAST (P52491), UBC13_ARATH (Q42541), UBC13_SCHPO (O13685), UBC13_YEAST (P52490), UBC14_ARATH (P42747), UBC14_SCHPO (Q9UTN8), UBC15_ARATH (P42743), UBC15_SCHPO (Q9Y818), UBC16_ARATH (Q9FWT2), UBC16_SCHPO (Q9P6I1), UBC17_ARATH (O23239), UBC17_CAEEL (Q11076), UBC18_ARATH (Q9FMM0), UBC19_ARATH (Q9LJZ5), UBC1_ARATH (P25865), UBC1_CAEEL (P52478), UBC1_COLGL (O74196), UBC1_MAGO7 (Q9UVR2), UBC1_MIMIV (Q5UQC9), UBC1_SCHPO (O74810), UBC1_YEAST (P21734), UBC20_ARATH (Q8L7T3), UBC21_CAEEL (P52484), UBC22_ARATH (Q9FF66), UBC23_ARATH (Q9ZVX1), UBC24_ARATH (Q8VY10), UBC25_ARATH (Q9LUQ5), UBC26_ARATH (Q8GY87), UBC27_ARATH (Q9FI61), UBC28_ARATH (Q94F47), UBC29_ARATH (Q9SLE4), UBC2_ARATH (P42745), UBC2_ASHGO (Q75EB8), UBC2_ASPFU (Q4WLA7), UBC2_CAEEL (P35129), UBC2_CANAL (O74201), UBC2_CANGA (Q6FR76), UBC2_CRYNB (P0CS17), UBC2_CRYNJ (P0CS16), UBC2_DEBHA (Q6BU36), UBC2_DICDI (Q553F3), UBC2_EMENI (Q96UP5), UBC2_KLULA (Q6CUD9), UBC2_MEDSA (P35130), UBC2_MIMIV (Q5UQ57), UBC2_NECHA (P78717), UBC2_NEUCR (P52493), UBC2_SCHPO (P23566), UBC2_TRIHA (Q58FS2), UBC2_USTMA (Q4PFA5), UBC2_WHEAT (P25866), UBC2_YARLI (Q6C093), UBC2_YEAST (P06104), UBC30_ARATH (Q9FKT3), UBC31_ARATH (Q9C8X7), UBC32_ARATH (Q9LSP7), UBC33_ARATH (Q9FK29), UBC34_ARATH (Q9SHI7), UBC35_ARATH (Q94A97), UBC36_ARATH (Q9FZ48), UBC37_ARATH (Q941B6), UBC3_ARATH (P42746), UBC3_MIMIV (Q5UQ88), UBC3_YEAST (P14682), UBC4_ARATH (P42748), UBC4_CANAX (P43102), UBC4_MIMIV (Q5UQ40), UBC4_SCHPO (P46595), UBC4_SOLLC (P35135), UBC4_WHEAT (P16577), UBC4_YEAST (P15731), UBC5A_ORYSJ (Q8S920), UBC5B_ORYSJ (Q8S919), UBC5_ARATH (P42749), UBC5_YEAST (P15732), UBC6_ARATH (P42750), UBC6_ASHGO (Q74Z34), UBC6_CANGA (Q6FQK7), UBC6_DEBHA (Q6BYG4), UBC6_KLULA (Q6CMG6), UBC6_SCHPO (O42646), UBC6_YEAST (P33296), UBC7_ARATH (Q42540), UBC7_CAEEL (P34477), UBC7_SCHPO (O00102), UBC7_WHEAT (P25868), UBC7_YEAST (Q02159), UBC84_DROME (P52487), UBC8_ARATH (P35131), UBC8_SCHPO (Q9P7R4), UBC8_YEAST (P28263), UBC9A_DANRE (Q9W6H5), UBC9B_DANRE (Q9DDJ0), UBC9_ARATH (P35132), UBC9_CAEEL (Q95017), UBC9_CHICK (P63283), UBC9_DICDI (Q9NGP4), UBC9_HUMAN (P63279), UBC9_MESAU (O09181), UBC9_MOUSE (P63280), UBC9_PAGMA (Q6Y1Z4), UBC9_RAT (P63281), UBC9_SCHPO (P40984), UBC9_SPETR (Q2EF73), UBC9_XENLA (P63282), UBC9_XENTR (Q28CQ4), UBC9_YEAST (P50623), UBCB_DICDI (Q94490), UBCD1_DROME (P25867), UBCD2_DROME (P52485), UBCD4_DROME (P52486), UBCD6_DROME (P25153), UBCX_DICDI (Q86IZ3), UBCX_PICAN (O60015), UBCX_PICPA (P49428), UBCX_YEAST (P29340), UBC_ASFB7 (P27949), UBC_ASFK5 (P0C8G3), UBC_ASFM2 (P25869), UBC_ASFP4 (P0C8G4), UBC_ASFWA (P0C8G5), UBE2A_HUMAN (P49459), UBE2A_MOUSE (Q9Z255), UBE2B_BOVIN (Q32P99), UBE2B_HUMAN (P63146), UBE2B_MOUSE (P63147), UBE2B_RABIT (P63148), UBE2B_RAT (P63149), UBE2C_BOVIN (Q32PA5), UBE2C_DICDI (Q54XS6), UBE2C_DROME (Q9VTY6), UBE2C_HUMAN (O00762), UBE2C_MACFA (Q4R9D1), UBE2C_MOUSE (Q9D1C1), UBE2C_SPISO (Q95044), UBE2C_XENLA (P56616), UBE2F_BOVIN (Q1RMW1), UBE2F_CHICK (Q5ZKX6), UBE2F_DANRE (Q6NY82), UBE2F_HUMAN (Q969M7), UBE2F_RAT (Q5U203), UBE2F_XENLA (Q6IRC7), UBE2F_XENTR (Q5M8Y2), UBE2H_BOVIN (Q32LN1), UBE2H_HUMAN (P62256), UBE2H_MOUSE (P62257), UBE2K_BOVIN (P61085), UBE2K_HUMAN (P61086), UBE2K_MOUSE (P61087), UBE2N_BOVIN (Q0P5K3), UBE2N_DICDI (Q86K32), UBE2N_DROME (P35128), UBE2N_HUMAN (P61088), UBE2N_MACFA (Q4R4I1), UBE2N_MOUSE (P61089), UBE2N_PONAB (Q5R7J6), UBE2N_RAT (Q9EQX9), UBE2O_HUMAN (Q9C0C9), UBE2O_MOUSE (Q6ZPJ3), UBE2S_BOVIN (Q1RML1), UBE2S_BRAFL (C3Z724), UBE2S_DANRE (Q4V908), UBE2S_DICDI (Q54I43), UBE2S_DROAN (B3MQV3), UBE2S_DROER (B3NWW9), UBE2S_DROGR (B4JKB7), UBE2S_DROME (Q9VX25), UBE2S_DROMO (B4L7V4), UBE2S_DROPE (B4H9W2), UBE2S_DROPS (B5DKM4), UBE2S_DROSE (B4IF39), UBE2S_DROSI (B4R6G1), UBE2S_DROVI (B4MA02), UBE2S_DROWI (B4N208), UBE2S_DROYA (B4Q2J2), UBE2S_HUMAN (Q16763), UBE2S_MOUSE (Q921J4), UBE2S_NEMVE (A7SE05), UBE2S_RANCA (C1C3R6), UBE2S_RAT (B5DFI8), UBE2S_XENTR (Q28F89), UBE2T_BOVIN (Q32LD2), UBE2T_HUMAN (Q9NPD8), UBE2T_MOUSE (Q9CQ37), UBE2T_XENLA (Q7ZY08), UBE2U_HUMAN (Q5VVX9), UBE2U_MACFA (Q95LM1), UBE2V_DICDI (Q54D06), UBE2W_BOVIN (A6H795), UBE2W_DANRE (Q4VBH4), UBE2W_DICDI (Q55EY8), UBE2W_HUMAN (Q96B02), UBE2W_MOUSE (Q8VDW4), UBE2W_RAT (B5DEI4), UBE2Z_DANRE (Q6DG60), UBE2Z_HUMAN (Q9H832), UBE2Z_MOUSE (Q3UE37), UBE2Z_RAT (Q3B7D1), UBE2Z_XENLA (Q6PCF7), UBE2Z_XENTR (Q66KB0), UE2NL_HUMAN (Q5JXB2), UEV1A_ARATH (Q93YP0), UEV1B_ARATH (Q9CAB6), UEV1C_ARATH (Q9SJ44), UEV1D_ARATH (Q9SVD7), Y1A1_ENCCU (Q8SSK3)False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): ELCL_ARATH (Q9FFY6), ELC_ARATH (Q9LHG8), SST6_SCHPO (Q7Z992), TS101_HUMAN (Q99816), TS101_MOUSE (Q61187), UEVLD_DANRE (Q6DBY5), UEVLD_HUMAN (Q8IX04), UEVLD_MOUSE (Q3U1V6), UEVLD_XENTR (Q66KB7)Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view]
[Clustal format, color]
[Clustal format, plain text]
[Fasta format]
|
| PDB [Detailed view] | 1A3S; 1AYZ; 1C4Z; 1FBV; 1FXT; 1FZY; 1I7K; 1J74; 1J7D; 1JAS; 1JAT; 1JBB; 1KPS; 1NXA; 1PZV; 1Q34; 1QCQ; 1TTE; 1U9A; 1U9B; 1UR6; 1UZX; 1W4U; 1WZV; 1WZW; 1X23; 1Y6L; 1Y8X; 1YH2; 1YLA; 1YRV; 1Z2U; 1Z3D; 1Z5Q; 1Z5S; 1ZDN; 1ZGU; 1ZUO; 2A4D; 2A7L; 2AAK; 2AWF; 2BEP; 2BF8; 2C2V; 2C4O; 2C4P; 2CLW; 2CYX; 2E2C; 2EDI; 2EKE; 2ESK; 2ESO; 2ESP; 2ESQ; 2F4W; 2FUH; 2GJD; 2GMI; 2GRN; 2GRO; 2GRP; 2GRQ; 2GRR; 2HLW; 2KJH; 2KLY; 2NVU; 2O25; 2OB4; 2PE6; 2PX9; 2QGX; 2UCZ; 2UYZ; 2VRR; 2XWU; 2Y4W; 2Y9M; 2YB6; 2YBF; 2YHO; 2Z5D; 3A33; 3A4S; 3BZH; 3CEG; 3E46; 3EB6; 3F92; 3FN1; 3FSH; 3H8K; 3HCT; 3HCU; 3JVZ; 3JW0; 3K9O; 3K9P; 3L1Y; 3L1Z; 3O2U; 3OJ4; 3ONG; 3PTF; 3R3Q; 3R42; 3RCZ; 3RPG; 3RZ3; 3TGD; |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)