Entry: PS50133

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] FCH
Accession [info] PS50133
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50133
Associated ProRule [info] PRU00083

Name and characterization of the entry

Description [info] FCH domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7667; R2=0.01513211; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1761.32082; R2=22.99317; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=444; N_SCORE=8.5; H_SCORE=10476; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=312; N_SCORE=6.5; H_SCORE=8958; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M'; M= -5,-13,-16,-16, -8, -9,-20, -6,  2,-10,  5, 13,-13,-19, -3,-10, -8, -3,  1,-24, -5, -6;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-25,  5, 11,-22, -2, -7,-23, -1,-17,-14,  1,-13,  3, -4,  3, -5,-20,-26,-14,  7;
/M: SY='F'; M=-15,-28,-23,-35,-27, 46,-29,-17,  8,-25, 10,  5,-22,-28,-29,-19,-20,-10,  5, 11, 26,-26;
/M: SY='S'; M=  3, -3,-15, -4, -5,-22,  7,-13,-22, -6,-21,-15,  2,-16, -7, -5,  9, -2,-13,-29,-20, -7;
/M: SY='D'; M= -4,  9,-22, 10,  3,-21, -9, -8,-21, -2,-20,-16,  7, -8, -3, -6,  7,  5,-16,-29,-13, -1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-21,  0,  6,-20,-10,  1,-19, -1,-16,-11,  3,-15,  5, -2, -1, -7,-18,-23, -7,  4;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-36,-26, 43,-30,-21, 13,-29, 25, 10,-24,-29,-30,-20,-23, -9,  9, -6, 14,-26;
/M: SY='W'; M=-15,-27,-33,-28,-19,  0,-23,-14,-11,-12, -9, -8,-25,-25,-12,-12,-26,-19,-16, 59, 14,-14;
/M: SY='D'; M= -4, 14,-15, 17, 10,-27,  0, -7,-28, -5,-26,-21, 11,-12, -1,-10, 13,  1,-21,-35,-21,  5;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-25,  5,  9,-26,-15, -6,-20,  3,-20,-12,  1, -2,  8,  4,  3, -3,-16,-29,-16,  7;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='Y'; M=-13,-21,-22,-24,-18, 17,-27,  2,  4,-17,  7,  7,-16,-25,-13,-11,-15, -8,  3, -9, 18,-17;
/M: SY='D'; M= -5, 13,-26, 16, 16,-29, -9, -2,-29, 11,-25,-17,  9,-10,  7,  5,  2, -7,-23,-29,-17, 11;
/M: SY='V'; M=  4,-14, -3,-18,-11,-13,-21,-17, -1, -9, -6, -3,-12,-20,-12,-10, -4, -2,  8,-28,-13,-13;
/M: SY='L'; M= -6,-25,-19,-27,-20,  7,-28,-20, 17,-26, 35, 14,-23,-26,-19,-19,-21, -3, 11,-21, -2,-20;
/M: SY='L'; M=-11,-11,-23,-14, -6,  1,-22, -7, -1,-12,  6,  3, -9,-21, -5, -7,-13, -8, -4,-19,  0, -6;
/M: SY='Q'; M= -9,  5,-26,  7, 11,-26,-14,  0,-23, 10,-20,-11,  3,-13, 13,  9,  1, -5,-19,-27,-13, 11;
/M: SY='R'; M=-17,-11,-21,-13, -6,-13,-21,  5,-21,  9,-13, -5, -5,-22,  4, 27,-13,-12,-18, -8,  1, -4;
/M: SY='L'; M= -8,-14,-21,-19,-13, -5,-23,-11,  6,-16,  8,  6,-11,-20, -5,-13, -8,  2,  3,-23, -4, -9;
/M: SY='D'; M=-11, 13,-28, 18, 18,-29,-15, -2,-27, 14,-23,-14,  6,-11, 13,  5, -2, -8,-24,-26,-12, 15;
/M: SY='B'; M= -5,  9,-26,  9,  4,-24,-13,  3,-22,  2,-20,-11,  6,-15,  7, -2, -2, -8,-20,-17,-10,  5;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-27, -4,  2,-23, 21,-12,-28, -8,-24,-17, -1,-15, -5, -8,  2,-11,-22,-17,-18, -2;
/M: SY='L'; M= -7,-19,-14,-22,-14, -7,-23,-12,  4,-13,  8,  5,-16,-21,-11, -7,-14, -8,  3,-23, -5,-14;
/M: SY='R'; M=-12,  3,-26,  7, 11,-23,-18, -4,-22, 12,-16,-11,  0,-13,  7, 15, -4, -5,-17,-27,-12,  7;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-21,-18,-11,  0,-22,-14,  2,-17, 11,  4,-14,-21, -9,-14,-10, -1, -1,-12,  0,-10;
/M: SY='C'; M= -6,-16, 15,-22,-18, -4,-23,-18, -1,-23, 12,  2,-14,-28,-17,-19,-12, -4,  0,-30,-11,-18;
/M: SY='E'; M= -9, 11,-28, 17, 31,-31,-15, -3,-30, 16,-24,-17,  4, -6, 14,  7,  0, -8,-26,-28,-17, 22;
/M: SY='D'; M=-10, 16,-26, 24, 21,-28,-13, -4,-26,  3,-19,-16,  5, -9,  6, -3,  2, -3,-22,-32,-17, 14;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-32,-24, 18,-30,-17, 21,-24, 25, 21,-25,-27,-20,-19,-22, -9, 16,-14,  8,-23;
/M: SY='K'; M=  0, -9,-20,-12, -2,-20,-17,-11, -8,  4,-11, -1, -7,-15,  3,  4, -4, -7, -6,-23,-12, -1;
/M: SY='Q'; M= -7,  5,-24,  6, 10,-24,-13, -5,-21,  7,-20,-11,  4,-12, 12,  4,  3, -3,-18,-27,-13, 11;
/M: SY='F'; M=-17,-27,-18,-33,-26, 44,-28,-13,  0,-24,  8,  1,-22,-30,-27,-18,-20,-10, -2, 16, 30,-25;
/M: SY='I'; M= -9,-24,-20,-29,-22, 15,-27,-15, 16,-21, 15, 16,-20,-24,-18,-18,-14, -4, 13,-14,  9,-21;
/M: SY='R'; M= -7, -5,-27, -7,  3,-24,-18,  2,-24, 23,-21, -8, -1,-14, 11, 29, -5, -7,-18,-22, -9,  5;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-27,  4, 28,-26,-19, -4,-23, 15,-16, -9, -3, -8, 16,  9, -4, -9,-21,-25,-14, 22;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  0,-19,-20,  0,-29, 31,-20,-10, -1,-19,  9, 62,-10,-10,-20,-18, -6,  0;
/M: SY='A'; M= 25,-12,-15,-20,-12,-14, -5,-17, -4,-11, -6, -2,-10,-14,-10,-17,  4, -1,  1,-21,-12,-12;
/M: SY='E'; M=  0,  5,-24,  6, 16,-27,-14, -6,-23, 12,-22,-13,  3, -9, 11,  5,  4, -3,-19,-27,-16, 13;
/M: SY='I'; M=  0,-24,-16,-30,-23,  2,-27,-24, 22,-24, 12,  8,-18,-22,-19,-23,-10, -5, 18,-22, -5,-23;
/M: SY='E'; M=-12, 18,-30, 29, 51,-31,-17,  0,-31,  8,-22,-22,  6, -3, 16, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 33;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-26,  1, 18,-24,-19, -6,-21, 14,-14, -9, -4,-11, 11, 12, -5, -7,-17,-25,-13, 14;
/M: SY='E'; M= -5, 10,-26, 17, 33,-29,-14, -4,-27,  6,-21,-18,  2, -5, 11, -2,  3, -6,-23,-30,-19, 22;
/M: SY='Y'; M=-19,-17,-29,-17,-17, 24,-28, 29, -5,-11, -3, -1,-15,-28, -8, -9,-17,-11,-12, 19, 67,-17;
/M: SY='A'; M= 27, -9,-14,-13,-10,-20, 10,-18,-15,-12,-18,-13, -4,-13,-10,-17, 15,  2, -5,-26,-21,-10;
/M: SY='K'; M= -9, -3,-24, -2,  7,-26,-12, -7,-24, 18,-22,-10, -1,-13, 10, 18, -3, -7,-18,-24,-14,  8;
/M: SY='Q'; M= -2,  2,-23, -1,  7,-24,-11, -5,-20,  9,-20, -8,  4,-12, 11,  7,  5,  0,-17,-27,-14,  8;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21,  9,-30,-20, 21,-28, 46, 22,-29,-29,-19,-20,-28,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='Q'; M= -2, -5,-22, -7,  2,-18,-11,  5,-18, -2,-14, -7,  0,-15,  6,  1,  1, -3,-15,-25, -9,  3;
/M: SY='K'; M= -4,  3,-25,  1,  8,-26,-12, -2,-26, 20,-24,-12,  5,-12,  8, 14,  0, -3,-20,-25,-12,  7;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-24,-30,-20,  4,-29,-17, 19,-25, 30, 17,-25,-26,-15,-19,-24,-10,  9,-10,  1,-18;
/M: SY='A'; M= 18, -7, -9,-12, -7,-14, -8,-15,-11,-10,-15,-12, -3,-14, -8,-12, 15,  8, -2,-27,-14, -8;
/M: SY='K'; M= -4,  2,-24,  1,  6,-24,-10, -6,-22, 15,-21,-10,  5,-14,  6, 13,  0, -6,-17,-26,-14,  5;
/M: SY='K'; M= -8,  2,-26,  1,  9,-27,-11, -2,-25, 16,-24,-11,  4,-10, 14, 13,  0, -4,-22,-25,-13, 11;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='Y'; M= -7,-16,-17,-20,-17,  8,-18,-11, -5,-13, -3, -2,-14,-22,-14,-12, -9, -2, -5,  3, 12,-15; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='L'; M= -6,-12,-16,-13, -8,  3,-16, -9,  0,-11,  7,  3,-12,-14, -9, -9,-11, -4, -2,  1,  2, -8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-26, -5,  3,-20,-17,  0,-26, 30,-20, -8,  0,-14,  9, 47, -9, -9,-18,-18, -8,  3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='S'; M=  4, -1,-19, -2,  7,-23, -1, -8,-20,  1,-20,-12,  1, -7,  6, -4,  8,  0,-15,-24,-16,  7; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='T'; M= -5, -7,-18, -8, -4,-12,-14, -4, -7, -6, -8, -3, -5,-12, -2, -5,  2,  3, -4,-23, -5, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='V'; M= -1,-13,-18,-15,-10, -2,-19,-12, -1, -5, -4,  1,-11,-18, -9, -7, -4, -3,  5,-20, -5,-10; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='E'; M=-12, 16,-24, 24, 27,-30,-13, -1,-31,  4,-24,-21,  6, -4,  7, -1,  2, -6,-26,-33,-19, 16;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-24,  9, 14,-24,-13, -3,-23, 10,-21,-14,  7,-12,  5,  6,  2, -3,-19,-30,-14,  9;
/M:         M= -4, -3,-23, -7, -3,-14, -5, -7,-14, -7, -9, -5,  0,-15, -5, -9, -4, -5,-14,-18,-11, -4;
/M: SY='E'; M=  0,  4,-24,  5, 13,-21,-14, -8,-19, -2,-19,-15,  1,  2,  4, -8,  4, -2,-18,-28,-17,  8;
/M: SY='Q'; M= -5,  2,-22,  3, 10,-22,-14,  0,-17,  1,-19,-10,  4,-12, 11, -2,  9,  1,-15,-28,-10, 10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 91 in 91 different sequences
Number of true positive hits 90 in 90 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.90 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.90 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] FCH
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
90 sequences

BZZ1_SCHPO  (Q09746), BZZ1_YEAST  (P38822), CDC15_SCHPO (Q09822), 
CIP4_DANRE  (Q5U3Q6), CIP4_HUMAN  (Q15642), CIP4_MOUSE  (Q8CJ53), 
CIP4_PONAB  (Q5RCJ1), CIP4_RAT    (P97531), CYK2_YEAST  (Q05080), 
EG13_ECHGR  (Q07839), EM13_ECHMU  (Q07840), FBP1L_HUMAN (Q5T0N5), 
FBP1L_MOUSE (Q8K012), FBP1L_RAT   (Q2HWF0), FBP1L_XENLA (Q6DCZ7), 
FBP1L_XENTR (Q6GUF4), FCHO1_DANRE (E7FBF7), FCHO1_HUMAN (O14526), 
FCHO1_MOUSE (Q8K285), FCHO2_DANRE (Q502I9), FCHO2_HUMAN (Q0JRZ9), 
FCHO2_MOUSE (Q3UQN2), FCHO2_PONAB (Q5R807), FCHO2_RAT   (D3ZYR1), 
FCSD1_HUMAN (Q86WN1), FCSD1_MOUSE (Q6PFY1), FCSD2_HUMAN (O94868), 
FCSD2_MOUSE (Q3USJ8), FER_CANFA   (Q9TTY2), FER_HUMAN   (P16591), 
FER_MOUSE   (P70451), FER_RAT     (P09760), FES_FELCA   (P14238), 
FES_FSVGA   (P00542), FES_HUMAN   (P07332), FES_MOUSE   (P16879), 
FNBP1_HUMAN (Q96RU3), FNBP1_MOUSE (Q80TY0), FNBP1_RAT   (Q8R511), 
FNBP1_XENLA (Q6GNV5), FPS_AVISP   (P00541), FPS_DROME   (P18106), 
FPS_FUJSV   (P00530), GAS7_HUMAN  (O60861), GAS7_MOUSE  (Q60780), 
GAS7_RAT    (O55148), IMP2_SCHPO  (Q10199), MGP1_DICDI  (Q54GD0), 
MGP2_DICDI  (Q55CK2), MGP3_DICDI  (Q55DK5), MGP4_DICDI  (Q54QF4), 
NOSTN_BOVIN (Q2KJB5), NOSTN_HUMAN (Q8IVI9), NOSTN_MOUSE (Q6WKZ7), 
NOSTN_RAT   (Q5I0D6), PACN1_BOVIN (A7MBI0), PACN1_DANRE (Q4V920), 
PACN1_HUMAN (Q9BY11), PACN1_MOUSE (Q61644), PACN1_PONAB (Q5R411), 
PACN1_RAT   (Q9Z0W5), PACN2_CHICK (O13154), PACN2_HUMAN (Q9UNF0), 
PACN2_MOUSE (Q9WVE8), PACN2_RAT   (Q9QY17), PACN2_XENLA (Q9DDA9), 
PACN3_HUMAN (Q9UKS6), PACN3_MOUSE (Q99JB8), PPIP1_HUMAN (O43586), 
PPIP1_MOUSE (P97814), PPIP2_HUMAN (Q9H939), PPIP2_MOUSE (Q99M15), 
RGA7_SCHPO  (O94466), RGA8_SCHPO  (Q09697), RGD1_YEAST  (P38339), 
RGD2_YEAST  (P43556), RHG04_HUMAN (P98171), SRG2B_HUMAN (P0DMP2), 
SRG2C_HUMAN (P0DJJ0), SRGP1_HUMAN (Q7Z6B7), SRGP1_MOUSE (Q91Z69), 
SRGP2_DANRE (B0S6J3), SRGP2_HUMAN (O75044), SRGP2_MOUSE (Q91Z67), 
SRGP2_RAT   (D4A208), SRGP3_HUMAN (O43295), SRGP3_MOUSE (Q812A2), 
SYP1_SCHPO  (O43059), Y1676_DICDI (Q75JD4), Y4695_DICDI (Q555L8)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

RGA9_SCHPO  (Q9UUJ3)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

HMHA1_XENLA (Q6DE55)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission