To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS50134

General information about the entry

Entry name [info] ZF_TAZ
Accession [info] PS50134
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-SEP-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 25-OCT-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50134
Associated ProRule [info] PRU00203

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger TAZ-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=80;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9065000; R2=0.0069994; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8320.8134766; R2=5.0651851; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=943; H_SCORE=13097; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=657; H_SCORE=11649; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-10, 13,-26, 22, -1,-29,  5,-10,-23, -8,-20,-16,  2,-17, -6,-13, -2,-10,-13,-31,-19, -3;
/M: SY='P'; M= -9, -9,-37,  0,  4,-31, -5,-16,-26, -9,-29,-21,-11, 55, -8,-17, -7,-12,-30,-29,-28, -5;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-19, -4,  8,-17,-18,-11,-14,  2,-15,-11, -4,-13,  0,  8,  7,  7, -5,-30,-14,  3;
/M: SY='R'; M=-13, -1,-30,  1, 17,-27,-20, -4,-30, 34,-24,-12,  0,-11, 12, 37, -8,-10,-22,-22,-12, 13;
/M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11, -1,-14,-22,  4,-24, 22,-17, -7, -3,-21, 12, 51,-11,-10,-19,-12,  4,  1;
/M: SY='K'; M=-10, -4,-28, -2, 14,-25,-22, -6,-18, 20,-11, -4, -6,-12, 17, 12,-10,-10,-18,-22,-10, 16;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-19,-18,-13,  4,-20, -8,  2,-19, 12,  2,-14,-23,-11,-14, -4,  0, -1,-16, 10,-13;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-26,-37,-28,  2,-37,-28, 41,-29, 25, 19,-23,-23,-21,-27,-21, -9, 28,-21, -1,-28;
/M: SY='Q'; M=-10,  9,-28,  4, 16,-36,-16, 10,-20,  8,-22, -4, 13,-12, 47,  8,  2, -8,-30,-24,-12, 31;
/M: SY='Q'; M=-13, -3,-30, -3, 13,-33,-20,  7,-23, 17,-20, -3,  0,-13, 43, 31, -3,-10,-27,-20,-10, 26;
/M: SY='C'; M=-10, -7, 22,-10,  1,-31,-23, -8,-26,  5,-22, -9, -7,-20, 18,  1, -6,-10,-21,-30,-17,  9;
/I:         I=-8; MI=-10; MD=-15; IM=-10; DM=-15;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24, 12,-33,-23, 29,-30, 36, 18,-26,-27,-22,-23,-26,-10, 16,-18,  2,-24;
/M: SY='V'; M=  4,-21,-16,-23,-15, -8,-23,-19, 12,-15, 10,  7,-21,-23, -8,-14, -9, -4, 19,-24, -9,-12;
/M: SY='F'; M= -5,-20,-17,-22,-15, 15,-20,-17,  2,-23, 14,  2,-14,-23,-17,-17, -4,  0,  1,-20,  0,-15;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-19,-32,-26,  4,-32,-26, 30,-27, 30, 17,-28,-28,-23,-22,-21, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
/M: SY='H'; M=-13, -2,-20, -2,  0,-13,-13, 44,-20,  2,-13, -2,  4,-13,  7, 15, -7,-11,-18,-18,  7,  0; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='K'; M= -9, -2,-20, -2,  4,-18,-13, -4,-20, 28,-18, -7,  0, -9,  7, 28, -7, -7,-13,-13, -7,  4; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=  0,  0,-20,  0, 10,-30,-10,  0,-20,  0,-25,-10,  5,-10, 31,  0, 19,  5,-20,-30,-15, 21;
/M: SY='C'; M=  1,-14, 27,-19,-11,-20,-20,-15,-19, -9,-11, -9,-12,-24, -3, -3, -6, -8,-11,-30,-18, -8;
/M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10,  0,-22,-20, -4,-28, 21,-22,-12, -4,  4,  6, 51,-10,-10,-22,-22,-14, -2;
/M: SY='E'; M=-13, 26,-28, 33, 38,-31,-14,  2,-31,  6,-24,-23, 16, -6, 11, -3,  2, -8,-30,-34,-20, 25;
/M: SY='A'; M= 13, -6,-23, -9, -2,-28,  6,-12,-24,  7,-21,-10, -3,-12,  5, -1,  1, -9,-17,-20,-18,  2;
/M: SY='N'; M=  0, 15,-23,  9, 17,-25,-10, -2,-23, 12,-24,-16, 19,-11,  6,  3,  3, -5,-23,-30,-18, 11;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M= -6, -4,-23, -5, -2,-20,-13, -9,-21,  1,-24,-16,  4,  8, -1, 10, 10,  9,-17,-31,-18, -4;
/M: SY='L'; M=-12,-18,-24,-16,  0, -3,-26,-13,  1,-12, 24,  7,-19,-22, -7, -1,-20,-10, -3,-22, -6, -4;
/M: SY='P'; M=-10, -7,-33, -7, -3,-23,-16,-10,-14, -8,-22, -7, -3, 49, -6,-14, -7, -8,-24,-31,-23, -8;
/M: SY='H'; M= -8,  9,-21,  4,  0,-20, -9, 43,-24, -8,-26,-11, 21,-17,  4, -3, 12, -2,-23,-36, -2,  0;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,-10,-28,-11, -3,-20,-21,  7, -8, -4,-14, -3, -3, -5,  9,  3, -2, -7,-12,-26, -7,  0;
/M: SY='T'; M= -8,  0,-21, -4, -1,-19,-20,  9,-21, 11,-19, -8,  2,-12,  1,  6,  3, 14,-13,-27, -4, -1;
/M: SY='M'; M=  3,-18,-18,-28,-18, -4,-16, -4, 14,-10, 14, 45,-18,-18, -2,-12,-14, -8,  8,-20, -4,-10;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 12,-32,-20, -6,-28, 41,-28, -8,  0,-10, 21, 26, -8,-10,-22,-20,-10, 16;
/M: SY='R'; M=-13,  6,-28,  5, 18,-25,-17,  0,-28, 24,-24,-14, 10,-12, 11, 31, -4, -8,-24,-26,-14, 13;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 41,-28, -8,-28;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 36, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 24,-23, -3,-23;
/M: SY='Q'; M=-11, -1,-27, -7,  0,-22,-20, -2, -8,  4,-13, -3,  6,-16, 18, 12, -2, -3,-14,-24,-10,  7;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='M'; M= -7,-13,-17,-23,-17, -3,-20, -7, 10,-10, 10, 36,-13,-17, -3,-10, -6, 11,  7,-23, -3,-10;
/M: SY='T'; M= -6,  2,-21,  0, 12,-21,-20,-12,-21, 15,-19,-12,  0, -8,  3,  6,  5, 16,-13,-27,-12,  8;
/M: SY='H'; M=-10,  0,-25, -5, -7,-19,  2, 14,-21, -1,-18, -2, 10,-19,  0,  9, -2, -9,-20,-27,-10, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  4,-27, -3,  0,-23,-19, -6, -8, 12,-18, -5, 12,-15,  9,  6, -5, -7,-14,-25,-11,  4;
/M: SY='K'; M= -2,-11,-21,-12, -5,-18,-19,-14,-11, 17,-16, -5, -8,-17, -3, 16, -4, -4,  1,-24,-12, -5;
/M: SY='G'; M=-10,-13,-29,-15,-12, -5, 10,-15,-26,  0,-20,-12, -6,-11,-13,  4, -9,-14,-20,-14,-10,-13;
/M: SY='R'; M=-13,  3,-26,  4, -1,-21,-21,-10,-16, 10,-16,-10,  1,-14, -1, 15, -4,  1,-11,-26,-11, -3;
/I:         I=-5; MI=-5; MD=-15; IM=-5;
/M: SY='C'; M= -7,-13, 79,-20,-20,-13,-20,-20,-20,-20,-13,-13,-13,-26,-20,-20, -7, -7, -7,-33,-20,-20; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='H'; M= -7, -4,-20, -2,  3,-19,-11, 15,-15, -3,-16, -6, -2, 13, 10, -3, -1, -6,-18,-19, -6,  5; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='F'; M=-11, -4,-20,-12,-18, 14,-20, -4,  1,-13, -6, -4,  5,-27,-17,-11, -7, -4,  0,-13, 13,-18;
/M: SY='A'; M= 20,-12,-23,-14,-11,-26, 20,-20,-22,-13,-21,-16, -9,  8,-13,-20,  2, -9,-17,-22,-26,-13;
/M: SY='H'; M=-13, -4,-27, -6, -5,-20, -3, 37,-29, -3,-20, -7,  4,-18,  1, 10, -3, -7,-23,-26, -1, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= 16,-16,-27,-14, -4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16, 46,-10,-20, -1, -6,-17,-26,-26,-10;
/M: SY='S'; M=  1, -8,-16, -7,  3,-15,-16,-15, -3,-10,-13, -9, -5,-14, -5,-12, 13,  6,  5,-33,-16, -2;
/M: SY='C'; M=  1, -7, 35,-12,-12,-18,-15,-19,-21,-17,-22,-18, -2,-20,-12,-17, 18, 16, -8,-41,-21,-12;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10,  0,-14, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='Q'; M= -8, -6,-26, -6,  9,-31,-22,  1, -9,  4,-14,  2, -6,-14, 41,  4, -2, -8,-13,-22,-10, 25;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='A'; M= 30,  2,-12, -8, -6,-20,  0,-12,-14, -8,-18,-14,  8,-12, -6,-14, 15,  3, -8,-28,-20, -6;
/I:         I=-7; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='W'; M=  4,-21,-32,-24,-17, -7,-13,  1,-19,-14,-17,-12,-19,-21,-10,-16,-16,-18,-20, 53, 11,-12;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='H'; M=-16, 18,-26, 13,  2,-22,-12, 60,-27, -6,-24,-10, 29,-19,  6, -1, -2,-12,-30,-34,  2,  1;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T'; M= -1,  0,-18, -3,  3,-23,-15,-10,-19,  7,-22,-11,  3,-10, 10,  2, 15, 18,-13,-29,-13,  6;
/M: SY='R'; M=-16,  5,-28,  2, 11,-22,-16,  2,-28, 20,-22,-14, 13,-16, 10, 42, -4, -8,-24,-26,-14,  7;
/M: SY='E'; M=-13, 20,-28, 25, 32,-28,-15, 19,-30,  3,-23,-18, 16, -9, 11, -2,  0,-10,-30,-33,-13, 21;
/M: SY='D'; M= -5, 29,-25, 32,  9,-31, -8, -3,-29,  8,-27,-21, 20,-12,  0, -2,  2, -6,-23,-33,-18,  5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -8,-17,-35,-10, -2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17, 74,-10,-18, -5, -1,-25,-30,-27,-10;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/I:         I=-8; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-23,-25,-16, -2,-28,-17, 15,-11, 19, 18,-18,-21,-11,-11,-18, -4,  8,-21, -3,-15;
/M: SY='P'; M=-10,  1,-33,  0,  0,-27,-13,-10,-20, -7,-30,-20,  8, 52, -7,-13, -3, -7,-30,-33,-27, -7;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-33,-26,  4,-33,-26, 32,-28, 31, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_10 which contains 556'006 sequence entries.


Total number of hits 27 in 16 different sequences
Number of true positive hits 27 in 16 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 3
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 90.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] TAZ-type
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
16 sequences

BT3_ARATH   (Q9SYL0    ), BT5_ARATH   (Q6EJ98    ), CBP1_CAEEL  (P34545    ), 
CBP_HUMAN   (Q92793    ), CBP_MOUSE   (P45481    ), CBP_RAT     (Q6JHU9    ), 
EP300_HUMAN (Q09472    ), EP300_MOUSE (B2RWS6    ), HAC12_ARATH (Q9FWQ5    ), 
HAC1_ARATH  (Q9C5X9    ), HAC2_ARATH  (Q9FYH1    ), HAC4_ARATH  (Q9LG11    ), 
HAC5_ARATH  (Q9LE42    ), HACL1_ORYSJ (Q6YXY2    ), HACL2_ORYSJ (Q5Z8V7    ), 
HACL3_ORYSJ (Q9XHY7    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
3 sequences

BT1_ARATH   (Q9FMK7    ), BT2_ARATH   (Q94BN0    ), BT4_ARATH   (Q9FJX5    )

		
PDB
[Detailed view]
19 PDB

1F81; 1L3E; 1L8C; 1P4Q; 1R8U; 1U2N; 2K8F; 2KA4; 2KA6; 2KJE; 2LWW; 2MH0; 2MZD; 3IO2; 3P57; 3T92; 5HOU; 5HP0; 5HPD
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission