Due to maintenance work, this service will not be available on Monday December 12th between 07.00 am and 9.00 am CEST.
Entry: PS50134

General information about the entry

Entry name [info] ZF_TAZ
Accession [info] PS50134
Entry type [info] MATRIX
Date [info] SEP-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2016 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50134
Associated ProRule [info] PRU00203

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger TAZ-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=80;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9065000; R2=0.0069994; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8320.8134766; R2=5.0651851; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=943; H_SCORE=13097; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=657; H_SCORE=11649; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-10, 13,-26, 22, -1,-29,  5,-10,-23, -8,-20,-16,  2,-17, -6,-13, -2,-10,-13,-31,-19, -3;
/M: SY='P'; M= -9, -9,-37,  0,  4,-31, -5,-16,-26, -9,-29,-21,-11, 55, -8,-17, -7,-12,-30,-29,-28, -5;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-19, -4,  8,-17,-18,-11,-14,  2,-15,-11, -4,-13,  0,  8,  7,  7, -5,-30,-14,  3;
/M: SY='R'; M=-13, -1,-30,  1, 17,-27,-20, -4,-30, 34,-24,-12,  0,-11, 12, 37, -8,-10,-22,-22,-12, 13;
/M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11, -1,-14,-22,  4,-24, 22,-17, -7, -3,-21, 12, 51,-11,-10,-19,-12,  4,  1;
/M: SY='K'; M=-10, -4,-28, -2, 14,-25,-22, -6,-18, 20,-11, -4, -6,-12, 17, 12,-10,-10,-18,-22,-10, 16;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-19,-18,-13,  4,-20, -8,  2,-19, 12,  2,-14,-23,-11,-14, -4,  0, -1,-16, 10,-13;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-26,-37,-28,  2,-37,-28, 41,-29, 25, 19,-23,-23,-21,-27,-21, -9, 28,-21, -1,-28;
/M: SY='Q'; M=-10,  9,-28,  4, 16,-36,-16, 10,-20,  8,-22, -4, 13,-12, 47,  8,  2, -8,-30,-24,-12, 31;
/M: SY='Q'; M=-13, -3,-30, -3, 13,-33,-20,  7,-23, 17,-20, -3,  0,-13, 43, 31, -3,-10,-27,-20,-10, 26;
/M: SY='C'; M=-10, -7, 22,-10,  1,-31,-23, -8,-26,  5,-22, -9, -7,-20, 18,  1, -6,-10,-21,-30,-17,  9;
/I:         I=-8; MI=-10; MD=-15; IM=-10; DM=-15;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-34,-24, 12,-33,-23, 29,-30, 36, 18,-26,-27,-22,-23,-26,-10, 16,-18,  2,-24;
/M: SY='V'; M=  4,-21,-16,-23,-15, -8,-23,-19, 12,-15, 10,  7,-21,-23, -8,-14, -9, -4, 19,-24, -9,-12;
/M: SY='F'; M= -5,-20,-17,-22,-15, 15,-20,-17,  2,-23, 14,  2,-14,-23,-17,-17, -4,  0,  1,-20,  0,-15;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-19,-32,-26,  4,-32,-26, 30,-27, 30, 17,-28,-28,-23,-22,-21, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
/M: SY='H'; M=-13, -2,-20, -2,  0,-13,-13, 44,-20,  2,-13, -2,  4,-13,  7, 15, -7,-11,-18,-18,  7,  0; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='K'; M= -9, -2,-20, -2,  4,-18,-13, -4,-20, 28,-18, -7,  0, -9,  7, 28, -7, -7,-13,-13, -7,  4; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=  0,  0,-20,  0, 10,-30,-10,  0,-20,  0,-25,-10,  5,-10, 31,  0, 19,  5,-20,-30,-15, 21;
/M: SY='C'; M=  1,-14, 27,-19,-11,-20,-20,-15,-19, -9,-11, -9,-12,-24, -3, -3, -6, -8,-11,-30,-18, -8;
/M: SY='R'; M=-18,-12,-32,-10,  0,-22,-20, -4,-28, 21,-22,-12, -4,  4,  6, 51,-10,-10,-22,-22,-14, -2;
/M: SY='E'; M=-13, 26,-28, 33, 38,-31,-14,  2,-31,  6,-24,-23, 16, -6, 11, -3,  2, -8,-30,-34,-20, 25;
/M: SY='A'; M= 13, -6,-23, -9, -2,-28,  6,-12,-24,  7,-21,-10, -3,-12,  5, -1,  1, -9,-17,-20,-18,  2;
/M: SY='N'; M=  0, 15,-23,  9, 17,-25,-10, -2,-23, 12,-24,-16, 19,-11,  6,  3,  3, -5,-23,-30,-18, 11;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M= -6, -4,-23, -5, -2,-20,-13, -9,-21,  1,-24,-16,  4,  8, -1, 10, 10,  9,-17,-31,-18, -4;
/M: SY='L'; M=-12,-18,-24,-16,  0, -3,-26,-13,  1,-12, 24,  7,-19,-22, -7, -1,-20,-10, -3,-22, -6, -4;
/M: SY='P'; M=-10, -7,-33, -7, -3,-23,-16,-10,-14, -8,-22, -7, -3, 49, -6,-14, -7, -8,-24,-31,-23, -8;
/M: SY='H'; M= -8,  9,-21,  4,  0,-20, -9, 43,-24, -8,-26,-11, 21,-17,  4, -3, 12, -2,-23,-36, -2,  0;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,-10,-28,-11, -3,-20,-21,  7, -8, -4,-14, -3, -3, -5,  9,  3, -2, -7,-12,-26, -7,  0;
/M: SY='T'; M= -8,  0,-21, -4, -1,-19,-20,  9,-21, 11,-19, -8,  2,-12,  1,  6,  3, 14,-13,-27, -4, -1;
/M: SY='M'; M=  3,-18,-18,-28,-18, -4,-16, -4, 14,-10, 14, 45,-18,-18, -2,-12,-14, -8,  8,-20, -4,-10;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 12,-32,-20, -6,-28, 41,-28, -8,  0,-10, 21, 26, -8,-10,-22,-20,-10, 16;
/M: SY='R'; M=-13,  6,-28,  5, 18,-25,-17,  0,-28, 24,-24,-14, 10,-12, 11, 31, -4, -8,-24,-26,-14, 13;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 41,-28, -8,-28;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 36, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 24,-23, -3,-23;
/M: SY='Q'; M=-11, -1,-27, -7,  0,-22,-20, -2, -8,  4,-13, -3,  6,-16, 18, 12, -2, -3,-14,-24,-10,  7;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='M'; M= -7,-13,-17,-23,-17, -3,-20, -7, 10,-10, 10, 36,-13,-17, -3,-10, -6, 11,  7,-23, -3,-10;
/M: SY='T'; M= -6,  2,-21,  0, 12,-21,-20,-12,-21, 15,-19,-12,  0, -8,  3,  6,  5, 16,-13,-27,-12,  8;
/M: SY='H'; M=-10,  0,-25, -5, -7,-19,  2, 14,-21, -1,-18, -2, 10,-19,  0,  9, -2, -9,-20,-27,-10, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  4,-27, -3,  0,-23,-19, -6, -8, 12,-18, -5, 12,-15,  9,  6, -5, -7,-14,-25,-11,  4;
/M: SY='K'; M= -2,-11,-21,-12, -5,-18,-19,-14,-11, 17,-16, -5, -8,-17, -3, 16, -4, -4,  1,-24,-12, -5;
/M: SY='G'; M=-10,-13,-29,-15,-12, -5, 10,-15,-26,  0,-20,-12, -6,-11,-13,  4, -9,-14,-20,-14,-10,-13;
/M: SY='R'; M=-13,  3,-26,  4, -1,-21,-21,-10,-16, 10,-16,-10,  1,-14, -1, 15, -4,  1,-11,-26,-11, -3;
/I:         I=-5; MI=-5; MD=-15; IM=-5;
/M: SY='C'; M= -7,-13, 79,-20,-20,-13,-20,-20,-20,-20,-13,-13,-13,-26,-20,-20, -7, -7, -7,-33,-20,-20; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='H'; M= -7, -4,-20, -2,  3,-19,-11, 15,-15, -3,-16, -6, -2, 13, 10, -3, -1, -6,-18,-19, -6,  5; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='F'; M=-11, -4,-20,-12,-18, 14,-20, -4,  1,-13, -6, -4,  5,-27,-17,-11, -7, -4,  0,-13, 13,-18;
/M: SY='A'; M= 20,-12,-23,-14,-11,-26, 20,-20,-22,-13,-21,-16, -9,  8,-13,-20,  2, -9,-17,-22,-26,-13;
/M: SY='H'; M=-13, -4,-27, -6, -5,-20, -3, 37,-29, -3,-20, -7,  4,-18,  1, 10, -3, -7,-23,-26, -1, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= 16,-16,-27,-14, -4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16, 46,-10,-20, -1, -6,-17,-26,-26,-10;
/M: SY='S'; M=  1, -8,-16, -7,  3,-15,-16,-15, -3,-10,-13, -9, -5,-14, -5,-12, 13,  6,  5,-33,-16, -2;
/M: SY='C'; M=  1, -7, 35,-12,-12,-18,-15,-19,-21,-17,-22,-18, -2,-20,-12,-17, 18, 16, -8,-41,-21,-12;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10,  0,-14, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='Q'; M= -8, -6,-26, -6,  9,-31,-22,  1, -9,  4,-14,  2, -6,-14, 41,  4, -2, -8,-13,-22,-10, 25;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='A'; M= 30,  2,-12, -8, -6,-20,  0,-12,-14, -8,-18,-14,  8,-12, -6,-14, 15,  3, -8,-28,-20, -6;
/I:         I=-7; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='W'; M=  4,-21,-32,-24,-17, -7,-13,  1,-19,-14,-17,-12,-19,-21,-10,-16,-16,-18,-20, 53, 11,-12;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='H'; M=-16, 18,-26, 13,  2,-22,-12, 60,-27, -6,-24,-10, 29,-19,  6, -1, -2,-12,-30,-34,  2,  1;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T'; M= -1,  0,-18, -3,  3,-23,-15,-10,-19,  7,-22,-11,  3,-10, 10,  2, 15, 18,-13,-29,-13,  6;
/M: SY='R'; M=-16,  5,-28,  2, 11,-22,-16,  2,-28, 20,-22,-14, 13,-16, 10, 42, -4, -8,-24,-26,-14,  7;
/M: SY='E'; M=-13, 20,-28, 25, 32,-28,-15, 19,-30,  3,-23,-18, 16, -9, 11, -2,  0,-10,-30,-33,-13, 21;
/M: SY='D'; M= -5, 29,-25, 32,  9,-31, -8, -3,-29,  8,-27,-21, 20,-12,  0, -2,  2, -6,-23,-33,-18,  5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -8,-17,-35,-10, -2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17, 74,-10,-18, -5, -1,-25,-30,-27,-10;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/I:         I=-8; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-23,-25,-16, -2,-28,-17, 15,-11, 19, 18,-18,-21,-11,-11,-18, -4,  8,-21, -3,-15;
/M: SY='P'; M=-10,  1,-33,  0,  0,-27,-13,-10,-20, -7,-30,-20,  8, 52, -7,-13, -3, -7,-30,-33,-27, -7;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-33,-26,  4,-33,-26, 32,-28, 31, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2016_11 which contains 553'231 sequence entries.


Total number of hits 27 in 16 different sequences
Number of true positive hits 27 in 16 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 3
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 90.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] TAZ-type
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
16 sequences

BT3_ARATH   (Q9SYL0    ), BT5_ARATH   (Q6EJ98    ), CBP1_CAEEL  (P34545    ), 
CBP_HUMAN   (Q92793    ), CBP_MOUSE   (P45481    ), CBP_RAT     (Q6JHU9    ), 
EP300_HUMAN (Q09472    ), EP300_MOUSE (B2RWS6    ), HAC12_ARATH (Q9FWQ5    ), 
HAC1_ARATH  (Q9C5X9    ), HAC2_ARATH  (Q9FYH1    ), HAC4_ARATH  (Q9LG11    ), 
HAC5_ARATH  (Q9LE42    ), HACL1_ORYSJ (Q6YXY2    ), HACL2_ORYSJ (Q5Z8V7    ), 
HACL3_ORYSJ (Q9XHY7    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
3 sequences

BT1_ARATH   (Q9FMK7    ), BT2_ARATH   (Q94BN0    ), BT4_ARATH   (Q9FJX5    )

		
PDB
[Detailed view]
19 PDB

1F81; 1L3E; 1L8C; 1P4Q; 1R8U; 1U2N; 2K8F; 2KA4; 2KA6; 2KJE; 2LWW; 2MH0; 2MZD; 3IO2; 3P57; 3T92; 5HOU; 5HP0; 5HPD
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission