PROSITE entry PS50134

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ZF_TAZ
Accession [info]	PS50134
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-SEP-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50134
Associated ProRule [info]	PRU00203

Name and characterization of the entry

Description [info]

Zinc finger TAZ-type profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=80;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9065000; R2=0.0069994; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8320.8134766; R2=5.0651851; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=943; H_SCORE=13097; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=657; H_SCORE=11649; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-10, 13,-26, 22, -1,-29,  5,-10,-23, -8,-20,-16,  2,-17, -6,-13, -2,-10,-13,-31,-19, -3;
/M: SY='P';  M= -9, -9,-37,  0,  4,-31, -5,-16,-26, -9,-29,-21,-11, 55, -8,-17, -7,-12,-30,-29,-28, -5;
/M: SY='E';  M= -5, -5,-19, -4,  8,-17,-18,-11,-14,  2,-15,-11, -4,-13,  0,  8,  7,  7, -5,-30,-14,  3;
/M: SY='R';  M=-13, -1,-30,  1, 17,-27,-20, -4,-30, 34,-24,-12,  0,-11, 12, 37, -8,-10,-22,-22,-12, 13;
/M: SY='R';  M=-19,-11,-30,-11, -1,-14,-22,  4,-24, 22,-17, -7, -3,-21, 12, 51,-11,-10,-19,-12,  4,  1;
/M: SY='K';  M=-10, -4,-28, -2, 14,-25,-22, -6,-18, 20,-11, -4, -6,-12, 17, 12,-10,-10,-18,-22,-10, 16;
/M: SY='L';  M= -5,-18,-19,-18,-13,  4,-20, -8,  2,-19, 12,  2,-14,-23,-11,-14, -4,  0, -1,-16, 10,-13;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-26,-37,-28,  2,-37,-28, 41,-29, 25, 19,-23,-23,-21,-27,-21, -9, 28,-21, -1,-28;
/M: SY='Q';  M=-10,  9,-28,  4, 16,-36,-16, 10,-20,  8,-22, -4, 13,-12, 47,  8,  2, -8,-30,-24,-12, 31;
/M: SY='Q';  M=-13, -3,-30, -3, 13,-33,-20,  7,-23, 17,-20, -3,  0,-13, 43, 31, -3,-10,-27,-20,-10, 26;
/M: SY='C';  M=-10, -7, 22,-10,  1,-31,-23, -8,-26,  5,-22, -9, -7,-20, 18,  1, -6,-10,-21,-30,-17,  9;
/I:         I=-8; MI=-10; MD=-15; IM=-10; DM=-15;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-23,-34,-24, 12,-33,-23, 29,-30, 36, 18,-26,-27,-22,-23,-26,-10, 16,-18,  2,-24;
/M: SY='V';  M=  4,-21,-16,-23,-15, -8,-23,-19, 12,-15, 10,  7,-21,-23, -8,-14, -9, -4, 19,-24, -9,-12;
/M: SY='F';  M= -5,-20,-17,-22,-15, 15,-20,-17,  2,-23, 14,  2,-14,-23,-17,-17, -4,  0,  1,-20,  0,-15;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-19,-32,-26,  4,-32,-26, 30,-27, 30, 17,-28,-28,-23,-22,-21, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
/M: SY='H';  M=-13, -2,-20, -2,  0,-13,-13, 44,-20,  2,-13, -2,  4,-13,  7, 15, -7,-11,-18,-18,  7,  0; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='K';  M= -9, -2,-20, -2,  4,-18,-13, -4,-20, 28,-18, -7,  0, -9,  7, 28, -7, -7,-13,-13, -7,  4; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q';  M=  0,  0,-20,  0, 10,-30,-10,  0,-20,  0,-25,-10,  5,-10, 31,  0, 19,  5,-20,-30,-15, 21;
/M: SY='C';  M=  1,-14, 27,-19,-11,-20,-20,-15,-19, -9,-11, -9,-12,-24, -3, -3, -6, -8,-11,-30,-18, -8;
/M: SY='R';  M=-18,-12,-32,-10,  0,-22,-20, -4,-28, 21,-22,-12, -4,  4,  6, 51,-10,-10,-22,-22,-14, -2;
/M: SY='E';  M=-13, 26,-28, 33, 38,-31,-14,  2,-31,  6,-24,-23, 16, -6, 11, -3,  2, -8,-30,-34,-20, 25;
/M: SY='A';  M= 13, -6,-23, -9, -2,-28,  6,-12,-24,  7,-21,-10, -3,-12,  5, -1,  1, -9,-17,-20,-18,  2;
/M: SY='N';  M=  0, 15,-23,  9, 17,-25,-10, -2,-23, 12,-24,-16, 19,-11,  6,  3,  3, -5,-23,-30,-18, 11;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M= -6, -4,-23, -5, -2,-20,-13, -9,-21,  1,-24,-16,  4,  8, -1, 10, 10,  9,-17,-31,-18, -4;
/M: SY='L';  M=-12,-18,-24,-16,  0, -3,-26,-13,  1,-12, 24,  7,-19,-22, -7, -1,-20,-10, -3,-22, -6, -4;
/M: SY='P';  M=-10, -7,-33, -7, -3,-23,-16,-10,-14, -8,-22, -7, -3, 49, -6,-14, -7, -8,-24,-31,-23, -8;
/M: SY='H';  M= -8,  9,-21,  4,  0,-20, -9, 43,-24, -8,-26,-11, 21,-17,  4, -3, 12, -2,-23,-36, -2,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,-10,-28,-11, -3,-20,-21,  7, -8, -4,-14, -3, -3, -5,  9,  3, -2, -7,-12,-26, -7,  0;
/M: SY='T';  M= -8,  0,-21, -4, -1,-19,-20,  9,-21, 11,-19, -8,  2,-12,  1,  6,  3, 14,-13,-27, -4, -1;
/M: SY='M';  M=  3,-18,-18,-28,-18, -4,-16, -4, 14,-10, 14, 45,-18,-18, -2,-12,-14, -8,  8,-20, -4,-10;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 12,-32,-20, -6,-28, 41,-28, -8,  0,-10, 21, 26, -8,-10,-22,-20,-10, 16;
/M: SY='R';  M=-13,  6,-28,  5, 18,-25,-17,  0,-28, 24,-24,-14, 10,-12, 11, 31, -4, -8,-24,-26,-14, 13;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 41,-28, -8,-28;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 36, 17,-30,-30,-23,-20,-23, -7, 24,-23, -3,-23;
/M: SY='Q';  M=-11, -1,-27, -7,  0,-22,-20, -2, -8,  4,-13, -3,  6,-16, 18, 12, -2, -3,-14,-24,-10,  7;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='M';  M= -7,-13,-17,-23,-17, -3,-20, -7, 10,-10, 10, 36,-13,-17, -3,-10, -6, 11,  7,-23, -3,-10;
/M: SY='T';  M= -6,  2,-21,  0, 12,-21,-20,-12,-21, 15,-19,-12,  0, -8,  3,  6,  5, 16,-13,-27,-12,  8;
/M: SY='H';  M=-10,  0,-25, -5, -7,-19,  2, 14,-21, -1,-18, -2, 10,-19,  0,  9, -2, -9,-20,-27,-10, -5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-27, -3,  0,-23,-19, -6, -8, 12,-18, -5, 12,-15,  9,  6, -5, -7,-14,-25,-11,  4;
/M: SY='K';  M= -2,-11,-21,-12, -5,-18,-19,-14,-11, 17,-16, -5, -8,-17, -3, 16, -4, -4,  1,-24,-12, -5;
/M: SY='G';  M=-10,-13,-29,-15,-12, -5, 10,-15,-26,  0,-20,-12, -6,-11,-13,  4, -9,-14,-20,-14,-10,-13;
/M: SY='R';  M=-13,  3,-26,  4, -1,-21,-21,-10,-16, 10,-16,-10,  1,-14, -1, 15, -4,  1,-11,-26,-11, -3;
/I:         I=-5; MI=-5; MD=-15; IM=-5;
/M: SY='C';  M= -7,-13, 79,-20,-20,-13,-20,-20,-20,-20,-13,-13,-13,-26,-20,-20, -7, -7, -7,-33,-20,-20; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='H';  M= -7, -4,-20, -2,  3,-19,-11, 15,-15, -3,-16, -6, -2, 13, 10, -3, -1, -6,-18,-19, -6,  5; D=-3;
/I:         DM=-15;
/M: SY='F';  M=-11, -4,-20,-12,-18, 14,-20, -4,  1,-13, -6, -4,  5,-27,-17,-11, -7, -4,  0,-13, 13,-18;
/M: SY='A';  M= 20,-12,-23,-14,-11,-26, 20,-20,-22,-13,-21,-16, -9,  8,-13,-20,  2, -9,-17,-22,-26,-13;
/M: SY='H';  M=-13, -4,-27, -6, -5,-20, -3, 37,-29, -3,-20, -7,  4,-18,  1, 10, -3, -7,-23,-26, -1, -5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M= 16,-16,-27,-14, -4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16, 46,-10,-20, -1, -6,-17,-26,-26,-10;
/M: SY='S';  M=  1, -8,-16, -7,  3,-15,-16,-15, -3,-10,-13, -9, -5,-14, -5,-12, 13,  6,  5,-33,-16, -2;
/M: SY='C';  M=  1, -7, 35,-12,-12,-18,-15,-19,-21,-17,-22,-18, -2,-20,-12,-17, 18, 16, -8,-41,-21,-12;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 41,-26,-10,  0,-14, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='Q';  M= -8, -6,-26, -6,  9,-31,-22,  1, -9,  4,-14,  2, -6,-14, 41,  4, -2, -8,-13,-22,-10, 25;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='A';  M= 30,  2,-12, -8, -6,-20,  0,-12,-14, -8,-18,-14,  8,-12, -6,-14, 15,  3, -8,-28,-20, -6;
/I:         I=-7; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='W';  M=  4,-21,-32,-24,-17, -7,-13,  1,-19,-14,-17,-12,-19,-21,-10,-16,-16,-18,-20, 53, 11,-12;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='H';  M=-16, 18,-26, 13,  2,-22,-12, 60,-27, -6,-24,-10, 29,-19,  6, -1, -2,-12,-30,-34,  2,  1;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='T';  M= -1,  0,-18, -3,  3,-23,-15,-10,-19,  7,-22,-11,  3,-10, 10,  2, 15, 18,-13,-29,-13,  6;
/M: SY='R';  M=-16,  5,-28,  2, 11,-22,-16,  2,-28, 20,-22,-14, 13,-16, 10, 42, -4, -8,-24,-26,-14,  7;
/M: SY='E';  M=-13, 20,-28, 25, 32,-28,-15, 19,-30,  3,-23,-18, 16, -9, 11, -2,  0,-10,-30,-33,-13, 21;
/M: SY='D';  M= -5, 29,-25, 32,  9,-31, -8, -3,-29,  8,-27,-21, 20,-12,  0, -2,  2, -6,-23,-33,-18,  5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-35,-10, -2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17, 74,-10,-18, -5, -1,-25,-30,-27,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/I:         I=-8; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M= -9,-20,-23,-25,-16, -2,-28,-17, 15,-11, 19, 18,-18,-21,-11,-11,-18, -4,  8,-21, -3,-15;
/M: SY='P';  M=-10,  1,-33,  0,  0,-27,-13,-10,-20, -7,-30,-20,  8, 52, -7,-13, -3, -7,-30,-33,-27, -7;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-21,-33,-26,  4,-33,-26, 32,-28, 31, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	27 in 16 different sequences
Number of true positive hits	27 in 16 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	3
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	90.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	ZN_FING
Feature description [info]	TAZ-type
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

16 sequences

BT3_ARATH   (Q9SYL0), BT5_ARATH   (Q6EJ98), CBP1_CAEEL  (P34545),

CBP_HUMAN   (Q92793), CBP_MOUSE   (P45481), CBP_RAT (Q6JHU9), 
EP300_HUMAN (Q09472), EP300_MOUSE (B2RWS6), HAC12_ARATH (Q9FWQ5), 
HAC1_ARATH  (Q9C5X9), HAC2_ARATH  (Q9FYH1), HAC4_ARATH  (Q9LG11), 
HAC5_ARATH  (Q9LE42), HACL1_ORYSJ (Q6YXY2), HACL2_ORYSJ (Q5Z8V7), 
HACL3_ORYSJ (Q9XHY7)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

3 sequences

BT1_ARATH   (Q9FMK7), BT2_ARATH   (Q94BN0), BT4_ARATH   (Q9FJX5)

PDB
[Detailed view]

35 PDB

1F81; 1L3E; 1L8C; 1LIQ; 1P4Q; 1R8U; 1U2N; 2K8F; 2KA4; 2KA6; 2KJE; 2LWW; 2MH0; 2MZD; 3IO2; 3P57; 3T92; 5HOU; 5HP0; 5HPD; 6FGN; 6FGS; 7LVS; 7QGS; 7XEZ; 7XFG; 8E1D; 8HAG; 8HAH; 8HAI; 8HAJ; 8HAK; 8HAL; 8HAM; 8HAN
» more