PROSITE entry PS50139
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | Z_BINDING |
| Accession [info] | PS50139 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
17-JUN-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50139 |
| Associated ProRule [info] | PRU00073 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Z-binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=65; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.4455511; R2=0.0132900; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=682; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=456; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= 0, -5,-21, -4, -5,-11, -6,-10, -4, -4, -2, -7, -6, 0, -6,-12, 0, 3, -7,-24, -6, -7; /M: SY='T'; M= 1, -8,-21, -9, -5,-10, -8,-10, -3, -2, -3, -5, -8, 2, -5,-10, 0, 4, -5,-24, -7, -7; /M: SY='A'; M= 4, 1,-18, 3, -3,-16,-10,-13, -3, -3, -2, -3, -1,-12, -3, -9, 0, 2, -3,-29,-11, -5; /M: SY='M'; M= 4, -3,-18, -5, 0,-18, -8, -4, -6, 2, -2, 5, 0,-10, 0, -8, 0, 4, -9,-27,-12, -1; /M: SY='Q'; M= 8, -3,-18, -1, 1,-23, -8,-11,-13, -1,-13, -9, -4, 7, 11, -2, 3, 5,-12,-30,-20, 2; /M: SY='D'; M= 1, 13,-17, 25, 17,-32,-10, -6,-22, 4,-10,-13, 1, -2, 4, -7, 2, -7,-18,-27,-14, 12; /M: SY='L'; M= -3, -8, -6,-10, -7, -6,-17,-11, 7,-10, 8, 3, -7,-18, 1, -5,-10, -1, 2,-23, -1, -5; /M: SY='E'; M= 4, -2,-13, 2, 26,-25,-15, -9,-19, 15,-13, -1, -6, 2, 20, 5, -1, -8,-19,-18,-14, 24; /M: SY='E'; M= 3, 1, -9, 7, 31,-31,-16, -4,-23, 10,-13, -9, -5, 2, 26, 3, -1, -9,-24,-17,-16, 30; /M: SY='R'; M= 0, -6,-19, -4, 5,-14,-15,-11,-12, 10, -9, 5, -7, -7, 14, 18, -5, -9,-10,-18, -7, 7; /M: SY='I'; M= 3,-18,-19,-31,-27, 3,-16,-21, 49,-19, 17, 8, -6,-32,-21,-23,-10, 3, 38,-30, -3,-27; /M: SY='L'; M=-16,-14, 20,-16, -8, 9,-25,-11, 6,-18, 24, 6,-16,-26,-16,-16,-17, -5, 2,-15, 13, -9; /M: SY='Q'; M= 3, 3,-16, 7, 12,-24,-13, -8,-20, 6,-13, -6, 0, -5, 20, 11, -1, -6,-17,-22,-14, 13; /M: SY='F'; M= -7,-20,-29,-22,-19, 30,-22,-15, 7,-10, 15, -3,-16,-26,-14, -9, -9, -5, 14, -5, 22,-19; /M: SY='L'; M= -9,-12, -4,-14,-12, 21,-20,-10, 20,-18, 35, 17,-18,-30,-19,-19,-18, -1, 12,-20, 26,-12; /M: SY='R'; M= -2, -9,-21, -8, 2, -1,-13,-11,-13, 7, -6, 0, -9, -9, 5, 10, -2, -9, -9,-13, -2, 1; /M: SY='D'; M= 5, 9,-18, 13, 10,-24, -7,-10,-15, 4,-11, -6, 7, -7, 5, -6, 2, -2,-14,-30,-17, 8; /M: SY='I'; M= 4, -3,-11, -6, -6, -5,-13,-12, 6, -7, 3, 4, -1,-18, -8,-11, -1, 5, 3,-32, -7, -7; /M: SY='G'; M= 1, -1,-28, -5, -9,-24, 38,-21,-12, -3,-16,-13, -1, -6, -9,-10, 2,-11,-22, -6,-22,-10; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='P'; M= 2, 0,-17, 5, 16,-28, -7, -7,-20, 9,-17,-14, -5, 19, 6, -6, 4, -2,-22,-24,-18, 11; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='T'; M= 7, -6,-20, -7, -3,-20, -5, -8, -8, -1,-12, -7, -4, 6, 1, -9, 7, 8, -8,-31,-19, -4; /M: SY='T'; M= 4, -8,-16,-12,-12, -6,-16,-16, 7, -6, 0, 2, -3,-15, -7, -9, 2, 10, 9,-31, -7,-11; /M: SY='T'; M= 16, -3,-25, -5, -2,-19,-10,-15, -7, 3,-11, 1, -1, 5, 5,-10, 10, 17, -1,-40,-21, -1; /M: SY='A'; M= 12, -6,-17, -9, -9, -1,-12,-16, 12,-10, 12, 11, -8,-19, -7,-16, -3, 7, 12,-35, -5, -9; /M: SY='M'; M= 3, -3,-24, -5, -4,-11,-13, 1, -1, 0, -5, 6, 2,-11, -3, -5, -2, -1, -2,-33,-10, -5; /M: SY='I'; M= 1, -6,-16, -7, -6,-11,-16,-11, 13,-10, 6, 1, -7,-19, 3, -8, -9, -1, 7,-24, -3, -4; /M: SY='I'; M= 11, -7,-15, -9, -8, 0,-10,-15, 14,-11, 14, 13, -9,-21, -7,-14, -5, 4, 12,-33, -5, -8; /M: SY='A'; M= 13, -4,-22, -4, 4,-13, -9,-18, -7, 10,-12, 7, -4, -5, 6, 2, 4, 2, -3,-30,-18, 2; /M: SY='K'; M= 2, 1,-24, -3, 1,-11, -3,-15,-12, 10,-15, 4, 8, -9, 4, 7, -2, -7,-13,-20,-15, 0; /M: SY='M'; M= 0, -7,-12, -8, 3, -5,-16,-14, 3, 2, 5, 8, -9,-13, -2, -4, -8, -5, 0,-21, 0, 1; /M: SY='G'; M= -7, -7, -4,-14,-13, -4, 20,-23, 2,-14, 6, -3, -8,-21,-19,-18, -9,-10,-10, -8, -7,-15; /M: SY='M'; M= -4, -8,-21,-12, -6, -4, -5, -2, -4, -2, 1, 7, -4,-16, 2, 2,-10, -9,-10,-16, -1, -4; /M: SY='M'; M= 5,-10,-20,-13, -9, -6,-15,-13, 7, 0, 2, 10, -6,-16, -6, -2, -3, 3, 8,-27, -4, -9; /M: SY='P'; M= 1, -4,-22, -4, 5,-24,-10, -6,-17, 7,-17,-12, -4, 28, 4, -7, 6, 9,-18,-31,-16, 2; /M: SY='K'; M= 12, -2,-28, -2, 10,-14, -8,-17,-13, 22,-16, 14, -1, 1, 5, 7, 3, -3, -9,-29,-19, 5; /M: SY='K'; M= -2, -4,-28, -3, 11,-12,-12, -9,-20, 26,-19, 11, -3, 7, 5, 17, 1,-10,-18,-20, -9, 6; /M: SY='E'; M= 1, 8,-11, 19, 22,-30,-16, -8,-18, 6, -7,-10, -3, -3, 9, -8, -1, -8,-15,-24,-13, 18; /M: SY='V'; M= 7,-18,-18,-22,-26, 7,-23,-25, 40,-19, 15, 5,-15,-35,-25,-16,-10, 7, 41,-30, 5,-26; /M: SY='N'; M= 0, 38,-11, 9,-10,-10, -1,-10, 0, 0,-19, -1, 75,-29,-10,-20, 1, 11,-19,-68,-38,-10; /M: SY='P'; M= -1,-12,-26, -7, 5,-22,-14, 1,-21, 8,-20, -9,-14, 25, 19, 19, -4, -6,-20,-21,-11, 6; /M: SY='V'; M= 8, -6,-23, -6,-14, -6,-18,-13, 10,-11, 3, 0, -6,-20,-10,-14, 0, 9, 16,-34, -5,-14; /M: SY='L'; M=-10,-10, 0,-10,-10, 19,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20, 0, 10,-20, 29,-10; /M: SY='Y'; M=-34,-26,-53,-11,-19, 25,-27, 1, -7,-10, 25, -8,-31,-20,-11, -3,-17, -8, 9, 35, 73,-19; /M: SY='A'; M= 8, 3,-24, 8, 1,-18, -6,-15,-16, 5,-14, -4, -1, -8, 5, 7, 8, 0, -9,-28,-16, -1; /M: SY='L'; M= -4,-14, -6,-17,-11, 9,-20, -2, 17, -8, 32, 30,-13,-32,-17,-14,-19, 0, 7,-23, 16,-11; /M: SY='E'; M= 2, -4, -9, 0, 24,-21,-16, -6,-18, 11, -8, 0, -8, -2, 19, 5, -3,-10,-18,-15,-10, 23; /M: SY='R'; M= -1, -2,-23, 2, 8,-15,-11,-12,-21, 18,-18, 3, -2, -2, 9, 21, 1,-10,-16,-19,-10, 6; /M: SY='Q'; M= 4, -3,-18, 0, 15,-19,-13, -9,-17, 11,-14, -1, -5, -2, 19, 10, 2, -5,-17,-18,-11, 15; /M: SY='G'; M= 0, 1,-35, -5, -9,-26, 36, -1,-12, -7,-16, -9, 3, -8, -8,-13, 1,-12,-24,-13,-22,-10; /M: SY='E'; M= -1, 1,-14, 6, 7,-13,-15,-12, -8, 6, 1, 5, -6,-11, 1, -1, -7, -6, -8,-22, -2, 4; /M: SY='I'; M= 6,-13,-15,-15,-19, 7,-19,-21, 28,-17, 17, 8,-15,-31,-20,-15,-10, 5, 28,-28, 8,-19; /M: SY='H'; M= -8, -9,-12, -6, -6, -8,-19, 2, -9, -8, -3, -7, -9,-13, -3, -1, -1, -4, -5,-18, 0, -7; /M: SY='R'; M= -4, -9,-14, -8, 3, -5,-15,-15,-13, 12, -8, 8, -8, -8, 5, 18, -5,-10,-10,-15, -4, 1; /M: SY='D'; M= 3, 3,-17, 7, 5,-21,-14, -9, -9, -1, -7, -8, -1, -8, 5, -6, 0, 1, -8,-28,-11, 5; /M: SY='G'; M= 5, 6,-21, 7, 3,-25, 10,-16,-13, 0,-14,-12, 3, -4, -2,-11, 4, -3,-16,-22,-21, 0; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='D'; M= 2, 7,-18, 13, 2,-22, 7,-14,-11, -2, -6,-10, 0, -8, -5,-11, 1, -4,-11,-17,-12, -1; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='T'; M= 4, 2,-16, -6, -6,-12, -9,-10, -2, -2, -6, 0, 10, -7, -1,-13, 7, 15, -3,-33,-13, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='P'; M= -8,-17,-27,-10, 7,-33,-10, 6,-25, 7,-25,-33,-25, 83, 0, -9, -5, 2,-33,-27,-17, -1; /M: SY='P'; M= -3,-14,-29, -8, 6,-31,-10, 3,-21, 8,-23,-24,-20, 71, 0, -8, -6, 1,-27,-32,-19, -1; /M: SY='M'; M= 1, -9,-16,-11, -8, -5,-18,-12, 6, -3, 7, 10, -8,-15, -5, -7, -4, 6, 7,-26, 2, -7; /M: SY='W'; M=-49,-49,-20,-39,-10, 10, 9,-49,-30,-20,-19,-30,-69,-30,-10, 0,-29,-49,-29,196, 50,-10; /M: SY='S'; M= 0, -8,-13, -7, -4, -8,-13,-10,-12, -1, -7, -6, -5,-12, 1, 3, 5, 0, -6,-20, -9, -4; /M: SY='I'; M= -2,-13, -9,-17,-15, 9,-18,-15, 26,-16, 25, 13,-14,-28,-19,-18,-13, 3, 19,-25, 12,-16; /M: SY='T'; M= 0, -6,-22, -6, -6,-10, -6,-13, -8, -4, -4, -7, -5, -7, -4,-11, 5, 7, -4,-17, -3, -7; /M: SY='D'; M= 3, 1,-15, 6, 3,-24, -7,-14,-15, 2,-12,-10, -4, 0, 4, 2, 0, -4,-12,-25,-16, 1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 17 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 17 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Z-binding |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
DSRAD_HUMAN (P55265), DSRAD_MOUSE (Q99MU3), DSRAD_RAT (P55266), E3_YLDV (Q9DHS8), PG065_MONPV (A0A7H0DN38), PG065_VACCC (P21081), PG065_VACCW (P21605), PG065_VAR67 (P33863), ZBP1_HUMAN (Q9H171), ZBP1_MOUSE (Q9QY24), ZBP1_RAT(Q8VDA5)» more
|
| PDB [Detailed view] |
25 PDB
1J75; 1QBJ; 1QGP; 1SFU; 1XMK; 2ACJ; 2GXB; 2HEO; 2L4M; 2L54; 2LNB; 3EYI; 3F21; 3F22; 3F23; 3IRQ; 3IRR; 4KA4; 5ZU1; 5ZUO; 5ZUP; 7C0I; 8GBC; 8GBD; 8I9J » more |