PROSITE entry PS50143
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BIR_REPEAT_2 |
| Accession [info] | PS50143 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00987 |
| Associated ProRule [info] | PRU00029 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | BIR repeat profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8155000; R2=0.0129576; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4973.9721680; R2=3.0424757; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=594; H_SCORE=6781; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=439; H_SCORE=6310; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10, 0,-19, 10, 68,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='L'; M=-12,-22,-23,-23,-15, 5,-27, -5, 7,-14, 22, 14,-20,-25,-12, -8,-22,-10, 2,-16, 6,-15; /M: SY='R'; M= -2, -4,-21, -7, -5,-13,-13,-10,-15, 7,-14, -7, 0,-17, -4, 11, -2, -4, -8,-23,-11, -5; /M: SY='T'; M= 3, -1,-11, -7, -8,-14, -8,-17,-15,-11,-17,-14, 3,-11, -8,-11, 25, 37, -5,-32,-14, -8; /M: SY='F'; M=-19,-28,-21,-36,-28, 70,-29,-14, -1,-27, 7, -1,-19,-29,-35,-18,-18, -9, -2, 11, 36,-28; /M: SY='Q'; M= -1, -2,-22, -2, 6,-23, -9, -4,-19, 1,-18, -9, -1,-12, 8, -2, 5, 0,-14,-26,-13, 7; /M: SY='N'; M= -5, 21,-21, 19, 6,-23, -6, 1,-23, -2,-24,-18, 22,-13, 0, -6, 10, 4,-21,-34,-16, 3; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='W'; M=-20,-35,-40,-38,-29, 30,-24,-22,-13,-22,-10,-13,-33,-30,-24,-19,-33,-23,-20,101, 35,-23; /M: SY='P'; M= -3,-16,-33,-11, 0,-26,-18,-19,-15, -8,-23,-15,-16, 56, -8,-17, -6, -7,-20,-28,-25, -7; /M: SY='I'; M= -7,-18,-23,-21,-15, 3,-24,-10, 4,-14, 4, 2,-12,-18,-13, -7,-10, -5, 2,-17, 3,-16; /M: SY='D'; M= -5, 8,-20, 9, 4,-22, -6, 2,-24, -1,-23,-14, 8,-12, 2, -3, 6, -3,-20,-28,-10, 2; /M: M= -3, -7,-17,-11,-11, -7,-14,-13, -7, -8, -6, -4, -4,-21,-10, -6, -5, -5, -3,-21, -9,-10; /M: M= -9,-10,-26,-11, -7,-11,-22,-13, -4, -7, -4, -3, -7, -2, -7, -5, -8, -5, -7,-25,-10, -9; /M: M= -1,-11,-24,-10, -5,-20,-13,-15,-10, -4,-14, -7,-11, -7, -1, -7, -4, -6, -5,-16,-13, -4; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='N'; M= -6, 0,-18, -5, -6, -2,-10, -4, -9, -6,-12, -7, 7,-13, -5, -4, 3, 0,-10,-20, -3, -6; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='P'; M= 0,-15,-23,-14, -7,-13,-18,-16, -2,-10,-11, -7,-13, 15,-10,-15, -2, -2, -2,-22,-11,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='E'; M= -6, 8,-23, 10, 23,-28,-15, 3,-26, 6,-21,-15, 6, -9, 15, 4, 3, -4,-24,-29,-15, 18; /M: SY='Q'; M= 0, 4,-23, 4, 10,-25,-14, -5,-19, 8,-18, -7, 1,-11, 11, 3, 3, -2,-15,-27,-14, 10; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-31,-22, 11,-29,-18, 21,-26, 38, 25,-27,-28,-18,-19,-26, -9, 13,-19, 1,-20; /M: SY='A'; M= 35,-12,-11,-20,-12,-17, -6,-20, -3,-12, -9, -7,-10,-13,-11,-19, 10, 2, 6,-24,-18,-12; /M: SY='R'; M= -1, 0,-23, -2, 6,-23,-14, -6,-20, 14,-20,-11, 3,-14, 7, 17, 0, -5,-14,-25,-14, 5; /M: SY='A'; M= 31, -3,-13,-13, -8,-18, -3,-14,-12, -6,-12,-10, 1,-13, -7,-10, 8, 0, -6,-24,-18, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-17,-30,-21,-37,-27, 60,-29,-19, 4,-29, 18, 6,-23,-29,-33,-19,-23,-11, 2, 7, 22,-27; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-26,-23,-20, 35,-29, 3, 0,-13, 3, 2,-18,-28,-17, -9,-19,-10, -5, 14, 49,-20; /M: SY='Y'; M=-12,-15,-16,-17,-16, 17,-24, 13, -9,-12, -6, -5,-13,-26,-11,-10,-12, -8,-11, 5, 41,-17; /M: SY='T'; M= -5, -6,-15,-13,-13, -4,-23,-17, 0,-14, 1, -3, -6,-17,-12,-13, 4, 24, 4,-25, -4,-13; /M: SY='G'; M= 0, -4,-27, -5,-11,-28, 39, -8,-32,-13,-26,-16, 3,-13,-10,-15, 2,-14,-26,-24,-23,-11; /M: SY='V'; M= -5,-11,-22,-12, -8,-14,-20,-13, -3, -2,-10, -5, -6, -6, -8, -1, -4, -3, 1,-27,-12, -9; /M: SY='G'; M= -3, -3,-27, -4, -7,-23, 9,-13,-24, -3,-22,-14, 0,-13, -4, -3, -1, -7,-20,-15,-16, -6; /M: SY='D'; M=-14, 24,-27, 36, 12,-28,-12, -6,-25, -5,-14,-18, 7,-13, -3,-11, -4, -9,-20,-34,-16, 5; /M: SY='E'; M= -9, 0,-28, 2, 9,-23, -9, 2,-22, 4,-19,-11, 0, -9, 4, 3, -4, -9,-20,-25,-12, 5; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='V'; M= 1,-19,-14,-21,-19, -7,-21,-24, 11,-10, 1, 2,-19,-19,-19,-13, -5, 5, 23,-26,-11,-19; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M= -4, -6,-22, -6, 5,-20,-17, -5,-16, 16,-15, -5, -5,-13, 11, 18, -5, -7,-11,-17, -7, 7; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='F'; M= -8,-20,-16,-26,-16, 31,-24,-10, -5,-20, -1, -4,-15,-17,-23,-17,-11, -8, -4, -7, 12,-18; /M: SY='F'; M=-10,-18, 11,-24,-22, 16,-16, -9,-15,-21,-10,-10,-12,-28,-22,-18, -9, -8,-10, -9, 12,-22; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -8, 7,-27, 9, 0,-26, 11, 8,-30, -3,-24,-14, 8,-16, -3, -6, 0,-11,-25,-29,-14, -2; /M: SY='V'; M= -2,-20,-13,-23,-20,-10, -4,-20, 1,-17, 3, 4,-17,-24,-16,-14,-11, -9, 7,-24,-13,-19; /M: SY='E'; M= -7,-11,-16,-11, 1,-19,-12,-14,-11, 1,-11, -5, -9,-17, -3, -1, -8,-10, -6,-25,-15, -2; /M: SY='L'; M= -9,-27,-21,-32,-23, 12,-32,-23, 24,-28, 31, 15,-24,-26,-22,-22,-21, -4, 16,-19, 1,-23; /M: SY='K'; M=-11, 3,-17, 4, -1,-14,-14, -7,-23, 5,-19,-12, 1,-16, -2, 5, -2, -3,-17,-23, -7, -2; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='N'; M= -9, 16,-10, 12, 0,-21, 0, -2,-23, 1,-23,-17, 21,-15, -2, 2, 3, -4,-21,-29,-17, -1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='W'; M=-16,-33,-35,-35,-27, 13,-21,-25,-16,-20,-13,-15,-31,-29,-21,-19,-31,-21,-22,101, 24,-20; /M: SY='E'; M= -8, 2,-26, 6, 21,-24,-16, -3,-21, 7,-16,-11, -1,-11, 10, 4, -1, -7,-18,-28,-14, 15; /M: SY='P'; M= -9, -9,-27, -6, 5,-15,-21, -6,-13, -3,-12, -9, -9, 6, 2, -4, -3, -2,-16,-20, -3, 1; /M: SY='G'; M= -6, 2,-18, 1, 0,-23, 8,-11,-24, -4,-20,-15, 5,-17, -6, -4, 1, -7,-18,-29,-20, -3; /M: SY='D'; M=-16, 36,-29, 51, 22,-36,-12, -2,-37, 7,-29,-26, 14, -9, 4, -2, 0, -9,-28,-36,-19, 13; /M: SY='D'; M=-12, 19,-19, 24, 6,-26,-10, 2,-24, -5,-18,-16, 12,-16, 1, -8, -1, -7,-20,-34,-15, 3; /M: SY='P'; M= 4,-19,-29,-16, -8,-22,-18,-22, -7,-13,-17,-12,-18, 46,-13,-21, -6, -5,-10,-27,-23,-13; /M: SY='W'; M= -8,-23,-31,-26,-13, 0,-22,-17, -1,-14, -1, 5,-23,-21, -7,-15,-20,-14, -7, 33, 6, -9; /M: SY='E'; M= -7, -2,-26, 0, 18,-17,-17, -3,-20, 3,-17,-12, -3, -9, 10, 4, 1, -5,-18,-22, -8, 13; /M: SY='E'; M= -7, 3,-26, 6, 18,-26,-16, -4,-23, 11,-19,-12, 0,-12, 12, 14, -3, -8,-18,-26,-15, 14; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='K'; M= 5, -9,-22,-12, -4,-20,-11,-11,-16, 11,-14, -7, -7,-15, 1, 10, -4, -4, -9,-19,-10, -2; /M: SY='R'; M= -8, -7,-25, -9, 0,-16,-19, -9,-22, 22,-17, -8, -3,-15, 4, 26, -5, -2,-14,-20, -8, 1; /I: I=-5; MD=-26; /M: SY='W'; M=-10,-23,-24,-24,-17, 5,-18, -9, -7,-17, -2, -4,-20,-24,-15,-13,-17,-13, -7, 26, 8,-15; D=-5; /I: I=-5; MD=-26; /M: SY='S'; M= -3, -5,-16, -9, -8, 6,-12, -5,-13,-10,-13,-10, 1,-17, -9, -6, 9, 6, -9,-18, 2, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-26; /M: SY='P'; M= -8,-10,-33, -2, 4,-28,-17,-13,-20, -5,-26,-17,-12, 56, -2,-10, -6, -8,-26,-27,-24, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; /M: SY='N'; M=-10, 8,-25, 5, 3,-20,-13, 4,-16, 1,-20,-11, 14,-13, 7, 2, 1, -5,-19,-26, -7, 4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='E'; M= -3, -7,-27, -4, 6,-17,-10, -9,-18, -3,-15,-12, -7, 3, -2, -6, -3, -7,-17,-21,-10, 1; /M: SY='F'; M=-19,-27,-22,-35,-27, 61,-29,-12, 2,-24, 11, 5,-20,-29,-31,-16,-20,-10, -1, 9, 33,-26; /M: SY='V'; M= -2,-27,-17,-30,-24, 3,-28,-23, 22,-21, 20, 14,-25,-26,-22,-17,-16, -5, 26,-23, -5,-23; /M: SY='R'; M=-12, -6,-26, -9, 0,-14,-21, -3, -9, 4, -2, 1, -2,-19, 8, 11,-11, -8,-12,-21, -5, 2; /I: E1=0;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 124 in 74 different sequences |
| Number of true positive hits | 124 in 74 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 3 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | REPEAT |
| Feature description [info] | BIR |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
74 sequences
BI51A_XENLA (Q8JGN5), BI51B_XENLA (Q4R1J6), BI52A_XENLA (Q50L39), BI52B_XENLA (Q804H7), BIR1A_MOUSE (Q9QWK5), BIR1B_MOUSE (Q9QUK4), BIR1E_MOUSE (Q9R016), BIR1F_MOUSE (Q9JIB6), BIR1G_MOUSE (Q9JIB3), BIR1_CAEEL (G5EFA2), BIR1_SCHPO (O14064), BIR1_YEAST (P47134), BIR2_CAEEL (G5ECJ5), BIR51_XENTR (Q28H51), BIR52_XENTR (Q28ER3), BIR7A_XENLA (Q8JHV9), BIR7B_XENLA (A9ULZ2), BIRC1_HUMAN (Q13075), BIRC2_HUMAN (Q13490), BIRC2_MOUSE (Q62210), BIRC3_CANLF (A1E2V0), BIRC3_HUMAN (Q13489), BIRC3_MOUSE (O08863), BIRC5_BOVIN (Q6J1J1), BIRC5_CANLF (Q8I009), BIRC5_CAVPO (E3SCZ8), BIRC5_FELCA (Q6I6F4), BIRC5_HUMAN (O15392), BIRC5_MOUSE (O70201), BIRC5_PIG (Q9GLN5), BIRC5_PONAB (Q5RAH9), BIRC5_RAT (Q9JHY7), BIRC6_HUMAN (Q9NR09), BIRC6_MOUSE (O88738), BIRC7_HUMAN (Q96CA5), BIRC7_MOUSE (A2AWP0), BIRC7_XENTR (A9JTP3), BIRC8_GORGO (Q95M71), BIRC8_HUMAN (Q96P09), BIRC8_PANTR (Q95M72), BIR_CHICK (Q90660), DIAP1_DROME (Q24306), DIAP2_DROME (Q24307), IAP1_NPVAC (P41435), IAP1_NPVOP (O10296), IAP1_OSHVF (Q6R7I2), IAP2_NPVAC (P41454), IAP2_NPVOP (O10324), IAP2_OSHVF (Q6R7E2), IAP3_NPVOP (P41437), IAP3_OSHVF (Q6R7D0), IAP4_OSHVF (Q6R7C4), IAPL_ASFC1 (P68764), IAPL_ASFC3 (O11451), IAPL_ASFCH (P68763), IAP_ASFB7 (P69180), IAP_ASFE1 (P69181), IAP_ASFE7 (P69182), IAP_ASFH8 (P69183), IAP_ASFK5 (P0C9X4), IAP_ASFL6 (P69184), IAP_ASFM1 (O11452), IAP_ASFM2 (O11453), IAP_ASFP4 (P0C9X5), IAP_ASFP5 (P68765), IAP_ASFWA (P0C9X6), IAP_GVCPM (P41436), PIAP_PIG(O62640), VF193_IIV6 (P47732), XIAP_HUMAN (P98170), XIAP_MOUSE (Q60989), XIAP_RAT(Q9R0I6), XIAP_XENLA (A5D8Q0), XIAP_XENTR (Q5BKL8)» more
|
| PDB [Detailed view] |
163 PDB
1C9Q; 1E31; 1F3H; 1F9X; 1G3F; 1G73; 1I3O; 1I4O; 1I51; 1JD4; 1JD5; 1JD6; 1KMC; 1M4M; 1NW9; 1OXN; 1OXQ; 1OY7; 1Q4Q; 1QBH; 1SDZ; 1SE0; 1TFQ; 1TFT; 1TW6; 1XB0; 1XB1; 1XOX; 2I3H; 2I3I; 2JK7; 2OPY; 2OPZ; 2POI; 2POP; 2QFA; 2QRA; 2RAW; 2RAX; 2UVL; 2VM5; 2VSL; 3CLX; 3CM2; 3CM7; 3D9T; 3D9U; 3EYL; 3F7G; 3F7H; 3F7I; 3G76; 3GT9; 3GTA; 3HL5; 3M0A; 3M0D; 3M1D; 3MUP; 3OZ1; 3SIP; 3SIQ; 3T6P; 3UEC; 3UED; 3UEE; 3UEF; 3UEG; 3UEH; 3UEI; 3UIG; 3UIH; 3UII; 3UIJ; 3UIK; 3UW4; 3UW5; 4A0I; 4A0J; 4A0N; 4EB9; 4EC4; 4HY0; 4HY4; 4HY5; 4J3Y; 4J44; 4J45; 4J46; 4J47; 4J48; 4KJU; 4KJV; 4KMN; 4KMP; 4LGE; 4LGU; 4MTI; 4MTZ; 4MU7; 4OXC; 4WVS; 4WVT; 4WVU; 5C0K; 5C0L; 5C3H; 5C3K; 5C7A; 5C7B; 5C7C; 5C7D; 5C83; 5C84; 5M6E; 5M6F; 5M6H; 5M6L; 5M6M; 5M6N; 5OQW; 5YUD; 6B5B; 6EXW; 6EY2; 6GJW; 6QCI; 6SHO; 6W74; 6W7O; 6W8I; 6YIE; 6YIF; 6YIH; 7LBK; 7LBO; 7LBP; 7LBQ; 7NK0; 7QGJ; 7RAV; 7TRL; 7TRM; 8ATM; 8ATO; 8ATU; 8ATX; 8AUK; 8AUW; 8AZA; 8DSF; 8DSO; 8E2D; 8E2E; 8E2F; 8E2G; 8E2H; 8E2I; 8E2K; 8FML; 8FVU; 8GH7; 8IVQ » more |