Entry: PS50156

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SSD
Accession [info] PS50156
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50156
Associated ProRule [info] PRU00199

Name and characterization of the entry

Description [info] Sterol-sensing domain (SSD) profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=159;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=154;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3390; R2=.01747028; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4860.01676; R2=37.54190; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=409; N_SCORE=8.5; H_SCORE=20252; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=295; N_SCORE=6.5; H_SCORE=15935; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-12, 21,-26, 30,  9,-20, -6, -6,-29, -7,-25,-23, 10, -6, -5,-11,  4, -5,-23,-32,-15,  2;
/M: SY='I'; M= -6,-21,-20,-26,-21, 11,-27,-16, 14,-16, 12,  9,-18,-25,-19,-15,-15, -7, 13,-14,  8,-21;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-21,-32,-25, 11,-31,-25, 26,-26, 19, 12,-21,-24,-23,-22,-15, -4, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='I'; M= -7,-18,-23,-20,-17, -8,-27,-22, 14,-17,  4,  3,-15, -6,-15,-16, -8,  1, 11,-26,-10,-18;
/M: SY='M'; M= -5,-24,-21,-30,-23, -1,-21,-17, 22,-20, 20, 27,-21,-23,-14,-19,-18, -9, 16,-21, -4,-20;
/M: SY='V'; M=  6,-17, -8,-22,-18, -7,-21,-21,  7,-17,  5,  4,-15,-20,-16,-18, -1,  9, 13,-27,-10,-17;
/M: SY='I'; M=  1,-17,-11,-24,-19, -6,-24,-21, 13,-20,  1,  2,-12,-19,-15,-21,  0,  5, 11,-24, -5,-19;
/M: SY='A'; M= 10,-13,-10,-19,-16, -9, -2,-20, -8,-16, -7, -5, -9,-17,-15,-18,  3,  6, -1,-23,-13,-16;
/M: SY='Y'; M=-16,-21,-18,-23,-19,  9,-28, -1, -1, -7, -1, -1,-19,-28,-11,  2,-18,-10, -2,  6, 31,-18;
/M: SY='L'; M= -3,-22,  5,-27,-20,  2,-26,-17,  4,-24, 15,  4,-20,-26,-20,-20,-13, -2,  6,-25, -6,-20;
/M: SY='V'; M= -6,-23,-17,-28,-23,  9,-26,-20, 18,-20, 14, 16,-20,-23,-19,-18,-11,  1, 19,-21, -1,-21;
/M: SY='M'; M=  6,-13, -5,-21,-15, -8,-17,-15,  0,-15,  5, 10,-13,-18,-10,-15, -1,  9,  3,-26,-10,-13;
/M: SY='F'; M= -8,-26,-17,-33,-25, 31,-28,-21, 13,-24, 15,  9,-22,-26,-27,-19,-15, -4, 15,-11,  8,-25;
/M: SY='L'; M=  2,-20,-19,-25,-17,  6,-21,-13,  8,-19, 16,  8,-18,-22,-15,-17,-11, -2,  4,-13,  7,-17;
/M: SY='Y'; M=-16,-20,-25,-22,-20, 29,-29,  5,  1,-15,  5,  1,-18,-27,-15,-12,-16, -2, -5, 14, 53,-20;
/M: SY='I'; M=  8,-18,-11,-23,-16, -9,-20,-21,  9,-17,  4,  2,-14,-19,-14,-18, -3, -2,  9,-26,-11,-16;
/M: SY='Y'; M= -8,-20, -4,-25,-22, 16,-26, -8,  0,-18,  0, -2,-18,-27,-19,-17,-10, -2,  2, -6, 23,-22;
/M: SY='Y'; M=-10,-17, -5,-19,-18,  6,-17,-14, -9,-16, -5, -7,-15,-26,-18,-15,-10, -7, -4, -5,  8,-18;
/M: SY='T'; M= -1,-12,-20,-14, -7,-11,-18,-10, -6,-11, -4, -3,-10,-17,  3, -9,  2,  6, -6,-13, -3, -2;
/M: SY='F'; M= -7,-21,-18,-27,-19, 26,-24,-15,  3,-21, 10,  5,-17,-24,-19,-16,-10,  0,  3,-10, 10,-18;
/M: SY='R'; M= -9, -7, -8,-14,-10, -5,-20, -8,-11, -6, -4, -5, -2,-22, -5,  4, -6,  1,-10,-22, -4, -9;
/M: SY='R'; M=-10,  6,-26,  6,  5,-25,-14,  1,-29, 20,-25,-14,  8,-15,  6, 28, -1, -6,-20,-27,-12,  3;
/M: SY='M'; M=-12,-23,-27,-28,-18,  4,-27,-16, 10,-12, 12, 16,-21,-22, -9,-12,-22,-12,  2,  3,  4,-13;
/M: SY='R'; M=-18, 13,-30, 20, 10,-30,-17, 12,-32, 14,-24,-15,  8,-15, 13, 25, -5,-11,-26,-28,-10,  9;
/I:         I=-4; MI=0; IM=0; MD=-15;
/M: SY='W'; M= -5,-16,-21,-19,-10,-15,-13,-15,-15,  0,-13, -2,-15,-12, -3, -3,-13,-10,-15,  8, -6, -7;
/I:         DM=-32;
/M: SY='V'; M= -3,-19,-15,-22,-18, -3,-25,-21, 15,-18, 11,  6,-17,-21,-15,-16, -5,  8, 19,-25, -7,-17; D=-6;
/I:         DM=-32;
/M: SY='G'; M= -5, -5,-26, -7, -5,-19, 12, -4,-29,  4,-23,-13,  2,-17, -5,  8, -2,-11,-22,-21,-14, -6;
/M: SY='S'; M=  6,  2,-13,  0, -2,-20,  2, -5,-21,-10,-28,-19, 12,-12, -1,-10, 32, 17,-13,-38,-18, -2;
/M: SY='K'; M=-11,  1,-29, -1,  9,-29,-18, -4,-27, 34,-26, -9,  4,-13, 17, 31, -5, -8,-22,-22,-11, 12;
/M: SY='W'; M=-13,-25,-30,-25,-20, 10,-20,-14, -3,-18, -5, -3,-22, -7,-17,-18,-17,-11, -8, 19, 16,-19;
/M: SY='W'; M= -1,-22,-17,-26,-22, -8, -3,-23, -4,-21, -4, -2,-18,-23,-18,-21,-13,-12, -4,  7, -7,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-18,-30,-22, 11,-30,-22, 21,-28, 41, 17,-30,-30,-23,-20,-26, -8, 16,-20,  0,-22;
/M: SY='G'; M= 21, -8,-19,-12,-13,-24, 31,-18,-25,-14,-22,-16, -2,-14,-13,-18, 11, -5,-15,-24,-24,-13;
/M: SY='I'; M=  0,-26,-21,-33,-23,  9,-27,-22, 22,-24, 20, 14,-21,-23,-20,-23,-16, -8, 16,-17,  0,-23;
/M: SY='A'; M= 32,-11,-13,-18,-11,-17, -1,-19, -8,-13, -9, -9, -8,-12,-10,-19, 11,  1, -1,-24,-18,-11;
/M: SY='G'; M= 10, -8,-22,-10,-15,-26, 42,-19,-30,-16,-25,-18,  0,-16,-15,-18,  8, -7,-20,-23,-26,-15;
/M: SY='V'; M= -4,-27, -7,-28,-24,  1,-27,-23, 19,-23, 21, 13,-26,-29,-22,-19,-15, -4, 25,-28, -8,-23;
/M: SY='F'; M=-11,-28,-19,-33,-24, 28,-29,-21, 16,-26, 22, 12,-22,-27,-25,-20,-18, -7, 13,-13,  7,-24;
/M: SY='T'; M= -3, -2,-16,-11,-12, -9,-19,-15,  1,-14, -4, -4,  4,-17,-11,-13,  7, 19,  2,-31,-11,-12;
/M: SY='V'; M= -2,-16,-17,-19,-17, -9,-21,-20, 11,-16, -4,  2,-12, -9,-16,-17,  0,  4, 17,-31,-13,-18;
/M: SY='F'; M=  4,-22, -8,-29,-22, 15,-22,-22,  5,-22, 10,  2,-19,-23,-24,-20, -9, -1,  9,-16, -1,-22;
/M: SY='F'; M=  0,-15, -7,-19,-14,  3,-15,-14, -3,-19,  2,  2,-10,-20,-13,-16,  3,  2, -1,-25, -7,-13;
/M: SY='S'; M= 22, -3,-10, -7, -4,-19, -1,-14,-16,-10,-22,-16,  3,-10, -4,-13, 29, 16, -6,-33,-19, -4;
/M: SY='F'; M= -7,-21,-10,-27,-21, 13,-26,-21,  9,-24, 12,  4,-16,-24,-21,-20, -8,  2,  8,-21, -1,-21;
/M: SY='V'; M= -2,-26,-18,-29,-24, 11,-22,-22, 15,-23, 15,  7,-23,-26,-24,-20,-15, -6, 18,-16,  2,-24;
/M: SY='F'; M=  3,-17,  2,-24,-18,  7,-18,-18, -4,-19,  2,  2,-14,-22,-17,-18, -3,  2,  0,-21, -5,-17;
/M: SY='S'; M= 16, -5,-15, -8, -9,-21, 15,-16,-21,-12,-23,-16,  2,-12, -9,-15, 21,  9,-11,-29,-21, -9;
/M: SY='L'; M= -4,-21,-19,-26,-19,  8,-23,-20,  8,-21, 12,  6,-18,-22,-18,-18, -9,  3,  6, -9,  0,-18;
/M: SY='G'; M=  2,-12,-26,-13,-19,-19, 42,-15,-27,-17,-22,-15, -5,-21,-18,-18, -1,-14,-19,-15,-14,-19;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-32,-25, 12,-32,-25, 25,-27, 26, 14,-25,-26,-24,-22,-19, -4, 22,-19,  1,-25;
/M: SY='L'; M= -3,-21,  5,-28,-22,  0,-27,-24,  9,-25, 10,  3,-17,-24,-20,-22, -9,  0,  8,-26, -7,-22;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-18,-12, -7, -5,-16,  5,-12,-10, -7, -5, -1,-17, -4, -8,  3,  6, -9,-23, -2, -6;
/M: SY='F'; M=-14,-27,-17,-31,-23, 18,-25,-13,  1,-24, 10,  4,-23,-27,-20,-19,-22,-13, -4, 16, 10,-20;
/M: SY='F'; M=-14,-29, -4,-35,-26, 31,-31,-22, 10,-30, 24,  8,-24,-30,-28,-22,-23,-10,  6,-13,  7,-26;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-29, -2,-15,-26, 47,-17,-32,-19,-20,-16, -1,-20,-17,-19, -4,-17,-25,-23,-25,-16;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-22,-25,-19,  0,-22,-21, 14,-15, 11, 10,-17,-22,-16,-15,-13, -7, 11,-21, -4,-18;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-23,  3,  9,-16,-18, -3,-19,  5,-15,-11, -1,-13,  1,  3,  1,  1,-13,-27, -9,  5;
/M: SY='F'; M=-12,-21,-24,-22,-13, 20,-25,-14, -2,-18,  0, -3,-17, -3,-19,-17,-11, -4, -5,-10,  9,-16;
/M: SY='T'; M=  4,  7,-13, -3, -8,-14,-10,-11, -9, -8,-17,-12, 15,-16, -8, -9, 15, 18, -4,-33,-16, -8;
/M: SY='A'; M= 10, -7,-19, -8, -2,-19, -4,-16,-14, -8,-11,-10, -7, -8, -7,-12,  4,  0, -8,-26,-17, -5;
/I:         MD=-27;
/M: SY='A'; M= 10, -7,-10,-11, -8, -5, -6,-10, -1, -8, -1, -3, -5, -9, -6,-10, -3, -3, -1,  0, -4, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L'; M= -6,-17,-22,-23,-19, -4,-15,-20, 12,-23, 13,  6,-11,-21,-16,-20,-10, -1,  6,-24, -8,-19;
/M: SY='T'; M=  3, -2,-16,-10,-11, -9,-10,-14, -8, -6,-12, -6,  3,-17,-10, -8,  6, 10, -2,-26,-12,-10;
/M: SY='E'; M=-10,  4,-18,  6, 21,-24,-21, -5,-16, -2,-10, -9, -1,-12, 13, -6, -4, -6,-19,-29,-14, 16;
/M: SY='V'; M=  6,-24,-19,-29,-25, -7,-16,-27, 21,-22,  5,  6,-19,-22,-22,-23, -9, -6, 24,-23,-11,-25;
/M: SY='L'; M= -4,-23,-18,-27,-21,  6,-27,-20, 16,-22, 19,  8,-21,-24,-20,-19,-12,  1, 16,-19,  1,-21;
/M: SY='P'; M=-11,-20,-38,-12, -1,-21,-21,-18,-18,-10,-26,-17,-19, 74, -8,-18,-10,-10,-27,-26,-24, -8;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-22,-34,-24, 23,-32,-22, 21,-30, 36, 16,-26,-28,-24,-22,-26,-10, 12,-14,  6,-24;
/M: SY='V'; M=  4,-24,-16,-29,-23, -2,-26,-26, 23,-22, 15,  9,-22,-23,-21,-21,-10,  0, 26,-24, -8,-23;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-31,-23,  7,-31,-23, 24,-28, 39, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 20,-22, -2,-23;
/I:         I=-4; MI=-20; IM=-20;
/M: SY='A'; M=  5,-20,-12,-23,-21,-11,  0,-23,  1,-22,  3, -1,-16,-23,-19,-21, -7, -8,  5,-24,-15,-21;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-26,-37,-28,  1,-36,-27, 42,-28, 22, 21,-22,-22,-20,-26,-20, -9, 29,-21, -1,-28;
/M: SY='G'; M= -3,  2,-29,  5,-11,-31, 51,-16,-39,-16,-30,-22,  4,-18,-15,-18,  2,-16,-29,-25,-28,-13;
/M: SY='V'; M= -7,-30,-18,-33,-27, 13,-32,-26, 27,-26, 24, 14,-27,-28,-26,-22,-19, -6, 29,-21, -1,-27;
/M: SY='D'; M=-12, 26,-17, 36, 16,-32,-13, -5,-33,  3,-27,-24, 10,-11,  1, -5,  5, -3,-23,-37,-19,  9;
/M: SY='D'; M=-16, 27,-27, 28,  8,-28,-11, 19,-30,  7,-27,-18, 26,-16,  4,  7, -1, -9,-28,-34,-11,  4;
/M: SY='M'; M=  6,-14,-17,-20,-13,-10,-18,-16,  5, -7,  0,  9,-12,-16, -9,-11, -1,  4,  8,-24,-10,-12;
/M: SY='F'; M=-12,-25,-19,-32,-25, 44,-23,-20,  3,-26,  9,  1,-17,-26,-30,-19,-12, -4,  4, -6, 13,-25;
/M: SY='M'; M= -5,-21,-12,-26,-18, -4,-25,-16, 10,-12, 15, 17,-19,-23,-12, -7,-16, -7,  9,-23, -6,-16;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-21,-31,-22,  4,-29,-19, 25,-25, 34, 24,-26,-26,-17,-20,-23, -9, 16,-21, -2,-20;
/M: SY='T'; M= 10,-11, -6,-18,-14, -9,-17,-19, -2,-14,  2, -3,-10,-19,-14,-13,  1, 11,  5,-27,-12,-14;
/M: SY='H'; M=  4, -1,-23, -5,  1,-24,-12, 18,-23,  8,-20, -8,  4,-14,  9,  6,  0, -8,-18,-24, -7,  3;
/M: SY='F'; M=  2, -9, -4,-15, -8,  5,-12,-10,-15,-14,-12,-11, -5,-20,-13,-15,  0, -4,-11,-16,  1,-10;
/M: SY='W'; M=  1,-24,-27,-26,-21,  8,-18,-13, -6,-15, -8, -8,-22,-24,-16,-17,-13,-10, -6, 39, 23,-18;
/M: SY='L'; M= -4, -7,-21, -7, -9,-11,-18,  0, -5, -9,  2,  1, -6,-21, -7, -2, -9, -7, -3,-27, -7, -9;
/M: SY='Q'; M= -9,  4,-26,  6, 13,-24,-11,  1,-25,  7,-22,-14,  5,-13, 15, 14,  5, -4,-23,-25,-10, 12;
/M: SY='T'; M= -1, -1,-16, -5, -1,-17,-15,-12,-12, -2,-15,-10,  2,-13, -1, -4, 13, 18, -6,-31,-13, -1;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-17; IM=0;
/M: SY='N'; M= -6,  2,-20,  0, -2,-17,-12, -7,-13,  5,-16, -7,  6,-10, -2,  5,  2,  0,-10,-27,-13, -2; D=-3;
/I:         DM=-17;
/M: SY='K'; M= -4, -1,-23,  1,  3,-24,-13,-11,-21, 12,-26,-14,  1,  6,  0,  3,  6,  1,-15,-28,-16,  0; D=-3;
/I:         DM=-17;
/M: SY='Q'; M= -4, -3,-24, -1,  8,-25,-15, -5,-19,  6,-18, -9, -2, -1, 14,  6,  2, -4,-18,-25,-14, 10; D=-3;
/I:         DM=-17;
/M:         M= -4, -4,-23, -3, -6,-13,-18, -6, -4, -8, -3, -4, -5,-11, -7,-11, -7, -6, -6,-22, -5, -8; D=-3;
/I:         DM=-17;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-22,  6, 12,-24, -8, -5,-19, -3,-20,-12,  6, -7,  7, -6,  8,  2,-18,-31,-17,  9;
/M: SY='V'; M= -3,-19,-11,-21,-16, -7,-18,-21,  3,-12, -3,  1,-17,-17,-17, -9, -7, -3, 13,-26,-12,-17;
/M: SY='E'; M=-10,  4,-27,  9, 18,-26,-17,  1,-26,  9,-23,-16,  1,  1,  6,  6,  1, -4,-21,-30,-15, 11;
/M: SY='E'; M= -6, 10,-26, 12, 20,-27,-15,  8,-24,  5,-20,-12,  8,-10, 15,  0,  1, -7,-24,-29,-13, 17;
/M: SY='R'; M=-14, -2,-28, -7,  1,-19,-20, -3,-11, 10,-13, -3,  6,-17,  9, 23, -7, -8,-13,-24,-10,  2;
/M: SY='I'; M= -9,-24,-23,-32,-25,  2,-31,-19, 30,-21, 16, 23,-20,-21,-15,-21,-15, -3, 21,-19,  3,-22;
/M: SY='A'; M= 17,-14,-20,-20,-16,-11,  4,-18, -7,-13,-10, -6, -9,-16,-14,-18,  0, -7, -3,-17,-10,-16;
/M: SY='R'; M=-12, -5,-28, -3, 13,-20,-21,  8,-18,  9,-13, -3, -2,-13, 10, 15, -7,-10,-17,-25, -7,  9;
/M: SY='A'; M= 10,-15,-11,-19,-18,-15,  7,-22, -8,-18, -8, -7,-11,-20,-18,-19,  1, -1,  1,-25,-18,-18;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-21,-31,-22,  5,-28,-15, 25,-23, 33, 33,-25,-25,-14,-18,-24, -9, 15,-21, -1,-19;
/M: SY='S'; M=  8, -7,-17, -9, -3,-15, -6,-13,-17,  0,-19,-12, -1,-14, -4,  1, 12,  5, -8,-26,-14, -4;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-28,  0, 21,-24,-16,  0,-17,  4,-13, -7, -3,-10, 13,  4, -4,-10,-19,-26,-12, 16;
/M: SY='T'; M=  1, -8,-18,-11,  2,-11,-19,-14, -3,-11,  0, -2, -9,-13, -5,-12,  2,  9, -1,-27,-12, -2;
/M: SY='G'; M=  9, -9,-23,-11,-15,-25, 42,-17,-28,-16,-24,-14, -1,-17,-14,-18,  7,-10,-19,-23,-25,-15;
/M: SY='P'; M=  1,-20,-28,-18,-11,-16,-14,-18, -8,-13,-15, -7,-20, 28,-13,-19, -9, -8, -9,-15,-14,-15;
/M: SY='S'; M= 16, -5,-13, -9, -5,-17, -7,-12,-16, -4,-19,-13,  0,-12, -4, -6, 19, 13, -7,-27,-12, -5;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-36,-26,  7,-34,-24, 35,-27, 26, 23,-23,-24,-20,-24,-21, -9, 23,-19,  1,-25;
/M: SY='T'; M=  0,-16,-16,-23,-16,  8,-21,-19,  4,-19,  6,  2,-12,-19,-16,-17,  0, 10,  4,-20, -2,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-14,-25,-16, -2,-28,-18, 10,-13, 12, 10,-17,-23,-10,-10,-16, -8,  5,-22, -4,-14;
/M: SY='T'; M= -5, 14,-17, 15,  2,-19,-13, -8,-20, -6,-20,-18,  9,-11, -4, -9, 16, 20,-13,-32,-10, -2;
/M: SY='S'; M=  7, -5,-15, -9, -7,-11, -9, -2,-11,-11,-14, -8,  1,-15, -4,-11, 15, 11, -7,-25, -3, -7;
/M: SY='L'; M= -7,-28,-13,-33,-24, 10,-31,-24, 22,-28, 28, 13,-25,-27,-23,-23,-21, -8, 17,-20, -1,-24;
/M: SY='T'; M= -3, -9, -7,-15,-16, -5,-15,-19, -4,-16, -4, -5, -5,-20,-16,-14,  5, 17,  4,-29,-11,-16;
/M: SY='B'; M=-11, 17, -8, 17, 11,-23,-15, -3,-23, -3,-21,-18, 13,-16,  1, -7,  1, -2,-21,-33,-14,  6;
/M: SY='V'; M=  1,-20,-10,-26,-22, -6,-20,-24, 13,-21,  7,  6,-17,-21,-18,-21, -7,  3, 15,-25,-10,-21;
/M: SY='L'; M= -5,-22,-20,-25,-19,  7,-10,-17,  3,-23, 19, 11,-19,-24,-18,-18,-15, -7,  1,-18, -4,-18;
/M: SY='A'; M= 16,-10, -4,-15,-11,-15,-10,-18, -6,-14,-12, -9, -6,-16,-11,-17, 16,  9,  4,-31,-17,-11;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-21,-39,-29, 58,-32,-22, 12,-30, 14,  5,-21,-28,-35,-22,-20,-10,  8,  1, 21,-29;
/M: SY='L'; M=  2,-19,-21,-24,-20,  3, -1,-21, -2,-22,  5, -1,-14,-21,-20,-20, -8, -6, -2,-17, -7,-20;
/M: SY='I'; M=  0,-23,-22,-30,-24, -6,-19,-24, 23,-22,  7, 12,-17,-20,-18,-23,-10, -4, 20,-23, -8,-24;
/M: SY='G'; M=  7,-11,-10,-14,-20,-27, 48,-21,-34,-20,-26,-18, -4,-21,-20,-21,  0,-16,-23,-23,-28,-20;
/M: SY='T'; M= 10,-10,  0,-18,-15, -3,-10,-17,-12,-15,-11, -9, -7,-17,-14,-16,  8, 11, -4,-22, -8,-14;
/M: SY='L'; M=-13,-28,-23,-34,-25, 22,-31,-18, 23,-26, 26, 21,-23,-26,-21,-21,-23,-10, 12,-11, 11,-23;
/M: SY='T'; M=  1,-10,-15,-15,-12, -6,-18,-15, -1,-14, -5, -5, -6,-16,-10,-14, 11, 20,  3,-23, -1,-12;
/M: SY='P'; M= -2,  2,-26,  7, -1,-25, -2,-13,-24, -8,-21,-17, -2, 10, -8,-10,  3, -1,-19,-30,-21, -6;
/I:         I=-6; MI=0; IM=0; MD=-20; MD=-20;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-21,-31,-24,  6,-31,-24, 25,-24, 21, 15,-24,-19,-22,-22,-18, -4, 21,-21, -3,-24;
/M: SY='P'; M=-11,-15,-35, -9,  0,-26,-20, -7,-19, -1,-25,-14,-12, 47, -2, -3, -7, -9,-24,-28,-20, -5;
/M: SY='A'; M= 18, -3,-20, -7, -1,-25,  4,-12,-21, -2,-18,-12, -3,-12,  1, -5,  4, -4,-14,-22,-19, -1;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-21,-33,-25,  4,-32,-23, 30,-26, 30, 22,-26,-26,-20,-22,-22, -8, 24,-22, -2,-24;
/M: SY='R'; M=-11, -3,-27, -2, 14,-26,-19,  4,-22, 13,-19, -8, -1,-13, 21, 23, -1, -5,-19,-24,-11, 16;
/M: SY='V'; M= -2, -6,-18,-11, -8, -8,-14,-14,  2,-12, -7, -2, -1,-18,-11,-13,  2,  1,  5,-28,-12,-10;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29, 70,-29,-19,  3,-29, 14,  5,-21,-29,-36,-19,-21,-10,  1,  6, 26,-28;
/M: SY='C'; M= -6,-19,107,-28,-28,-20,-27,-29,-28,-28,-20,-19,-18,-37,-28,-29, -7, -8, -9,-48,-29,-28;
/M: SY='L'; M= -3,-22, -2,-28,-20, -1,-26,-20, 11,-22, 14, 11,-19,-23,-14,-20,-14, -5,  7,-23, -6,-18;
/M: SY='Y'; M=-15,-19,-26,-23,-16, 22,-17, -3, -5,-16,  3,  3,-16,-25, -8,-12,-16,-11,-10,  3, 26,-12;
/M: SY='A'; M= 19, -4, -4,-10, -9,-19,  2,-16,-18,-12,-20,-15,  1,-13, -9,-15, 18, 11, -8,-31,-20, -9;
/M: SY='A'; M= 17,-14, 14,-21,-18,-16,-10,-23, -8,-17,-10, -9,-12,-20,-17,-21,  5,  3,  4,-30,-19,-18;
/M: SY='I'; M= -3,-26,-18,-32,-24,  9,-27,-21, 23,-22, 19, 19,-23,-25,-21,-20,-16, -6, 22,-19, -1,-23;
/M: SY='A'; M= 11,-13, -1,-17,-13,-15, -9,-17, -6,-15, -8, -4, -9,-18, -9,-17,  7,  1,  1,-30,-16,-11;
/M: SY='V'; M= -6,-28,-10,-32,-26,  2,-31,-24, 27,-24, 22, 18,-27,-28,-23,-21,-18, -6, 29,-26, -6,-25;
/M: SY='V'; M= -5,-25,-11,-30,-24, 11,-29,-24, 17,-24, 16,  7,-21,-25,-24,-21,-13,  0, 18,-20, -1,-24;
/M: SY='F'; M= -6,-25,-17,-32,-24, 36,-24,-20,  6,-24,  7,  4,-18,-25,-27,-19,-10, -5,  9, -8, 10,-23;
/M: SY='B'; M=-12, 31,-16, 28,  7,-25, -8,  1,-25, -3,-25,-18, 29,-16, -1, -6,  5, -2,-24,-38,-19,  3;
/M: SY='F'; M=-16,-26,-23,-30,-25, 40,-24, -9,  4,-22, 12,  6,-21,-29,-25,-17,-20,-10,  1,  5, 32,-24;
/M: SY='F'; M= -5,-27,-18,-32,-25, 22,-28,-21, 17,-24, 18,  8,-24,-27,-26,-21,-17, -7, 18,-12,  8,-25;
/M: SY='L'; M= -2,-24,-19,-27,-21, 12,-24,-11, 12,-19, 19, 13,-23,-26,-17,-17,-17, -7, 10, -9, 14,-20;
/M: SY='Q'; M= -7, -9,-24,-12,  2, -9,-22,  1, -9, -6,-10, -1, -6,-15, 17, -4, -2, -5,-12,-18, -2, 10;
/M: SY='L'; M= -3,-24,-12,-29,-21,  3,-25,-18, 14,-22, 20, 19,-23,-18,-16,-19,-18, -8, 10,-21, -5,-19;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-14,-17,-14,  0,-24,-21,  0,-16,  5, -2, -8,-16,-14,-14,  5, 31,  4,-25, -5,-14;
/M: SY='F'; M=-13,-29,-21,-38,-29, 52,-31,-23, 13,-28, 11,  5,-20,-27,-33,-22,-18, -9, 10, -1, 18,-29;
/M: SY='F'; M=-19,-26,-24,-31,-25, 55,-30, -3,  1,-21,  8,  1,-21,-30,-26,-16,-21,-10, -4, 17, 50,-25;
/M: SY='P'; M=  2,-11,-23,-11, -8,-19,-10,-18,-11,-12,-17,-12, -7, 20,-11,-16,  4,  3, -9,-30,-21,-11;
/M: SY='A'; M= 33,-11,-16,-16, -8,-22, -1,-19,-14,-10,-15,-13,-10,  6,-10,-19,  8,  1, -7,-23,-22,-10;
/M: SY='C'; M= -5,-25, 27,-32,-27, -7,-31,-27, 12,-26,  6,  5,-22,-29,-24,-26,-14, -8, 15,-32,-13,-27;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-32,-22, 10,-29,-16, 23,-24, 34, 29,-25,-26,-16,-19,-24, -9, 14,-19,  1,-20;
/M: SY='S'; M= 14, -6,-10, -9, -8,-16, -7,-16, -9,-12,-18,-12, -1,-13, -8,-13, 25, 17,  2,-34,-17, -8;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-24,-33,-23, 12,-31,-19, 22,-26, 31, 19,-26,-27,-19,-21,-26,-11, 10, -5,  8,-22;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 101 in 98 different sequences
Number of true positive hits 74 in 74 different sequences
Number of 'unknown' hits 26 in 23 different sequences
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.67 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SSD
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
74 sequences

DISP1_DANRE (Q6R5J2), DISP1_HUMAN (Q96F81), DISP1_MOUSE (Q3TDN0), 
DISP2_DANRE (Q6R5J1), DISP2_HUMAN (A7MBM2), DISP2_MOUSE (Q8CIP5), 
DISP_DROME  (Q9VNJ5), HMDH1_YEAST (P12683), HMDH2_YEAST (P12684), 
HMDH_AGRIP  (O76819), HMDH_ASPTE  (Q9Y7D2), HMDH_ASPTN  (Q0C8L9), 
HMDH_BLAGE  (P54960), HMDH_BOVIN  (A7Z064), HMDH_CRIGR  (P00347), 
HMDH_CYBJA  (O74164), HMDH_DROME  (P14773), HMDH_GIBF5  (S0DQM8), 
HMDH_GIBFU  (P0CT44), HMDH_HUMAN  (P04035), HMDH_MESAU  (P09610), 
HMDH_MOUSE  (Q01237), HMDH_PHYB8  (Q12649), HMDH_PIG    (Q1W675), 
HMDH_PONAB  (Q5R6N3), HMDH_RABIT  (Q29512), HMDH_RAT    (P51639), 
HMDH_SCHPO  (Q10283), HMDH_STRPU  (P16393), HMDH_XENLA  (P20715), 
MMPL8_MYCBO (Q7TVL0), MMPL8_MYCBP (A1KQF8), MMPL8_MYCTA (A5U9F2), 
NPC1_CAEEL  (Q19127), NPC1_HUMAN  (O15118), NPC1_MOUSE  (O35604), 
NPC1_PIG    (P56941), NPC1_YEAST  (Q12200), NPC2_CAEEL  (P34389), 
NPCL1_HUMAN (Q9UHC9), NPCL1_MOUSE (Q6T3U4), NPCL1_RAT   (Q6T3U3), 
PTC1_CAEEL  (Q09614), PTC1_CHICK  (Q90693), PTC1_CYNPY  (O42335), 
PTC1_DANRE  (Q98864), PTC1_HUMAN  (Q13635), PTC1_MOUSE  (Q61115), 
PTC2_CYNPY  (O42334), PTC2_HUMAN  (Q9Y6C5), PTC2_MOUSE  (O35595), 
PTC_DROME   (P18502), PTHD1_DANRE (Q5RIV7), PTHD1_HUMAN (Q96NR3), 
PTHD1_MOUSE (Q14B62), PTHD2_HUMAN (Q9P2K9), PTHD2_MOUSE (A3KFU9), 
PTHD3_HUMAN (Q3KNS1), PTHD3_MOUSE (Q0EEE2), PTHD4_HUMAN (Q6ZW05), 
PTHD4_MOUSE (B9EKX1), PTR9_CAEEL  (Q03602), SCAP_BOVIN  (A6QM06), 
SCAP_CRIGR  (P97260), SCAP_HUMAN  (Q12770), SCAP_MOUSE  (Q6GQT6), 
SCAP_PIG    (Q5MNU5), SCAP_RAT    (A2RRU4), SCAP_SCHPO  (O43043), 
SCAP_XENLA  (A0JPH4), Y1562_METJA (Q58957), ZDH22_HUMAN (Q8N966), 
ZDH22_MOUSE (A0PK84), ZDH22_RAT   (Q2TGI8)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Unknown' sequences
23 sequences

MMPL3_MYCTO (P9WJV4), MMPL3_MYCTU (P9WJV5), MMPL8_MYCTO (P9WJU4), 
MMPL8_MYCTU (P9WJU5), MMPLA_STRCO (Q53902), MMPLB_MYCBO (P65375), 
MMPLB_MYCLE (O06079), MMPLB_MYCTO (P9WJT8), MMPLB_MYCTU (P9WJT9), 
MMPLB_STRCO (O54101), MMPLC_MYCTO (P9WJT6), MMPLC_MYCTU (P9WJT7), 
MMPLC_STRCO (O88022), MMPLD_STRCO (Q9XA86), SECF_RICAH  (A8GM76), 
SECF_RICB8  (A8GYD9), SECF_RICBR  (Q1RH99), SECF_RICCN  (Q92JB3), 
SECF_RICFE  (Q4UKA5), SECF_RICM5  (A8F0L9), SECF_RICRS  (A8GQT5), 
YDFJ_BACSU  (P96687), YDGH_BACSU  (P96706)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

SECDF_THET8 (Q5SKE6)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission