Entry: PS50177

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NTF2_DOMAIN
Accession [info] PS50177
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50177
Associated ProRule [info] PRU00137

Name and characterization of the entry

Description [info] Nuclear transport factor 2 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5280; R2=0.01996389; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3320.59226; R2=25.36219; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=399; N_SCORE=8.5; H_SCORE=12172; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=299; N_SCORE=6.5; H_SCORE=10904; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V'; M= -4,-26,-18,-28,-20,  0,-30,-25, 25,-22, 20, 12,-24,-25,-21,-20,-15, -4, 26,-25, -6,-21;
/M: SY='A'; M= 15,-15,-11,-18,-18,-17, 10,-22, -9,-16,-13, -9,-10,-19,-18,-19,  5, -3,  4,-27,-20,-18;
/M: SY='N'; M= -6,  4,-24,  3,  3,-18, -7, -8,-22,  4,-18,-14,  6,-15, -2,  4,  0, -4,-18,-23,-13,  0;
/M: SY='Q'; M=  6, -4,-15, -7,  5,-22, -9, -4,-17, -3,-15, -6, -4,-12,  8, -7,  5,  1,-14,-24,-12,  6;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 77,-30,-20,  1,-30, 12,  1,-20,-30,-39,-20,-20,-10,  0,  9, 29,-30;
/M: SY='V'; M= -3,-25,-10,-28,-23,  1,-28,-24, 19,-23, 21, 12,-25,-27,-22,-19,-14,  1, 25,-26, -7,-23;
/M: SY='Q'; M= -6,  4,-27,  3, 11,-29,-15,  2,-21,  8,-19, -9,  4,-12, 20,  8, -1, -6,-21,-25,-12, 15;
/M: SY='Q'; M= -6, -2,-24, -5,  5,-21,-18, 12,-13, -3,-14, -3,  1,-15, 21, -2,  0, -7,-16,-23, -4, 12;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 35,-30, 16,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 28, 75,-21;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 11,  1,-15,  4,  1,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -7, 24, 67,-22;
/M: SY='E'; M= -3,  2,-23,  2,  5,-19,-14,  1,-18,  1,-17,-11,  3,-14,  5,  1,  4, -1,-15,-25, -6,  4;
/M: SY='I'; M= -8,-15,-22,-19,-12, -3,-22,-15,  8,-15,  4,  2,-10,-19,-13,-13, -8,  1,  6,-22, -4,-14;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='F'; M=-14,-27,-22,-32,-24, 34,-28,-13,  9,-23, 19, 11,-24,-28,-24,-17,-22,-10,  5,  6, 21,-22; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='D'; M=-14, 27,-23, 36, 10,-30, -6,  1,-30, -2,-25,-21, 15,-14,  1, -6,  1, -8,-24,-33,-15,  5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='N'; M= -6, 10,-24,  8,  8,-25, -5, -4,-24,  4,-24,-16, 13,-10,  5,  3,  5, -2,-21,-30,-18,  6;
/M: SY='N'; M= -6,  5,-23,  4,  4,-15,-15, -4,-17,  1,-13, -9,  6,-15,  1,  4, -1, -3,-16,-25, -9,  2;
/M: SY='R'; M=-12,-15,-32,-12, -3,-21,-19,-11,-22,  7,-21,-13,-10, 18, -1, 22, -8, -7,-21,-17,-16, -6;
/M: SY='H'; M= -4,  2,-24,  3, 12,-25,-12, 13,-23,  3,-21,-11,  5,-12, 13,  4,  4, -4,-21,-28,-10, 12;
/M: SY='H'; M= -3, -1,-23, -4,  1,-18, -8,  4,-17, -1,-13, -7,  4,-17,  3,  0, -2, -7,-16,-24, -8,  1;
/M: SY='L'; M= -4,-28,-19,-31,-22,  4,-29,-22, 23,-26, 34, 18,-27,-27,-20,-21,-22, -8, 19,-22, -3,-22;
/M: SY='H'; M= -6, -6,-18, -9, -8,-15, -7, 14,-18, -9,-14, -7,  0,-17, -3, -7, -2, -5,-16,-24, -2, -7;
/M: SY='R'; M=-11,  3,-22,  3,  0,-19,-15, -5,-19,  8,-18, -9,  4,-16,  3, 10, -4, -7,-16,-24, -8,  1;
/M: SY='F'; M= -5,-26,-20,-31,-22, 28,-25,-16,  9,-24, 22, 11,-22,-26,-22,-19,-20, -9,  4, -7, 13,-21;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-21,-20, 32,-30, 18,  0,-11,  0,  0,-20,-30,-11,-10,-20,-10,-10, 29, 78,-20;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S'; M=  2, -3,-20, -4, -5,-19, -8, -4,-13, -8,-12, -8, -1,-13, -3, -8,  3,  1, -9,-28,-13, -5;
/M: SY='E'; M= -9, 18,-27, 26, 29,-30,-14,  1,-29,  3,-24,-20,  8, -2,  9, -4,  3, -6,-26,-33,-18, 19;
/M: SY='N'; M= -2,  6,-18,  3,  4,-23,-14, -9,-20,  4,-21,-14,  7, -6, -1,  1,  2,  0,-15,-30,-17,  0;
/M: SY='S'; M= 16, -2,  0, -6, -5,-20, -3,-13,-19,-11,-25,-18,  5,-13, -5,-13, 28, 12, -9,-37,-21, -5;
/M: SY='M'; M= -8,-13,-15,-19,-14,  0,-23,-11,  3,-10,  1,  8,-11,-20,-10, -8, -5,  6,  4,-20,  2,-13;
/M: SY='F'; M= -8,-26,-20,-32,-22, 23,-27,-18, 13,-22, 22, 17,-22,-25,-21,-17,-20, -9,  9,-12,  6,-21;
/M: SY='T'; M=  2, -3,-14, -8, -8,-13,-11,-11, -9,-12,-16,-11,  4,-13, -7,-12, 21, 22, -3,-31,-10, -8;
/M: SY='F'; M=-16,-22,-28,-25,-17,  8,-24, -9, -4,-10,  4,  0,-16,-25,-13,  5,-19,-11, -7,  6,  6,-15;
/M: SY='P'; M= -6,  0,-24,  1,  6,-22,-13,-11,-17, -2,-21,-15,  2,  9, -2, -5,  6,  4,-15,-31,-19,  1;
/M: SY='G'; M= -7,  6,-20,  9, -8,-26, 19,-13,-26,-14,-20,-14,  4,-18,-12,-16, -1,-10,-20,-29,-21,-10;
/M: SY='N'; M= -8,  2,-26, -2,  3,-18,-13, -4,-15, -1,-18,-11,  7,  2,  4, -5, -2, -6,-19,-26,-13,  2;
/M: SY='H'; M= -3,  0,-24,  1, -1,-21,-11,  4,-19, -4,-17,-10, -2, -8,  4, -5,  0, -3,-16,-23, -5,  0;
/M: SY='A'; M=  2, -7,-20,-11,-11,-13, -1,-15, -7,-15, -7, -6, -2,-18,-10,-15,  2, -1, -4,-26,-14,-11;
/M: SY='T'; M= -4,  1,-20, -4,  1,-20,-14, -4,-14,  1,-17, -9,  5,-14,  3,  1,  6,  7,-10,-29,-12,  1;
/M: SY='G'; M= -3,-15,-24,-16,-16,-19, 17,-17,-11,-15,-12, -1,-10,-17,-12,-14, -5,-11, -5,-23,-18,-15;
/M: SY='R'; M= -2, -8,-20,-11, -3,-16,-17, -9,-12,  2,-12, -4, -6,-11,  1,  6,  4,  5, -6,-25, -9, -2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='S'; M= -3,  3,-19,  1, -2,-19, -9, -9,-14, -4,-13, -8,  3,-12,  0, -5,  5,  5,-10,-28,-14, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='H'; M= -4, -7,-12,-11, -8,  1,-15,  4, -5, -9, -4, -1, -3,-16, -8, -5, -5, -5, -3,-17, -1, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-15,-11, -5, -1,-14, -7, -4, -5, -3, -2, -4,-12, -4, -4, -2,  1, -4,-15, -3, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='S'; M= -4, -2,-14, -3, -4, -9, -6, -2,-11, -4, -9, -5,  1,-11, -2,  1,  3,  2, -9,-10, -5, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-15, -8, -3, -4, -9,  0, -8,  1, -5,  0, -5, -7,  1,  4, -7, -6, -7,-10, -2, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-17,  4, 13,-19,-14, -2,-18,  8,-14,-10,  4, -6,  8,  8, -4, -7,-18,-22,-12, 10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='E'; M=  3,  4,-23,  4, 16,-25, -5, -4,-25,  5,-21,-16,  4,-10,  4,  2,  4, -5,-20,-27,-18,  9;
/M: SY='I'; M=-10,-23,-25,-32,-27,  9,-33,-23, 33,-25, 13, 12,-14,-23,-21,-24,-16, -8, 22,-18,  3,-27;
/M: SY='V'; M= -2,-12,-18,-17,-14,  0,-19, -6,  2,-13,  1,  2, -7,-22,-12,-12, -5, -4,  4,-24, -4,-13;
/M: SY='B'; M= -8, 17,-26, 17, 15,-29,-12,  0,-27, 13,-25,-16, 16,-12, 11, 10,  2, -6,-25,-30,-16, 13;
/M: SY='K'; M= -4, -4,-24, -5,  6,-18,-17,  1,-20, 11,-14, -6, -3,-14,  6, 11, -4, -6,-15,-23, -8,  5;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-31,-23, 14,-31,-20, 21,-25, 29, 14,-25,-28,-22,-17,-23, -9, 15,-16,  5,-23;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-20,-12, -7,-11,-16,-13, -6, -7, -5, -2, -6, -7, -5, -9,  0,  1, -5,-26,-12, -7;
/M: SY='S'; M=  4,  5,-17,  4,  3,-22, -6, -4,-22, -2,-26,-17, 10,-12,  2, -4, 20,  7,-15,-29,-15,  2;
/M: SY='L'; M= -9,-21,-13,-23,-15, -2,-21,-15,  4,-17, 18,  8,-18,-25,-13, -8,-16, -6,  1,-22, -4,-15;
/M: SY='P'; M=-10,  9,-28, 12,  8,-28,-10, -2,-26,  1,-27,-19,  9, 13,  2, -1,  2, -4,-26,-32,-20,  3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='Y'; M=-10,-17,-22,-20,-16, 17,-16,  7, -8,-15, -2, -2,-12,-22,-15,-11,-12,-10, -8,  2, 19,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-27,  9, 18,-27,-13,  2,-23,  4,-20,-10,  1,  0, 16,  3, -1, -7,-23,-26,-14, 16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='K'; M= -9,  3,-21,  4,  0,-18,-15, -9,-18,  5,-15,-10,  1,-16, -1,  3, -4, -5,-13,-26,-11, -1;
/M: SY='T'; M= -4, -8, -8,-14,-14, -8,-21,-14,  0,-13, -4, -4, -5,-20,-10,-12,  1,  7,  2,-26, -6,-13;
/M: SY='Q'; M= -1,  2,-21, -1,  2,-23,-14,  0,-17,  5,-19, -7,  4,-13,  9,  2,  6,  4,-13,-27,-11,  5;
/M: SY='H'; M= -6,-16,-21,-20,-14,  2,-22, 12, -3,-14,  1,  2,-10,-23,-11, -5,-10, -9,  0,-21,  4,-14;
/M: SY='D'; M= -7, 10,-25, 16, 14,-23,-16, -6,-21,  4,-18,-15,  2,-11,  1, -3, -1, -6,-15,-29,-14,  7;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-18,-31,-23,  0,-31,-24, 25,-22, 15, 11,-21,-23,-16,-18,-16, -8, 20,-21, -4,-22;
/M: SY='Q'; M= -6, -3,-22, -4,  4,-18,-17, -4,-14, -3,-13, -7, -2,-14,  7, -2,  4,  3,-12,-20, -9,  5;
/M: SY='T'; M=  0, -2,-16, -4, -4,-18,-14,-14,-14, -2,-19,-12,  1, -6, -4, -4, 15, 20, -6,-31,-15, -4;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-19,-31,-24, 11,-29,-23, 22,-24, 17, 10,-22,-25,-22,-21,-15, -5, 21,-18,  1,-23;
/M: SY='D'; M=-11, 18,-26, 26,  6,-27,-15,  1,-24, -4,-18,-16,  6, -5, -1, -9, -1, -4,-19,-33,-14,  2;
/M: SY='S'; M=  6, -6, -7, -9, -8,-14, -3,-13,-16,-13,-16,-13, -4,-16,-11,-15,  9,  6, -6,-27,-14,-10;
/M: SY='Q'; M=-10, -1,-28,  2,  6,-27,-17, -1,-15,  1,-16, -5, -3,-14, 25, -1, -4, -9,-19,-13, -6, 15;
/M: SY='P'; M=  3, -8,-23, -8, -3,-17,-15,-14, -8,-10,-14,-11, -7, 12, -9,-15,  1, -1, -8,-28,-16, -8;
/M: SY='T'; M= -3,-10, -4,-14,-12, -8,-18,-10, -9,-15, -7, -5, -7,-18,-10,-13,  8, 16, -3,-22, -5,-12;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M:         M= -4, -7,-10, -9, -8,-12, -2, -5, -7, -8, -9, -3, -3, -3, -5, -7, -2, -4, -6,-17,-10, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M:         M= -6, -7,-22,-10, -9,-11, -8, -2,-11,-13, -9, -5, -1,-10, -6,-11, -1, -1,-12,-22, -7, -8;
/M: SY='E'; M= -5,  7,-23,  7,  9,-25, -4,  1,-25,  2,-23,-15,  8,-12,  5, -2,  6, -1,-20,-30,-15,  6;
/M: SY='G'; M= -3,  7,-24,  4, -3,-26, 14, -8,-27, -2,-24,-16, 12,-16, -2, -2,  5, -6,-23,-28,-20, -3;
/M: SY='G'; M=  1, -7,-15, -9,-14,-24, 28,-15,-27,-13,-21,-11, -2,-19,-12,-11,  2, -9,-19,-25,-23,-13;
/M: SY='V'; M= -2,-27,-18,-31,-26,  2,-28,-22, 27,-21, 16, 18,-24,-25,-21,-21,-15, -5, 29,-22, -2,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-16,-30,-21,  9,-31,-22, 18,-21, 19, 11,-23,-26,-18,-18,-19, -8, 15,-19,  0,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-21,-31,-26,  5,-27,-26, 26,-23, 11, 10,-20,-24,-23,-22,-13, -5, 25,-21, -3,-26;
/M: SY='M'; M=-10,-15,-20,-21,-15,  7,-23, -9,  7,-12,  5, 15,-11,-22, -9, -9,-10, -3,  5,-18,  2,-12;
/M: SY='V'; M=  6,-25, -5,-27,-26, -4,-26,-28, 20,-18,  5,  5,-25,-26,-26,-20, -5,  4, 38,-30,-12,-26;
/M: SY='T'; M=  0, -5,-12,-10,-11,-11,-18, -9, -3,-13, -6, -5, -2,-18, -8,-13,  5, 11,  1,-29, -8,-10;
/M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-18,-31, 65,-18,-39,-18,-29,-19,  0,-19,-16,-18,  0,-19,-30,-20,-29,-17;
/M:         M= -6,-10,-22,-12, -2, -4,-16, -8, -9, -7, -5, -5, -8,-18, -2, -5, -3, -2, -7,-17,  0, -2;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-17,-31,-24, 21,-28,-19, 16,-24, 25, 17,-25,-28,-23,-18,-19, -7, 16,-16,  4,-22;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-22,-10, -3, -8,-21,-12,-12,  7,-12, -7, -2,-15, -3,  6, -1,  7, -9,-20, -3, -3;
/M:         M= -9, -9, -7,-10, -6, -6,-15,-15,-12,-14, -3, -8, -9,-22,-13,-12, -9, -7, -8,-20,-10, -9;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='D'; M= -7, 13,-24, 17,  6,-25, -9, -7,-23,  5,-20,-16,  8, -8, -2, -1, -1, -5,-18,-29,-16,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='D'; M= -9, 14,-27, 19, 16,-29,  6, -4,-30,  0,-25,-19,  9, -6,  4, -6,  0,-11,-27,-28,-20, 10; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='D'; M=-12, 16,-26, 19,  8,-24, -7, -1,-26,  4,-23,-16, 11, -8,  5,  1, -1, -6,-24,-25,-12,  6; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='Q'; M= -6, -5,-23, -5,  4,-17,-13, -8,-14, -1,-15, -8, -3,  5,  6, -4,  0, -3,-16,-23,-13,  5; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-22,-19,-10,-10,-22,-15,  1, -5,  4,  3,-15,-12, -7,  3,-11, -6,  4,-23,-10,-10; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='R'; M=-15, -7,-27, -9, -4,-16,-15,  4,-21, 12,-13, -5,  1,-20,  5, 35, -8, -9,-17,-21, -6, -3;
/M: SY='K'; M= -2, -7,-24, -9, -4,-15,-10, -3,-21,  9,-20,-10, -1, -9, -3,  9, -2, -7,-15,-22,-10, -5;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-21,-39,-30, 75,-30,-19,  2,-29, 10,  1,-20,-30,-38,-20,-20,-10,  1,  9, 30,-30;
/M: SY='T'; M=  3, -4,-10, -7, -7,-15,-14,-11, -9,-12,-10, -8, -2,-16, -4,-12, 11, 12, -2,-32,-13, -6;
/M: SY='Q'; M=-13, -2,-30, -2, 16,-33,-20, 10,-24, 15,-20, -4,  0,-13, 42, 26, -3,-10,-27,-21, -9, 27;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-14,-12, -9,-10,-17,-14, -4,-10,-10, -3, -2,-14, -4,-10, 13, 22,  2,-29,-10, -7;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28, 69,-30,-18,  3,-29, 15,  3,-21,-30,-36,-19,-21,-10,  1,  7, 29,-28;
/M: SY='I'; M=-11,-27,-21,-31,-24, 17,-31,-13, 20,-24, 20, 13,-23,-27,-22,-19,-20, -8, 17,-13, 11,-24;
/M: SY='L'; M= -2,-28,-17,-30,-23,  4,-28,-24, 22,-25, 32, 15,-28,-28,-22,-21,-20, -6, 22,-23, -5,-23;
/M: SY='A'; M=  9,-11,-16,-15, -8,-14,-10,-18, -6, -8, -5, -4,-10,-16,-10,-11,  2,  6,  3,-25,-14, -9;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='P'; M= -4,-13,-29,-10, -2,-19,-16,-14,-15, -7,-19,-13,-10, 36, -6,-10, -4, -6,-18,-26,-20, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-10, -2, -3,-14,  2, -6,-14, -3,-10, -7,  1,-11,  1,  0,  1, -2,-11,-16,-10, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='Q'; M= -6,  2,-25,  0,  8,-25, -7,  1,-21,  1,-19,-10,  8,-12, 13,  6,  2, -6,-22,-27,-15,  9;
/M: SY='N'; M= -5, 15,-23, 10,  5,-24, -5, -3,-19, -3,-23,-15, 20, -8,  5, -6,  8,  1,-21,-32,-18,  4;
/M: SY='N'; M= -7,  5,-24,  4, -3,-21,  7,-10,-28,  4,-26,-16,  9,-15, -5,  3,  4, -3,-21,-26,-16, -4;
/M: SY='S'; M=  2, -3,-20, -5, -6,-23, 11,-14,-25,  0,-26,-16,  4,-14, -5, -2, 13,  4,-15,-28,-19, -6;
/M: SY='Y'; M=-16,-25,-27,-27,-23, 26,-29, -4,  5,-19,  9,  3,-23,-29,-18,-16,-21, -8, -1, 21, 41,-22;
/M: SY='F'; M= -8,-16, -4,-20,-17, 10,-20,-11, -9,-11, -5, -5,-14,-25,-18,-12,-12, -9, -3,-13,  7,-18;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-16,-35,-30,  0,-35,-30, 37,-26, 16, 14,-25,-26,-25,-25,-16, -6, 37,-25, -5,-30;
/M: SY='V'; M=  2,-15,-16,-18,-13, -7,-20,-16,  3,-13,  4,  1,-14,-20,-14,-12, -9, -3,  6,-22, -7,-14;
/M: SY='N'; M= -4, 24,-17, 12,  0,-20, -2,  4,-20, -1,-29,-19, 39,-16,  0, -2, 18,  7,-23,-39,-18,  0;
/M: SY='D'; M=-18, 40,-30, 57, 25,-39,-12,  1,-37,  2,-28,-26, 16, -9,  8, -7,  0,-10,-30,-37,-19, 17;
/M: SY='M'; M= -8,-16, -8,-21, -9, -6,-27,-15,  4,-13,  3,  5,-14,-20, -8,-10,-10, -4,  2,-23, -5,-10;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-21,-35,-25, 41,-31,-20, 13,-29, 28, 10,-24,-29,-29,-21,-24,-10,  7, -5, 16,-25;
/M: SY='R'; M=-18,-14,-27,-16, -7,  1,-23,  0,-18, 10,-10, -5, -7,-22,  1, 35,-12,-10,-13,-13,  3, -5;
/M: SY='F'; M=-14,-27,-24,-33,-26, 31,-32,-14, 18,-24, 16, 10,-22,-27,-24,-20,-21, -9, 11, -1, 26,-26;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 58 in 58 different sequences
Number of true positive hits 57 in 57 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.28 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.28 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann, N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NTF2
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
57 sequences

BRE5_YEAST  (P53741), G3BP1_BOVIN (Q32LC7), G3BP1_HUMAN (Q13283), 
G3BP1_MOUSE (P97855), G3BP1_PONAB (Q5RB87), G3BP2_HUMAN (Q9UN86), 
G3BP2_MOUSE (P97379), G3BP2_PONAB (Q5R9L3), G3BP_SCHPO  (O94260), 
M2K3_ARATH  (O80396), MEX67_CANAL (P84149), MEX67_SCHPO (Q9Y8G3), 
MEX67_YEAST (Q99257), NTF2_ARATH  (Q9C7F5), NTF2_ASHGO  (Q75AA5), 
NTF2_BOVIN  (Q32KP9), NTF2_CAEEL  (Q21735), NTF2_CANAX  (Q9P926), 
NTF2_CANGA  (Q6FRC6), NTF2_DAVTA  (Q8NJ52), NTF2_DEBHA  (Q6BWC0), 
NTF2_DICDI  (Q86HW7), NTF2_EMENI  (Q96VN3), NTF2_HUMAN  (P61970), 
NTF2_KLULA  (Q6CQX4), NTF2_MOUSE  (P61971), NTF2_NEUCR  (P87102), 
NTF2_ORYSJ  (Q9XJ54), NTF2_PONAB  (Q5R8G4), NTF2_RAT    (P61972), 
NTF2_SCHPO  (Q10100), NTF2_XENLA  (O42242), NTF2_YARLI  (Q6CC82), 
NTF2_YEAST  (P33331), NXF1_BOVIN  (Q1RMS5), NXF1_CAEEL  (Q9XVS7), 
NXF1_COTJA  (P58797), NXF1_DROME  (Q9U1H9), NXF1_HUMAN  (Q9UBU9), 
NXF1_MOUSE  (Q99JX7), NXF1_PONAB  (Q5R752), NXF1_RAT    (O88984), 
NXF2_CAEEL  (Q9XVS8), NXF2_DROME  (Q9VV73), NXF2_HUMAN  (Q9GZY0), 
NXF3_HUMAN  (Q9H4D5), NXT1_BOVIN  (Q2KIW0), NXT1_CAEEL  (Q9U757), 
NXT1_DROME  (Q9V3H8), NXT1_HUMAN  (Q9UKK6), NXT1_MOUSE  (Q9QZV9), 
NXT1_SCHPO  (P0CAN8), NXT2_BOVIN  (A6QNX3), NXT2_CHICK  (Q5ZLH0), 
NXT2_HUMAN  (Q9NPJ8), NXT2_MOUSE  (Q3UNA4), NXT2_RAT    (B2GV77)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

NXF5_HUMAN  (Q9H1B4)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

CATEA_XENLA (Q805F3)

		
PDB
[Detailed view]
24 PDB

1A2K; 1AR0; 1ASK; 1GY5; 1GY6; 1GY7; 1GYB; 1JB2; 1JB4; 1JB5; 1JKG; 1JN5; 1OF5; 1OUN; 1Q40; 1QMA; 1U5O; 1ZX2; 2QIY; 3NV0; 3Q90; 4FCJ; 4FCM; 4IIA
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission